检索结果-内蒙古大学图书馆

分析化学 2012年第2期40卷 177-183页

作者：隋少卉董俊军王京兰蔡耘钱小红防化学院三系军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室北京蛋白质组研究中心

比较分析了强阳离子交换(SCX)与等电聚焦(IPG-IEF)技术在磷酸化蛋白质组学中的应用。采用3种标准磷酸化蛋白对SCX与IPG-IEF两种技术对磷酸化肽段富集的有效性进行考察。以HepG2细胞为复杂样本,考察SCX与IPG-IEF在实际样本中的应用情况。... 详细信息

比较分析了强阳离子交换(SCX)与等电聚焦(IPG-IEF)技术在磷酸化蛋白质组学中的应用。采用3种标准磷酸化蛋白对SCX与IPG-IEF两种技术对磷酸化肽段富集的有效性进行考察。以HepG2细胞为复杂样本,考察SCX与IPG-IEF在实际样本中的应用情况。对SCX与IPG-IEF技术在18O标记的磷酸化蛋白质组定量研究中的应用情况进行考察。蛋白鉴定采用高准确度、高灵敏度、高分辨率的LTQ-FTICR-MS/MS质谱仪。实验表明:SCX和IPG-IEF在大规模磷酸化肽段分离过程中均有效;在复杂样本中,SCX技术的分离效果优于IPG-IEF;IPG-IEF的重复性好于SCX;在磷酸化蛋白质组定量分析结果表明,IPG-IEF技术的稳定性优于SCX。本研究为根据不同实验目的而选择适当的磷酸化蛋白质组预分离技术提供了有用信息。

关键词：磷酸化肽段分离强阳离子交换等电聚焦傅里叶交换离子回旋质谱

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GIT2与TRAF1协同调控NF-κB通路的机制

GIT2与TRAF1协同调控NF-κB通路的机制

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细胞—生命的基础——中国细胞生物学学会2013年全国学术大会·武汉

作者：刘博雅贺福初王建北京工业大学生命科学与生物工程学院军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京白质组研究中心国家蛋白质组学国家重点实验室蛋白质药物国家工程研究中心

核因子κB(nuclear factor-kappaB,NF-κB)是一类具有多向转录调节作用的转录因子,调节免疫和炎症反应,在很多生物学过程中发挥重要作用,例如先天免疫和适应性免疫,胚胎发育和肿瘤形成。TRAF(The TNF receptor-associated factor)家族... 详细信息

核因子κB(nuclear factor-kappaB,NF-κB)是一类具有多向转录调节作用的转录因子,调节免疫和炎症反应,在很多生物学过程中发挥重要作用,例如先天免疫和适应性免疫,胚胎发育和肿瘤形成。TRAF(The TNF receptor-associated factor)家族是一组结构相似的脚手架蛋白,它们介导TNFR超家族成员引起的细胞凋亡。TRAF1由于可以和TNFR2相互作用而被发现,

关键词： GIT2 TRAF1 NF-κB

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应用氨基酸稳定同位素标记-质谱技术构建肺癌细胞14-3-3 sigma相互作用的分子网络

应用氨基酸稳定同位素标记-质谱技术构建肺癌细胞14-3-3 sigma相...

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全国肿瘤病因学和肿瘤流行病学学术会议

作者：肖汀米薇李敏曾邦荣冯林程书钧高燕宁 100021 北京中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院肿瘤研究所分子肿瘤学国家重点实验室军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质研究中心蛋白质组学国家重点实验室

目的：筛选14-3-3 sigma在非小细胞肺癌细胞中的功能相关蛋白,构建相互作用的分子网络.方法：构建稳定过表达14-3-3 sigma蛋白的非小细胞肺癌细胞株(PG细胞,大细胞肺癌),四甲基偶氮唑蓝(MTT)方法检测PG细胞的生长速度.利用稳定同位素标... 详细信息

