检索结果-内蒙古大学图书馆

中国科学：生命科学 2016年第12期46卷 1345-1353页

作者：赵文娟杨冬贺福初军事医学科学院放射与辐射医学研究所国家蛋白质科学中心(北京)北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206

胚胎干细胞(ESC)在发育过程中分化为内胚层、中胚层和外胚层3个胚层.其中内胚层进一步向终末细胞的分化,是形成整个消化道和呼吸道,以及肝脏、胰腺等器官的基础.ESC形成内胚层主要经历以下几个分化阶段:外胚叶的分化、原条的形成、内胚... 详细信息

胚胎干细胞(ESC)在发育过程中分化为内胚层、中胚层和外胚层3个胚层.其中内胚层进一步向终末细胞的分化,是形成整个消化道和呼吸道,以及肝脏、胰腺等器官的基础.ESC形成内胚层主要经历以下几个分化阶段:外胚叶的分化、原条的形成、内胚层与中胚层的分离以及定型内胚层的形成.本文主要从信号通路、转录因子以及表观遗传调控等几个方面综述胚胎干细胞向内胚层分化的分子机制,并重点介绍其组学研究进展,以期为该领域研究者提供重要参考信息.

关键词：胚胎干细胞内胚层信号通路表观遗传组学

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开管毛细管色谱柱的制备及其在蛋白质组学研究中的应用进展

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色谱 2016年第3期34卷 226-231页

作者：周珊珊翟睿焦丰龙郝斐然吕雅瑶钱小红张养军广西医科大学广西南宁530021 军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206

近年来随着生命科学等领域的深入发展,人们对微量样本分离分析的需求越来越高,液相色谱系统的微量化受到了更多的关注。由于开管毛细管色谱柱具有较低的反向压力,可通过采用更长的色谱柱提高柱效,从而实现对复杂生物样本的高效分离,因... 详细信息

近年来随着生命科学等领域的深入发展,人们对微量样本分离分析的需求越来越高,液相色谱系统的微量化受到了更多的关注。由于开管毛细管色谱柱具有较低的反向压力,可通过采用更长的色谱柱提高柱效,从而实现对复杂生物样本的高效分离,因而成为液相色谱柱新的发展方向。本文对开管毛细管色谱柱的制备方法及应用进展进行了综述。

关键词：毛细管液相色谱开管毛细管色谱柱多孔层蛋白质组学综述

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多反应监测方法评估丹参和人参对大鼠肝药酶的调控作用

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中草药 2016年第20期47卷 3647-3655页

作者：程汉兴孙爱华王宇光高月姜颖安徽医科大学合肥安徽230032 军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206 军事医学科学院放射与辐射医学研究所药理毒理研究室北京100850

目的建立新型特异性强的高通量细胞色素P450(CYP)丰度测定方法,以人参和丹参为工具药考察药物对肝药酶的调控作用。方法采用基于质谱多反应监测(MRM)模式方法,以串联配体法(QconCAT)表达合成的重标肽段作为内标对丹参与人参处理后,对9... 详细信息

目的建立新型特异性强的高通量细胞色素P450(CYP)丰度测定方法,以人参和丹参为工具药考察药物对肝药酶的调控作用。方法采用基于质谱多反应监测(MRM)模式方法,以串联配体法(QconCAT)表达合成的重标肽段作为内标对丹参与人参处理后,对9种大鼠肝脏CYP(CYP1A1、CYP1A2、CYP2B1、CYP2B2、CYP2C6、CYP2C11、CYP3A1、CYP3A2、CYP17A1)蛋白特异肽段进行定量,探讨丹参和人参对肝脏CYP酶的表达上调或者下调作用。结果 QconCAT重标合成内标肽段与肝脏样品肽段质谱表征一致,与对照组相比,丹参与人参作用后,对大鼠肝内CYP1A1、CYP2B2的表达均具有下调作用,对CYP1A2、CYP2B1的表达均具有上调作用。丹参同时下调CYP3A2、CYP2C11和CYP17A1的表达,而人参则上调这3种蛋白的表达。建立了MRM方法对大鼠肝脏CYP蛋白定量方法,定量方法相对标准偏差在5.9%以内,相对误差在6.8%以内,定量标准曲线的线性系数大于0.9。结论对9种大鼠肝脏CYP酶进行定量研究,其中CYP2B1、CYP2B2和CYP17A1是首次进行蛋白质定量研究。丹参与人参对CYP亚型产生的调控作用存在差异性,为药物配伍实践中提供临床参考价值,避免不良药物相互作用反应。

