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华中农业大学学报 2020年第6期39卷 44-49页

作者：尼玛此姆韩雨庭唐婕黄若霞马焕成伍建榕云南省高校森林灾害预警控制重点实验室/西南林业大学生物多样性保护学院昆明650224 西南地区生物多样性保育国家林业和草原局重点实验室/西南林业大学林学院昆明650224

采集云南省红河州绿春县骑马坝乡的胡椒种植地的胡椒根系及土壤样品,进行胡椒瘟病的调查,计算胡椒瘟病的发病率与病情指数,并利用湿筛沉淀法、植株根部染色等方法对所选样地的胡椒根际及根部周围的丛枝菌根真菌的孢子密度、丰富度、多... 详细信息

采集云南省红河州绿春县骑马坝乡的胡椒种植地的胡椒根系及土壤样品,进行胡椒瘟病的调查,计算胡椒瘟病的发病率与病情指数,并利用湿筛沉淀法、植株根部染色等方法对所选样地的胡椒根际及根部周围的丛枝菌根真菌的孢子密度、丰富度、多样性指数及菌根侵染率进行调查和计算。结果显示,当菌根侵染率最高(62.5%)时,孢子密度也最高,达到11.725个/g,胡椒瘟病的发病率和病情指数最低,分别为20%和9;当菌根侵染率和孢子密度最低为11%和2.475个/g时,胡椒瘟病的发病率和病情指数最高,分别为80%和53.5;相关性分析结果表明丛枝菌根真菌的孢子密度、丰富度和菌根侵染率与胡椒瘟病发病率和病情指数呈显著负相关关系(P<0.05),即丛枝菌根真菌孢子的丰富度及孢子密度越大,菌根侵染率越高,胡椒瘟病的发病率就越低,病情指数也就越小。由此可看出,胡椒根系土壤中丛枝菌根真菌的存在能增强胡椒的抗病性,减少病害的发生。

关键词：丛枝菌根真菌(AMF) 胡椒瘟病真菌多样性胡椒生物防治

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CRISPR/Cas基因编辑技术在植物病原真菌中的应用研究进展

CRISPR/Cas基因编辑技术在植物病原真菌中的应用研究进展

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中国植物病理学会2021年学术年会

作者：夏雄飞韩长志西南林业大学生物多样性保护学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室

CRiSPR/Cas （Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats/CRISPRassociated）是在细菌、古细菌基因组中含有的一种成簇有规律的间隔短回文重复序列,基于其功能学术界开发了CRISPR/Cas基因编辑技术,与传统的锌指核酶（ZFNs）和转录激活因子样效应物核酶（TALENs）基因编辑方法相比,该技术拥有更高效、更简便的优势,现广泛应用于植物、动物等多种生物基因功能挖掘和定向遗传改良中。前人对于植物病原真菌致病基因的功能研究,多采用单个基因敲除试验的方式进行。学术界尚未见有关CRISPR/Cas基因编辑技术在植物病原真菌中应用的系统综述。本研究通过对CRISPR/Cas系统的组成、作用机制和运用原理进行阐述,系统总结了该技术在植物病原真菌（稻瘟病菌、橡胶树胶孢炭疽菌、玉米黑粉病菌等）中的致病相关基因组定点编辑应用情况,明确该基因组编辑技术的局限性,并针对上述问题提出一些建议及对未来应用与研究方向的展望,以期为进一步开展该领域的科学研究提供重要的理论指导。研究结果表明,学术界已经利用该系统对部分植物病原真菌中的诸多基因开展基因敲除及功能研究工作,例如稻瘟病菌中的SDH、ALB1、Spo11,橡胶树胶孢炭疽菌中的URA5,玉米黑粉病菌中的bE1、bW2、don3等;同时,已经实现一系列诸如共同编辑、单交叉介导的基因同源重组编辑、荧光蛋白标记、两轮转化、微同源重组、PEG介导编辑、内源性基因标记等应用策略。尽管如此,目前CRISPR/Cas系统在植物病原真菌基因编辑方面,依然存在着整体上编辑效率普遍不高、规范化操作不高以及sgRNA设计工具、突变检验方式、载体选用不统一等问题。相较于植物病原真菌分布及种类、数量的多样性,该系统在植物病原真菌中的应用范围还较小,同时,某些真菌较难实现基因同源重组,缺乏启动子和有效的选择信号标,严重影响了该技术应用于植物病原真菌致病基因功能的解析。因此,未来学术研究应进一步挖掘该系统新的应用方式与应用对象,规范该系统中的载体及步骤操作等,从而更好地提高基因的编辑效率,明确植物病原菌中致病基因的功能。

