检索结果-内蒙古大学图书馆

分子植物育种 2022年第14期20卷 4634-4641页

作者：张璋王毅罗玛妮娅王娟杨宇明郑元西南林业大学林学院昆明650224 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201 西南林业大学绿色发展研究院昆明650233

MYB转录因子在真菌的生长发育和胁迫响应中发挥多种作用。为了解牛樟芝MYB的功能,本研究利用本地BLAST对牛樟芝基因组进行比对分析,获得了9个牛樟芝MYB基因序列,并对牛樟芝MYB转录因子进行功能预测分析,利用转录组测序分析MYB基因在不... 详细信息

MYB转录因子在真菌的生长发育和胁迫响应中发挥多种作用。为了解牛樟芝MYB的功能,本研究利用本地BLAST对牛樟芝基因组进行比对分析,获得了9个牛樟芝MYB基因序列,并对牛樟芝MYB转录因子进行功能预测分析,利用转录组测序分析MYB基因在不同段木培养条件下子实体和菌丝体中的表达情况。蛋白理化性质分析发现,9个牛樟芝MYB转录因子多为不稳定蛋白,理论等电点介于4.92~8.51;亚细胞定位预测结果显示有1个转录因子(ACMYB1)定位在细胞质中,推测其可能参与细胞质基因的转录调控;有8个定位在细胞核中,占总蛋白的88.9%。二级结构预测发现以无规则卷曲和α-螺旋为主要结构,β-转角为次要结构。将9个牛樟芝MYB转录因子与5个已知功能的MYB蛋白共同构建系统进化树,14个MYB转录因子分为Ⅰ、Ⅱ两个分支,其中ACMYB1、ACMYB5与冬虫夏草中参与菌丝生长的MYB-6聚为一支,ACMYB9与冬虫夏草中参与子实体生长的MYB-3聚为一支,ACMYB6与顶头孢霉AcMYBA聚为一支。分析牛樟芝MYB转录因子在不同段木菌丝和子实体中的相对表达量,发现ACMYB1、ACMYB5、ACMYB6均在香樟段木菌丝体阶段高表达,推测其参与了牛樟芝菌丝体的生长,ACMYB9基因在香樟段木子实体阶段表达量上调,说明ACMYB9可能参与调控牛樟芝子实体的发育。本研究结果可为进一步挖掘研究牛樟芝MYB转录因子的功能奠定基础。

关键词：牛樟芝 MYB转录因子生物信息学分析转录组分析

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滇西南旱冬瓜天然林的林分特征研究

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西部林业科学 2012年第5期41卷 63-67页

作者：陈伟陈宏伟杨斌史富强陈绍安李江孟梦冯弦刘际梅国家林业局重点开放性实验室云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201 云南省林业科学院云南昆明650201 普洱市林业科学研究所云南普洱665000

为探讨速生乡土树种旱冬瓜生长特性,对滇西南864株旱冬瓜优良植株生长情况进行调查及统计分析,并选择宁洱县松山自然保护区旱冬瓜天然林开展群落调查。结果表明,旱冬瓜优良资源主要分布于阴坡及半阴、半阳坡,其生活习性偏向于阴性,25... 详细信息

为探讨速生乡土树种旱冬瓜生长特性,对滇西南864株旱冬瓜优良植株生长情况进行调查及统计分析,并选择宁洱县松山自然保护区旱冬瓜天然林开展群落调查。结果表明,旱冬瓜优良资源主要分布于阴坡及半阴、半阳坡,其生活习性偏向于阴性,25°以下的平缓坡面适宜旱冬瓜植株的自然生长;旱冬瓜占优势的自然群落具有乔木层、灌木层、草本层和层间附生植物,群落植物种类丰富,区系成分复杂,主要以热带和温带成分组成为主,其中热带分布属占绝对优势,并呈现出一定的过渡性特征。

关键词：旱冬瓜天然林生长特性群落特征

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基于全基因组牛樟芝中萜烯合成酶的鉴定与表达分析

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分子植物育种 2023年第1期21卷 130-137页

作者：罗玛妮娅王毅张璋原晓龙张雪蕊郑元西南林业大学林学院昆明650224 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201 鲁东大学生命科学学院烟台264025

萜烯合成酶(terpene synthases, TPS)是一类异戊二烯环化酶,是真菌萜类化合物生物合成的关键酶之一。为深入了解牛樟芝的萜烯合成酶基因功能,本研究利用BLAST比对获得14个牛樟芝萜烯合成酶(AcTPS)基因,并通过生物信息学方法对其产物蛋... 详细信息

