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分子植物育种 2023年

作者：马福仙余姣君原晓龙王毅张汉尧黄冈师范学院生物与农业资源学院云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室西南林业大学林学院西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室

滇紫草(Onosma paniculatum)通常作为紫草(Arnebiae radix)的替代品使用，是云南传统的中药材。本研究首次采用流式细胞术(以玉米(Zea mays)基因组为对照)和高通量测序技术的Survey分析测定滇紫草基因组大小。结果显示，流式细胞术测定... 详细信息

滇紫草(Onosma paniculatum)通常作为紫草(Arnebiae radix)的替代品使用，是云南传统的中药材。本研究首次采用流式细胞术(以玉米(Zea mays)基因组为对照)和高通量测序技术的Survey分析测定滇紫草基因组大小。结果显示，流式细胞术测定的滇紫草基因组大小约为880.20 Mbp；高通量测序获得原始数据64.09 Gb，处理后得到约59.72 Gb的过滤数据(Clean data)，测序质量良好；数据约简法(K-monomeric unit， K-mer)分析预估滇紫草为复杂基因组，大小为848.08 Mbp，杂合度为0.3%，GC含量约为37.17%。分析滇紫草基因组的基本信息，为其后续研究物种进化、基因资源利用和药用成分合成途径等提供科学依据。

关键词：滇紫草流式细胞术 K-mer分析基因组大小

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云南松松小蠹致死木特性分析

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广东农业科学 2012年第24期39卷 89-92页

作者：孙盟杨斌季梅翟雍善赵宁王大伟泽桑梓西南林业大学资源学院云南昆明650224 云南省林业科学院/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室云南昆明650201 广西国有黄冕林场广西鹿寨545600

云南松松小蠹是一类严重危害云南松的蛀干害虫,为研究其致死特性,笔者在云南省蠹害发生地区进行调查,运用SPSS19.00以及DPS7.05对数据分析,结果表明:蠹害致死云南松胸径越大蠹害发生越轻微,两者呈现线性负相关,相关系数r=-0.963,P=0.037... 详细信息

云南松松小蠹是一类严重危害云南松的蛀干害虫,为研究其致死特性,笔者在云南省蠹害发生地区进行调查,运用SPSS19.00以及DPS7.05对数据分析,结果表明:蠹害致死云南松胸径越大蠹害发生越轻微,两者呈现线性负相关,相关系数r=-0.963,P=0.037;林木郁闭度、树高、冠幅与蠹害致死率不相关。无论是云南松纯林,还是混交林,甚至二者间蠹害致死木上、中、下各部分成虫数量、松小蠹幼虫数量、每一母坑道对应幼虫数量均差异性不显著。云南松蠹害纯林、混交林间蠹害致死木上、中、下各部分间纵坑道数量、横坑道数量间差异性均不显著;纯林蠹害致死木纵坑道数量树干上部显著多于中部,中部显著多于下部;混交林蠹害致死木纵坑道数量树干上部显著多于中部及下部。纯林及混交林蠹害致死木横坑道数量树干上部显著小于中部及下部。

关键词：云南松松小蠹蠹害致死木

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西南桦基因组调查测序

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分子植物育种 2023年

作者：马福仙董洪进原晓龙耿云芬王毅丁淑金张汉尧黄冈师范学院生物与农业资源学院云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室西南林业大学林学院西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室

西南桦(Betula alnoides)是重要的用材树种，且具有潜在的药用价值。本研究采用流式细胞术(以玉米(Zea mays)基因组为对照)和基于MGISEQ2000测序平台的基因组调查方法测定西南桦基因组大小。结果显示，流式细胞术测定的西南桦基因组大... 详细信息

西南桦(Betula alnoides)是重要的用材树种，且具有潜在的药用价值。本研究采用流式细胞术(以玉米(Zea mays)基因组为对照)和基于MGISEQ2000测序平台的基因组调查方法测定西南桦基因组大小。结果显示，流式细胞术测定的西南桦基因组大小约为1.00 Gb；高通量测序获得原始数据32.82 Gb，处理后得到约30.38 Gb的过滤数据(Clean data)，测序质量良好；数据约简法(K-monomeric unit， K-mer)分析预估西南桦是复杂基因组，为四倍体植物，基因组大小为924.00 Mb，杂合度为3.3%，GC含量约为36.14%。分析西南桦基因组的基本信息，为其后续研究物种进化、倍性水平和全基因组测序等提供科学依据。

