检索结果-内蒙古大学图书馆

基因组学与应用生物学 2020年第11期39卷 5240-5246页

作者：原晓龙李云琴王毅云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

法尼基焦磷酸合酶(farnesyl pyrophosphate synthase,FPS)是萜类化合物生物合成过程中的关键酶和限速酶,影响后续支路产物的代谢。为探究牛樟芝中AcFPS基因与萜类化合物生物合成间的关系,本研究从牛樟芝基因组中分离并克隆得到AcFPS基因... 详细信息

法尼基焦磷酸合酶(farnesyl pyrophosphate synthase,FPS)是萜类化合物生物合成过程中的关键酶和限速酶,影响后续支路产物的代谢。为探究牛樟芝中AcFPS基因与萜类化合物生物合成间的关系,本研究从牛樟芝基因组中分离并克隆得到AcFPS基因,并对其蛋白进行生物信息学分析,比较AcFPS基因在含不同碳、氮源添加物培养基上的表达量。结果表明,AcFPS基因含5个外显子、4个内含子,其外显子拼接总长1095 bp,编码364个氨基酸;AcFPS是一种位于细胞质中无信号肽和跨膜结构的蛋白,该蛋白含有4个保守序列,分别为DomainⅠ(GGKLNRG LSVVD)、DomainⅡ(DDMMD)、DomainⅢ(KFSLQKHXLIVIXKT)、DomainⅣ(DDFLD);牛樟芝AcFPS与污叉丝孔菌(XP007371273)、白腐菌(XP008044628)、绣球菌(XP027616692)、根纤维孔菌(XP012183648)和绵腐卧孔菌(XP024343411)等多孔菌目真菌的FPS蛋白聚为一支;以果糖为碳源、以番茄浸粉为氮源能有效诱导AcFPS基因的表达。本研究为深入解析牛樟芝萜类化合物合成分子机制及其异源表达提供了依据。

关键词：牛樟芝 AcFPS基因基因克隆最佳表达培养基筛选

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土壤含水量对极小种群毛枝五针松幼苗抗氧化活性的影响

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热带亚热带植物学报 2016年第2期24卷 182-188页

作者：康洪梅张珊珊杨文忠方波云南省林业科学院国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

为探究水分对毛枝五针松（Pinuswangii）幼苗生理特性的影响，对不同土壤含水量下幼苗松针的抗氧化活性进行了研究。结果表明，土壤含水量为田问持水量的40％～80％时，其POD、SOD和CAT活性较强；随着处理时间的延长，细胞质膜渗透性减... 详细信息

为探究水分对毛枝五针松（Pinuswangii）幼苗生理特性的影响，对不同土壤含水量下幼苗松针的抗氧化活性进行了研究。结果表明，土壤含水量为田问持水量的40％～80％时，其POD、SOD和CAT活性较强；随着处理时间的延长，细胞质膜渗透性减弱，抗逆性变弱；脯氨酸、可溶性糖和蛋白质含量均以20％～40％的田问持水量较高；处理30d后丙二醛含量随着土壤含水量的增加而提高，在土壤含水量为田问持水量的40％时，丙二醛含量最低，抗逆性最强。因此，人工培育幼苗时，土壤水分过多的时间尽量不要超过30d，控制土壤水分为田问最大持水量的30％～50％，这样能提高幼苗存活率。

关键词：毛枝五针松土壤含水量幼苗生理特性

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应用简化基因组技术对富民枳遗传多样性检测

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东北林业大学学报 2020年第4期48卷 36-41页

作者：张珊珊陈剑杨文忠国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室(云南省林业科学院) 昆明650201

富民枳是云南特有的极小种群野生植物,野生资源仅剩15株。通过二代测序技术,对其进行简化基因组测序,开发一批特异性高的单核苷酸多态性标记,分析天然种群和回归种群的遗传多样性。经过遗传变异检测,共获得SNP位点491 189个,通过样品最... 详细信息

