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西北林学院学报 2009年第6期24卷 33-37页

作者：付玉嫔陈少瑜吴涛郝佳波司马用康云南省林业科学院国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南省森林植物培育与开发利用实验室云南昆明650204

为了探讨大果木莲的濒危机制,以非濒危同属近缘种中缅木莲为对照,对二者的生境、种子特征及萌发特性进行了比较研究。结果表明：大果木莲聚合果大小约为中缅木莲的2倍,蓇葖果数量约为其1/2,理论种子生产力（胚珠数）为其61%,实际种子生... 详细信息

为了探讨大果木莲的濒危机制,以非濒危同属近缘种中缅木莲为对照,对二者的生境、种子特征及萌发特性进行了比较研究。结果表明：大果木莲聚合果大小约为中缅木莲的2倍,蓇葖果数量约为其1/2,理论种子生产力（胚珠数）为其61%,实际种子生产力（结实量）为其58.8%,萌发时间较中缅木莲长10~15 d,二者萌发率都在60%以上,但大果木莲的萌发率变异高达39.6%。大果木莲生境多为石灰岩山地,岩石裸露较多,环境潮湿,萌发更新环境较中缅木莲恶劣。

关键词：大果木莲中缅木莲濒危种子形态特征萌发率种子生产力

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牛樟逆境胁迫相关WRKY转录因子的鉴定及表达分析

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分子植物育种 2022年第21期20卷 7025-7035页

作者：张璋王毅罗玛妮娅郑元西南林业大学林学院昆明650224 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

WRKY转录因子是植物逆境研究中最广泛的家族之一,在植物响应生物胁迫和非生物胁迫中具有重要作用。本研究利用本地BLAST对牛樟基因组进行比对分析得到58个牛樟WRKY基因序列,并对牛樟WRKY转录因子进行理化性质、保守基序、系统进化及表... 详细信息

WRKY转录因子是植物逆境研究中最广泛的家族之一,在植物响应生物胁迫和非生物胁迫中具有重要作用。本研究利用本地BLAST对牛樟基因组进行比对分析得到58个牛樟WRKY基因序列,并对牛樟WRKY转录因子进行理化性质、保守基序、系统进化及表达谱分析。保守结构域和基序预测发现,牛樟转录因子家族蛋白主要分为三大类,即Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ类,多数蛋白较保守,其中Ⅰ、Ⅱ类中有两个蛋白(CkWRKY25,CkWRKY1)存在Q残基的变异;CkWRKY基因表达谱数据分析发现,有22个基因在受干旱、低温胁迫时上调表达,占牛樟WRKY家族的37.9%,其中18个基因受干旱胁迫呈高表达水平,占上调基因的81.8%,4个基因在4℃低温胁迫下表达量显著升高,占比18.2%。将牛樟中22个表达差异显著的基因与14个具有抗旱、抗寒WRKY基因共同建树,结果显示36个WRKYs蛋白聚为两大类,参与干旱及低温胁迫的蛋白主要集中在第一大类中,其中CkWRKY26、CkWRKY38、CkWRKY39、CkWRKY45、CkWRKY55分别和参与干旱胁迫的蛋白聚为一支,且C端锌指结构均为C2H2;CkWRKY20、CkWRKY54和参与低温胁迫中陆地棉的GhWRKY62、毛果杨的PtWRKY34、西洋参的PqWRKY7、旱地棉的GaWRKY28、陆地棉的GhWRKY73以及小麦的TaWRKY19和TaWRKY10聚为一支。本研究基于牛樟高通量转录组数据,探究牛樟WRKY转录因子家族生物学特性,为深入研究牛樟WRKY基因非生物胁迫调控提供科学依据。

关键词：牛樟 WRKY转录因子转录组分析干旱与低温胁迫

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牡丹花瓣高效液相色谱指纹图谱研究

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西部林业科学 2018年第1期47卷 52-58页

作者：华梅原晓龙王毅杨卫陈剑马惠芬呼延丽杨宇明王娟云南省林业科学院云南昆明650201 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室云南昆明650201

