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云南农业大学学报（自然科学） 2022年第6期37卷 949-956页

作者：夏雄飞陈云芳覃悦韩长志西南林业大学生物多样性保护学院云南昆明650224 中华人民共和国苏州海关江苏苏州215000 西南林业大学生物多样性保护学院云南昆明650224 云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

[目的]通过对不同类型植物病原物中分泌蛋白及碳水化合物活性酶(CAZymes)进行系统对比分析,为深入解析分泌蛋白及CAZymes在不同植物病原物致病机制中的重要作用提供理论基础.[方法]选择9种真菌、5种细菌和9种卵菌共23种不同类型病原物... 详细信息

[目的]通过对不同类型植物病原物中分泌蛋白及碳水化合物活性酶(CAZymes)进行系统对比分析,为深入解析分泌蛋白及CAZymes在不同植物病原物致病机制中的重要作用提供理论基础.[方法]选择9种真菌、5种细菌和9种卵菌共23种不同类型病原物作为研究对象,根据分泌蛋白的基本特征,采用SignalP v5.0等在线分析程序对病原物中的分泌蛋白进行预测;利用在线工具dbCAN对获取的分泌蛋白进行CAZymes预测;最终对3种类型植物病原物预测结果进行系统对比分析.[结果]真菌、细菌和卵菌的分泌蛋白数量分别为71～510、105-227和119～768个,所占比例分别为0.74％～3.93％、2.05％～3.91％和0.96％～2.90％;真菌、细菌和卵菌中含有的CAZymes平均数量分别为26、4和26个,种类分别为62～76、8～14和24～36种,其中真菌中AA9、GH11和GH28等类别的CAZymes数量较多,细菌中GH25和PL_6的数量较多,卵菌中PL3 2和GH17的数量较多.[结论]卵菌的分泌蛋白占比较小,真菌的分泌蛋白占比最值差异较大;细菌的CAZymes数量与种类最少,真菌的CAZymes种类最多,显示了不同类型植物病原物与植物互作以及种间竞争等协同进化过程中存在共性化和差异化的毒性策略.

关键词：植物病原物分泌蛋白 CAZymes 生物信息学

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炭疽属真菌GH12蛋白找寻及生物信息学分析

炭疽属真菌GH12蛋白找寻及生物信息学分析

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中国植物病理学会2023年学术年会

作者：薄淑文韩长志西南林业大学生物多样性保护学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室

炭疽属(Colletotrichum)真菌是一类主要危害农林植物的病原真菌,广泛分布于热带、亚热带和温带地区,其寄主种类繁多,可以侵染各种农作物、花卉、林木等。碳水化合物活性酶(Carbohydrate-Active enzymes,CAZymes)参与降解寄主植物细胞壁... 详细信息

炭疽属(Colletotrichum)真菌是一类主要危害农林植物的病原真菌,广泛分布于热带、亚热带和温带地区,其寄主种类繁多,可以侵染各种农作物、花卉、林木等。碳水化合物活性酶(Carbohydrate-Active enzymes,CAZymes)参与降解寄主植物细胞壁,促进病原菌在寄主植物细胞中附着、侵入、定殖等过程。糖苷水解酶(Glycoside hydrolases,GH)作为碳水化合物活性酶(CAZymes)中的一类蛋白,在实现植物病原真菌侵染植物过程中发挥着非常重要的作用。糖苷水解酶(GH)家族具有诸多亚家族,糖苷水解酶12 (GH12)家族具有内切纤维素酶、木葡聚糖酶、β-1,3-1,4-葡聚糖酶活性,为典型的多功能糖苷水解酶家族。本研究通过NCBI数据库共获得146条炭疽属真菌GH12蛋白序列,采用SienalP v6.0、PrtComp v9.0、TMHMM v2.0、Protscale、PHD等在线分析程序对氨基酸序列的信号肽、亚细胞定位、跨膜结构域、疏水性、等电点等性质进行预测分析。结果显示,在146条GH12蛋白序列中,有93条在N端含有典型的信号肽序列;有38条分泌至胞外,剩余108条分别定位细胞膜外,细胞质膜、高尔基体、溶酶体、细胞核、线粒体中;有123条不含有跨膜结构域,剩余23条含有1个及以上的跨膜结构域;有26条预测为亲水性,120条预测为疏水性;146条均含有无规则卷曲、α螺旋、β折叠,部分含有TM helix (跨膜螺旋);且大部分属于酸性蛋白;大多数GH12蛋白序列的脂肪族氨基酸指数在60～85范围内,有140条不稳定系数小于40,预测为稳定性蛋白,剩余6条预测为非稳定性蛋白;分析发现,有些GH12蛋白序列并不符合分泌蛋白的特征。对炭疽属GH12蛋白进行预测分析,以期为深入研究炭疽菌属真菌不同的寄主范围、致病机制以及GH12的互作机制打下坚实的理论基础。

