检索结果-内蒙古大学图书馆

遗传 2016年第2期38卷 137-143页

作者：杨献伟杨瑞馥崔玉军军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

同源重组(Homologous recombination)是塑造细菌群体多样性的重要原因之一。遗传物质通过同源重组在细菌不同种系间进行水平转移,打乱了克隆繁殖形成的竖向系统发育结构,从而为系统发育重建和种群结构判定带来困难。本文讨论了同源重组... 详细信息

同源重组(Homologous recombination)是塑造细菌群体多样性的重要原因之一。遗传物质通过同源重组在细菌不同种系间进行水平转移,打乱了克隆繁殖形成的竖向系统发育结构,从而为系统发育重建和种群结构判定带来困难。本文讨论了同源重组对系统发育分析和进化研究的影响,从实际应用的角度对量化重组程度和鉴定重组事件的常用软件及方法进行了综述,归纳了各软件工具和模型方法的优缺点,旨在对细菌重组分析和种群进化研究有所借鉴。

关键词：同源重组克隆基因组系统发育种群结构

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嗜麦芽窄食单胞菌外膜蛋白OmpA的生物信息学分析

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军事医学 2017年第12期41卷 987-990页

作者：李燕赵尊全刘鹏尚学义汤雪萍李艳安徽医科大学解放军307医院临床学院合肥230032 军事科学院军事医学研究院附属医院重症医学科北京100071 军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

目的对嗜麦芽窄食单胞菌外膜蛋白A(OmpA)的结构和功能进行预测与分析。方法利用生物信息学软件和生物数据库对OmpA蛋白的理化性质、信号肽、跨膜区、亚细胞定位、二级与三级结构、同源性、保守结构域及抗原决定簇进行预测分析。结果 Omp... 详细信息

目的对嗜麦芽窄食单胞菌外膜蛋白A(OmpA)的结构和功能进行预测与分析。方法利用生物信息学软件和生物数据库对OmpA蛋白的理化性质、信号肽、跨膜区、亚细胞定位、二级与三级结构、同源性、保守结构域及抗原决定簇进行预测分析。结果 OmpA蛋白为亲水性蛋白,其1~22位氨基酸为信号肽序列,无跨膜结构并定位于细胞膜外;二级结构中含无规则卷曲、α-螺旋、β-转角和β-片层比例分别为50.27%、24.59%、9.29%和15.85%;三级结构预测OmpA蛋白为桶状蛋白;OmpA蛋白在不同嗜麦芽窄食单胞菌株间高度保守,而与人、小鼠的蛋白序列进行比对分析未找到同源序列;OmpA蛋白保守结构域在N端为OM膜通道蛋白超家族,在C端为OmpA_C超家族;OmpA蛋白含有11个优势抗原决定簇区域。结论通过对OmpA进行生物信息学分析获得该蛋白的特性,不仅为进一步研究该蛋白的结构与功能提供参考资料,也为研制相关亚单位疫苗提供理论依据。

关键词：嗜麦芽窄食单胞菌外膜蛋白A 生物信息学结构功能抗原决定簇

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中国2011—2015年登革热疫情分析

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寄生虫与医学昆虫学报 2017年第2期24卷 118-125页

作者：张红张恒端彭志强李剑森肖建鹏林立丰温亮赵彤言军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室解放军95948部队保障部医院广东省疾病预防控制中心广东省公共卫生研究院军事医学科学院疾病预防控制所疾病监测中心

本文探讨了中国2011—2015年登革热疫情的时空分布特征。收集整理中国各省2011—2015年登革热疫情监测数据,应用Arc GIS 9.0软件建立地理信息库,利用Sa TScan7.0软件进行时空聚类分析,确定登革热疫情发生的时空热点区域,再对该热点区域... 详细信息

本文探讨了中国2011—2015年登革热疫情的时空分布特征。收集整理中国各省2011—2015年登革热疫情监测数据,应用Arc GIS 9.0软件建立地理信息库,利用Sa TScan7.0软件进行时空聚类分析,确定登革热疫情发生的时空热点区域,再对该热点区域进一步进行疫情分析。中国2011—2015年登革热疫情呈显著的聚集性分布。一级时空聚类区为广东省2014年10月;存在2个二级聚类区,一个是云南省2015年10月,另一个是江西、福建省2014年9月。登革热的热点区域广东省2013—2015年的时空聚类分析显示,一级聚类区为广州市、东莞市和佛山市,聚类时段为2014年9—10月;二级聚类区为广东省东部的潮州市,聚类时间为2015年9月。我国2011—2015年登革热疫情主要分布于东南沿海区域(以广东省为主)、西南部地区(以云南省为主)。广东省2013—2014年登革发疫情主要聚集于该省的中部地区,2015年高发聚集区东移至该省东部。

