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分子植物育种 2020年第16期18卷 5300-5305页

作者：关淑文王毅郝佳波原晓龙陆斌西南林业大学昆明650224 云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

查尔酮合成酶(chalcone synthase, CHS)是植物次生代谢途径中的关键酶。本研究依据转录组数据设计特异性引物,采用RT-PCR方法成功地从竹叶花椒(Zanthoxylum armatum)中克隆得到一个全新的CHS基因的全长cDNA序列,命名为ZaCHS (NCBI登录号... 详细信息

查尔酮合成酶(chalcone synthase, CHS)是植物次生代谢途径中的关键酶。本研究依据转录组数据设计特异性引物,采用RT-PCR方法成功地从竹叶花椒(Zanthoxylum armatum)中克隆得到一个全新的CHS基因的全长cDNA序列,命名为ZaCHS (NCBI登录号:MK953733)。序列分析结果表明,ZaCHS包含完整的cDNA开放阅读框(OFR),由1 173 bp组成,编码390个氨基酸。Blast比对结果显示该蛋白属于CHS家族蛋白;系统进化树结果显示竹叶花椒ZaCHS与芸香科植物甜橙、克里曼丁桔等的CHS亲缘关系较近。荧光定量PCR检测显示,ZaCHS在竹叶花椒中的表达量从高到低分别为:嫁接树的叶、嫁接树的茎、实生树的茎、实生树的叶。通过对竹叶花椒CHS基因进行克隆与分析,为后续深入研究竹叶花椒类黄酮代谢途径相关基因、CHS基因表达调控以及CHS基因家族进化提供帮助。

关键词：竹叶花椒查尔酮合成酶嫁接基因功能分析

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清香桂红色与绿色茎干株系的RAPD差异分析

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云南农业大学学报（自然科学版） 2018年第5期33卷 898-903页

作者：陈海云周筑白平李红永培伟吴涛张学星云南省林业科学院云南昆明650201 云南山川园林有限公司云南昆明650100 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室云南昆明650201

【目的】分别以红色和绿色茎干的清香桂植株为材料,对其遗传物质进行分子水平上的差异检测。【方法】用混合DNA样品对200个10碱基随机引物进行筛选,然后用筛出的引物对红色和绿色茎干的清香桂单株DNA样品各14个进行RAPD-PCR扩增,对差异... 详细信息

【目的】分别以红色和绿色茎干的清香桂植株为材料,对其遗传物质进行分子水平上的差异检测。【方法】用混合DNA样品对200个10碱基随机引物进行筛选,然后用筛出的引物对红色和绿色茎干的清香桂单株DNA样品各14个进行RAPD-PCR扩增,对差异性条带进行回收测序和核苷酸序列分析。【结果】43个引物在28个样品中具有多态性,8个能在多数红色和绿色茎干植株中产生差异条带,其中3个引物(C06、M09和N10)可稳定地产生清晰的7个差异性条带,且条带C06-350在所有14个红茎植株类型中都出现而在14个绿茎植株中均缺失,其核苷酸序列长度为352～381 bp,在NCBI上未搜索到同源的核苷酸或氨基酸序列。【结论】红茎与绿茎清香桂植株之间发生了遗传变化,C06-350是与清香桂红茎特征紧密联系的1个标记。

关键词：清香桂红色茎干 RAPD

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沉水樟与非生物胁迫相关bHLH基因家族成员鉴定及表达分析

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分子植物育种 2023年

作者：杨志娟王毅张艺原晓龙王拓璋郑元西南林业大学林学院云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室

沉水樟(Cinnamomum micranthum)是重要速生经济树种，也是中国Ⅲ级濒危保护植物。本研究基于沉水樟基因组鉴定出bHLH家族转录因子，并结合转录组测序获得的干旱和低温处理沉水樟的的基因表达谱，从中筛选得到与干旱和低温胁迫响应相关的... 详细信息

