检索结果-内蒙古大学图书馆

中国循证医学杂志 2024年第9期24卷 1085-1093页

作者：何倩潘喆敏向蔓宛慧琴秦婴逸贺佳海军军医大学军队卫生统计学教研室上海200433 同济大学医学院上海200092

目的通过公式推导和实例验证,分析多阅片者多病例(multi-reader multi-case,MRMC)设计影像诊断试验准确度评价的统计分析方法。方法本研究包括理论推导和实例验证两个部分。理论部分详细介绍了MRMC统计分析方法,特别是Obuchowski-Rocket... 详细信息

目的通过公式推导和实例验证,分析多阅片者多病例(multi-reader multi-case,MRMC)设计影像诊断试验准确度评价的统计分析方法。方法本研究包括理论推导和实例验证两个部分。理论部分详细介绍了MRMC统计分析方法,特别是Obuchowski-Rockette(OR)与Dorfman-Berbaum-Metz(DBM)方法的原理和步骤。实例部分研究共纳入了100例受试者,其中67例疾病患者。四名阅片者分别采用传统胶卷影像方法和数字化影像方法进行阅片。通过OR与DBM方法对阅片结果进行分析。结果实例研究显示,OR和DBM方法结果具有较高的一致性。当OR方法采用Jackknife估计协方差矩阵时,其结果与DBM方法完全吻合。结论为准确评估影像诊断试验的临床性能,推荐采用OR和DBM方法进行影像诊断试验准确性评价的统计分析,以确保阅片者因素对评价结果的影响得到充分考虑。OR与DBM方法的结果较为接近,实际应用时应考虑具体数据特点和研究设计选择合适的分析方法。同时,OR与DBM方法的应用目前仍存在一定挑战,如软件实现、缺失数据处理,未来仍需要进一步的探索。

关键词：多阅片者多病例影像诊断试验准确性

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基于广义增强模型的倾向性评分重叠权重加权方法研究

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中国卫生统计 2024年第5期41卷 676-681页

作者：涂博祥秦婴逸徐宵赵艳芳海军军医大学军队卫生统计学教研室 200433 同济大学医学院

目的本研究构建了基于广义增强模型的倾向性评分重叠权重加权模型(GBM-OW)。方法通过模拟数据探讨在混杂因素与处理因素间关系复杂的情况下,不同样本量,不同倾向性评分值重叠程度下GBM-OW模型在均衡混杂因素、效应估计等方面的表现,并... 详细信息

目的本研究构建了基于广义增强模型的倾向性评分重叠权重加权模型(GBM-OW)。方法通过模拟数据探讨在混杂因素与处理因素间关系复杂的情况下,不同样本量,不同倾向性评分值重叠程度下GBM-OW模型在均衡混杂因素、效应估计等方面的表现,并与多因素调整模型及其它三种倾向性评分加权模型进行比较。结果及结论从模拟结果来看,当变量之间关系复杂、样本量大、倾向性评分值重叠程度小的情况下,GBM-OW模型在各方面均有较好的表现,可应用于观察性研究中。

关键词：倾向性评分重叠权重广义增强模型

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基于miRNA-134-5p/BDNF/Akt信号通路探讨X线辐射致大鼠心肌细胞凋亡的机制

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海军军医大学学报 2024年第11期45卷 1352-1361页

作者：顾静付力文韩晓斐方丹金戈董晓丽颉亚辉侯敏甘肃中医药大学基础医学院生理学教研室兰州730000 甘肃中医药大学公共卫生学院数学与卫生统计学教研室兰州730000 甘肃中医药大学基础医学院解剖学与组织胚胎学教研室兰州730000

目的探讨X线辐射对大鼠心肌细胞凋亡的影响及相关机制。方法将大鼠H9C2心肌细胞分为空白对照组、X线照射组(X-ray组)、X线照射miRNA-134-5p抑制剂组(X-inhibitor组)、X线照射miRNA-134-5p抑制剂阴性对照组(X-NC组)。最终选择以6 Gy X线... 详细信息