关键词： CRISPR/Cas 植物病原真菌基因编辑研究综述

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喜马拉雅山底雅段和札达段蚂蚁多样性

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森林与环境学报 2020年第3期40卷 313-320页

作者：刘霞徐正会张翔李晓艳刘兰兰张新民西南林业大学生物多样性保护学院云南昆明650224 云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

为揭示喜马拉雅山蚂蚁群落的生态学规律,采用样地调查法对喜马拉雅山底雅段和札达段的蚂蚁群落进行调查。共观察蚂蚁5355头,隶属于2亚科5属7种,其中底雅段7种,札达段3种。对该地区蚂蚁物种丰富度进行估计,结果表明底雅段和札达段的蚂蚁... 详细信息

为揭示喜马拉雅山蚂蚁群落的生态学规律,采用样地调查法对喜马拉雅山底雅段和札达段的蚂蚁群落进行调查。共观察蚂蚁5355头,隶属于2亚科5属7种,其中底雅段7种,札达段3种。对该地区蚂蚁物种丰富度进行估计,结果表明底雅段和札达段的蚂蚁物种丰富度较低。底雅段南坡的蚂蚁物种数目、Shannon-Wiener多样性指数、Fisherα指数和优势度指数表现出"中域效应"现象,而个体密度则表现出"多域效应"现象;札达段南坡的蚂蚁物种数目、个体密度和Fisherα指数均表现出"多域效应"现象。蚂蚁群落相似性系数显示各样地间的蚂蚁群落处于极不相似至极相似水平,表明该地区不同海拔蚂蚁群落既有差异又存在一定共性。在底雅段和札达段,海拔对蚂蚁物种的分布和多样性有较大影响,坡向和植被对蚂蚁群落分化有重要作用。

关键词：蚁科物种多样性优势度群落相似性喜马拉雅山

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中国蚁科昆虫研究文献的计量学分析

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西南林业大学学报（社会科学） 2021年第5期5卷 105-110页

作者：房华徐正会西南林业大学图书馆云南昆明650233 西南林业大学生物多样性保护学院云南昆明650233 云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650233

为评价中国蚁科昆虫研究历史及发展趋势,以CNKI中的《中国期刊全文数据库》为数据源,结合文献追溯法对早期论文和国外期刊论文进行人工查询,系统整理了中国蚁科昆虫研究文献,采用文献计量学方法统计分析了中国蚁科昆虫研究文献。通过对... 详细信息

为评价中国蚁科昆虫研究历史及发展趋势,以CNKI中的《中国期刊全文数据库》为数据源,结合文献追溯法对早期论文和国外期刊论文进行人工查询,系统整理了中国蚁科昆虫研究文献,采用文献计量学方法统计分析了中国蚁科昆虫研究文献。通过对年份、研究机构和作者、载文期刊、学科分类等文献特征的分析评价,揭示了自1758年科学分类学诞生以来中国蚁科昆虫研究的历史和发展动态,并对该领域今后的研究方向提出了建议,以期为有关研究团队和机构提供参考。

关键词：蚁科文献计量学研究历史发展趋势中国

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丽江人工栽培羊肚菌病害调查及病原鉴定

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贵州农业科学 2021年第5期49卷 67-74页

作者：潘启强李云霞陈健鑫吕则佳伍建榕马焕成西南林业大学生物多样性保护学院云南省高校森林灾害预警控制重点实验室云南昆明650224 西南林业大学林学院国家林业局西南地区生物多样性保育重点实验室云南昆明650224