沉水樟(Cinnamomum micranthum)是重要速生经济树种，也是中国Ⅲ级濒危保护植物。本研究基于沉水樟基因组鉴定出bHLH家族转录因子，并结合转录组测序获得的干旱和低温处理沉水樟的的基因表达谱，从中筛选得到与干旱和低温胁迫响应相关的bHLHs。结果显示：在沉水樟基因组中共鉴定到158个具有bHLH基因保守结构域的成员(CmbHLH001～CmbHLH158)，平均氨基酸数为371个，其中156个CmbHLHs是不稳定蛋白，且大部分属于亲水蛋白。根据亚细胞定位预测结果显示，大部分CmbHLHs必须在细胞核内才能发挥稳定生物学功能。沉水樟bHLH转录因子基序分析结果表明，158个bHLH都含有保守结构域motif 1和motif 2。基于沉水樟转录组数据的表达谱分析结果，在干旱和低温胁迫下，有16个CmbHLHs表达上调，33个表达下调。其中，CmbHLH123在干旱处理中差异上调倍数最高，CmbHLH049、CmbHLH061、CmbHLH072、CmbHLH080、CmbHLH081、CmbHLH090、CmbHLH112、CmbHLH125、CmbHLH126在干旱和低温胁迫中均显示下调，且在低温处理中差异下调倍数最高；CmbHLH133在干旱和低温同时处理时差异上调倍数最高。本研究为进一步确定bHLHs生物学功能奠定基础。

关键词：沉水樟 bHLH转录因子干旱和低温胁迫表达分析

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木质藤本植物黑老虎的居群结构与动态

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东北林业大学学报 2015年第9期43卷 23-29,51页

作者：付玉嫔司马永康祁荣频郝佳波毛云玲尹艾萍陈少瑜刘冬芬张荣贵国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室(云南省林业科学院) 昆明650201 红河州林业科学研究所

为了了解木质藤本药食兼用植物黑老虎的居群结构及动态，采用典型样地法，以径级结构代替年龄结构及方差均值比率法研究了云南分水岭国家级自然保护区、云南大围山自然保护区和云南无量山自然保护区等3个黑老虎居群的年龄结构、高度结... 详细信息

为了了解木质藤本药食兼用植物黑老虎的居群结构及动态，采用典型样地法，以径级结构代替年龄结构及方差均值比率法研究了云南分水岭国家级自然保护区、云南大围山自然保护区和云南无量山自然保护区等3个黑老虎居群的年龄结构、高度结构和空间分布格局，编制了特定时间生命表，绘制了存活曲线。结果表明：黑老虎3个居群的年龄结构分为5级，总体呈倒金字塔形，年龄结构中都无I级幼苗，幼藤储备也很少，中成年藤和老年藤的比例占到了60％～80％．均属于衰退型居群：其高度结构受支柱木和林冠层高度的影响，不同居群的高度结构包括的级数不同，但发育都是连续的；3个居群的分布格局不同，分水岭居群呈现集群分布，无量山居群和大围山居群呈随机分布，当前的生长可分为幼藤、中成年藤和老藤3个时期，存活曲线呈现凸形，正处于衰退状态。极弱的更新能力和较少的居群数量预示黑老虎居群的生存和繁育都面临极大的挑战，且具有濒危植物所具有的特征．应加强保护和人工引种驯化。

关键词：黑老虎木质藤本居群格局居群动态生命表存活曲线

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基于全基因组序列预测里氏木霉QM6a的分泌蛋白

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华中农业大学学报 2017年第2期36卷 28-32页

作者：韩长志王娟西南林业大学林学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650224 云南省林业科学院/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

里氏木霉(Trichoderma reesei)QM6a为重要的产纤维素酶工业生产菌株,为明确其内存在的分泌蛋白,对该菌分泌蛋白进行预测,并明确其特征。利用SignalP、ProtComp等5个软件对该菌中9 143条蛋白质序列进行分泌蛋白预测,并对上述分泌蛋白的... 详细信息