关键词：西南桦流式细胞术数据约简法(K-mer)分析基因组大小

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云南沟谷雨林建群种绒毛番龙眼居群的遗传多样性

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南方农业学报 2022年第3期53卷 850-858页

作者：陈少瑜李江陈伟冯弦云南省林业和草原科学院/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201 云南省林业和草原科学院林业研究所云南昆明650201 云南省林业和草原科学院林产化工研究所云南昆明650201

【目的】了解云南特有的沟谷雨林主要建群种绒毛番龙眼居群的遗传多样性及遗传结构特征,为雨林植被恢复的采种规划和恢复效果评估提供重要参考。【方法】采用SSR分子标记技术,检测分析云南省西双版纳州和普洱市思茅区的绒毛番龙眼3个天... 详细信息

【目的】了解云南特有的沟谷雨林主要建群种绒毛番龙眼居群的遗传多样性及遗传结构特征,为雨林植被恢复的采种规划和恢复效果评估提供重要参考。【方法】采用SSR分子标记技术,检测分析云南省西双版纳州和普洱市思茅区的绒毛番龙眼3个天然居群和1个人工居群共82个样本的SSR多态性,采用POPGENE v.1.32、GenAlEx 6.501和STRUCTURE 2.3.3等进行遗传多样性及遗传结构分析。【结果】19对SSR引物共检测到88个等位基因,每对引物平均4.632个,19个位点的Shannon’s信息指数(I)变化范围为0.264~1.687,平均为0.879;多态信息指数(PIC)变化范围为0.128~0.729,平均为0.422,期望杂合度(He)的变化范围为0.138~0.765,平均为0.473;4个居群I和He的均值分别为0.785,0.437。19个位点的遗传分化系数(F_(ST))均值为0.069,基因流(Nm)的均值为3.363。STRUCTURE分析将绒毛番龙眼4个居群82个样本分为4个类群,基于遗传距离的UPGMA聚类显示4个居群聚为2个分支,菜阳河天然林居群、普文人工林居群和普文天然林居群聚为一支,勐养镇天然林居群单独为另一支。【结论】绒毛番龙眼的遗传多样性处于中等水平;居群间的遗传分化较低,遗传变异主要来源于居群内;建议特别关注居群内个体的选择和保护,在沟谷雨林植被恢复中设定天然居群多样性水平的恢复目标,并通过科学的采种规划实现这一目标。

关键词：绒毛番龙眼 SSR分子标记珍稀濒危树种沟谷雨林建群种遗传多样性

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七彩红竹查尔酮合成酶IhCHS1基因的克隆与分析

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竹子研究汇刊 2014年第3期33卷 11-16页

作者：周旭王晨晨毕玮王娟杨宇明王毅西南林业大学林学院云南昆明650224 云南林业科学院国家林业局云南珍稀濒特森林植物繁育和保护重点实验室云南昆明650201 云南林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201

通过已报道查尔酮合成酶基因的保守序列设计特异引物,扩增得到七彩红竹(Indosasa hispida ***)查尔酮合成酶(Chalcone Synthase,CHS)基因片段,再以RACE法获得CHS基因全长cDNA序列。该cDNA全长1953 bp,含1542 bp的开放阅读框,编码含513... 详细信息

通过已报道查尔酮合成酶基因的保守序列设计特异引物,扩增得到七彩红竹(Indosasa hispida ***)查尔酮合成酶(Chalcone Synthase,CHS)基因片段,再以RACE法获得CHS基因全长cDNA序列。该cDNA全长1953 bp,含1542 bp的开放阅读框,编码含513个氨基酸残基的蛋白质。多序列比对结果表明IhCHS1推断的蛋白与节节麦(Aegilops tauschii)等禾本科植物的CHS相似性在87%以上,临位法构建系统发生树显示IhCHS1与禾本科植物CHS亲缘关系较近。RT-PCR结果显示IhCHS1在幼嫩红秆中大量表达。

