检索结果-内蒙古大学图书馆

中国农业科学 2017年第23期50卷 4644-4655页

作者：王文龙冯陈晨红梅岳建伟呼和巴特尔刘春霞内蒙古农业大学兽医学院/农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室内蒙古农业大学生命科学学院

【目的】探明不同发育阶段骆驼斯氏副柔线虫的转录组差异,了解不同发育阶段虫体在功能分类和代谢通路等方面的生物学特征,挖掘生长发育相关功能基因,丰富寄生性线虫转录组学信息。【方法】采用Illumina Hi Seq2000TM高通量测序技术对斯... 详细信息

【目的】探明不同发育阶段骆驼斯氏副柔线虫的转录组差异,了解不同发育阶段虫体在功能分类和代谢通路等方面的生物学特征,挖掘生长发育相关功能基因,丰富寄生性线虫转录组学信息。【方法】采用Illumina Hi Seq2000TM高通量测序技术对斯氏副柔线虫虫卵、第三期幼虫和雌虫进行转录组测序,构建3个样本的c DNA文库,评估建库质量;利用Trinity软件对所得序列进行De novo组装及组装效率评估;之后对获得的有效序列进行功能注释及相关生物信息学分析。【结果】测序及组装后虫卵、第三期幼虫和雌虫分别获得47 717、76 342和54 624个Unigenes,在虫卵和第三期幼虫比对中共有33 579个差异表达基因,其中表达上调的基因有20 477个,表达下调的基因有13 102个;在雌虫和第三期幼虫比对中共有32 199个差异表达基因,其中表达上调的基因有9 293个,表达下调的基因有22 906个。将成对比较的差异表达基因分别进行GO功能分类,其中虫卵和第三期幼虫比对中有6 617、3 891和8 755个Unigenes,雌虫和第三期幼虫比对中有7 043、3 686和10 177个Unigenes分别注释到生物过程、细胞组成和分子功能三大类中;通过KEGG pathway数据库分析,虫卵和第三期幼虫比对中有6 521个差异表达基因参与到251条通路中,显著富集MAPK信号通路、Wnt信号通路和氧化磷酸化等通路,雌虫和第三期幼虫比对中有6 528个参与到251条通路中,显著富集新陈代谢通路、DNA复制和细胞周期等通路。差异表达基因功能聚类分析中,雌虫和虫卵在调控生长速率和生殖发育等方面高表达;第三期幼虫在防御机制和糖类代谢等方面高表达;且3个发育阶段均在胚胎发育,胚后发育中富集高表达,其中在胚胎发育和胚后发育中分别有242和202个相关功能基因在3个发育阶段都表达,这些基因可能在胚胎(后)发育过程中起核心作用。此外,获得了9种异时性基因(如:LIN-28、LIN-14和RHEB-1等)、48个核激素受体(NHRs),包括NHR-49,NHR-48,NHR-40,NHR-1等以及36个锌金属蛋白酶(NAS),包括NAS-36、NAS-33和NAS-14等,并对其在斯氏副柔线虫虫卵、第三期幼虫和雌虫中的富集程度进行分析,发现这些基因在维持线虫正常生长发育过程中发挥关键作用,【结论】利用RNA-seq技术对3个发育阶段的斯氏副柔线虫进行测序和生物信息学分析,研究了不同发育阶段虫体的差异表达基因在GO功能分类、KEGG代谢通路和基因功能聚类等方面的生物学特性,筛选出多种异时性基因和发育相关重要基因,为后续开展斯氏副柔线虫功能基因组学研究,虫体与宿主互作、致病机制、免疫逃避等研究提供了理论依据。

关键词：斯氏副柔线虫转录组差异表达基因发育相关基因

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阿拉善双峰驼MSTN基因序列生物信息学分析

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黑龙江畜牧兽医 2018年第1期 41-46,248-250页

作者：杨惠额尔敦木图姜建强刘图雅戴钦阿拉腾呼依嘎白龙内蒙古农业大学兽医学院农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室内蒙古阿拉善左旗农牧业局兽医局内蒙古阿拉善经济开发区农牧业服务中心内蒙古阿拉善左旗巴润别立动物卫生监督站内蒙古鄂托克旗蒙西镇农牧业执法队

