检索结果-内蒙古大学图书馆

军事医学 2017年第2期41卷 101-105页

作者：张敏梁冰玉李天一沈平苏齐鉴李敬云李林安徽医科大学合肥230000 广西医科大学公共卫生学院广西艾滋病防治研究重点实验室南宁530021 军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室全军艾滋病检测中心北京100071 钦州市钦南区疾病预防控制中心广西钦州535000 广西中医药大学附属瑞康医院南宁530021

目的对广西1例HIV-1 G亚型毒株感染者体内病毒近似全长基因组进行序列测定并进行系统进化分析。方法对前期鉴定的1例HIV-1G亚型毒株感染者进行背景信息收集,并采集其外周血,提取病毒RNA,利用逆转录巢式-PCR技术分两段扩增并测定病毒近... 详细信息

目的对广西1例HIV-1 G亚型毒株感染者体内病毒近似全长基因组进行序列测定并进行系统进化分析。方法对前期鉴定的1例HIV-1G亚型毒株感染者进行背景信息收集,并采集其外周血,提取病毒RNA,利用逆转录巢式-PCR技术分两段扩增并测定病毒近似全长基因序列。利用MEGA6软件对全长序列进行系统进化分析。结果获得了病毒近似全长基因组序列,长度为8847 bp。在系统进化树中,该毒株与G亚型参考株成簇,Bootstrap值为100%。系统溯源分析显示,该毒株与广西首次报道的G亚型JN106043毒株关系最近(Bootstrap值为100%,基因离散率为5%)。结论该毒株可能是由广西毒株传播所致,提示G亚型毒株在广西地区可能存在一定的局部流行,需进一步监测。该毒株序列的测定和分析对于广西地区HIV流行状况分析具有重要意义。

关键词： HIV-1 G亚型近似全长序列系统进化树分析

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河南驻马店市性传播HIV感染者中流行的HIV亚型分析

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中国艾滋病性病 2015年第10期21卷 839-842页

作者：孙国清韩婧婉崔海燕桂滔刘永健李韩平李天一王晓林鲍作义庄道民刘思扬李敬云李林河南省疾病预防控制中心郑州450016 军事医学科学院微生物流行病研究所全军艾滋病检测中心病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071 驻马店市疾病预防控制中心河南驻马店463000

目的分析河南驻马店市经性传播的艾滋病病毒(HIV)感染者中,HIV流行毒株亚型及其毒株特征。方法通过专业问卷调查,了解驻马店地区经性传播HIV感染者的基本状况。采集感染者的EDTA抗凝静脉血,检测其CD+4T淋巴细胞(简称CD4细胞)计数,提取... 详细信息

目的分析河南驻马店市经性传播的艾滋病病毒(HIV)感染者中,HIV流行毒株亚型及其毒株特征。方法通过专业问卷调查,了解驻马店地区经性传播HIV感染者的基本状况。采集感染者的EDTA抗凝静脉血,检测其CD+4T淋巴细胞(简称CD4细胞)计数,提取外周血浆中病毒核糖核酸(RNA),使用反转录巢式荧光定量聚合酶链反应(PCR)方法扩增病毒全长gag和部分pol基因,利用Clustal软件比对序列,利用BioEdit软件手工校对,利用NCBI网站HIV分型工具分析病毒亚型,利用MEGA软件构建NJ树,分析病毒系统进化关系。结果共收集到HIV感染者血液74份,全部经性传播感染HIV。经过测序,共获得HIV全长gag基因56条(75.7%),全长pol基因38条(51.4%)。对61例HIV感染者感染病毒亚型进行了分析,其中B亚型毒株47例(77.0%),CRF01_AE毒株6例(9.8%),CRF07_BC毒株4例(6.6%),C亚型毒株2例(3.3%),新型重组毒株2例(3.3%)。系统进化分析显示,所有的B亚型毒株均为Thai B毒株。38例获得pol区序列的样本中,有4例具有耐药突变。结论驻马店市性传播HIV感染者中流行的HIV毒株构成复杂,Thai B亚型毒株是优势毒株,CRF01_AE、CRF07_BC、C等亚型毒株均已进入该人群,而且出现了新型重组毒株。针对该人群的HIV流行毒株监测至关重要。

关键词：艾滋病病毒性传播流行毒株亚型系统进化分析

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广西首例HIV-1G亚型毒株的发现和近似全长基因组序列分析

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军事医学 2012年第3期36卷 192-195页

作者：李天一梁淑家陈立力刘伟李敬云李林军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室全军艾滋病检测中心北京100071 广西壮族自治区疾病预防控制中心南宁530028 兰州军区乌鲁木齐总医院乌鲁木齐830000

