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分子植物育种 2025年第5期 1488-1502页

作者：罗玛妮娅王毅张璋原晓龙王丽娟冯发玉徐令文郑元西南林业大学林学院云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室西南林业大学生物与食品工程学院

NAC转录因子是植物转录因子家族中的重要成员之一，对植物生长发育和非生物胁迫响应具有重要作用。本研究通过本地BLAST与鳄梨基因组比对分析获得72个鳄梨NAC (PaNAC)转录因子，利用二代转录组测序获得鳄梨干旱和低温胁迫转录组数据，... 详细信息

NAC转录因子是植物转录因子家族中的重要成员之一，对植物生长发育和非生物胁迫响应具有重要作用。本研究通过本地BLAST与鳄梨基因组比对分析获得72个鳄梨NAC (PaNAC)转录因子，利用二代转录组测序获得鳄梨干旱和低温胁迫转录组数据，对其蛋白理化性质、系统进化树及基因表达谱分析，并对干旱和低温胁迫相关基因进行RT-qPCR验证。转录组分析结果表明，在干旱胁迫下有56个PaNACs表达，低温胁迫下共有53个PaNACs表达。系统进化树结果表明，PaNAC25和参与干旱胁迫的拟南芥ANAC019、ANAC055和ANAC072聚为1支，Pa NAC10、Pa NAC50和PaNAC51分别与刚毛柽柳ThNAC24、茶树CsNAC17、水稻Os NAC022聚为1支。RT-qPCR结果显示，鳄梨NAC转录因子中PaNAC10、PaNAC25、PaNAC50和PaNAC51参与干旱胁迫响应，Pa NAC35和Pa NAC69参与低温胁迫响应。本研究结果为进一步探究鳄梨NAC转录因子家族生物学特性及基因功能奠定基础，为揭示NAC基因参与非生物胁迫调控提供科学依据。

关键词：鳄梨(Persea americana) NAC转录因子转录组分析干旱低温胁迫

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基于简化基因组技术的云南蓝果树群体遗传分析

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植物研究 2019年第6期39卷 899-907页

作者：张珊珊康洪梅杨文忠云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育国家林业局重点实验室

极小种群野生植物云南蓝果树是国家和云南省实施极小种群野生植物保护工程的代表性物种。为有效保护其遗传资源,本研究通过二代测序技术,对其进行简化基因组测序,开发一批特异性高的单核苷酸多态性标记,分析现存群体的遗传结构和遗传多... 详细信息

极小种群野生植物云南蓝果树是国家和云南省实施极小种群野生植物保护工程的代表性物种。为有效保护其遗传资源,本研究通过二代测序技术,对其进行简化基因组测序,开发一批特异性高的单核苷酸多态性标记,分析现存群体的遗传结构和遗传多样性。经过遗传变异检测,本次研究中共获得SNP位点98498个,通过样品最低测序深度>2,样品缺失率<0.5,次要基因型频率(MAF)>0.05筛选以后,得到有效SNP位点6309个。基于过滤后的SNP,运用生物信息学分析方法,对云南蓝果树完成了群体的遗传分析,其中:系统进化树分析将云南蓝果树划分为3大类,研究分析了云南蓝果树各分类的私人等位基因数目(Private)、平均观测杂合度(H o)、平均期望杂合度(H e)、核苷酸多样性(π)和平均近交系数(F IS)5个遗传多样性参数;群体结构和主成分分析进一步证明了,云南蓝果树现存植株之间亲缘关系较远,遗传多样性差异较大,具有很高的遗传资源保存价值。本研究结果将为基于遗传管理的云南蓝果树就地保护、遗传资源保存和种群重建等保护工程提供科学依据。

关键词：云南蓝果树简化基因组测序 SNP 群体遗传分析遗传管理

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干旱胁迫下AMF对云南蓝果树幼苗生长和光合特征的影响

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生态学报 2016年第21期36卷 6850-6862页

作者：张珊珊康洪梅杨文忠向振勇云南省林业科学院珍稀濒特森林植物保护和繁育国家林业局重点实验室昆明650201

采用盆栽试验与称重控水法,将土壤相对含水量分别控制在田间最大持水量的100%、91.68%、82.85%、60.00%、41.86%和21.28%,并在这6个不同的土壤相对含水量条件下,分别设添加苯菌灵(杀真菌剂)(低AMF)和不添加苯菌灵(高AMF)处理,研究干旱... 详细信息