以不同引种地不同品种的9个新鲜牡丹花瓣为实验材料,采用高效液相色谱法(HPLC)测定9个不同引种地不同品种牡丹花瓣样品中的化学成分。液相色谱条件为Eclipse plus C18色谱柱(4.6×150mm,5μm),流动相为乙腈-1%乙酸梯度洗脱,流速0.8m... 详细信息

以不同引种地不同品种的9个新鲜牡丹花瓣为实验材料,采用高效液相色谱法(HPLC)测定9个不同引种地不同品种牡丹花瓣样品中的化学成分。液相色谱条件为Eclipse plus C18色谱柱(4.6×150mm,5μm),流动相为乙腈-1%乙酸梯度洗脱,流速0.8mL/min,检测波长360nm,柱温为35℃。通过中药色谱指纹图谱相似度评价系统(国家药典委员会)进行相似度分析,建立9个样品牡丹花瓣的指纹图谱,为科学评价与有效控制牡丹花瓣产品质量提供新方法。结果表明,本研究建立的分析方法有较好的重复性,9个引种牡丹花瓣样品指纹图谱共有6个主要共有峰,可作为鉴别引种地牡丹花瓣质量的主要依据。

关键词：牡丹花瓣高效液相色谱指纹图谱

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蛹虫草聚酮合酶基因的多样性分析

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西部林业科学 2019年第2期48卷 97-103,113页

作者：原晓龙李云琴王毅云南省林业科学院云南昆明650201 国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201

以蛹虫草的菌丝体为材料,利用基因组挖掘的方式从蛹虫草基因组中获得其聚酮合酶(Polyketide synthase,PKS)基因,对这些PKS基因进行生物信息学分析以推断它们的功能,并检测它们在不同培养基上的表达情况。结果表明:蛹虫草中含有13个PKS基... 详细信息

以蛹虫草的菌丝体为材料,利用基因组挖掘的方式从蛹虫草基因组中获得其聚酮合酶(Polyketide synthase,PKS)基因,对这些PKS基因进行生物信息学分析以推断它们的功能,并检测它们在不同培养基上的表达情况。结果表明:蛹虫草中含有13个PKS基因(CmPKS 1-13),包括2个非还原型聚酮合酶(Non-reducing PKS,NR-PKS),5个部分还原的聚酮合酶(Partial-reducing PKS,PR-PKS),6个高度还原型聚酮合酶(Highly reducing PKS,HR-PKS);聚类分析显示CmPKS 1、CmPKS 3可能参与链格孢吡喃酮(alternapyrone),CmPKS 4可能参与黄曲霉素,CmPKS 5可能参与美伐他汀,CmPKS 6可能参与分生孢子色素,CmPKS 8可能参与伊快霉素的生物合成,其余PKS与生物合成未知化合物的PKS聚为一支;半定量PCR显示CmPKS 7和CmPKS 9在4种培养基上均强烈表达;CmPKS 3、CmPKS 6在4种培养基上微弱表达;CmPKS 10、CmPKS 11和CmPKS 12只在GL培养基上强烈表达,在其余3种培养基上微弱表达;CmPKS 1和CmPKS 4只在GL培养上微弱表达,CmPKS 8仅在GS培养基上微弱表达;CmPKS 2、CmPKS 5和CmPKS 13在检测的培养基中都不表达。本研究为进一步异源表达蛹虫草中的PKS基因及其功能鉴定、具新颖结构聚酮化合物的发掘奠定基础。

关键词：蛹虫草基因组挖掘聚酮合酶基因表达聚酮类化合物

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深纹核桃WRKY转录因子的全基因组鉴定与分析

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分子植物育种 2022年第23期20卷 7737-7750页

作者：徐令文王毅王丽娟郝佳波张雨李贤忠陆斌西南林业大学林学院昆明650224 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