【目的】探明丽江当地羊肚菌干腐病的病原,为人工栽培羊肚菌干腐病的综合防治提供理论依据。【方法】对丽江市永胜县人工栽培的羊肚菌干腐病进行普查和专项调查,采用组织分离法对田间发病的羊肚菌进行分离培养及纯化,获得病原菌株,采用... 详细信息

【目的】探明丽江当地羊肚菌干腐病的病原,为人工栽培羊肚菌干腐病的综合防治提供理论依据。【方法】对丽江市永胜县人工栽培的羊肚菌干腐病进行普查和专项调查,采用组织分离法对田间发病的羊肚菌进行分离培养及纯化,获得病原菌株,采用柯赫氏法则对羊肚菌病原菌进行致病性测定,结合形态学与分子生物学相结合的方法对病原菌进行鉴定。【结果】丽江市永胜县人工栽培的羊肚菌干腐病发生严重,平均干腐病发病率为24.51%,病情指数为19.30;危害羊肚菌的病原有长毛拟青霉(Paecilomyces penicillatus)、燕麦镰刀菌(Fusarium avenaceum)和芬芳镰刀菌(Fusarium redolens)。【结论】丽江市羊肚菌干腐病发病率高,病原菌是长毛拟青霉、燕麦镰刀菌和芬芳镰刀菌。

关键词：羊肚菌病害调查病原鉴定 ITS 系统发育丽江

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云南高黎贡山蚂蚁区系及物种多样性研究

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西南林业大学学报（自然科学） 2022年第5期42卷 1-17页

作者：徐正会房华赵梦乔黄钊和玉成余新林唐建彦施建雄何国成和晓阳西南林业大学生物多样性保护学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650233 西南林业大学图书馆云南昆明650223 云南高黎贡山国家级自然保护区保山管护局腾冲分局云南腾冲679100 云南高黎贡山国家级自然保护区保山管护局隆阳分局云南保山678028 云南高黎贡山国家级自然保护区怒江管护局泸水分局云南六库673199 云南高黎贡山国家级自然保护区怒江管护局贡山分局云南贡山673500

高黎贡山位于横断山系最西边,是青藏高原向横断山区过渡地带,连接着东喜马拉雅地区、横断山地区和印度−缅甸地区3个生物多样性热点地区,生物物种高度富集,是世界生物圈保护区和具有国际意义的陆地生物多样性关键地区。为全面揭示高黎贡... 详细信息

高黎贡山位于横断山系最西边,是青藏高原向横断山区过渡地带,连接着东喜马拉雅地区、横断山地区和印度−缅甸地区3个生物多样性热点地区,生物物种高度富集,是世界生物圈保护区和具有国际意义的陆地生物多样性关键地区。为全面揭示高黎贡山的蚂蚁区系及物种多样性,本研究修订了前人研究报道中的错误,2019—2021年通过系统的调查,合计记载高黎贡山蚂蚁9亚科、67属、245个已知种,比前人研究新增19属(占28.4%)、124种(占50.6%)。高黎贡山蚂蚁区系具有典型的东喜马拉雅地区、横断山地区和印度−缅甸地区区系汇聚特点,虽然北部山脊有少量古北界成分渗入,但是没有形成规模性群落,因此高黎贡山龙陵至贡山区域在中国动物地理区划中应划入东洋界西南区范围。属级水平上与其他动物地理界的紧密度依次为古北界、澳洲界、非洲界、新北界和新热带界;种级水平上与其他动物地理界的紧密度依次为古北界、澳洲界、非洲界、新北界、新热带界,与其他动物地理区的紧密度依次为华南区、华中区、华北区、青藏区、蒙新区、东北区。高黎贡山蚂蚁物种多样性从北向南随着纬度降低,气温升高,蚂蚁物种多样性升高;东坡有效积温高于西坡,其蚂蚁物种多样性高于西坡;蚂蚁个体密度主要受湿度影响,适宜的湿度有利于提高蚂蚁群落个体密度;在自然保护区外,过多的人为干扰降低了蚂蚁的物种多样性。因此,高黎贡山蚂蚁物种多样性主要受气温、湿度、坡向和人为干扰影响。

