检索结果-内蒙古大学图书馆

中国抗生素杂志 2017年第10期42卷 871-879页

作者：邢少贞赵飞扬孙强米志强安小平童贻刚赵宝华河北师范大学生命科学院石家庄050024 青岛农业大学动物科技学院青岛266109 军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

噬菌体是解决致病菌多重耐药性问题的最佳选择之一,然而噬菌体的宿主特异性使得噬菌体的裂解谱有限,因此研究噬菌体宿主特异性对于噬菌体治疗应用具有重要意义。本研究通过筛选大肠埃希菌宿主菌BL21噬菌体IME253的耐受菌,结合对敏感菌... 详细信息

噬菌体是解决致病菌多重耐药性问题的最佳选择之一,然而噬菌体的宿主特异性使得噬菌体的裂解谱有限,因此研究噬菌体宿主特异性对于噬菌体治疗应用具有重要意义。本研究通过筛选大肠埃希菌宿主菌BL21噬菌体IME253的耐受菌,结合对敏感菌和耐受菌的高通量测序,分析基因组差异,预测噬菌体耐受相关基因,发现耐受与外膜受体蛋白FepA有关。然后利用向导CRISPR/Cas9切开敏感菌fepA基因,同时利用Red同源重组系统无痕敲除fepA基因,证明fepA基因敲除可以导致细菌BL21对噬菌体IME253耐受。本实验利用比较基因组学分析平台,建立了一种宿主耐受噬菌体的分析方法,并且利用CRIPSR无痕敲除技术来验证耐受相关基因,为噬菌体治疗提供理论基础。

关键词：噬菌体高通量测序噬菌体受体 CRISPR 同源重组

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利用蛋白质组技术快速鉴定噬菌体结构蛋白

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中国抗生素杂志 2017年第9期42卷 760-765页

作者：赵飞扬邢少贞孙强裴广倩米志强安小平童贻刚任慧英军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071 青岛农业大学动物科技学院青岛266109 河北师范大学生命科学院石家庄050024

为快速鉴定噬菌体的结构蛋白,并且发现具有新功能的蛋白,为噬菌体功能的研究提供基础。本研究用临床分离到的屎肠球菌为指示菌,从医院污水中分离到1株裂解性噬菌体,命名为v B_Efa P_IME199。对噬菌体大量培养、浓缩和纯化,然后进行蛋白... 详细信息

为快速鉴定噬菌体的结构蛋白,并且发现具有新功能的蛋白,为噬菌体功能的研究提供基础。本研究用临床分离到的屎肠球菌为指示菌,从医院污水中分离到1株裂解性噬菌体,命名为v B_Efa P_IME199。对噬菌体大量培养、浓缩和纯化,然后进行蛋白质组学分析、全基因组测序,进化分析,确定该噬菌体为短尾噬菌体科,全基因组序列长为18839bp,GC含量为34.6%。在线注释预测该噬菌体基因组功能基因,注释出22个ORFs,其中11个ORFs为假想蛋白序列,其余11个ORFs的功能已知。采用质谱技术对浓缩纯化的噬菌体进行蛋白质组分析,共鉴定出11个蛋白质,其中有6个蛋白为功能已知的结构蛋白,其余为假想蛋白。本实验利用蛋白质组技术快速有效的鉴定出噬菌体的结构蛋白,建立了一种噬菌体蛋白的分析方法,为该噬菌体的基因功能研究提供了基础。

关键词：噬菌体 vB_EfaP_IME199 基因组学蛋白质组学

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鼠疫耶尔森菌基因组无痕修饰方法的建立

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军事医学 2017年第3期41卷 209-212,221页

作者：肖丽生祁芝珍吕瑞辰宋凯陈荣王敏吴海莲赵海红宋亚军安徽医科大学合肥230032 军事医学科学院微生物流行病研究所、病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071 青海省地方病预防控制所西宁811602 解放军总医院微生物科北京100853

目的构建鼠疫耶尔森菌(鼠疫菌)中基因组无痕修饰的技术平台,深入研究鼠疫菌相关基因的功能及作用机制。方法通过不对称PCR扩增抗性盒片段(含修饰靶标区域上下游同源臂),将其导入含pKD46质粒的鼠疫菌中。在阿拉伯糖的诱导下,pKD46质粒可... 详细信息

