检索结果-内蒙古大学图书馆

分子植物育种 2022年第21期20卷 7025-7035页

作者：张璋王毅罗玛妮娅郑元西南林业大学林学院昆明650224 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

WRKY转录因子是植物逆境研究中最广泛的家族之一,在植物响应生物胁迫和非生物胁迫中具有重要作用。本研究利用本地BLAST对牛樟基因组进行比对分析得到58个牛樟WRKY基因序列,并对牛樟WRKY转录因子进行理化性质、保守基序、系统进化及表... 详细信息

WRKY转录因子是植物逆境研究中最广泛的家族之一,在植物响应生物胁迫和非生物胁迫中具有重要作用。本研究利用本地BLAST对牛樟基因组进行比对分析得到58个牛樟WRKY基因序列,并对牛樟WRKY转录因子进行理化性质、保守基序、系统进化及表达谱分析。保守结构域和基序预测发现,牛樟转录因子家族蛋白主要分为三大类,即Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ类,多数蛋白较保守,其中Ⅰ、Ⅱ类中有两个蛋白(CkWRKY25,CkWRKY1)存在Q残基的变异;CkWRKY基因表达谱数据分析发现,有22个基因在受干旱、低温胁迫时上调表达,占牛樟WRKY家族的37.9%,其中18个基因受干旱胁迫呈高表达水平,占上调基因的81.8%,4个基因在4℃低温胁迫下表达量显著升高,占比18.2%。将牛樟中22个表达差异显著的基因与14个具有抗旱、抗寒WRKY基因共同建树,结果显示36个WRKYs蛋白聚为两大类,参与干旱及低温胁迫的蛋白主要集中在第一大类中,其中CkWRKY26、CkWRKY38、CkWRKY39、CkWRKY45、CkWRKY55分别和参与干旱胁迫的蛋白聚为一支,且C端锌指结构均为C2H2;CkWRKY20、CkWRKY54和参与低温胁迫中陆地棉的GhWRKY62、毛果杨的PtWRKY34、西洋参的PqWRKY7、旱地棉的GaWRKY28、陆地棉的GhWRKY73以及小麦的TaWRKY19和TaWRKY10聚为一支。本研究基于牛樟高通量转录组数据,探究牛樟WRKY转录因子家族生物学特性,为深入研究牛樟WRKY基因非生物胁迫调控提供科学依据。

关键词：牛樟 WRKY转录因子转录组分析干旱与低温胁迫

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深纹核桃WRKY转录因子的全基因组鉴定与分析

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分子植物育种 2022年第23期20卷 7737-7750页

作者：徐令文王毅王丽娟郝佳波张雨李贤忠陆斌西南林业大学林学院昆明650224 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

WRKY是一类存在于植物中的转录因子,参与激素调节通路,与植物生长发育有关。基于深纹核桃转录组测序数据,本研究利用NCBI在线工具筛选蛋白结构域,获得深纹核桃WRKY转录因子基因序列。通过生物信息学方法进行分析,结果表明,共发掘88个JsW... 详细信息

WRKY是一类存在于植物中的转录因子,参与激素调节通路,与植物生长发育有关。基于深纹核桃转录组测序数据,本研究利用NCBI在线工具筛选蛋白结构域,获得深纹核桃WRKY转录因子基因序列。通过生物信息学方法进行分析,结果表明,共发掘88个JsWRKY转录因子,根据结构域数目和锌指结构可以分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ类型,氨基酸大小为104~981 aa,平均分子质量为45 503.23,平均理论等电点(pI)值为7.334 5,其中88个转录因子脂肪系数(Aliphatic index)均小于100,均不具有信号肽和跨膜结构;87个WRKY转录因子为不稳定蛋白,除了JsWRKY7定位于细胞核和细胞质,其余87个JsWRKY转录因子均定位于细胞核。转录组测序分析显示JsWRKY转录因子在6年生的Juglans sigillata cv. Xixiang嫁接树进行环剥与不进行无环剥、结果的老树3种条件下,除了3个基因(JsWRKY19, Js WRKY75, JsWRKY84)不表达,其余基因在茎、叶中的表达均有变化,其中JsWRKY42、JsWRKY18、JsWRKY55、JsWRKY34、JsWRKY88、JsWRKY59、JsWRKY43、JsWRKY78基因只在结果的老树叶片中高表达;JsWRKY32、JsWRKY47、JsWRKY67、JsWRKY51、JsWRKY61、JsWRKY79、JsWRKY9、JsWRKY63、JsWRKY73、JsWRKY44、JsWRKY33、JsWRKY7、JsWRKY68、JsWRKY45仅于无环剥处理的茎中高表达;JsWRKY27、JsWRKY77、JsWRKY86、JsWRKY80只在环剥处理的茎中高表达;JsWRKY20、JsWRKY21、JsWRKY58只在老树的茎、叶中表达;JsWRKY46、JsWRKY65、JsWRKY56只在有环剥、无环剥处理下茎、叶中表达。本研究结果为进一步挖掘JsWRKY转录因子功能及其分子生物学研究奠定了基础,同时为进一步研究其他植物WRKY转录因子的家族特征提供理论依据。

