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枯草芽孢杆菌BEST195的碳水化合物酶类(CAZymes)的分布与进化分析

西南农业学报 2021年第6期34卷 1195-1200页

作者：祝友朋韩长志西南林业大学生物多样性保护学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

【目的】分析枯草芽孢杆菌BEST195的碳水化合物酶类的分布与进化情况,对枯草芽孢杆菌工业菌株的开发利用具有重要意义。【方法】利用CAT在线预测程序对前期获得的102个分泌蛋白序列进行CAZymes预测。【结果】明确枯草芽孢杆菌BEST195中C... 详细信息

【目的】分析枯草芽孢杆菌BEST195的碳水化合物酶类的分布与进化情况,对枯草芽孢杆菌工业菌株的开发利用具有重要意义。【方法】利用CAT在线预测程序对前期获得的102个分泌蛋白序列进行CAZymes预测。【结果】明确枯草芽孢杆菌BEST195中CAZymes的数量为57个,分别为27个GH、21个CBM、2个CE、4个PL、1个GT和2个GH/CBM。同时,通过对上述CAZymes进行遗传关系分析,明确存在GH/PL/CBM、GH/CBM、GH/CBM/CE/PL、GH/CBM/CE/PL/GT等大的类别;以及通过对上述蛋白互作关系分析,发现大部分CAZymes蛋白已具有明显的结构特征和相互作用的关系。【结论】完成了枯草芽孢杆菌BEST195中CAZymes的预测,并明确CAZymes在分类方面尚需进一步细分为亚类,该项目为开展工业菌株发挥CAZymes蛋白功能研究打下了坚实的理论基础。

关键词：枯草芽孢杆菌BEST195 碳水化合物活性酶预测程序遗传关系

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滇西南地区蚂蚁物种多样性研究

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西南农业学报 2021年第8期34卷 1728-1739页

作者：郭宁妍钱昱含徐正会郝永强蒋华李海斌张宁张力西南林业大学生物多样性保护学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

【目的】为了全面揭示云南的蚂蚁物种多样性规律。【方法】采用样地调查法研究滇西南地区的蚂蚁群落。【结果】滇西南地区5个垂直带共记录蚂蚁10亚科、65属、188种,缅甸尼兰蚁[Nylanderia birmana(Forel)]和宽结大头蚁(Pheidole noda Sm... 详细信息

【目的】为了全面揭示云南的蚂蚁物种多样性规律。【方法】采用样地调查法研究滇西南地区的蚂蚁群落。【结果】滇西南地区5个垂直带共记录蚂蚁10亚科、65属、188种,缅甸尼兰蚁[Nylanderia birmana(Forel)]和宽结大头蚁(Pheidole noda Smith)为优势种。各样地蚂蚁群落主要指标为物种数目3~55种(平均28.6种),个体密度4.0~4089.4头·m^(-2)(平均594.6头·m^(-2)),多样性指数0.2619~2.6397(平均1.6870),均匀度指数0.0924~0.7766(平均0.5283),优势度指数0.1033~0.9143平均(0.3310);蚂蚁群落间相似性系数0.4113~0.4806(平均0.4503),处于中等不相似水平。【结论】随着海拔升高,蚂蚁群落物种数目、个体密度、多样性指数和均匀度指数总体出现中域效应现象,主要原因是垂直带下部植被受人类改变及干热河谷效应影响;蚂蚁群落主要指标同时出现多域效应现象,原因是不同植被类型中存在不同物种的聚集群及不同海拔小生境存在差异。滇西南地区5个垂直带蚂蚁群落差异明显,在生物多样性保护中具有不同的价值。

关键词：蚁科蚂蚁群落生物多样性云南

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祁连山国家公园青海片区蚂蚁物种多样性研究

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环境昆虫学报 2021年第1期43卷 93-103页

作者：熊忠平和秋菊徐正会翟奖李彪黄钊钱昱含西南林业大学生物多样性保护学院昆明650224 云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650224

本研究采用样地调查法研究了祁连山国家公园青海片区的蚂蚁物种多样性。在祁连山国家公园青海片区记录蚂蚁2亚科、6属、13种,发现1个中国新记录种:沃尔切胸蚁Temnothorax volgensis(Ruzsky),发现7个青海新记录种。光亮黑蚁Formica candi... 详细信息