富民枳是云南特有的极小种群野生植物,野生资源仅剩15株。通过二代测序技术,对其进行简化基因组测序,开发一批特异性高的单核苷酸多态性标记,分析天然种群和回归种群的遗传多样性。经过遗传变异检测,共获得SNP位点491 189个,通过样品最低测序深度>2,样品缺失率<0.5、次要基因型频率(MAF)>0.05筛选以后,得到有效SNP位点41 077个。基于过滤后的SNP,运用生物信息学分析方法,对富民枳完成了群体的遗传多样性分析,研究分析了富民枳天然种群和回归种群的私人等位基因数目、平均观测杂合度(Ho)、平均期望杂合度(He)、核苷酸多样性(π)和平均近交系数(FIS)5个遗传多样性参数。结果表明,富民枳现存植株的遗传多样性较高,具有很高的遗传资源保存价值,但是回归种群的Ho值、He值、π值分别为0.398 3、0.291和0.330 6,分别仅是天然种群遗传多样性的87%、78%和73%,并未达到90%以上遗传多样性的标准。

关键词：富民枳简化基因组测序遗传多样性分析遗传管理

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西南桦叶绿体基因组密码子偏好性分析

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基因组学与应用生物学 2020年第12期39卷 5758-5764页

作者：原晓龙李云琴王毅张劲峰云南省林业和草原科学院昆明650201 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

密码子偏好性广泛存在于各种植物中。本研究利用Codon W和在线软件CUSP分析西南桦(Betula alnoides)叶绿体基因组中的45条蛋白编码序列。结果显示,西南桦叶绿体基因组的ENC值在36.86~56.10之间,密码子第3位上的GC含量为27.80%,RSCU>... 详细信息

密码子偏好性广泛存在于各种植物中。本研究利用Codon W和在线软件CUSP分析西南桦(Betula alnoides)叶绿体基因组中的45条蛋白编码序列。结果显示,西南桦叶绿体基因组的ENC值在36.86~56.10之间,密码子第3位上的GC含量为27.80%,RSCU>1的密码子中有23个以A或U作为结尾,说明其密码子偏好以AU结尾;ENC与密码子第3位碱基的GC含量呈显著相关;3种图形分析均表明西南桦叶绿体基因组密码子偏好性受突变影响较大;最优密码子以C结尾的有7个,G结尾的有2个,U结尾的有1个。本研究为西南桦无性系地理种源鉴定、保持种源多样性提供了科学依据。

关键词：西南桦(Betula alnoides) 叶绿体基因组密码子偏好性突变

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基于ISSR遗传多样性分析的云南蓝果树保护措施探索

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植物遗传资源学报 2015年第3期16卷 664-669页

作者：向振勇张珊珊杨文忠康洪梅云南省林业科学院珍稀濒特森林植物保护和繁育国家林业局重点实验室昆明650201

保存种群的遗传多样性和进化潜力是成功拯救保护濒危物种的关键。云南蓝果树（Nyssa yunnanensis ***）是国家I级重点保护的极度濒危野生植物,也是国家实施极小种群野生植物保护工程的目的物种。为了制定针对性的保护措施,采用ISSR分子... 详细信息

保存种群的遗传多样性和进化潜力是成功拯救保护濒危物种的关键。云南蓝果树（Nyssa yunnanensis ***）是国家I级重点保护的极度濒危野生植物,也是国家实施极小种群野生植物保护工程的目的物种。为了制定针对性的保护措施,采用ISSR分子标记方法对64株极度濒危物种云南蓝果树子代个体进行遗传多样性分析。从100条引物中筛选出12条ISSR引物,共扩增出77个稳定、清晰的条带。其中58个为多态性条带,物种水平上的多态性条带百分率（PPL）变动范围为50.00%-87.50%,平均值为（74.65±0.01）%;等位基因观察值（Na）为1.7532;有效等位基因观察值（Ne）为1.5804;Nei＇s基因多样性指数（He）为0.3206,多态性信息含量指数（PIC）变动范围为0.15-0.44,平均值为0.27±0.01;Shannon＇s遗传多样性信息指数（I）随着样本数的增加而升高,但当样本数达到24及以上时,Shannon＇s指数的数值基本不再变化。基于遗传多样性分析结果,从地质历史原因和人为干扰因素等方面对云南蓝果树的濒危机制进行了探析,并提出了有针对性的云南蓝果树保护措施。

关键词：云南蓝果树 ISSR标记遗传多样性濒危机制科学保护

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思茅松叶绿体基因组密码子偏好性分析

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基因组学与应用生物学 2021年第3期40卷 1278-1283页