关键词：蚁科分类区系地理区划生物多样性高黎贡山

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广南县杉木三种侵染性病害病原鉴定

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中国森林病虫 2021年第5期40卷 1-8页

作者：韩雨庭唐婕尼玛此姆马焕成伍建榕云南省高校森林灾害预警控制重点实验室西南林业大学生物多样性保护学院云南昆明650224 西南地区生物多样性保育国家林业和草原局重点实验室西南林业大学林学院云南昆明650224

为明确云南省广南县杉木Cunninghamia lanceolata侵染性病害的病原菌种类,对病组织进行分离获得病原菌,通过柯赫氏法则进行验证,结合形态特征和系统发育树进行鉴定,并进行复合侵染试验。结果表明:广南县杉木3种主要的侵染性病害分别为... 详细信息

为明确云南省广南县杉木Cunninghamia lanceolata侵染性病害的病原菌种类,对病组织进行分离获得病原菌,通过柯赫氏法则进行验证,结合形态特征和系统发育树进行鉴定,并进行复合侵染试验。结果表明:广南县杉木3种主要的侵染性病害分别为杉木炭疽病、杉木赤枯病和杉木落针病,其病原真菌依次为暹罗刺盘孢Colletotrichum siamense、小孢拟盘多毛孢Pestalotiopsis microspo-ra和杉叶散斑壳Lophodermium uncinatum。复合侵染的病斑比单独接种的扩展速度更快,且***的致病力比***的强。3种侵染性病害的病原菌种类和致病性测定,可为病害防治及抗病育种等工作提供科学的理论依据。

关键词：侵染性病害病原鉴定复合侵染杉木炭疽病广南县

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基于无人机多光谱影像的云南切梢小蠹危害监测反演研究

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西南农业学报 2021年第9期34卷 1878-1884页

作者：马云强李宇宸刘梦盈石雷张军张忠和西南林业大学生物多样性保护学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224 中国林业科学研究院资源昆虫研究所云南昆明650224 云南大学资源环境与地球科学学院云南昆明650504

【目的】探索如何利用多光谱遥感对云南切梢小蠹的危害状况进行快速准确的监测。【方法】基于多光谱无人机获取研究区影像结合实地采集样方数据,应用DNN深度学习模型定量反演研究区云南切梢小蠹危害信息,分析虫害等级光谱图像发现GNRE... 详细信息

【目的】探索如何利用多光谱遥感对云南切梢小蠹的危害状况进行快速准确的监测。【方法】基于多光谱无人机获取研究区影像结合实地采集样方数据,应用DNN深度学习模型定量反演研究区云南切梢小蠹危害信息,分析虫害等级光谱图像发现GNRE指数和NDVI指数对虫害造成的枯稍率的相关性。【结果】将两指数应用于模型拟合,对比结果发现植被指数NDVI与云南切梢小蠹危害的枯梢率相关性为R^(2)=0.67696,高于GNRE的R^(2)=0.45331,且危害等级分类总体分类精度为71.11%,Kappa系数为0.6751,危害等级由高到低的面积占比分别为1.18%、8.60%、73.73%、16.47%。【结论】利用无人机影像结合深度学习技术,可准确得到切梢小蠹分布信息,且危害等级分布呈现出由道路以及树林密度较小区域向密度较大区域其危害性逐渐减小,可为后续大范围切梢小蠹危害云南松的监测与防治提供参考。