目的构建鼠疫耶尔森菌(鼠疫菌)中基因组无痕修饰的技术平台,深入研究鼠疫菌相关基因的功能及作用机制。方法通过不对称PCR扩增抗性盒片段(含修饰靶标区域上下游同源臂),将其导入含pKD46质粒的鼠疫菌中。在阿拉伯糖的诱导下,pKD46质粒可表达与同源重组相关的3个酶(Exo,Beta和Gam蛋白),诱导重组后再导入p KSI-1质粒与目的基因的重组载体,与抗性盒进行第二次同源重组。通过加入阿拉伯糖和IPTG诱导pREDTKI表达重组酶和I-SceⅠ酶,可对未发生重组的抗性盒片段和p KSI-1质粒上的I-SceⅠ位点酶切,从而起到消除抗性盒与质粒作用,达到无痕修饰的目的。结果与结论成功构建了鼠疫菌的Δwaa A和waa A(△9nt)两个突变株。根据不同的实验目的选择相应的基因敲除方法,得到的无痕修饰菌株为鼠疫菌相关基因的功能研究奠定了基础。

关键词：鼠疫菌同源重组基因编辑

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中国内地寨卡病毒病输入传播风险评估研究

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寄生虫与医学昆虫学报 2017年第2期24卷 91-102页

作者：张文慧赵国平姚宏武樊正伟肖丹李新楼方立群军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071 中国人民解放军总医院北京100089 航天系统部疾病预防控制中心北京100101

2016年全球寨卡病毒病疫情暴发,使我国面临一定的输入传播风险。本研究基于2016年全球寨卡病毒病报告疫情数据、全球国际航班客流量数据和我国云南和广西边境口岸分布等数据,通过计算输入风险指数评估我国主要城市寨卡病毒病输入风险。... 详细信息

2016年全球寨卡病毒病疫情暴发,使我国面临一定的输入传播风险。本研究基于2016年全球寨卡病毒病报告疫情数据、全球国际航班客流量数据和我国云南和广西边境口岸分布等数据,通过计算输入风险指数评估我国主要城市寨卡病毒病输入风险。应用生态位模型预测中国当前埃及伊蚊、白纹伊蚊的分布区域,结合内地主要城市寨卡病毒病输入风险指数、埃及伊蚊或白纹伊蚊的分布概率等数据,计算主要城市寨卡病毒病输入后继发本地传播风险指数,评估本地传播风险。研究表明北京、上海和广州经国际航班输入寨卡病毒病的风险高;云南省德宏州、临沧市和西双版纳州以及广西防城港市和北海市经陆运口岸输入的风险较高;需加强口岸检疫,及时发现病例。仅考虑埃及伊蚊在该病传播中发挥作用,海口、三亚和湛江存在寨卡病毒病本地传播风险。云南省德宏州、临沧市两地在3-11月份如发生陆运口岸输入寨卡病毒病,存在经埃及伊蚊引起本地传播的中等风险。这些城市需要加强人群和伊蚊的监测,以利于早发现疫情、及早采取防蚊灭蚊等防控措施。

关键词：寨卡病毒病埃及伊蚊白纹伊蚊传播风险评估

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拟核结合蛋白H-NS调控副溶血弧菌vp1667的转录

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军事医学 2017年第6期41卷 445-448页

作者：詹明华张伟周冬生黄新祥杨慧盈殷喆张义全河北北方学院附属第一医院检验科河北张家口075000 军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071 江苏大学医学院江苏镇江212013

目的研究副溶血弧菌H-NS对vp1667的转录调控机制。方法提取副溶血弧菌hns突变株(Δhns)和野生株(WT)的总RNA,采用实时定量RT-PCR的方法验证H-NS对vp1667的转录调控关系;采用引物延伸实验研究vp1667的转录起始位点,并根据产物的丰度判断H... 详细信息

