检索结果-内蒙古大学图书馆

军事医学 2011年第1期35卷 21-24,43页

作者：石锦平任长虹李媛张继业范礼斌张成岗安徽医科大学生命科学学院生物学教研室安徽合肥230032 军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室北京100850

目的以秀丽隐杆线虫为模式生物制备人源脑红蛋白(human neuroglobin,hNgb)转基因线虫,初步探讨外源性hNgb对线虫寿命和产卵率的影响。方法通过显微注射方法制备hNgb转基因线虫,使用蛋白印迹和免疫组织化学进行鉴定。使用野生型N2和增强... 详细信息

目的以秀丽隐杆线虫为模式生物制备人源脑红蛋白(human neuroglobin,hNgb)转基因线虫,初步探讨外源性hNgb对线虫寿命和产卵率的影响。方法通过显微注射方法制备hNgb转基因线虫,使用蛋白印迹和免疫组织化学进行鉴定。使用野生型N2和增强型绿色荧光蛋白(EGFP)转基因线虫作为对照组,测量转基因线虫的寿命和产卵率。结果成功获得hNgb转基因株系线虫,其寿命和产卵率与野生型N2和EGFP转基因线虫相比,差异无统计学意义。结论外源性hNgb转基因不影响线虫的发育和正常生理功能,可用于Ngb功能的深入研究。

关键词：脑红蛋白秀丽隐杆线虫转基因株系产卵率寿命

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社会失败应激致抑郁样行为动物模型的研究

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军事医学 2011年第3期35卷 193-196页

作者：张飞龙徐志伟范礼斌张成岗安徽医科大学生命科学学院生物学教研室合肥230032 军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室全军军事认知与心理卫生研究中心北京100850

目的探讨社会失败应激抑郁模型建立的可行性及有效性。方法连续给予C57BL/6小鼠社会失败心理应激21 d,应激结束24 h后依次通过社会交互实验、开场实验、糖水偏爱实验等评价手段,对小鼠进行抑郁行为评价。结果与对照组相比,社会失败应... 详细信息

目的探讨社会失败应激抑郁模型建立的可行性及有效性。方法连续给予C57BL/6小鼠社会失败心理应激21 d,应激结束24 h后依次通过社会交互实验、开场实验、糖水偏爱实验等评价手段,对小鼠进行抑郁行为评价。结果与对照组相比,社会失败应激导致C57BL/6小鼠出现显著焦虑样行为,而仅有50%-60%的社会失败应激小鼠出现社会逃避及兴趣缺失的抑郁样行为,表现为应激易感。其他应激小鼠评价结果与对照组无差异,未出现抑郁样行为,表现出应激抗性。结论通过社会失败应激,为建立一种新的抑郁动物模型提供了实验依据。

关键词：社会失败易感表型抑郁模型,动物应激抗抑郁药

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Apak的组织表达谱及其白血病相关性分析

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军事医学 2011年第2期35卷 100-103页

作者：窦睿郭兴田春艳曾慧敏艾辉胜张令强范礼斌安徽医科大学生命科学学院生物学教研室合肥230032 军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京100850 中国医学科学院北京协和医学院基础医学院北京100730 解放军307医院北京100071

目的探讨P53负调控蛋白Apak的组织分布特征并分析其白血病相关性。方法利用组织斑点杂交分析Apak在多种组织中的分布情况,Northern杂交分析其在5种白血病细胞系的转录,并用RT-PCR分析Apak在32例白血病患者和12例健康人外周血中的mRNA水... 详细信息

目的探讨P53负调控蛋白Apak的组织分布特征并分析其白血病相关性。方法利用组织斑点杂交分析Apak在多种组织中的分布情况,Northern杂交分析其在5种白血病细胞系的转录,并用RT-PCR分析Apak在32例白血病患者和12例健康人外周血中的mRNA水平。结果 Apak的组织表达谱分析表明该基因只在胎肝、胎脾以及成人唾液腺、膀胱、左右心室和心尖中高表达。在多种白血病细胞系Jurkat,AHH-1,MOLT-4,SKO-007和HL-60和部分白血病患者的外周血中Apak也呈现高转录,提示Apak在白血病发生中可能发挥重要功能。结论本研究揭示了Apak是一种具有组织特异性分布的P53负调节蛋白,其在白血病中的高表达提示其可能与该病的发生有一定的关联。

关键词：肿瘤抑制蛋白P53 Apak 组织表达谱白血病细胞系,肿瘤细胞周期转录因子

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利用MPprimer设计引物并优化扩增条件以提高多重PCR效率的实验研究

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生物化学与生物物理进展 2010年第3期37卷 342-346页

作者：王稳屈武斌申志勇任长虹刘虎岐张成岗军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室医学神经生物学国家重点实验室北京100850 西北农林科技大学生命科学学院杨凌712100

