检索结果-内蒙古大学图书馆

湖泊科学 2013年第5期25卷 681-687页

作者：谭芮李伟杨宇明杜凡王娟西南林业大学昆明650224 云南省林业科学院昆明650201 国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室昆明650201

2011年5、7、10月在纳帕海湖滨湿地选择3种不同人为干扰生境类型,每个干扰生境布设3个固定样方,对湖滨湿地植物群落中主要种群的空间生态位和季节特征进行研究.结果表明:在3种干扰水平维度上,春、夏、秋3个季节湖滨湿地植物生态位宽度... 详细信息

2011年5、7、10月在纳帕海湖滨湿地选择3种不同人为干扰生境类型,每个干扰生境布设3个固定样方,对湖滨湿地植物群落中主要种群的空间生态位和季节特征进行研究.结果表明:在3种干扰水平维度上,春、夏、秋3个季节湖滨湿地植物生态位宽度指数前4位由大到小变化的顺序分别是:春季:绵毛酸模叶蓼(0.9731)>华扁穗草(0.8040)>平车前(0.6468)>毛果弹裂碎米荠(0.5021);夏季:平车前(0.8674)>荠(0.8581)>华扁穗草(0.8440)>绵毛酸模叶蓼(0.7814);秋季:华扁穗草(0.9698)>绵毛酸模叶蓼(0.7730)>平车前(0.6650)>西南委陵菜(0.6647).因此,湖滨湿地植物的生态位宽度在不同干扰水平上会随着季节的变化出现显著的改变.同样,生态位重叠和生态位分化随着季节的变化也会发生明显的改变,其中春、秋季的生态位重叠程度低,分化程度高,且春季较秋季略强,而夏季的生态位重叠程度高且分化程度低.这些结果为揭示纳帕海湖滨湿地植物群落格局与动态及人为干扰影响生物多样性的生态过程提供了基础资料,同时为进一步深入研究不同人为干扰下湖滨湿地植物群落中主要种群敏感性反应的规律提供了科学依据.

关键词：纳帕海湿地干扰生态位宽度生态位重叠

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铁力木幼苗接种丛枝菌根菌剂的效应

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林业科技开发 2015年第5期29卷 64-66页

作者：耿云芬邱琼卯吉华景跃波云南省林业科学院昆明650201 国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南省森林植物培育与开发利用重点实验室

采用温室盆栽法,研究了国家二级濒危植物铁力木幼苗接种丛枝菌根菌剂对其生长量、生物量和叶片光合作用的影响。结果表明,引进的丛枝菌根菌种能侵染铁力木根系,侵染率为43.69%;苗高、地径、叶片数、主根长、侧根数分别比对照提高32.3%,2... 详细信息

采用温室盆栽法,研究了国家二级濒危植物铁力木幼苗接种丛枝菌根菌剂对其生长量、生物量和叶片光合作用的影响。结果表明,引进的丛枝菌根菌种能侵染铁力木根系,侵染率为43.69%;苗高、地径、叶片数、主根长、侧根数分别比对照提高32.3%,23.8%,42.4%,89.0%和60.0%。地上鲜质量、地下鲜质量、地上干质量、地下干质量比对照分别提高了49.3%,44.9%,45.9%和54.4%。菌根化幼苗的净光合速率(Pn)、气孔导度(Gs)、蒸腾速率(Tr)增加,胞间CO2浓度降低。研究表明,引进的美国丛枝菌根菌剂能侵染铁力木根系,形成共生关系,能促进铁力木幼苗生长、增加生物量,提高幼苗的光合能力。

关键词：丛枝菌根真菌铁力木幼苗生长效应光合作用

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黄单胞菌Xanthomonas campestris *** 756C中Ⅵ型分泌蛋白的生物信息学分析

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华中农业大学学报 2016年第4期35卷 42-48页

作者：韩长志王娟西南林业大学林学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650224 云南省林业科学院/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室昆明650201

为明确黄单胞菌Xanthomonas campestris *** 756C(Xcr)中存在的Ⅵ型分泌蛋白(Tss)数量及其所具有的信号肽、保守motif等信息以及该菌中Tss与其他病菌中同源序列之间的遗传关系,利用关键词对Xcr蛋白质数据库进行搜索,并对Xcr中Tss氨基酸... 详细信息