萜烯合成酶(terpene synthases, TPS)是一类异戊二烯环化酶,是真菌萜类化合物生物合成的关键酶之一。为深入了解牛樟芝的萜烯合成酶基因功能,本研究利用BLAST比对获得14个牛樟芝萜烯合成酶(AcTPS)基因,并通过生物信息学方法对其产物蛋白进行功能预测,利用半定量PCR分析不同碳氮源培养基对牛樟芝萜烯合成酶基因表达的影响。结果表明,14个AcTPS蛋白的氨基酸数量为317~2 693个;理论等电点平均pI值为5.96,有6个蛋白(AcTPS6, Ac TPS9, AcTPS10, AcTPS11, AcTPS13, AcTPS14)不稳定系数>40,均为不稳定蛋白;AcTPS12脂肪系数>100,为疏水性蛋白。基因表达谱数据显示,10个牛樟芝萜烯合成酶有6个基因在不同培养基上表达量差异显著,其中AcTPS7只在葡萄糖和土豆蛋白胨培养基中表达,AcTPS10在葡萄糖培养基的表达量高,AcTPS3、AcTPS8及AcTPS6在番茄浸粉培养基中表达量显著,AcTPS2在麦芽浸粉培养基中表达量较高,推测不同培养基能够调控牛樟芝萜烯合成酶的表达。本研究结果为深入研究牛樟芝萜烯合成酶功能及调控机制提供理论依据,为后续利用基因工程手段大量获取牛樟芝萜类产物及其衍生物奠定理论基础。

关键词：牛樟芝萜烯合成酶生物信息学表达分析基因表达分析

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基于二代测序哈巴乌头叶绿体基因组分析

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西部林业科学 2023年第1期52卷 175-181页

作者：马福仙魏健生耿云芬张汉尧西南林业大学西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室云南昆明650224 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201 哈巴雪山省级自然保护区管护局云南迪庆674402

为了解哈巴乌头叶绿体基因组特征及密码子偏好性,本研究采用Illumina HiSeq对哈巴乌头叶绿体基因组进行测序,组装获得完整叶绿体基因组序列,并利用CUSP和Codon W软件分析该物种叶绿体基因组密码子偏好性。结果显示:哈巴乌头叶绿体基因... 详细信息

为了解哈巴乌头叶绿体基因组特征及密码子偏好性,本研究采用Illumina HiSeq对哈巴乌头叶绿体基因组进行测序,组装获得完整叶绿体基因组序列,并利用CUSP和Codon W软件分析该物种叶绿体基因组密码子偏好性。结果显示:哈巴乌头叶绿体基因组全长155800 bp,是典型的四分结构,由1对长为29296 bp的IR、1个长为16864 bp的SSC和1个长86399 bp的LSC组成;该基因组包括84个蛋白质编码基因、8个rRNA基因和37个tRNA基因;系统进化分析显示,哈巴乌头和中甸乌头聚在同一个分支;叶绿体基因组密码子的3个位置上GC含量依次为GC1(46.65%)>GC2(39.71%)>GC3(29.01%),说明其偏好以A/U结尾;有效密码子数(ENC)范围为36.77~58.98,ENC值>45的编码序列有36个,说明密码子偏性低;中性绘图等分析显示哈巴乌头叶绿体基因组密码子偏好性受选择的影响较大;最优密码子有14个,均以A/U结尾。本研究为哈巴乌头叶绿体基因工程、种源鉴定等研究提供参考依据。

关键词：哈巴乌头 Illumina测序叶绿体基因组密码子偏好性

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干旱对云南蓝果树种子萌发的影响

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江西农业大学学报 2018年第3期40卷 516-524页

作者：张珊珊康洪梅杨文忠诺苏那玛云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育国家林业局重点实验室云南昆明650201 宾夕法尼亚州立大学理学院美国宾夕法尼亚州16563

干旱是影响森林植物天然更新的重要因子,但干旱如何阻碍云南蓝果树天然更新的机制尚不清楚。试验采用室内受控的方法,研究干旱可能导致的水分需求限制和自毒效应加剧对云南蓝果树种子萌发这一关键环节的影响。结果表明:PEG 6 000浓度、... 详细信息