本研究采用样地调查法研究了祁连山国家公园青海片区的蚂蚁物种多样性。在祁连山国家公园青海片区记录蚂蚁2亚科、6属、13种,发现1个中国新记录种:沃尔切胸蚁Temnothorax volgensis(Ruzsky),发现7个青海新记录种。光亮黑蚁Formica candida Smith、满凹头蚁Formica manchu Wheeler、亮腹黑褐蚁Formica gagatoides Ruzsky是蚂蚁群落的优势种。青海片区4个垂直带蚂蚁群落的多样性顺序为:东段景阳岭垭口东坡>中西段热水垭豁东坡>中东段景阳岭垭口西坡>西段热水垭豁西坡。各垂直带物种数目、个体密度、多样性指数总体随海拔升高而降低,主要受海拔和气温因素制约;这些指标在不同垂直带出现多域效应、中域效应或底域效应现象,说明不同海拔高度上栖息着适应了不同生境的物种聚集群,同时受到人类对生境干扰的影响。青海片区东坡蚂蚁物种丰富度和多样性指数高于西坡,主要受降雨和湿度影响。从相似性系数看,青海片区不同生境的蚂蚁群落存在一定分化,具有不同生态功能和保护价值。

关键词：蚁科群落生物多样性国家公园祁连山

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基于红外相机技术对中华斑羚活动节律的研究

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野生动物学报 2022年第1期43卷 32-37页

作者：赵晨光何明超苏晋芬罗蕊高顺勇陆元敏李旭段玉宝西南林业大学云南省高校极小种群野生动物保育重点实验室昆明650224 西南林业大学生物多样性保护学院昆明650224 云南药山国家级自然保护区管护局昭通657000 云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650224

动物行为是动物对外界环境变化和内在生理活动改变所做出的整体性反应,动物行为节律研究是了解其活动特征时空变化及影响因素的重要内容。因此,于2017年3月—2018年12月采用红外相机监测技术,在药山国家级自然保护区布设了45台红外相机... 详细信息

动物行为是动物对外界环境变化和内在生理活动改变所做出的整体性反应,动物行为节律研究是了解其活动特征时空变化及影响因素的重要内容。因此,于2017年3月—2018年12月采用红外相机监测技术,在药山国家级自然保护区布设了45台红外相机对中华斑羚(Naemorhedus griseus)的日活动节律进行研究。结果表明:中华斑羚的活动具有明显的晨昏性,活动模式呈经典的双峰型,上午的活动高峰出现在06:00—09:00,活动的最高峰出现在09:00,下午的活动高峰出现在16:00—20:00,活动的最高峰出现在19:00,2个活动高峰出现在日出和日落前后,为昼行性活动。通过对中华斑羚的月活动节律研究发现,各月份间的相对活动强度存在显著性差异(t=5.289,d f=11,P<0.05),活动频率在7月达到峰值。对季节活动节律研究发现,4个季节间的相对活动强度存在显著性差异(t=3.328,d f=3,P<0.05),表现出不同的活动规律。昼夜节律分析表明,中华斑羚具有较强的昼行性活动能力。

关键词：活动节律红外相机技术中华斑羚药山自然保护区

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核桃长足象触角感器的扫描电镜观察

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生物学杂志 2021年第4期38卷 96-99页

作者：张新民赵宁韩秀杨斌西南林业大学生物多样性保护学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650224

为了掌握核桃长足象触角上的感器类型、数量和分布规律,利用扫描电子显微镜对核桃长足象雄性成虫触角上的感器进行观察。结果表明:核桃长足象触角上分布9种感受器类型,分别为毛形感器、腔锥感器、刺形感器、锥形感器、端指形感器、鳞形... 详细信息

为了掌握核桃长足象触角上的感器类型、数量和分布规律,利用扫描电子显微镜对核桃长足象雄性成虫触角上的感器进行观察。结果表明:核桃长足象触角上分布9种感受器类型,分别为毛形感器、腔锥感器、刺形感器、锥形感器、端指形感器、鳞形感器、腔形感器、棒形感器和叉形感器;感器的类型和数量在柄节、梗节和鞭节上的分布规律有明显差异,柄节的感器类型、数量较少,鞭节的第6、7鞭亚节上的感器类型和数量最多,说明这2个亚节是触角感受能力最强的部位。

关键词：核桃长足象触角感器扫描电镜

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分子植物病理学研究生课程教学改革研究——以西南林业大学为例

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教育观察 2022年第34期11卷 33-35页

作者：夏雄飞韩长志西南林业大学生物多样性保护学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室

分子植物病理学作为面向农林院校植物病理学和森林病理学研究方向研究生开设的课程，在提升学生专业素养方面发挥着重要作用。目前，该课程存在着内容结构设置不合理、教学用书更新不及时、教学方式单一及成绩评价受限等“教”方面的问... 详细信息

分子植物病理学作为面向农林院校植物病理学和森林病理学研究方向研究生开设的课程，在提升学生专业素养方面发挥着重要作用。目前，该课程存在着内容结构设置不合理、教学用书更新不及时、教学方式单一及成绩评价受限等“教”方面的问题，以及学生学习兴趣不高、专业知识基础不牢等“学”方面的问题，上述“教”“学”两大方面问题严重影响着资源利用与植物保护、森林保护学等相关专业研究生的教育质量。研究生分子植物病理学课程教学应调整课程结构、优化授课内容、拓展教学途径、改进考核方式，进一步提高研究生教学质量。