作者：原晓龙陈伟王毅李江云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

密码子偏好性(codon usage bias)是指同义密码子的使用频率不同的现象,该现象广泛存在于植物中。本研究利用CodonW1.4.2和CUSP软件分析思茅松(Pinus kesiya ***)叶绿体基因组的45条CDS,结果显示思茅松叶绿体基因组密码子第三位碱基的GC... 详细信息

密码子偏好性(codon usage bias)是指同义密码子的使用频率不同的现象,该现象广泛存在于植物中。本研究利用CodonW1.4.2和CUSP软件分析思茅松(Pinus kesiya ***)叶绿体基因组的45条CDS,结果显示思茅松叶绿体基因组密码子第三位碱基的GC含量为29.63%,偏好以AT碱基结尾;ENC值在37.66~60.30之间,且ENC值>45的CDS有37个,占总参试基因的82.22%;GC_(1)、GC_(2)、GC_(3)与GCall均为极显著相关,GC_(3)与ENC呈显著相关。中性绘图分析显示GC_(12)和GC_(3)的相关系数为-0.1114,回归系数为-0.1111;ENC-plot软件分析显示大部分基因与标准曲线的距离较远;PR2-plot软件分析显示思茅松叶绿体基因组在密码子的碱基使用频率方面,T>A,G>C。这些说明思茅松叶绿体基因密码子偏好性的主要影响因素为选择,突变的作用较小。本研究为思茅松种源选择、系统发育等研究提供科学依据。

关键词：思茅松叶绿体基因组密码子偏好性选择

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滇牡丹中3个类查尔酮合成酶基因的克隆与表达

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浙江农业学报 2019年第9期31卷 1478-1484页

作者：原晓龙李云琴王毅云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室

从开黄花的滇牡丹转录组中分离了3个CHS基因,利用生物信息学预测其基因功能,并比较不同花发育时期CHS基因的表达量。结果显示:3个CHS基因的cDNA全长分别为1173、1185、1128bp,依次命名为PdCHS1(GenBank登录号MK516264)、PdCHS2(GenBank... 详细信息

从开黄花的滇牡丹转录组中分离了3个CHS基因,利用生物信息学预测其基因功能,并比较不同花发育时期CHS基因的表达量。结果显示:3个CHS基因的cDNA全长分别为1173、1185、1128bp,依次命名为PdCHS1(GenBank登录号MK516264)、PdCHS2(GenBank登录号MK516265)和PdCHS3(GenBank登录号MK516266),分别编码390、394和375个氨基酸;这3个CHS基因编码的蛋白均为无信号肽的非分泌蛋白,均含查尔酮合成酶活性位点基序(G/A)FGPG。聚类结果显示,滇牡丹中的3个CHS蛋白归属于不同分支。基因表达结果显示,PdCHS1基因在花蕾期和花蕊中表达量较高,PdCHS2基因在末花期和初花期表达量较高,PdCHS3基因在末花期和花蕾期表达量较高。这3个CHS基因分别参与不同次生代谢产物的合成,推测PdCHS1参与柚皮素查尔酮,PdCHS2参与芪类化合物,PdCHS3参与聚酮类化合物的生物合成。

关键词：滇牡丹查尔酮合成酶基因生物信息学次生代谢

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牛樟芝非还原型聚酮合酶基因的克隆及表达分析

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中草药 2018年第20期49卷 4870-4876页

作者：原晓龙华梅陈剑陈中华王娟杨宇明王毅云南省林业科学院云南昆明650204 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650204 国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650204

目的获得牛樟芝聚酮合酶基因(Ac PKS1)全长,对其进行生物学分析并分析该基因在不同培养基上的表达差异。方法通过对牛樟芝基因组分析获得牛樟芝聚酮合酶基因,通过设计含有起始密码子和终止密码子的特异引物并以牛樟芝c DNA为模板克隆得... 详细信息

