检索结果-内蒙古大学图书馆

福建农林大学学报（自然科学版） 2021年第6期50卷 789-797页

作者：徐令文王毅郝佳波张雨赵敏赵川李贤忠陆斌西南林业大学林学院云南昆明650224 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

在深纹核桃(Julans sigillata ***)转录组数据中,鉴定萜烯合成酶的基因家族成员,并使用生物信息学方法分析其理化性质、蛋白结构,对不同状态下的表达模式进行分析.深纹核桃萜烯合成酶基因家族中含有65个基因,所含氨基酸176~852个,平均... 详细信息

在深纹核桃(Julans sigillata ***)转录组数据中,鉴定萜烯合成酶的基因家族成员,并使用生物信息学方法分析其理化性质、蛋白结构,对不同状态下的表达模式进行分析.深纹核桃萜烯合成酶基因家族中含有65个基因,所含氨基酸176~852个,平均分子质量62228,平均理论等电点值为5.72,除JsTPS6、JsTPS23、JsTPS56分布于叶绿体和细胞质内,其余均定位于叶绿体.转录组测序分析表明,33个JsTPS基因只在茎中表达,11个JsTPS基因只在叶中表达,JsTPS基因家族表达具有组织特异性.JsTPS66、JsTPS24、JsTPS30、JsTPS3、JsTPS31、JsTPS1基因只在环剥处理试验株的叶中高表达,JsTPS10、JsTPS7只在结果老树的茎、叶中表达,JsTPS70同时在环剥植株的茎和结果老树的叶中表达,且前者表达量高于后者.推测JsTPS70可能参与茎条防御相关生理活动,JsTPS66可能参与叶片防御相关生理活动.

关键词：深纹核桃转录因子萜烯合成酶表达分析

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竹叶花椒ZaGGPPS基因克隆与表达分析

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广西植物 2021年第4期41卷 598-605页

作者：关淑文王毅郝佳波原晓龙陆斌李贤忠西南林业大学林学院昆明650224 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

为了揭示竹叶花椒萜类代谢的分子机理及嫁接对其风味的影响,该文依据转录组数据设计特异性引物,采用RT-PCR方法从竹叶花椒(Zanthoxylum armatum)中克隆得到一个全新的牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(GGPPS)基因的全长cDNA序列,命名为ZaGG... 详细信息

为了揭示竹叶花椒萜类代谢的分子机理及嫁接对其风味的影响,该文依据转录组数据设计特异性引物,采用RT-PCR方法从竹叶花椒(Zanthoxylum armatum)中克隆得到一个全新的牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(GGPPS)基因的全长cDNA序列,命名为ZaGGPPS,并利用NCBI、ProParam、SignalP 4.1 server、DNAMAN和MEGA 7.0软件对ZaGGPPS基因进行生物信息学分析,并比较其在嫁接树和实生树中的表达量。结果表明:ZaGGPPS包含完整的cDNA开放阅读框(OFR),由1086 bp组成,编码361个氨基酸。其蛋白的相对分子量为39079.14 Da,理论等电点pI为6.38。Blast比对结果显示该蛋白质属于GGPPS家族蛋白,含有2个GGPPS蛋白特有的天冬氨酸富集基序,分别是“DDXXXXD”和“DDXXD”,以及5个特征性功能结构域。系统进化树结果显示竹叶花椒与芸香科植物甜橙(Citrus sinensis)、克里曼丁桔(***)、柚子(***)等亲缘关系较近。荧光定量PCR检测显示,ZaGGPPS基因在竹叶花椒中的表达量从高到低分别为实生树的叶、嫁接树的叶、实生树的茎、嫁接树的茎。牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶是竹叶花椒萜类化合物生物合成途径中的关键酶,通过嫁接可影响ZaGGPPS基因在叶和茎中的表达量。该文对竹叶花椒ZaGGPPS基因进行了克隆与分析,为后续深入研究竹叶花椒香气形成的分子机理及利用分子生物学手段选育优良品种提供理论依据。

关键词：竹叶花椒牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶克隆生物信息学分析

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水培条件下氮磷钾配比施肥对木荷幼苗生长的影响

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西部林业科学 2021年第4期50卷 88-94,112页