多重PCR技术广泛应用于多个研究领域,其中引物设计及扩增条件是提高多重PCR实验效率的关键因素.为探讨优化多重PCR实验的方法,以小鼠5个看家基因为研究对象,使用实验室新近开发的MPprimer程序设计多重PCR引物,并通过改变多种反应条件来... 详细信息

多重PCR技术广泛应用于多个研究领域,其中引物设计及扩增条件是提高多重PCR实验效率的关键因素.为探讨优化多重PCR实验的方法,以小鼠5个看家基因为研究对象,使用实验室新近开发的MPprimer程序设计多重PCR引物,并通过改变多种反应条件来优化多重PCR实验.结果表明,MPprimer程序能够设计出理想的多重PCR引物,并且通过对退火温度及延伸时间进行优化,可显著提高多重PCR实验效率,对于提高基因表达的规模化检测能力具有积极的促进作用.

关键词： PCR 多重PCR 引物设计 MPprimer

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不均一性核糖核蛋白(hnRNP)在中枢神经系统中的作用

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军事医学科学院院刊 2010年第1期34卷 80-83页

作者：刘一沉任长虹王航雁张成岗军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室医学神经生物学国家重点实验室北京100850 解放军总医院小儿内科北京100853

不均一性核糖核蛋白(heterogeneous nuclear ribonucleoprotein,hnRNP)是一类可参与mRNA前体剪接、mRNA转运和降解等多种功能的RNA结合蛋白。目前发现hnRNP家族蛋白也参与了神经细胞、神经胶质细胞的生长调控过程,并且与多种中枢神经系... 详细信息

不均一性核糖核蛋白(heterogeneous nuclear ribonucleoprotein,hnRNP)是一类可参与mRNA前体剪接、mRNA转运和降解等多种功能的RNA结合蛋白。目前发现hnRNP家族蛋白也参与了神经细胞、神经胶质细胞的生长调控过程,并且与多种中枢神经系统疾病的发生发展密切相关。该文对hnRNP的结构、功能及其在中枢神经系统中的作用进行综述,旨在为理解神经系统疾病的分子机制提供新线索。

关键词：不均一性核糖核蛋白神经细胞神经胶质细胞中枢神经系统神经系统疾病

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秀丽线虫缺氧相关剪接调节因子的筛查

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西北农林科技大学学报（自然科学版） 2010年第7期38卷 197-202页

作者：张继业任长虹庞剑会李稚锋刘虎岐张成岗西北农林科技大学生命科学学院陕西杨凌712100 军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室医学神经生物学国家重点实验室北京100850

【目的】基于RNA干涉文库,寻找与秀丽线虫缺氧损伤表型相关的剪接调节因子。【方法】利用喂饲RNA干涉(RNA interference,RNAi)文库筛选技术,对秀丽线虫基因组中的351个RNA结合蛋白(RNA bindingprotein,RBP)基因进行筛选。【结果】经过2... 详细信息

【目的】基于RNA干涉文库,寻找与秀丽线虫缺氧损伤表型相关的剪接调节因子。【方法】利用喂饲RNA干涉(RNA interference,RNAi)文库筛选技术,对秀丽线虫基因组中的351个RNA结合蛋白(RNA bindingprotein,RBP)基因进行筛选。【结果】经过2次筛选共得到5个与缺氧相关的RBP编码基因,其中剪接因子1个,参与mRNA翻译过程的基因4个。【结论】剪接调节因子可能在mRNA的剪接和翻译水平上参与低氧应答。

关键词：喂饲RNAi文库筛选秀丽线虫缺氧 RNA结合蛋白

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蛋白酶体激活因子REGγ的重组表达及其体外功能的初步探讨

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军事医学科学院院刊 2010年第1期34卷 5-7,11页

作者：吴敏聂晶张令强汪渊安徽医科大学分子生物学实验室和生物化学与分子生物学教研室合肥230032 军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京100850

目的蛋白酶体激活因子11S调节蛋白复合物γ亚单位(11S regulator complex gamma subunit,REGγ)的重组表达,初步探讨其与骨形成负调控分子酪蛋白激酶-2相互作用蛋白-1(caseinkinase-2interactingprotein-1,CK-IP-1)的相互作用。方法首先以质粒pCMV-Myc-REGγ为模板,通过聚合酶链反应(PCR)扩增出765bp的REGγcDNA片段,然后亚克隆到原核表达载体pGEX-4T-2并转化入大肠杆菌BL21经IPTG诱导表达,表达产物超声破碎后进行SDS-PAGE和Western印迹鉴定,进而通过GSTPull-down实验验证REGγ是否与CKIP-1存在相互作用。结果通过测序证实原核表达载体pGEX-4T-2-REGγ构建成功,进一步表达鉴定发现GST-REGγ蛋白主要以可溶性的形式存在于裂解上清中;GSTPull-down实验表明REGγ与CKIP-1存在明显的相互作用。结论REGγ与CKIP-1在体外存在相互作用,为进一步深入研究REGγ对CKIP-1的调控作用奠定了基础。