为明确黄单胞菌Xanthomonas campestris *** 756C(Xcr)中存在的Ⅵ型分泌蛋白(Tss)数量及其所具有的信号肽、保守motif等信息以及该菌中Tss与其他病菌中同源序列之间的遗传关系,利用关键词对Xcr蛋白质数据库进行搜索,并对Xcr中Tss氨基酸序列开展信号肽、跨膜结构域以及保守基序(motif)的生物信息学分析,同时,对Xcr中所含有的Tss与其他病原菌中同源序列之间的遗传关系进行分析。明确Xcr中存在3个Tss,分别命名为TssA、TssB、TssC,上述Tss均含有高于50%比例的!螺旋结构,均定位在细胞膜上以及具有3个保守motif,而就信号肽而言,仅TssC含有明显的信号肽序列。Xcr中的Tss与Xcc、Xca等黄单胞菌属病菌中的Tss具有较近的亲缘关系。

关键词： Xanthomonas campestris pv.raphani 756C Ⅵ型分泌系统 Ⅵ型分泌蛋白黄单胞菌属

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非洲菊叶绿体基因组密码子偏好性分析

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分子植物育种 2022年

作者：卢珍红莫锡君原晓龙李绅崇单芹丽王毅云南省农业科学院花卉研究所云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室

为分析非洲菊叶绿体基因组密码子使用模式，本研究从其叶绿体基因组中去除重复CDS(Coding DNA sequence)和序列长度小于300 bp后得到53条基因序列，利用Codon W和在线程序CUSP分析其密码子偏好性。结果显示，非洲菊叶绿体基因组密码子第... 详细信息

为分析非洲菊叶绿体基因组密码子使用模式，本研究从其叶绿体基因组中去除重复CDS(Coding DNA sequence)和序列长度小于300 bp后得到53条基因序列，利用Codon W和在线程序CUSP分析其密码子偏好性。结果显示，非洲菊叶绿体基因组密码子第3位的GC含量为27.94%，偏向于以碱基A和U结尾；ENC范围36.02～57.43，平均值为47.66，ENC值>45的基因有40条，密码子的偏性较弱；RSCU值>1.00的密码子有29个。中性绘图、ENC-plot及PR2-plot分析结果显示，自然选择是非洲菊叶绿体基因组密码子使用偏性的主要影响因素。最优密码子为UUG、CUU、AAU、AGA、GGA、UAU、CAU。本研究结果为非洲菊重要经济性状的遗传改良、叶绿体遗传和进化分析提供必要的基础数据。

关键词：非洲菊叶绿体基因组密码子偏好性自然选择

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青头菌(Russula virescens)聚酮合酶基因的克隆及碳源对该基因表达的影响

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福建农林大学学报（自然科学版） 2021年第2期50卷 250-256页

作者：原晓龙王毅杨文忠云南省林业和草原科学院云南省森林培育与开发利用重点实验室/国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

为了解青头菌中具体的聚酮合酶基因,从青头菌(Russula virescens)基因组挖掘并克隆到一个聚酮合酶(polyketide synthase,PKS)基因(RvPKS),通过生物信息学分析预期其功能,并检测了不同浓度碳源添加物对该基因表达的影响.结果表明:RvPKS基... 详细信息

为了解青头菌中具体的聚酮合酶基因,从青头菌(Russula virescens)基因组挖掘并克隆到一个聚酮合酶(polyketide synthase,PKS)基因(RvPKS),通过生物信息学分析预期其功能,并检测了不同浓度碳源添加物对该基因表达的影响.结果表明:RvPKS基因(GenBank登录号:MT655136)的cDNA长度为6039 bp,编码2012个氨基酸,结构域组织顺序为SAT-KS-AT-ACP-TE,各结构域的保守活性氨基酸序列为SAT(GIIGFSSGII)、KS(DTACSSSL)、AT(NVVEAHGTGTQ)、ACP(VVGHSLGEYVA)和TE(LGGWSLGGIIA);预测的RvPKS编码蛋白与火丝菌(Pyronema omphalodes)、鸡枞菌属(Termitomyces sp.)、白环菇属(Leucoagaricus sp.)、乌氏曲霉(Aspergillus udagawae)、丝曲霉(Aspergillus lentulus)、Penicillium subrubescens等相关聚酮合酶蛋白聚为一支,该蛋白可能催化合成一种新型的分生孢子色素.此外,2%山梨醇和10%蔗糖能强烈诱导RvPKS基因的表达.