为了研究阿拉善双峰驼肌肉生长抑制素(MSTN)基因,进一步探讨阿拉善双峰驼MSTN基因的结构及功能,试验采用5对引物对阿拉善双峰驼MSTN基因进行PCR扩增,所得产物进行序列拼接,利用生物信息学方法对阿拉善双峰驼MSTN基因的结构、理化性质及... 详细信息

为了研究阿拉善双峰驼肌肉生长抑制素(MSTN)基因,进一步探讨阿拉善双峰驼MSTN基因的结构及功能,试验采用5对引物对阿拉善双峰驼MSTN基因进行PCR扩增,所得产物进行序列拼接,利用生物信息学方法对阿拉善双峰驼MSTN基因的结构、理化性质及其编码蛋白信号肽、跨膜位置、亚细胞定位等进行分析,并讨论了阿拉善双峰驼与其他物种MSTN氨基酸序列的进化关系。结果表明:阿拉善双峰驼MSTN基因长7.3 kb,1~581 bp为第一外显子区,2 384~2 757 bp为第二外显子区,4 800~6 737 bp为第三外显子区。阿拉善双峰驼MSTN蛋白属于疏水性不稳定蛋白,18~19位氨基酸是最有可能的剪切位点,作为信号肽的可能性很大;二级结构中α-螺旋占22.40%,延伸链占26.67%,β-转角占7.73%,无规则卷曲占43.20%;阿拉善双峰驼MSTN蛋白有1个跨膜结构区域,其功能域可能位于278~375位氨基酸处。阿拉善双峰驼MSTN基因与哺乳类及灵长类动物的亲缘关系较近,与猪的亲缘关系最近(相似性高达99.2%)。说明阿拉善双峰驼MSTN基因编码的蛋白符合一般TGF-β超家族的结构特征,并符合已知MSTN蛋白的结构特征,与猪、灵长类及反刍类动物的分子进化距离较近。

关键词：阿拉善双峰驼肌肉生长抑制素(MSTN) 基因序列蛋白质生物信息学

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骆驼福斯盘尾丝虫病组织病理学观察

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中国农业大学学报 2017年第1期22卷 62-67页

作者：于志超罗晓平张伟李军燕王瑞杨莲茹杨晓野内蒙古农业大学兽医学院/农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室呼和浩特010018

为更有效地对骆驼盘尾丝虫病进行防治,利用流行病学调查和常规病理学观察的方法,对骆驼盘尾丝虫病进行研究。结果表明:内蒙古阿拉善左旗骆驼盘尾丝虫病平均感染率为85.4%,感染强度为1~15峰-1,虫体形成的结节分布在骆驼的颈项韧带处;共... 详细信息

为更有效地对骆驼盘尾丝虫病进行防治,利用流行病学调查和常规病理学观察的方法,对骆驼盘尾丝虫病进行研究。结果表明:内蒙古阿拉善左旗骆驼盘尾丝虫病平均感染率为85.4%,感染强度为1~15峰-1,虫体形成的结节分布在骆驼的颈项韧带处;共收集到209个结节,它们的形态和质地各不相同,软的结节内形成纤维组织囊腔,硬的结节内形成钙化灶;骆驼年龄段不同,结节的分布呈不同变化;病理组织学观察显示,囊腔周围有各种炎性细胞侵润,囊腔内有不同状态的雌虫虫体,骆驼盘尾丝虫病表现为骆驼的寄生虫性肉芽肿。

关键词：福斯盘尾丝虫骆驼流行病学调查病理组织学观察

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梅花鹿体内脑肠肽的表达及细胞定位分析

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畜牧兽医学报 2017年第1期48卷 157-165页

作者：刘骄张曼金鑫范燕茹田巧珍杨银凤内蒙古农业大学兽医学院农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室呼和浩特010018

