检索结果-内蒙古大学图书馆

生物化学与生物物理进展 2014年第2期41卷 126-138页

作者：陈雨晗张令强贺福初军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室北京100850

泛素化是常见的蛋白质翻译后修饰方式之一,其参与了生物体内细胞分裂与分化、生长发育、转录调节、损伤应激、免疫应答等多方面的生理活动.近年来,泛素研究领域的重要成员之一——去泛素化酶(deubiquitylating enzymes)被不断发现和报道... 详细信息

泛素化是常见的蛋白质翻译后修饰方式之一,其参与了生物体内细胞分裂与分化、生长发育、转录调节、损伤应激、免疫应答等多方面的生理活动.近年来,泛素研究领域的重要成员之一——去泛素化酶(deubiquitylating enzymes)被不断发现和报道.作为一类可以移除泛素的异肽酶类,去泛素化酶具有结构和功能的多样性.基因表达调控一直是分子遗传学的研究热点,系统整理和总结去泛素化酶与基因表达调控的关系具有重要意义.本文综述了去泛素化酶与基因表达调控的关系,包括去泛素化酶与染色质稳态维持、细胞周期调控和DNA损伤修复等三个方面,并对该领域未来的研究方向进行了预测和讨论.

关键词：去泛素化酶基因表达调控染色质调节细胞周期调节 DNA损伤应激

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金属标记结合高效液相色谱-选择离子监测质谱的蛋白质绝对定量新方法

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色谱 2014年第4期32卷 361-368页

作者：李佳斌周廉淇颜辉李楠楠郝斐然田芳张养军蛋白质组学国家重点实验室北京蛋白质组研究中心军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京 102206

建立了金属标记结合高效液相色谱-选择性离子监测质谱（SIM）的蛋白质绝对定量新方法。实验考察了金属标记效率、金属标记的稳定性、标记后肽段的色谱保留和质谱行为、新定量方法的线性范围和准确度。实验结果表明金属标记具有标记效率... 详细信息

建立了金属标记结合高效液相色谱-选择性离子监测质谱（SIM）的蛋白质绝对定量新方法。实验考察了金属标记效率、金属标记的稳定性、标记后肽段的色谱保留和质谱行为、新定量方法的线性范围和准确度。实验结果表明金属标记具有标记效率高，稳定性好，色谱保留行为一致等优点。另外，金属标记-选择离子监测质谱绝对定量方法灵敏度高，其定量限低至1 fmol，线性范围为1-500 fmol，线性范围内 R2值大于0.99，具有良好的线性关系；经过测量，标准肽段的回收率为117.01％，说明该方法具有较高的准确度。将该方法应用于腾冲嗜热菌中烯醇酶蛋白的定量分析，相对标准偏差为5.47％，表明该方法的精密度高。以上结果表明该方法可以用于生物样本中的蛋白质的绝对定量分析，为比较简单的生物样本中蛋白质的绝对定量方法提供了一种新的选择。

关键词：金属标记高效液相色谱选择离子监测质谱蛋白质绝对定量

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磷酸化蛋白质组学的新进展及其在肝脏生理和病理机制中的应用

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生物工程学报 2014年第7期30卷 1004-1017页

作者：衣泰龙田苗苗杨晓明徐平安徽医科大学安徽合肥230032 军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206 军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206

蛋白质磷酸化是最常见的蛋白质翻译后修饰形式。由于蛋白质的磷酸化形式可以被磷酸酶和磷酸激酶进行可逆的调控,所以在众多的生命活动过程中蛋白质的磷酸化修饰起着重要的调控作用,因此对生物体内蛋白质磷酸化修饰的系统研究对于揭示生... 详细信息

蛋白质磷酸化是最常见的蛋白质翻译后修饰形式。由于蛋白质的磷酸化形式可以被磷酸酶和磷酸激酶进行可逆的调控,所以在众多的生命活动过程中蛋白质的磷酸化修饰起着重要的调控作用,因此对生物体内蛋白质磷酸化修饰的系统研究对于揭示生命科学的奥秘显得十分重要。近年来,随着质谱技术和生物信息学软件以及磷酸化肽段富集方法的发展,利用质谱对生物体内蛋白质磷酸化修饰研究的技术逐渐成熟。肝脏作为人体最重要的代谢和免疫器官,深入研究肝脏细胞内蛋白质磷酸化修饰形式对于理解其功能具有重要指导意义。目前,迅速发展的磷酸化蛋白质组学技术已经被广泛应用到肝脏功能的生物学研究中。这些研究加深了人们对肝脏的生理及病理状态的分子生物学机制的了解。本文综述了当前磷酸化蛋白质组学的研究进展和磷酸化蛋白质组学在肝脏中的研究。

关键词：蛋白质磷酸化肝脏磷酸化蛋白质组磷酸化肽富集定量蛋白质组生物信息学

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用于同位素稀释质谱法的一种新的标准曲线计算方法及其在药物代谢酶绝对定量中的应用

用于同位素稀释质谱法的一种新的标准曲线计算方法及其在药物代谢...