WRKY是一类存在于植物中的转录因子,参与激素调节通路,与植物生长发育有关。基于深纹核桃转录组测序数据,本研究利用NCBI在线工具筛选蛋白结构域,获得深纹核桃WRKY转录因子基因序列。通过生物信息学方法进行分析,结果表明,共发掘88个JsW... 详细信息

WRKY是一类存在于植物中的转录因子,参与激素调节通路,与植物生长发育有关。基于深纹核桃转录组测序数据,本研究利用NCBI在线工具筛选蛋白结构域,获得深纹核桃WRKY转录因子基因序列。通过生物信息学方法进行分析,结果表明,共发掘88个JsWRKY转录因子,根据结构域数目和锌指结构可以分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ类型,氨基酸大小为104~981 aa,平均分子质量为45 503.23,平均理论等电点(pI)值为7.334 5,其中88个转录因子脂肪系数(Aliphatic index)均小于100,均不具有信号肽和跨膜结构;87个WRKY转录因子为不稳定蛋白,除了JsWRKY7定位于细胞核和细胞质,其余87个JsWRKY转录因子均定位于细胞核。转录组测序分析显示JsWRKY转录因子在6年生的Juglans sigillata cv. Xixiang嫁接树进行环剥与不进行无环剥、结果的老树3种条件下,除了3个基因(JsWRKY19, Js WRKY75, JsWRKY84)不表达,其余基因在茎、叶中的表达均有变化,其中JsWRKY42、JsWRKY18、JsWRKY55、JsWRKY34、JsWRKY88、JsWRKY59、JsWRKY43、JsWRKY78基因只在结果的老树叶片中高表达;JsWRKY32、JsWRKY47、JsWRKY67、JsWRKY51、JsWRKY61、JsWRKY79、JsWRKY9、JsWRKY63、JsWRKY73、JsWRKY44、JsWRKY33、JsWRKY7、JsWRKY68、JsWRKY45仅于无环剥处理的茎中高表达;JsWRKY27、JsWRKY77、JsWRKY86、JsWRKY80只在环剥处理的茎中高表达;JsWRKY20、JsWRKY21、JsWRKY58只在老树的茎、叶中表达;JsWRKY46、JsWRKY65、JsWRKY56只在有环剥、无环剥处理下茎、叶中表达。本研究结果为进一步挖掘JsWRKY转录因子功能及其分子生物学研究奠定了基础,同时为进一步研究其他植物WRKY转录因子的家族特征提供理论依据。

关键词：深纹核桃(Juglans sigillata) 基因组 WRKY转录因子表达分析

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基于油橄榄全基因组参与水胁迫NAC基因的鉴定及表达分析

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分子植物育种 2023年第3期21卷 736-746页

作者：王丽娟王毅李贤忠张璋冯发玉胡青陆斌西南林业大学林学院昆明650224 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

本研究以干旱和水淹胁迫中的‘佛奥’和‘TYZ-1号’2个油橄榄品种苗木为试材,基于油橄榄全基因组数据,鉴定出36个油橄榄NAC转录因子家族成员,利用生物信息学软件进行结构及功能预测,将油橄榄OeNAC蛋白与模式植物拟南芥AtNAC蛋白构建进... 详细信息

