检索结果-内蒙古大学图书馆

中国科学：生命科学 2015年第12期45卷 1177-1184页

作者：周冬虎姜颖贺福初军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206

可变剪接是造成生物体内转录组和蛋白质组多样性和复杂性的重要机制.自20世纪80年代间被首次报道以来,人们逐渐意识到生物体内的可变剪接现象广泛存在,其能够调节增殖、分化、发育、凋亡等一系列重要的生物学进程,且机体对其调控有着高... 详细信息

可变剪接是造成生物体内转录组和蛋白质组多样性和复杂性的重要机制.自20世纪80年代间被首次报道以来,人们逐渐意识到生物体内的可变剪接现象广泛存在,其能够调节增殖、分化、发育、凋亡等一系列重要的生物学进程,且机体对其调控有着高度的精密性和统一性.近年来,随着高通量测序技术及生物信息学方法的飞速发展和完善,可变剪接研究领域取得了一系列新的成就,人们对可变剪接的认识也在不断加深,从最初对单一可变剪接事件的研究逐步深入到组学层面的分析:高通量组学数据的不断产出、整合,使得大规模、系统性可变剪接亚型功能的研究成为可能;在更为宏观的领域,组织、器官、物种或生理病理状态下特异性的剪接模式也逐渐为人们所知晓;同时,借助组学手段,剪接层面的临床治疗策略也开始崭露头角,并且有着传统分子治疗无可比拟的优越性.本文从组学的角度出发,回顾了近年来可变剪接领域取得的最新进展,并对其未来在基础及应用领域的发展方向做了初步的展望.

关键词：可变剪接生命组学多组学研究

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一种简单的毛细管色谱柱电加热装置的制作方法及其在液相色谱-质谱联用系统中的应用

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色谱 2015年第6期33卷 563-570页

作者：金祖耀吕雅瑶周珊珊郝斐然付斌应万涛钱小红张养军安徽医科大学安徽合肥230032 蛋白质组学国家重点实验室北京蛋白质组研究中心军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京102206

为了实现蛋白质组的深度覆盖,特别是低丰度蛋白质的定性鉴定和定量分析,目前常用的方法是采用更长或装填更小粒径填料的毛细管色谱柱,但因此带来的问题是色谱柱反向柱压显著升高。针对以上问题发展了一种简单的毛细管色谱柱电加热装置... 详细信息

为了实现蛋白质组的深度覆盖,特别是低丰度蛋白质的定性鉴定和定量分析,目前常用的方法是采用更长或装填更小粒径填料的毛细管色谱柱,但因此带来的问题是色谱柱反向柱压显著升高。针对以上问题发展了一种简单的毛细管色谱柱电加热装置制作方法,并将该装置安装于液相色谱-质谱联用系统,分别以牛血清白蛋白(BSA)酶切肽段混合物和酵母蛋白(yeast)酶切肽段混合物为样品,从柱压和柱效两方面对该装置的性能进行了评价。实验结果表明,所制作的毛细管柱电加热装置安装在装填粒径为3μm反相色谱填料的毛细管柱上,在最佳电流(100 mA)下对BSA及yeast酶切肽段混合物进行分离时的柱压比不加电流时的柱压降低至少50%,柱效略有升高。这说明所制作的毛细管色谱柱电加热装置能显著降低柱压,为在较低的柱压条件下选择更小粒径色谱颗粒填料的毛细管色谱柱提供了一种有效的方法。

关键词：毛细管高效液相色谱-串联质谱蛋白质组学电加热装置柱压柱效

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蛋白质组技术在中药配伍药理学和毒理学机制研究中的应用

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中国药理学与毒理学杂志 2015年第6期29卷 973-978页

作者：程汉兴孙爱华姜颖北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京102206 安徽医科大学合肥安徽230032

配伍用药是中药遣药组方、辨证施治的主要形式和应用特点。组方的宜忌多来自前人经验的总结,大多缺少相应的分子机制研究做配伍的理论支撑。作为规模化研究蛋白质的工具,蛋白质组技术可以从整体水平,较全面地呈现中药多种有效成分进入... 详细信息