为了明确脑肠肽Ghrelin(又名胃饥饿素)在梅花鹿体内的表达及定位,采用反转录-聚合酶链式反应(RTPCR)、实时荧光定量PCR(RT-qPCR)和免疫组织化学技术检测了梅花鹿食管、瘤胃、网胃、瓣胃、皱胃、十二指肠、空肠、回肠、盲肠、结肠、肝、... 详细信息

为了明确脑肠肽Ghrelin(又名胃饥饿素)在梅花鹿体内的表达及定位,采用反转录-聚合酶链式反应(RTPCR)、实时荧光定量PCR(RT-qPCR)和免疫组织化学技术检测了梅花鹿食管、瘤胃、网胃、瓣胃、皱胃、十二指肠、空肠、回肠、盲肠、结肠、肝、胰、甲状腺、垂体前叶、肺、肾、脾及卵巢等器官中Ghrelin mRNA的相对表达量和Ghrelin蛋白的定位分布情况。RT-qPCR结果显示:Ghrelin mRNA在上述器官中均有表达,其中皱胃内的表达量显著高于其他器官(P<0.05);免疫组织化学染色结果表明Ghrelin蛋白在这些器官中均有表达,在消化管内的分布最为广泛。梅花鹿体内Ghrelin mRNA和Ghrelin蛋白的特定表达模式,揭示这一新型分子在梅花鹿的生长发育过程中可能存有广泛的生物学作用,尤其在胃肠道功能方面可能作为一种重要的调节方式而存在。

关键词：梅花鹿 Ghrelin RT-qPCR RT-PCR 免疫组织化学

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捕食性真菌Duddingtonia flagrans原生质体获得与再生的荧光标记评价

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菌物学报 2017年第3期36卷 302-310页

作者：张伟杨晓野王瑞祝晓蕊王新芳梁萌内蒙古农业大学兽医学院农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室内蒙古呼和浩特010018

为了更准确快捷地评价利用酶解法酶解捕食性真菌Duddingtonia flagrans菌丝产生的原生质体数量及菌丝细胞壁降解情况,采用活体荧光染料羧基荧光素乙酰乙酸(carboxyfluorescein diacetate succinimidyl ester,CFSE),对该捕食性真菌菌丝... 详细信息

为了更准确快捷地评价利用酶解法酶解捕食性真菌Duddingtonia flagrans菌丝产生的原生质体数量及菌丝细胞壁降解情况,采用活体荧光染料羧基荧光素乙酰乙酸(carboxyfluorescein diacetate succinimidyl ester,CFSE),对该捕食性真菌菌丝酶解后产生的原生质体进行荧光标记,分别考察了标记浓度、标记时间、孵育温度对原生质体标记效果的影响,并观察CFSE标记后的原生质体再生情况。结果表明CFSE终浓度为10μmol/L,标记时间为15min,孵育温度为36℃,是CFSE标记捕食性真菌原生质体的理想条件,该试验同时表明CFSE不影响原生质体的再生率。CFSE作为一种活细胞示踪荧光探针,可以快速高效地标记捕食性真菌原生质体,该方法为捕食性真菌原生质体制备质量的快速评价提供了新的思路。

关键词：羧基荧光素乙酰乙酸(CFSE) 荧光标记标记浓度标记时间孵育温度原生质体再生

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利用套式PCR法检测内蒙古部分地区奶牛隐孢子虫感染情况及其虫种鉴定

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黑龙江畜牧兽医 2018年第16期 92-96页

作者：尹相吉聂福贵郭少平钱英红陈湘江徐跃峰王新芳郭宏年梁萌王文蕊杨晓野王瑞内蒙古农业大学兽医学院/农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室呼和浩特010018 内蒙古阿拉善盟畜牧兽医工作站内蒙古阿拉善750306 内蒙古自治区农牧业科学院呼和浩特010031 诸城市畜牧兽医管理局山东诸城262200

为了调查内蒙古部分地区规模化牛场奶牛隐孢子虫的感染情况及其虫种类型,试验在4个牛场采集了295份奶牛的粪样,从粪便样品中直接提取DNA进行套式PCR法检测,之后将其目的片段克隆至p GM-T载体上进行测序和同源性分析以鉴定虫种。结果表... 详细信息

