检索结果-内蒙古大学图书馆

西部林业科学 2018年第2期47卷 21-25,38页

作者：原晓龙陈剑华梅李云琴王娟杨宇明王毅云南省林业科学院云南昆明650201 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

为了挖掘岩生树花地衣型真菌转录组数据中的NRPS基因,找出其潜在化合物或蛋白,以岩生树花地衣型真菌的转录组数据为基础,分析获得一个新的NRPS基因(Ri NRPS)。利用BLAST比对、分子系统进化及anti SMASH、NRPS predictor、Na PDo S、Nor... 详细信息

为了挖掘岩生树花地衣型真菌转录组数据中的NRPS基因,找出其潜在化合物或蛋白,以岩生树花地衣型真菌的转录组数据为基础,分析获得一个新的NRPS基因(Ri NRPS)。利用BLAST比对、分子系统进化及anti SMASH、NRPS predictor、Na PDo S、Norine等生物信息学分析手段对岩生树花地衣型真菌Ri NRPS基因进行分析,结果显示,Ri NRPS基因相对分子质量为702 699.9,等电点5.83,为不稳定蛋白;其开放阅读框总长19 098bp,编码6 362个氨基酸;该蛋白不存在信号肽,为非分泌蛋白,定位于细胞质基质中;可能合成HC-toxin合成酶,可能的催化反应是以Orn(鸟氨酸)、Gln(谷氨酰胺)、Gln(谷氨酰胺)、Cys(半胱氨酸)4个氨基酸作为底物合成环状四肽,此环状四肽可能是一种具毒素活性的多肽、其结构式为C21H32N4O6。研究结果为以后岩生树花NRPS基因的挖掘及非核糖体多肽类物质的生物合成提供参考。

关键词：岩生树花 RiNRPS基因 HC-toxin合成酶生物信息学分析

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牛樟干旱与低温胁迫相关NAC转录因子的鉴定及表达分析

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基因组学与应用生物学 2022年第2期41卷 363-371页

作者：张璋王毅罗玛妮娅王丽娟冯发玉原晓龙郑元西南林业大学林学院昆明650224 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

NAC蛋白是最大的植物特异性转录因子家族之一,在植物响应生物胁迫和非生物胁迫中具有重要作用。本研究利用二代转录组测序获得牛樟干旱及低温胁迫的转录组数据,并利用本土BLAST从基因组数据中获得牛樟全基因组78个CkNAC转录因子序列,利... 详细信息

NAC蛋白是最大的植物特异性转录因子家族之一,在植物响应生物胁迫和非生物胁迫中具有重要作用。本研究利用二代转录组测序获得牛樟干旱及低温胁迫的转录组数据,并利用本土BLAST从基因组数据中获得牛樟全基因组78个CkNAC转录因子序列,利用分析软件进行保守基序分析。利用转录组分析获得与干旱和低温胁迫相关的CkNAC,进行系统进化和相关基因荧光定量PCR验证。牛樟NAC基因表达谱数据分析发现,有18个基因在受干旱、低温胁迫时表达差异显著,占牛樟NAC家族的23.1%,其中10个基因受干旱胁迫呈高表达水平,占上调基因的55.6%。将14个牛樟NAC转录因子与8个具有抗旱、抗寒NAC蛋白共同构建系统发育进化树,结果显示22个NACs蛋白聚为Ⅰ类和Ⅱ类,参与干旱和低温胁迫的蛋白集中在Ⅰ类。Ⅰ类中CkNAC14、CkNAC23、CkNAC44和CkNAC70分别和参与干旱胁迫的普通小麦(Triticum aestivum)TaNAC67、梭梭(Haloxylon ammodendron)HaNAC38、拟南芥(Arabidopsis thaliana)ANAC072和大豆(Glycine max)GmNAC20聚为一支,其中CkNAC44和CkNAC70与ANAC072和GmNAC20的相似性分别为59.0%和58.2%,推测CkNAC14、CkNAC23、CkNAC44和CkNAC70可能参与调控牛樟在干旱逆境下的反应。利用RT-qPCR技术检测牛樟NAC基因在不同逆境胁迫中的表达变化,结果显示,CkNAC14、CkNAC23、CkNAC44和CkNAC70受干旱胁迫诱导显著上调。本研究基于牛樟高通量转录组数据,探究牛樟NAC转录因子家族生物学特性,为深入研究牛樟NAC基因的非生物胁迫调控提供科学依据。