配伍用药是中药遣药组方、辨证施治的主要形式和应用特点。组方的宜忌多来自前人经验的总结,大多缺少相应的分子机制研究做配伍的理论支撑。作为规模化研究蛋白质的工具,蛋白质组技术可以从整体水平,较全面地呈现中药多种有效成分进入机体后发挥的多途径、多靶点调控过程,进而揭示中药配伍发挥宜忌作用的分子机制。本文对近年蛋白质组技术,包括双向电泳、荧光双向差异凝胶电泳技术和基于稳定同位素标记的相对和绝对定量技术在中药配伍宜忌和相应的药理毒理学机制研究中的应用进行综述,为进一步探讨中药配伍宜忌原理,更好地实现中药现代化和实际临床用药发展提供理论指导基础。

关键词：中药配伍蛋白质组药理学毒理学

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基于“菌心说”学说从人菌平衡角度揭示中医“藏象学说”的物质基础

基于“菌心说”学说从人菌平衡角度揭示中医“藏象学说”的物质基...

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第十八届中国科协年会

作者：张成岗军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室全军军事认知与心理卫生研究中心北京 100850

“藏象学说”可以说是中医的灵魂，然而却一直难以为现代医学所理解，从而难以促进中医现代化的实现。结合国际上关于肠道菌群的相关研究，以及我们实验室的大量实证性研究工作，我们意外发现有可能可以从人体与人体共生微生物菌群角度... 详细信息

“藏象学说”可以说是中医的灵魂，然而却一直难以为现代医学所理解，从而难以促进中医现代化的实现。结合国际上关于肠道菌群的相关研究，以及我们实验室的大量实证性研究工作，我们意外发现有可能可以从人体与人体共生微生物菌群角度揭示中医“藏象学说”的物质基础，认为中医的“藏”可能对应于人体共生菌群尤其是肠道菌群、而中医的“象”则可能对应于人体本身，因此，中医“藏象学说”可以被理解为从人体和肠道菌群平衡的角度对于人体结构与功能进行合理解释的一种学说，在此基础上我们提出了“菌心说”学说，不仅支持中医“藏象学说”的学术观点，而且认为人体肠道菌群赋予人体饥饿感、驱动人体产生吃饭的动机，并影响甚至主导人的情感和欲望等情商相关问题，而人脑则主导人的智商。因而，从这个角度可以比较容易理解中医的“脏腑理论”中的几个关键问题，包括“脾胃不和”、“心与小肠相表里”、“肺与大肠相表里”等，结合“菌心说”学说来看，中医的“脾”、“心”、“肺”可能指的是胃、小肠、大肠中的人体共生微生物菌群，构成了“脏腑理论”中“脏”的部分内容，而“腑”的相应内容则分别与西医解剖结构“胃”、“小肠”、“大肠”相一致。在此基础上，可以合理推测穴位以及经络等中医的概念，有可能是中医的“藏”即西医的微生物群体通过人体的相应组织形成的特殊结构，既与神经系统相密切关联，同时又有其特殊的存在和运行通路即经络和脉络体系。一个健康的人体必须确保人体与人体共生微生物菌群的平衡，否则就会表现出亚健康和慢病等症状。为此，基于“菌心说”学说，从人菌平衡角度，有可能揭示中医“藏象学说”的物质基础，将为中医现代化找到关键的科学支点，也将为针灸、经络、穴位以及中药的研发与评价提供新的线索。

关键词：藏象学说菌心说人菌平衡针灸经络穴位肠道菌群中医西医生物学微生物学

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氧化石墨烯固定化凝集素的制备及在糖蛋白/糖肽富集中的应用

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色谱 2015年第2期33卷 116-122页

作者：时照梅范超黄俊杰白海红秦伟捷蔡耘钱小红安徽医科大学研究生学院安徽合肥230032 军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206

生物体内蛋白质的糖基化修饰调控着细胞识别、细胞黏附和迁移以及免疫应答等多种生理过程,并与多种人类重大疾病的发生、发展密切相关。因此对蛋白质糖基化修饰的鉴定,不仅能够为生物学机理研究提供重要信息,对疾病诊断标志物和治疗靶... 详细信息