关键词：深纹核桃(Juglans sigillata) 基因组 WRKY转录因子表达分析

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基于油橄榄全基因组参与水胁迫NAC基因的鉴定及表达分析

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分子植物育种 2023年第3期21卷 736-746页

作者：王丽娟王毅李贤忠张璋冯发玉胡青陆斌西南林业大学林学院昆明650224 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

本研究以干旱和水淹胁迫中的‘佛奥’和‘TYZ-1号’2个油橄榄品种苗木为试材,基于油橄榄全基因组数据,鉴定出36个油橄榄NAC转录因子家族成员,利用生物信息学软件进行结构及功能预测,将油橄榄OeNAC蛋白与模式植物拟南芥AtNAC蛋白构建进... 详细信息

本研究以干旱和水淹胁迫中的‘佛奥’和‘TYZ-1号’2个油橄榄品种苗木为试材,基于油橄榄全基因组数据,鉴定出36个油橄榄NAC转录因子家族成员,利用生物信息学软件进行结构及功能预测,将油橄榄OeNAC蛋白与模式植物拟南芥AtNAC蛋白构建进化树。结果表明OeNAC转录因子分为两个大类和14个亚家族,14个亚家族中有13个亚族同时包含了油橄榄和拟南芥NAC蛋白,说明拟南芥和油橄榄的NAC家族在进化水平上有一定的相似性。结合油橄榄水分胁迫(干旱,水淹)基因表达谱,分析出8个NAC转录因子(OeNAC31,OeNAC33,Oe NAC25,Oe NAC30,OeNAC7,OeNAC23,OeNAC20,OeNAC1)在‘佛奥’和‘TYZ-1号’中均呈现高表达且对水分胁迫均有响应,推测这8个基因是油橄榄水分调节的主要基因。将在水分胁迫下具有表达量的Oe NAC蛋白与已知水分胁迫相关的NAC转录因子构建进化树发现8个胁迫相关的转录因子中的Oe NAC31与已知的水分调控因子支持率更高,表明OeNAC31转录因子可能是参与油橄榄水分调控的最主要基因,其在两个品种中都有不同的表达量,这可能是‘佛奥’和‘TYZ-1号’抗性不同的原因。本研究通过油橄榄转录组测序,对油橄榄NAC转录因子进行全基因组鉴定、蛋白理化性质、系统发育、保守元件及基因表达谱分析,探究油橄榄NAC转录因子在‘TYZ-1号’和‘佛奥’中基因表达模式,也为油橄榄NAC基因家族的功能验证及水胁迫反应关键基因的挖掘提供参考。

关键词：油橄榄 NAC转录因子生物信息学基因表达谱水分胁迫

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1个含有SDR结构域PKS/NRPS基因的克隆

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浙江农林大学学报 2019年第6期36卷 1247-1253页

作者：原晓龙李娟李云琴王毅云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650204 云南大学中草药生物资源研究所云百草实验室云南昆明650091

聚酮和非核糖体多肽的复合化合物具有独特的生理活性,它们由聚酮合酶/非核糖体肽合成酶(PKS/NRPS)催化合成。目前球孢白僵菌Beauveria bassiana中含SDR结构域的PKS/NRPS酶的生物合成机制尚不清楚,采用基因挖掘技术从球孢白僵菌基因组中... 详细信息