关键词：牛樟 NAC转录因子转录组分析干旱与低温胁迫

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牛樟芝actri5基因的克隆与最佳表达培养基的筛选

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西部林业科学 2019年第5期48卷 76-80,88页

作者：原晓龙李云琴王毅国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201 云南省林业和草原科学院云南昆明650201

为探讨牛樟芝单端孢霉二烯合酶( actri5 )基因与单端孢霉烯类化合物间的关系,从牛樟芝基因组中分离并克隆 actri5 基因,对其进行生物信息学分析和表达谱分析,以获得该基因的最佳表达培养基。结果表明, actri5 基因含5个外显子、4个内含... 详细信息

为探讨牛樟芝单端孢霉二烯合酶( actri5 )基因与单端孢霉烯类化合物间的关系,从牛樟芝基因组中分离并克隆 actri5 基因,对其进行生物信息学分析和表达谱分析,以获得该基因的最佳表达培养基。结果表明, actri5 基因含5个外显子、4个内含子,其蛋白与根纤维孔菌( Fibroporia radiculosa, XP_012177824 )的TRI5蛋白的一致性为46%;ACTRI5蛋白不含信号肽,无跨膜结构,定位于细胞质基质的内质网上;序列比对分析显示该蛋白含有Mg2+绑定位点(DDXXX)、焦磷酸与二价离子螯合区域(NDXXSFYKE)及FPP结合基序(XXRYRL)3个保守结构域;聚类分析结果显示牛樟芝ACTRI5与绣球菌TRI5( SparassiScrispa, XP_027613108 )、变色栓菌TRI5( TrameteSversicolor, XP_008037460 )、球孢白僵菌TRI5( Beauveria bassiana, XP_008596951 )、里氏木霉TRI5( Trichoderma reesei, XP_006964535 )和 AspergilluScostaricaensiSTRI5( XP_025537855 )聚为一支,该分支均编码单端孢霉二烯合酶;actri5 基因在以果糖为碳源添加物及以番茄浸粉、酪蛋白胨和胰蛋白胨为氮源添加物的培养基上表达,而在其他培养基上不表达。本研究为牛樟芝中 tri5 基因功能的进一步研究、单端孢霉烯族化合物检测和异源表达奠定基础。

关键词：牛樟芝单端孢霉二烯合酶生物信息学分析基因功能鉴定

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基于SSR标记的云南省核桃种质资源遗传多样性及核心种质构建

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植物遗传资源学报 2020年第3期21卷 767-774页

作者：吴涛陈少瑜肖良俊宁德鲁潘莉贺娜朱云凤云南省林业和草原科学院/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室昆明650201 云南省林业和草原科学院经济林研究所昆明650201

利用SSR分子标记技术对云南省14个州市1061份核桃种质资源进行遗传多样性分析,在此基础上,通过最小距离逐步取样法构建核心种质并进行了核心种质的多样性检测。结果表明,19对SSR引物共检测到322个等位基因,每对引物平均16.95个,Shannon... 详细信息