关键词：青头菌聚酮合酶聚类分析基因表达

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黄花杓兰菌根真菌rDNA ITS的多样性

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浙江农林大学学报 2015年第5期32卷 815-820页

作者：缪福俊蒋宏王宏虬原晓龙陈剑杨宇明王娟云南省林业科学院国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201 西南林业大学林学院云南昆明650224

杓兰属Cypripedium植物因具较高的观赏和药用价值而长期被过度采集,已成为濒危植物。菌根真菌是其栽培和保育能否成功的重要协同因子。采用免培养技术对滇西北4个不同居群的黄花杓兰Cypripedium flavum毛根的真菌进行核糖体脱氧核糖核... 详细信息

杓兰属Cypripedium植物因具较高的观赏和药用价值而长期被过度采集,已成为濒危植物。菌根真菌是其栽培和保育能否成功的重要协同因子。采用免培养技术对滇西北4个不同居群的黄花杓兰Cypripedium flavum毛根的真菌进行核糖体脱氧核糖核酸内转录间隔区(rDNA ITS)区段扩增。结果表明:从4个居群的毛根中共克隆得到366个真菌ITS-taxa,其中白水河居群93个,石卡雪山居群90个,天生桥居群103个,纳帕村居群80个;黄花杓兰毛根系统中存在丰富多样的菌根真菌类型,分别涉及胶膜菌属Tulasnella,伏革菌属Corticium,瘤菌根菌属Epulorhiza和丝核菌属Rhizoctoia 4个属及一类归属未定的真菌(uncultured mycorrhizal fungi);胶膜菌属对于黄花杓兰具有一定的寄主专一性特征,可能对黄花杓兰的生长有促生作用。以上结果为菌肥的研制和黄花杓兰植物的栽培与保育工作提供科学依据。

关键词：微生物学黄花杓兰菌根真菌 rDNA ITS 胶膜菌属多样性

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滇牡丹(Paeonia delavayi)二氢黄酮醇4-还原酶基因的鉴定及表达

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分子植物育种 2020年第4期18卷 1083-1087页

作者：李云琴原晓龙陈中华王毅云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

为了研究二氢黄酮醇4-还原酶基因(DFR)对滇牡丹(Paeonia delavayi)花瓣中花色形成的作用,本研究采用RT-PCR技术首次从滇牡丹中克隆得到一个具有完整开放阅读框的二氢黄酮醇4-还原酶基因(PdDFR),生物信息学分析和转录模式分析显示,该基... 详细信息

为了研究二氢黄酮醇4-还原酶基因(DFR)对滇牡丹(Paeonia delavayi)花瓣中花色形成的作用,本研究采用RT-PCR技术首次从滇牡丹中克隆得到一个具有完整开放阅读框的二氢黄酮醇4-还原酶基因(PdDFR),生物信息学分析和转录模式分析显示,该基因全长1 050 bp,共编码349个氨基酸,其蛋白序列与黄牡丹(Paeonia lutea) DFR的蛋白序列具有99.00%的一致性。序列比对分析显示PdDFR基因存在一个由21个氨基酸组成的NADPH结合位点"VTGATGYIGSWLVKTLLERGN"。滇牡丹PdDFR蛋白与黄牡丹(Paeonia lutea, ALX35996.1)、蓖麻(Ricinus communis, XP015577076.1)、木薯(Manihot esculenta, XP021607-041.1)的DFR蛋白聚为一类;转录模式分析表明PdDFR基因在红色花瓣中有表达,在根、茎、叶中不表达。本研究通过对滇牡丹转录组数据的分析,分离并克隆得到PdDFR基因,为利用基因工程技术选育优良滇牡丹花卉品种提供理论参考。

关键词：滇牡丹(Paeonia delavayi) 二氢黄酮醇4-还原酶生物信息学分析

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基于简化基因组测序的野生竹叶花椒遗传多样性分析

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分子植物育种 2023年

作者：尹庆丰王毅呼延丽郝佳波蒙进芳陆斌西南林业大学林学院云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室

为探究36份花椒资源间的遗传关系，本研究基于Illumina NovaSeq测序平台并利用ddRAD-seq (Double digest restriction site-associated DNA sequencing)技术对36分花椒资源进行了测序。结果显示，测序Q20值均值为98.00%，测序Q30值均值为93.72%，平均GC含量为36.01%；经过过滤和筛选共获得78 222 636个高质量SNP，其中纯合突变率平均值为91.17%；杂合突变率平均值为8.98%；SNP频谱分析显示碱基转换突变为主要SNP突变型。基于SNP进行的群体主成分分析、群体遗传结构分析以及群体发育树分析结果能够相互验证，可将36份花椒资源分为4个类群。在群体遗传多样性分析中发现，群体间的分化指数Fst在0.07～0.80之间，属于中等偏强且存在较大程度的遗传分化，遗传多样性差异较大。本研究利用ddRAD-seq技术解析的36份花椒资源群体遗传结构和群体遗传多样性，所筛选的SNP标记提供了丰富的信息，有助于完善花椒分子标记数据库，也为后续花椒遗传图谱构建、分子标记辅助选择育种、系统发育研究以及优良品种选育提供了基础。

