检索结果-内蒙古大学图书馆

中国畜牧兽医 2022年第1期49卷 1-11页

作者：刘在霞段仕孙燕勇吕琦付绍印何小龙张文广刘永斌内蒙古农业大学动物科学学院内蒙古自治区动物遗传育种与繁殖重点实验室呼和浩特010018 内蒙古自治区农业基因组大数据工程研究中心呼和浩特010018 内蒙古自治区农牧业科学院呼和浩特010031 和田师范专科学校和田848000

【目的】整合分析多个绵羊睾丸转录组数据集,揭示绵羊睾丸差异基因及蛋白质互作网络关系,以期探索影响绵羊精子生成的关键基因,为绵羊的繁殖提供理论参考。【方法】对74个绵羊睾丸转录组进行生物信息学分析,通过limma软件包进行差异基... 详细信息

【目的】整合分析多个绵羊睾丸转录组数据集,揭示绵羊睾丸差异基因及蛋白质互作网络关系,以期探索影响绵羊精子生成的关键基因,为绵羊的繁殖提供理论参考。【方法】对74个绵羊睾丸转录组进行生物信息学分析,通过limma软件包进行差异基因分析,使用WGCNA构建加权绵羊睾丸差异基因共表达网络,并通过MCODE计算网络中重要基因;利用Metascape进行功能富集分析,利用Cytoscape插件AutoAnnotate识别基因集簇。【结果】最终筛选到11884个基因,构建237366对蛋白质互作关系;对2058个差异基因构建蛋白质互作网络,产生46169对蛋白质互作关系,确定了4个得分最高的基因集合。对2058个差异基因构建加权共表达网络,共获得7个模块,其中Blue模块内有929个基因,功能富集分析发现显著富集于雄性配子产生、繁殖、精子发生、鞭毛运动和AMPK信号通路等,且富集结果高度连接并聚成一个完整的网络,最终确定了25个参与精子发生和精子细胞发育过程的关键基因。【结论】本研究揭示了绵羊睾丸表达基因的蛋白质互作网络和多维差异基因的蛋白质互作网络,最终找到与睾丸精子发生相关且有互作关系的25个基因,为绵羊繁殖研究提供理论依据。

关键词：绵羊睾丸差异基因蛋白质互作网络关键基因集精子发生

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基于卷积神经网络的蒙古文字体风格迁移模型

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内蒙古农业大学学报（自然科学版） 2021年第5期42卷 94-99页

作者：李进高静陈俊杰王永军申志军内蒙古农业大学计算机与信息工程学院内蒙古自治区农牧业大数据研究与应用重点实验室呼和浩特010011

目前设计一套特定风格样式的蒙古文字体是一项十分繁琐的工作,需要依靠传统人工方式或者计算机辅助对每个蒙古文字体进行单独设计,既耗时又耗力,故一种能自动生成蒙古文字体风格的模型十分有必要。国内外已有学者开展了对汉字和英文字... 详细信息

目前设计一套特定风格样式的蒙古文字体是一项十分繁琐的工作,需要依靠传统人工方式或者计算机辅助对每个蒙古文字体进行单独设计,既耗时又耗力,故一种能自动生成蒙古文字体风格的模型十分有必要。国内外已有学者开展了对汉字和英文字体风格自动迁移的研究,但蒙古文领域仍处于空白阶段。因此,该文提出将卷积神经网络模型应用于蒙古文字体风格迁移,并给出了基于卷积神经网络的蒙古文字体风格自动迁移模型,实现了相应的算法和软件。在蒙古文字体数据集上进行实验,模型采用均方根优化器自动调节深度学习率,逐渐减少差异值,可直接从蒙古文标题字体生成蒙古文手写体等字体,得到的生成字体样式基本接近真实字体样式,达到字体风格迁移的效果。

关键词：蒙古文字体卷积神经网络风格迁移自动生成

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基于BP神经网络的空气质量等级预测模型构建

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内蒙古农业大学学报（自然科学版） 2023年第4期44卷 40-46页

作者：刘敏扈华内蒙古农业大学计算机与信息工程学院/内蒙古自治区农牧业大数据研究与应用重点实验室呼和浩特010011

精确预测呼和浩特市空气质量有助于相关部门把握该市空气质量情况并实施治理空气污染政策。首先,通过爬虫技术获取该市2013年—2021年PM_(2.5)、PM_(10)、SO_(2)、NO_(2)、CO、O_(3)共6种污染物浓度与空气质量等级标签的2700组真实数据... 详细信息