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第二十届全国色谱学术报告会

作者：周珊珊王欢欢张养军钱小红军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京市中关村生命科学院路33号102206

细胞色素P450 酶(CYP)和尿苷二磷酸葡萄糖醛酸基转移酶(UGT)酶是药物进行代谢重要的药物代谢酶.这些酶量的不同对药物的生物利用度具有很大的影响,导致药物在不同个体具有不同的药代动力学和毒理学行为1.目前,稳定同位素稀释多反应监测... 详细信息

细胞色素P450 酶(CYP)和尿苷二磷酸葡萄糖醛酸基转移酶(UGT)酶是药物进行代谢重要的药物代谢酶.这些酶量的不同对药物的生物利用度具有很大的影响,导致药物在不同个体具有不同的药代动力学和毒理学行为1.目前,稳定同位素稀释多反应监测质谱(SID-MRM MS)已经成为复杂生物样本中药物代谢酶定量分析的常用方法.

关键词：细胞色素P450酶(CYP) 尿苷二磷酸葡萄糖醛酸基转移酶(UGT)酶基体干扰多反应监测(MRM)

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一种简单的毛细管色谱柱电加热装置的制作方法

一种简单的毛细管色谱柱电加热装置的制作方法

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中国化学会第十二届全国分析化学年会

作者：吕雅瑶金祖耀薛瑞卿张养军钱小红军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京市昌平区生命科学园路33 号102206

随着蛋白质组学研究的深入,毛细管高效液相色谱-质谱联用技术已经成为蛋白质、蛋白质组定性鉴定和定量分析的常用分析方法1.由于生物样品中蛋白质种类繁多,动态范围宽,难于实现蛋白质组的深度覆盖,特别是难于实现对低丰度蛋白质的定性...

随着蛋白质组学研究的深入,毛细管高效液相色谱-质谱联用技术已经成为蛋白质、蛋白质组定性鉴定和定量分析的常用分析方法1.由于生物样品中蛋白质种类繁多,动态范围宽,难于实现蛋白质组的深度覆盖,特别是难于实现对低丰度蛋白质的定性鉴定和定量分析,而疾病相关的蛋白质标志物通常以低丰度的形式存在,因此,发展高灵敏度和高通量的液质联用方法显得非常迫切.

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高丰度蛋白的消减策略

高丰度蛋白的消减策略

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中国化学会第十二届全国分析化学年会

作者：杨景晶钱小红应万涛蔡耘蛋白质组学国家重点实验室北京蛋白质组研究中心军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京市昌平区生命园路33号北京102206

复杂生物体内的蛋白质、因不同修饰所产生的蛋白质异构体数量多达数百万种,其表达丰度具有很宽的动态范围,理化性能也存在很大的差异.高丰度蛋白异构体因表达量高而易于被分离鉴定,但中低丰度蛋白本身由于丰度低,且在分离与鉴定过程中,...

复杂生物体内的蛋白质、因不同修饰所产生的蛋白质异构体数量多达数百万种,其表达丰度具有很宽的动态范围,理化性能也存在很大的差异.高丰度蛋白异构体因表达量高而易于被分离鉴定,但中低丰度蛋白本身由于丰度低,且在分离与鉴定过程中,易受到高丰度蛋白的干扰,难以有效鉴定,因此,中低丰度蛋白的有效分离和鉴定是深度覆盖蛋白质组研究中遇到的最大挑战,促使新的富集或鉴定方法的开发.

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原核生物蛋白质基因组学研究进展

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生物工程学报 2014年第7期30卷 1026-1035页

作者：张成普徐平朱云平军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室国家蛋白质科学中心(北京)北京蛋白质组研究中心蛋白质药物国家工程研究中心北京102206

随着基因组测序技术的不断发展,大量微生物基因组序列可以在短时间内得以准确鉴定。为了进一步探究基因组的结构与功能,基于序列特征与同源特征的基因组注释算法广泛应用于新测序物种。然而受基因组测序质量以及算法本身准确性偏低等问... 详细信息