关键词：炭疽属 GH12 生物信息学糖苷水解酶

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基于野外影像的白尾梢虹雉换羽研究

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四川动物 2023年第6期42卷 652-658页

作者：候自强高歌王斌张艳奇杨志涵罗旭西南林业大学云南省森林灾害预警与控制重点实验室/生物多样性保护学院昆明650224 云南高黎贡山国家级自然保护区保山管护局云南保山678000 云南高黎贡山国家级自然保护区泸水管护分局云南泸水673100

白尾梢虹雉Lophophorus sclateri是一种狭域分布的高山雉类,尚未开展过换羽研究。2014—2019年,利用红外相机在云南高黎贡山收集了白尾梢虹雉的64张野外独立有效照片和9段视频,发现白尾梢虹雉繁殖不同步,不同巢出雏时间相差可达1个月,5... 详细信息

白尾梢虹雉Lophophorus sclateri是一种狭域分布的高山雉类,尚未开展过换羽研究。2014—2019年,利用红外相机在云南高黎贡山收集了白尾梢虹雉的64张野外独立有效照片和9段视频,发现白尾梢虹雉繁殖不同步,不同巢出雏时间相差可达1个月,5月出雏较多;刚出雏的雏鸟飞羽有明显羽片,6月完成雏后换羽、9月完成稚后换羽;成鸟5月开始更换尾羽,10月更换完毕,从第5枚尾羽开始向两侧更换,兼具向心型和离心型的特点;雄性存在羽毛延迟成熟现象,可用状态信号假说解释。本研究首次报道了野生白尾梢虹雉的换羽特征和雄性个体的羽毛延迟成熟现象,表明红外相机影像可为雉类换羽提供时间和羽毛形态特征数据,这为野生雉类的换羽研究提供了新思路。

关键词：白尾梢虹雉红外相机鸟类换羽

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AtIDD5基因过表达植株构建及其表型分析

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分子植物育种 2022年

作者：徐晓东李林倩于德嘉董萍萍陈健鑫郑洪健张国斌杨红玉昆明学院农学与生命科学学院云南农业大学植物保护学院西南林业大学生物多样性保护学院云南省高校森林灾害预警控制重点实验室

植物的生长与发育与糖的信号或合成有密切关系，拟南芥IDD5 （Indeterminate Domain 5）基因编码一个C2H2型锌指类的转录因子。本研究构建了由35S驱动的AtIDD5超表达植株AtIDD5-OE，并发现超表达T3代稳定植株中AtIDD5表达水平显著升高... 详细信息

植物的生长与发育与糖的信号或合成有密切关系，拟南芥IDD5 （Indeterminate Domain 5）基因编码一个C2H2型锌指类的转录因子。本研究构建了由35S驱动的AtIDD5超表达植株AtIDD5-OE，并发现超表达T3代稳定植株中AtIDD5表达水平显著升高；表型分析显示超表达植株的幼苗根生长明显减慢，整个植株生长发育迟缓。与对淀粉粒的发育进行正调控相反，暗示AtIDD5对植物的生长过程产生反馈调节作用，本研究为后期研究AtIDD5基因在植物生长发育中的功能提供线索。