聚酮和非核糖体多肽的复合化合物具有独特的生理活性,它们由聚酮合酶/非核糖体肽合成酶(PKS/NRPS)催化合成。目前球孢白僵菌Beauveria bassiana中含SDR结构域的PKS/NRPS酶的生物合成机制尚不清楚,采用基因挖掘技术从球孢白僵菌基因组中分离得到1个PKS/NRPS基因(命名Bbpks2),利用生物信息学分析对其功能进行预测并检测该基因在以6.0 g·L^-1麦芽提取物和3.0 g·L^-1酵母提取物为基本氮源培养基,7种碳源添加物和以1.8 g·L^-1麦芽糖和6.0 g·L^-1葡萄糖为基本碳源培养基,4种氮源添加物培养基上的具体表达情况,其中每种添加物含量为4.0 g·L^-1。结果显示:Bbpks2基因长度为12 051 bp,编码4 016个氨基酸;其结构域组织顺序为KS-AT-DH-MT-KR-ACP-C-A-PP-SDR,是一种含有SDR结构域的PKS/NRPS;系统进化分析发现,BbPKS2与球孢白僵菌JEF007菌株(PMB64475.1)、头状虫草Tolypocladium capitatum(PNY25600.1)等的PKS/NRPS蛋白聚在同个分支中,可能参与一种聚酮/非核糖体多肽类化合物的生物合成;比较不同氮源、碳源添加物对Bbpks2基因表达的影响,发现该基因在添加了乳糖的培养基上的表达量是其他碳源添加物的3.4倍以上,添加了牛肉浸粉的培养基上表达量是其他氮源添加物的1.3倍以上。该研究为下一步通过异源表达鉴定Bbpks2基因的具体功能,及其调控机理研究和基因资源利用奠定基础。

关键词：森林保护学球孢白僵菌杂合PKS/NRPS 生物信息学分析

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低温胁迫下云南3个核桃品种抗寒生理生化指标的变化

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西部林业科学 2014年第6期43卷 72-75,90页

作者：潘莉范志远曾清贤刘娇李淑芳杜春花赵廷松杨建华邹伟烈张顺芬云南省林业科学院云南昆明650201 云南省森林植物培育和开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室云南昆明650201 云南省鲁甸县林业局云南鲁甸657100

采用人工模拟低温环境的方法,以漾泡、大麻1号和大麻2号3个核桃品种的2年生离体叶片为试材,测定不同温度下其相对电导率、丙二醛、可溶性糖和脯氨酸等抗寒生理生化指标。结果表明:随着处理温度的降低,3个品种核桃的相对电导率逐渐升高,... 详细信息

采用人工模拟低温环境的方法,以漾泡、大麻1号和大麻2号3个核桃品种的2年生离体叶片为试材,测定不同温度下其相对电导率、丙二醛、可溶性糖和脯氨酸等抗寒生理生化指标。结果表明:随着处理温度的降低,3个品种核桃的相对电导率逐渐升高,丙二醛和可溶性糖含量则呈现"升高-降低-升高"的变化规律,脯氨酸含量分别呈"升高-降低"的变化规律。综合4个抗寒生理生化指标,大麻1号和大麻2号的抗寒能力强于漾泡核桃。

关键词：核桃抗寒性生理生化指标低温胁迫

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基于MaxEnt滇牡丹潜在适生区研究

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西部林业科学 2018年第3期47卷 24-29页

作者：陈剑原晓龙谭芮华梅杨卫孙金金呼延丽王娟云南省林业科学院云南昆明650201 国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201 西南林业大学云南昆明650224

滇牡丹是我国特有植物,天然分布区狭窄,野生资源正面临严重的人为破坏,对滇牡丹适生区进行研究,有助于滇牡丹的人工繁育、保护和利用。利用Max Ent模型,对全国19个气候因子和48个滇牡丹野生资源地理分布点进行分析,获得滇牡丹潜在适生... 详细信息