随着基因组测序技术的不断发展,大量微生物基因组序列可以在短时间内得以准确鉴定。为了进一步探究基因组的结构与功能,基于序列特征与同源特征的基因组注释算法广泛应用于新测序物种。然而受基因组测序质量以及算法本身准确性偏低等问题的影响,现有的基因组注释存在着相当比例的假基因以及注释错误,尤其是蛋白质N端的注释错误。为了弥补基因组注释的不足,以基因芯片或RNA-seq为核心的转录组测序技术和以串联质谱为核心的蛋白质组测序技术可以高通量地对基因的转录和翻译产物进行精确测定,进而实现预测基因结构的实验验证。然而,原核生物细胞中存在的大量非编码RNA给转录组测序技术引入了污染数据,限制了其对基因组注释的应用。相对而言,以串联质谱技术为核心的蛋白质组学测序可以在短时间内鉴定到生物体内大量的蛋白质,实现注释基因的验证甚至校准。已成为基因组注释和重注释的重要依据,并因而衍生了"蛋白质基因组学"的新研究方向。文中首先介绍传统的基于序列预测和同源比对的基因组注释算法,指出其中存在的不足。在此基础上,结合转录组学与蛋白质组学的技术特点,分析蛋白质组学对于原核生物基因组注释的优势,总结现阶段大规模蛋白质基因组学研究的进展情况。最后从信息学角度指出当前蛋白质组数据进行基因组重注释存在的问题与相应的解决方案,进而探讨未来蛋白质基因组学的发展方向。

关键词：蛋白质基因组学原核生物基因组注释质谱

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Meta-analysis在多种组学领域的应用

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生物工程学报 2014年第7期30卷 1094-1104页

作者：韩明飞朱云平军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室国家蛋白质科学中心(北京)北京蛋白质组研究中心蛋白质药物国家工程研究中心北京102206

Meta-analysis作为一种整合多特征、多数据的统计方法,上世纪90年代被引入生命科学领域。随着高通量测序技术的快速发展,以基因组学、转录组学和蛋白质组学为核心的生命组学逐渐成为生命科学研究的新热点。海量数据的快速产出推动了组... 详细信息

Meta-analysis作为一种整合多特征、多数据的统计方法,上世纪90年代被引入生命科学领域。随着高通量测序技术的快速发展,以基因组学、转录组学和蛋白质组学为核心的生命组学逐渐成为生命科学研究的新热点。海量数据的快速产出推动了组学研究的发展,也引发了数据规模过大、难以系统整合等问题。针对上述情况,meta-analysis被广泛地应用于分析各组学数据,方法也不断得到改进。本文系统总结了有代表性的meta-analysis方法,考察了目前meta-analysis在多个组学领域的应用现状,最后讨论了meta-analysis尚待解决的问题并展望未来的发展方向。

关键词： meta-analysis 基因组学转录组学蛋白质组学

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中国蛋白质组学研究进展——以人类肝脏蛋白质组计划和蛋白质组学技术发展为主题

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中国科学：生命科学 2014年第12期44卷 1099-1112页

作者：李衍常李宁徐忠伟翟琳辉樊锋旭常乘张成普郑俊杰徐平贺福初中国人民解放军军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室国家蛋白质科学中心(北京)北京蛋白质组研究中心蛋白质药物国家工程研究中心北京102206 安徽医科大学研究生学院合肥230032

蛋白质组学是对细胞或生物体全部蛋白质的系统鉴定、定量并阐释其生物学功能的学科.自21世纪初期开始,随着高精度、高灵敏度和快速扫描质谱仪的出现和快速发展以及微量蛋白质组样品高效分离技术的进步,蛋白质组学获得了快速发展,并在生... 详细信息

蛋白质组学是对细胞或生物体全部蛋白质的系统鉴定、定量并阐释其生物学功能的学科.自21世纪初期开始,随着高精度、高灵敏度和快速扫描质谱仪的出现和快速发展以及微量蛋白质组样品高效分离技术的进步,蛋白质组学获得了快速发展,并在生理过程与病理机制研究等几乎所有生命科学研究领域得到了广泛的应用.过去10年,中国蛋白质组学研究在政府的支持和广大蛋白质组学研究人员的努力下呈现出腾飞式的发展态势.本文综述了人类肝脏蛋白质组计划和2010-2013年中国蛋白质组学技术的发展.

关键词：蛋白质组学人类肝脏蛋白质组计划蛋白质相互作用蛋白质翻译后修饰生物信息学

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实时荧光定量PCR的数据分析方法

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生物技术通讯 2015年第1期26卷 140-145页

作者：易健明屈武斌张成岗军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室全军军事认知与心理卫生研究中心北京100850 安徽医科大学研究生院安徽合肥230032

实时荧光定量PCR是目前检测目的核酸拷贝数及分析靶基因在mRNA表达水平相对变化的主流技术。研究表明,分析结果的准确性依赖于数据分析方法的可靠性。我们简要综述实时荧光定量PCR的数据分析方法。

关键词：实时荧光定量PCR 绝对定量相对定量动力学法

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