作者：罗婷康洪梅杨文忠张珊珊云南省林业和草原科学院云南昆明650201 云南省森林培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

为探究木荷幼苗生长对不同氮磷钾配比营养液的响应情况,为木荷壮苗培育合理施肥提供科学的理论依据,选择1月龄木荷幼苗作为试验材料,以Hoagland营养液为母液,进行氮磷钾3因素6水平缺素试验,在水培条件下研究不同氮磷钾配比对木荷幼苗生... 详细信息

为探究木荷幼苗生长对不同氮磷钾配比营养液的响应情况,为木荷壮苗培育合理施肥提供科学的理论依据,选择1月龄木荷幼苗作为试验材料,以Hoagland营养液为母液,进行氮磷钾3因素6水平缺素试验,在水培条件下研究不同氮磷钾配比对木荷幼苗生长的影响。结果表明:不同的氮磷钾营养液配比中,木荷幼苗的各项指标变化趋势基本一致,氮磷钾肥对木荷幼苗生长的影响表现为P>K>N,处理15表现最佳,处理12幼苗长势最差;木荷幼苗的株高、生物量、SOD、POD、CAT、SP均表现出随着施肥水平的提高先升高后降低的变化趋势,Pro和MDA在高水平施肥时显著增加。研究显示,以Hoagland液为水培营养液母液,氮磷钾水平分别为母液中氮磷钾元素浓度的1、1和0.5倍时,木荷幼苗生长最佳。

关键词：木荷幼苗水培营养氮磷钾肥生长指标生理指标

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桑黄9个萜类合成酶基因的鉴定及表达分析

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森林与环境学报 2021年第4期41卷 402-409页

作者：李云琴王毅张子蕴原晓龙杨焱杨文忠云南省林业和草原科学院云南昆明650201 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林草局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201 上海市农业科学院食用菌研究所上海201106

为了解高等药用真菌桑黄的萜类合成酶(TPS)基因的功能,从桑黄全基因组中分离获得TPS基因,并对其进行生物信息学分析、系统发育树构建,分析其在不同碳源和氮源培养条件下的表达情况。结果表明:在桑黄基因组中分离出9个SsTPS基因,除SsTPS... 详细信息

为了解高等药用真菌桑黄的萜类合成酶(TPS)基因的功能,从桑黄全基因组中分离获得TPS基因,并对其进行生物信息学分析、系统发育树构建,分析其在不同碳源和氮源培养条件下的表达情况。结果表明:在桑黄基因组中分离出9个SsTPS基因,除SsTPS2蛋白质没有特征基序外,其余SsTPS蛋白质均具有TPS的典型特征基序;二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。9个SsTPS聚为2个支系,初步推测SsTPS1为倍半萜合成酶,且可以催化合成α-muurolene;SsTPS3、SsTPS4、SsTPS5、SsTPS9属于倍半萜合成酶,SsTPS3和SsTPS5合成δ-cadinene的类似物或衍生物,SsTPS4和SsTPS9分别合成β-copaene、α-muurolene的类似物或衍生物;Ss TPS2为三萜合成酶。Ss TPS1、Ss TPS4、Ss TPS6基因在所有培养基中均不表达,其余基因呈现差异化表达,Ss TPS7仅在添加肌醇为碳源、大豆蛋白粉为氮源的培养基中低量表达;Ss TPS2、Ss TPS3、Ss TPS5、Ss TPS8、Ss TPS9分别在添加果糖为碳源、大豆蛋白粉为氮源、牛肉浸粉为氮源、酵母粉为氮源、香蕉粉为氮源的培养基中表达量最高。基因簇分析显示,Ss TPS1和Ss TPS4编码基因所在contig有基因簇的存在。

关键词：桑黄萜类合成酶生物信息学分析基因表达

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思茅松育苗试验及造林后效果分析

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西部林业科学 2022年第3期51卷 11-17页

作者：付玉嫔孟梦姜远标杨斌李杨涛唐红艳李倩贾平王琴燕云南省林业和草原科学院云南昆明650201 云南省森林植物培育与开发利用实验室云南昆明650201 云南康森林业技术咨询有限公司云南德宏687400 普洱市林业科学研究所云南普洱665000 思茅区思茅街道办事处农林水综合服务中心云南普洱665000