目的研究副溶血弧菌H-NS对vp1667的转录调控机制。方法提取副溶血弧菌hns突变株(Δhns)和野生株(WT)的总RNA,采用实时定量RT-PCR的方法验证H-NS对vp1667的转录调控关系;采用引物延伸实验研究vp1667的转录起始位点,并根据产物的丰度判断H-NS对vp1667的调控关系;将vp1667的启动子区克隆入p HRP309质粒的β-半乳糖苷酶基因上游,构建Lac Z重组质粒,并将该重组质粒转入Δhns和WT中获得Lac Z菌株。通过Lac Z报告基因融合实验研究H-NS对vp1667的调控关系。PCR扩增vp1667的启动子区序列并纯化His-H-NS蛋白,通过凝胶阻滞实验(EMSA)研究His-H-NS对vp1667启动子区是否具有直接的结合作用;采用DNaseⅠ足迹实验研究HisH-NS对vp1667启动子区的具体结合位点。结果与结论引物延伸结果显示,vp1667只有一个转录起始位点T(-28)(翻译起始位点为+1),且其转录活性受H-NS的抑制;EMSA和DNaseⅠ足迹实验结果显示,His-H-NS不能结合到vp1667的启动子区,表明H-NS只能间接抑制vp1667的转录。

关键词：副溶血弧菌 H-NS vp1667 转录调控

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类脂A是贝氏柯克斯体在吞噬细胞内存活增殖的关键因子

类脂A是贝氏柯克斯体在吞噬细胞内存活增殖的关键因子

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2017年第二届全国特殊病原体学术会议

作者：王涛于永慧罗声栋孙志会何泽民宋立华病原微生物与生物安全国家重点实验室军事医学科学院微生物流行病研究所

目的贝氏柯克斯体(Coxiella burnetii,简称Cb,俗称Q热立克次体)是一类在自然界广泛分布、革兰氏阴性、人畜共患的烈性病原体,为经典的生物战剂和生物恐怖剂.LpxC是革兰氏阴性菌类脂A合成途径中的保守基因.本研究旨在分析化合物LPC-011(...

目的贝氏柯克斯体(Coxiella burnetii,简称Cb,俗称Q热立克次体)是一类在自然界广泛分布、革兰氏阴性、人畜共患的烈性病原体,为经典的生物战剂和生物恐怖剂.LpxC是革兰氏阴性菌类脂A合成途径中的保守基因.本研究旨在分析化合物LPC-011(LpxC抑制剂)对Cb在吞噬细胞和非吞噬细胞中生长繁殖的影响,进而分析类脂A在Cb吸附入侵、菌体增殖过程中的生物学作用.方法 Cb在Vero、BGMK、THP-1等常用细胞模型或体内靶细胞的酸性类吞噬溶酶体囊泡内增殖,生长周期约为7天.

关键词：

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细菌基因组同源重组:量化与鉴定

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遗传 2016年第2期38卷 137-143页

作者：杨献伟杨瑞馥崔玉军军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

同源重组(Homologous recombination)是塑造细菌群体多样性的重要原因之一。遗传物质通过同源重组在细菌不同种系间进行水平转移,打乱了克隆繁殖形成的竖向系统发育结构,从而为系统发育重建和种群结构判定带来困难。本文讨论了同源重组... 详细信息

同源重组(Homologous recombination)是塑造细菌群体多样性的重要原因之一。遗传物质通过同源重组在细菌不同种系间进行水平转移,打乱了克隆繁殖形成的竖向系统发育结构,从而为系统发育重建和种群结构判定带来困难。本文讨论了同源重组对系统发育分析和进化研究的影响,从实际应用的角度对量化重组程度和鉴定重组事件的常用软件及方法进行了综述,归纳了各软件工具和模型方法的优缺点,旨在对细菌重组分析和种群进化研究有所借鉴。

关键词：同源重组克隆基因组系统发育种群结构

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嗜麦芽窄食单胞菌外膜蛋白OmpA的生物信息学分析

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军事医学 2017年第12期41卷 987-990页

作者：李燕赵尊全刘鹏尚学义汤雪萍李艳安徽医科大学解放军307医院临床学院合肥230032 军事科学院军事医学研究院附属医院重症医学科北京100071 军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

目的对嗜麦芽窄食单胞菌外膜蛋白A(OmpA)的结构和功能进行预测与分析。方法利用生物信息学软件和生物数据库对OmpA蛋白的理化性质、信号肽、跨膜区、亚细胞定位、二级与三级结构、同源性、保守结构域及抗原决定簇进行预测分析。结果 Omp... 详细信息