精确预测呼和浩特市空气质量有助于相关部门把握该市空气质量情况并实施治理空气污染政策。首先,通过爬虫技术获取该市2013年—2021年PM_(2.5)、PM_(10)、SO_(2)、NO_(2)、CO、O_(3)共6种污染物浓度与空气质量等级标签的2700组真实数据,各等级标签内按照7∶3的比例随机抽取训练集与测试集;其次,建立BP神经网络模型,设置输入层、隐含层和输出层的神经元数,确定SIGMOID与SOFTMAX为激活函数,基于反向传播算法输入训练集学习BP神经网络模型,评估模型在测试集上的性能;再次利用同样的训练集与测试集构建贝叶斯模型并验证其性能;最后,对比两种模型的预测精度。结果表明,BP神经网络模型Micro-F1值为90.247%,具有较高的预测准确率,可以为该市的空气质量等级预测提供一种合理有效的综合评价方法。

关键词：空气质量污染物 BP神经网络贝叶斯网络

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基于VSWI和TVDI差异的河套灌区沈乌灌域耕地灌溉面积遥感监测

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灌溉排水学报 2020年第8期39卷 129-135页

作者：田鑫李瑞平王思楠范雷雷于明辉内蒙古农业大学水利与土木建筑工程学院呼和浩特010018 威海市城市规划技术服务中心有限公司山东威海264200 内蒙古自治区农牧业大数据研究与应用重点实验室呼和浩特010018 威海市国土资源地理信息中心山东威海264200

【目的】尝试利用遥感数据实现对河套灌区沈乌灌域灌溉面积的提取,为沈乌灌域现代化管理提供理论依据。【方法】利用Landsat-8数据对研究区域的植被供水指数VSWI、温度干旱指数TVDI进行反演,根据实测数据,构建基于VSWI和TVDI差异的灌溉... 详细信息

【目的】尝试利用遥感数据实现对河套灌区沈乌灌域灌溉面积的提取,为沈乌灌域现代化管理提供理论依据。【方法】利用Landsat-8数据对研究区域的植被供水指数VSWI、温度干旱指数TVDI进行反演,根据实测数据,构建基于VSWI和TVDI差异的灌溉面积监测模型,对沈乌灌域的灌溉面积进行遥感提取。【结果】2种模型具有较高的一致性,基于VSWI和TVDI的灌溉面积监测模型反演精度分别为85.3%和89.7%。【结论】证明了2种监测模型的可行性,同时发现基于TVDI差异的灌溉面积监测模型精度高于基于VSWI差异的灌溉面积监测模型。

关键词：灌区管理灌溉面积遥感 VSWI TVDI

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盐和干旱胁迫对沙葱种子萌发的影响

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北方农业学报 2022年第6期50卷 10-16页

作者：魏鹏超曹镇宇杨忠仁张凤兰韩旭周岩内蒙古农业大学园艺与植物保护学院/内蒙古自治区野生特有蔬菜种质资源与种质创新重点实验室内蒙古呼和浩特010011 内蒙古自治区农牧业大数据研究与应用重点实验室内蒙古呼和浩特010011

【目的】探究盐和干旱胁迫对沙葱种子萌发的影响,为沙葱人工栽培和抗逆性研究提供参考依据。【方法】以沙葱种子为试验材料,采用不同浓度NaCl、Na2SO4混合的中性盐溶液和PEG-6000溶液分别模拟盐和干旱胁迫,测定其发芽率、发芽势、发芽... 详细信息

【目的】探究盐和干旱胁迫对沙葱种子萌发的影响,为沙葱人工栽培和抗逆性研究提供参考依据。【方法】以沙葱种子为试验材料,采用不同浓度NaCl、Na2SO4混合的中性盐溶液和PEG-6000溶液分别模拟盐和干旱胁迫,测定其发芽率、发芽势、发芽指数和活力指数,并通过相对发芽率与各处理浓度建立的函数方程确定其种子的耐受性。【结果】随着盐和干旱胁迫的增强,沙葱种子的萌发指标均逐渐下降,初始萌发时间延迟。当盐浓度为75 mmol/L和150 mmol/L时,种子萌发时间分别延迟至第3天和第5天,其发芽率分别下降到23.33%和12.66%;当PEG-6000浓度为15%和20%时,种子萌发时间分别延迟至第3天和第4天,其发芽率分别下降到38.66%和25.33%。沙葱种子耐盐和耐旱半致死渗透势分别为-0.20 MPa和-3.80 MPa,耐盐和耐旱极限渗透势分别为-0.60 MPa和-7.38 MPa。【结论】轻度干旱环境并未明显抑制沙葱种子的萌发,其耐旱极限渗透势为-7.38 MPa;低渗盐溶液显著抑制沙葱种子的萌发,其耐盐极限渗透势为-0.60 MPa。