为重复检验思茅松苗期试验结果及其造林效果是否具有一致性,采用U_(15)*(5^(8))均匀设计,开展浸种、容器规格、基质施用缓释肥及叶面喷施氮肥等组合措施的思茅松育苗试验研究,结果显示:(1)容器规格和基质施用缓释肥为思茅松容器苗生长... 详细信息

为重复检验思茅松苗期试验结果及其造林效果是否具有一致性,采用U_(15)*(5^(8))均匀设计,开展浸种、容器规格、基质施用缓释肥及叶面喷施氮肥等组合措施的思茅松育苗试验研究,结果显示:(1)容器规格和基质施用缓释肥为思茅松容器苗生长的关键影响因子。在造林前后的3个时期不同因子对地径的影响均呈现相同的规律,主导因子依次为容器规格和缓释肥,径(地径或胸径)、高(苗高或树高)均随容器容积的增大而呈增大趋势,但对苗高的影响则略有不同,苗期缓释肥对苗高影响居于容器规格之前,思茅松造林后则以容器规格居前,总体上营养空间显著地影响苗期生长及造林后幼树的生长。(2)试验中以0.10 g/L的IBA溶液浸泡种子播种于基质施3.5 kg/m^(3)缓释肥的15.0 cm×24.0 cm无纺布容器中的处理措施效果最好,在苗龄107 d、造林6.5个月和2.5 a时,思茅松的地径/胸径、苗高/幼树高、分枝轮数和冠幅等指标在同一生长阶段中都显著优于其它试验处理,并且与2019年苗期重复试验的结果一致,验证了应用优质苗木造林,可提高林分质量和生长量的结论。本试验的最佳组合可作为思茅松容器苗标准化培育的技术措施应用于生产。

关键词：思茅松容器苗培育 IBA浸种容器规格缓释肥造林

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云南欧洲甜樱桃品种SSR鉴定及遗传多样性分析

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西南林业大学学报（自然科学） 2024年第6期44卷 72-80页

作者：杨跃仙段利武卯梅华王毅马山俊云南林业职业技术学院云南昆明650224 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

为了解云南省目前引种和栽培的欧洲甜樱桃品种情况及其遗传多样性状况,经过SSR标记的筛选,对云南省昆明市、马龙县、石林县、牟定县不同基地和资源圃的85份欧洲甜樱桃品种进行基因型鉴定和遗传多样性分析。结果表明:共筛选出16个稳定性... 详细信息

为了解云南省目前引种和栽培的欧洲甜樱桃品种情况及其遗传多样性状况,经过SSR标记的筛选,对云南省昆明市、马龙县、石林县、牟定县不同基地和资源圃的85份欧洲甜樱桃品种进行基因型鉴定和遗传多样性分析。结果表明:共筛选出16个稳定性好、高度多态性的SSR标记;85份欧洲甜樱桃品种中有71份品种都有不同程度的重复,剔除同物异名和异物同名的品种后,筛选出31份欧洲甜樱桃品种;31份品种用16个SSR标记共扩增出74个等位片段,有效等位基因(Ne)的大小为1.1027~3.8363,平均值为2.70,香农指数(I)范围为0.2245~1.5151,平均值1.1295。观测杂合度(Ho)的范围为0.0968~0.7742,平均值0.6250,多态信息含量(PIC)的范围为0.0931~0.7393,平均值0.5953。该研究结果表明云南省85份甜樱桃品种实为31个基因型,遗传多样性水平中等偏高。

关键词：甜樱桃品种鉴定遗传多样性 SSR

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外来入侵植物肿柄菊在云南的扩散风险研究

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广西植物 2021年第5期41卷 789-798页

作者：陈剑王四海朱枫袁春明云南省林业和草原科学院昆明650201 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物繁育和保护重点实验室昆明650201 西南林业大学地理与生态旅游学院昆明650224