为了调查内蒙古部分地区规模化牛场奶牛隐孢子虫的感染情况及其虫种类型,试验在4个牛场采集了295份奶牛的粪样,从粪便样品中直接提取DNA进行套式PCR法检测,之后将其目的片段克隆至p GM-T载体上进行测序和同源性分析以鉴定虫种。结果表明：可通过套式PCR法从阳性粪便的DNA抽提物中扩增出目的条带,大小分别为800 bp和505 bp;对测得的序列和NCBI上已发表的安氏隐孢子虫（***）18S rRNA基因序列进行BLAST比对分析,相似度为100%;采集样品的阳性率为14.9%（44/295）。说明套式PCR法可用于检测奶牛粪便样品中的隐孢子虫,且在一定程度上能够很好地反映出奶牛隐孢子虫的感染情况,并能有效鉴别其虫种。

关键词：隐孢子虫套式PCR 奶牛粪便内蒙古同源性分析 18S rRNA基因

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捕食性真菌Duddingtoniaflagrans捕食马圆线虫幼虫动态观察

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动物医学进展 2018年第10期39卷 122-125页

作者：李军燕罗宏亮王瑞杨莲茹赵治国张伟李斌杨晓野罗晓平内蒙古农业大学兽医学院/农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室内蒙古呼和浩特010018 内蒙古自治区农牧业科学院兽医研究所呼和浩特010031 金宇保灵生物药品有限公司内蒙古呼和浩特010020 内蒙古出入境检验检疫局内蒙古呼和浩特010020 新疆农业大学新疆乌鲁木齐830052

为探讨捕食性真菌Duddingtonia flagrans在捕食线虫的过程中产生的细微变化,如捕食器的形成过程,捕获虫体前后的变化等,利用线虫三期幼虫作为诱导物,在玻片培养基中刺激捕食性真菌产生捕食器,然后对其捕食线虫过程进行了适时动态的观察... 详细信息

为探讨捕食性真菌Duddingtonia flagrans在捕食线虫的过程中产生的细微变化,如捕食器的形成过程,捕获虫体前后的变化等,利用线虫三期幼虫作为诱导物,在玻片培养基中刺激捕食性真菌产生捕食器,然后对其捕食线虫过程进行了适时动态的观察。结果显示,接种有较强活力的线虫三期幼虫2h后捕食器,即菌环开始形成,而后联合形成菌网;4h后虫体被捕食器捕获,24h后线虫即被完全致死;5d后,虫体发生皱缩直至完全消解。***还可以自发产生捕食器(菌环),显示了其较强的捕食线虫的效率和能力。本研究为阐明捕食性真菌捕食机制提供了重要的参考依据。

关键词：捕食线虫真菌 Duddingtoniaflagrans 马圆线虫3期幼虫生物防治捕食器

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内蒙古部分地区放牧牛羊弓形虫血清学调查

内蒙古部分地区放牧牛羊弓形虫血清学调查

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第十一届全国寄生虫学青年工作者学术研讨会

作者：方变变罗晓平李军燕王鹏龙乌云塔娜萨日娜耿万恒高海英内蒙古自治区农牧业科学院内蒙古农业大学兽医学院农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室

目的:弓形虫(Toxopiasma gondii)是一种人畜共患病原体,可寄生于包括人在内的哺乳动物、鸟类等200多种宿主体内。目前世界各地均有该病报道,国内调查结果显示:2003年,青海省羊弓形虫阳性率为7.78%,牛为12.67%;2010年,内蒙古地区放牧绵... 详细信息