关键词：人参丹参 CYP450 多反应监测药物配伍

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人体微生态尤其是肠道微生态为新药研发提供前所未有的机遇和挑战

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中国药理学与毒理学杂志 2016年第7期30卷 703-713页

作者：张成岗军事医学科学院放射与辐射医学研究所、蛋白质组学国家重点实验室、全军军事认知与心理卫生研究中心北京100850

进入21世纪以来,国内外慢病高发的态势并没有得到有效控制,对医学和药学领域提出了新的挑战,无论是化学药、生物药还是中药的研发与评价,都面临着如何显著提升药效、降低其毒副作用即增敏促效的极其迫切的现实需求。随着精准医疗和大数... 详细信息

进入21世纪以来,国内外慢病高发的态势并没有得到有效控制,对医学和药学领域提出了新的挑战,无论是化学药、生物药还是中药的研发与评价,都面临着如何显著提升药效、降低其毒副作用即增敏促效的极其迫切的现实需求。随着精准医疗和大数据时代的到来,为新药研发、老药新用等提出了新的机遇与挑战。然而,由于目前不断认识到由人体共生微生物群体所构成的人体微生态系统尤其是肠道微生态系统在人体健康与疾病方面越来越重要的作用,甚至与部分疾病如肥胖和糖尿病具有一定程度的因果关系,因此,对于目前药物研发甚至当前医学理论体系的一些核心思路提出了新的思考,只有从根本上对这些核心问题进行正确分析,才有可能让新药研发在新的时期以创新的方式走出传统路线,为真正有效实现慢病防控事业做出新的贡献。本文结合国内外人体微生态尤其是肠道微生态领域的研究进展,系统分析当前新药研发存在的问题,提出如何分别从人体、人体微生态和人体与人体微生态平衡这3个角度综合出发,破解当前慢病高发时期新药研发所面临和困扰的难题,期望能够促进新药研发以及慢病防控事业又好又快地发展,为我国人民身心健康服务。

关键词：人体微生态肠道微生态肠道菌群新药研发中药菌心说人菌平衡

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泛素、泛素链和蛋白质泛素化研究进展

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生物工程学报 2016年第1期32卷 14-30页

作者：兰秋艳高媛李衍常洪学传徐平武汉大学药学院组合生物合成与新药发现教育部重点实验室湖北武汉430072 军事医学科学院放射与辐射医学研究所国家蛋白质科学中心(北京)北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206

蛋白质泛素化是以泛素单体和泛素链作为信号分子,共价修饰细胞内其他蛋白质的一种翻译后修饰形式。不同蛋白质底物、同一底物的不同氨基酸修饰位点以及同一位点上泛素链连接方式的不同均可导致细胞效应的差异。蛋白质泛素化在真核细胞... 详细信息

蛋白质泛素化是以泛素单体和泛素链作为信号分子,共价修饰细胞内其他蛋白质的一种翻译后修饰形式。不同蛋白质底物、同一底物的不同氨基酸修饰位点以及同一位点上泛素链连接方式的不同均可导致细胞效应的差异。蛋白质泛素化在真核细胞内广泛存在,除了介导蛋白质的26S蛋白酶体降解途径之外,还广泛参与了基因转录、蛋白质翻译、信号传导、细胞周期控制以及生长发育等几乎所有的生命活动过程。泛素链的形成及其修饰过程的任何失调均可导致生物体内环境的紊乱,从而产生严重的疾病。文中结合实验室研究,综述了泛素的发现历史、基因特点、晶体结构,特别是泛素链的组装过程、结构、功能以及与人类相关疾病关系的新进展,可为这些疾病的治疗靶点和药物靶标的研究提供思路。

