检索结果-内蒙古大学图书馆

医学分子生物学杂志 2004年第6期1卷 344-346页

作者：李力张令强贺福初军事医学科学院放射医学研究所基因组学与蛋白质组学研究室北京市100850

SR蛋白是在真核生物RNA剪接中发挥重要功能的一类剪接因子。它们可以结合特定的RNA ,参与识别 5′及 3′剪接位点 ,与snRNP及其他剪接因子共同完成RNA的组成性和选择性剪接。这对于生物体的发育、分化等具有决定性作用。在多种生物中 ,S... 详细信息

SR蛋白是在真核生物RNA剪接中发挥重要功能的一类剪接因子。它们可以结合特定的RNA ,参与识别 5′及 3′剪接位点 ,与snRNP及其他剪接因子共同完成RNA的组成性和选择性剪接。这对于生物体的发育、分化等具有决定性作用。在多种生物中 ,SR蛋白家族的某一成员功能缺陷往往会导致发育停滞、分化障碍和致死效应。本文就几种SR蛋白在不同生物中的缺陷型研究进行了综述。

关键词： SR蛋白 RNA剪接 RNA干扰基因打靶

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中国人群IL-1R1基因变异及其对跨膜区功能影响的预测

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中华医学遗传学杂志 2004年第4期21卷 316-320页

作者：冯凯周钢桥翟芸朱佩芳王正国贺福初蒋建新 400042 重庆第三军医大学创伤烧伤复合伤国家重点实验室大坪医院野战外科研究所/中国人民解放军交通医学研究所中国军事医学科学院放射医学研究所基因组学和蛋白质组学研究室国家人类基因组北方研究中心

目的检测中国人白细胞介素-1 Ⅰ型受体基因(interleukin-1 receptor type Ⅰ,IL-1)调控区和编码区的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs),并初步探讨其可能对中国人IL-1R1的功能影响.方法采用直接测序的方法检测基因... 详细信息

目的检测中国人白细胞介素-1 Ⅰ型受体基因(interleukin-1 receptor type Ⅰ,IL-1)调控区和编码区的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs),并初步探讨其可能对中国人IL-1R1的功能影响.方法采用直接测序的方法检测基因的5'区、编码区、部分内含子区和3'区,以确定中国人群中 IL-1R1基因SNP的位置和类型,用生物信息学方法对编码区SNP的功能进行了预测.结果在9643 bp的测序长度中,共发现了16个SNP,包括5'区4个,内含子区4个,编码区1个,3'非编码区7个.其中一个SNP能引起 IL-1R1跨膜区氨基酸的替代,生物信息学分析显示它能够引起跨膜区结构的改变.结论 IL-1R1基因变异可能对IL-1R1的功能产生影响.

关键词：白细胞介素 IL-1R1基因单核苷酸多态性

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肺癌转移相关蛋白的比较蛋白质组分析与鉴定

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生物化学与生物物理进展 2003年第4期30卷 586-593页

作者：蒋代凤应万涛万晶宏邱宗荫钱小红贺福初军事医学科学院放射医学研究所基因组学与蛋白质组学实验室北京100850 重庆医科大学检验系重庆400016

采用比较蛋白质组技术对肺巨细胞癌高、低转移株的蛋白质表达谱进行双向电泳分离和MALDI TOF分析 ,并在蛋白质和mRNA水平进行进一步验证 ,成功鉴定了 11个肺癌转移相关蛋白 .其中 ,候选蛋白膜联蛋白1(ANX1)、细胞骨架蛋白 (CK18)、Rho ... 详细信息

采用比较蛋白质组技术对肺巨细胞癌高、低转移株的蛋白质表达谱进行双向电泳分离和MALDI TOF分析 ,并在蛋白质和mRNA水平进行进一步验证 ,成功鉴定了 11个肺癌转移相关蛋白 .其中 ,候选蛋白膜联蛋白1(ANX1)、细胞骨架蛋白 (CK18)、Rho GDP解离抑制剂 1(GDIR)、原肌球蛋白 3(TPMF)、蛋白谷氨酰胺γ 谷氨酰转移酶 (TGLC)和白介素 18(IL 18)在肺巨细胞癌高转移株显著高表达 ,而候选蛋白核氯离子通道蛋白 1(CLI1)、蛋白质二硫键异构酶 (ER6 0 )、肌酸激酶、硫氧还蛋白过氧化物酶 1(PDX1)和热休克蛋白 6 0(CH6 0 )在肺巨细胞癌高转移株显著低表达 .大多数的候选蛋白可通过调控肿瘤细胞的生长、迁移、粘附、凋亡和肿瘤免疫等环节来影响肿瘤细胞的侵袭和转移能力 .迄今为止 ,还未见候选蛋白CLI1和IL 18与肺癌转移相关的报道。