目的探讨X线辐射对大鼠心肌细胞凋亡的影响及相关机制。方法将大鼠H9C2心肌细胞分为空白对照组、X线照射组(X-ray组)、X线照射miRNA-134-5p抑制剂组(X-inhibitor组)、X线照射miRNA-134-5p抑制剂阴性对照组(X-NC组)。最终选择以6 Gy X线辐照大鼠H9C2心肌细胞,48 h后检测各项指标变化。采用CCK-8法检测细胞存活率,用流式细胞术和Hoechst 33342染色检测细胞凋亡率,用DCFH-DA荧光探针法检测细胞内活性氧(ROS)水平,用JC-1法检测细胞线粒体膜电位变化,用超氧化物歧化酶(SOD)和丙二醛(MDA)检测试剂盒分别测定细胞中SOD活性、MDA水平,用qPCR法检测细胞中miRNA-134-5p表达,用蛋白质印迹法检测细胞中脑源性神经营养因子(BDNF)、Akt、磷酸化Akt(p-Akt)、Bcl2、Bax蛋白的表达。结果与空白对照组相比,X-ray组大鼠心肌细胞中ROS和MDA水平上升、SOD活性下降、线粒体膜电位下降百分比增加、DNA损伤微核形成数增加、细胞凋亡率升高(均P<0.01);与X-ray组相比,X-inhibitor组上述各项指标均有所逆转(P<0.05或P<0.01),而X-NC组的以上各指标差异均无统计学意义(均P>0.05)。与空白对照组相比,X-ray组大鼠心肌细胞中miRNA-134-5p水平上调,BDNF表达及Bcl2/Bax、p-Akt/Akt比值下降(均P<0.01);与X-ray组相比,X-inhibitor组大鼠心肌细胞中miRNA-134-5p水平下降,BDNF表达及Bcl2/Bax、p-Akt/Akt比值升高(均P<0.01),X-NC组各项指标差异均无统计学意义(均P>0.05)。结论X线照射诱导了大鼠心肌细胞发生氧化应激、线粒体损伤及DNA损伤,最终导致细胞凋亡,其发生机制可能涉及miRNA-134-5p/BDNF/Akt信号通路。

关键词：放射性心脏损伤辐射心肌细胞微RNA-134-5p 细胞凋亡

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多组资料倾向性评分加权法模型构建与比较

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中国循证医学杂志 2023年第3期23卷 362-372页

作者：徐宵涂博祥秦婴逸贺佳同济大学医学院上海200092 海军军医大学军队卫生统计学教研室上海200433

目的比较处理多组资料数据时三种倾向性评分加权方法在不同样本量的条件下均衡协变量的能力和估计处理效应的优劣。方法采用Monte Carlo模拟的方法生成数据集,比较三种倾向性评分加权方法Logistic-IPTW、Logistic-OW和GBM-OW法均衡协... 详细信息

目的比较处理多组资料数据时三种倾向性评分加权方法在不同样本量的条件下均衡协变量的能力和估计处理效应的优劣。方法采用Monte Carlo模拟的方法生成数据集,比较三种倾向性评分加权方法Logistic-IPTW、Logistic-OW和GBM-OW法均衡协变量和估计处理效应的优劣。协变量均衡水平指标为绝对标准均值差。处理效应评价指标包括处理效应的点估计值、均方根误差、可信区间覆盖率。结果在5种协变量与处理因素、结局变量有不同复杂程度的相关关系的场景下,相比于Logistic-IPTW法和Logistic-OW法,GBMOW法在效应估计方面更优,同时拥有更小的均方根误差;在协变量均衡性方面,三种方法效果都比较好,GBMOW方法在多组资料倾向性评分分布重叠度较低,且在协变量与分组变量、结局变量有越来越复杂的非线性关系时表现变好。结论在处理多组资料时,GBM-OW法相对另外两种方法,在协变量与分组变量、结局变量之间存在非线性或(和)交互关系时具有优势。运用此方法后效应估计更加接近真实值,为较优的选择。

关键词：倾向性评分加权法重叠加权多组资料广义增强模型逆概率加权

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多阅片者多病例设计在人工智能辅助阅片影像诊断试验评价中的应用

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海军军医大学学报 2025年第4期46卷 504-510页