采用盆栽试验与称重控水法,将土壤相对含水量分别控制在田间最大持水量的100%、91.68%、82.85%、60.00%、41.86%和21.28%,并在这6个不同的土壤相对含水量条件下,分别设添加苯菌灵(杀真菌剂)(低AMF)和不添加苯菌灵(高AMF)处理,研究干旱胁迫下AMF对极小种群野生植物云南蓝果树幼苗生长和光合特征的影响,揭示云南蓝果树濒危的微生物学机制,为云南蓝果树保护措施的制定与实施奠定基础。结果表明,添加苯菌灵处理显著降低了不同水分条件下的AMF侵染率,说明试验中AMF处理的实生苗在生长和光合特征上的差异是苯菌灵处理下侵染率下降导致的;随着干旱胁迫的加剧,云南蓝果树幼苗的根部AMF侵染率显著降低、叶面积等生长指标和净光合速率(Pn)等光合参数都发生显著变化;高AMF处理可以显著增加水分充足和轻度干旱胁迫条件下云南蓝果树幼苗的大部分生长指标和光合参数,而对重度胁迫下的云南蓝果树幼苗没有显著影响,说明重度干旱胁迫对其影响大于AMF的影响;另外,整合了可塑性指数分析和隶属函数分析两种方法对其抗旱性进行评价,云南蓝果树幼苗基本上无法通过调节形态和光合能力来适应水分环境的变化,但是高AMF处理可使云南蓝果树幼苗具有较强的可塑性和更强的抗旱性。实验结果为云南蓝果树的科学保育及种苗繁育提供了理论依据。

关键词：丛枝菌根真菌干旱胁迫生长指标光合特征云南蓝果树

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土壤水分和光强对景东翅子树幼苗生长及光合特性的影响

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植物研究 2022年第3期42卷 502-511页

作者：张珊珊袁春明云南省林业和草原科学院国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育国家林业局重点实验室/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室昆明650201

以1年生极小种群野生植物景东翅子树(Pterospermum kingtungense)实生苗为研究对象,通过双因子室内受控试验,设置6个土壤水分梯度(100%、90%、80%、60%、40%、30%田间持水量)和4个光强梯度(100%、75%、50%、25%自然光照),研究土壤水分... 详细信息

以1年生极小种群野生植物景东翅子树(Pterospermum kingtungense)实生苗为研究对象,通过双因子室内受控试验,设置6个土壤水分梯度(100%、90%、80%、60%、40%、30%田间持水量)和4个光强梯度(100%、75%、50%、25%自然光照),研究土壤水分和光强对其幼苗生长(地上部分生物量、地下部分生物量、叶片数量和株高)及光合特性[净光合速率(Pn)、蒸腾速率(Tr)、气孔导度(Gs)、胞间二氧化碳摩尔分数(Ci)、气孔限制值(Ls)和瞬时水分利用效率(WUE)]的影响。结果表明:(1)随着土壤水分的减少,景东翅子树幼苗的生长及光合指标呈现先升高后降低的趋势,一般会在田间持水能力W2(32.11%)或W3(28.54%)处理下达到峰值,W6(10.70%)条件下的生长状况最差。(2)随着光强的降低,除了Ls外,景东翅子树幼苗的4个生长指标及5个光合特性指标均表现出先增加后减少的趋势,且均在光强为L2(75%自然光照)或L3(50%自然光照)条件下表现最佳。(3)不同土壤水分和不同光强的综合评价得分显示,W2土壤水分和L2光强下的综合评价得分分别最高,证明适量的土壤水分环境和适度遮荫最适于景东翅子树幼苗的生长及其光合作用。(4)二元线性回归分析结果表明,土壤水分和光强这2个自变量分别对景东翅子树幼苗的生长和光合指标有较强的影响。研究结果可为景东翅子树的幼苗培育及其种群恢复与重建提供理论依据。

关键词：景东翅子树土壤水分光强天然更新

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云南省国家重点保护野生植物资源的现状与评价

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云南植物研究 2003年第2期25卷 181-191页

作者：李玉媛司马永康方波郭立群蒋宏赵文书云南省林业科学院/国家林业局云南珍稀濒危森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650204

报道了云南省于 1997年 5月至 2 0 0 1年 8月对我省 90种重点保护野生植物进行的资源调查结果 ,其中被列入《国家重点保护野生植物名录 (第一批 )》的 73种 ,国家I级保护植物 2 2种、国家II级保护植物 5 1种 ,其他保护植物 17种。云南... 详细信息

