检索结果-内蒙古大学图书馆

广西植物 2018年第9期38卷 1146-1154页

作者：原晓龙华梅陈剑王娟杨宇明王毅云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650204

为了研究牛樟芝中PKS基因与化合物之间的关系,该研究通过对牛樟芝基因组分析获得牛樟芝聚酮合酶基因,以此序列为模板设计含有起始密码子和终止密码子的特异引物并以牛樟芝c DNA为模板克隆获得一个高度还原型PKS(HR-PKS)基因全长,命名为A... 详细信息

为了研究牛樟芝中PKS基因与化合物之间的关系,该研究通过对牛樟芝基因组分析获得牛樟芝聚酮合酶基因,以此序列为模板设计含有起始密码子和终止密码子的特异引物并以牛樟芝c DNA为模板克隆获得一个高度还原型PKS(HR-PKS)基因全长,命名为AcPKS2;对AcPKS2基因进行生物信息学分析,并比较该基因在不同培养基上的表达量。结果表明:AcPKS2全长7 842 bp,有24个内含子,其外显子共编码2 613个氨基酸,该蛋白的相对分子质量为293.5 kDa,理论等电点pI为5.78。用CDD分析其结构域显示,该基因属于HR-PKS,其结构域组织排列为KS-AT-DH-MT-ER-KR-ACP-TE,8个结构域其活性位点分别为β-酮基合成酶(DTACSSSL)、酰基转移酶(GHSIGETA)、脱水酶(RNDGSTSPL)、甲基转移酶(SFDIITAFDV)、烯酰还原酶(HAGVSSPAA)、酮基还原酶(GSPGQANYTAA)、酰基转移酶(YGLDSLTSVRL)、硫酯酶(KQPNGPY)。系统发育树显示AcPKS2与其他化合物未知的HR-PKS蛋白聚为一支,结构域和系统进化树分析显示该基因可能编码一种新的含TE结构域高度还原型聚酮合酶;表达分析结果显示葡萄糖和果糖能够诱导该基因的表达。

关键词：牛樟芝高度还原型PKS 生物信息学分析基因表达

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蛹虫草聚酮合酶基因的多样性分析

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西部林业科学 2019年第2期48卷 97-103,113页

作者：原晓龙李云琴王毅云南省林业科学院云南昆明650201 国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201

以蛹虫草的菌丝体为材料,利用基因组挖掘的方式从蛹虫草基因组中获得其聚酮合酶(Polyketide synthase,PKS)基因,对这些PKS基因进行生物信息学分析以推断它们的功能,并检测它们在不同培养基上的表达情况。结果表明:蛹虫草中含有13个PKS基... 详细信息

以蛹虫草的菌丝体为材料,利用基因组挖掘的方式从蛹虫草基因组中获得其聚酮合酶(Polyketide synthase,PKS)基因,对这些PKS基因进行生物信息学分析以推断它们的功能,并检测它们在不同培养基上的表达情况。结果表明:蛹虫草中含有13个PKS基因(CmPKS 1-13),包括2个非还原型聚酮合酶(Non-reducing PKS,NR-PKS),5个部分还原的聚酮合酶(Partial-reducing PKS,PR-PKS),6个高度还原型聚酮合酶(Highly reducing PKS,HR-PKS);聚类分析显示CmPKS 1、CmPKS 3可能参与链格孢吡喃酮(alternapyrone),CmPKS 4可能参与黄曲霉素,CmPKS 5可能参与美伐他汀,CmPKS 6可能参与分生孢子色素,CmPKS 8可能参与伊快霉素的生物合成,其余PKS与生物合成未知化合物的PKS聚为一支;半定量PCR显示CmPKS 7和CmPKS 9在4种培养基上均强烈表达;CmPKS 3、CmPKS 6在4种培养基上微弱表达;CmPKS 10、CmPKS 11和CmPKS 12只在GL培养基上强烈表达,在其余3种培养基上微弱表达;CmPKS 1和CmPKS 4只在GL培养上微弱表达,CmPKS 8仅在GS培养基上微弱表达;CmPKS 2、CmPKS 5和CmPKS 13在检测的培养基中都不表达。本研究为进一步异源表达蛹虫草中的PKS基因及其功能鉴定、具新颖结构聚酮化合物的发掘奠定基础。