里氏木霉(Trichoderma reesei)QM6a为重要的产纤维素酶工业生产菌株,为明确其内存在的分泌蛋白,对该菌分泌蛋白进行预测,并明确其特征。利用SignalP、ProtComp等5个软件对该菌中9 143条蛋白质序列进行分泌蛋白预测,并对上述分泌蛋白的氨基酸大小分布情况、信号肽长度及其切割位点等性质进行分析。里氏木霉中含有分泌蛋白356个,其氨基酸长度、信号肽长度与其他植物病原菌不同;信号肽切割位点属于A-X-A类型,与其他已经报道的植物病原真菌、细菌以及卵菌中分泌蛋白信号肽切割位点一致。通过上述生物信息学分析方法有效地实现了里氏木霉分泌蛋白的预测,也证明了分泌蛋白的信号肽切割位点具有物种保守性特点。

关键词：里氏木霉分泌蛋白信号肽预测软件

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八角ISSR-PCR反应体系的建立及引物筛选研究

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西部林业科学 2013年第2期42卷 8-13页

作者：吴涛陈海云陈少瑜宁德鲁冯丹李勇杰张艳丽云南省林业科学院云南昆明650201 国家林业局重点开放性实验室云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201

以文山、广西2个居群6个单株的八角嫩叶为研究材料,以八角叶片基因组DNA为模板,在分析归纳相关树种ISSR-PCR体系的基础上,确定一个反应体系并对ISSR引物库进行筛选,同时结合正交设计针对具体引物进行体系优化。结果表明,八角的ISSR-PCR... 详细信息

以文山、广西2个居群6个单株的八角嫩叶为研究材料,以八角叶片基因组DNA为模板,在分析归纳相关树种ISSR-PCR体系的基础上,确定一个反应体系并对ISSR引物库进行筛选,同时结合正交设计针对具体引物进行体系优化。结果表明,八角的ISSR-PCR反应体系(25μL)为DNA模板0.003～0.016 ng,Taq DNA聚合酶0.5～1.0 U,dNTPs 0.2 mmol.L-1,Mg2+浓度2.5～3.0 mmol.L-1,引物浓度0.6～0.8μmol.L-1。扩增程序为,94℃预变性5 min;94℃变性30 s,引物特异温度退火45 s,72℃延伸1 min,40个循环;72℃最后延伸7min;4℃保存。获得效果稳定并具有多态性的ISSR引物13条。研究结果可为八角遗传多样性分析和种质资源鉴定等研究奠定基础。

关键词：八角 ISSR—PCR 反应体系 DNA模板扩增程序引物筛选

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基于PCR-DGGE技术的剑湖湿地湖滨带土壤微生物群落结构多样性分析

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农业环境科学学报 2013年第7期32卷 1405-1412页

作者：刘绍雄王明月王娟杨宇明缪福俊王金华张敬宜熊智西南林业大学西南山地森林资源保育与利用省部共建教育部重点实验室昆明650224 云南省林业科学院国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南省森林植物繁育和开发利用重点实验室昆明650204

为了解剑湖湿地湖滨带植物根际土壤中细菌的群落结构特征多样性,应用PCR-DGGE技术对剑湖湿地湖滨带4种植物根际土壤细菌的群落结构进行了研究,根据DGGE指纹图谱,对它们的遗传多样性进行了分析。结果表明,不同植物群落根际和非根际土壤... 详细信息