目的获得广西首例HIV-1 G亚型毒株全长基因组序列并分析其来源。方法采集1例广西HIV感染者血浆,提取病毒RNA,利用逆转录巢式-PCR技术,分两段扩增病毒近似全长基因序列,对PCR产物进行核苷酸序列测定,利用MEGA软件对全长序列进行系统进化... 详细信息

目的获得广西首例HIV-1 G亚型毒株全长基因组序列并分析其来源。方法采集1例广西HIV感染者血浆,提取病毒RNA,利用逆转录巢式-PCR技术,分两段扩增病毒近似全长基因序列,对PCR产物进行核苷酸序列测定,利用MEGA软件对全长序列进行系统进化分析。结果获得了8800 bp长度的近似全长基因组序列,系统发育分析结果显示该毒株与HV-1 G亚型参考株成簇,Bootstrap值为99%,通过与世界上其他地区流行的HIV-1 G亚型毒株进行亲缘分析,该毒株与喀麦隆流行毒株的关系最近。结论在广西发现了首例HIV-1 G亚型感染者,推测该毒株是由境外传入的,应对广西地区流行的HIV-1毒株的来源和变异进行密切监测。

关键词： G亚型,HIV-1 近似全长序列系统进化树分析基因组

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对in—houseHIV-1基因型耐药性检测方法的评价

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中华检验医学杂志 2011年第9期34卷 849-854页

作者：耿庆茂李韩平辛天义庄道民鲍作义刘永健李林王铮刘思扬李敬云全军艾滋病检测中心军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物安全国家重点实验室北京100071 河南省沈丘县卫生局

目的评价in—houseHIV—1基因型耐药检测方法的敏感性与准确性。方法收集2004年4月至2008年10月全军艾滋病检测中心检测的来自河南、广西130份血浆标本。以美国FDA批准的HIV-1基因型耐药性检测系统（ViroSeq^TMv2．0）为参考方法，并与... 详细信息

目的评价in—houseHIV—1基因型耐药检测方法的敏感性与准确性。方法收集2004年4月至2008年10月全军艾滋病检测中心检测的来自河南、广西130份血浆标本。以美国FDA批准的HIV-1基因型耐药性检测系统（ViroSeq^TMv2．0）为参考方法，并与建立起的基因型耐药性检测方法（in—house）平行检测待检样本，比较二者在扩增效率、耐药突变位点检测以及耐药报告等方面的一致性。结果已知的14850个耐药突变位点中，2种方法可同时对99．3％（14752／14850）的耐药突变位点准确检出；在对不同突变位点的检测中，2种方法对蛋白酶抑制剂耐药突变位点、逆转录酶抑制剂耐药突变位点及两类抑制剂耐药突变位点检测一致率分别为99．7％、99．0％和99．3％（Kappa值分别为0．9099、0．9521和0．9488，P值均〈0．01）；2种方法出具的两类药物的耐药结果报告一致率94．6％（Kappa=0．6374，P〈0．01）。本研究共检测到34个ViroSeq“数据库（ViroSeq^TMsoftwarev2．7）未收录位点，其中2个突变位点对耐药的影响较大。结论in—house基因型耐药性检测方法与ViroSeq^TM基因型耐药性检测系统在耐药突变位点检测以及评价上具有高度一致性，是一种快速准确、性价比高的HIV-1基因型耐药检测方法，同时在耐药数据库方面具有一定优势。

关键词： HIV-1 基因型抗药性,病毒微生物敏感性试验

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一组分离自男男性行为人群HIV-1毒株的近似全长序列分析

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中国病毒病杂志 2011年第2期1卷 99-105页

作者：王铮庄道民刘思扬陈立力李林刘永健李韩平鲍作义王晓林李天一李敬云军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室全军艾滋病检测中心北京100071

目的对5名北京市男男性行为者体内人类免疫缺陷病毒-1(HIV-1)全基因组特征进行全面分析。方法采用淋巴细胞共培养法分离出病毒,并采用RT-PCR法扩增出其近似全长基因组,测序后对其基因序列特征进行深入分析。结果经系统进化和重组分析,... 详细信息

目的对5名北京市男男性行为者体内人类免疫缺陷病毒-1(HIV-1)全基因组特征进行全面分析。方法采用淋巴细胞共培养法分离出病毒,并采用RT-PCR法扩增出其近似全长基因组,测序后对其基因序列特征进行深入分析。结果经系统进化和重组分析,分离出的5株病毒分属CRF07_BC、CRF01_AE和B亚型。病毒虽然分属不同亚型,但膜区糖基化位点的数目和分布位置都趋于保守,V3环顶端序列存在GPGR和GWGR两种形式,嗜性预测皆为M嗜性。结论男男性行为人群中HIV-1流行毒株存在CRF01_AE、CRF07_BC和B亚型。本研究获得的全长序列将为研究HIV-1各亚型在男男性行为人群中的传播和进化提供理论依据。