关键词：分子植物病理学研究生教学改革案例教学

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拟南芥C2H2型转录因子AtIDD5结构和功能的生物信息学分析

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西南农业学报 2023年第11期36卷 2319-2328页

作者：徐晓东张国斌李林倩陈健鑫于德嘉董萍萍殷伊君郭丽红杨红玉昆明学院农学与生命科学学院昆明650214 云南农业大学植物保护学院昆明650201 西南林业大学生物多样性保护学院/云南省高校森林灾害预警控制重点实验室昆明650224 曲靖师范学院生物资源与食品工程学院云南曲靖655011

【目的】研究拟南芥C2H2型转录因子AtIDD5结构和功能的生物信息,分析其理化性质、组织表达模式、亚细胞定位、蛋白互作网络和启动子顺式作用元件,预测AtIDD5同源蛋白、参与响应元件以及AtIDD5调控与被调控基因,为进一步研究AtIDD5蛋白... 详细信息

【目的】研究拟南芥C2H2型转录因子AtIDD5结构和功能的生物信息,分析其理化性质、组织表达模式、亚细胞定位、蛋白互作网络和启动子顺式作用元件,预测AtIDD5同源蛋白、参与响应元件以及AtIDD5调控与被调控基因,为进一步研究AtIDD5蛋白在植株生长发育中的作用机制提供线索。【方法】利用Uniprot、TMHMM2.0、MEGA7.0、STRING等软件对AtIDD5蛋白进行理性化性质推断、AtIDD5基因在植物组织中的表达模式预测、AtIDD5蛋白进行亚细胞定位分析、蛋白互相作用网络构建以及AtIDD5基因启动子顺式作用元件分析。【结果】AtIDD5基因的编码区(Coding sequence,CDS)全长1809 bp,编码602个氨基酸,其中丝氨酸占比最高,为17.5%。根据所含元素的数量推算其分子式为C1475 H2273 N469 O528 S12,不稳定指数为56.63,属于不稳定蛋白。AtIDD5蛋白含有4个锌指结构,属于典型的C2H2型转录因子。构建AtIDD5同源蛋白序列系统发育树,其中氨基酸序列相似度大于60%的其他物种有6个,分别是亚麻芥(Camelina sativa)、盐芥(Eutrema salsugineum)、白芥(Sinapis alba)、油菜(Brassica na⁃pus)、萝卜(Raphanus sativus)、芝麻菜(Eruca vesicaria subsp)。基因表达模式预测AtIDD5基因在茎、叶、花、角果、花中均有表达,在叶片中的表达量最高;亚细胞定位预测AtIDD5蛋白位于细胞核与叶绿体中。蛋白互作网络预测了与AtIDD5互作的蛋白有20个,直接结合的有10个。AtIDD5蛋白通过与多种蛋白的互作广泛参与了植物生长发育基因表达的调控过程。AtIDD5基因启动子包含有大量的核心顺式元件、光响应元件和激素响应元件。【结论】推测AtIDD5基因本身的表达受到光和激素等因子的调控;预测AtIDD5基因在植株生长发育、激素调节和逆境胁迫中发挥着重要作用。

关键词： AtIDD5 生物信息学亚细胞定位表达模式互作蛋白启动子分析

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鸡嗉子榕蜂群落中雌蜂触角感器及适生意义

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应用昆虫学报 2021年第3期58卷 736-746页

作者：刘志祥杨培李宗波西南林业大学生物多样性保护学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650224 云南中医药大学昆明650500

【目的】感知化学信息是榕小蜂群落组成和功能分化的基础,以触角为代表的感觉器官,恰能反映其寄主识别和繁殖中所承受的进化压力和适应形态。本文旨在对当前唯一以“专有信息通道”为基础形成的鸡嗉子榕Ficus semicordata榕蜂群落中雌... 详细信息