关键词： AtIDD5 超表达植物构建拟南芥

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薇甘菊化学成分对六种核桃病原真菌的抑菌活性

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湖北农业科学 2023年第5期62卷 66-72页

作者：张威祁进康李晋芳胡世俊闫晓慧西南林业大学生物多样性保护学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650233 西南林业大学林学院/西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室昆明650233

为探究入侵植物薇甘菊(Mikania micrantha H.B.K)化学成分的抑菌作用,采用硅胶柱层析、Sephadex LH-20凝胶柱层析色谱法,从薇甘菊地上部分乙酸乙酯萃取物中分离得到5个化合物,根据1H NMR、13C NMR、MS波谱数据,分别鉴定为豆甾醇(1)、薇... 详细信息

为探究入侵植物薇甘菊(Mikania micrantha H.B.K)化学成分的抑菌作用,采用硅胶柱层析、Sephadex LH-20凝胶柱层析色谱法,从薇甘菊地上部分乙酸乙酯萃取物中分离得到5个化合物,根据1H NMR、13C NMR、MS波谱数据,分别鉴定为豆甾醇(1)、薇甘菊内酯(2)、去氧薇甘菊内酯(3)、异泽兰素(4)和泽兰黄酮(5)。采用平皿法测定了薇甘菊甲醇提取物、不同溶剂萃取物及分离得到的化合物对6种核桃病原真菌菌丝生长的抑制活性。结果表明,薇甘菊乙酸乙酯萃取物对炭疽菌、正丁醇萃取物对叶点霉的菌丝生长有较强的抑制作用,EC50分别为1.25000 mg/mL和1.66000 mg/mL;化合物2和化合物3对拟茎点霉和壳梭孢菌丝生长抑制率均显著高于其他化合物,化合物2和化合物3对拟茎点霉的EC50分别为60.62μg/mL和89.13μg/mL,对壳梭孢的EC50分别为43.65μg/mL和61.66μg/mL。

关键词：入侵植物薇甘菊(Mikania micrantha H.B.K) 化学成分核桃抑菌活性

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植物提取物对4株水稻病原菌的抑菌活性筛选

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浙江农业科学 2023年第10期64卷 2468-2473页

作者：赵鹏杨态娇张东华张学良黄朝政伍建榕刘丽闫晓慧云南省高校森林灾害预警控制重点实验室西南林业大学生物多样性保护学院云南昆明650224 国家林业和草原局西南地区生物多样性保育重点实验室西南林业大学林学院云南昆明650224

为开发新型植物源农药,探究水稻恶苗病、稻瘟病、褐变穗病和稻曲病的生物防治方法,以木贼镰孢(Fusarium equiseti)、稻梨孢(Pyricularia oryzae)、极细链格孢(Alternaria tenuissima)、稻绿核菌(Ustilaginoidea oryzae)为供试病原菌,采... 详细信息

为开发新型植物源农药,探究水稻恶苗病、稻瘟病、褐变穗病和稻曲病的生物防治方法,以木贼镰孢(Fusarium equiseti)、稻梨孢(Pyricularia oryzae)、极细链格孢(Alternaria tenuissima)、稻绿核菌(Ustilaginoidea oryzae)为供试病原菌,采用生长速率法及孢子萌发实验法对17种植物的23种提取物进行了室内抑菌活性测定。生长速率法结果显示:在浓度为2 mg·mL^(-1)时,茵陈蒿、牛尾蒿和鱼眼草提取物对木贼镰孢菌丝生长有一定的抑制活性,抑菌率分别为71.66%、63.33%、50.00%;茵陈蒿、香丝草提取物对稻梨孢的菌丝生长抑制率分别为33.33%、30.83%。孢子萌发实验结果表明,鱼眼草、墨西哥鼠尾草、茵陈蒿提取物对稻绿核菌孢子萌发的抑制率分别为49.68%、45.38%、43.23%;茵陈蒿、牛尾蒿、香丝草提取物对极细链格孢子萌发有一定的抑制作用,抑制率分别为73.69%、50.60%、45.02%。本研究发现,茵陈蒿、牛尾蒿的提取物具有较好的抑菌活性,为今后开发植物源抑菌剂提供了一定的理论依据。