滇牡丹是我国特有植物,天然分布区狭窄,野生资源正面临严重的人为破坏,对滇牡丹适生区进行研究,有助于滇牡丹的人工繁育、保护和利用。利用Max Ent模型,对全国19个气候因子和48个滇牡丹野生资源地理分布点进行分析,获得滇牡丹潜在适生区分布区范围,并进行可视化梯度分级。研究结果表明,全国范围内,滇牡丹潜在适生区仅分布于云南省、四川省、贵州省及西藏自治区,并主要集中分布于滇西北和滇中、滇东北的部分地区;19个气候因子中,温度季节性变化标准差、等温性、年均温变化范围这3个气候因子依次对滇牡丹天然分布起到最重要的作用,3个变量的值分别为4 100-4 900、46-49、22.50-26.00℃时,最适合滇牡丹的生长发育。研究结果可为滇牡丹种植选择优先区域提供科学参考。

关键词：滇牡丹 Maxent模型潜在适生区气候因子

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牛樟芝发酵液提取物抗菌活性研究

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广西植物 2017年第8期37卷 1068-1073页

作者：赵能原晓龙陈剑陈中华王娟杨宇明王毅云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室昆明6502042 西南林业大学昆明650224 云南省林业科学院国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650204

牛樟芝作为一种珍稀食用和药用菌,具有极大的开发潜力。该研究以麦芽浸粉肉汤液体培养基(BD,美国BD公司)对牛樟芝菌丝体进行摇床培养60 d后,收获发酵液并用乙酸乙酯对其进行萃取,浓缩至干获得提取物;同时,采用抑菌圈法评价培养物对13种... 详细信息

牛樟芝作为一种珍稀食用和药用菌,具有极大的开发潜力。该研究以麦芽浸粉肉汤液体培养基(BD,美国BD公司)对牛樟芝菌丝体进行摇床培养60 d后,收获发酵液并用乙酸乙酯对其进行萃取,浓缩至干获得提取物;同时,采用抑菌圈法评价培养物对13种致病细菌抗菌活性(蜡样芽孢杆菌、缓慢芽孢杆菌、无乳链球菌、短小芽孢杆菌、福氏志贺氏菌、枯草芽孢杆菌、金黄色葡萄球菌、藤黄微球菌、副溶血性弧菌、溶血性葡萄球菌、铜尿假单胞菌、乙型副伤寒沙门氏菌、大肠埃希菌),并检测相应致病细菌的最低抑制浓度(MIC)。结果表明:牛樟芝麦芽浸粉肉汤发酵液提取物对供试的13种致病菌均有抑菌活性;在供试的13种致病菌中,提取物对缓慢芽孢杆菌、短小芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌、副溶血性弧菌、藤黄微球菌5种致病菌的最低抑制浓度值均小于80μg·m L^(-1),其中对藤黄微球菌的最低抑制浓度最低为66.5μg·m^(-1);随着培养时间的增加,提取物的抗菌活性也增加。这说明牛樟芝菌丝体在液体培养条件下,能够产生广谱高效抑菌活性的次生代谢产物。该研究结果为牛樟芝进一步的有效利用开发奠定了理论基础。

关键词：牛樟芝菌丝体珍稀食药用菌抑菌圈法最低抑制浓度致病细菌

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蒜头果的内生真菌多样性分析

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基因组学与应用生物学 2018年第9期37卷 3859-3866页

作者：王毅王娟王四海李云琴原晓龙陈中华云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201 中国科学院昆明植物研究所/植物化学与西部植物资源持续利用国家重点实验室昆明650201

蒜头果为我国特有单种属植物,其果实富含神经酸,是一种很有开发前景的野生植物资源。为了解蒜头果中内生真菌的种类及分布情况,本研究对生长于裸露石灰岩山地和石灰岩林地两种生境的蒜头果分别取样,利用传统分离方法对蒜头果的根、树皮... 详细信息

蒜头果为我国特有单种属植物,其果实富含神经酸,是一种很有开发前景的野生植物资源。为了解蒜头果中内生真菌的种类及分布情况,本研究对生长于裸露石灰岩山地和石灰岩林地两种生境的蒜头果分别取样,利用传统分离方法对蒜头果的根、树皮及叶组织中的内生真菌进行分离纯化,并依据形态学特征和r DNA-ITS序列对菌种进行鉴定。所有样品共分离获得112株内生真菌,分别属于10个属,其中紫霉属（Purpureocillium）、酵母样菌属（Acaromyces）、木霉属（Trichoderma）、淡紫紫孢菌（Purpureocillium lilacinum）为优势菌种。分析显示内生真菌在不同部位差异明显,根中内生真菌分布最为普遍,两种生境条件下分离率都为100%,对比之下树皮分离率分别为56.7%和63.3%,叶的都为26.7%。不同生境对蒜头果内生真菌具有明显影响,在裸露石灰岩山地根、树皮、叶的多样性指数分别为0.756、1.518和0.662,石灰岩林地分别为1.412、1.439和0.974。在两种生境条件下,树皮的真菌多样性相似,根和叶的多样性都表现出石灰岩林地高于裸露石灰岩山地。