本研究以干旱和水淹胁迫中的‘佛奥’和‘TYZ-1号’2个油橄榄品种苗木为试材,基于油橄榄全基因组数据,鉴定出36个油橄榄NAC转录因子家族成员,利用生物信息学软件进行结构及功能预测,将油橄榄OeNAC蛋白与模式植物拟南芥AtNAC蛋白构建进化树。结果表明OeNAC转录因子分为两个大类和14个亚家族,14个亚家族中有13个亚族同时包含了油橄榄和拟南芥NAC蛋白,说明拟南芥和油橄榄的NAC家族在进化水平上有一定的相似性。结合油橄榄水分胁迫(干旱,水淹)基因表达谱,分析出8个NAC转录因子(OeNAC31,OeNAC33,Oe NAC25,Oe NAC30,OeNAC7,OeNAC23,OeNAC20,OeNAC1)在‘佛奥’和‘TYZ-1号’中均呈现高表达且对水分胁迫均有响应,推测这8个基因是油橄榄水分调节的主要基因。将在水分胁迫下具有表达量的Oe NAC蛋白与已知水分胁迫相关的NAC转录因子构建进化树发现8个胁迫相关的转录因子中的Oe NAC31与已知的水分调控因子支持率更高,表明OeNAC31转录因子可能是参与油橄榄水分调控的最主要基因,其在两个品种中都有不同的表达量,这可能是‘佛奥’和‘TYZ-1号’抗性不同的原因。本研究通过油橄榄转录组测序,对油橄榄NAC转录因子进行全基因组鉴定、蛋白理化性质、系统发育、保守元件及基因表达谱分析,探究油橄榄NAC转录因子在‘TYZ-1号’和‘佛奥’中基因表达模式,也为油橄榄NAC基因家族的功能验证及水胁迫反应关键基因的挖掘提供参考。

关键词：油橄榄 NAC转录因子生物信息学基因表达谱水分胁迫

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砧木、接穗的选择对美国山核桃嫁接成活率及生长的影响

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西北林学院学报 2012年第4期27卷 141-143,148页

作者：马婷陈宏伟熊新武贺娜肖良俊王高升李甜江郎南军云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室云南省林业科学院云南昆明650204

以1年生山核桃实生苗为砧木,从美国山核桃采穗圃中采集优良穗条,按照接穗不同部位,砧木不同径级进行嫁接。通过对嫁接成活率以及苗木成活后生长情况的比较分析,结果表明:1)顶端穗条嫁接成活率最低,中部穗条嫁接成活率最高;2)砧木与接穗... 详细信息

以1年生山核桃实生苗为砧木,从美国山核桃采穗圃中采集优良穗条,按照接穗不同部位,砧木不同径级进行嫁接。通过对嫁接成活率以及苗木成活后生长情况的比较分析,结果表明:1)顶端穗条嫁接成活率最低,中部穗条嫁接成活率最高;2)砧木与接穗粗度差异越小嫁接成活率越高,差异越大则嫁接成活率越低;3)砧木越粗,嫁接后苗高生长越快,但对地径和嫁接口径并无显著影响。因此,选择适宜的砧木和穗条能够大大提高嫁接成活率,提供优质的嫁接苗。

关键词：美国山核桃砧木接穗生长量

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哀牢山常绿阔叶林木质藤本幼苗的光合特性对光环境变化的响应

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西南林业大学学报（自然科学） 2017年第2期37卷 1-11页

作者：吴涛耿云芬柴勇郝佳波袁春明云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室云南昆明650201 云南省林业科学院云南昆明650201

以哀牢山亚热带常绿阔叶林中11种常见的木质藤本植物为研究对象,含林窗、林缘更新、喜光或适应高光强生境的常绿蔷薇、山羊桃、南蛇藤、五风藤、冷饭团、爬山虎6种植物,以及林内更新的、喜荫或适应低光强生境的石宝茶藤、川西尾叶素馨... 详细信息

以哀牢山亚热带常绿阔叶林中11种常见的木质藤本植物为研究对象,含林窗、林缘更新、喜光或适应高光强生境的常绿蔷薇、山羊桃、南蛇藤、五风藤、冷饭团、爬山虎6种植物,以及林内更新的、喜荫或适应低光强生境的石宝茶藤、川西尾叶素馨、冠盖绣球、肖菝葜和葡萄酸藤子5种植物,使用便携式光合仪测定其置于林外、林缘和林内3种生境下2年生幼苗的光合气体交换参数、光合-光响应曲线和光合-CO_2响应曲线,分析其叶片对光环境的适应能力及对不同生境的适应性。结果表明:从林外到林缘再到林内,11种木质藤本植物的P_n、WUE、T_r、P_(max_、LSP、LCP和R_d均呈下降趋势,而C_i、AQY、A_(max)、R_p和CE呈上升趋势,且喜光木质藤本植物光合生理指标的各项测定值在相同生境时通常都显著高于喜荫植物的;依据光合生理指标分析结果,11种木质藤本植物中适应强光的物种是爬山虎、常绿蔷薇、山羊桃和南蛇藤,适应弱光的物种是葡萄酸藤子、石宝茶藤和冠盖绣球,而冷饭团、五风藤、肖菝葜和川西尾叶素馨对光环境的适应能力居于二者中间。