关键词：蛹虫草基因组挖掘聚酮合酶基因表达聚酮类化合物

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基于SSR标记的云南省核桃种质资源遗传多样性及核心种质构建

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植物遗传资源学报 2020年第3期21卷 767-774页

作者：吴涛陈少瑜肖良俊宁德鲁潘莉贺娜朱云凤云南省林业和草原科学院/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室昆明650201 云南省林业和草原科学院经济林研究所昆明650201

利用SSR分子标记技术对云南省14个州市1061份核桃种质资源进行遗传多样性分析,在此基础上,通过最小距离逐步取样法构建核心种质并进行了核心种质的多样性检测。结果表明,19对SSR引物共检测到322个等位基因,每对引物平均16.95个,Shannon... 详细信息

利用SSR分子标记技术对云南省14个州市1061份核桃种质资源进行遗传多样性分析,在此基础上,通过最小距离逐步取样法构建核心种质并进行了核心种质的多样性检测。结果表明,19对SSR引物共检测到322个等位基因,每对引物平均16.95个,Shannon信息指数(I)平均为1.3375,期望杂合度(He)平均为0.6040,Nei′s遗传多样性指数(Nei)平均为0.6043,数据表明云南核桃种质资源具有较为丰富的遗传多样性。遗传多样性在各州市分布不均,其中,迪庆州核桃资源的遗传多样性相对最高,最低的是临沧地区。基于遗传距离的UPGMA聚类结果,以5%~30%的取样比例分别构建初级种质(PC)、次级种质(SC)、核心种质-1(CC-1)、核心种质-2(CC-2)等4个核心种质,经遗传多样性分析及t检验,最终确定10.84%取样比例、115份样本量的核心种质-1(CC-1)为云南核桃资源的核心种质。

关键词：核桃 SSR分子标记种质资源遗传多样性核心种质

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磷胁迫和不同栽植方式下云南松幼苗生物量及其分配的变化

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西北林学院学报 2011年第5期26卷 53-58页

作者：尹艾萍付玉嫔祁荣频杨卫吴涛徐亮云南省林业科学院国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南省森林植物培育与开发利用实验室云南昆明650204

研究云南松与旱冬瓜混栽对磷胁迫的反应。通过温室砂培试验研究了云南松与旱冬瓜2树种不同栽植方式下云南松幼苗的生长、生物量及其分配。供试营养液为Hoagland营养液,设置了缺磷(0 mg.L-1)、低磷(31 mg.L-1)和适磷(62 mg.L-1)3个水平... 详细信息

研究云南松与旱冬瓜混栽对磷胁迫的反应。通过温室砂培试验研究了云南松与旱冬瓜2树种不同栽植方式下云南松幼苗的生长、生物量及其分配。供试营养液为Hoagland营养液,设置了缺磷(0 mg.L-1)、低磷(31 mg.L-1)和适磷(62 mg.L-1)3个水平。结果表明:(1)磷胁迫下,纯栽植或与旱冬瓜混栽,云南松幼苗的苗高、地径、根长、地上、地下和全株干重均低于对照,在低磷胁迫时差异不显著,缺磷时差异显著(P<0.05);随着磷胁迫程度增加云南松幼苗根冠比增加。(2)不同栽植方式对云南松幼苗的影响表现为,磷胁迫下,随着旱冬瓜混栽比例(0、1、2株)增加,云南松幼苗的苗高、地径、根长、根尖数、地上、地下、全株生物量、根冠比减少。磷胁迫可降低云南松幼苗的生物量,但它可通过地上部与地下部干物质分配来适应磷营养的胁迫;苗期混交旱冬瓜对云南松幼苗的生长有一定影响,但对旱冬瓜的生长是有利的;云南松幼苗以降低地下部分的生长来适应磷胁迫下地上部分与旱冬瓜幼苗对光照和空间的竞争。