为了解剑湖湿地湖滨带植物根际土壤中细菌的群落结构特征多样性,应用PCR-DGGE技术对剑湖湿地湖滨带4种植物根际土壤细菌的群落结构进行了研究,根据DGGE指纹图谱,对它们的遗传多样性进行了分析。结果表明,不同植物群落根际和非根际土壤细菌多样性指数(H′)、丰度(S)和均匀度(J)均有所不同,根际土壤细菌多样性指数、均匀度、丰富度均高于非根际,其中茭草根际土壤细菌多样性指数、均匀度、丰富度均最高,说明植物群落类型与土壤微生物多样性的关系十分密切;不同植物群落根际土壤细菌群落结构相似性较高,非根际土壤细菌群落结构相似性较低,在82%的相似水平上聚为4大类群,根际土壤细菌和茭草非根际土壤细菌聚为一类,其余非根际土壤细菌各聚为一类,说明植物群落对微生物群落结构具有一定的影响。对DGGE的优势条带序列分析,同源性最高的微生物分别属于变形菌门(Proteobacteria)、草酸杆菌科(Oxalobacteraceae)、紫色杆菌属(Janthinobacte rium)、杜擀氏菌属(Duganella)、埃希氏菌属(Escherichia)和链球菌属(Streptococcus),它们均为未培养微生物。不同植物群落根际土壤氮磷含量均有所差异,其中茭草根际土壤氮磷含量最高,湿地土壤细菌多样性与土壤有机质、总N、总P的含量呈正相关关系,土壤细菌多样性与土壤pH值呈负相关关系。

关键词： PCR—DGGE 剑湖湿地根际微生物多样性

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珍稀植物蒜头果扦插繁育技术研究

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种子 2022年第5期41卷 139-143页

作者：耿云芬王四海杨嫱云南省林业和草原科学院昆明650201 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物繁育和保护重点实验室昆明650201

为了保护和可持续利用蒜头果资源,本研究从插条年龄、扦插基质和生长激素对扦插生根影响探讨蒜头果扦插的适宜条件。结果表明,插条的年龄越小越有利于扦插生根,当年生插条生根率最高(45±5.00)%,其次为一年生(38±7.64)%和二年... 详细信息

为了保护和可持续利用蒜头果资源,本研究从插条年龄、扦插基质和生长激素对扦插生根影响探讨蒜头果扦插的适宜条件。结果表明,插条的年龄越小越有利于扦插生根,当年生插条生根率最高(45±5.00)%,其次为一年生(38±7.64)%和二年生枝条(35±10.00)%,但是它们之间的差异并不显著(p>0.05),然而三年生枝条没有生根。在用于扦插的珍珠岩、河沙、椰糠+珍珠岩(1∶1)、土壤+珍珠岩(1∶1)、蛭石+珍珠岩(1∶1)、蛭石等6种基质中,透气保湿性好的椰糠+珍珠岩(1∶1)基质生根率最高(51.67±7.64)%,其次为蛭石+珍珠岩(1∶1)基质,生根率为(40.00±13.29)%。激素种类和浓度对蒜头果扦插生根都有显著影响,分别用1000 mg/L和200 mg/L的吲哚丁酸钾溶液处理插穗,生根率有着极显著差异(p<0.01),分别为(66.67±12.58)%和(38.33±7.64)%;上述同等浓度萘乙酸钠溶液处理插穗,生根率有着显著差异(p<0.05),分别为(45.00±8.66)%和(25.00±5.00)%;较高浓度的吲哚丁酸钾溶液(1000 mg/L和500 mg/L)与相同浓度的萘乙酸钠溶液相比能显著提高扦插生根率(p<0.05)。综上所述,蒜头果扦插选择幼嫩的当年生或一年生枝条,透气保湿性好的基质,较高浓度的吲哚丁酸钾溶液处理有利于插穗生根。

关键词：蒜头果扦插基质激素

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外来入侵植物肿柄菊在云南的分布特征及其影响因素

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生态学杂志 2018年第9期37卷 2573-2580页

作者：朱枫王四海陈剑李宁云吴超西南林业大学地理学院昆明650224 云南省林业科学院云南省森林植物资源培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201 西南林业大学/国家高原湿地研究中心昆明650224