关键词：沙葱种子盐胁迫干旱胁迫萌发

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一种基于注意力机制的高分遥感影像场景分类的方法

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内蒙古科技与经济 2021年第15期 100-103,105页

作者：陶东华申志军穆丽娜薛有为内蒙古农业大学计算机与信息工程学院内蒙古自治区农牧业大数据研究与应用重点实验室内蒙古呼和浩特010018

针对高分遥感影像场景分类准确率低的问题,提出了一种改进的卷积神经网络模型AResNet。该模型将注意力机制引入到预置残差网络中,使用卷积注意力模块分别从通道和空间两个维度学习特征信息,增强了特征的可判别性,实现对遥感影像场景的... 详细信息

针对高分遥感影像场景分类准确率低的问题,提出了一种改进的卷积神经网络模型AResNet。该模型将注意力机制引入到预置残差网络中,使用卷积注意力模块分别从通道和空间两个维度学习特征信息,增强了特征的可判别性,实现对遥感影像场景的有效分类。在此基础上,采用ImagNet预训练参数,在训练过程中,采用Adam算法不断优化参数。实验结果表明,在NWPU-RESISC45数据集上,AResNet模型分类准确率提升到了94.3%,验证了模型的有效性。

关键词：高分遥感影像场景分类注意力机制卷积神经网络

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一种高效自动化的转录组差异性表达分析方法

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生命科学研究 2019年第1期23卷 39-45页

作者：赵芳高静刘振羽王永军邬学敏内蒙古农业大学计算机与信息工程学院内蒙古自治区农牧业大数据研究与应用重点实验室中国内蒙古呼和浩特010018

差异性表达分析是转录组研究的核心目标之一,对于揭示基因功能和调控规律具有重要意义。但该分析属于多步迭代且耗时较长的计算密集型过程,软件之间具有复杂的数据依赖关系,输入输出格式不尽相同。传统方式下,软件安装与使用复杂、繁琐... 详细信息

差异性表达分析是转录组研究的核心目标之一,对于揭示基因功能和调控规律具有重要意义。但该分析属于多步迭代且耗时较长的计算密集型过程,软件之间具有复杂的数据依赖关系,输入输出格式不尽相同。传统方式下,软件安装与使用复杂、繁琐的手动操作、分析环境的不易迁移以及无法按需集成都是有待解决的关键问题。针对上述问题,文中首次将云开源项目Docker容器技术应用于生物信息领域,提出一种高效自动化的转录组差异性表达分析方法。首先将最佳实践流程在Docker容器中内置与集成,其次多脚本联动与Web服务相结合,最后形成一个轻量级、易迁移、高效自动化的转录组差异性表达分析"黑匣子"。实验结果表明,与传统方式相比,该方法的分析时间缩短约72%,效率提升2倍多,为研究人员提供了更高效的技术支持。

关键词： Docker容器转录组差异性表达分析最佳实践流程脚本

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面向农作物病虫害领域的命名实体识别

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内蒙古农业大学学报（自然科学版） 2022年第1期43卷 86-90页

作者：谢聪娇高静陈俊杰内蒙古农业大学计算机与信息工程学院呼和浩特010011 内蒙古自治区农牧业大数据研究与应用重点实验室呼和浩特010011 内蒙古自治区大数据中心呼和浩特010096

命名实体识别是信息抽取的基础任务,面向农作物病虫害领域的命名实体识别对于农业信息化建设具有重要意义。为了提高面向农作物病虫害领域命名实体识别的准确率,提出了采用字符级词性标注与自定义领域词典结合双向长短时记忆网络(Bi-LST... 详细信息

命名实体识别是信息抽取的基础任务,面向农作物病虫害领域的命名实体识别对于农业信息化建设具有重要意义。为了提高面向农作物病虫害领域命名实体识别的准确率,提出了采用字符级词性标注与自定义领域词典结合双向长短时记忆网络(Bi-LSTM)+条件随机场模型(CRF)的方法对"病虫害"、"作物"、"地名"、"农药"4类实体词进行识别,该方法的准确率达到了97.10%,因此该模型能够有效应用于农作物病虫害领域的命名实体识别任务。