关键词：藤本植物幼苗叶片光合特性光环境哀牢山

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短柄草基因组调查测序

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分子植物育种 2023年

作者：杨跃仙段利武马山俊曾昭朝原晓龙王毅云南林业职业技术学院云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室

短柄草(Brachypodium sylvaticum (Huds.) Beauv.)是禾本科中一种体型较小的可自花结实的二倍体多年生植物，是多年生草本植物中优秀的候选模式植物。为大规模全基因组测序及其组装策略提供研究基础、确定其基因组大小及复杂程度提供信... 详细信息

短柄草(Brachypodium sylvaticum (Huds.) Beauv.)是禾本科中一种体型较小的可自花结实的二倍体多年生植物，是多年生草本植物中优秀的候选模式植物。为大规模全基因组测序及其组装策略提供研究基础、确定其基因组大小及复杂程度提供信息，本研究采用流式细胞术和二代测序技术的数据约简法(Ken-monomeric unit， K-mer)分析评估短柄草基因组大小，并分析其基因组的特征信息。研究结果显示，(1)以玉米作为内参，流式细胞测定短柄草基因组大小约为349.35 Mb；(2)高通量测序获得原始数据23.85 Gb，处理后得到约21.41 Gb的Clean data，数据质量良好；(3) K-mer分析显示短柄草基因组大小约为385.45 Mb，杂合度较低(0.3%)，GC含量为45.85%；(4) NT数据库比对发现二穗短柄草(B. distachyon)、安第斯短柄草(B. andinum)、大麦(Hordeum vulgare)亲缘关系较近。本研究为短柄草的全基因组de novo测序策略提供有效依据，也为未来短柄草分子育种及高效牧草培育奠定基础。

关键词：短柄草流式细胞术全基因组Survey分析基因组大小(C值)

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思茅松纯林及针阔混交林中松实小卷蛾和微红梢斑螟诱捕量比较研究

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西部林业科学 2012年第2期41卷 96-98页

作者：冯志伟闫争亮刘云彩胡光辉李思广云南省林业科学院云南昆明650201 国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室/云南省森林植物培育和开发利用重点实验室云南昆明650201

在思茅松纯林和针阔混交林中,以(E,E)-2,4-癸二烯醛、(Z)-11-十六碳烯乙酸酯为引诱剂,对松实小卷蛾和微红梢斑螟进行了诱捕试验。结果表明,以(E,E)-2,4-癸二烯醛为引诱剂,在思茅松纯林和混交林内平均每个诱捕器分别诱捕到松实小卷蛾6.3... 详细信息

在思茅松纯林和针阔混交林中,以(E,E)-2,4-癸二烯醛、(Z)-11-十六碳烯乙酸酯为引诱剂,对松实小卷蛾和微红梢斑螟进行了诱捕试验。结果表明,以(E,E)-2,4-癸二烯醛为引诱剂,在思茅松纯林和混交林内平均每个诱捕器分别诱捕到松实小卷蛾6.30头和3.10头;以(Z)-11-十六碳烯乙酸酯为引诱剂,在思茅松纯林和混交林内平均每个诱捕器分别诱捕到微红梢斑螟3.60头和2.40头;混交林内的松实小卷蛾和微红梢斑螟的诱捕量显著少于纯林。

关键词：思茅松松实小卷蛾微红梢斑螟诱捕

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