检索结果-内蒙古大学图书馆

病毒学报 2024年第1期40卷 13-26页

作者：李丰辰蒋豪然夏百成马洪滨朱汝南许晶黄艳智郜振国胡孔新李岩向星宇吴巨龙许红梅张凤王文慧张燕崔爱利中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室国家卫生健康委医学病毒和病毒病重点实验室北京102206 解放军总医院第五医学中心北京100039 首都儿科研究所北京100020 陕西省疾病预防控制中心西安710054 长春市儿童医院长春130051 新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心乌鲁木齐830002 中国检验检疫科学研究院卫生检验与检疫研究所北京100123 河北省疾病预防控制中心石家庄050021 湖南省疾病预防控制中心长沙410005 山东省疾病预防控制中心济南250014 重庆医科大学附属儿童医院重庆400014 青岛市疾病预防控制中心青岛市预防医学研究院青岛266000 河南省疾病预防控制中心郑州450016

为阐明我国全人群急性呼吸道感染(Acute respiratory infection,ARI)病例中人冠状病毒229E(Human coronavirus 229E,HCoV-229E)感染情况及病毒基因特征,本研究对2009-2021年间中国十一省份15,335例ARI监测病例中HCoV-229E核酸阳性病例进行描述性流行病学分析,同时对HCoV-229E阳性病例的临床标本进行S基因扩增和测序,阳性序列用于病毒系统发育和进化分析。本研究中共检测出316例HCoV阳性病例,其中38例为HCoV-229E阳性。HCoV-229E检出率在不同季节中差异无统计学意义(χ^(2)=2.345,P=0.504);男性检出率高于女性(χ^(2)=4.546,P<0.05);不同年龄组中,除了5~17岁青少年组未检测到HCoV-229E,其他年龄组间HCoV-229E检出率差异无统计学意义(χ^(2)=1.927,P=0.588)。在38例HCoV-229E阳性病例中有23例(60.53%)为混合感染病例,和HCoV-229E单一感染病例相比,包括肺炎病例在内的下呼吸道感染病例在混合感染病例中比例增高。本研究共获得9条2019-2021年HCoV-229E刺突蛋白(Spike protein,S)基因序列,结合从GenBank中下载的90条HCoV-229E S基因代表性序列共同构建系统发育树。结果表明,全球HCoV-229E序列可划分为Genogroup1~6共6个组,具有明显的时间聚集性。Genogroup 6是目前全球流行的主要优势谱系,位于HCoV-229E系统发育树的末端。本研究所获得的9条HCoV-229E序列均隶属于Genogroup 6,但位于不同分支。S基因分子进化速率约为7.32×10^(-4)替换/位点/年,S蛋白处于负向选择压力下(ω<1),但仍有个别正向选择位点存在,S蛋白多个位点上发生氨基酸突变和N-糖基化位点突变,其中部分突变发生在S蛋白受体结合结构域的3个受体结合环中。本研究通过开展中国内地部分地区ARI病例中HCoV-229E感染情况和病毒基因特征分析,阐述了我国HCoV-229E流行病学特征和病毒分子进化特点,为我国HCoV-229E感染的控制与预防提供基线数据。

关键词：人冠状病毒229E 流行特征系统发育分析分子进化

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鼻病毒与呼吸道疾病关系研究进展

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中华实验和临床病毒学杂志 2025年第2期39卷 254-258页

作者：赵若涵夏百成谢智博徐希柱张燕山东第一医科大学(山东省医学科学院)公共卫生与健康管理学院济南中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室国家卫生健康委医学病毒和病毒病重点实验室北京

鼻病毒(Rhinovirus, RV)是人类呼吸道感染的重要病原体之一, 与呼吸道疾病的密切相关。RV不仅能引起普通感冒, 还与毛细支气管炎、肺炎、哮喘等下呼吸道疾病相关, 特别是在哮喘的发生与加重中发挥了重要作用。本文系统归纳了现有文献中R... 详细信息