关键词：磷胁迫混栽云南松旱冬瓜生物量

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基于SSR标记的黑老虎种质资源的遗传多样性和遗传结构

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中南林业科技大学学报 2024年第5期44卷 156-166页

作者：李思广陈少瑜付玉嫔尹艾萍司马永康祁荣频周云王绍昌云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用实验室云南昆明650201 云南省林业和草原科学院国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201 屏边苗族自治县林业和草原局云南屏边661299

【目的】揭示黑老虎5个群体70份种质资源的遗传多样性水平和遗传结构状况,为种质资源评价、保护及利用提供理论依据。【方法】用筛选出的17对引物进行所有样本SSR-PCR扩增,扩增产物经毛细管电泳后采用GenAlex v6.502、Ntsys V2.2及Struc... 详细信息

【目的】揭示黑老虎5个群体70份种质资源的遗传多样性水平和遗传结构状况,为种质资源评价、保护及利用提供理论依据。【方法】用筛选出的17对引物进行所有样本SSR-PCR扩增,扩增产物经毛细管电泳后采用GenAlex v6.502、Ntsys V2.2及Structure 2.3.4等软件进行遗传多样性和遗传结构分析。【结果】17对引物的70份样本中共检测到147个等位基因,平均每对引物扩增出8.647个等位基因。17个位点的Shannon信息指数(I)平均值为1.421,期望杂合度(He)平均值为0.648,多态信息指数(PIC)平均值为0.612。5个群体中马关群体(MGH)的遗传多样性最高,I和He分别为1.070和0.544。群体遗传分化系数(Fst)平均值为0.323,有32.3%的变异来源于群体间。分子方差分析(AMOVA)显示群体间方差分量比为28.8%,群体间的遗传变异占总变异量的28.8%。17个位点群体内近交系数(Fis)的平均值为0.161(Fis>0),黑老虎存在较强的近亲交配,5个群体中只有广西群体(GXH)Fis<0。基因流(Nm)为0.876,属中等水平。UPGMA聚类和STRUCTURE分析将70份黑老虎种质资源划分成了3个类群:类群Ⅰ由来自MGH的样本资源组成,类群Ⅱ主要由屏边群体(PBH)的样本资源组成,类群Ⅲ主要由GXH、贵州群体(GZH)及湖南群体(HNH)的样本资源组成。【结论】黑老虎种质资源具有丰富的遗传多样性,群体间存在极高的遗传分化,遗传变异主要来源于群体内的个体。大部分种质的遗传背景比较单一,同一群体的不同种质遗传组分基本相同。在黑老虎育种及资源保护和开发工作中,应在尽量涵盖全部群体类别的基础上,特别重视遗传多样性丰富的群体以及各群体内不同类型个体的选择、保存和利用。

关键词：黑老虎种质资源 SSR标记遗传多样性遗传结构

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牛樟干旱与低温胁迫相关NAC转录因子的鉴定及表达分析

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基因组学与应用生物学 2022年第2期41卷 363-371页

作者：张璋王毅罗玛妮娅王丽娟冯发玉原晓龙郑元西南林业大学林学院昆明650224 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

NAC蛋白是最大的植物特异性转录因子家族之一,在植物响应生物胁迫和非生物胁迫中具有重要作用。本研究利用二代转录组测序获得牛樟干旱及低温胁迫的转录组数据,并利用本土BLAST从基因组数据中获得牛樟全基因组78个CkNAC转录因子序列,利... 详细信息

