检索结果-内蒙古大学图书馆

广西植物 2018年第9期38卷 1146-1154页

作者：原晓龙华梅陈剑王娟杨宇明王毅云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650204

为了研究牛樟芝中PKS基因与化合物之间的关系,该研究通过对牛樟芝基因组分析获得牛樟芝聚酮合酶基因,以此序列为模板设计含有起始密码子和终止密码子的特异引物并以牛樟芝c DNA为模板克隆获得一个高度还原型PKS(HR-PKS)基因全长,命名为A... 详细信息

为了研究牛樟芝中PKS基因与化合物之间的关系,该研究通过对牛樟芝基因组分析获得牛樟芝聚酮合酶基因,以此序列为模板设计含有起始密码子和终止密码子的特异引物并以牛樟芝c DNA为模板克隆获得一个高度还原型PKS(HR-PKS)基因全长,命名为AcPKS2;对AcPKS2基因进行生物信息学分析,并比较该基因在不同培养基上的表达量。结果表明:AcPKS2全长7 842 bp,有24个内含子,其外显子共编码2 613个氨基酸,该蛋白的相对分子质量为293.5 kDa,理论等电点pI为5.78。用CDD分析其结构域显示,该基因属于HR-PKS,其结构域组织排列为KS-AT-DH-MT-ER-KR-ACP-TE,8个结构域其活性位点分别为β-酮基合成酶(DTACSSSL)、酰基转移酶(GHSIGETA)、脱水酶(RNDGSTSPL)、甲基转移酶(SFDIITAFDV)、烯酰还原酶(HAGVSSPAA)、酮基还原酶(GSPGQANYTAA)、酰基转移酶(YGLDSLTSVRL)、硫酯酶(KQPNGPY)。系统发育树显示AcPKS2与其他化合物未知的HR-PKS蛋白聚为一支,结构域和系统进化树分析显示该基因可能编码一种新的含TE结构域高度还原型聚酮合酶;表达分析结果显示葡萄糖和果糖能够诱导该基因的表达。

关键词：牛樟芝高度还原型PKS 生物信息学分析基因表达

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滇牡丹类黄酮7-O-葡萄糖基转移酶基因的鉴定与表达分析

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西部林业科学 2018年第5期47卷 19-25页

作者：原晓龙陈剑陈中华华梅王娟王毅云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

以野生滇牡丹为试验材料,以其转录组数据为基础,采用反转录PCR技术克隆得到一个具完整开放阅读框的类黄酮7-O-葡萄糖基转移酶基因(Pd7GT),并通过生物信息学分析手段、基因表达对该基因进行分析。结果显示:该基因全长1 446bp (Gen Bank... 详细信息

以野生滇牡丹为试验材料,以其转录组数据为基础,采用反转录PCR技术克隆得到一个具完整开放阅读框的类黄酮7-O-葡萄糖基转移酶基因(Pd7GT),并通过生物信息学分析手段、基因表达对该基因进行分析。结果显示:该基因全长1 446bp (Gen Bank登录号为KX394687),可编码481个蛋白氨基酸;生物信息学分析发现Pd7GT蛋白C末端含有典型糖基转移酶识别区(WAPQV)和UDP-葡萄糖基配体绑定位点(HCGWNS)的PSPG盒子,其蛋白序列GWAPQVMILEHEAVGGFVTHCGWNSTLEGISAGLPLVTWPIFAEQFYNEK,与可可(XP_007042481)、Herrannia umbratica (XP_021298085)、毛果杨(XP_006379195)、巨桉(XP_010066837)等以葡萄糖为糖基配体的类黄酮7-O-糖基转移酶聚为一类; Pd7GT基因在组织茎中表达量最高、不同花发育时期的花谢期表达量最高、不同颜色花瓣中黄花花瓣表达量最高。本研究为滇牡丹糖基转移酶异源表达、分子育种等研究提供一定的基础,为未来通过基因工程培育具新颖花色和抗性的滇牡丹新品种提供必要材料。

关键词：滇牡丹类黄酮7-O-葡萄糖基转移酶生物信息学分析基因表达

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高产脂思茅松牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因的克隆及表达

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福建农林大学学报（自然科学版） 2018年第6期47卷 711-716页