关键词：泛素泛素链晶体结构赖氨酸残基疾病

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基于固定化Pronase E酶与质谱的糖链结构分析方法

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分析试验室 2016年第1期35卷 1-6页

作者：张曼丽于子翔钱小红应万涛安徽医科大学军事医学科学院合肥230032 蛋白质组学国家重点实验室北京蛋白质组研究中心军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京102206

位点特异性糖链结构的解析,是糖蛋白质结构分析面临的巨大挑战。Pronase E蛋白水解酶,能够降解糖蛋白或糖肽中大部分的氨基酸序列,而保留糖链与少量氨基酸的序列,与色谱、质谱分析等联用,可以实现糖链结构的鉴定,同时,保留的氨基酸序列... 详细信息

位点特异性糖链结构的解析,是糖蛋白质结构分析面临的巨大挑战。Pronase E蛋白水解酶,能够降解糖蛋白或糖肽中大部分的氨基酸序列,而保留糖链与少量氨基酸的序列,与色谱、质谱分析等联用,可以实现糖链结构的鉴定,同时,保留的氨基酸序列可以辅助实现修饰位点的识别,两者结合,可以获取位点特异性糖链结构的信息。但Pronase E酶解的缺点是,酶解效率较低,常需要较高浓度的蛋白酶。本实验将Pronase E固定化在基质上,固定化后的Pronase E具备较高的局部浓度,从而实现目标糖蛋白的快速高效酶解。采用核糖核酸酶B作为标准糖蛋白,优化了Pronase E酶切的方案,包括酶切时蛋白与酶的用量比、酶切时间、固定化Pronase E酶的有效贮存时间等;同时优化选择了糖链的富集方法,并对于基质辅助激光解吸飞行时间质谱分析中,糖链适合的基质进行对比选择,从而获得更好的糖链谱图及更为丰富的糖链结构信息。

关键词：糖蛋白糖链结构固定化Pronase E 基质辅助激光解吸飞行时间质谱

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蛋白质水解酶和样品预处理优化技术在蛋白质组学研究中的应用

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生物工程学报 2016年第3期32卷 306-316页

作者：吴飞林赵明治张瑶熊智徐平西南林业大学生命科学学院云南昆明650224 军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室国家蛋白质科学中心(北京)北京蛋白质组研究中心蛋白质药物国家工程研究中心北京102206 中国科学院微生物研究所北京100101

蛋白质组学是全景式鉴定、定量蛋白质,并研究蛋白质功能的学科。基于高分辨质谱的鸟枪法蛋白组学研究技术首先利用不同的位点特异性蛋白酶对复杂蛋白质样品进行酶解,进而利用质谱获得蛋白质相关的定性和定量信息。为了获得高质量的质谱... 详细信息

蛋白质组学是全景式鉴定、定量蛋白质,并研究蛋白质功能的学科。基于高分辨质谱的鸟枪法蛋白组学研究技术首先利用不同的位点特异性蛋白酶对复杂蛋白质样品进行酶解,进而利用质谱获得蛋白质相关的定性和定量信息。为了获得高质量的质谱信息,前期的样品处理和质谱数据采集同样重要。本文对蛋白组学中常用的Trypsin、Lys-C、Glu-C等位点特异性蛋白酶的酶切特点进行了总结,并综述了目前常用的几种酶切组合策略和样本预处理技术在提高蛋白质组学研究效率中的作用。

关键词：蛋白质组学蛋白质水解酶多种酶组合技术过滤器辅助样品制备技术

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常见拷贝数变异与疾病的关联研究

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中华医学遗传学杂志 2016年第3期33卷 388-391页

作者：杨菲曹鹏博周钢桥中南大学生命科学学院国家重点遗传学实验室长沙410083 军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京100850

基因组多态性主要包括单核苷酸变异（single nucleotide variation，SNV）、易位、插入以及拷贝数变异（copy number variation，CNV）等形式，其中CNV是结构变异的一种形式。人们按照CNV在人群中的发生频率将其分为常见CNV和罕见CNV。... 详细信息

