检索结果-内蒙古大学图书馆

中国农业科学 2025年第5期58卷 851-866页

作者：罗正英胡鑫吴转娣钱禛锋田春艳刘新龙李富生云南农业大学农学与生物技术学院/云南省作物生产与智慧农业重点实验室云南省农业科学院甘蔗研究所/云南甘蔗遗传改良重点实验室/农业农村部甘蔗生物学与遗传育种重点实验室(云南) 云南省农业科学院热带作物生物育种全国重点实验室

【目的】蔗茅（Erianthus fulvus）是甘蔗重要的野生资源，可用于改良品种的抗逆性和产量。系统鉴定和开发蔗茅基因组中的简单重复序列（simple sequence repeat,SSR）位点，筛选可利用的多态性SSR标记，解析蔗茅资源的遗传多样性特征... 详细信息

【目的】蔗茅（Erianthus fulvus）是甘蔗重要的野生资源，可用于改良品种的抗逆性和产量。系统鉴定和开发蔗茅基因组中的简单重复序列（simple sequence repeat,SSR）位点，筛选可利用的多态性SSR标记，解析蔗茅资源的遗传多样性特征，开发重要性状关联分子标记，对于利用蔗茅基因资源改良品种性状具有重要意义。【方法】采用生物信息学软件TBtools中的SSRminer模块，对二倍体蔗茅全基因组序列进行系统性SSR位点挖掘，并对所得数据进行统计分析，揭示其在基因组中的分布模式及规律。利用Batch Target Region Primer Design功能批量设计SSR引物，并通过Primer check工具评估引物的特异性。在6个蔗茅种质中，通过对随机合成的50对SSR引物和14对来自甘蔗的SSR引物进行扩增效率和多态性比较分析，验证引物多态性。【结果】共鉴定出152 707个蔗茅SSR位点，平均检测频率为5.64 kb/个，大部分分布在基因间区。SSR类型分布以单碱基、二碱基、三碱基为主。二核苷酸SSR类型中的基序重复次数变化最大，而五核苷酸的基序重复次数变异最低。共检测出883种不同的SSR基序重复类型，其中，A/T和AT/TA是最为丰富。共设计144 692对SSR引物，其中85 025对显示高特异性。这些特异性引物在基因组上呈现出两端密集、中间稀疏的分布特点。扩增试验显示，50对随机合成的SSR引物中，有42对在蔗茅中扩增出稳定清晰的条带，其中32对显示出多态性，多态率为64.0%。与甘蔗SSR引物相比，蔗茅SSR引物表现出更高的扩增效率和更好的多态性水平。经过筛选，从32对有效的蔗茅SSR引物中确定了16对多态性好且扩增条带清晰的引物。这16对引物共扩增出72条条带，多态性信息量（polymorphism information content,PIC）范围为0.63—0.83，平均PIC值为0.74，表明它们在蔗茅种质资源的多态性分析和分子标记研究中具有有效性和实用性。【结论】揭示了蔗茅基因组中高丰度和多样性的SSR分布特征。获得16对扩增效率高、多态性良好的SSR引物。

关键词：蔗茅基因组简单序列重复特异扩增多态性分析

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斑籽木中番茄黄化曲叶病毒与伴随卫星的分子鉴定及基因组结构分析

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植物保护学报 2025年第1期52卷 157-167页

作者：钟静李婷婷张水英封庆红罗予赵丽玲丁铭云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室农业农村部西南农业基因资源与种质创制重点实验室昆明650223 云南思农蔬菜种业发展有限责任公司楚雄651300

为明确番茄黄化曲叶病毒(tomato yellow leaf curl virus,TYLCV)对杂草斑籽木Baliospermum solanifolium的侵染情况,自云南省元谋县小丙岭村番茄地周边田间地头采集具有黄化、花叶症状的斑籽木病样和健康样品,对样品中病毒及伴随卫星进... 详细信息