目的:弓形虫(Toxopiasma gondii)是一种人畜共患病原体,可寄生于包括人在内的哺乳动物、鸟类等200多种宿主体内。目前世界各地均有该病报道,国内调查结果显示:2003年,青海省羊弓形虫阳性率为7.78%,牛为12.67%;2010年,内蒙古地区放牧绵羊弓形虫血清阳性率为10.6%;2014年,内蒙古地区放牧绵羊弓形虫血清阳性率为13.3%,牛血清阳性率为0%;2018年,延边地区的牛弓形虫感染率为10.69%。由于该病在全世界引起了巨大的公共卫生负担,每年约有20万例先天性弓形虫病儿出生。为此,本研究拟调查了内蒙古主要牧区放牧牛羊弓形虫的感染情况,为后续研究及防控措施的构建提供依据。方法:从内蒙古自治区呼伦贝尔市新巴尔虎右旗及阿拉善盟左旗的15个不同羊场随机采集牛羊血液样品共286份。5000r/min,15min离心,取上清液于1.5m L灭菌离心管中。采用间接血凝试验(IHA)检测弓形虫阳性率。其中,阳性血清效价不低于1:1024,阴性血清第一孔允许有前置现象"+"外,其余各孔均为"-"。在稀释液为"-"的前提下,对待检血清进行判定,否则重做。待检血清效价达到或超过1:64判为阳性,"++"为阳性终点。结果:在检测的238份(阿拉善68份,呼伦贝尔176份)绵羊血清中,检出阳性样品4个,总阳性率为1.68%。其中,阿拉善盟阳性率为4.84%,呼伦贝尔阳性率为1.12%。统计分析结果表明,两地间弓形虫感染率差异显著(P<0.05)。在检测的48份牛血清中,未检测到阳性样品,样本阳性率为0%。结论:调查结果显示,内蒙古牧区羊弓形虫感染率高于牛,较牛而言,羊对弓形虫感染较敏感。且位于内蒙古东北角的呼伦贝尔市新巴尔虎右旗羊感染率低于地处内蒙古西南角的阿拉善左旗。究其原因,可能与内蒙古阿拉善盟左旗距内地城市较近有关。为此,内蒙古作为畜牧业大省,应加强该病的监测,进而评估该病在畜间传播风险,为公共卫生安全提供保障。

关键词：牛羊弓形虫病流行病学调查

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常用驱虫药物对内蒙古农牧区羊胃肠道线虫驱虫效果研究

常用驱虫药物对内蒙古农牧区羊胃肠道线虫驱虫效果研究

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第十一届全国寄生虫学青年工作者学术研讨会

作者：罗晓平李军燕方变变王鹏龙乌云塔娜耿万恒高海英冯新港杨晓野内蒙古自治区农牧业科学院内蒙古农业大学兽医学院农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室

目的:羊胃肠道线虫病是由寄生于羊胃肠道中的多种线虫引起的一类重要寄生虫病,其在羊疫病中占有相当重要的地位。特点通常表现为感染率高、感染强度大、分布流行范围广,造成的经济损失大。在羊胃肠道线虫病防治方面,由于疫苗的缺失,目... 详细信息