目的：筛选14-3-3 sigma在非小细胞肺癌细胞中的功能相关蛋白,构建相互作用的分子网络.方法：构建稳定过表达14-3-3 sigma蛋白的非小细胞肺癌细胞株(PG细胞,大细胞肺癌),四甲基偶氮唑蓝(MTT)方法检测PG细胞的生长速度.利用稳定同位素标记氨基酸(stable isotope labeling by amino acids in cell culture, SILAC)技术,联合线性离子阱回旋共振质谱仪(LC-LTQ-FT)鉴定由14-3-3 sigma过表达引起的差异表达蛋白,将质谱鉴定为表达＞2倍或＜0.5倍的蛋白作为差异蛋白.通过检索人类蛋白参考数据库(Human protein reference database,HPRD)和蛋白质交互作用网络数据库(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)构建分子网络.结果：鉴定结果显示C4克隆中外源14-3-3 sigma表达量最高(命名为PGSC4),后续实验用PGSC4细胞进行.转染14-3-3 sigma后,PG细胞生长速度明显减慢.建立了包含147个蛋白差异蛋白的数据库.构建的分子网络中含有26个蛋白,其中参与了多个细胞活动(细胞周期调控、细胞分化、凋亡等)的重要激酶——酪蛋白激酶Ⅱα亚基(casein kinaseⅡsubunit alpha,CSNK2A1)是表达升高最明显的蛋白质,与DNA损伤调节机制相关的转录调节因子MEN1 (Menin)则是表达降低幅度最大的蛋白质.结论：14-3-3 sigma可以抑制非小细胞肺癌PG细胞的生长速度,与细胞周期、DNA损伤修复等机制相关的蛋白质发生了变化,并构成了相互作用的分子网络.

关键词： 14-3-3蛋白质类肺肿瘤细胞培养氨基酸稳定同位素标记-质谱技术 PG细胞分子网络

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全麻药物对突触可塑性影响的研究进展

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国际麻醉学与复苏杂志 2013年第1期34卷 81-84页

作者：仇焕容张成岗叶铁虎中国医学科学院中国协和医科大学北京协和医院麻醉科 100730 军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室全军军事认知与心理卫生研究中心

背景全麻药物作用于中枢神经系统的多种神经递质和受体靶点，而这些又恰恰是神经突触可塑性相关机制中的重要成分或结构，通过调节突触可塑性进而对学习记忆功能产生广泛而多样的作用。目的推进对全麻药物麻醉机理的认识。内容分析全麻... 详细信息

背景全麻药物作用于中枢神经系统的多种神经递质和受体靶点，而这些又恰恰是神经突触可塑性相关机制中的重要成分或结构，通过调节突触可塑性进而对学习记忆功能产生广泛而多样的作用。目的推进对全麻药物麻醉机理的认识。内容分析全麻药物对大脑突触可塑性影响的研究进展趋向为临床麻醉药物的合理使用、减少术中知晓和术后认知功能障碍等相关并发症的发生提供科学依据。

关键词：全麻药物突触可塑性长时程增强长时程抑制树突棘

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新型肝损伤血清标志物Pep5定量检测方法的建立及临床应用

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检验医学与临床 2013年第20期10卷 2641-2643页

作者：傅海媛侯利平周晓明黄亚娟宋纯艳孙云波汪洋杨保安肖汉族甄蓓魏开华王海滨解放军总医院北京100853 军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室国家蛋白质科学中心(北京) 安徽省芜湖市第二人民医院北京102206 北京正旦国际科技有限责任公司 241000 湖南金健药业有限责任公司北京102206 解放军三○二医院常德415001

目的建立定量检测血清多肽Pep5的酶联免疫吸附方法(ELISA),用于判定肝损伤进程的研究。方法以待测血清样本稀释液包被酶联板,5%脱脂奶粉封闭,辣根过氧化物酶标记的抗Pep5单克隆抗体作为标记抗体,建立定量检测人血清多肽Pep5的ELISA,并... 详细信息

目的建立定量检测血清多肽Pep5的酶联免疫吸附方法(ELISA),用于判定肝损伤进程的研究。方法以待测血清样本稀释液包被酶联板,5%脱脂奶粉封闭,辣根过氧化物酶标记的抗Pep5单克隆抗体作为标记抗体,建立定量检测人血清多肽Pep5的ELISA,并用于临床检测690例肝损伤及健康血清样本。结果灵敏度为1.25ng/mL;线性范围(0～24ng/mL)内相关系数为0.998 7;与乙酰胆碱酯酶、层黏连蛋白、透明质酸、三型前胶原交叉反应率小于1.00%;添加回收率在99.09%～107.08%;批内、批间变异系数(CV)分别为5.62%～7.32%、6.21%～6.45%。与其他肝损伤指标乙酰胆碱酯酶试剂盒进行对比试验,表明两种检测方法有一定的相关性(r=0.68)。临床检测结果表明血清多肽Pep5水平随着肝损伤程度加重而升高,与正常血清差异有统计学意义(P<0.01)。结论多肽Pep5可用于肝损伤进程定量血清学检测,检测方法简便、可靠,为后续深入研究多肽Pep5的功能及相关诊断试剂盒的研制和开发提供了科学依据。