作者：王毅原晓龙陈伟李江云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

以高产脂思茅松为材料,基于转录组数据分析,采用RT-PCR方法获得思茅松牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(GGPS)基因的c DNA序列,Gen Bank登录号为KM382173.1.序列分析显示,思茅松GGPS基因c DNA全长1 152 bp,编码383个氨基酸,属于GGPS家族.... 详细信息

以高产脂思茅松为材料,基于转录组数据分析,采用RT-PCR方法获得思茅松牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(GGPS)基因的c DNA序列,Gen Bank登录号为KM382173.1.序列分析显示,思茅松GGPS基因c DNA全长1 152 bp,编码383个氨基酸,属于GGPS家族.序列比对分析显示,思茅松GGPS拥有GGPS家族特有的两个功能保守结构域FARM(DDLPSMDND)、SARM(DDILD),其与马尾松GGPS的同源性为78.07%.系统进化树分析显示,思茅松GGPS与马尾松GGPS的亲缘关系最近.荧光定量PCR分析表明,在思茅松的树皮中,GGPS基因的表达明显受到割脂物理伤害的诱导,在高产脂思茅松个体幼枝中的表达量远远高于在低产脂思茅松个体的表达量.

关键词：高产脂思茅松牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(GGPS) 荧光定量PCR 基因功能

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滇牡丹类黄酮5-O-葡萄糖基转移酶基因的鉴定及表达分析

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北方园艺 2018年第14期 102-108页

作者：原晓龙陈剑陈中华华梅王毅云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

以野生黄花滇牡丹(Paeonia delavayi)为试材,采用RT-PCR技术,克隆得到一个具完整开放阅读框的类黄酮5-O-葡萄糖基转移酶(Pd5GT)基因,并对其进行生物信息学分析和转录模式分析,以期为研究滇牡丹花色素形成机理,滇牡丹糖基转移酶功能鉴定... 详细信息

以野生黄花滇牡丹(Paeonia delavayi)为试材,采用RT-PCR技术,克隆得到一个具完整开放阅读框的类黄酮5-O-葡萄糖基转移酶(Pd5GT)基因,并对其进行生物信息学分析和转录模式分析,以期为研究滇牡丹花色素形成机理,滇牡丹糖基转移酶功能鉴定及花卉品质改良提供理论基础。结果表明:该基因全长1 410bp,编码469个氨基酸(GenBank登录号:ARA67364);生物信息学分析发现Pd5GT蛋白C末端含有PSPG盒子,其氨基酸序列为WCSQVEVLSHPSLGCFVTHCGWNSTTESLVCGVPVVAFPQWTDQGTNAKL,与已知功能的5GT蛋白序列聚为一类;该基因在茎、叶中微弱表达,在花中大量表达,在不同颜色的花瓣中均可大量表达。综上所述Pd5GT基因可能编码5-O-糖基转移酶,具有一定的组织特异性,花色特异性不明显。

关键词：滇牡丹糖基转移酶克隆基因表达分析

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岩生树花地衣型真菌NRPS基因的生物信息学分析

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西部林业科学 2018年第2期47卷 21-25,38页

作者：原晓龙陈剑华梅李云琴王娟杨宇明王毅云南省林业科学院云南昆明650201 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

为了挖掘岩生树花地衣型真菌转录组数据中的NRPS基因,找出其潜在化合物或蛋白,以岩生树花地衣型真菌的转录组数据为基础,分析获得一个新的NRPS基因(Ri NRPS)。利用BLAST比对、分子系统进化及anti SMASH、NRPS predictor、Na PDo S、Nor... 详细信息

为了挖掘岩生树花地衣型真菌转录组数据中的NRPS基因,找出其潜在化合物或蛋白,以岩生树花地衣型真菌的转录组数据为基础,分析获得一个新的NRPS基因(Ri NRPS)。利用BLAST比对、分子系统进化及anti SMASH、NRPS predictor、Na PDo S、Norine等生物信息学分析手段对岩生树花地衣型真菌Ri NRPS基因进行分析,结果显示,Ri NRPS基因相对分子质量为702 699.9,等电点5.83,为不稳定蛋白;其开放阅读框总长19 098bp,编码6 362个氨基酸;该蛋白不存在信号肽,为非分泌蛋白,定位于细胞质基质中;可能合成HC-toxin合成酶,可能的催化反应是以Orn(鸟氨酸)、Gln(谷氨酰胺)、Gln(谷氨酰胺)、Cys(半胱氨酸)4个氨基酸作为底物合成环状四肽,此环状四肽可能是一种具毒素活性的多肽、其结构式为C21H32N4O6。研究结果为以后岩生树花NRPS基因的挖掘及非核糖体多肽类物质的生物合成提供参考。