目的对嗜麦芽窄食单胞菌外膜蛋白A(OmpA)的结构和功能进行预测与分析。方法利用生物信息学软件和生物数据库对OmpA蛋白的理化性质、信号肽、跨膜区、亚细胞定位、二级与三级结构、同源性、保守结构域及抗原决定簇进行预测分析。结果 OmpA蛋白为亲水性蛋白,其1~22位氨基酸为信号肽序列,无跨膜结构并定位于细胞膜外;二级结构中含无规则卷曲、α-螺旋、β-转角和β-片层比例分别为50.27%、24.59%、9.29%和15.85%;三级结构预测OmpA蛋白为桶状蛋白;OmpA蛋白在不同嗜麦芽窄食单胞菌株间高度保守,而与人、小鼠的蛋白序列进行比对分析未找到同源序列;OmpA蛋白保守结构域在N端为OM膜通道蛋白超家族,在C端为OmpA_C超家族;OmpA蛋白含有11个优势抗原决定簇区域。结论通过对OmpA进行生物信息学分析获得该蛋白的特性,不仅为进一步研究该蛋白的结构与功能提供参考资料,也为研制相关亚单位疫苗提供理论依据。

关键词：嗜麦芽窄食单胞菌外膜蛋白A 生物信息学结构功能抗原决定簇

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实施传染病监测是预防控制传染病的有效途径

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中华流行病学杂志 2017年第4期38卷 417-418页

作者：王丽萍曹务春中国疾病预防控制中心传染病预防控制处、传染病监测预警中国疾病预防控制中心重点实验室北京102206 军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

传染病监测是我国疾病预防控制工作的重要内容之一。建国以来，我国传染病监测和报告制度不断完善，技术手段不断革新，在控制传染病暴发流行中发挥了不可替代的作用。当前全球传染病形势仍然较为严峻，传染病监测仍将是防控传染病的有... 详细信息

传染病监测是我国疾病预防控制工作的重要内容之一。建国以来，我国传染病监测和报告制度不断完善，技术手段不断革新，在控制传染病暴发流行中发挥了不可替代的作用。当前全球传染病形势仍然较为严峻，传染病监测仍将是防控传染病的有效途径。本期“传染病监测”栏目的论文，针对不同监测数据进行分析、解释，将成为我国传染病控制研究方面的重要信息，为传染病防控研究提供科学依据。

关键词：传染病监测预防控制

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一种条带免疫印迹试剂用于HIV抗体确证的效果评价

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中国艾滋病性病 2017年第1期23卷 63-64,68页

作者：王晓林梁姝孙国清刘永健常帅李敬云鲍作义军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071 四川省疾病预防控制中心成都610000 河南省疾病预防控制中心郑州450016

目的评估一种条带免疫印迹试剂确证艾滋病病毒(HIV)抗体的效果。方法用蛋白印迹试验(WB)和条带免疫印迹试剂(LIA)平行检测1 035份标本,按照各自的说明书判断结果,对检测结果进行比较和分析。结果总体上,两种试剂检测的一致率为95.3%,对... 详细信息

目的评估一种条带免疫印迹试剂确证艾滋病病毒(HIV)抗体的效果。方法用蛋白印迹试验(WB)和条带免疫印迹试剂(LIA)平行检测1 035份标本,按照各自的说明书判断结果,对检测结果进行比较和分析。结果总体上,两种试剂检测的一致率为95.3%,对经过确证的640份HIV抗体阳性标本(含2份HIV-1O组和2份HIV-2标本)的检测的结果完全一致。在339份WB试剂判断为阴性的标本中,LIA试剂有5份(1.5%)为不确定结果,而在362份LIA试剂判断为阴性的标本中,WB试剂有28份(7.7%)为不确定结果(χ~2=15.29,P<0.001)。在初次检测的341份标本中,确证了17份为HIV抗体阳性,考核试剂检测5份为不确定,12份为阳性。结论 LIA试剂显示出非特异反应暨不确定结果少的优势,可考虑用于HIV抗体的常规确证,并在实际应用中不断改进完善。

关键词：艾滋病病毒抗体确证蛋白印迹试验条带免疫印迹试验艾滋病病毒抗体不确定

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