为明确番茄黄化曲叶病毒(tomato yellow leaf curl virus,TYLCV)对杂草斑籽木Baliospermum solanifolium的侵染情况,自云南省元谋县小丙岭村番茄地周边田间地头采集具有黄化、花叶症状的斑籽木病样和健康样品,对样品中病毒及伴随卫星进行PCR检测、全基因组克隆和测序、SDT比对分析、基因组结构特征分析和重组分析。结果显示:从2个斑籽木病样中共分离到4条菜豆金色花叶病毒属Begomovirus病毒DNA-A全序列和4条β卫星全序列;分离的4条DNA-A全基因组序列均与TYLCV中国分离物的核苷酸序列相似性最高,为100.0%;在分离的4条β卫星全序列中,2条β卫星分离物与赛葵黄脉β卫星(Malvastrum yellow vein betasatellite,MaYVB)分离物的核苷酸序列相似性最高,大于99.2%,另外2条β卫星分离物与中国番茄曲叶β卫星(tomato leaf curl China betasatellite,ToLCCNB)分离物的核苷酸序列相似性最高,大于94.6%;系统进化分析结果显示所获得的分离物均与云南省TYLCV分离物亲缘关系较近,获得的所有序列均未发现重组现象。表明TYLCV可伴随不同种的β卫星共同侵染斑籽木,斑籽木是一个易感TYLCV的中间寄主。

关键词：番茄黄化曲叶病毒斑籽木 β卫星重组分析序列比对发育树

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芦笋DUF247基因家族成员鉴定及表达分析

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生物技术通报 2025年第1期41卷 198-209页

作者：李云宾黎玉萍成钦林春毛自朝刘正杰云南农业大学农学与生物技术学院昆明650201 云南省作物生产与智慧农业重点实验室昆明650201

【目的】对芦笋全基因组DUF247家族进行鉴定与分析,为该基因家族特别是AoSOFF的性别决定的分子功能研究奠定基础。【方法】利用生物信息学方法对芦笋中的DUF247基因家族成员进行鉴定,开展其各成员编码蛋白理化性质、聚类、蛋白保守结构... 详细信息

【目的】对芦笋全基因组DUF247家族进行鉴定与分析,为该基因家族特别是AoSOFF的性别决定的分子功能研究奠定基础。【方法】利用生物信息学方法对芦笋中的DUF247基因家族成员进行鉴定,开展其各成员编码蛋白理化性质、聚类、蛋白保守结构域、启动子中顺式作用元件及表达模式分析;利用实时定量PCR(RT-qPCR)和组织原位杂交技术验证芦笋性别决定基因AoSOFF的表达模式。【结果】芦笋中鉴定出24个DUF247基因家族成员,它们不均匀地分布在7条染色体上,且在不同器官中呈现差异表达。该家族成员编码蛋白的理化性质如氨基酸组成、分子量、理论等电点、不稳定系数和脂肪族系数等都存在差异。RT-qPCR和组织原位杂交结果表明,DUF247基因家族成员之一AoSOFF在芦笋雄花无性别分化早期的雌蕊、雄蕊以及花冠中均有较高表达,但在性别分化早期开始降低表达;在两性花中的表达量较低;而在雌性芦笋各组织中表达极低或检测不到,说明AoSOFF在雄性芦笋中特异性表达,与芦笋性别决定中的雌性抑制功能密切相关。【结论】芦笋DUF247家族成员具有明显的保守性,在芦笋不同性别的不同组织中的表达模式存在显著差异,特别是AoSOFF是一个雄性专一性基因,其同源基因参与植物的自交亲和调控,预示其以自交不亲和类似的反应导致雌性发育的抑制。

关键词：芦笋 DUF247 AoSOFF 性别分化雄性专一性雌性抑制原位杂交

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番茄褐色皱纹果病毒(ToBRFV)云南建水分离物鉴定及全基因组序列分析