关键词：多肽Pep5 酶联免疫吸附法肝损伤血清学诊断

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人VEGF165和小鼠VEGF164共同抗原表位分析及验证

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中国生物制品学杂志 2012年第8期25卷 989-994页

作者：刘英富霍景瑞范国才孙志贤王清明蛋白质组学国家重点实验室北京蛋白质组研究中心军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京102206

目的分析人VEGF165和小鼠VEGF164的共同抗原表位,为血管内皮生长因子(Vascular endothelial growth factor,VEGF)表位疫苗的设计和验证奠定基础。方法分析人VEGF165和小鼠VEGF164蛋白与KDR结合的关键位点,确定其共同表位。将共同表位插... 详细信息

目的分析人VEGF165和小鼠VEGF164的共同抗原表位,为血管内皮生长因子(Vascular endothelial growth factor,VEGF)表位疫苗的设计和验证奠定基础。方法分析人VEGF165和小鼠VEGF164蛋白与KDR结合的关键位点,确定其共同表位。将共同表位插入到VEGF骨架蛋白中,扩增含共同表位的骨架蛋白基因,与原核表达载体pET-24a连接,构建重组表达质粒pET-24a-FV,转化大肠杆菌BL21(DE3),IPTG诱导表达,表达产物经Sephacryl S-100凝胶柱进行纯化,纯化的蛋白进行SDS-PAGE分析。以纯化的表位展示蛋白免疫小鼠,获得免疫血清,ELISA法测定血清效价,Western blot和间接免疫荧光法检测免疫小鼠血清对小鼠VEGF164和VEGF165的识别。结果人VEGF165和小鼠VEGF164共同抗原表位为KDR 40s loop结合区的EYPDEIEYIFKP;重组表达质粒经双酶切及测序证明构建正确;表位展示蛋白主要以包涵体形式表达,表达量占菌体总蛋白的20%,纯度可达92%;小鼠VEGF164和人VEGF165均能与小鼠免疫血清发生反应,血清效价达到1∶104;免疫血清不仅能识别表位展示蛋白,还能识别小鼠VEGF164和人VEGF165单体和二聚体,还可与人HeLa、小鼠B16肿瘤细胞之间存在阳性反应,表明表位展示蛋白能展示VFGF的共同抗原表位。结论骨架蛋白展示的VEGF164和VEGF165共同表位免疫小鼠后,能产生针对这两个蛋白的特异免疫反应,证实EYPDEIEYIFKP表位是VEGF164和VEGF165的共同抗原表位。

关键词：血管内皮生长因子抗原表位免疫

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肝细胞癌的微环境研究进展

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生物化学与生物物理进展 2012年第5期39卷 416-422页

作者：刘志磊孙薇贺福初丛宪玲姜颖安徽医科大学研究生学院合肥230032 军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206 吉林大学中日联谊医院长春130031

越来越多的研究表明,肿瘤细胞与其周围微环境的交互作用是肿瘤发生、上皮间质转化、肿瘤浸润和转移的关键调节因素.肝细胞癌的微环境可以分为细胞组分和非细胞组分.主要的细胞组分包含:肝星形细胞、肿瘤相关的纤维母细胞、免疫细胞和肝... 详细信息

越来越多的研究表明,肿瘤细胞与其周围微环境的交互作用是肿瘤发生、上皮间质转化、肿瘤浸润和转移的关键调节因素.肝细胞癌的微环境可以分为细胞组分和非细胞组分.主要的细胞组分包含:肝星形细胞、肿瘤相关的纤维母细胞、免疫细胞和肝窦内皮细胞等.非细胞组分包含:胞外基质蛋白、酶类、各种生长因子和炎症因子等.综述了近年来肝细胞癌的微环境研究进展,分别从细胞组分和非细胞组分及其之间的相互作用角度对肝细胞癌微环境作一介绍.