关键词：肺癌转移蛋白质组核氯离子通道蛋白1 白介素18

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人类新型Krppel类转录因子hBKLF的cDNA克垄、亚细胞定位及表达特征

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Acta Genetica Sinica 2003年第1期30卷 1-9页

作者：王茫桔瞿祥虎等军事医学科学院放射医学研究所基因组和蛋白质组学研究室，北京100850 北京大学第一医院血液内科，北京100034

人胎肝cDNA文库FLD4585克隆可能编码一种造血相关的转录因子，本文旨在从22周孕龄人胎肝中获得其编码基因的全长cDNA序列，分析其编码蛋白的功能域、基因组结构、染色体定位、亚细胞定位及表达谱特征。采用5′RACE方法获得FLD4585克隆... 详细信息

人胎肝cDNA文库FLD4585克隆可能编码一种造血相关的转录因子，本文旨在从22周孕龄人胎肝中获得其编码基因的全长cDNA序列，分析其编码蛋白的功能域、基因组结构、染色体定位、亚细胞定位及表达谱特征。采用5′RACE方法获得FLD4585克隆全长；生物信息学方法确定hBKLF基因结构、染色体定位及功能域特征；GFP融合蛋白技术确定hBKLF亚细胞定位；Northern杂交、RT-PCR、Western印迹方法分析其表达谱。结果获得了Fld4585克隆编码的hBKLFcDNA全长序列，它含1810bp，编码345个氨基酸，与小鼠BKLF同源，C端含3个特征性C2H2结构的锌指，是KLF转录因子家族的新成员。HBKLF基因跨越33kb，含6个外显子和5个内含子，位于4号染色体4p15.2-p16.1。GFP-hBKLF融合蛋白在COS-7细胞中呈细小点状分布于核内，核仁区无分布。HBKLF含有两个转录本，大小为4.4kb-7.5kb和1.35kb-2.4kb。大转录本在成人及胎儿组织广泛表达，小转录本在外周血白细胞、肝脏和骨髓表达量最高，红系和粒系细胞均表达hBKLF。HBKLF表达量随肝脏发育成熟而下降，随红系、粒系成熟而升高。以上研究提示hBKLF可能是一种在体内广泛发挥作用的转录因子，在造血的调控中可能有重要作用。

关键词：人类新型Krueppel类转录因子 hBKLF cDNA克隆亚细胞定位表达特征

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人分化相关基因Ndr2的克隆与组织表达谱研究

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中国生物化学与分子生物学报 2002年第2期18卷 139-144页

作者：翟芸魏汉东瞿祥虎周钢桥贺福初军事医学科学院放射医学研究所基因组学与蛋白质组学研究室北京100850

人Ndr1基因参与细胞终末分化 ,并且对肿瘤细胞增殖和肿瘤转移具有抑制作用 .从人 2 2周孕龄胎肝cDNA文库中获得与人Ndr1基因同源的一段表达性序列标签 ,继而从成人脑cDNA文库分离出其全长cDNA(2 12 1bp) ,并将该基因命名为Ndr2 .其染色... 详细信息

人Ndr1基因参与细胞终末分化 ,并且对肿瘤细胞增殖和肿瘤转移具有抑制作用 .从人 2 2周孕龄胎肝cDNA文库中获得与人Ndr1基因同源的一段表达性序列标签 ,继而从成人脑cDNA文库分离出其全长cDNA(2 12 1bp) ,并将该基因命名为Ndr2 .其染色体定位为 14q11 1- 11 2 ,开放阅读框编码 371个氨基酸 ,且与NDR1蛋白一样 ,含有一个典型的α β水解酶折叠类结构域 (α βhydrolasefold) .Northern杂交和点杂交分析显示 ,该基因与Ndr1一样 ,在脑中高表达 ,在胚胎组织的表达较低 ,在 8种人肿瘤细胞中的表达极低 .然而 ,Ndr2基因的组织表达谱与Ndr1又有鲜明的差异 :其在成人骨骼肌和脑等神经组织中表达最高 ,在唾液腺、肝、肾、心肌和气管中的表达次之 .结果提示 ,NDR2具有与NDR1相似或相关的重要功能 .