利用SSR分子标记技术对云南省14个州市1061份核桃种质资源进行遗传多样性分析,在此基础上,通过最小距离逐步取样法构建核心种质并进行了核心种质的多样性检测。结果表明,19对SSR引物共检测到322个等位基因,每对引物平均16.95个,Shannon信息指数(I)平均为1.3375,期望杂合度(He)平均为0.6040,Nei′s遗传多样性指数(Nei)平均为0.6043,数据表明云南核桃种质资源具有较为丰富的遗传多样性。遗传多样性在各州市分布不均,其中,迪庆州核桃资源的遗传多样性相对最高,最低的是临沧地区。基于遗传距离的UPGMA聚类结果,以5%~30%的取样比例分别构建初级种质(PC)、次级种质(SC)、核心种质-1(CC-1)、核心种质-2(CC-2)等4个核心种质,经遗传多样性分析及t检验,最终确定10.84%取样比例、115份样本量的核心种质-1(CC-1)为云南核桃资源的核心种质。

关键词：核桃 SSR分子标记种质资源遗传多样性核心种质

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七彩红竹二氢黄酮醇4-还原酶基因IhDFR1的克隆及表达分析

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植物生理学报 2014年第4期50卷 447-452页

作者：缪福俊陈剑孙浩王毅王晨晨原晓龙杨宇明王娟云南省林业科学院、国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室、云南省森林植物培育与开发利用重点实验室昆明650201 中国科学院沈阳应用生态研究所沈阳110016 西南林业大学林学院昆明650224

二氢黄酮醇4-还原酶(DFR)是植物花色素苷合成途径中的关键酶,在植物花色的形成过程中起重要作用。依据七彩红竹转录组数据设计特异引物,采用RT-PCR技术从七彩红竹中克隆获得了一个新的DFR基因cDNA全长,命名为IhDFR1(登录号为KF728205)... 详细信息

二氢黄酮醇4-还原酶(DFR)是植物花色素苷合成途径中的关键酶,在植物花色的形成过程中起重要作用。依据七彩红竹转录组数据设计特异引物,采用RT-PCR技术从七彩红竹中克隆获得了一个新的DFR基因cDNA全长,命名为IhDFR1(登录号为KF728205)。序列分析结果表明,IhDFR1基因cDNA全长945 bp,编码314个氨基酸。生物信息学预测显示,该基因编码的蛋白具有典型的DFR蛋白功能结构域,存在2个特异结合位点,属于非Asn/Asp型DFR酶,与禾本科植物中的DFR具有较高的相似性。对不同发育时期七彩红竹的IhDFR1基因进行时空表达的结果显示,只有在竹秆颜色呈现红紫色时,IhDFR1基因才有表达。以上结果初步显示IhDFR1蛋白可能作为一个重要的酶参与竹秆花色素苷的代谢调控,同时为进一步研究七彩红竹花色素苷产生的分子机理和综合开发利用奠定了基础。

关键词：七彩红竹花色素苷二氢黄酮醇4-还原酶基因表达

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乳油木幼苗对不同水分胁迫强度的生理响应

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西部林业科学 2020年第6期49卷 21-27页

作者：罗婷裴艳辉云南省林业和草原科学院云南昆明650201 国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201

为了探明不同的水分胁迫强度下乳油木幼苗的生理响应机制,以及其生长发育过程中的需水关键期和适宜的浇水量,以乳油木幼苗为试验材料,设置两组不同的盆栽水分胁迫试验进行研究。结果表明,不同强度干旱胁迫试验中,叶片SOD酶活性变化幅度... 详细信息

为了探明不同的水分胁迫强度下乳油木幼苗的生理响应机制,以及其生长发育过程中的需水关键期和适宜的浇水量,以乳油木幼苗为试验材料,设置两组不同的盆栽水分胁迫试验进行研究。结果表明,不同强度干旱胁迫试验中,叶片SOD酶活性变化幅度较大,土壤相对含水量从26%下降到15%时,酶活性显著降低了74.6%;POD、CAT酶活性无明显变化趋势。不同土壤水分胁迫试验中,叶片的SOD酶活性变化差异性显著,在土壤相对含水量达到40%时活性最大;POD、CAT酶活性变化不显著;叶片MDA含量在土壤相对含水量40%时最低。到胁迫后期,两组试验乳油木幼苗叶片的脯氨酸含量显著增加,说明脯氨酸积累对干旱胁迫反应较可溶性糖和可溶性蛋白更为强烈和敏感。研究表明,在土壤相对含水量40%左右时较适宜乳油木幼苗生长,土壤相对含水量26%左右是乳油木幼苗生长的需水关键期。