关键词：肝细胞癌肿瘤微环境组织间隙液

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基于质谱的选择反应监测技术相关策略和方法的研究进展

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生物化学与生物物理进展 2012年第11期39卷 1118-1127页

作者：常乘吴松锋马洁张伟朱云平军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206 国防科学技术大学机电工程与自动化学院自动控制系长沙410073

随着蛋白质组学研究的不断深入,基于质谱的选择反应监测技术(SRM)已经成为以发现生物标志物为代表的定向蛋白质组学研究的重要手段.SRM技术根据假设信息,特异性地获取符合假设条件的质谱信号,去除不符合条件的离子信号干扰,从而得到特... 详细信息

随着蛋白质组学研究的不断深入,基于质谱的选择反应监测技术(SRM)已经成为以发现生物标志物为代表的定向蛋白质组学研究的重要手段.SRM技术根据假设信息,特异性地获取符合假设条件的质谱信号,去除不符合条件的离子信号干扰,从而得到特定蛋白质的定量信息.SRM技术具有更高的灵敏度和精确性、更大的动态范围等优势.该技术可分为实验设计、数据获取和数据分析三个步骤.在这几个步骤中,最重要的是利用生物信息学手段总结当前实验数据的结果,并用机器学习方法和总结的经验规则进行SRM实验的母离子和子离子对的预测.针对数据质控和定量的生物信息学方法研究在提高SRM数据可靠性方面具有重要作用.此外,为方便SRM的研究,本文还收集、汇总了SRM技术相关的软件、工具和数据库资源.随着质谱仪器的不断发展,新的SRM实验策略以及分析方法、计算工具也应运而生.结合更优化的实验策略、方法,采用更精准的生物信息学算法和工具,SRM在未来蛋白质组学的发展中将发挥更加重要的作用.

关键词：定向蛋白质组学生物质谱选择反应监测技术蛋白质特异性肽段母离子-子离子对

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基于固相萃取的微量糖蛋白糖基化修饰表征技术的建立

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分析化学 2012年第7期40卷 1019-1024页

作者：江静韩欢欢马成王继峰应万涛钱小红蛋白质组学国家重点实验室北京蛋白质组研究中心军事医学科学院放射与辐射医学研究所中国人民解放军总医院军医进修学院蛋白质药物国家工程研究中心

结合自制亲水固相萃取富集柱和生物质谱鉴定技术,实现了糖基化蛋白质核糖核酸酶B的糖含量测定、糖基化位点确认、聚糖富集及结构表征,以及不同糖型相对丰度分析。结果表明:其糖含量8.47%,糖基化位点为34位的Asn,糖链主要为5种高甘露糖... 详细信息

结合自制亲水固相萃取富集柱和生物质谱鉴定技术,实现了糖基化蛋白质核糖核酸酶B的糖含量测定、糖基化位点确认、聚糖富集及结构表征,以及不同糖型相对丰度分析。结果表明:其糖含量8.47%,糖基化位点为34位的Asn,糖链主要为5种高甘露糖型结构(Man5-9GlcNAc2)。所建立的HILIC富集技术,有利于针对微量生物样本,如生物工程药物糖蛋白及重要功能糖蛋白,开展位点特异性糖链结构解析,为糖蛋白质的药效或功能研究提供线索。

关键词：糖蛋白亲水固相萃取基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱线性离子阱傅里叶变换离子回旋共振质谱仪

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肝纤维化发生发展及逆转过程中肝巨噬细胞亚群分类

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中国生物化学与分子生物学报 2012年第10期28卷 879-887页

作者：陈芳艳贺福初姜颖军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206

肝纤维化是由持续性损伤修复反应引起的,导致肝组织内细胞外基质异常沉积,进一步引发肝脏结构和肝功能异常改变的一种病理过程.已有大量研究表明,肝纤维化在去除损伤因素后是可以逆转的.肝星状细胞作为主要的效应细胞,合成和分泌各种胶... 详细信息

肝纤维化是由持续性损伤修复反应引起的,导致肝组织内细胞外基质异常沉积,进一步引发肝脏结构和肝功能异常改变的一种病理过程.已有大量研究表明,肝纤维化在去除损伤因素后是可以逆转的.肝星状细胞作为主要的效应细胞,合成和分泌各种胶原和细胞外基质,一直被认为是肝纤维化发生发展的中心环节.最近的研究发现,巨噬细胞作为主要的调节细胞,能同时调节肝星状细胞的功能和基质胶原的降解,促进肝纤维化的形成.而在肝纤维化逆转过程中,促使活化的肝星状细胞凋亡和纤维胶原的降解,促进肝纤维化的逆转.目前已有研究表明,巨噬细胞亚群在肝纤维化发生发展及逆转中具有双向调控作用,但是对于动物模型体内还没有系统的研究巨噬细胞亚群的分类.本文对巨噬细胞亚群的分类研究做一个全面的综述,对肝脏巨噬细胞在肝纤维化中分子机制的进一步研究具有一定的参考价值和借鉴意义.

关键词：肝纤维化巨噬细胞亚群 Kupffer细胞

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