预测外来入侵植物的潜在入侵范围以及对不同环境的适应性,能够为外来植物入侵提供预警和预防。该文通过实地调查肿柄菊(Tithonia diversifolia)在云南的入侵范围,以及收集世界其他地区分布点,结合12个关键环境变量,利用MaxEnt模型对肿... 详细信息

预测外来入侵植物的潜在入侵范围以及对不同环境的适应性,能够为外来植物入侵提供预警和预防。该文通过实地调查肿柄菊(Tithonia diversifolia)在云南的入侵范围,以及收集世界其他地区分布点,结合12个关键环境变量,利用MaxEnt模型对肿柄菊适生区范围和环境限制因子进行分析。结果表明:在世界范围适生区分布格局中,肿柄菊在云南无高适生区,次适生区总面积占全省总面积的3.58%,中适生区占32.90%,低适生区占42.80%,非适生区占20.72%;有扩散风险的区域主要为中适生区,普遍分布于云南省26°N以南地区;实地调查肿柄菊分布最高海拔2200 m,在海拔1000~1500 m分布最为密集,而模型预测显示海拔2000 m以下都适宜肿柄菊生长,且500~2000 m为最适宜海拔范围;在12个环境变量中年降雨量、人类足迹、年均温、海拔等环境变量对肿柄菊的分布起到了最重要的作用。综上结果表明,目前在云南肿柄菊零星的分布点已到达其潜在分布区的边缘,但已入侵区域还远小于潜在可入侵区域。为了预防肿柄菊在我国南方地区大面积扩散带来危害,有必要对其入侵和扩散态势进行监测。

关键词：外来入侵植物肿柄菊 MaxEnt模型环境变量扩散

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竹叶花椒MYB基因家族的鉴定及其表达特性的分析

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经济林研究 2021年第4期39卷 148-157页

作者：冯发玉王毅王丽娟罗玛妮娅徐令文杨彦萍陆斌西南林业大学林学院云南昆明650224 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201 云南省林业和草原科学院国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

【目的】利用测序获得的竹叶花椒Zanthoxylum armatum转录组数据,研究竹叶花椒中MYB转录因子家族的序列信息、进化模式、表达模式,探寻此家族中参与竹叶花椒皮刺生长发育的相关基因,为进一步揭示MYB转录因子家族生物学功能提供理论依据... 详细信息

【目的】利用测序获得的竹叶花椒Zanthoxylum armatum转录组数据,研究竹叶花椒中MYB转录因子家族的序列信息、进化模式、表达模式,探寻此家族中参与竹叶花椒皮刺生长发育的相关基因,为进一步揭示MYB转录因子家族生物学功能提供理论依据,为后续的无刺竹叶花椒品种的基因工程培育奠定理论基础。【方法】利用生物信息学方法,从测序获得的竹叶花椒转录组数据库中筛选MYB转录因子,对其蛋白基序、理化性质、系统进化关系、基因表达特性等进行分析,并利用qRT-PCR技术和基因克隆,对所选基因进行验证。【结果】从竹叶花椒中共鉴定出39条MYB转录因子序列,其中包括9个R1-MYB型基因、28个R2R3-MYB型基因、1个R3型基因和1个R4型基因。对其蛋白理化性质的分析结果表明:39个MYB转录因子所含氨基酸数量为101~621个,其均为可溶性蛋白,而其二级结构以无规则卷曲为主。亚细胞定位预测结果显示:39个MYB转录因子定位于细胞核的可能性最大,这符合转录因子调控下游基因的表达特性。基因表达情况的分析结果显示:部分MYB转录因子在竹叶花椒同一组织的不同发育时期的表达差异显著,其中ZaMYB10、ZaMYB23和ZaMYB25这3个基因的表达量随着皮刺的不断发育均呈逐渐增长的趋势,表明这3个基因可能与皮刺的生长发育相关。qRT-PCR分析结果表明:ZaMYB10基因在皮刺中有特异表达。基因克隆结果表明:ZaMYB10基因具有长为1032 bp的完整的cDNA开放阅读框,其编码343个氨基酸。【结论】鉴定出39个竹叶花椒MYB转录因子,其均包含SANT保守结构域,根据表达模式判断,其中的ZaMYB10转录因子可能参与了竹叶花椒皮刺生长发育的调控。