关键词：命名实体识别 Bi-LSTM CRF 病虫害

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褪黑激素对内蒙古绒山羊皮肤中let-7家族及其靶基因的影响

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畜牧兽医学报 2019年第7期50卷 1367-1379页

作者：王建蒙付绍印丽春白雪刘斌季小阳刘永斌张文广内蒙古农业大学动物科学学院动物遗传育种与繁殖自治区重点实验室呼和浩特010018 内蒙古自治区农业基因组大数据工程研究中心呼和浩特010018 内蒙古自治区农牧业科学院呼和浩特010031 内蒙古ATCG生物信息研究所呼和浩特010020 内蒙古民族大学动物科学技术学院通辽028000 内蒙古犇牛科技有限公司呼和浩特010018

旨在探索褪黑激素(melatonin, MT)对let-7家族成员及其靶基因在内蒙古绒山羊皮肤周期性表达的影响。本研究选取内蒙古绒山羊罕山型个体6只,分为埋植组(皮下埋植MT,n=3)和对照组(不埋植MT,n=3),连续12个月采集绒山羊个体皮肤组织为试验材... 详细信息

旨在探索褪黑激素(melatonin, MT)对let-7家族成员及其靶基因在内蒙古绒山羊皮肤周期性表达的影响。本研究选取内蒙古绒山羊罕山型个体6只,分为埋植组(皮下埋植MT,n=3)和对照组(不埋植MT,n=3),连续12个月采集绒山羊个体皮肤组织为试验材料,利用qRT-PCR技术检测皮肤组织中11个let-7家族成员的表达变化,结合RNA-Seq技术分析let-7家族靶基因的表达变化。结果表明:1)在整个皮肤毛囊周期内,MT上调let-7b、let-7e、let-7a-3p的表达,下调let-7f、let-7g、let-7c、let-7a-5p、let-7d、miR-98的表达。2)在4月份,MT上调"let-7g、let-7i、miR-98"的表达,下调PTGS2、PLCG1等靶基因的表达;下调"let-7a-5p、let-7b、let-7c"的表达,上调TGIF2、RBL1等靶基因的表达。3)在6月份,MT下调"let-7g、let-7i、miR-98"的表达,上调PTGS2、PLCG1、SRC等靶基因的表达;上调"let-7a-5p、let-7b、let-7c"的表达,下调GDF5、TGIF2、RBL1等靶基因的表达。4)let-7家族成员的靶基因主要参与VEGF、TGF-β、Oxytocin和NF-kappa B信号通路,在细胞过程、激素调节和转录因子调控方面发挥重要作用。综上表明,MT可能通过改变let-7家族重要成员的表达水平,影响相应靶基因的表达,进而在皮肤毛囊的周期性生长过程中发挥重要作用,研究结果为进一步揭示MT介导miRNAs影响羊绒生长的分子机理提供了理论依据。

关键词：内蒙古绒山羊皮肤褪黑激素 let-7家族靶基因

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光照处理下不同温度对沙葱种子萌发和生理指标的影响

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安徽农业科学 2024年第3期52卷 31-34页

作者：魏鹏超鄂圆圆张东杨忠仁张凤兰内蒙古农业大学园艺与植物保护学院/内蒙古自治区野生特有蔬菜种质资源与种质创新重点实验室内蒙古呼和浩特010000 内蒙古自治区农牧业大数据研究与应用重点实验室内蒙古呼和浩特010011

为探索沙葱种子萌发的最适条件,以沙葱种子为试材,开展光照处理下不同温度对其种子萌发特性及抗氧化酶活性的影响。结果表明,各光照处理下,20℃时发芽率极显著高于10与30℃;12和24 h光照处理时,10与30℃下种子发芽率仅为0。表明10和30... 详细信息

为探索沙葱种子萌发的最适条件,以沙葱种子为试材,开展光照处理下不同温度对其种子萌发特性及抗氧化酶活性的影响。结果表明,各光照处理下,20℃时发芽率极显著高于10与30℃;12和24 h光照处理时,10与30℃下种子发芽率仅为0。表明10和30℃均不能提高种子在光照条件下的萌发率,反而导致光对其抑制作用加剧。黑暗与12 h光照环境下,10和30℃处理时种子SOD活性在萌发后期明显高于20℃;各光照环境下,20℃处理时种子POD和CAT含量均高于10与30℃,而MDA含量则低于10与30℃,可见沙葱种子是典型的需暗性种子,适宜萌发温度为20℃,各光照环境下高温与低温均会限制种子的萌发。

关键词：沙葱种子光照温度抗氧化系统萌发

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