检索结果-内蒙古大学图书馆

湖北农业科学 2014年第20期53卷 4992-4996页

作者：韩长志西南林业大学林学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650224

希金斯炭疽菌(Colletotrichum higginsanum Sacc.)可以侵染菜心、萝卜等众多十字花科蔬菜引起炭疽病,给生产造成巨大的经济损失。通过对该菌中可能的腺苷酸环化酶(AC)氨基酸序列进行理化性质、细胞信号肽、跨膜区结构以及二级结构等生... 详细信息

希金斯炭疽菌(Colletotrichum higginsanum Sacc.)可以侵染菜心、萝卜等众多十字花科蔬菜引起炭疽病,给生产造成巨大的经济损失。通过对该菌中可能的腺苷酸环化酶(AC)氨基酸序列进行理化性质、细胞信号肽、跨膜区结构以及二级结构等生物信息学分析。结果表明,该菌种Ch Cap1,Ch Cap2与Srv2在理化性质、二级结构、亚细胞定位方面差异较大,以期为深入开展AC基因的定位、表达以及功能域等方面研究及为进一步实现以控制病原菌G蛋白信号途径功能新药物靶标的开发提供有力的理论支撑。

关键词：希金斯炭疽菌(Colletotrichum higginsanum Sacc.) 腺苷酸环化酶理化性质亚细胞定位二级结构

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禾谷炭疽菌碳水化合物酶类蛋白注释及其理化性质分析

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河南师范大学学报（自然科学版） 2017年第3期45卷 48-52页

作者：韩长志许僖西南林业大学林学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650224

禾谷炭疽菌侵染玉米、小麦等农作物引起的炭疽病,给各国农业生产造成了巨大的经济损失.基于前期研究结果,以267个碳水化合物酶类蛋白(CAZymes)序列为基础,对其进行理化性质分析,结果表明,近2/3的蛋白理论等电点小于6,属于酸性蛋白,同时... 详细信息

禾谷炭疽菌侵染玉米、小麦等农作物引起的炭疽病,给各国农业生产造成了巨大的经济损失.基于前期研究结果,以267个碳水化合物酶类蛋白(CAZymes)序列为基础,对其进行理化性质分析,结果表明,近2/3的蛋白理论等电点小于6,属于酸性蛋白,同时,通过随机数软件对上述蛋白进行10%抽样分析,明确了不同理论等电点类别的分泌蛋白所具有的分子质量、分子式、原子数量、半衰期、不稳定性系数、脂肪族氨基酸指数、总平均亲水性等性质.该研究为深入解析禾谷炭疽菌CAZymes蛋白的功能奠定了坚实的理论基础.

关键词：禾谷炭疽菌分泌蛋白理化性质预测程序

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禾谷炭疽菌腺苷酸环化酶的生物信息学分析

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贵州农业科学 2014年第10期42卷 64-68页

作者：韩长志西南林业大学林学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

为了给禾谷炭疽菌新靶标药物的研究开发提供参考,以酿酒酵母的典型腺苷酸环化酶（AC）序列为基础,利用炭疽菌属蛋白数据库在线对其进行Blastp比对及关键词搜索,通过SMART对该菌典型AC蛋白的保守结构域、理化性质、细胞信号肽、跨膜区结... 详细信息

为了给禾谷炭疽菌新靶标药物的研究开发提供参考,以酿酒酵母的典型腺苷酸环化酶（AC）序列为基础,利用炭疽菌属蛋白数据库在线对其进行Blastp比对及关键词搜索,通过SMART对该菌典型AC蛋白的保守结构域、理化性质、细胞信号肽、跨膜区结构以及二级结构等生物信息学进行分析,同时比较禾谷炭疽菌中典型AC氨基酸序列与其他物种同源序列的遗传关系。结果表明：禾谷炭疽菌中存在一个与酿酒酵母Srv2同源的序列,命名为CgCap1腺苷酸环化酶蛋白,该酶蛋白包含有530个氨基酸,基因序列长1 906bp具有保守CARP结构域,等电点蛋白在5~6范围,属亲水性、不稳定蛋白,不含信号肽序列,定位于质膜上,二级结构中的β折叠所占比例较低,与同属于炭疽菌属真菌胶孢炭疽菌、西瓜炭疽菌的亲缘关系较近。

关键词：禾谷炭疽菌腺苷酸环化酶理化性质亚细胞定位二级结构

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希金斯炭疽菌磷酸二酯酶生物信息学分析

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科学技术与工程 2014年第27期22卷 163-167页