关键词：蒜头果植物内生真菌多样性石灰岩山地

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水培条件下氮磷钾配比施肥对木荷幼苗生长的影响

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西部林业科学 2021年第4期50卷 88-94,112页

作者：罗婷康洪梅杨文忠张珊珊云南省林业和草原科学院云南昆明650201 云南省森林培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

为探究木荷幼苗生长对不同氮磷钾配比营养液的响应情况,为木荷壮苗培育合理施肥提供科学的理论依据,选择1月龄木荷幼苗作为试验材料,以Hoagland营养液为母液,进行氮磷钾3因素6水平缺素试验,在水培条件下研究不同氮磷钾配比对木荷幼苗生... 详细信息

为探究木荷幼苗生长对不同氮磷钾配比营养液的响应情况,为木荷壮苗培育合理施肥提供科学的理论依据,选择1月龄木荷幼苗作为试验材料,以Hoagland营养液为母液,进行氮磷钾3因素6水平缺素试验,在水培条件下研究不同氮磷钾配比对木荷幼苗生长的影响。结果表明:不同的氮磷钾营养液配比中,木荷幼苗的各项指标变化趋势基本一致,氮磷钾肥对木荷幼苗生长的影响表现为P>K>N,处理15表现最佳,处理12幼苗长势最差;木荷幼苗的株高、生物量、SOD、POD、CAT、SP均表现出随着施肥水平的提高先升高后降低的变化趋势,Pro和MDA在高水平施肥时显著增加。研究显示,以Hoagland液为水培营养液母液,氮磷钾水平分别为母液中氮磷钾元素浓度的1、1和0.5倍时,木荷幼苗生长最佳。

关键词：木荷幼苗水培营养氮磷钾肥生长指标生理指标

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牛樟芝HMGR基因的克隆和表达分析

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基因组学与应用生物学 2018年第1期37卷 358-365页

作者：原晓龙肖支叶陈丽英陈剑陈中华赵能王娟杨宇明王毅云南省林业科学院国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南省森林植物培育与开发利用重点实验室昆明650204 西南林业大学林学院昆明650224 普洱市林业管理服务中心云南普洱665000

为研究牛樟芝（Antrodia camphorata）萜类生物合成MVA途径中关键酶3-羟-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶（3-hydroxy-3-methylglutary CoA reductase,HMGR）的调控机制,从牛樟芝基因组中分离并克隆出AcHMGR基因,对其进行生物信息学分析、... 详细信息

为研究牛樟芝（Antrodia camphorata）萜类生物合成MVA途径中关键酶3-羟-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶（3-hydroxy-3-methylglutary CoA reductase,HMGR）的调控机制,从牛樟芝基因组中分离并克隆出AcHMGR基因,对其进行生物信息学分析、不同碳氮源添加物对该基因的诱导表达情况进行分析。分析显示：AcHMGR基因含7个外显子、6个内含子;开放阅读框为3 402 bp,编码1 133个氨基酸残基组成蛋白质序列;AcHMGR包含HMGR典型的多肽位点,即2个HMG-CoA结合基序：PLG（Ⅰ/Ⅴ）AGPLK（Ⅰ/Ⅴ）DG和AEGTLVASTSRG,2个NADP结合基序：TGDAMGMNMI和IEVGT（Ⅰ/Ⅴ）GGGT;分子系统进化分析显示,AcHMGR蛋白序列与其他多孔菌科真菌的HMGR聚为一支;表达谱分析显示：碳源中的果糖、氮源中的酪蛋白胨诱导表达AcHMGR基因的能力最强。本研究为探讨牛樟芝萜类,尤其是三萜类化合物的生物合成及调控机理提供了帮助。

关键词：牛樟芝 3-羟-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶(HMGR) 基因克隆诱导表达

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