关键词：乳油木水分胁迫干旱胁迫生理变化

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施肥对云南蓝果树幼苗抗旱生理指标的影响

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中南林业科技大学学报 2021年第2期41卷 54-62页

作者：罗婷杨文忠张珊珊云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201 云南省林业和草原科学院国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

【目的】为了解不同氮磷钾配比施肥条件下云南蓝果树的抗旱性生理特征,建立云南蓝果树幼苗最佳施肥技术方案,为其种苗繁育提供理论依据,进而促进其保护措施的有效实施。【方法】以云南蓝果树1年生幼苗为研究对象,根据"3414"... 详细信息

【目的】为了解不同氮磷钾配比施肥条件下云南蓝果树的抗旱性生理特征,建立云南蓝果树幼苗最佳施肥技术方案,为其种苗繁育提供理论依据,进而促进其保护措施的有效实施。【方法】以云南蓝果树1年生幼苗为研究对象,根据"3414"肥料效应试验设计,研究不同氮磷钾配比施肥对云南蓝果树幼苗可溶性蛋白(SP)、超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)、过氧化氢酶(CAT)、脯氨酸(Pro)和丙二醛(MDA)6个生理指标的影响。【结果】除丙二醛外,其余测定指标在施肥处理条件下的值均高于不施肥处理,整体表现为不施肥(N0P0K0)<缺氮(N0P2K2)<缺钾(N2P2K0)<缺磷(N2P0K2),说明云南蓝果树幼苗抗旱性生理指标对氮肥的依赖性最强,其次是钾肥和磷肥;氮磷钾配施时,中氮中磷低钾(N2P2K1)水平下的值最优;根据拟合的一元二次方程,云南蓝果树幼苗的试验理论最佳氮、磷、钾施肥量分别为5.28、0.99和2.97 g/株;肥效的发挥还受到三者彼此间互作的影响,在中氮、低钾(N2K1)水平时利于磷肥肥效的发挥,中氮、中磷(N2P2)水平时利于钾肥肥效的发挥,中磷、低钾(P2K1)水平利于氮肥肥效的发挥,这与中氮中磷低钾(N2P2K1)水平下云南蓝果树抗旱性指标最优是一致的。【结论】适当施肥会增强云南蓝果树幼苗的生理生化过程,中氮、中磷、低钾水平处理下表现最好。

关键词： “3414”施肥试验云南蓝果树生理指标抗旱性极小种群植物

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丽江云杉体胚发生过程差异蛋白分析

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生物技术通报 2011年第12期27卷 117-122页

作者：陈少瑜吴涛陈芳王寅冰易善军云南省林业科学院国家林业局云南省珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室云南省森林植物培育与利用重点实验室昆明650204 西南林学院昆明650224

以丽江云杉非胚性愈伤组织、胚性愈伤组织以及体胚发育过程的球型胚、鱼雷胚和子叶胚培养物为材料,采用双向电泳技术对体胚发生过程中特异表达蛋白进行分析。结果表明,丽江云杉非胚性、胚性愈伤组织及不同发育阶段体胚的蛋白质种类丰富(... 详细信息

以丽江云杉非胚性愈伤组织、胚性愈伤组织以及体胚发育过程的球型胚、鱼雷胚和子叶胚培养物为材料,采用双向电泳技术对体胚发生过程中特异表达蛋白进行分析。结果表明,丽江云杉非胚性、胚性愈伤组织及不同发育阶段体胚的蛋白质种类丰富(1 857-2 344个),胚性愈伤及发育体胚蛋白种类多于非胚性愈伤,球型胚蛋白种类最为丰富(2 344个)。非胚性、愈伤组织及各发育阶段体胚共检测到44个差异表达蛋白,它们有明显的变化特点,子叶胚阶段的差异蛋白变化最为显著(23个,占特异蛋白总数的52.3%),鱼雷胚新出现大比例的分子量小于30 kD、pI为6.0左右的弱酸性小分子量特异蛋白(8个,占此阶段特异蛋白总数的88.9%),这些体胚发育晚期特异表达蛋白可能与体胚形态建成有密切关系。