作者：韩长志西南林业大学林学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650224

磷酸二酯酶(Pde)在植物病原菌G蛋白信号传导途径上发挥着重要作用。Pde已在粟酒裂殖酵母菌、稻瘟病菌等中有相关报道,然而,对于侵染十字花科植物的希金斯炭疽菌中Pde研究尚不深入。基于酿酒酵母中已经报道的典型Pde序列,利用Blastp以及... 详细信息

磷酸二酯酶(Pde)在植物病原菌G蛋白信号传导途径上发挥着重要作用。Pde已在粟酒裂殖酵母菌、稻瘟病菌等中有相关报道,然而,对于侵染十字花科植物的希金斯炭疽菌中Pde研究尚不深入。基于酿酒酵母中已经报道的典型Pde序列,利用Blastp以及关键词对炭疽菌蛋白质数据库进行比对、搜索,并通过SMART保守结构域分析。同时,通过对该菌中典型Pde氨基酸序列进行理化性质、疏水性、细胞信号肽、跨膜区结构、亚细胞定位以及二级结构等生物信息学分析,此外,通过对希金斯炭疽菌中的典型Pde与其他物种中的同源序列进行遗传关系比较分析。通过上述生物信息学分析,以期为深入开展Pde定位、功能研究等方面研究,同时,为进一步实现以控制病原菌G蛋白信号途径功能新的药物靶标的开发提供有力的理论支撑。

关键词：希金斯炭疽菌磷酸二酯酶理化性质亚细胞定位二级结构

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全基因组预测枯草芽孢杆菌XF-1的分泌蛋白

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福建农业学报 2016年第4期31卷 384-388页

作者：韩长志西南林业大学林学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

枯草芽孢杆菌XF-1对诸多植物病原菌具有抑制作用,是农业生产上重要的生防菌之一。利用SignalP、ProtComp、TMHMM、Phobius、LipoP、TatP等预测程序对枯草芽孢杆菌中3 853条蛋白质序列进行分泌蛋白的预测研究,并对所获得的分泌蛋白开展... 详细信息

枯草芽孢杆菌XF-1对诸多植物病原菌具有抑制作用,是农业生产上重要的生防菌之一。利用SignalP、ProtComp、TMHMM、Phobius、LipoP、TatP等预测程序对枯草芽孢杆菌中3 853条蛋白质序列进行分泌蛋白的预测研究,并对所获得的分泌蛋白开展氨基酸分布、信号肽长度、切割位点等性质进行分析。结果表明,该菌含有分泌蛋白为104个,其氨基酸长度、信号肽长度与植物病原菌不同;信号肽切割位点属于A-X-A类型,与其他已经报道的植物病原真菌、细菌以及卵菌中分泌蛋白信号肽切割位点一致。通过上述生物信息学分析方法有效地实现了枯草芽孢杆菌分泌蛋白的预测,分泌蛋白的信号肽切割位点具有物种保守型特点。

关键词：枯草芽孢杆菌分泌蛋白信号肽预测程序

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球花石楠黑斑病菌生物学特性

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中国森林病虫 2015年第2期34卷 6-8,30页

作者：韩长志李瑞强西南林业大学林学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

对球花石楠黑斑病菌Alternaria sp.生物学特性进行了研究。结果显示,该病原菌生长最适条件为PDA,28℃,p H 8,碳源为麦芽糖,氮源为蛋白胨,明确该病菌可以较好地适应不同的光照条件以及不同碳源、氮源等营养环境条件。

关键词：球花石楠黑斑病链格孢生物学特性

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球花石楠黑斑病病害调查及病原鉴定初报

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中国森林病虫 2014年第5期33卷 8-9,34页

作者：韩长志李瑞强西南林业大学林学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

以西南林业大学校园及生活区内球花石楠黑斑病的病害调查为切入点,进行病原分离、鉴定研究,为深入开展病害防治奠定基础。结果显示:校园内的发病率37%,生活区发病率42%;经过柯赫氏法则验证、形态学鉴定,明确病原为链格孢属Alternaria真菌。

关键词：球花石楠黑斑病病害调查链格孢属

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管氏肿腿蜂感染Wolbachia的分子检测

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西南林业大学学报（自然科学） 2016年第3期36卷 169-173页

作者：黄镜梅刘乃勇许小露李丽芳杨斌朱家颖西南林业大学林学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

Wolbachia是一类在节肢动物中广泛感染的胞内共生菌,为了解Wolbachia在管氏肿腿蜂体内的感染情况,采用Wolbachia的通用引物、A大组特异性引物和B大组特异性引物对管氏肿腿蜂体内Wolbachia的wsp基因进行PCR扩增及序列测定,所获得的基因... 详细信息