目的获得牛樟芝聚酮合酶基因(Ac PKS1)全长,对其进行生物学分析并分析该基因在不同培养基上的表达差异。方法通过对牛樟芝基因组分析获得牛樟芝聚酮合酶基因,通过设计含有起始密码子和终止密码子的特异引物并以牛樟芝c DNA为模板克隆得到Ac PKS1基因全长,并对该基因进行生物信息学分析及在不同培养基上的表达谱分析。结果 Ac PKS1全长6 348 bp,含有6个内含子和7个外显子,外显子编码2 115个氨基酸;通过生物信息学分析,推测该基因为真菌I型非还原型PKS,结构域为SAT-KS-PT-ACP-ACP-TE,系统树分析显示Ac PKS1与其他未知功能的聚酮合酶(PKS)聚为一支,说明Ac PKS1可能是一种新的聚酮化合物环化方式;表达谱分析表明,葡萄糖为Ac PKS1基因表达的必要条件,且葡萄糖含量与Ac PKS基因表达量呈正相关。结论本研究为Ac PKS1功能鉴定以及牛樟芝基因资源利用奠定基础。

关键词：牛樟芝聚酮合酶生物信息学分析表达谱 AcPKS1

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陈齿爪鳃金龟对油橄榄挥发物的趋向反应

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东北林业大学学报 2012年第3期40卷 127-129页

作者：闫争亮刘凌马惠芬国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室(云南省林业科学院) 昆明650201

通过GC-MS分析,确定了油橄榄(Olea europaea)树叶挥发物的主要成分为:β-石竹烯(14.29%)、α-芹子烯(13.13%)、β-芹子烯(10.15%)、α-石竹烯(6.60%)、橙花叔醇(6.72%)、3-己烯-1-醇(5.03%)和苯乙醛(5.61%)等。利用"Y"型双向... 详细信息

通过GC-MS分析,确定了油橄榄(Olea europaea)树叶挥发物的主要成分为:β-石竹烯(14.29%)、α-芹子烯(13.13%)、β-芹子烯(10.15%)、α-石竹烯(6.60%)、橙花叔醇(6.72%)、3-己烯-1-醇(5.03%)和苯乙醛(5.61%)等。利用"Y"型双向选择嗅觉仪进行的室内趋向反应试验发现,芳樟醇、β-石竹烯、α-石竹烯、α-芹子烯和β-芹子烯对陈齿爪鳃金龟(Holotrichia cheni)具有显著的引诱作用;3-己烯-1-醇和壬醛化合物对陈齿爪鳃金龟雌虫具有明显的驱避作用,苯乙醛具有明显的引诱活性;橙花叔醇对雌虫具有驱避作用,而对雄虫则表现引诱活性。

关键词：陈齿爪鳃金龟油橄榄挥发性物质趋向试验

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云南松与旱冬瓜混交林林地土壤养分及细根、叶片养分特征

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东北林业大学学报 2011年第3期39卷 69-71页

作者：杨卫付玉嫔祁荣频徐亮尹艾萍吴涛国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室(云南省林业科学院) 昆明650204

为了探讨云南松与旱冬瓜混交对养分的利用情况,对云南松纯林、云南松与旱冬瓜混交林分、旱冬瓜纯林3种林分类型进行了林地土壤及叶片、根系养分质量分数的测定分析。结果表明:云南松与旱冬瓜混交林地土壤表层土的有机质、有效磷、水解... 详细信息

为了探讨云南松与旱冬瓜混交对养分的利用情况,对云南松纯林、云南松与旱冬瓜混交林分、旱冬瓜纯林3种林分类型进行了林地土壤及叶片、根系养分质量分数的测定分析。结果表明:云南松与旱冬瓜混交林地土壤表层土的有机质、有效磷、水解氮、有效钾、全氮、全磷、全钾、交换性钙、镁离子等肥力指标都比纯林高,pH值也发生了变化,介于云南松纯林与旱冬瓜纯林林地土壤的pH值之间,为4.93～5.15。云南松与旱冬瓜混交提高了2树种细根的养分质量分数,提高了云南松叶片的养分质量分数,云南松叶片的m(N)∶m(P)<14,研究区普遍受氮养分限制,且在夏季混交林比纯林受氮养分限制更明显。云南松与旱冬瓜混交提高了林地土壤养分质量分数,尤其是有效养分的质量分数,对改良土壤和防止地力衰退具有重要的作用。

关键词：云南松旱冬瓜混交林土壤养分养分特征

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