生物体内蛋白质的糖基化修饰调控着细胞识别、细胞黏附和迁移以及免疫应答等多种生理过程,并与多种人类重大疾病的发生、发展密切相关。因此对蛋白质糖基化修饰的鉴定,不仅能够为生物学机理研究提供重要信息,对疾病诊断标志物和治疗靶标的发现也至关重要。然而在复杂生物体系中,大多数糖蛋白为低丰度蛋白质,其含量与现有质谱仪器的检测灵敏度之间存在较大差距,所以对含有不同糖型结构的糖蛋白进行全面/高效的富集,是实现高灵敏度糖蛋白鉴定的必由之路。凝集素富集作为一种有效的糖蛋白富集方法,已在糖蛋白质组学研究中得到了广泛的应用。针对现有凝集素功能化材料存在负载量偏低以及富集效率有限等问题,我们制备了两种以氧化石墨烯(GO)为载体的新型固定化凝集素,利用GO比表面积大,功能基团含量高,分散性、化学稳定性好等特点,实现了高负载量的凝集素固定(GO-ConA 2.073 mg/mg,RSD=1.0%;GO-WGA 1.908 mg/mg,RSD=0.14%)。同时考察了材料的可重复使用性与稳定性:每隔3天测一次同一GO-lectin材料对对应糖蛋白的富集效果,可以看出材料合成两周内富集效果都>200μg/mg。将该GO-lectin成功应用于糖蛋白、糖肽的选择性富集,在糖蛋白质组学研究中体现出良好的应用潜力。

关键词：凝集素氧化石墨烯富集糖蛋白糖肽

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泛素连接酶-底物选择关系的研究进展

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生物技术通报 2015年第1期31卷 11-20页

作者：李杨李栋军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206

泛素是一种包含76个氨基酸的小分子蛋白。泛素共价结合到底物的过程称为泛素化修饰。泛素化修饰过程是一个由级联的泛素激活酶、泛素结合酶和泛素连接酶所介导的复杂过程,泛素化修饰具有高效、ATP依赖、高度特异的特点。泛素化修饰与细... 详细信息

泛素是一种包含76个氨基酸的小分子蛋白。泛素共价结合到底物的过程称为泛素化修饰。泛素化修饰过程是一个由级联的泛素激活酶、泛素结合酶和泛素连接酶所介导的复杂过程,泛素化修饰具有高效、ATP依赖、高度特异的特点。泛素化修饰与细胞周期调控、细胞凋亡、转录调控、DNA损伤修复等一系列生物学过程密切相关。在泛素化修饰过程中,泛素连接酶对底物的识别,是决定泛素化修饰特异性的关键环节。泛素连接酶底物识别的相关机制研究不断被报道,鉴定泛素连接酶底物的高通量方法也在不断的改进和发展。随着实验研究的不断深入,实验数据的不断产出,利用生物信息学进行泛素连接酶底物的研究也开始受到关注。对泛素连接酶识别底物的相关机制、高通量泛素连接酶底物的鉴定方法、泛素连接酶底物的生物信息学研究和生物信息学在泛素连接酶底物研究中的发展方向进行讨论。

关键词：泛素化修饰泛素连接酶底物生物信息学

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肝星状细胞的去活化机制与抗肝纤维化治疗

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中华肝脏病杂志 2015年第1期23卷 77-80页

作者：劳远翔贺福初姜颖北京协和医学院基础学院、中国医学科学院基础医学研究所 100005 军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室

肝纤维化是一个可逆的瘢痕反应,发生在几乎所有的慢性肝损伤的患者中,一般是由肝纤维化导致肝硬化,以节结形成和肝脏收缩为主要特征.理解肝纤维化的分子基础很重要,因为纤维化反应是几乎所有肝脏疾病后期并发症的基础,包括门静脉高压,腹... 详细信息

肝纤维化是一个可逆的瘢痕反应,发生在几乎所有的慢性肝损伤的患者中,一般是由肝纤维化导致肝硬化,以节结形成和肝脏收缩为主要特征.理解肝纤维化的分子基础很重要,因为纤维化反应是几乎所有肝脏疾病后期并发症的基础,包括门静脉高压,腹水,肝性脑病,合成功能障碍以及代谢能力损害等,所以肝纤维化既是对肝细胞的直接功能损害,也是门静脉阻力增加的直接原因.对肝纤维化进行全面研究将有助于控制肝脏疾病的发生及发展.