干旱是影响森林植物天然更新的重要因子,但干旱如何阻碍云南蓝果树天然更新的机制尚不清楚。试验采用室内受控的方法,研究干旱可能导致的水分需求限制和自毒效应加剧对云南蓝果树种子萌发这一关键环节的影响。结果表明:PEG 6 000浓度、浸提液浓度和浸提液来源器官(根、茎和叶)对云南蓝果树种子萌发均产生极显著的影响,且随着处理水平浓度的提高,云南蓝果树的发芽率和发芽势呈降低趋势,但是12.5 g/L和25 g/L浸提液浓度之间、10%与15%PEG 6 000浓度之间的差异不显著;建立的二元线性回归方程表明,浸提液浓度的标准化影响系数的绝对值都低于PEG 6 000浓度的标准化影响系数的绝对值,说明干旱导致的水分缺失对云南蓝果树种子萌发的影响要强于干旱导致的自毒效应加剧的影响。因此,综合原始生境的改变,气候变化引起的干旱胁迫通过水分缺失和自毒效应加剧两种作用方式,共同影响了云南蓝果树的种子萌发,从而阻碍其天然更新。研究结果阐明了干旱对云南蓝果树种子萌发的影响机制,初步揭示了云南蓝果树濒危的原因和机理,为云南蓝果树的有效保存提供了科学理论依据。

关键词：天然更新干旱水分需求自毒效应种子萌发

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蒜头果叶绿体基因组密码子偏好性分析

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西南林业大学学报（自然科学） 2021年第3期41卷 15-22页

作者：原晓龙刘音康洪梅陈中华李云琴王毅云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201 云南省水文水资源局昆明分局/云南省水环境监测中心昆明市分中心云南昆明650051

为了解蒜头果叶绿体基因组密码子的使用偏性,利用Codon W 1.4.2和CUSP软件对蒜头果叶绿体基因组中33个基因的密码子进行中性绘图,应用ENC−plot、PR2−plot绘图分析并确定了其最优密码子。结果表明:蒜头果叶绿体基因组密码子的第3位碱基G... 详细信息

为了解蒜头果叶绿体基因组密码子的使用偏性,利用Codon W 1.4.2和CUSP软件对蒜头果叶绿体基因组中33个基因的密码子进行中性绘图,应用ENC−plot、PR2−plot绘图分析并确定了其最优密码子。结果表明:蒜头果叶绿体基因组密码子的第3位碱基GC含量为28.43%,远低于第1位(47.74%)和第2位(41.05%),RSCU值大于1的密码子有30个,其中12个以A结尾,16个以U结尾,说明蒜头果叶绿体基因组的编码基因偏好以A和U结尾。GC_(12)和GC_(3)的相关系数为0.1646,相关性不显著,回归系数为0.0004;有效密码子数(ENC)范围为40.39~54.86,大于45的有25个,ENC比值主要分布在−0.05~0.05之外。蒜头果叶绿体基因组中的大部分基因分布在PR2平面图的下半部或右下半部,说明蒜头果叶绿体基因组密码子偏好性更多地受选择的影响,同时亦受其他因素的影响。蒜头果叶绿体基因组的最优密码子确定为UUU、UUA、GUA等18个。

关键词：蒜头果叶绿体基因组密码子偏好性

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麻疯树树皮的挥发性化学成分研究

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西北林学院学报 2011年第4期26卷 180-183页

作者：马惠芬和丽萍郎南军余珍郑科彭明俊向振勇孔继君袁瑞玲云南省林业科学院云南昆明650204 国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650204 中国科学院昆明植物研究所植物化学开放研究实验室云南昆明650204

采用乙醇加热回流法提取麻疯树树皮中的挥发性成分,利用气相色谱-质谱联用仪(GC-MS)及GC对其提取物化学成分进行了解析,分离鉴定化合物的组成及相对含量。从麻疯树树皮的挥发性物质中分离出56个色谱峰,鉴定出37种化合物。化合物类型包... 详细信息

采用乙醇加热回流法提取麻疯树树皮中的挥发性成分,利用气相色谱-质谱联用仪(GC-MS)及GC对其提取物化学成分进行了解析,分离鉴定化合物的组成及相对含量。从麻疯树树皮的挥发性物质中分离出56个色谱峰,鉴定出37种化合物。化合物类型包括醛、酮、酯、萜类化合物、甾醇类、脂肪酸、烷烃、烯烃、芳香族化合物等,实验证明乙醇加热回流提取是一种提取植物挥发性成分很有效的方法。麻疯树皮的提取物中发现了多种具有开发价值的三萜类和植物甾醇类物质,3个地点采集的麻疯树树皮的化合物组成和相对含量差异不明显,为了解麻疯树的化学物质基础和进一步开发研究提供了理论依据。