鼻病毒(Rhinovirus, RV)是人类呼吸道感染的重要病原体之一, 与呼吸道疾病的密切相关。RV不仅能引起普通感冒, 还与毛细支气管炎、肺炎、哮喘等下呼吸道疾病相关, 特别是在哮喘的发生与加重中发挥了重要作用。本文系统归纳了现有文献中RV相关的多种呼吸道疾病。虽然目前尚无针对RV的特效治疗药物和疫苗, 但针对RV的多价疫苗和抗病毒药物的研发为未来RV的感染防控提供了更多的参考。明确RV与疾病之间的关系, 将为优化治疗策略、预防和控制呼吸道疾病提供有力支持。

关键词：鼻病毒呼吸道感染流行病学

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2019—2022年长春市某哨点医院儿童急性呼吸道感染病例中肠道病毒流行病学与基因特征分析

引用

中国病毒病杂志 2024年第2期14卷 145-151页

作者：张瑶田玉玲王慧玲王娜王利武谢智博李汶霞王雅各宋金华夏百成孙馨张燕纪龙山东第一医科大学(山东省医学科学院) 山东济南250117 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所、国家卫生健康委医学病毒和病毒病重点实验室、传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室北京102206 长春市儿童医院吉林长春130061

目的了解2019—2022年吉林省长春市某哨点医院儿童急性呼吸道感染(acute respiratory infections,ARIs)病例中肠道病毒的流行情况及型别组成。方法采集2019年6月—2022年12月长春市儿童医院ARIs患儿的咽拭子样本,并收集患儿临床信息,用... 详细信息

目的了解2019—2022年吉林省长春市某哨点医院儿童急性呼吸道感染(acute respiratory infections,ARIs)病例中肠道病毒的流行情况及型别组成。方法采集2019年6月—2022年12月长春市儿童医院ARIs患儿的咽拭子样本,并收集患儿临床信息,用描述性分析方法对肠道病毒感染病例的性别、年龄和季节分布情况进行分析。采用实时荧光反转录聚合酶链反应(real-time quantitative reverse transcription PCR,real-time qRT-PCR)技术检测肠道病毒,使用反转录聚合酶链反应(reverse transcription PCR,RT-PCR)技术扩增肠道病毒VP1全长并进行系统进化分析。结果共采集2707例ARIs病例的咽拭子样本,检出肠道病毒阳性样本65例,检出率为2.40%。65份阳性样本中,32.31%(21/65)为混合感染,以肠道病毒和鼻病毒的双重混合感染最为常见,占肠道病毒阳性病例的10.77%(7/65)。2019—2022年春季、夏季、秋季和冬季肠道病毒的检出率分别为0、6.91%(40/579)、2.90%(21/725)和0.45%(4/894),不同季节肠道病毒检出率差异有统计学意义(χ^(2)=78.036,P<0.01),夏季检出率最高,秋季次之。本研究共鉴定出10种型别肠道病毒,分别为CVA2、CVA4、CVA5、CVA6、CVA10、CVA16、CVB3、E11、E18和EV-D68,其中CVA4检出最多,占比为44.82%(26/58),其余型别检出占比为1.72%~12.07%。结论2019—2022年长春市儿童ARIs病例中肠道病毒夏秋季检出率较高,肠道病毒感染以EV-A组为主。

关键词：急性呼吸道感染肠道病毒基因分型流行病学住院病例

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基于GenBank分析2000—2023年间中国大陆地区人轮状病毒基因序列变迁

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中国病毒病杂志 2025年

作者：陈燕谢迪姜慧敏李利利薛垂召李金松段招军甘肃中医药大学公共卫生学院中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室成都康华生物制品股份有限公司华北理工大学基础医学院河北省慢性疾病基础医学重点实验室中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所(国家热带病研究中心)传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室国家卫生健康委员会寄生虫病原与媒介生物学重点实验室世界卫生组织热带病合作中心科技部国家级热带病国际研究中心

目的利用GenBank中国大陆地区的人轮状病毒（human rotavirus）基因序列，了解2000—2023年间中国大陆地区hRV型别分布特征和变迁过程。方法从GenBank中下载2000—2023年中国大陆地区hRV VP4和VP7序列，对序列进行分型，并根据上传作... 详细信息