关键词： HIV-1 近似全长序列男男性行为人群

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广西首例HIV-1 G亚型毒株的发现和近似全长基因组序列分析

广西首例HIV-1 G亚型毒株的发现和近似全长基因组序列分析

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第五次全国免疫诊断暨疫苗学术研讨会

作者：李天一梁淑家陈立力刘伟刘永健王铮王晓林刘思扬李韩平庄道民鲍作义李敬云李林军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室全军艾滋病检测中心广西壮族自治区疾病预防控制中心

在我国广西地区收集1例感染了HIV-1毒株的病人外周血血浆,提取病毒RNA,利用逆转录巢式-PCR技术,分两段扩增病毒近似全长基因序列,对PCR产物进行核苷酸序列测定和分析,获得了8800bp长度的近似全长序列,利用MEGA软件进行系统进化分析,结... 详细信息

在我国广西地区收集1例感染了HIV-1毒株的病人外周血血浆,提取病毒RNA,利用逆转录巢式-PCR技术,分两段扩增病毒近似全长基因序列,对PCR产物进行核苷酸序列测定和分析,获得了8800bp长度的近似全长序列,利用MEGA软件进行系统进化分析,结果显示该毒株为G亚型毒株,系统发育分析结果显示该毒株与G亚型参考株成簇,Bootstrap值较高(99%);通过与世界上其他地区流行的G亚型毒株进行亲缘分析,发现该毒株与喀麦隆流行毒株关系较近,提示该毒株可能是由境外传入。这是广西地区发现的首例HIV-1G亚型毒株,也是国内报道的首例G亚型近似全长基因序列,该序列的测定和分析对于广西地区流行毒株监测具有重要意义。

关键词： G亚型,HIV-1 近似全长序列系统进化树分析

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5株不同亚型HIV-1毒株gp120序列特征分析及其蛋白的表达

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中华微生物学和免疫学杂志 2009年第5期29卷 424-430页

作者：王铮李敬云鲍作义李韩平庄道民刘思杨李林军事医学科学院微生物流行病研究所全军艾滋病检测中心病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

目的分析我国HIV-1主要亚型毒株的gp120区域的序列特征，并表达出gp120糖基化蛋白，为研究gp120的致病机制和设计疫苗奠定基础。方法利用巢式PCR从来自于不同省份的5名HIV-1感染者外周血单个核细胞DNA中扩增全长gp120基因并测序，对序... 详细信息

目的分析我国HIV-1主要亚型毒株的gp120区域的序列特征，并表达出gp120糖基化蛋白，为研究gp120的致病机制和设计疫苗奠定基础。方法利用巢式PCR从来自于不同省份的5名HIV-1感染者外周血单个核细胞DNA中扩增全长gp120基因并测序，对序列特征进行分析，并将获得的gp120基因克隆入真核表达载体，体外表达获得gp120糖基化蛋白。结果序列分析显示，此5条gp120序列分属HIV-1 Thai-B、BC重组和AE重组亚型，虽然亚型不同，但这些gp120序列在相同的位置都存在着一些保守的糖基化位点，且都具备相同的Furin蛋白酶第一切割位点，与参考序列比较发现，不同的HIV亚型序列中，除V3序列长度较为保守外，V1、V2、V4、V5各区域都有不同程度的缺失现象，与BC重组和AE重组亚型相比，Thai-B亚型V3的顶端环呈现出多种组合。最终将这5条gp120序列都克隆入真核表达载体并表达出糖基化的gp120蛋白。结论在设计疫苗和检测试剂时应考虑到膜区的高变性，gp120糖蛋白的体外表达有利于进一步开展针对我国主要HIV流行毒株膜蛋白致病机制和疫苗学的研究。

关键词： HIV-1 gp120 糖基化蛋白

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ASPCR检测微量HIV-1 K103N耐药突变方法的建立

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中华微生物学和免疫学杂志 2009年第12期29卷 1130-1134页

作者：郭东星李韩平李林庄道民王铮鲍作义刘思扬刘永健李敬云军事医学科学院微生物流行病研究所全军艾滋病检测中心病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

目的建立检测微量HIV-1 K103N耐药突变的等位基因特异扩增实时定量PCR（allele-specific real-time PCR，ASPCR）方法，用于微量K103N耐药突变的检测和分析。方法首先建立检测K103N耐药突变的ASPCR方法，然后对方法进行验证，最后采用AS... 详细信息