关键词：简化基因组竹叶花椒 SNP 系统发育树遗传多样性分析

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岩生树花地衣型真菌NRPS基因的生物信息学分析

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西部林业科学 2018年第2期47卷 21-25,38页

作者：原晓龙陈剑华梅李云琴王娟杨宇明王毅云南省林业科学院云南昆明650201 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

为了挖掘岩生树花地衣型真菌转录组数据中的NRPS基因,找出其潜在化合物或蛋白,以岩生树花地衣型真菌的转录组数据为基础,分析获得一个新的NRPS基因(Ri NRPS)。利用BLAST比对、分子系统进化及anti SMASH、NRPS predictor、Na PDo S、Nor... 详细信息

为了挖掘岩生树花地衣型真菌转录组数据中的NRPS基因,找出其潜在化合物或蛋白,以岩生树花地衣型真菌的转录组数据为基础,分析获得一个新的NRPS基因(Ri NRPS)。利用BLAST比对、分子系统进化及anti SMASH、NRPS predictor、Na PDo S、Norine等生物信息学分析手段对岩生树花地衣型真菌Ri NRPS基因进行分析,结果显示,Ri NRPS基因相对分子质量为702 699.9,等电点5.83,为不稳定蛋白;其开放阅读框总长19 098bp,编码6 362个氨基酸;该蛋白不存在信号肽,为非分泌蛋白,定位于细胞质基质中;可能合成HC-toxin合成酶,可能的催化反应是以Orn(鸟氨酸)、Gln(谷氨酰胺)、Gln(谷氨酰胺)、Cys(半胱氨酸)4个氨基酸作为底物合成环状四肽,此环状四肽可能是一种具毒素活性的多肽、其结构式为C21H32N4O6。研究结果为以后岩生树花NRPS基因的挖掘及非核糖体多肽类物质的生物合成提供参考。

关键词：岩生树花 RiNRPS基因 HC-toxin合成酶生物信息学分析

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珍稀植物蒜头果扦插繁育技术研究

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种子 2022年第5期41卷 139-143页

作者：耿云芬王四海杨嫱云南省林业和草原科学院昆明650201 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物繁育和保护重点实验室昆明650201

为了保护和可持续利用蒜头果资源,本研究从插条年龄、扦插基质和生长激素对扦插生根影响探讨蒜头果扦插的适宜条件。结果表明,插条的年龄越小越有利于扦插生根,当年生插条生根率最高(45±5.00)%,其次为一年生(38±7.64)%和二年... 详细信息

为了保护和可持续利用蒜头果资源,本研究从插条年龄、扦插基质和生长激素对扦插生根影响探讨蒜头果扦插的适宜条件。结果表明,插条的年龄越小越有利于扦插生根,当年生插条生根率最高(45±5.00)%,其次为一年生(38±7.64)%和二年生枝条(35±10.00)%,但是它们之间的差异并不显著(p>0.05),然而三年生枝条没有生根。在用于扦插的珍珠岩、河沙、椰糠+珍珠岩(1∶1)、土壤+珍珠岩(1∶1)、蛭石+珍珠岩(1∶1)、蛭石等6种基质中,透气保湿性好的椰糠+珍珠岩(1∶1)基质生根率最高(51.67±7.64)%,其次为蛭石+珍珠岩(1∶1)基质,生根率为(40.00±13.29)%。激素种类和浓度对蒜头果扦插生根都有显著影响,分别用1000 mg/L和200 mg/L的吲哚丁酸钾溶液处理插穗,生根率有着极显著差异(p<0.01),分别为(66.67±12.58)%和(38.33±7.64)%;上述同等浓度萘乙酸钠溶液处理插穗,生根率有着显著差异(p<0.05),分别为(45.00±8.66)%和(25.00±5.00)%;较高浓度的吲哚丁酸钾溶液(1000 mg/L和500 mg/L)与相同浓度的萘乙酸钠溶液相比能显著提高扦插生根率(p<0.05)。综上所述,蒜头果扦插选择幼嫩的当年生或一年生枝条,透气保湿性好的基质,较高浓度的吲哚丁酸钾溶液处理有利于插穗生根。

关键词：蒜头果扦插基质激素

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