关键词：登革热蚊媒传染病时空分布聚类分析

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实施传染病监测是预防控制传染病的有效途径

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中华流行病学杂志 2017年第4期38卷 417-418页

作者：王丽萍曹务春中国疾病预防控制中心传染病预防控制处、传染病监测预警中国疾病预防控制中心重点实验室北京102206 军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

传染病监测是我国疾病预防控制工作的重要内容之一。建国以来，我国传染病监测和报告制度不断完善，技术手段不断革新，在控制传染病暴发流行中发挥了不可替代的作用。当前全球传染病形势仍然较为严峻，传染病监测仍将是防控传染病的有... 详细信息

传染病监测是我国疾病预防控制工作的重要内容之一。建国以来，我国传染病监测和报告制度不断完善，技术手段不断革新，在控制传染病暴发流行中发挥了不可替代的作用。当前全球传染病形势仍然较为严峻，传染病监测仍将是防控传染病的有效途径。本期“传染病监测”栏目的论文，针对不同监测数据进行分析、解释，将成为我国传染病控制研究方面的重要信息，为传染病防控研究提供科学依据。

关键词：传染病监测预防控制

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一种条带免疫印迹试剂用于HIV抗体确证的效果评价

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中国艾滋病性病 2017年第1期23卷 63-64,68页

作者：王晓林梁姝孙国清刘永健常帅李敬云鲍作义军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071 四川省疾病预防控制中心成都610000 河南省疾病预防控制中心郑州450016

目的评估一种条带免疫印迹试剂确证艾滋病病毒(HIV)抗体的效果。方法用蛋白印迹试验(WB)和条带免疫印迹试剂(LIA)平行检测1 035份标本,按照各自的说明书判断结果,对检测结果进行比较和分析。结果总体上,两种试剂检测的一致率为95.3%,对... 详细信息

目的评估一种条带免疫印迹试剂确证艾滋病病毒(HIV)抗体的效果。方法用蛋白印迹试验(WB)和条带免疫印迹试剂(LIA)平行检测1 035份标本,按照各自的说明书判断结果,对检测结果进行比较和分析。结果总体上,两种试剂检测的一致率为95.3%,对经过确证的640份HIV抗体阳性标本(含2份HIV-1O组和2份HIV-2标本)的检测的结果完全一致。在339份WB试剂判断为阴性的标本中,LIA试剂有5份(1.5%)为不确定结果,而在362份LIA试剂判断为阴性的标本中,WB试剂有28份(7.7%)为不确定结果(χ~2=15.29,P<0.001)。在初次检测的341份标本中,确证了17份为HIV抗体阳性,考核试剂检测5份为不确定,12份为阳性。结论 LIA试剂显示出非特异反应暨不确定结果少的优势,可考虑用于HIV抗体的常规确证,并在实际应用中不断改进完善。

关键词：艾滋病病毒抗体确证蛋白印迹试验条带免疫印迹试验艾滋病病毒抗体不确定

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北京大气PM_(2.5)对A549细胞炎性因子及DNA损伤的毒性

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中国环境科学 2016年第5期36卷 1579-1588页

作者：焦周光付绪磊温占波李劲松李娜张柯王洁胡凌飞军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071 渤海大学食品科学与工程学院辽宁锦州121013

为探讨大气PM_(2.5)及其不同组分对人肺上皮细胞A549的毒性作用及其剂量-反应关系,将前期采集的PM_(2.5)颗粒物用不同方法进一步制备PM_(2.5)水溶性组分、PM_(2.5)脂溶性组分和PM_(2.5)单纯颗粒物,将制备的PM_(2.5)颗粒物及其组分以不... 详细信息