关键词：无人机多光谱云南切梢小蠹危害反演

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生长素对樟叶越桔离体培养物次生代谢物含量的影响

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西部林业科学 2020年第1期49卷 133-139页

作者：谭亚婷尚俊可罗旭璐张訸丁勇赵平闫晓慧唐军荣西南林业大学国家林业局西南地区生物多样性保育重点实验室云南昆明650224 西南林业大学西南山地森林资源保育与利用教育部重点实验室云南昆明650224 西南林业大学云南省高校林木生物技术重点实验室云南昆明650224 西南林业大学生物多样性保护学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

为补充樟叶越桔野生资源中熊果苷、6’-O-咖啡酰熊果苷(CA)的不足,以同一批次的樟叶越桔组培苗为材料,对其茎段和叶片中的熊果苷、CA含量进行了测定,并比较不同NAA或IBA处理下,组培苗离体茎段、叶片培养物中熊果苷、CA的含量差别。结果... 详细信息

为补充樟叶越桔野生资源中熊果苷、6’-O-咖啡酰熊果苷(CA)的不足,以同一批次的樟叶越桔组培苗为材料,对其茎段和叶片中的熊果苷、CA含量进行了测定,并比较不同NAA或IBA处理下,组培苗离体茎段、叶片培养物中熊果苷、CA的含量差别。结果表明,组培苗叶片中熊果苷和CA的含量要明显高于茎段。在NAA诱导处理下组培苗离体叶片或茎段均能产生愈伤组织,且所有诱导物中仅有熊果苷产生,未检测出CA;而在IBA诱导处理下,均能检测出熊果苷、CA。熊果苷含量在NAA 0.5mg/L处理叶片时的含量最高,为(1.01±0.04)%,而CA含量则以IBA 0.3mg/L处理茎段时含量最高,为(0.47±0.00)%。因此,樟叶越桔组培苗的叶片、茎段分别是离体生产熊果苷、CA的最适材料,而NAA或IBA可作为樟叶越桔组培苗离体叶片或茎段产生熊果苷、CA的诱导子。研究结果为樟叶越桔组培苗开展次生代谢产物的研究提供了前期基础,也为樟叶越桔可持续开发利用提供技术保障。

关键词：樟叶越桔组培苗离体培养次生代谢产物

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基于全基因组序列的核桃细菌性黑斑病菌分泌蛋白的预测及特征分析

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南京林业大学学报(自然科学版) 2019年第3期43卷 17-22页

作者：祝友朋刘宏莉韩长志西南林业大学生物多样性保护与利用学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室

【目的】充分了解核桃黑斑病菌的侵染机制。【方法】以全基因组序列已经公布的7个核桃细菌性黑斑病菌菌株CFBP2528、CFBP7179、CFBP8253、DW3F3、J303、NCPPB1447、Xaj417等所具有的蛋白序列为预测数据,基于分泌蛋白所具有的主要特征,利... 详细信息

【目的】充分了解核桃黑斑病菌的侵染机制。【方法】以全基因组序列已经公布的7个核桃细菌性黑斑病菌菌株CFBP2528、CFBP7179、CFBP8253、DW3F3、J303、NCPPB1447、Xaj417等所具有的蛋白序列为预测数据,基于分泌蛋白所具有的主要特征,利用SignalP v4.1、ProtCompB v9.0、TMHMM v2.0、big-PI Fungal predictor、TargetP v1.1、LipoP v1.0等在线分析程序对分泌蛋白进行预测,同时分析其氨基酸组成及分布、信号肽长度、信号肽切割位点等特征。【结果】核桃细菌性黑斑病菌的分泌蛋白平均为74个,其氨基酸长度多集中于101～400氨基酸,所占比例为63.65%。信号肽氨基酸残基中以A最多,所占比例为22.04%;其次是L,所占比例为19.27%。信号肽长度以19～29个氨基酸的最多,所占比例为79.62%,信号肽切割位点属于A-X-A类型。【结论】核桃细菌性黑斑病菌中分泌蛋白的有效预测,可为深入解析核桃细菌性黑斑病菌中分泌蛋白在侵染过程中所发挥的功能提供理论依据。

关键词：核桃细菌性黑斑病菌全基因组分泌蛋白生物信息学分析

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