关键词：重组表达质粒蛋白酶体激活因子REGγ 酪蛋白激酶-2相互作用蛋白-1 聚合酶链反应

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利用RT-PCR技术验证基于小鼠外显子芯片发现的缺血相关基因的表达

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生物技术通讯 2010年第3期21卷 299-303页

作者：王稳周瑞杭兴宜任长虹刘虎岐张成岗西北农林科技大学生命科学学院陕西杨凌712100 军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室医学神经生物学国家重点实验室北京100850

目的:利用RT-PCR技术验证并确认基于小鼠外显子芯片发现的部分缺血相关基因的表达,以鉴定候选基因的外显子是否发生可变剪接,从而实现对外显子芯片结果的鉴定。方法:根据生物信息学分析结果,选取小鼠外显子芯片中的3个基因(Ube3c,633043... 详细信息

目的:利用RT-PCR技术验证并确认基于小鼠外显子芯片发现的部分缺血相关基因的表达,以鉴定候选基因的外显子是否发生可变剪接,从而实现对外显子芯片结果的鉴定。方法:根据生物信息学分析结果,选取小鼠外显子芯片中的3个基因(Ube3c,6330439K17Rik,Atp7a),在预测发生可变剪接的外显子两侧设计上下游引物,PCR后进行凝胶回收,再克隆到载体中进行测序。结果:RT-PCR及测序结果表明,Ube3c基因在6号外显子、6330439K17Rik基因在12号外显子、Atp7a基因在3号外显子发生可变剪接,与芯片预测结果一致。结论:RT-PCR技术可针对外显子芯片的结果进行可靠性验证,为可变剪接基因表达研究提供了一种有效手段。

关键词：可变剪接外显子外显子芯片缺血相关基因 RT-PCR

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转录因子结合位点生物信息学研究进展

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遗传 2009年第4期31卷 365-373页

作者：侯琳钱敏平朱云平邓明华北京大学数学科学学院北京100871 军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京100850 北京大学理论生物学中心北京100871

转录因子结合位点(Transcription factor binding site,TFBS)是与转录因子结合的DNA序列,它们与转录因子相互作用调控基因的转录过程。确定TFBS是理解转录调控机制,建立转录调控网络的关键问题。随着高通量实验技术的发展,结合ChIP-chi... 详细信息

转录因子结合位点(Transcription factor binding site,TFBS)是与转录因子结合的DNA序列,它们与转录因子相互作用调控基因的转录过程。确定TFBS是理解转录调控机制,建立转录调控网络的关键问题。随着高通量实验技术的发展,结合ChIP-chip实验以及多个基因组的序列信息来预测TFBS已成为新的研究热点。本文简要概述了用于TFBS定位的实验技术,TFBS信息相关的数据库,重点评述了描述TFBS的模型以及预测TFBS的多种软件。TFBS的生物信息学研究的发展,将与相关领域相互促进,有助于进一步揭示转录调控机制。

关键词：转录因子结合位点生物信息学 ChIP—chip 位置权重矩阵系统发育足迹分析法

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外显子芯片的数据分析和可变剪接预测的新算法

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军事医学科学院院刊 2009年第5期33卷 465-468,472页

作者：杭兴宜邓明华孙志贤张成岗军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室北京100850 北京大学数学科学学院北京大学理论生物学中心北京100871

可变剪接(alternative splicing)是产生高等真核生物蛋白质多样性的重要分子调控机制之一,众多研究表明,可变剪接可以改变蛋白质的结构和功能从而导致多种人类疾病。外显子芯片是Affymetrix公司开发的全基因组范围内检测外显子表达的高... 详细信息

可变剪接(alternative splicing)是产生高等真核生物蛋白质多样性的重要分子调控机制之一,众多研究表明,可变剪接可以改变蛋白质的结构和功能从而导致多种人类疾病。外显子芯片是Affymetrix公司开发的全基因组范围内检测外显子表达的高通量芯片系统,可通过检测外显子的差异表达来推断可变剪接事件。和传统的3′基因表达芯片相比,外显子芯片不仅探针(probe)设计的密度大,而且覆盖了全转录本中所有已知和预测的外显子。外显子芯片的数据分析包含基因和外显子两个水平的分析流程以及可变剪接预测部分。由于使用常规的芯片分析方法并不能有效地预测可变剪接事件,因此本文就现有的外显子芯片分析方法和流程进行综述,并着重介绍可变剪接事件预测的新算法。

关键词：外显子芯片可变剪接算法基因表达

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