目的:羊胃肠道线虫病是由寄生于羊胃肠道中的多种线虫引起的一类重要寄生虫病,其在羊疫病中占有相当重要的地位。特点通常表现为感染率高、感染强度大、分布流行范围广,造成的经济损失大。在羊胃肠道线虫病防治方面,由于疫苗的缺失,目前仍以药物驱虫为主,但随着驱虫药无节制的使用,胃肠道线虫耐药性也不断加剧。如何合理用药以减缓线虫耐药性产生的速度成为亟需解决的问题,而合理用药的前提便是线虫耐药性的检测及敏感药物的筛选。本研究以内蒙古农区和牧区放牧或半舍饲且感染有胃肠道线虫的绵羊为研究对象,以粪便虫卵减少试验为检测方法,以用药组粪便虫卵减少率和95%置信域下限为评价指标,探查内蒙古绵羊胃肠道线虫对常用驱虫药的耐药性,同时筛选适用于本地区的敏感高效驱虫药物,为兽医临床用药提供依据。方法:分别在内蒙古农区、牧区选择绵羊数在200～500之间,5个月内未使用任何药物驱虫的羊群牧场8个,随机选取100只2岁羊只进行直肠粪便采集,同时逐只打耳标进行标记。对粪便虫卵计数在100个/克以上的羊只,按EPG从大到小排队,蛇形分为4组,包括用药组(氯氰碘柳胺钠组、丙硫咪唑组、伊维菌素组)和对照组。参照世界兽医寄生虫学促进协会(WAAVP)关于蠕虫抗药性检测方法中的粪便虫卵减少试验进行分析,并做了适当的改进。结果:使用丙硫咪唑驱虫的5个牧场中,来自牧区的3个牧场的羊胃肠道线虫均对其产生了耐药性,而来自农区的2个牧场中,1个的虫体对其敏感,另有一个对其疑似耐药;在使用氯氰碘柳胺钠驱虫的5个牧场中,牧区有1个牧场羊胃肠道线虫存在氯氰碘柳胺钠疑似耐药,另外4个来自农区和牧区的牧场的虫体均对该药敏感;而使用伊维菌素的8个牧场中,全部牧场的羊胃肠道线虫均对其产生耐药性。结论:对于内蒙古农区和牧区的放牧绵羊而言,其胃肠道线虫对伊维菌素均产生了耐药性,而对丙硫咪唑和氯氰碘柳胺钠来说,两者在农区的驱虫效果相当,而在牧区,胃肠道线虫对氯氰碘柳胺钠敏感或疑似耐药,而对丙硫咪唑则产生很强的耐药性。究其原因,主要是牧区驱虫时春季以伊维菌素为主,秋季以丙硫咪唑为主,平时则随机用药,而农区则主要使用伊维菌素驱虫,偶尔使用丙硫咪唑。为此,目前,内蒙古地区羊胃肠道线虫驱虫时,应选用除伊维菌素以外的驱虫药物,如丙硫咪唑、氯氰碘柳胺钠、碘硝酚等,而且,在内蒙古地区羊胃肠道线虫耐药性不断加剧的情况下,需经常监测羊胃肠道线虫对驱虫药物的耐药性变化,适时更换药物。

关键词：羊胃肠道线虫耐药性

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马鹿β-防御素-1cDNA全长克隆、序列信息及表达分析

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畜牧兽医学报 2017年第2期48卷 225-234页

作者：田巧珍金鑫张曼蔡硕刘骄王云鹤杨银凤内蒙古农业大学兽医学院呼和浩特010018 农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室呼和浩特010018

为了研究马鹿β-防御素-1(Red deerβ-defensin-1,redBD-1)基因的结构与功能,揭示该基因的组织表达规律。本研究利用PCR结合RACE(Rapid-amplification of cDNA ends)技术从马鹿舌黏膜中克隆redBD-1基因的cDNA全长序列并对其进行了生物... 详细信息

为了研究马鹿β-防御素-1(Red deerβ-defensin-1,redBD-1)基因的结构与功能,揭示该基因的组织表达规律。本研究利用PCR结合RACE(Rapid-amplification of cDNA ends)技术从马鹿舌黏膜中克隆redBD-1基因的cDNA全长序列并对其进行了生物信息学分析,同时采用Real-time quantitative PCR(RT-qPCR)技术检测该基因在各组织的表达情况。结果表明,redBD-1基因的cDNA全长序列为455bp,开放阅读框(ORF)为192bp,编码64个氨基酸。生物信息学分析表明,redBD-1蛋白的理论分子量为6.94ku,有10个带正电荷的氨基酸残基,无带负电荷的氨基酸残基,理论等电点为10.85。预测redBD-1蛋白有一个分泌信号肽结构,无跨膜区,主要在细胞外发挥生理功能;6个保守的半胱氨酸残基分别以Cys1-Cys5、Cys2-Cys4和Cys3-Cys6连接形成3个分子内二硫键;成熟蛋白的三级结构是由β-折叠、延伸和无规则卷曲构成。redBD-1基因编码的氨基酸序列同源性最高的是梅花鹿β-防御素(siBD-1)为98.4%,其次是水牛肠β-防御素(BEBD)为92.2%,与人β-防御素-2(HBD-2)同源性最低仅为35.9%。RT-qPCR结果得出,redBD-1在被检器官中均有表达,在消化系统、呼吸系统以及生殖系统的大部分器官表达量较高,肝、肾和脾等实质性器官表达量相对较低。本试验为今后深入研究防御素基因功能以及马鹿黏膜免疫系统提供理论依据。

关键词：马鹿β-防御素-1 RACE 基因克隆序列分析定量表达

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