检索结果-内蒙古大学图书馆

经济林研究 2021年第4期39卷 148-157页

作者：冯发玉王毅王丽娟罗玛妮娅徐令文杨彦萍陆斌西南林业大学林学院云南昆明650224 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201 云南省林业和草原科学院国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

【目的】利用测序获得的竹叶花椒Zanthoxylum armatum转录组数据,研究竹叶花椒中MYB转录因子家族的序列信息、进化模式、表达模式,探寻此家族中参与竹叶花椒皮刺生长发育的相关基因,为进一步揭示MYB转录因子家族生物学功能提供理论依据... 详细信息

【目的】利用测序获得的竹叶花椒Zanthoxylum armatum转录组数据,研究竹叶花椒中MYB转录因子家族的序列信息、进化模式、表达模式,探寻此家族中参与竹叶花椒皮刺生长发育的相关基因,为进一步揭示MYB转录因子家族生物学功能提供理论依据,为后续的无刺竹叶花椒品种的基因工程培育奠定理论基础。【方法】利用生物信息学方法,从测序获得的竹叶花椒转录组数据库中筛选MYB转录因子,对其蛋白基序、理化性质、系统进化关系、基因表达特性等进行分析,并利用qRT-PCR技术和基因克隆,对所选基因进行验证。【结果】从竹叶花椒中共鉴定出39条MYB转录因子序列,其中包括9个R1-MYB型基因、28个R2R3-MYB型基因、1个R3型基因和1个R4型基因。对其蛋白理化性质的分析结果表明:39个MYB转录因子所含氨基酸数量为101~621个,其均为可溶性蛋白,而其二级结构以无规则卷曲为主。亚细胞定位预测结果显示:39个MYB转录因子定位于细胞核的可能性最大,这符合转录因子调控下游基因的表达特性。基因表达情况的分析结果显示:部分MYB转录因子在竹叶花椒同一组织的不同发育时期的表达差异显著,其中ZaMYB10、ZaMYB23和ZaMYB25这3个基因的表达量随着皮刺的不断发育均呈逐渐增长的趋势,表明这3个基因可能与皮刺的生长发育相关。qRT-PCR分析结果表明:ZaMYB10基因在皮刺中有特异表达。基因克隆结果表明:ZaMYB10基因具有长为1032 bp的完整的cDNA开放阅读框,其编码343个氨基酸。【结论】鉴定出39个竹叶花椒MYB转录因子,其均包含SANT保守结构域,根据表达模式判断,其中的ZaMYB10转录因子可能参与了竹叶花椒皮刺生长发育的调控。

关键词：竹叶花椒 MYB 皮刺生物信息学分析基因表达分析

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西南桦基因组调查测序

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分子植物育种 2023年

作者：马福仙董洪进原晓龙耿云芬王毅丁淑金张汉尧黄冈师范学院生物与农业资源学院云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室西南林业大学林学院西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室

西南桦(Betula alnoides)是重要的用材树种，且具有潜在的药用价值。本研究采用流式细胞术(以玉米(Zea mays)基因组为对照)和基于MGISEQ2000测序平台的基因组调查方法测定西南桦基因组大小。结果显示，流式细胞术测定的西南桦基因组大... 详细信息

西南桦(Betula alnoides)是重要的用材树种，且具有潜在的药用价值。本研究采用流式细胞术(以玉米(Zea mays)基因组为对照)和基于MGISEQ2000测序平台的基因组调查方法测定西南桦基因组大小。结果显示，流式细胞术测定的西南桦基因组大小约为1.00 Gb；高通量测序获得原始数据32.82 Gb，处理后得到约30.38 Gb的过滤数据(Clean data)，测序质量良好；数据约简法(K-monomeric unit， K-mer)分析预估西南桦是复杂基因组，为四倍体植物，基因组大小为924.00 Mb，杂合度为3.3%，GC含量约为36.14%。分析西南桦基因组的基本信息，为其后续研究物种进化、倍性水平和全基因组测序等提供科学依据。

关键词：西南桦流式细胞术数据约简法(K-mer)分析基因组大小

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基于二代测序哈巴乌头叶绿体基因组分析

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西部林业科学 2023年第1期52卷 175-181页

作者：马福仙魏健生耿云芬张汉尧西南林业大学西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室云南昆明650224 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201 哈巴雪山省级自然保护区管护局云南迪庆674402

为了解哈巴乌头叶绿体基因组特征及密码子偏好性,本研究采用Illumina HiSeq对哈巴乌头叶绿体基因组进行测序,组装获得完整叶绿体基因组序列,并利用CUSP和Codon W软件分析该物种叶绿体基因组密码子偏好性。结果显示:哈巴乌头叶绿体基因... 详细信息