NAC蛋白是最大的植物特异性转录因子家族之一,在植物响应生物胁迫和非生物胁迫中具有重要作用。本研究利用二代转录组测序获得牛樟干旱及低温胁迫的转录组数据,并利用本土BLAST从基因组数据中获得牛樟全基因组78个CkNAC转录因子序列,利用分析软件进行保守基序分析。利用转录组分析获得与干旱和低温胁迫相关的CkNAC,进行系统进化和相关基因荧光定量PCR验证。牛樟NAC基因表达谱数据分析发现,有18个基因在受干旱、低温胁迫时表达差异显著,占牛樟NAC家族的23.1%,其中10个基因受干旱胁迫呈高表达水平,占上调基因的55.6%。将14个牛樟NAC转录因子与8个具有抗旱、抗寒NAC蛋白共同构建系统发育进化树,结果显示22个NACs蛋白聚为Ⅰ类和Ⅱ类,参与干旱和低温胁迫的蛋白集中在Ⅰ类。Ⅰ类中CkNAC14、CkNAC23、CkNAC44和CkNAC70分别和参与干旱胁迫的普通小麦(Triticum aestivum)TaNAC67、梭梭(Haloxylon ammodendron)HaNAC38、拟南芥(Arabidopsis thaliana)ANAC072和大豆(Glycine max)GmNAC20聚为一支,其中CkNAC44和CkNAC70与ANAC072和GmNAC20的相似性分别为59.0%和58.2%,推测CkNAC14、CkNAC23、CkNAC44和CkNAC70可能参与调控牛樟在干旱逆境下的反应。利用RT-qPCR技术检测牛樟NAC基因在不同逆境胁迫中的表达变化,结果显示,CkNAC14、CkNAC23、CkNAC44和CkNAC70受干旱胁迫诱导显著上调。本研究基于牛樟高通量转录组数据,探究牛樟NAC转录因子家族生物学特性,为深入研究牛樟NAC基因的非生物胁迫调控提供科学依据。

关键词：牛樟 NAC转录因子转录组分析干旱与低温胁迫

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滇牡丹类黄酮7-O-葡萄糖基转移酶基因的鉴定与表达分析

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西部林业科学 2018年第5期47卷 19-25页

作者：原晓龙陈剑陈中华华梅王娟王毅云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

以野生滇牡丹为试验材料,以其转录组数据为基础,采用反转录PCR技术克隆得到一个具完整开放阅读框的类黄酮7-O-葡萄糖基转移酶基因(Pd7GT),并通过生物信息学分析手段、基因表达对该基因进行分析。结果显示:该基因全长1 446bp (Gen Bank... 详细信息

以野生滇牡丹为试验材料,以其转录组数据为基础,采用反转录PCR技术克隆得到一个具完整开放阅读框的类黄酮7-O-葡萄糖基转移酶基因(Pd7GT),并通过生物信息学分析手段、基因表达对该基因进行分析。结果显示:该基因全长1 446bp (Gen Bank登录号为KX394687),可编码481个蛋白氨基酸;生物信息学分析发现Pd7GT蛋白C末端含有典型糖基转移酶识别区(WAPQV)和UDP-葡萄糖基配体绑定位点(HCGWNS)的PSPG盒子,其蛋白序列GWAPQVMILEHEAVGGFVTHCGWNSTLEGISAGLPLVTWPIFAEQFYNEK,与可可(XP_007042481)、Herrannia umbratica (XP_021298085)、毛果杨(XP_006379195)、巨桉(XP_010066837)等以葡萄糖为糖基配体的类黄酮7-O-糖基转移酶聚为一类; Pd7GT基因在组织茎中表达量最高、不同花发育时期的花谢期表达量最高、不同颜色花瓣中黄花花瓣表达量最高。本研究为滇牡丹糖基转移酶异源表达、分子育种等研究提供一定的基础,为未来通过基因工程培育具新颖花色和抗性的滇牡丹新品种提供必要材料。

关键词：滇牡丹类黄酮7-O-葡萄糖基转移酶生物信息学分析基因表达

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昆阳磷矿植被恢复地土壤肥力状况分析及评价

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长江流域资源与环境 2012年第12期21卷 1492-1498页

作者：和丽萍王玉杰方向京孟广涛李贵祥北京林业大学水土保持学院北京100083 云南省林业科学院云南昆明650204 国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650204

采用野外调查、室内分析并结合相关的方法,对昆阳磷矿人工林植被恢复样地土壤养分指标进行研究,以对矿区植被恢复地土壤肥力现状进行科学合理的评价。结果表明:矿区植被恢复地土壤的容重均小于1.8g/cm,孔隙多,结构性较好,有益于植物的生... 详细信息