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植物病理学报 2025年第2期55卷 194-202页

作者：肖雨晴吕高莹李树军陈永对苏晓霞杨李源滨周晓罡余大朝王田田郑宽瑜张仲凯云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室昆明650205 云南神谷科技股份有限公司昆明650220

番茄褐色皱纹果病毒(tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)近年来在全球番茄产区快速发生蔓延,造成严重的经济损失。云南建水番茄上出现疑似ToBRFV感染的症状,并对周边番茄产区产生危害。本研究对云南建水田间疑似ToBRFV感染的番茄... 详细信息

番茄褐色皱纹果病毒(tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)近年来在全球番茄产区快速发生蔓延,造成严重的经济损失。云南建水番茄上出现疑似ToBRFV感染的症状,并对周边番茄产区产生危害。本研究对云南建水田间疑似ToBRFV感染的番茄果实样品进行电子显微镜观察及RT-PCR检测鉴定,并进一步对分离株进行全基因组测序分析,构建系统进化树分析其与其它ToBRFV分离株的进化关系。结果表明,从感病的番茄果实上发现杆状病毒粒体,大小约18 nm×300 nm,具有烟草花叶病毒属病毒的典型形态特征;用ToBRFV特异性检测引物进行RT-PCR扩增得到591 bp目的片段,经NCBI blast比对,与ToBRFV具有最高一致率(达99%以上),将该分离株命名为ToBRFV-2022-JS(GenBank登录号:OR593752)。测序发现ToBRFV-2022-JS基因组全长6386 nt,具有4个ORFs,分别编码126 kDa和183 kDa复制酶,30 kDa运动蛋白MP和17.5 kDa外壳蛋白CP。进化树分析显示该分离株与ToBRFV银川分离株(GenBank登录号:OR500698.1)的亲缘关系最近,核苷酸序列一致率为99.73%。上述结果表明云南建水番茄果实受到ToBRFV感染。该结果为ToBRFV在云南番茄产区的监测与防控提供了依据。

关键词：番茄褐色皱纹果病毒云南建水番茄果实病毒基因组系统进化分析

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钾肥对甘蔗根际微生物多样性和群落构建过程的影响

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应用生态学报 2025年第2期36卷 526-536页

作者：张仲富王禹童艾静刀静梅李傲梅邓军吴建明赵勇云南省农业科学院热带作物生物育种全国重点实验室昆明650000 云南省农业科学院甘蔗研究所云南开远661699 广西农业科学院甘蔗研究所/广西甘蔗遗传改良重点实验室/农业农村部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室广西南宁530007

微生物丰富种群和稀有种群在生态系统中发挥着防止病原体传播、控制养分循环和促进污染物降解等关键作用,但目前在农田生态系统中关注较少。本研究使用高通量测序技术和构建生态模型系统评估了不同施钾量(0、75、150、225和300 kg·... 详细信息

微生物丰富种群和稀有种群在生态系统中发挥着防止病原体传播、控制养分循环和促进污染物降解等关键作用,但目前在农田生态系统中关注较少。本研究使用高通量测序技术和构建生态模型系统评估了不同施钾量(0、75、150、225和300 kg·hm^(-2))对甘蔗根际土壤细菌和真菌的丰富种群及稀有种群多样性、驱动因素和群落构建过程的影响。结果表明:施钾肥能够显著改变甘蔗土壤养分含量和酶活性特征,在施钾量为300和225 kg·hm^(-2)时土壤养分含量和酶活性分别达到最高。甘蔗根际土壤微生物的丰富种群集中在几个优势类群中,施钾肥能够极显著改变根际微生物物种组成和群落结构。施钾肥条件下土壤脲酶、有机质和过氧化氢酶等是影响细菌和真菌丰富种群与稀有种群群落结构的主要限制性因子。同时施钾肥对根际细菌群落的影响大于真菌,对丰富种群的影响大于稀有种群。施钾肥后甘蔗根际细菌和真菌群落构建过程主要由确定性过程驱动,细菌群落中异质选择占主导过程,而真菌群落中同质选择占主导过程,同时细菌和真菌丰富种群和稀有种群的群落构建也受确定性过程驱动。综上表明,施钾对甘蔗土壤养分和酶活性存在显著影响,增施钾肥有助于增加细菌和真菌丰富种群及稀有种群的多样性,调控甘蔗根际土壤微生物群落构建过程。