关键词：植物提取物生长速率法孢子萌发实验法水稻病原菌抑菌活性

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基于全基因组序列的黄单胞菌分泌蛋白质预测及其特征分析

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江苏农业学报 2021年第1期37卷 53-59页

作者：覃悦祝友朋韩长志西南林业大学生物多样性保护学院云南昆明650224 云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

黄单胞菌(Xanthomonas campestris)作为诸多革兰氏阴性细菌之一,主要危害十字花科农作物和核桃、杧果等经济林植物。前人对植物病原细菌、真菌等的分泌蛋白和相关蛋白质开展了预测及分析研究,明确其分泌蛋白在致病过程中具有非常重要的... 详细信息

黄单胞菌(Xanthomonas campestris)作为诸多革兰氏阴性细菌之一,主要危害十字花科农作物和核桃、杧果等经济林植物。前人对植物病原细菌、真菌等的分泌蛋白和相关蛋白质开展了预测及分析研究,明确其分泌蛋白在致病过程中具有非常重要的作用。本研究以已经公布全基因组序列的黄单胞菌*** B100、*** *** str.8004、*** CN14中的蛋白质序列为基础,结合细菌中分泌蛋白的基本特征,采用在线分析程序(包括SignalP v5.0、ProtComp v9.0等)对上述3个黄单胞菌的分泌蛋白序列进行预测和分析,明确上述细菌中分别含有135个、128个、135个分泌蛋白,并对分泌蛋白所具有的基本特征开展分析,为深入研究黄单胞菌分泌蛋白的功能打下理论基础。

关键词：黄单胞菌全基因组信号肽生物信息学

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喜马拉雅山错那段不同海拔梯度蚂蚁多样性

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环境昆虫学报 2021年第3期43卷 584-593页

作者：刘霞许国莲徐正会张翔李晓艳刘兰兰钱昱含西南林业大学生物多样性保护学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650224

为了揭示喜马拉雅山不同海拔梯度蚂蚁的多样性规律,采用样地调查法研究了喜马拉雅山错那段北坡、南坡和山间谷地的蚂蚁群落。共采集蚂蚁标本7516头,隶属于2亚科、5属、7种。利用EstimateS 9.1.0程序对该地区蚂蚁物种丰富度进行估计并绘... 详细信息

为了揭示喜马拉雅山不同海拔梯度蚂蚁的多样性规律,采用样地调查法研究了喜马拉雅山错那段北坡、南坡和山间谷地的蚂蚁群落。共采集蚂蚁标本7516头,隶属于2亚科、5属、7种。利用EstimateS 9.1.0程序对该地区蚂蚁物种丰富度进行估计并绘制物种累计曲线,结果表明错那段的蚂蚁物种实际观察值等于或接近该地区蚂蚁丰富度的估计值。多样性分析显示,错那段3个垂直带蚂蚁物种数目、Shannon-Wiener多样性指数和Fisherα指数顺序为北坡>山间谷地>南坡,优势度指数顺序为北坡<山间谷地<南坡,个体密度顺序为北坡>南坡>山间谷地;在各垂直带上蚂蚁群落物种数目、个体密度、多样性指数总体随海拔升高呈现垂直带中下部较高,垂直带上部较低;群落各项指标更多的表现出“多域效应”现象,降水和海拔对蚂蚁物种丰富度和多样性起决定作用,凋落物的质量和坡度有重要影响。相关性分析发现错那段蚂蚁物种多样性指数与草本盖度极相关,优势度指数与灌木盖度相关性显著;群落相似性分析表明植被类型和海拔高差对蚂蚁群落间相似性有重要作用。