关键词：麻疯树树皮挥发性物质加热回流气相色谱-质谱

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滇紫草基因组大小测定

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分子植物育种 2023年

作者：马福仙余姣君原晓龙王毅张汉尧黄冈师范学院生物与农业资源学院云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室西南林业大学林学院西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室

滇紫草(Onosma paniculatum)通常作为紫草(Arnebiae radix)的替代品使用，是云南传统的中药材。本研究首次采用流式细胞术(以玉米(Zea mays)基因组为对照)和高通量测序技术的Survey分析测定滇紫草基因组大小。结果显示，流式细胞术测定... 详细信息

滇紫草(Onosma paniculatum)通常作为紫草(Arnebiae radix)的替代品使用，是云南传统的中药材。本研究首次采用流式细胞术(以玉米(Zea mays)基因组为对照)和高通量测序技术的Survey分析测定滇紫草基因组大小。结果显示，流式细胞术测定的滇紫草基因组大小约为880.20 Mbp；高通量测序获得原始数据64.09 Gb，处理后得到约59.72 Gb的过滤数据(Clean data)，测序质量良好；数据约简法(K-monomeric unit， K-mer)分析预估滇紫草为复杂基因组，大小为848.08 Mbp，杂合度为0.3%，GC含量约为37.17%。分析滇紫草基因组的基本信息，为其后续研究物种进化、基因资源利用和药用成分合成途径等提供科学依据。

关键词：滇紫草流式细胞术 K-mer分析基因组大小

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西南桦基因组调查测序

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分子植物育种 2023年

作者：马福仙董洪进原晓龙耿云芬王毅丁淑金张汉尧黄冈师范学院生物与农业资源学院云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室西南林业大学林学院西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室

西南桦(Betula alnoides)是重要的用材树种，且具有潜在的药用价值。本研究采用流式细胞术(以玉米(Zea mays)基因组为对照)和基于MGISEQ2000测序平台的基因组调查方法测定西南桦基因组大小。结果显示，流式细胞术测定的西南桦基因组大... 详细信息

西南桦(Betula alnoides)是重要的用材树种，且具有潜在的药用价值。本研究采用流式细胞术(以玉米(Zea mays)基因组为对照)和基于MGISEQ2000测序平台的基因组调查方法测定西南桦基因组大小。结果显示，流式细胞术测定的西南桦基因组大小约为1.00 Gb；高通量测序获得原始数据32.82 Gb，处理后得到约30.38 Gb的过滤数据(Clean data)，测序质量良好；数据约简法(K-monomeric unit， K-mer)分析预估西南桦是复杂基因组，为四倍体植物，基因组大小为924.00 Mb，杂合度为3.3%，GC含量约为36.14%。分析西南桦基因组的基本信息，为其后续研究物种进化、倍性水平和全基因组测序等提供科学依据。

关键词：西南桦流式细胞术数据约简法(K-mer)分析基因组大小

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龙陵县高海拔地区旱冬瓜优良家系的早期选择

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西部林业科学 2012年第2期41卷 82-86页

作者：袁莲珍陈宏伟史富强杨斌陈伟徐玉梅陈绍安刘际梅西南林业大学云南昆明650224 云南省林业科学院热带林业研究所云南普文666102 云南省林业科学院云南昆明650201 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室云南昆明650201

通过对旱冬瓜87个家系和当地商品种在龙陵县高海拔地区栽培试验,对其苗高、地径生长量及造林后18个月幼林的树高、胸径生长量的测定与分析。结果表明,(1)所选优树的种子与当地的商品种培育苗木的高、径生长量的差异显著;优良家系苗期高... 详细信息

通过对旱冬瓜87个家系和当地商品种在龙陵县高海拔地区栽培试验,对其苗高、地径生长量及造林后18个月幼林的树高、胸径生长量的测定与分析。结果表明,(1)所选优树的种子与当地的商品种培育苗木的高、径生长量的差异显著;优良家系苗期高于商品种的家系有72个,占参试家系83%;幼林期高于商品种的家系为82个,占94%。(2)在旱冬瓜的家系间存在着丰富的遗传变异,不同家系旱冬瓜在苗期及幼林期的高、径生长上均存在着极显著差异,表明开展旱冬瓜优良家系选择十分必要。(3)综合旱冬瓜苗期和幼林期入选的家系,通过聚类分析,表现较好、性状相对稳定的家系为54、55、63、72、75、78、81、122号,共8个家系,可作为龙陵县高海拔地区当地造林的采种母树。

关键词：龙陵县高海拔地区旱冬瓜优良家系早期选择

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