关键词：甘蔗钾肥根际微生物群落微生物丰富种群微生物稀有种群群落构建土壤酶活性

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苦荞RILs群体千粒质量和粒形的遗传特性分析

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江西农业大学学报 2025年第2期47卷 302-313页

作者：石茂竹黎瑞源刘迪陈庆富王莉花石桃雄贵州师范大学生命科学学院贵州贵阳550001 贵州师范大学贵州省信息与计算科学重点实验室贵州贵阳550001 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室云南昆明650205

【目的】千粒质量是苦荞产量性状三大构成因素之一,其大小由粒形(粒长、粒宽和粒厚)和籽粒充实度等决定,研究千粒质量和粒形的遗传变异与分子机理对苦荞育种有着十分重要的意义。【方法】以‘晋荞麦2号×品苦1号’衍生的重组自交系(... 详细信息

【目的】千粒质量是苦荞产量性状三大构成因素之一,其大小由粒形(粒长、粒宽和粒厚)和籽粒充实度等决定,研究千粒质量和粒形的遗传变异与分子机理对苦荞育种有着十分重要的意义。【方法】以‘晋荞麦2号×品苦1号’衍生的重组自交系(JP-RILs)群体为材料,在2个环境中对粒长、粒宽、长宽比及千粒质量等4个性状进行变异、主基因+多基因遗传模型、相关性和聚类等分析。【结果】在E1和E22个环境中,JP-RILs群体的4个调查性状均呈现连续的变异及明显的双向超亲分离现象,其中长宽比变异系数最大(15.30%、15.70%),其次是粒长(11.27%、11.03%),粒宽变异系数最小(5.46%、5.94%)。粒宽的最佳模型均为MX1-A-AI,受1对加性上位性主基因+加性多基因控制,主基因遗传率分别为69.84%和62.68%,多基因遗传率分别为23.90%和34.24%。长宽比的最佳模型均为4MG-AI,受4对加性主基因控制,主基因遗传率分别为98.07%和98.26%。粒长的最佳模型分别为4MG-AI和1MG-A,受4对或1对加性主基因控制,主基因遗传率分别为97.98%和88.39%。千粒质量的最佳模型分别为2MG-DE和4MG-EEEA,受2对重叠主基因或4对加性主基因控制,主基因遗传率分别为36.61%和70.43%。聚类分析筛选出千粒质量较大的长粒和圆粒类型以及千粒质量较低的圆粒类型,可作为新品种选育以及粒形和千粒质量遗传学研究的基础材料。【结论】苦荞JP-RILs群体千粒质量和粒形均存在明显的主效基因,且上位性效应占主导地位,为苦荞粒形和千粒质量的QTL定位和遗传改良提供依据。

关键词：苦荞重组自交系粒形主基因+多基因遗传模型相关性分析聚类分析

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三元低共熔溶剂预处理对龙竹酶解糖化和乙醇发酵的影响

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林业工程学报 2025年第1期10卷 86-96页

作者：曹静刘昭明杨海艳史正军王大伟石纯杨静西南林业大学材料与化学工程学院昆明650224 云南省高校特色林木生物质资源化学利用重点实验室西南林业大学昆明650224

笔者以滇产龙竹为原料,通过对其进行三乙基苄基氯化铵/草酸(TEBAC/OA)二元低共熔溶剂(DES)和TEBAC/OA/H_(2)O三元DES预处理,以预处理底物的酶解糖化效率和乙醇发酵浓度作为预处理性能的评价指标,并对比分析预处理前后龙竹和再生木质素... 详细信息