关键词：岩生树花 RiNRPS基因 HC-toxin合成酶生物信息学分析

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牡丹花瓣高效液相色谱指纹图谱研究

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西部林业科学 2018年第1期47卷 52-58页

作者：华梅原晓龙王毅杨卫陈剑马惠芬呼延丽杨宇明王娟云南省林业科学院云南昆明650201 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室云南昆明650201

以不同引种地不同品种的9个新鲜牡丹花瓣为实验材料,采用高效液相色谱法(HPLC)测定9个不同引种地不同品种牡丹花瓣样品中的化学成分。液相色谱条件为Eclipse plus C18色谱柱(4.6×150mm,5μm),流动相为乙腈-1%乙酸梯度洗脱,流速0.8m... 详细信息

以不同引种地不同品种的9个新鲜牡丹花瓣为实验材料,采用高效液相色谱法(HPLC)测定9个不同引种地不同品种牡丹花瓣样品中的化学成分。液相色谱条件为Eclipse plus C18色谱柱(4.6×150mm,5μm),流动相为乙腈-1%乙酸梯度洗脱,流速0.8mL/min,检测波长360nm,柱温为35℃。通过中药色谱指纹图谱相似度评价系统(国家药典委员会)进行相似度分析,建立9个样品牡丹花瓣的指纹图谱,为科学评价与有效控制牡丹花瓣产品质量提供新方法。结果表明,本研究建立的分析方法有较好的重复性,9个引种牡丹花瓣样品指纹图谱共有6个主要共有峰,可作为鉴别引种地牡丹花瓣质量的主要依据。

关键词：牡丹花瓣高效液相色谱指纹图谱

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Leptographiumbhutanense提取物抑菌活性的初步分析

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基因组学与应用生物学 2018年第2期37卷 808-814页

作者：肖支叶原晓龙华梅陈剑邱坚郑科王毅西南林业大学材料工程学院昆明650224 云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室、国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

内生真菌是动植物体内的微生物类群,其多样性、复杂性和特殊性的特点使其能够产生化学结构新颖、具有多种生物活性的次生代谢产物。本研究采用纸片法检测Leptographium bhutanense发酵提取物对13种致病细菌的抑菌活性,并对抗菌化合物的... 详细信息

内生真菌是动植物体内的微生物类群,其多样性、复杂性和特殊性的特点使其能够产生化学结构新颖、具有多种生物活性的次生代谢产物。本研究采用纸片法检测Leptographium bhutanense发酵提取物对13种致病细菌的抑菌活性,并对抗菌化合物的最低抑菌浓度（MIC）、热稳定性、光稳定性进行检测;同时,采用OSMAC策略寻找产抗菌化合物的最佳培养基、最佳培养时间和最佳接种量。分析显示提取物对3种人体致病细菌（蜡样芽孢杆菌,副溶血性弧菌,溶血性葡萄球菌）具有抑菌活性;其MIC值分别为：12.5mg/mL、6.25 mg/mL和6.25 mg/mL;提取物具有较好的热稳定性和光稳定性。产抗菌化合物的最佳培养基为：MFS,最佳培养时间和最佳接种量分别为15 d和1.0 g/100 mL。本研究为昆虫内生真菌抗菌化合物的开发利用提供帮助。

关键词：昆虫内生真菌 Leptographium bhutanense 提取物抑菌活性最低抑菌浓度稳定性

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清香桂红色与绿色茎干株系的RAPD差异分析

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云南农业大学学报（自然科学版） 2018年第5期33卷 898-903页

作者：陈海云周筑白平李红永培伟吴涛张学星云南省林业科学院云南昆明650201 云南山川园林有限公司云南昆明650100 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室云南昆明650201

【目的】分别以红色和绿色茎干的清香桂植株为材料,对其遗传物质进行分子水平上的差异检测。【方法】用混合DNA样品对200个10碱基随机引物进行筛选,然后用筛出的引物对红色和绿色茎干的清香桂单株DNA样品各14个进行RAPD-PCR扩增,对差异... 详细信息