目的利用GenBank中国大陆地区的人轮状病毒（human rotavirus）基因序列，了解2000—2023年间中国大陆地区hRV型别分布特征和变迁过程。方法从GenBank中下载2000—2023年中国大陆地区hRV VP4和VP7序列，对序列进行分型，并根据上传作者、时间、标本号等将VP4和VP7关联为同一株病毒；统计分析各年的VP4(P)、VP7(G)的型别及构成比和各毒株（VP4和VP7属于同一株）的型别（G/P）及其构成比和在各年份的分布。结果从GenBank中共下载到2000—2023年中国大陆地区hRV序列4 600条，其中4 124条人轮状病毒VP4和VP7序列用于分析，VP4序列中有8种P基因型，VP7序列中有9种G基因型，关联后获得19种不同G/P型别的毒株。在研究时间范围内，最主要的VP4优势型别为P [8]；而VP7经历了多个优势型别的变迁，从2002年的G3,2012年变迁为G9,2021—2022年出现G8。优势毒株型别最初主要为G3P [8],G1P [8]、G2P [4]次之；自2014年，G9P [8]基因型逐渐出现并成为主要流行基因型；2021年起，G8P [8]开始出现。结论中国大陆地区人轮状病毒流行优势型别发生多次转换，主要体现在G基因型的转换，P基因型长期以P [8]为优势基因型；应当持续监测其型别转换及引起的流行特征变化。

关键词：轮状病毒序列基因型变迁

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肠道病毒D68型流行基因型高灵敏通用型Real-time RT-PCR检测方法建立及应用

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病毒学报 2025年第3期 625-633页

作者：肖梦怡韩振志路环环丛如意冀天娇祝双利孙强刘莹周蕾栗凡梁钰材范华肖金波张勇山东第一医科大学(山东省医学科学院) 公共卫生与健康管理学院国家脊髓灰质炎实验室世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室国家卫生健康委员会生物安全重点实验室首都儿科研究所病毒学研究室儿童病毒病病原学北京市重点实验室中国人民解放军疾病预防控制中心华北理工大学公共卫生学院沈阳医学院山东第二医科大学基础医学院

自2014年肠道病毒D组68型（Enterovirus D68,EV-D68）引起急性弛缓性脊髓炎暴发以来，一直被广泛关注。建立一种快速、高效且便捷的EV-D68特异性Real-time RT-PCR检测方法，对于及时发现潜在的传染源并迅速阻断传播至关重要。本研究参考... 详细信息

自2014年肠道病毒D组68型（Enterovirus D68,EV-D68）引起急性弛缓性脊髓炎暴发以来，一直被广泛关注。建立一种快速、高效且便捷的EV-D68特异性Real-time RT-PCR检测方法，对于及时发现潜在的传染源并迅速阻断传播至关重要。本研究参考EV-D68各个基因型VP1区代表序列设计探针和引物，通过制作标准品，对其特异性、灵敏度以及重复性进行全面评价，并用临床样本检测其可靠性。结果显示，本研究所设计的探针和引物仅能检出EV-D68，其他73种血清型肠道病毒均无检出情况，最低检测下限为2×10～1拷贝/μL，拷贝数与循环阈值之间具有良好的线性关系（R2=0.9933），重复性检测的变异系数小于1.70%，稳定性良好。采用本研究设计的探针和引物对41份临床样本进行检测时，实现了零漏检，与测序的金标准结果完全吻合，对于目前流行的B3和D3基因亚型可以实现全覆盖。综上所述，本研究设计的特异性探针引物在EV-D68检测中展现出高效且准确的特性，同时对目前流行的基因型具有较强的通用性，能够为EV-D68感染的临床诊断、疫情监测以及流行病学调查工作提供有力支持，为EV-D68的快速鉴定和相关疾病防控提供关键技术支撑。

关键词：肠道病毒D组68型实时荧光定量RT-PCR 特异性灵敏度重复性

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