Wolbachia是一类在节肢动物中广泛感染的胞内共生菌,为了解Wolbachia在管氏肿腿蜂体内的感染情况,采用Wolbachia的通用引物、A大组特异性引物和B大组特异性引物对管氏肿腿蜂体内Wolbachia的wsp基因进行PCR扩增及序列测定,所获得的基因片段分别命名为w Sgu、wSgu A和wSguB,长度分别为620、572 bp和463 bp。基因序列分析表明wSgu与wSguB序列间碱基差异较大,同源性仅为60%。系统发育分析表明该寄生蜂感染了A大组的Wolbachia,但对于该寄生蜂是否也感染了B大组的Wolbachia尚待确定。

关键词：管氏肿腿蜂 Wolbachia wsp基因 PCR 序列分析

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全基因组预测褐环乳牛肝菌的分泌蛋白

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江苏农业科学 2017年第23期45卷 45-48页

作者：韩长志刘艳任雪敏西南林业大学林学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

褐环乳牛肝菌作为针叶树种上重要的外生真菌,为宿主植物提供营养元素和水分,在此过程中,对于该菌分泌蛋白发挥的作用机制尚不清楚。利用Signal P、Prot Comp等预测程序对褐环乳牛肝菌中18 303条蛋白质序列进行分泌蛋白找寻,明确其含有32... 详细信息

褐环乳牛肝菌作为针叶树种上重要的外生真菌,为宿主植物提供营养元素和水分,在此过程中,对于该菌分泌蛋白发挥的作用机制尚不清楚。利用Signal P、Prot Comp等预测程序对褐环乳牛肝菌中18 303条蛋白质序列进行分泌蛋白找寻,明确其含有327个分泌蛋白,同时,对上述分泌蛋白的氨基酸大小分布、信号肽长度、信号肽切割位点等进行分析,明确该菌分泌蛋白的氨基酸长度集中于51~450 aa,信号肽长度以17~21 aa的序列最为集中,其信号肽切割位点均属于A-X-A类型。通过上述生物信息学分析方法有效地实现了褐环乳牛肝菌分泌蛋白的预测,分泌蛋白的信号肽切割位点类型与其他已经报道的致病疫霉、粗糙脉孢霉、禾谷炭疽菌等分泌蛋白信号肽切割位点一致。研究结果为进一步解析分泌蛋白在该菌为宿主植物提供营养过程中发挥的作用机制提供重要的理论支持。

关键词：褐环乳牛肝菌全基因组分泌蛋白信号肽预测程序

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希金斯炭疽菌腺苷酸环化酶相关蛋白生物信息学分析

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生物技术 2014年第6期24卷 56-60页

作者：韩长志西南林业大学林学院云南省森林灾害预警与控制重点实验室云南昆明650224

[目的]希金斯炭疽菌可引起菜心、萝卜等十字花科植物的炭疽病,给经济产生巨大损失。目前,炭疽病菌对苯并咪唑类杀菌剂所产生的抗性问题引起了学者广泛关注,有待于开发新的作用靶标的化学药剂。腺苷酸环化酶(AC)在G蛋白信号传导途径上发... 详细信息

[目的]希金斯炭疽菌可引起菜心、萝卜等十字花科植物的炭疽病,给经济产生巨大损失。目前,炭疽病菌对苯并咪唑类杀菌剂所产生的抗性问题引起了学者广泛关注,有待于开发新的作用靶标的化学药剂。腺苷酸环化酶(AC)在G蛋白信号传导途径上发挥着重要作用。[方法]基于酿酒酵母中Srv2序列,通过Blastp比对及关键词搜索,并利用SMART进行保守结构域分析,同时,通过对该菌中AC相关蛋白序列进行理化性质、信号肽、跨膜结构域等分析。[结果]明确该菌含有2个与Srv2同源的AC相关蛋白Cg Cap1、Cg Cap2,就理化性质、二级结构等特征方面而言,Cg Cap1、Cg Cap2与Srv2有着较大的差异。此外,通过对Srv2与Cg Cap1、Cg Cap2及其同源序列进行比对分析,发现Cg Cap1、Cg Cap2序列分别与其同源序列及Srv2的C端、N端具有较大的相似性,推测上述序列分别为希金斯炭疽菌AC的C端和N端。[结论]该研究为深入开展该菌AC的研究打下坚实的理论基础。

关键词：希金斯炭疽菌腺苷酸环化酶相关蛋白理化性质亚细胞定位二级结构

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