公路网是外来入侵植物肿柄菊(Tithonia diversifolia)进行远距离传播的主要途径,近些年肿柄菊在云南表现出迅速的扩散态势和较强的入侵能力。为探讨肿柄菊沿公路进行扩散过程中各种环境因素对群落建立的影响,本研究通过大范围沿公路实... 详细信息

公路网是外来入侵植物肿柄菊(Tithonia diversifolia)进行远距离传播的主要途径,近些年肿柄菊在云南表现出迅速的扩散态势和较强的入侵能力。为探讨肿柄菊沿公路进行扩散过程中各种环境因素对群落建立的影响,本研究通过大范围沿公路实地调查,分析肿柄菊的扩散和分布特征及其影响因素。结果表明:肿柄菊分布于云南省北热带、南亚热带、中亚热带和北亚热带等多种气候类型区,分布区覆盖云南省71个县(区),与10多年前相比肿柄菊有明显的向北和向高海拔扩散趋势。肿柄菊向更高纬度和海拔扩散过程中,气候因素对群落分布有一定影响;在较低纬度和海拔区域肿柄菊的分布主要受人为干扰的影响。不同路缘生境类型影响肿柄菊沿公路扩散范围,植被郁闭度较低的草地、经济林地、农田等生境有利于群落的建立;而植被郁闭度较高原始林地和次生林地不利于群落建立。公路在肿柄菊的远距离扩散过程中起着重要作用,车流量大、车速高的高等级公路更有利于肿柄菊扩散,云南密集的高速公路网促进了肿柄菊沿公路扩散效率,加速了肿柄菊侵占新领地的过程。随着公路交通的快速发展,肿柄菊的扩散速度也明显加快,今后应对其种群发展趋势进行跟踪监测,以期为肿柄菊入侵预警提供基础信息。

关键词：植物扩散生境人为干扰群落建立

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云南热区4种林分土壤有机碳的比较研究

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西部林业科学 2013年第3期42卷 79-85页

作者：陈伟孟梦李江邱琼冯弦杨斌徐玉梅国家林业局重点开放性实验室云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201 云南省林业科学院云南昆明650201

以普洱市思茅区清水河13年生西南桦人工林、高阿丁枫人工林、思茅松人工林及思茅松天然林为研究对象,对林分土层0～50 cm土壤有机碳含量及密度进行调查分析。结果表明:(1)土壤有机碳含量、可溶性有机碳含量和土壤微生物量碳含量在4种林... 详细信息

以普洱市思茅区清水河13年生西南桦人工林、高阿丁枫人工林、思茅松人工林及思茅松天然林为研究对象,对林分土层0～50 cm土壤有机碳含量及密度进行调查分析。结果表明:(1)土壤有机碳含量、可溶性有机碳含量和土壤微生物量碳含量在4种林分中均呈随土层深度增加而递减的变化趋势,0～50 cm土层土壤有机碳含量为高阿丁枫人工林>西南桦人工林>思茅松人工林>思茅松天然林,土壤可溶性碳含量为高阿丁枫人工林最大,西南桦人工林最小;土壤微生物量碳主要集中于土壤表层,西南桦人工林土壤微生物量碳含量最高。(2)土壤可溶性碳占土壤有机碳的比值范围为0.32%～1.25%,3种人工林土壤表层微生物量碳占土壤有机碳的比值均大于思茅松天然林,3种人工林均处于碳的积累阶段。(3)0～50 cm土层土壤有机碳密度以思茅松人工林最大,达到85.79 t/hm2;其次为西南桦人工林、高阿丁枫人工林,思茅松天然林最低,为61.36 t/hm2。(4)土壤可溶性碳、土壤微生物量碳与土壤有机碳含量成显著的正相关关系,土壤有机碳和可溶性碳与土壤容重成显著的负相关关系。

关键词：云南热区人工林土壤有机碳

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