关键词：蚁科多样性垂直带喜马拉雅山

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短毛切梢小蠹肠道细菌群落结构与多样性

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中国森林病虫 2023年第2期42卷 1-8页

作者：崔雅洁赵宁李宗波杨斌西南林业大学生物多样性保护学院云南省高校森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224 西南林业大学生命科学学院云南昆明650224

为明确短毛切梢小蠹Tomicus brevipilosus肠道细菌群落结构及其多样性,采用宏基因组测序技术对短毛切梢小蠹肠道和残体的细菌DNA测序,分析细菌群落的组成、丰度及多样性。结果发现:共鉴定出23门53纲119目188科221属458种;变形菌门Proteo... 详细信息

为明确短毛切梢小蠹Tomicus brevipilosus肠道细菌群落结构及其多样性,采用宏基因组测序技术对短毛切梢小蠹肠道和残体的细菌DNA测序,分析细菌群落的组成、丰度及多样性。结果发现:共鉴定出23门53纲119目188科221属458种;变形菌门Proteobacteria、放线菌门Actinobacteria、拟杆菌门Bacteroidetes为肠道和残体菌群的优势门,平均相对丰度分别为64.14%和61.21%、26.58%和24.78%、8.79%和12.08%;分枝菌酸杆菌属Mycolicibacterium、中慢生根瘤菌属Mesorhizobium、叶杆菌属Phyllobacterium、慢生根瘤菌属Bradyrhizobium为肠道和残体菌群优势属,平均相对丰度分别为17.60%和16.67%、 13.89%和10.01%、 10.27%和5.82%、10.90%和18.89%;肠道和残体的细菌群落组成和多样性有明显不同。这些结果将为深入探究短毛切梢小蠹的肠道菌群功能及其灾变机制提供新的视野和理论依据。

关键词：短毛切梢小蠹消化道细菌群落多样性宏基因组技术

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四川大凉山东部蚂蚁物种多样性研究

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四川农业大学学报 2021年第6期39卷 742-754页

作者：韩秀徐正会张新民李彪翟奖李婷西南林业大学生物多样性保护学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650224

【目的】研究四川大凉山东部的蚂蚁多样性规律。【方法】采用样地调查法对该区域的蚂蚁物种多样性进行调查;利用Estimate S9.1.0程序对数据进行处理,分析抽样的充分性;利用多样性分析方法分析蚂蚁群落的组成、物种多样性及群落相似性;用... 详细信息

【目的】研究四川大凉山东部的蚂蚁多样性规律。【方法】采用样地调查法对该区域的蚂蚁物种多样性进行调查;利用Estimate S9.1.0程序对数据进行处理,分析抽样的充分性;利用多样性分析方法分析蚂蚁群落的组成、物种多样性及群落相似性;用Pearson相关分析方法分析蚂蚁物种多样性与植被的关系。【结果】在大凉山东部8个垂直带上共采获蚂蚁35 630头,经鉴定隶属6亚科43属136种。各样地蚂蚁群落个体密度2.0~399.8头/m^(2)(平均值96.9头/m^(2)),在各垂直带的北坡底域效应显著,而在南坡多域效应表现明显;优势度指数在各样地间变化较大,总体呈多域效应现象;多样性指数受坡向影响较大,北坡多表现为中域效应现象,南坡多表现为多域效应现象;相似性系数0.158 5~0.583 3(平均0.259 8),处于中等不相似水平。【结论】纬度、坡向和海拔影响蚂蚁物种多样性。海拔是蚂蚁群落主要指标的决定因素,物种数目、个体密度和多样性指数总体随海拔升高而降低,但同时受坡向、气候和人为因素的共同影响。尽管各垂直带均已受到不同程度的人为干扰,但相似性系数仍然较低,表明不同垂直带蚂蚁群落间差异明显,具有较好的生态功能和保护价值。

关键词：蚁科生物多样性群落垂直带四川

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