【目的】分别以红色和绿色茎干的清香桂植株为材料,对其遗传物质进行分子水平上的差异检测。【方法】用混合DNA样品对200个10碱基随机引物进行筛选,然后用筛出的引物对红色和绿色茎干的清香桂单株DNA样品各14个进行RAPD-PCR扩增,对差异性条带进行回收测序和核苷酸序列分析。【结果】43个引物在28个样品中具有多态性,8个能在多数红色和绿色茎干植株中产生差异条带,其中3个引物(C06、M09和N10)可稳定地产生清晰的7个差异性条带,且条带C06-350在所有14个红茎植株类型中都出现而在14个绿茎植株中均缺失,其核苷酸序列长度为352～381 bp,在NCBI上未搜索到同源的核苷酸或氨基酸序列。【结论】红茎与绿茎清香桂植株之间发生了遗传变化,C06-350是与清香桂红茎特征紧密联系的1个标记。

关键词：清香桂红色茎干 RAPD

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蒜头果的内生真菌多样性分析

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基因组学与应用生物学 2018年第9期37卷 3859-3866页

作者：王毅王娟王四海李云琴原晓龙陈中华云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201 中国科学院昆明植物研究所/植物化学与西部植物资源持续利用国家重点实验室昆明650201

蒜头果为我国特有单种属植物,其果实富含神经酸,是一种很有开发前景的野生植物资源。为了解蒜头果中内生真菌的种类及分布情况,本研究对生长于裸露石灰岩山地和石灰岩林地两种生境的蒜头果分别取样,利用传统分离方法对蒜头果的根、树皮... 详细信息

蒜头果为我国特有单种属植物,其果实富含神经酸,是一种很有开发前景的野生植物资源。为了解蒜头果中内生真菌的种类及分布情况,本研究对生长于裸露石灰岩山地和石灰岩林地两种生境的蒜头果分别取样,利用传统分离方法对蒜头果的根、树皮及叶组织中的内生真菌进行分离纯化,并依据形态学特征和r DNA-ITS序列对菌种进行鉴定。所有样品共分离获得112株内生真菌,分别属于10个属,其中紫霉属（Purpureocillium）、酵母样菌属（Acaromyces）、木霉属（Trichoderma）、淡紫紫孢菌（Purpureocillium lilacinum）为优势菌种。分析显示内生真菌在不同部位差异明显,根中内生真菌分布最为普遍,两种生境条件下分离率都为100%,对比之下树皮分离率分别为56.7%和63.3%,叶的都为26.7%。不同生境对蒜头果内生真菌具有明显影响,在裸露石灰岩山地根、树皮、叶的多样性指数分别为0.756、1.518和0.662,石灰岩林地分别为1.412、1.439和0.974。在两种生境条件下,树皮的真菌多样性相似,根和叶的多样性都表现出石灰岩林地高于裸露石灰岩山地。

关键词：蒜头果植物内生真菌多样性石灰岩山地

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福贡龙竹种子无菌诱导植株再生及快速繁殖

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西部林业科学 2018年第3期47卷 118-122页

作者：呼延丽毕玮李灿雯李丹王娟王毅王四海杨宇明云南省林业科学院云南昆明650201 国家林业局重点开放性实验室云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201

以福贡龙竹种子为外植体,开展组培快繁技术研究。结果表明,用75%酒精消毒60s,再用0.1%的Hg Cl2溶液消毒30min的效果最好;适宜诱导形成丛生芽的培养基为MS+6-BA 2mg/L+IBA 0.5mg/L+KT 0.2mg/L;最佳继代增殖培养基为MS+6-BA 3mg/L+NAA 0.2... 详细信息

以福贡龙竹种子为外植体,开展组培快繁技术研究。结果表明,用75%酒精消毒60s,再用0.1%的Hg Cl2溶液消毒30min的效果最好;适宜诱导形成丛生芽的培养基为MS+6-BA 2mg/L+IBA 0.5mg/L+KT 0.2mg/L;最佳继代增殖培养基为MS+6-BA 3mg/L+NAA 0.2mg/L;以MS+IBA 1mg/L+NAA 0.5mg/L为最佳生根培养基;将生根组培苗炼苗移栽,90d后成活率达81%以上。

关键词：福贡龙竹组织培养丛芽诱导快速繁殖

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