关键词：肝硬化肝星状细胞机制

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基于液相色谱-质谱联用的肝微粒体中药物代谢酶定量方法研究进展

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色谱 2015年第6期33卷 553-557页

作者：王欢欢吕雅瑶彭博钱小红张养军广西医科大学药学院广西南宁530021 军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206

肝微粒体中的药物代谢酶是参与药物代谢的主要酶类,不管是合成药物,还是组成复杂的中药,主要经过肝脏中药物代谢酶的代谢转化成易于排泄的化合物。由于药物代谢酶的表达水平具有较大的个体差异性,因此,药物代谢酶的准确定量对药物的药... 详细信息

肝微粒体中的药物代谢酶是参与药物代谢的主要酶类,不管是合成药物,还是组成复杂的中药,主要经过肝脏中药物代谢酶的代谢转化成易于排泄的化合物。由于药物代谢酶的表达水平具有较大的个体差异性,因此,药物代谢酶的准确定量对药物的药理、药物相互作用和临床应用具有重要意义。本文综述了近十年来药物代谢酶定量方法的研究进展。

关键词：药物代谢酶定量方法液相色谱-质谱综述

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Ras相关C3肉毒毒素底物1(Rac1)多克隆抗体的制备及应用

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细胞与分子免疫学杂志 2015年第8期31卷 1120-1123页

作者：张莉莉郝露左威马维佳刘莹安徽医科大学研究生学院安徽合肥230032 军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室北京蛋白质组研究中心抗体工程研究室北京102206

目的制备抗Ras相关C3肉毒毒素底物1(Rac1)兔多克隆抗体并进行初步应用。方法以人宫颈癌细胞系He La细胞c DNA为模板,构建重组表达质粒p ET-32a-Rac1。His-Rac1融合蛋白在大肠杆菌中成功表达,将纯化后的融合蛋白作为免疫原免疫家兔制备... 详细信息

目的制备抗Ras相关C3肉毒毒素底物1(Rac1)兔多克隆抗体并进行初步应用。方法以人宫颈癌细胞系He La细胞c DNA为模板,构建重组表达质粒p ET-32a-Rac1。His-Rac1融合蛋白在大肠杆菌中成功表达,将纯化后的融合蛋白作为免疫原免疫家兔制备兔多克隆抗体。分别采用ELISA、Western blot法和免疫组织化学技术对抗Rac1抗血清的效价及特异性进行鉴定。结果 His-Rac1融合蛋白成功构建并高效表达。制备的抗Rac1兔多克隆抗体可以检测到He La细胞、MCF-7细胞的Rac1蛋白,并能识别人肾组织中的Rac1蛋白。结论成功制备了兔抗人Rac1多克隆抗体,该抗体可以识别多种天然样本中的Rac1蛋白。

关键词： Rac1 原核表达多克隆抗体

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长链非编码RNA功能的研究进展及其与癌症的关系

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生物物理学报 2015年第2期31卷 79-89页

作者：屠欣怡宋瑾贺福初周钢桥清华大学生命科学学院北京100084 军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京100850

长链非编码RNA(long noncoding RNA,lnc RNA)是指长度在200个核苷酸以上且不能编码蛋白质的RNA。lnc RNA起初被认为是转录噪声,但后续研究表明,许多lnc RNA只在机体特定生理状态的特定部位表达,或是只在某些特定的生物过程中表达,对特定... 详细信息

长链非编码RNA(long noncoding RNA,lnc RNA)是指长度在200个核苷酸以上且不能编码蛋白质的RNA。lnc RNA起初被认为是转录噪声,但后续研究表明,许多lnc RNA只在机体特定生理状态的特定部位表达,或是只在某些特定的生物过程中表达,对特定lnc RNA的基因敲低可导致表型改变,从而证明了其是有功能的。事实上,目前的lnc RNA研究几乎覆盖所有的生理学和病理学过程,也包括癌症的发生发展。癌症是细胞失控生长所导致的一类疾病,是每年人口死亡的主要原因之一,其发生、发展机理与相应治疗策略的研究,已成为当今的一大课题。近年来,越来越多的lnc RNA被证明参与了癌症的多种发生发展过程,从而逐渐成为预防与治疗癌症的新突破口。文章就lnc RNA目前已知的功能及其与癌症的关系做一综述。

关键词：长链非编码RNA 癌症

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