目的建立检测微量HIV-1 K103N耐药突变的等位基因特异扩增实时定量PCR（allele-specific real-time PCR，ASPCR）方法，用于微量K103N耐药突变的检测和分析。方法首先建立检测K103N耐药突变的ASPCR方法，然后对方法进行验证，最后采用ASPCR方法检测对照样本。构建含K103N突变的质粒作为标准品，然后设计特异性引物用以区分野生型和突变型模板，采用SYBRgreen法进行实时定量PCR，并绘制标准曲线。分别采用特异性和非特异性引物扩增模板，根据二者Ct（cycle threshold）值结合相应的标准曲线判断是否存在K103N突变及突变比例。对ASPCR检测K103N突变位点的特异性、敏感性、准确性、重复性等进行验证。结果特异性和非特异性引物扩增等量野生型模板的Ct值之差（△Ct）可达13．56；当突变比例小于0．1％时仍具有良好的准确性；批内变异系数小于0．7，批间变异系数小于1．6；检测灵敏度可达0．01％。检测阴性对照样本的△Ct显著高于临界值，阳性对照样本检测结果均为阳性。结论ASPCR是一种快速、灵敏、准确的检测HIV-1微量耐药突变的方法，可为临床抗病毒治疗提供理论指导。

关键词： HIV ASPCR 微量耐药

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HIV的起源与SIV的跨种传播

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军事医学科学院院刊 2009年第6期33卷 501-504页

作者：李敬云军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室全军艾滋病检测中心北京100071

人免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)是在全球广泛流行并导致严重危害的人类病原体,是由非人灵长类动物免疫缺陷病毒(simian immunodeficiency virus,SIV)跨种传播给人类并进化而来的。本文介绍了SIV跨种传播进化为多种HI... 详细信息

人免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)是在全球广泛流行并导致严重危害的人类病原体,是由非人灵长类动物免疫缺陷病毒(simian immunodeficiency virus,SIV)跨种传播给人类并进化而来的。本文介绍了SIV跨种传播进化为多种HIV毒株的科学发现及跨种传播病毒在新型宿主中的适应性进化,分析了这些发现的科学和公共卫生意义。

关键词：人免疫缺陷病毒非人灵长类动物免疫缺陷病毒起源进化

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我国部分地区HIV-1流行毒株亚型分布及gag基因变异特征研究

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军事医学科学院院刊 2009年第6期33卷 505-508页

作者：陈立力刘永健李韩平鲍作义庄道民刘思扬王铮赖章丽李林李敬云军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室全军艾滋病检测中心北京100071 兰州军区乌鲁木齐总医院乌鲁木齐830000

目的:分析我国4个地区的人免疫缺陷病毒1型(HIV-1)主要流行毒株的亚型分布,以及在宿主免疫压力下的基因变异和抗原表位的变化情况,初步探讨这些地区HIV-1gag基因的分子进化特征。方法:从来自河南、广东、四川、北京的HIV-1感染者血浆样... 详细信息

目的:分析我国4个地区的人免疫缺陷病毒1型(HIV-1)主要流行毒株的亚型分布,以及在宿主免疫压力下的基因变异和抗原表位的变化情况,初步探讨这些地区HIV-1gag基因的分子进化特征。方法:从来自河南、广东、四川、北京的HIV-1感染者血浆样本中提取基因组RNA,经逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增部分gag基因,用扩增产物直接进行测序;使用Genotyping Tool软件进行亚型分析,使用MEGA4.1软件绘制系统进化树;用Distance工具计算各个亚型序列的基因离散率;用SNAP程序分析同义替换率与非同义替换率的比值(Ks/Ka),并对各亚型中我国人群中较常见的HLA-Ⅰ型限制的CTL抗原表位的突变情况进行分析。结果:这些地区HIV-1主要流行毒株gag基因亚型主要是B′、CRF07_BC、CRF01_AE、B、CRF08_BC和CRF02_AG。各亚型内的基因离散率不同,由大到小排列为CRF01_AE>B>CRF08_BC>CRF07_BC>B′,Ks/Ka为CRF01_AE>B>CRF08_BC>B′>CRF07_BC。p17区段的CTL抗原表位变异远大于p24区段。各个亚型共享序列中存在的突变位点由多到少排列为CRF01_AE>B>B′>CRF07_BC。结论:我国HIV-1流行毒株的gag基因序列中,CRF01_AE亚型受到的选择压力最大,基因离散率也最大,且CTL抗原表位的变异亦最大,其次是B和B′亚型,CRF07_BC亚型变异最小。各亚型间CTL抗原表位变异的差异明显。

关键词：人类免疫缺陷病毒1型 gag基因基因型遗传变异

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