【目的】感知化学信息是榕小蜂群落组成和功能分化的基础,以触角为代表的感觉器官,恰能反映其寄主识别和繁殖中所承受的进化压力和适应形态。本文旨在对当前唯一以“专有信息通道”为基础形成的鸡嗉子榕Ficus semicordata榕蜂群落中雌蜂触角感器进行系统研究,探讨感器的形态分化及生态适应性。【方法】采用扫描电镜技术观察5种鸡嗉子榕小蜂雌蜂的触角及其感器,确定了5种雌蜂触角感器的类型、形态、数量和分布,分析了多孔板形感器的比表面积与挥发物释放量之间的相关性。【结果】5种雌蜂触角均呈膝状,由柄节、梗节和数量不等的鞭亚节形成的鞭节组成,传粉榕小蜂和非传粉榕小蜂触角的主要差别在于第1鞭亚节处着生的脊骨突和梗节背面的角锥形感器。触角上共发现7类10种感器,分别为毛形感器、刺形感器(类型1、类型2和类型3)、锥形感器(类型1和类型2)、栓锥型乳突状感器、腔锥形感器、多孔板形感器和角锥形感器,其中腔锥形感器和角锥形感器仅见于传粉榕小蜂触角上,毛形感器和刺形感器1数量最多,分布最广泛;锥形感器和栓锥型乳突状感器常见于鞭节中上部;多孔板形感器分布于触角的索节和棒节处,交替环状排列,且随榕小蜂产卵时序后延,多孔板形感器感知指数呈递减趋势,并与不同发育期榕果的挥发物释放量呈显著正相关关系。【结论】不同功能物种的榕小蜂触角及其感器有明显的生态适应性,特别是增加多孔板形感器数量和长度来提高对气味物质的感知,利于解释榕蜂群落内的信息调控与稳定共存。

关键词：鸡嗉子榕榕小蜂群落雌蜂触角感器进化适应性多孔板形感器感知指数

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金平马鞍底蝴蝶多样性与时空动态分析

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西南林业大学学报（自然科学） 2021年第4期41卷 168-175页

作者：朱恩骄张正旺和秋菊李晨阳施雯易传辉西南林业大学生物多样性保护学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650233 西南林业大学云南生物多样性研究院云南昆明650233

为了解金平县蝴蝶多样性时空动态,采用样线法,2017-2018年对金平样区内蝴蝶多样性进行研究。结果表明:金平样区共观测到10科75属147种5 199只蝴蝶,其中以蛱蝶科和眼蝶科最多,均有32种,各占物种总数的21.77%;其次为凤蝶科、粉蝶科和灰蝶... 详细信息

为了解金平县蝴蝶多样性时空动态,采用样线法,2017-2018年对金平样区内蝴蝶多样性进行研究。结果表明:金平样区共观测到10科75属147种5 199只蝴蝶,其中以蛱蝶科和眼蝶科最多,均有32种,各占物种总数的21.77%;其次为凤蝶科、粉蝶科和灰蝶科,各有17种,各占物种总数的11.56%,物种数最少的为环蝶科和珍蝶科,均仅1种,各占物种数的0.68%;个体数最多的为粉蝶科,有1 771只,占个体总数的34.06%;其次为蛱蝶科,有1 182只,占个体总数比例的22.74%。2017年和2018年观测到的蝴蝶物种数量和群落结果均有一定差异,反映出蝴蝶群落结构的动态性。多样性和丰富度以蛱蝶科最大,分别为0.849 7和29.256;均匀度和优势度以粉蝶科最大,分别为0.281 8和0.321 4;G-F指数以蚬蝶最大,为0.830 1。各多样性指数和均匀度均表现出时间和空间上的差异。结果表明,多样性存在时空分布的差异性,可能主要与气候、小气候和寄主植物物候有关。

关键词：蝴蝶多样性时空动态群落结构金平县

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基于野外影像的白尾梢虹雉换羽研究

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四川动物 2023年第6期42卷 652-658页

作者：候自强高歌王斌张艳奇杨志涵罗旭西南林业大学云南省森林灾害预警与控制重点实验室/生物多样性保护学院昆明650224 云南高黎贡山国家级自然保护区保山管护局云南保山678000 云南高黎贡山国家级自然保护区泸水管护分局云南泸水673100

白尾梢虹雉Lophophorus sclateri是一种狭域分布的高山雉类,尚未开展过换羽研究。2014—2019年,利用红外相机在云南高黎贡山收集了白尾梢虹雉的64张野外独立有效照片和9段视频,发现白尾梢虹雉繁殖不同步,不同巢出雏时间相差可达1个月,5... 详细信息

白尾梢虹雉Lophophorus sclateri是一种狭域分布的高山雉类,尚未开展过换羽研究。2014—2019年,利用红外相机在云南高黎贡山收集了白尾梢虹雉的64张野外独立有效照片和9段视频,发现白尾梢虹雉繁殖不同步,不同巢出雏时间相差可达1个月,5月出雏较多;刚出雏的雏鸟飞羽有明显羽片,6月完成雏后换羽、9月完成稚后换羽;成鸟5月开始更换尾羽,10月更换完毕,从第5枚尾羽开始向两侧更换,兼具向心型和离心型的特点;雄性存在羽毛延迟成熟现象,可用状态信号假说解释。本研究首次报道了野生白尾梢虹雉的换羽特征和雄性个体的羽毛延迟成熟现象,表明红外相机影像可为雉类换羽提供时间和羽毛形态特征数据,这为野生雉类的换羽研究提供了新思路。

关键词：白尾梢虹雉红外相机鸟类换羽

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