作者：宛慧琴向蔓潘喆敏秦婴逸何倩贺佳同济大学医学院上海200092 海军军医大学(第二军医大学)卫生勤务学系军队卫生统计学教研室上海200433

目的使用多阅片者多病例(MRMC)设计评价人工智能(AI)辅助阅片影像诊断试验的临床效能,以期为影像诊断试验的临床评价提供科学依据。方法采用影像诊断试验中广泛应用的MRMC设计,详细阐述了MRMC设计中Obuchowski-Rockette(OR)法的模型构... 详细信息

目的使用多阅片者多病例(MRMC)设计评价人工智能(AI)辅助阅片影像诊断试验的临床效能,以期为影像诊断试验的临床评价提供科学依据。方法采用影像诊断试验中广泛应用的MRMC设计,详细阐述了MRMC设计中Obuchowski-Rockette(OR)法的模型构建及其检验方法。实例研究共收集了3家医院200例受试者的CT影像资料,其中133例为肋骨骨折患者,68例为非肋骨骨折患者,由3位阅片医师对所有CT影像进行判读。分析在2种阅片方式(医师+AI辅助阅片、医师独立阅片)下肋骨骨折检出的AUC值、灵敏度和特异度的差异。结果AI辅助阅片组的AUC值为0.958,医师独立阅片组的AUC值为0.902,两组AUC值差异有统计学意义(P<0.001)。AI辅助阅片组总体的灵敏度为0.970,特异度为0.946;医师独立阅片组的灵敏度为0.838,特异度为0.966;两组灵敏度差值为0.131(95%CI 0.091~0.171),特异度差值为-0.020(95%CI-0.059~0.020),说明AI辅助阅片与医师独立阅片的灵敏度差异有统计学意义而特异度差异无统计学意义。两组的阳性似然比均大于10,阴性似然比均小于0.2,阳性预测值都接近1,说明AI辅助阅片影像诊断试验的诊断准确性高。结论AI辅助阅片在提高诊断效能方面有显著优势,不仅可以提高肋骨骨折诊断的准确性和检出率,还能提高医师工作效率,优化医院服务。

关键词：人工智能多阅片者多病例设计 Obuchowski-Rockette法肋骨骨折诊断准确性

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基于贝叶斯网络的随机森林优化填补算法

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海军军医大学学报 2025年第2期46卷 253-257页

作者：董鑫宇陈琪杨志宇贺佳同济大学医学院上海200092 海军军医大学(第二军医大学)卫生勤务学系军队卫生统计学教研室上海200433

目的评估并改进缺失数据处理方法,提升二分类结局预测模型性能。方法模拟数据缺失场景,通过预测模型的ROC AUC及均方根误差(RMSE)共同评估直接剔除、均值填补、随机森林填补、多重填补对预测模型性能的影响,并将贝叶斯网络引入随机森林... 详细信息

目的评估并改进缺失数据处理方法,提升二分类结局预测模型性能。方法模拟数据缺失场景,通过预测模型的ROC AUC及均方根误差(RMSE)共同评估直接剔除、均值填补、随机森林填补、多重填补对预测模型性能的影响,并将贝叶斯网络引入随机森林填补算法,利用变量间相关性进行填补方法的优化。结果不同缺失占比下,通过AUC及RMSE均可得出贝叶斯网络优化随机森林填补算法效果最佳。此外,在缺失占比为10%~20%时,各种填补方法对预测模型的性能提升效果大体相同;当缺失占比为30%~40%时,相较于均值填补,除贝叶斯网络优化随机森林填补算法外,随机森林填补更好,其效果略优于多重填补;当缺失占比接近50%时,即使模型性能依旧较好,但填补数据逐渐偏离真实数据特征,模型的可用性下降。结论贝叶斯网络优化随机森林填补算法总体效果较好,当随机缺失占比30%~40%时可优先考虑。

关键词：预测模型缺失填补随机森林贝叶斯网络

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SDAEC算法在单细胞测序数据批次校正中的应用

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中国卫生统计 2024年第4期41卷 501-506页

作者：王文杰李康谢宏宇哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081 浙江大学医学院附属妇产科医院临床研究中心

目的提出深度堆叠降噪自编码嵌套聚类(stacked denoising auto encoder embedded cluster, SDAEC)算法并用于单细胞mRNA测序(single cell mRNA sequence, scRNA-seq)数据的批次效应移除,对其移除批次效应性能进行评估。方法基于单细... 详细信息