报道了云南省于 1997年 5月至 2 0 0 1年 8月对我省 90种重点保护野生植物进行的资源调查结果 ,其中被列入《国家重点保护野生植物名录 (第一批 )》的 73种 ,国家I级保护植物 2 2种、国家II级保护植物 5 1种 ,其他保护植物 17种。云南记录有分布而在本次调查中未找到的物种 3种。从本次调查的结果可看出 ,云南的国家重点保护植物种质资源丰富 ,种类几乎为全国的一半 ;但资源数量偏少 ,有 4 6种的占有面积不足 5km2 ;极危物种和濒危物种所占的比例大 ,极危物种 4 8种 ,濒危物种 37种 ;物种在各个地州间分布不均匀 ,绝大多数分布于滇东南和滇南 ,其中红河州 38种 ,文山州 36种 ;从海拔分布上看 ,主要分布于 10 0 0～ 2 0 0 0m之间。此外 ,由于物种分布的地点不同 ,物种受到保护的程度不同 ,人为影响方式也多种多样。根据云南省野生重点保护植物资源的特点及受到威胁的情况 ,提出了加强生态保护意识的教育和宣传 ,强化植物资源管理 ,积极开展植物资源的开发利用和繁育技术的研究以及集约栽培、综合利用及可持续经营牛式的研究 ,加强法制建设等对策和建议。

关键词：云南国家重点保护野生植物资源现状资源调查资源评价开发利用可持续经营法制建设

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应用简化基因组技术对富民枳遗传多样性检测

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东北林业大学学报 2020年第4期48卷 36-41页

作者：张珊珊陈剑杨文忠国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室(云南省林业科学院) 昆明650201

富民枳是云南特有的极小种群野生植物,野生资源仅剩15株。通过二代测序技术,对其进行简化基因组测序,开发一批特异性高的单核苷酸多态性标记,分析天然种群和回归种群的遗传多样性。经过遗传变异检测,共获得SNP位点491 189个,通过样品最... 详细信息

富民枳是云南特有的极小种群野生植物,野生资源仅剩15株。通过二代测序技术,对其进行简化基因组测序,开发一批特异性高的单核苷酸多态性标记,分析天然种群和回归种群的遗传多样性。经过遗传变异检测,共获得SNP位点491 189个,通过样品最低测序深度>2,样品缺失率<0.5、次要基因型频率(MAF)>0.05筛选以后,得到有效SNP位点41 077个。基于过滤后的SNP,运用生物信息学分析方法,对富民枳完成了群体的遗传多样性分析,研究分析了富民枳天然种群和回归种群的私人等位基因数目、平均观测杂合度(Ho)、平均期望杂合度(He)、核苷酸多样性(π)和平均近交系数(FIS)5个遗传多样性参数。结果表明,富民枳现存植株的遗传多样性较高,具有很高的遗传资源保存价值,但是回归种群的Ho值、He值、π值分别为0.398 3、0.291和0.330 6,分别仅是天然种群遗传多样性的87%、78%和73%,并未达到90%以上遗传多样性的标准。

关键词：富民枳简化基因组测序遗传多样性分析遗传管理

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土壤含水量对极小种群毛枝五针松幼苗抗氧化活性的影响

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热带亚热带植物学报 2016年第2期24卷 182-188页

作者：康洪梅张珊珊杨文忠方波云南省林业科学院国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

为探究水分对毛枝五针松（Pinuswangii）幼苗生理特性的影响，对不同土壤含水量下幼苗松针的抗氧化活性进行了研究。结果表明，土壤含水量为田问持水量的40％～80％时，其POD、SOD和CAT活性较强；随着处理时间的延长，细胞质膜渗透性减... 详细信息

为探究水分对毛枝五针松（Pinuswangii）幼苗生理特性的影响，对不同土壤含水量下幼苗松针的抗氧化活性进行了研究。结果表明，土壤含水量为田问持水量的40％～80％时，其POD、SOD和CAT活性较强；随着处理时间的延长，细胞质膜渗透性减弱，抗逆性变弱；脯氨酸、可溶性糖和蛋白质含量均以20％～40％的田问持水量较高；处理30d后丙二醛含量随着土壤含水量的增加而提高，在土壤含水量为田问持水量的40％时，丙二醛含量最低，抗逆性最强。因此，人工培育幼苗时，土壤水分过多的时间尽量不要超过30d，控制土壤水分为田问最大持水量的30％～50％，这样能提高幼苗存活率。

关键词：毛枝五针松土壤含水量幼苗生理特性

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基于ISSR遗传多样性分析的云南蓝果树保护措施探索

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植物遗传资源学报 2015年第3期16卷 664-669页

作者：向振勇张珊珊杨文忠康洪梅云南省林业科学院珍稀濒特森林植物保护和繁育国家林业局重点实验室昆明650201

保存种群的遗传多样性和进化潜力是成功拯救保护濒危物种的关键。云南蓝果树（Nyssa yunnanensis ***）是国家I级重点保护的极度濒危野生植物,也是国家实施极小种群野生植物保护工程的目的物种。为了制定针对性的保护措施,采用ISSR分子... 详细信息