为了解哈巴乌头叶绿体基因组特征及密码子偏好性,本研究采用Illumina HiSeq对哈巴乌头叶绿体基因组进行测序,组装获得完整叶绿体基因组序列,并利用CUSP和Codon W软件分析该物种叶绿体基因组密码子偏好性。结果显示:哈巴乌头叶绿体基因组全长155800 bp,是典型的四分结构,由1对长为29296 bp的IR、1个长为16864 bp的SSC和1个长86399 bp的LSC组成;该基因组包括84个蛋白质编码基因、8个rRNA基因和37个tRNA基因;系统进化分析显示,哈巴乌头和中甸乌头聚在同一个分支;叶绿体基因组密码子的3个位置上GC含量依次为GC1(46.65%)>GC2(39.71%)>GC3(29.01%),说明其偏好以A/U结尾;有效密码子数(ENC)范围为36.77~58.98,ENC值>45的编码序列有36个,说明密码子偏性低;中性绘图等分析显示哈巴乌头叶绿体基因组密码子偏好性受选择的影响较大;最优密码子有14个,均以A/U结尾。本研究为哈巴乌头叶绿体基因工程、种源鉴定等研究提供参考依据。

关键词：哈巴乌头 Illumina测序叶绿体基因组密码子偏好性

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云南松松小蠹致死木特性分析

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广东农业科学 2012年第24期39卷 89-92页

作者：孙盟杨斌季梅翟雍善赵宁王大伟泽桑梓西南林业大学资源学院云南昆明650224 云南省林业科学院/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室云南昆明650201 广西国有黄冕林场广西鹿寨545600

云南松松小蠹是一类严重危害云南松的蛀干害虫,为研究其致死特性,笔者在云南省蠹害发生地区进行调查,运用SPSS19.00以及DPS7.05对数据分析,结果表明:蠹害致死云南松胸径越大蠹害发生越轻微,两者呈现线性负相关,相关系数r=-0.963,P=0.037... 详细信息

云南松松小蠹是一类严重危害云南松的蛀干害虫,为研究其致死特性,笔者在云南省蠹害发生地区进行调查,运用SPSS19.00以及DPS7.05对数据分析,结果表明:蠹害致死云南松胸径越大蠹害发生越轻微,两者呈现线性负相关,相关系数r=-0.963,P=0.037;林木郁闭度、树高、冠幅与蠹害致死率不相关。无论是云南松纯林,还是混交林,甚至二者间蠹害致死木上、中、下各部分成虫数量、松小蠹幼虫数量、每一母坑道对应幼虫数量均差异性不显著。云南松蠹害纯林、混交林间蠹害致死木上、中、下各部分间纵坑道数量、横坑道数量间差异性均不显著;纯林蠹害致死木纵坑道数量树干上部显著多于中部,中部显著多于下部;混交林蠹害致死木纵坑道数量树干上部显著多于中部及下部。纯林及混交林蠹害致死木横坑道数量树干上部显著小于中部及下部。

关键词：云南松松小蠹蠹害致死木

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七彩红竹查尔酮合成酶IhCHS1基因的克隆与分析

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竹子研究汇刊 2014年第3期33卷 11-16页

作者：周旭王晨晨毕玮王娟杨宇明王毅西南林业大学林学院云南昆明650224 云南林业科学院国家林业局云南珍稀濒特森林植物繁育和保护重点实验室云南昆明650201 云南林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201

通过已报道查尔酮合成酶基因的保守序列设计特异引物,扩增得到七彩红竹(Indosasa hispida ***)查尔酮合成酶(Chalcone Synthase,CHS)基因片段,再以RACE法获得CHS基因全长cDNA序列。该cDNA全长1953 bp,含1542 bp的开放阅读框,编码含513... 详细信息

通过已报道查尔酮合成酶基因的保守序列设计特异引物,扩增得到七彩红竹(Indosasa hispida ***)查尔酮合成酶(Chalcone Synthase,CHS)基因片段,再以RACE法获得CHS基因全长cDNA序列。该cDNA全长1953 bp,含1542 bp的开放阅读框,编码含513个氨基酸残基的蛋白质。多序列比对结果表明IhCHS1推断的蛋白与节节麦(Aegilops tauschii)等禾本科植物的CHS相似性在87%以上,临位法构建系统发生树显示IhCHS1与禾本科植物CHS亲缘关系较近。RT-PCR结果显示IhCHS1在幼嫩红秆中大量表达。

关键词：七彩红竹查尔酮合成酶基因克隆表达分析

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旱冬瓜种源/家系苗期生长指标的研究

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安徽农业科学 2010年第23期38卷 12388-12389,12393页

作者：史富强陈宏伟杨斌陈伟徐玉梅陈绍安刘际梅云南省林业科学院热带林业研究所云南普文666102 云南省林业科学院云南昆明650204 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室云南昆明650204

对15个种源99个旱冬瓜家系苗木的苗高和地径生长量进行了测定与分析,结果表明,种源及家系间苗木的苗高和地径生长差异显著,其中以瑞丽种源最好,其次为孟连、西盟、陇川、潞西的种源,表现最差的是镇沅种源;家系间苗高生长量表现最好的是... 详细信息