目的提出深度堆叠降噪自编码嵌套聚类(stacked denoising auto encoder embedded cluster, SDAEC)算法并用于单细胞mRNA测序(single cell mRNA sequence, scRNA-seq)数据的批次效应移除,对其移除批次效应性能进行评估。方法基于单细胞数据具有高维度、高稀疏性及高度非线性误差特点,通过将单细胞Louvain聚类算法嵌入堆叠降噪自动编码器(stacked denoising auto encoder, SDAE)算法中,形成SDAEC算法,用于单细胞测序数据的批次效应移除。结合实际卵巢癌组织scRNA-seq数据,利用分布邻域嵌入(t-distributed stochastic neighbor embedding, tSNE)、 k最近邻批次效应检测(k-nearest-neighbor batch-effect test, kBET)、调整兰德系数(adjusted rand index, ARI)、标准化互信息(normalized mutual information, NMI)、平均轮廓宽度(average silhouette width, ASW)评价其移除批次效应性能。结果利用SDAEC方法对scRNA-seq数据批次效应移除性能高于Combat、相互最近邻(mutual nearest neighbors, MNN)、分布匹配残差网络(maximum mean discrepancy distribution-matching residual networks, MMD-ResNet)和基于零膨胀负二项的方差提取法(zero-inflated negative binomial-based wanted variation extraction, ZINB-WaVE)。结论 SDAEC算法能够移除scRNA-seq数据的批次效应,提高scRNA-seq数据下游分析的有效性,具有实际应用价值。

关键词：深度堆叠降噪自编码嵌套聚类单细胞测序批次效应卵巢癌

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单细胞RNA测序数据批次效应校正方法

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中国卫生统计 2023年第1期40卷 153-156页

作者：王文杰李康谢宏宇哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150086 浙江大学医学院附属妇产科医院

传统的“bulk”RNA测序通过测量一个细胞群中基因的平均表达水平来描述一个组织的整体状态,掩盖了单个细胞的信号及组织内细胞异质性。单细胞RNA测序(single-cell RNA-sequencing,scRNA-seq)是近年来新兴的检测技术,通过单个细胞的转录... 详细信息

传统的“bulk”RNA测序通过测量一个细胞群中基因的平均表达水平来描述一个组织的整体状态,掩盖了单个细胞的信号及组织内细胞异质性。单细胞RNA测序(single-cell RNA-sequencing,scRNA-seq)是近年来新兴的检测技术,通过单个细胞的转录图谱分析其分子状态[1],在描绘细胞微环境,阐述相关生物学机制,识别新的治疗靶点等方面取得了前所未有的进展[2]。scRNA-seq数据通常由多批次实验数据整合而成,批次效应主要来源于实验数据的获取时间、操作人员、试剂批次、设备及检测技术平台等方面。批次效应可能是高度非线性的,它的存在使得下游分析复杂化,结果难以解释。因此,有效地移除scRNA-seq数据批次效应至关重要。

关键词：批次效应分子状态生物学机制细胞微环境数据整合细胞群校正方法整体状态

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中国骨科临床实践指南及共识的质量评价

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中国循证医学杂志 2024年第7期24卷 832-837页

作者：樊子娟李帝均闫磊邢丹周奇王斌山西医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室太原030001 山西医科大学第二医院骨科太原030001 北京大学人民医院骨关节疾病诊疗中心北京100044 兰州大学基础医学院循证医学中心兰州730000 STAR秘书处兰州730000 浙江大学医学院附属第一医院骨科杭州310006

目的了解近年我国骨科已发表的指南与共识的评级现状,帮助使用者遴选临床指南和共识,指导临床实践,并推动我国骨科指南和共识质量的针对性提升。方法计算机检索CNKI、WanFang Data、SinoMed数据库,搜集相关的中国骨科临床实践指南与共识... 详细信息