关键词：七彩红竹查尔酮合成酶基因克隆表达分析

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旱冬瓜种源/家系苗期生长指标的研究

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安徽农业科学 2010年第23期38卷 12388-12389,12393页

作者：史富强陈宏伟杨斌陈伟徐玉梅陈绍安刘际梅云南省林业科学院热带林业研究所云南普文666102 云南省林业科学院云南昆明650204 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室云南昆明650204

对15个种源99个旱冬瓜家系苗木的苗高和地径生长量进行了测定与分析,结果表明,种源及家系间苗木的苗高和地径生长差异显著,其中以瑞丽种源最好,其次为孟连、西盟、陇川、潞西的种源,表现最差的是镇沅种源;家系间苗高生长量表现最好的是... 详细信息

对15个种源99个旱冬瓜家系苗木的苗高和地径生长量进行了测定与分析,结果表明,种源及家系间苗木的苗高和地径生长差异显著,其中以瑞丽种源最好,其次为孟连、西盟、陇川、潞西的种源,表现最差的是镇沅种源;家系间苗高生长量表现最好的是瑞丽的62号家系,地径生长量表现最好的是瑞丽的49号家系;苗期综合表现较好的家系有22个,分别为49、50、51、52、53、55、59、61、62、72、77、78、81、85、88、94、120、122、123、127、128、129号家系。

关键词：旱冬瓜种源/家系苗期生长指标

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巨龙竹组培苗污染优势内生菌的分离与鉴定

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南方农业学报 2013年第3期44卷 416-421页

作者：刘绍雄王娟王明月王金华熊智西南林业大学西南山地森林资源保育与利用省部共建教育部重点实验室昆明650224 云南省林业科学院国家林业局云南珍稀濒特植物保护与繁育重点实验室云南省森林植物培育与开发利用重点实验室昆明650201

【目的】对引起巨龙竹组培苗污染的优势内生菌进行分离与鉴定,为后期巨龙竹组织培养基的优化及预防巨龙竹组织培养过程中内生菌污染提供科学依据。【方法】采用NA培养基分离纯化菌株,然后通过菌体的形态结构观察、生理生化试验及16SrDN... 详细信息

【目的】对引起巨龙竹组培苗污染的优势内生菌进行分离与鉴定,为后期巨龙竹组织培养基的优化及预防巨龙竹组织培养过程中内生菌污染提供科学依据。【方法】采用NA培养基分离纯化菌株,然后通过菌体的形态结构观察、生理生化试验及16SrDNA序列同源性分析,对引起巨龙竹组培苗污染的优势内生菌进行鉴定。【结果】引起巨龙竹组培苗污染的优势内生菌为SWFU03菌株,其形态特征及生理生化试验结果与芽孢杆菌属(Bacillus)坚强芽孢杆菌(Bacillusfirmus)的生理生化特征基本相同;16SrDNA序列分析结果表明,菌株SWFU03与坚强芽孢杆菌(GQ903389.1)在同一系统发育分支,其同源性为99.11%。【结论】引起巨龙竹组培苗污染的优势内生菌菌株SWFU03为坚强芽孢杆菌。

关键词：巨龙竹组织培养内生菌污染坚强芽孢杆菌

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迪庆州核桃种质资源的遗传多样性与遗传结构

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西部林业科学 2021年第2期50卷 71-77页

作者：陆婷陈少瑜吴涛肖良俊云南省林业和草原技术推广总站云南昆明650224 云南省林业和草原科学院经济林研究所云南昆明650201 云南省林业和草原科学院/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

利用SSR分子标记技术对云南省迪庆藏族自治州3个群体共161份深纹核桃种质资源进行遗传多样性分析,揭示资源的遗传多样性水平及遗传结构特征,为其保护和利用提供依据。结果表明:18对SSR引物对161份DNA样本进行扩增,共检测到171个等位基因... 详细信息