保存种群的遗传多样性和进化潜力是成功拯救保护濒危物种的关键。云南蓝果树（Nyssa yunnanensis ***）是国家I级重点保护的极度濒危野生植物,也是国家实施极小种群野生植物保护工程的目的物种。为了制定针对性的保护措施,采用ISSR分子标记方法对64株极度濒危物种云南蓝果树子代个体进行遗传多样性分析。从100条引物中筛选出12条ISSR引物,共扩增出77个稳定、清晰的条带。其中58个为多态性条带,物种水平上的多态性条带百分率（PPL）变动范围为50.00%-87.50%,平均值为（74.65±0.01）%;等位基因观察值（Na）为1.7532;有效等位基因观察值（Ne）为1.5804;Nei＇s基因多样性指数（He）为0.3206,多态性信息含量指数（PIC）变动范围为0.15-0.44,平均值为0.27±0.01;Shannon＇s遗传多样性信息指数（I）随着样本数的增加而升高,但当样本数达到24及以上时,Shannon＇s指数的数值基本不再变化。基于遗传多样性分析结果,从地质历史原因和人为干扰因素等方面对云南蓝果树的濒危机制进行了探析,并提出了有针对性的云南蓝果树保护措施。

关键词：云南蓝果树 ISSR标记遗传多样性濒危机制科学保护

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牛樟芝非还原型聚酮合酶基因的克隆及表达分析

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中草药 2018年第20期49卷 4870-4876页

作者：原晓龙华梅陈剑陈中华王娟杨宇明王毅云南省林业科学院云南昆明650204 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650204 国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650204

目的获得牛樟芝聚酮合酶基因(Ac PKS1)全长,对其进行生物学分析并分析该基因在不同培养基上的表达差异。方法通过对牛樟芝基因组分析获得牛樟芝聚酮合酶基因,通过设计含有起始密码子和终止密码子的特异引物并以牛樟芝c DNA为模板克隆得... 详细信息

目的获得牛樟芝聚酮合酶基因(Ac PKS1)全长,对其进行生物学分析并分析该基因在不同培养基上的表达差异。方法通过对牛樟芝基因组分析获得牛樟芝聚酮合酶基因,通过设计含有起始密码子和终止密码子的特异引物并以牛樟芝c DNA为模板克隆得到Ac PKS1基因全长,并对该基因进行生物信息学分析及在不同培养基上的表达谱分析。结果 Ac PKS1全长6 348 bp,含有6个内含子和7个外显子,外显子编码2 115个氨基酸;通过生物信息学分析,推测该基因为真菌I型非还原型PKS,结构域为SAT-KS-PT-ACP-ACP-TE,系统树分析显示Ac PKS1与其他未知功能的聚酮合酶(PKS)聚为一支,说明Ac PKS1可能是一种新的聚酮化合物环化方式;表达谱分析表明,葡萄糖为Ac PKS1基因表达的必要条件,且葡萄糖含量与Ac PKS基因表达量呈正相关。结论本研究为Ac PKS1功能鉴定以及牛樟芝基因资源利用奠定基础。

关键词：牛樟芝聚酮合酶生物信息学分析表达谱 AcPKS1

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基因组步移技术克隆思茅松α-蒎烯合成酶基因及表达分析

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基因组学与应用生物学 2019年第6期38卷 2699-2705页

作者：王毅朱金鑫原晓龙陈伟李江云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室

蒎烯合成酶(α-pinene synthase, APS)是α-蒎烯生物合成的关键酶。本研究利用同源克隆及基因组步移法从思茅松中克隆得到一个α-蒎烯合成酶基因,命名为PkAPS (GenBank登录号为KX394684),基因全长3 523 bp,含有10个内含子,其c DNA全长1 ... 详细信息

蒎烯合成酶(α-pinene synthase, APS)是α-蒎烯生物合成的关键酶。本研究利用同源克隆及基因组步移法从思茅松中克隆得到一个α-蒎烯合成酶基因,命名为PkAPS (GenBank登录号为KX394684),基因全长3 523 bp,含有10个内含子,其c DNA全长1 956 bp,编码651个氨基酸残基。生物信息学分析显示PkAPS属于萜烯合成酶家族蛋白;系统进化树分析显示PkAPS与马尾松α-蒎烯合成酶亲缘关系最近。基因表达分析显示:PkAPS在高产脂思茅松个体各组织的表达量均高于低产产脂思茅松个体;而在高产脂思茅松不同组织中的表达比较中,PkAPS在小枝中的表达量最高。本研究将有利于进一步研究思茅松α-蒎烯合成酶调控机理及培育高产α-蒎烯思茅松新品种的研究。

关键词：思茅松(Pinus kesiya var. langbianensis) α-蒎烯合成酶基因组步移法荧光定量 PCR高产脂

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