目的了解近年我国骨科已发表的指南与共识的评级现状,帮助使用者遴选临床指南和共识,指导临床实践,并推动我国骨科指南和共识质量的针对性提升。方法计算机检索CNKI、WanFang Data、SinoMed数据库,搜集相关的中国骨科临床实践指南与共识,检索时限为2016年1月至2023年10月。由2位评价员独立筛选文献、提取资料后,采用指南科学性、透明性和适用性的评级工具(scientific,transparent and applicable rankings,STAR)对2016年后在中国医学期刊发表的中国骨科指南和共识进行了综合评级。若两位评价员存在争议,则由第三位评价员裁定。采用Kappa值评估两位评价员的结果一致性。结果共获得191篇骨科相关指南和共识,其中指南74篇,共识117篇。纳入评价的指南平均得分为34.4分,共识平均得分为21.7分。纳入指南在注册、计划书、工作组、临床问题、证据、共识方法、推荐意见、可及性及其他领域得分均高于共识。Kappa值检验结果为0.684。结论近年来国内已发表的骨科临床实践指南与共识虽然方法学评分逐年增加,但是总体质量有待进步。未来的指南需要在资助透明、推荐意见形成、指南发布与传播方面进一步提高。

关键词：骨科临床实践指南专家共识指南评价

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Leptin循环水平与结直肠腺瘤及结直肠癌的关联性:一项病例对照和孟德尔随机化研究

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南方医科大学学报 2023年第12期43卷 1989-1997页

作者：赵欢灵凌羽晓宓帅朱家豪范佳耀杨叶王晶李迎君杭州医学院公共卫生系流行病与卫生统计学教研室浙江杭州310053 宁波大学医学院公共卫生学院浙江宁波315211 德清县莫干山镇卫生院浙江德清313200 浙江大学医学院公共卫生学院大数据健康科学系浙江杭州310058

目的探究Leptin循环水平与结直肠腺瘤及结直肠癌发生风险的关联,为结直肠腺瘤及结直肠癌的防治提供依据。方法以浙江大学医学院附属第一医院、浙江省肿瘤医院、浙江省诸暨市人民医院及杭州市临安区第一人民医院为研究现场,共收集结直肠... 详细信息

目的探究Leptin循环水平与结直肠腺瘤及结直肠癌发生风险的关联,为结直肠腺瘤及结直肠癌的防治提供依据。方法以浙江大学医学院附属第一医院、浙江省肿瘤医院、浙江省诸暨市人民医院及杭州市临安区第一人民医院为研究现场,共收集结直肠腺瘤患者497例,结直肠癌患者955例,健康对照911例。通过问卷收集研究对象的基本信息,并采集血液样本和提取DNA,选取Leptin的工具变量并进行基因分型检测。采用Logistic回归模型并进行分层分析,评估血清Leptin水平与结直肠腺瘤,结直肠癌以及结直肠腺瘤进展为结直肠癌的关联。进一步将遗传风险评分(GRS)和单核苷酸多态性(SNPs)作为工具变量,采用两阶段最小二乘法和逆方差加权法进行单样本和两样本孟德尔随机化分析,来评估Leptin循环水平与结直肠腺瘤,结直肠癌及结直肠腺瘤进展为结直肠癌风险之间潜在的因果关联。结果病例对照研究结果显示,与最低四分数的Leptin水平相比,高水平的Leptin与结直肠腺瘤呈正相关(OR=1.63,95%CI:1.16~2.30,P=0.005),高水平的Leptin与结直肠癌呈负相关(OR=0.53,95%CI:0.38~0.74,P<0.001),高水平的Leptin也与结直肠腺瘤患者进展为结直肠癌的风险呈负相关(OR=0.44,95%CI:0.29~0.66,P<0.001)。而孟德尔随机化分析结果显示,Leptin的GRS无论是否加权,均与结直肠腺瘤,结直肠癌以及结直肠腺瘤进展为结直肠癌的风险无统计学关联。两样本孟德尔随机化研究也未发现Leptin与结直肠癌风险之间的关联(P>0.05)。结论病例对照研究结果提示Leptin可能与结直肠腺瘤,结直肠癌及结直肠腺瘤进展为结直肠癌的风险存在关联,但孟德尔随机化研究尚不支持Leptin与结直肠腺瘤,结直肠癌及结直肠腺瘤进展为结直肠癌风险之间存在因果关联。

关键词： Leptin 结直肠腺瘤结直肠癌孟德尔随机化

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