为探讨大气PM_(2.5)及其不同组分对人肺上皮细胞A549的毒性作用及其剂量-反应关系,将前期采集的PM_(2.5)颗粒物用不同方法进一步制备PM_(2.5)水溶性组分、PM_(2.5)脂溶性组分和PM_(2.5)单纯颗粒物,将制备的PM_(2.5)颗粒物及其组分以不同浓度(10,50,100,200,400μg/m L)对A549细胞染毒,用MTS法分别在染毒6,10,24,48,72h后测定细胞活力,染毒24h后用ELISA及RT-QPCR法测定炎性因子IL-6和TNF-α表达量,AP位点计数法测定细胞DNA损伤情况.结果表明:除PM_(2.5)水溶性组分外,其余染毒样本高浓度染毒时始终对细胞生长表现出抑制作用,其中低浓度染毒时可在较短时间对细胞生长表现出抑制作用,染毒时间较长时抑制作用减弱或消失,PM_(2.5)水溶性组分对细胞生长抑制作用并不显著;除PM_(2.5)水溶性组分外,其余染毒样本都显著升高了IL-6m RNA的相对表达量和IL-6蛋白的分泌,除PM_(2.5)脂溶性组分外,其余染毒样本都显著升高了TNF-αm RNA的相对表达量;除PM_(2.5)水溶性组分外,其余染毒样本都显著提高了DNA碱基缺失程度.总的来说,PM_(2.5)水溶性组分在抑制细胞活力、造成炎性损伤及DNA损伤方面作用相对较小,而PM_(2.5)所产生的毒性作用并不仅限于其所吸附的复杂成分,其中作为载体的固体核心颗粒对机体可能造成的毒性作用也不容忽视.

关键词： PM2.5 组分 A549 细胞活力炎性因子 DNA损伤

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大肠埃希菌的群体基因组学研究

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中华预防医学杂志 2016年第6期50卷 554-558页

作者：武雅蓉杨瑞馥崔玉军军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

将群体遗传学的理论与方法应用于特定种群多个分离株的全基因组序列中，进行数据挖掘和分析的学科称为群体基因组学（population genomics）。近年来，测序技术的迅猛发展使得低成本、快速获得大量个体全基因组序列成为可能，这推动了... 详细信息

将群体遗传学的理论与方法应用于特定种群多个分离株的全基因组序列中，进行数据挖掘和分析的学科称为群体基因组学（population genomics）。近年来，测序技术的迅猛发展使得低成本、快速获得大量个体全基因组序列成为可能，这推动了群体基因组学在进化领域的广泛应用。本文以经典模式生物大肠埃希菌为例，回顾了大肠埃希菌A、B1、B2、D和E五个基因型之间进化关系的确立历程；总结了基因组突变率、选择信号以及适应性进化模式的分析实例；并对群体基因组学在应对O157：H7和O104：H4菌株所致疫情暴发中的应用进行了综述。这些研究结果说明，尽管发展时间较短，群体基因组学在解析细菌种群结构、探索进化规律以及疾病暴发应对等领域已经发挥了重要作用；加强该学科研究对大肠埃希菌以及其他病原细菌的进化与防控研究工作均有积极意义。

关键词：大肠杆菌基因组遗传学,群体种群结构流行病学

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添加扩增内标的PCR方法快速检测食品中的阪崎克罗诺杆菌

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食品工业科技 2017年第2期38卷 49-52,58页

作者：张德福赵禹宗张明仪淑敏赵文竹汤轶伟李春励建荣渤海大学食品科学与工程学院、辽宁省食品安全重点实验室、生鲜农产品贮藏加工及安全控制技术国家地方联合工程研究中心辽宁锦州121013 军事医学科学院微生物流行病研究所、病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071 渤海大学数理学院辽宁锦州121013

为了解决常规PCR方法检测阪崎克罗诺杆菌时因检测过程中环境和食品理化因素的影响而导致的假阴性结果的产生,本研究以细菌16S rRNA基因为扩增内标对照,以阪崎克罗诺杆菌特异性基因grx B为靶基因设计了一对特异性引物,并通过优化PCR反应... 详细信息

为了解决常规PCR方法检测阪崎克罗诺杆菌时因检测过程中环境和食品理化因素的影响而导致的假阴性结果的产生,本研究以细菌16S rRNA基因为扩增内标对照,以阪崎克罗诺杆菌特异性基因grx B为靶基因设计了一对特异性引物,并通过优化PCR反应条件,最终建立了一种添加扩增内标的阪崎克罗诺杆菌PCR检测方法,可以指示PCR过程中因存在DNA聚合酶抑制剂而导致的假阴性结果。通过对20种细菌进行PCR检测显示,该方法对阪崎克罗诺杆菌具有良好的特异性。灵敏度实验结果表明,该检测方法对阪崎克罗诺菌纯DNA模板的检测灵敏度为2.15×102fg/μL,对阪崎克罗诺杆菌纯培养物的检测灵敏度为9.4×103CFU/m L。对人工污染婴幼儿奶粉的检测结果显示,阪崎克罗诺杆菌接种量为0.94 CFU/g的婴幼儿奶粉样品经过8 h增菌培养后,即可检出。食品样品检测结果表明,不添加扩增内标的PCR检测方法中出现的假阴性结果可被本方法检出。该检测方法特异性强、灵敏度较高,能消除阪崎克罗诺杆菌常规PCR检测方法中可能出现的假阴性结果,适用于婴幼儿配方乳粉、乳制品等食品中阪崎克罗诺杆菌的快速检测。