采用野外调查、室内分析并结合相关的方法,对昆阳磷矿人工林植被恢复样地土壤养分指标进行研究,以对矿区植被恢复地土壤肥力现状进行科学合理的评价。结果表明:矿区植被恢复地土壤的容重均小于1.8g/cm,孔隙多,结构性较好,有益于植物的生长;植被恢复地土壤样本的有机质含量缺乏,全氮和碱解氮含量属于中等和较缺乏水平,全磷和有效磷、全钾和速效钾含量极为丰富。土壤有机质、有效磷,变异系数较大,分布不均匀,碱解氮、全氮、全磷、速效钾为中等变异的养分指标,变异系数相对小些,土壤中全钾呈弱变异,在土壤中的含量相对分布比较均匀。通过灰色关联度分析,得出研究区不同植被类型或不同年代组合恢复模式土壤肥力顺序为:2005年恢复的旱冬瓜+藏柏+麻栎林>2006年恢复的旱冬瓜+藏柏+麻栎林>2007年恢复的旱冬瓜+藏柏林>平台覆土>2005年恢复的旱冬瓜+藏柏林>2005年恢复的旱冬瓜+藏柏+墨西哥柏林。

关键词：植被恢复土壤肥力评价昆阳磷矿

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皮革肾岛衣一个聚酮合酶基因的克隆与鉴定

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福建农林大学学报（自然科学版） 2019年第1期48卷 82-87页

作者：原晓龙华梅陈剑张传光王毅云南省林业科学院/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

通过对地衣型真菌皮革肾岛衣转录组数据的分析,挖掘出1条非还原型聚酮合酶基因,通过RT-PCR首次克隆得到该基因的cDNA全长(NpPKS2),并通过生物信息学手段分析其基因和蛋白氨基酸序列,采用荧光定量PCR技术分析该基因在不同培养基上的表达... 详细信息

通过对地衣型真菌皮革肾岛衣转录组数据的分析,挖掘出1条非还原型聚酮合酶基因,通过RT-PCR首次克隆得到该基因的cDNA全长(NpPKS2),并通过生物信息学手段分析其基因和蛋白氨基酸序列,采用荧光定量PCR技术分析该基因在不同培养基上的表达情况.结果显示:NpPKS2基因全长6 249 bp,编码2 082个氨基酸;生物信息学分析显示该基因编码1种非还原型聚酮合酶,结构域顺序为SAT-KS-AT-PT-ACP-TE,根据聚类分析和结构域分析,推断NpPKS2为苔色酸合成酶;荧光定量分析显示地衣型真菌皮革肾岛衣中的NpPKS2基因用BMG培养基培养时表达量最高.

关键词：皮革肾岛衣非还原型聚酮合酶生物信息学基因表达

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高产脂思茅松牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因的克隆及表达

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福建农林大学学报（自然科学版） 2018年第6期47卷 711-716页

作者：王毅原晓龙陈伟李江云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

以高产脂思茅松为材料,基于转录组数据分析,采用RT-PCR方法获得思茅松牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(GGPS)基因的c DNA序列,Gen Bank登录号为KM382173.1.序列分析显示,思茅松GGPS基因c DNA全长1 152 bp,编码383个氨基酸,属于GGPS家族.... 详细信息

以高产脂思茅松为材料,基于转录组数据分析,采用RT-PCR方法获得思茅松牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(GGPS)基因的c DNA序列,Gen Bank登录号为KM382173.1.序列分析显示,思茅松GGPS基因c DNA全长1 152 bp,编码383个氨基酸,属于GGPS家族.序列比对分析显示,思茅松GGPS拥有GGPS家族特有的两个功能保守结构域FARM(DDLPSMDND)、SARM(DDILD),其与马尾松GGPS的同源性为78.07%.系统进化树分析显示,思茅松GGPS与马尾松GGPS的亲缘关系最近.荧光定量PCR分析表明,在思茅松的树皮中,GGPS基因的表达明显受到割脂物理伤害的诱导,在高产脂思茅松个体幼枝中的表达量远远高于在低产脂思茅松个体的表达量.

关键词：高产脂思茅松牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(GGPS) 荧光定量PCR 基因功能

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