笔者以滇产龙竹为原料,通过对其进行三乙基苄基氯化铵/草酸(TEBAC/OA)二元低共熔溶剂(DES)和TEBAC/OA/H_(2)O三元DES预处理,以预处理底物的酶解糖化效率和乙醇发酵浓度作为预处理性能的评价指标,并对比分析预处理前后龙竹和再生木质素的结构特征,探索TEBAC/OA/H_(2)O三元DES预处理的机制。试验结果表明:在TEBAC/OA和H_(2)O物质的量比为1∶5,反应温度为140℃,反应时间为6 h时,三元TEBAC/OA/H_(2)O预处理对龙竹的木质素脱除率为90.53%;底物预处理在酶用量为13 FPU/g底物的情况下,酶解得率由二元DES的54.70%增加至70.77%,相应地,发酵乙醇含量由13.25 g/L提高至18.33 g/L。X射线光电子能谱、X射线衍射和比表面积与孔径分析结果显示,三元DES与二元DES预处理相比,底物的表面木质素覆盖率和结晶度/纤维素含量比值分别降低了16.62%和28.57%,比表面积增加了16.23%;同时,底物的疏水度、聚合度分别降低了47.93%和6.72%,纤维素酶可及度增加了28.80%,表明三元DES预处理可使纤维素发生一定程度的润胀,无定型区域的部分木质素和半纤维素被去除,这能够为纤维素酶提供更多的活性位点。此外,木质素的核磁共振结果表明,与二元DES预处理相比,三元DES预处理可更好地保留再生木质素的完整性,且对木质素的缩合反应有一定的抑制作用。本研究结果为开发生物质能源、材料和化学品等提供了一定的参考价值。

关键词：龙竹低共熔溶剂预处理酶水解乙醇发酵

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甘蔗近缘野生种蔗茅的研究进展和利用潜力

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植物遗传资源学报 2025年

作者：钱禛锋赵昌祖万慧兰何丽莲王先宏李富生云南农业大学农学与生物技术学院云南农业大学甘蔗研究所云南省作物生产与智慧农业重点实验室

现代甘蔗栽培品种主要是甘蔗属里2-5个甘蔗原种的少数无性系的杂交后代，遗传背景狭窄，血缘相近，致使近30年来甘蔗品种的产量、糖分和抗性等方面一直难有较大突破。充分利用甘蔗近缘野生种，是拓宽甘蔗遗传背景和加速甘蔗高贵化育种... 详细信息

现代甘蔗栽培品种主要是甘蔗属里2-5个甘蔗原种的少数无性系的杂交后代，遗传背景狭窄，血缘相近，致使近30年来甘蔗品种的产量、糖分和抗性等方面一直难有较大突破。充分利用甘蔗近缘野生种，是拓宽甘蔗遗传背景和加速甘蔗高贵化育种的重要基础。蔗茅属于甘蔗的近缘野生种，是甘蔗育种的重要野生种质，也是甘蔗属复合体基因组演化和功能基因解析的重要资源。自20世纪80年代以来，蔗茅种质资源的采集和研究，以及甘蔗与蔗茅的属间远缘杂交和抗旱耐冷甘蔗新品种培育取得重要进展。另外，蔗茅的许多优异性状，包括高糖、耐冷和抗旱等的生理及分子响应机制也逐渐被解析。为更好探索蔗茅优异性状的分子基础及其在甘蔗育种中的应用价值，本文系统综述蔗茅的研究进展和利用现状，分析蔗茅的遗传多样性和基因组演化特性，解析蔗茅中蔗糖合成和转运的主要通路及其关键基因的转录模式，并进一步提出蔗茅作为模式植物和生物燃料植物的应用潜力；同时，分析了蔗茅对低温和干旱胁迫的分子响应特征，讨论了蔗茅在甘蔗育种研究和利用中存在的问题，展望了未来发展方向。