对15个种源99个旱冬瓜家系苗木的苗高和地径生长量进行了测定与分析,结果表明,种源及家系间苗木的苗高和地径生长差异显著,其中以瑞丽种源最好,其次为孟连、西盟、陇川、潞西的种源,表现最差的是镇沅种源;家系间苗高生长量表现最好的是瑞丽的62号家系,地径生长量表现最好的是瑞丽的49号家系;苗期综合表现较好的家系有22个,分别为49、50、51、52、53、55、59、61、62、72、77、78、81、85、88、94、120、122、123、127、128、129号家系。

关键词：旱冬瓜种源/家系苗期生长指标

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思茅松产脂力分析

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福建农林大学学报（自然科学版） 2016年第4期45卷 405-408页

作者：缪福俊李江熊智原晓龙杨宇明王娟云南省林业科学院云南昆明650201 国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201 西南林业大学研究生院云南昆明650224

采用V型下降采脂方法对200株思茅松进行产脂力测定,并结合3个主要树体因子（胸径、冠幅、树高）进行相关性分析.结果表明：与产脂力相关性最强的树体因子为胸径,相关系数为0.853,平均单刀产脂力为7.18 g;在相同径级条件下,思茅松的产脂... 详细信息

采用V型下降采脂方法对200株思茅松进行产脂力测定,并结合3个主要树体因子（胸径、冠幅、树高）进行相关性分析.结果表明：与产脂力相关性最强的树体因子为胸径,相关系数为0.853,平均单刀产脂力为7.18 g;在相同径级条件下,思茅松的产脂力表现出显著的差异,均存在相对高、低产的思茅松;当径级为33-34 cm时,思茅松G33-6最高产脂力达到25.86 g;思茅松在雨季的产脂力比旱季高,产脂力与季节温度有关.表明产脂力可能与思茅松本身的遗传因子相关.

关键词：思茅松树体因子产脂力遗传因子

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泡核桃肌醇半乳糖苷合成酶基因克隆及表达分析

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基因组学与应用生物学 2018年第5期37卷 2029-2033页

作者：王毅肖良俊马婷宁德鲁云南省林业科学院、经济林研究所、云南省木本油料工程技术研究中心昆明650201 云南省林业科学院、云南省森林植物培育与开发利用重点实验室、国家林业局云南珍稀濒特森林植物繁育和保护重点实验室昆明650201

肌醇半乳糖苷合成酶是植物中棉子糖系列寡糖合成中的关键酶,在植物抗性生理中扮演重要作用。本研究利用RT-PCR技术从泡核桃中成功克隆获得一个受冷害诱导的肌醇半乳糖苷合成酶基因（Js GS1）,其含有1 026 bp的开放阅读框,编码341个氨基... 详细信息

肌醇半乳糖苷合成酶是植物中棉子糖系列寡糖合成中的关键酶,在植物抗性生理中扮演重要作用。本研究利用RT-PCR技术从泡核桃中成功克隆获得一个受冷害诱导的肌醇半乳糖苷合成酶基因（Js GS1）,其含有1 026 bp的开放阅读框,编码341个氨基酸,登录号为：KX657831。该基因推断的蛋白与核桃（Juglans regia）GS蛋白的相似性为89%;系统进化树分析显示其与核桃、麻疯树（Jatropha curcas）、蓖麻（Ricinus communis）形成一个分支。半定量PCR显示：低温4℃处理3 h后有微弱表达,6 h后大量表达。这说明Js GS1是典型的受冷害诱导的GS基因。本研究为揭示泡核桃抗寒机理以及肌醇半乳糖苷合成酶在冷害胁迫下的作用提供帮助,并为利用基因工程手段培育抗寒新品种提供理论依据。

关键词：泡核桃肌醇半乳糖苷合成酶冷害基因表达基因克隆

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重点实验室开放课题管理办法

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西部林业科学 2002年第1期 73-74页

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滇西南旱冬瓜天然林的林分特征研究

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西部林业科学 2012年第5期41卷 63-67页

作者：陈伟陈宏伟杨斌史富强陈绍安李江孟梦冯弦刘际梅国家林业局重点开放性实验室云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201 云南省林业科学院云南昆明650201 普洱市林业科学研究所云南普洱665000

为探讨速生乡土树种旱冬瓜生长特性,对滇西南864株旱冬瓜优良植株生长情况进行调查及统计分析,并选择宁洱县松山自然保护区旱冬瓜天然林开展群落调查。结果表明,旱冬瓜优良资源主要分布于阴坡及半阴、半阳坡,其生活习性偏向于阴性,25... 详细信息

为探讨速生乡土树种旱冬瓜生长特性,对滇西南864株旱冬瓜优良植株生长情况进行调查及统计分析,并选择宁洱县松山自然保护区旱冬瓜天然林开展群落调查。结果表明,旱冬瓜优良资源主要分布于阴坡及半阴、半阳坡,其生活习性偏向于阴性,25°以下的平缓坡面适宜旱冬瓜植株的自然生长;旱冬瓜占优势的自然群落具有乔木层、灌木层、草本层和层间附生植物,群落植物种类丰富,区系成分复杂,主要以热带和温带成分组成为主,其中热带分布属占绝对优势,并呈现出一定的过渡性特征。

关键词：旱冬瓜天然林生长特性群落特征

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