关键词：阪崎克罗诺杆菌扩增内标假阴性 PCR检测

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TEM-1型β内酰胺酶的原核表达纯化及活性验证

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生物技术通讯 2017年第3期28卷 319-323页

作者：李静徐建余宁年智刘传杰黄洁刘雪超李涛王慧华北理工大学河北唐山063009 军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

目的:产β-内酰胺酶是大肠杆菌、肺炎克雷伯菌等对β内酰胺类抗生素耐药的主要机制之一,该酶能水解青霉素、头孢菌素、碳青酶烯类等多种抗生素,其中TEM型是发现最早且种类最多的β内酰胺酶。探讨TEM-1型β内酰胺酶原核表达载体的构建、... 详细信息

目的:产β-内酰胺酶是大肠杆菌、肺炎克雷伯菌等对β内酰胺类抗生素耐药的主要机制之一,该酶能水解青霉素、头孢菌素、碳青酶烯类等多种抗生素,其中TEM型是发现最早且种类最多的β内酰胺酶。探讨TEM-1型β内酰胺酶原核表达载体的构建、酶的纯化及活性验证。方法:利用PCR技术,以大肠杆菌全基因组为模板钓取TEM-1基因,构建p ET22b(+)-TEM-1表达质粒,经测序鉴定后,转入大肠杆菌Transetta(DE3),IPTG诱导表达、亲和纯化,并通过抗生素水解实验验证其酶活性。结果:构建了可溶性表达TEM-1的工程菌,通过亲和纯化最终获得纯度达90%以上的TEM-1型β内酰胺酶,该酶可水解氨苄西林。结论:获得了对氨苄西林具有水解活性的TEM-1型β内酰胺酶,并对其进行了酶动力学参数检测,验证其抗生素水解特性,有利于对临床抗生素的合理应用做出指导。

关键词： TEM-1 β内酰胺酶表达纯化酶动力学

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铁硫蛋白形成的关键分子BolA同系物3蛋白抗体制备及鉴定

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广西医科大学学报 2017年第4期34卷 601-606页

作者：陈佳唯方军胡童远寇志华孙世惠李军锋周育森广西医科大学南宁530021 军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071 蚌埠医学院蚌埠233000

目的:研究参与铁硫蛋白形成的关键分子BolA同系物3(BolA3)在细胞中的功能,通过重组表达BolA3蛋白,进而免疫制备并鉴定针对该分子的抗体。方法:从人肺癌细胞A549细胞中提取RNA,RT-PCR扩增出BolA3基因,构建BolA3基因重组原核表达载体pQE30... 详细信息

目的:研究参与铁硫蛋白形成的关键分子BolA同系物3(BolA3)在细胞中的功能,通过重组表达BolA3蛋白,进而免疫制备并鉴定针对该分子的抗体。方法:从人肺癌细胞A549细胞中提取RNA,RT-PCR扩增出BolA3基因,构建BolA3基因重组原核表达载体pQE30-BolA3,使用IPTG诱导蛋白表达,Western blotting法鉴定表达中带His标签的重组BolA3蛋白,使用镍(Ni)柱纯化该蛋白。程序免疫大耳白兔,酶联免疫吸附试验(ELISA)方法测定兔血清中抗体滴度。Western blotting法检测制备的抗体与真核表达的BolA3蛋白结合的特异性,并利用已制备的BolA3蛋白抗体检测多种细胞中BolA3内源性表达。结果:克隆的BolA3基因序列与理论序列相一致,原核表达并纯化了BolA3重组蛋白,程序免疫大耳白兔后,获得了高滴度、高特异性的抗体血清。使用所得纯化的BolA3蛋白抗体检测到多种细胞内源性表达BolA3。结论:成功制备针对BolA3的多克隆抗体,为进一步深入研究BolA3蛋白的生物学功能奠定了基础。

关键词： BolA3 铁硫蛋白多克隆抗体

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