关键词：竹叶花椒 MYB 皮刺生物信息学分析基因表达分析

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迪庆州核桃种质资源的遗传多样性与遗传结构

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西部林业科学 2021年第2期50卷 71-77页

作者：陆婷陈少瑜吴涛肖良俊云南省林业和草原技术推广总站云南昆明650224 云南省林业和草原科学院经济林研究所云南昆明650201 云南省林业和草原科学院/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

利用SSR分子标记技术对云南省迪庆藏族自治州3个群体共161份深纹核桃种质资源进行遗传多样性分析,揭示资源的遗传多样性水平及遗传结构特征,为其保护和利用提供依据。结果表明:18对SSR引物对161份DNA样本进行扩增,共检测到171个等位基因... 详细信息

利用SSR分子标记技术对云南省迪庆藏族自治州3个群体共161份深纹核桃种质资源进行遗传多样性分析,揭示资源的遗传多样性水平及遗传结构特征,为其保护和利用提供依据。结果表明:18对SSR引物对161份DNA样本进行扩增,共检测到171个等位基因,平均每对引物9.5个。3个群体的观察杂合度(H_(o))和期望杂合度(H_(e))的变化范围分别为0.390~0.580和0.580~0.619,平均值分别为0.467和0.598;Shannon信息指数(I)介于1.153~1.313之间,平均为1.231,数据表明迪庆州核桃种质资源的遗传多样性属于中等水平。群体间的遗传分化系数(F_(ST))介于0.0052~0.2253之间,平均为0.0652,表明遗传变异主要来源于群体内的个体,仅有6.52%来源于群体间,各位点的基因流(N_(m))平均为4.2663(N_(m)>1),群体间的基因交流阻止了群体间的分化。STRUCTURE分析将161份核桃资源分成3个类群,而基于Nei’s遗传距离的UPGMA聚类将3个群体划分成2组,维西和香格里拉聚为一组,德钦单独为一组。

关键词：深纹核桃种质资源遗传多样性遗传结构 SSR分子标记

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基于林分关键指标的云南省云南松地理分布格局

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西部林业科学 2021年第1期50卷 19-26页

作者：陈剑杨文忠张珊珊王有兵王磊郑畹王生李建伟云南省林业和草原科学院云南珍稀濒特森林植物保护和繁育国家林草局重点实验室云南昆明650201 云南省林业调查规划院大理分院云南大理671000 云南省林业和草原科学院云南昆明650201 云南省林业和草原科学院森林植物培育与开发利用省级重点实验室云南昆明650201

云南松是云南省重要的森林资源,其林分普遍存在退化情况,对其提质增效已是紧迫的任务,但目前尚缺乏全省云南松林分质量及其地理分布格局的定量评价作为参考。本文用MaxEnt模型,结合350个云南松分布点和47个环境变量,获得云南松适生区范... 详细信息

云南松是云南省重要的森林资源,其林分普遍存在退化情况,对其提质增效已是紧迫的任务,但目前尚缺乏全省云南松林分质量及其地理分布格局的定量评价作为参考。本文用MaxEnt模型,结合350个云南松分布点和47个环境变量,获得云南松适生区范围;并通过Arcgis 10.2平台,在云南松适生范围区内对1500个云南松小班的3个关键指标,即公顷蓄积、年龄、生长速度进行插值和分级计算,获得全省范围内各指标分级及其地理分布格局。结果显示:总体上,云南松林分的公顷蓄积、生长速度处于较低的等级,而年龄结构为衰退型;生境退化、优良种源丧失、自然演替被打断等因素,是造成云南松在整体分布上年龄结构不合理、生长速度慢和公顷蓄积低等退化特征的原因;建议对现有云南松林进行提质增效,对优良种源进行集中经营,促进地带性植被演替进程的恢复。本研究为云南省森林资源的可持续经营提供参考。

关键词：云南松林分关键指标分布格局公顷蓄积年龄结构生长速度

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