利用SSR分子标记技术对云南省迪庆藏族自治州3个群体共161份深纹核桃种质资源进行遗传多样性分析,揭示资源的遗传多样性水平及遗传结构特征,为其保护和利用提供依据。结果表明:18对SSR引物对161份DNA样本进行扩增,共检测到171个等位基因,平均每对引物9.5个。3个群体的观察杂合度(H_(o))和期望杂合度(H_(e))的变化范围分别为0.390~0.580和0.580~0.619,平均值分别为0.467和0.598;Shannon信息指数(I)介于1.153~1.313之间,平均为1.231,数据表明迪庆州核桃种质资源的遗传多样性属于中等水平。群体间的遗传分化系数(F_(ST))介于0.0052~0.2253之间,平均为0.0652,表明遗传变异主要来源于群体内的个体,仅有6.52%来源于群体间,各位点的基因流(N_(m))平均为4.2663(N_(m)>1),群体间的基因交流阻止了群体间的分化。STRUCTURE分析将161份核桃资源分成3个类群,而基于Nei’s遗传距离的UPGMA聚类将3个群体划分成2组,维西和香格里拉聚为一组,德钦单独为一组。

关键词：深纹核桃种质资源遗传多样性遗传结构 SSR分子标记

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思茅松产脂力分析

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福建农林大学学报（自然科学版） 2016年第4期45卷 405-408页

作者：缪福俊李江熊智原晓龙杨宇明王娟云南省林业科学院云南昆明650201 国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201 西南林业大学研究生院云南昆明650224

采用V型下降采脂方法对200株思茅松进行产脂力测定,并结合3个主要树体因子（胸径、冠幅、树高）进行相关性分析.结果表明：与产脂力相关性最强的树体因子为胸径,相关系数为0.853,平均单刀产脂力为7.18 g;在相同径级条件下,思茅松的产脂... 详细信息

采用V型下降采脂方法对200株思茅松进行产脂力测定,并结合3个主要树体因子（胸径、冠幅、树高）进行相关性分析.结果表明：与产脂力相关性最强的树体因子为胸径,相关系数为0.853,平均单刀产脂力为7.18 g;在相同径级条件下,思茅松的产脂力表现出显著的差异,均存在相对高、低产的思茅松;当径级为33-34 cm时,思茅松G33-6最高产脂力达到25.86 g;思茅松在雨季的产脂力比旱季高,产脂力与季节温度有关.表明产脂力可能与思茅松本身的遗传因子相关.

关键词：思茅松树体因子产脂力遗传因子

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泡核桃肌醇半乳糖苷合成酶基因克隆及表达分析

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基因组学与应用生物学 2018年第5期37卷 2029-2033页

作者：王毅肖良俊马婷宁德鲁云南省林业科学院、经济林研究所、云南省木本油料工程技术研究中心昆明650201 云南省林业科学院、云南省森林植物培育与开发利用重点实验室、国家林业局云南珍稀濒特森林植物繁育和保护重点实验室昆明650201

肌醇半乳糖苷合成酶是植物中棉子糖系列寡糖合成中的关键酶,在植物抗性生理中扮演重要作用。本研究利用RT-PCR技术从泡核桃中成功克隆获得一个受冷害诱导的肌醇半乳糖苷合成酶基因（Js GS1）,其含有1 026 bp的开放阅读框,编码341个氨基... 详细信息

肌醇半乳糖苷合成酶是植物中棉子糖系列寡糖合成中的关键酶,在植物抗性生理中扮演重要作用。本研究利用RT-PCR技术从泡核桃中成功克隆获得一个受冷害诱导的肌醇半乳糖苷合成酶基因（Js GS1）,其含有1 026 bp的开放阅读框,编码341个氨基酸,登录号为：KX657831。该基因推断的蛋白与核桃（Juglans regia）GS蛋白的相似性为89%;系统进化树分析显示其与核桃、麻疯树（Jatropha curcas）、蓖麻（Ricinus communis）形成一个分支。半定量PCR显示：低温4℃处理3 h后有微弱表达,6 h后大量表达。这说明Js GS1是典型的受冷害诱导的GS基因。本研究为揭示泡核桃抗寒机理以及肌醇半乳糖苷合成酶在冷害胁迫下的作用提供帮助,并为利用基因工程手段培育抗寒新品种提供理论依据。

关键词：泡核桃肌醇半乳糖苷合成酶冷害基因表达基因克隆

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