[目的]明晰干旱半干旱区耕地水资源短缺的时空变化特征及驱动因素，是实现区域水资源可持续利用的首要前提，对保障区域乃至全国粮食安全和生态健康有着重要意义。[方法]文章以内蒙古为典型研究区，以水足迹理论为依据，通过构建耕地水资源短缺指数（Arable Land Water Scarcity Index,AWSI），分析2000—2018年内蒙古耕地水资源短缺指数时空格局及变化特征，并进一步借助地理探测器模型定量揭示研究区内气候、植被、地形、人口密度等11个自然和社会经济因素对耕地水资源短缺时空变化的影响差异。[结果]（1）内蒙古耕地水资源短缺指数总体呈西高东低的分布特征，西部耕地缺水压力较大。2000—2018年内蒙古耕地水资源短缺指数呈增加趋势，增加区域占总面积82%以上，主要分布在东部和中部地区。（2）自然因素主要决定内蒙古耕地水资源短缺的空间格局，其影响明显大于社会经济因素，但是2000—2018年社会经济因素的影响力在呈增大趋势。（3）自然因素中以蒸发量、年均温、降水量为主的气候因子在生态探测中共有19组显著差异，占据了影响因子中的主导地位。而在社会经济因素与自然因素的交互作用下，影响力呈现相互增强或非线性增强。[结论]由于农业水资源短缺空间分布不均及供需矛盾加剧，亟需增加节水设施和调整种植结构成为内蒙古未来农业水资源可持续利用的重要问题。
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