关键词：甘蔗蔗茅种质创新遗传多样性高糖育种抗逆性

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植物中谷氨酸代谢及其在响应逆境胁迫中的作用

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植物生理学报 2025年第2期61卷 123-133页

作者：葛硕实袁柱东刘运通崔海杨晓杜绍媚朱梓桐杨利云玉溪师范学院化学生物与环境学院云南省高校滇中农业生物资源开发利用与环境保护重点实验室云南省高校玉溪特色农业资源发掘与利用重点实验室云南玉溪653100 云南师范大学生命科学学院生物能源持续开发利用教育部工程中心云南省生物质能与环境生物技术重点实验室昆明650500

植物中广泛存在与哺乳动物细胞中离子型谷氨酸受体(ionotropic glutamate receptors, iGLuRs)同源的谷氨酸受体(glutamate receptors-like receptors, GLRs)。谷氨酸(glutamate, Glu)可广泛调控植物形态建成、生长发育及其对环境胁迫的响应和适应,暗示着Glu在植物中可能作为一个新型信号分子发挥作用。结合最新研究进展,本文综述了Glu在植物体内代谢及其在植物形态建成、生长发育、响应和适应各种环境胁迫中的作用及机制,以期为植物抗逆性研究提供新的思路和方向。

关键词：谷氨酸代谢信号分子耐逆性

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当归肉桂醇脱氢酶AsCAD功能鉴定及表达分析

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生物技术通报 2025年第2期41卷 295-308页

作者：向春繁李勒松王娟梁艳丽杨生超栗孟飞赵艳云南农业大学西南中药材种质创新与利用国家地方联合工程研究中心云南省药用植物生物学重点实验室农学与生物技术学院昆明650201 云南特色植物提取实验室昆明650106 甘肃农业大学农学院兰州730070

【目的】探究当归中木质素合成关键肉桂醇脱氢酶的催化活性及表达特性,为解决当归抽薹后根部木质化问题提供新的研究思路和理论基础。【方法】以非木质化根(UBP)和木质化根(BP)为实验材料,基于转录组数据挖掘候选肉桂醇脱氢酶基因;克隆A... 详细信息

【目的】探究当归中木质素合成关键肉桂醇脱氢酶的催化活性及表达特性,为解决当归抽薹后根部木质化问题提供新的研究思路和理论基础。【方法】以非木质化根(UBP)和木质化根(BP)为实验材料,基于转录组数据挖掘候选肉桂醇脱氢酶基因;克隆AsCADs基因的全长CDS,构建pET-28a-AsCADs原核表达载体,转入大肠杆菌(***)BL21(DE3),并诱导重组蛋白表达及体外酶活测定;生物信息学分析具有活性的CAD蛋白序列;利用实时荧光定量PCR对木质化和非木质化根部进行基因表达模式分析。【结果】共鉴定出30个AsCADs基因,其中挖掘并克隆到3个肉桂醇脱氢酶基因AsCAD1、AsCAD4和AsCAD24,均包含2个Zn^(2+)结合位点和1个NAD(H)辅酶结合位点。体外酶活测定发现AsCAD1能催化松柏醛和咖啡醛还原为相应的醇,AsCAD4和AsCAD24能催化对羟基肉桂醛、松柏醛、咖啡醛和芥子醛还原为相应的醇。AsCAD1、AsCAD4和AsCAD24开放阅读框为1083 bp,编码360个氨基酸,理论等电点(p I)为6.1和5.52,AsCAD1为疏水性蛋白,AsCAD4和AsCAD24为亲水性蛋白,均不含跨膜结构和信号肽,亚细胞定位均定位在细胞质中。RT-q PCR结果显示AsCAD1在非木质化根(UBP)中的表达量高,而AsCAD4和AsCAD24在木质化根(BP)中的表达量高。【结论】成功克隆了AsCAD1、AsCAD4和AsCAD24基因,原核表达后蛋白均具有催化活性,其相对表达水平在木质化与非木质化根中存在差异。

关键词：当归木质化肉桂醇脱氢酶原核表达体外酶活表达分析

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