关键词：丽江云杉体细胞胚胎发生胚性愈伤组织双向电泳技术差异蛋白

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神黄豆苗木生长节律和根系生长研究

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西部林业科学 2023年第2期52卷 138-143页

作者：呼延丽郝佳波王飞陆斌云南省林业和草原科学院云南昆明650201 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

斑色花是景颇族的吉祥树。以神黄豆1 a生实生苗为材料,通过苗高、地径的年生长量观测,进行生长节律模型拟合、划分其生长阶段;选取苗龄4个月不同育苗方式的容器苗,用根系分析系统分析根系。结果显示:神黄豆1 a生实生苗苗高和地径Logisti... 详细信息

斑色花是景颇族的吉祥树。以神黄豆1 a生实生苗为材料,通过苗高、地径的年生长量观测,进行生长节律模型拟合、划分其生长阶段;选取苗龄4个月不同育苗方式的容器苗,用根系分析系统分析根系。结果显示:神黄豆1 a生实生苗苗高和地径Logistic方程拟合效果好。生长节律表现出“慢—快—慢”的阶段性节律,可用其对神黄豆苗高、地径的生长开展分析和预测;神黄豆幼苗生长阶段划分为4个时期,即出苗期、生长初期、速生期和生长后期;相同苗龄不同育苗方式的根系生长指标差异显著,结果显示根系总长度、根尖数、分叉数相关性极显著。

关键词：神黄豆生长模型生长阶段根系分析

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橙黄硬皮马勃菌种的分离纯化及其菌根的人工合成

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中南林业科技大学学报 2022年第7期42卷 1-8,66页

作者：张珊珊杨文忠云南省林业和草原科学院国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201

【目的】为分离纯化菌根食用菌橙黄硬皮马勃的菌种,促进云南松无菌苗菌根的人工合成,实现云南松菌根化苗木的定向培育和菌根食用菌的人工驯化栽培。【方法】采用子实体组织分离法和综合PDA培养基对橙黄硬皮马勃子实体进行菌种分离,对其... 详细信息

【目的】为分离纯化菌根食用菌橙黄硬皮马勃的菌种,促进云南松无菌苗菌根的人工合成,实现云南松菌根化苗木的定向培育和菌根食用菌的人工驯化栽培。【方法】采用子实体组织分离法和综合PDA培养基对橙黄硬皮马勃子实体进行菌种分离,对其子实体、组织分离菌株和菌根菌的核糖体转录间隔区片段(ITS)进行分子鉴定,研究不同栽培基质条件下的接种处理对云南松菌根合成及其幼苗生长的影响。【结果】1)从邻接法构建的系统发育树上可以看出,采集的子实体、组织分离菌株和菌根菌确认为橙黄硬皮马勃。2)接种处理后的云南松幼苗生长指标显著高于未接种处理,而且在不同基质处理间差异显著,其中在蛭石和珍珠岩和泥炭土(质量比10:1:5)的混合基质中均表现最优。3)橙黄硬皮马勃在此混合基质中的菌根侵染率、菌根依赖性和菌根贡献率均最高,分别为92.66%、292.86%和65.85%,显著高于其他两种基质处理,可能是橙黄硬皮马勃菌丝更适宜生长在该混合基质,进而利于云南松无菌苗的菌根合成,也间接促进了云南松幼苗的生长。【结论】橙黄硬皮马勃菌种的分离纯化和菌根合成基质的筛选是云南松无菌苗菌根合成的关键。

关键词：菌根食用菌 ITS序列验证栽培基质菌根合成

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