基因组多态性主要包括单核苷酸变异（single nucleotide variation，SNV）、易位、插入以及拷贝数变异（copy number variation，CNV）等形式，其中CNV是结构变异的一种形式。人们按照CNV在人群中的发生频率将其分为常见CNV和罕见CNV。常见CNV已经逐渐成为疾病关联研究新的遗传标记。多项研究已经证明CNV与疾病的发生风险密切相关，例如神经发育类疾病、病毒感染疾病、慢性炎症性疾病和肿瘤等。随着高分辨率基因组分型芯片技术和全基因组测序技术的发展，人类基因组的CNV图谱逐渐被完善和细化。对于CNV的深入研究不仅有助于对人类基因组结构变异和遗传进化的进一步理解，还将使人们对个体间的遗传差异以及影响疾病的遗传因素产生新的认识。同时科技的进步也促使了CNV研究方法的多样化以及CNV相关疾病研究种类的多样化。本文就CNV的特点、作用机制、检测方法以及常见CNV与人类疾病发生的关联研究进行综述。

关键词：常见拷贝数变异疾病关联研究

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人乳腺癌肿瘤移植裸鼠模型的构建及其肿瘤浸润髓系细胞的分离

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军事医学 2016年第7期40卷 561-563,568页

作者：王兴柳迪唐丽贺福初军事医学科学院放射与辐射医学研究所，蛋白质组学国家重点实验室北京102206

目的人乳腺癌肿瘤移植裸鼠模型的构建及其肿瘤浸润髓系细胞的分离。方法将p HAGE-EF-Zs GDEST质粒与病毒包装质粒p MD2.G和ps PAX2首先通过磷酸钙转染方式包装带绿色荧光的慢病毒,再利用包装好的慢病毒感染BT474细胞,通过流式分选筛选... 详细信息

目的人乳腺癌肿瘤移植裸鼠模型的构建及其肿瘤浸润髓系细胞的分离。方法将p HAGE-EF-Zs GDEST质粒与病毒包装质粒p MD2.G和ps PAX2首先通过磷酸钙转染方式包装带绿色荧光的慢病毒,再利用包装好的慢病毒感染BT474细胞,通过流式分选筛选阳性细胞,扩大培养后,种植于裸鼠乳腺脂肪垫,应用活体荧光成像仪和体外测量肿瘤大小,对人-裸鼠肿瘤移植模型的构建效果进行评价;通过机械法分离该小鼠模型的肿瘤浸润髓系细胞。结果筛选出带绿色荧光的BT474稳定株,种植于裸鼠乳腺脂肪垫,构建了人-裸鼠肿瘤移植模型,并分离出其肿瘤浸润髓系细胞。结论成功分离出了肿瘤浸润髓系细胞,为后续研究肿瘤浸润髓系细胞的功能奠定了基础。

关键词：乳腺肿瘤肿瘤移植鼠模型肿瘤浸润髓系细胞慢病毒

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相对和绝对定量同位素标记技术在肝细胞癌蛋白质组学中的应用研究进展

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中华肝脏病杂志 2016年第12期24卷 952-955页

作者：齐英姿陈凌声徐平军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京100850 广西大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室南宁530005

肝细胞癌以其异质性强、早期诊断难、预后不良和致死率高等特点，成为危害我国国民健康的重要疾病。准确的早期诊断对于提高肝癌切除手术的成功率和降低术后复发与转移至关重要，其关键是早期诊断生物标志物的筛选和验证。以同位素标记... 详细信息

肝细胞癌以其异质性强、早期诊断难、预后不良和致死率高等特点，成为危害我国国民健康的重要疾病。准确的早期诊断对于提高肝癌切除手术的成功率和降低术后复发与转移至关重要，其关键是早期诊断生物标志物的筛选和验证。以同位素标记相对和绝对定量技术、基于预定同位素标记氨基酸的细胞培养技术等为代表的定量蛋白质组学技术是蛋白质组学技术重要的组成部分，其中前者因其通量高、定量精度高、不受样品来源限制等优势成为定量蛋白质组学技术中的支柱型技术。现就该技术在肝细胞癌发生、发展过程的分子机制及其标志物的筛选研究进展进行综述，为深入理解肝细胞癌发生发展的分子机制和这些新发现的生物标志物的开发创造条件。

关键词：肝肿瘤蛋白质组学同位素标记肿瘤标志物同位素标记相对和绝对定量技术

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