关键词：人分化相关基因 Ndr2 克隆组织表达谱细胞分化染色体定位α/β水解酶折叠类结构域

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定量蛋白质组学研究技术

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生命的化学 2002年第4期22卷 382-385页

作者：杨何义钱小红军事医学科学院放射医学研究所基因组学与蛋白质组学研究室北京100850

随着蛋白质组研究的深入发展,人们已不满足对一个混合体系中蛋白质进行定性和简单定量分析,要求更加准确的定量分析。为此,有人提出了“定量蛋白质组学”概念。目前,应用于定量蛋白质学的研究技术主要有:蛋白质荧光染色技术、同位素标... 详细信息

随着蛋白质组研究的深入发展,人们已不满足对一个混合体系中蛋白质进行定性和简单定量分析,要求更加准确的定量分析。为此,有人提出了“定量蛋白质组学”概念。目前,应用于定量蛋白质学的研究技术主要有:蛋白质荧光染色技术、同位素标记技术、同位素亲和标签技术、蛋白质芯片技术。

关键词：定量蛋白质组学蛋白质荧光染色蛋白质芯片技术同位素技术同位素亲和标签技术

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应用蛋白质组学方法研究食管癌组织中异常表达的蛋白

应用蛋白质组学方法研究食管癌组织中异常表达的蛋白

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第七届海内外生命科学论坛

作者：胡海吴旻王明荣夏书华应万涛胡莉萍徐昕蔡岩蔡有余钱小红沈岩中国医学科学院中国协和医科大学肿瘤研究所分子肿瘤学国家重点实验室北京100021 军事医学科学院放射医学研究所基因组学与蛋白质组学实验室 100850 中国医学科学院中国协和医科大学基础医学研究所生物化学及分子生物学国家重点实验室北京100007

蛋白质组学方法是直接观察组织细胞中所有蛋白表达状态的高通量研究方法.通过比较在不同病理、生理状态下、不同外因刺激下细胞、组织蛋白的表达图谱，可能发现与特定生命现象相关的蛋白质.本文中应用这一方法分析了食管癌组织与配对的... 详细信息

蛋白质组学方法是直接观察组织细胞中所有蛋白表达状态的高通量研究方法.通过比较在不同病理、生理状态下、不同外因刺激下细胞、组织蛋白的表达图谱，可能发现与特定生命现象相关的蛋白质.本文中应用这一方法分析了食管癌组织与配对的癌旁组织间差异表达的蛋白.肿瘤细胞或癌旁食管上皮细胞通过显微切割方式从组织冰冻切片中获得，提取其总蛋白进行二维电泳.电泳胶被银染显色，应用Imagemarster 2-D Elite软件对获得的蛋白图谱加以分析，寻找癌与癌旁组织差异表达的蛋白，最后用质谱技术测定目的蛋白的肽质指纹谱.本研究共分析了34例食管癌及其配对的癌旁组织，发现并鉴定了29个差异表达的蛋白.其中9个在食管癌组织表达上调，包括HSP27、MHCⅠ等;20个在癌旁组织中高表达，如膜联蛋白(annexin)Ⅰ、膜联蛋白Ⅴ等.根据已有的资料提示，这些蛋白分别与细胞增殖、细胞凋亡、免疫反应、转录调控等相关.以上结果表明蛋白质组学方法将会在肿瘤发生、发展机理的研究方面发挥重要作用，通过这种方法鉴定的肿瘤异常表达蛋白可能成为肿瘤诊断及预后判断的标志物.

关键词：蛋白质组学食管癌二维电泳蛋白表达

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基于PC/Linux的核酸序列分析系统的构建及其应用

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生物化学与生物物理进展 2001年第2期28卷 263-266页

作者：张成岗欧阳曙光张绍文瞿祥虎鱼咏涛周钢桥吴松锋贺福初军事医学科学院放射医学研究所基因组学与蛋白质组学研究室北京 100850

基于PC机和Linux操作系统, 利用Phred/Phrap/Consed软件和Blast软件, 构建了核酸序列大规模自动分析系统. 该套系统可自动完成从测序峰图向核酸序列的转化、载体序列去除、序列自动拼接、重复序列鉴定以及序列的相似性分析, 可加速对大... 详细信息

基于PC机和Linux操作系统, 利用Phred/Phrap/Consed软件和Blast软件, 构建了核酸序列大规模自动分析系统. 该套系统可自动完成从测序峰图向核酸序列的转化、载体序列去除、序列自动拼接、重复序列鉴定以及序列的相似性分析, 可加速对大规模测序数据的分析和利用.

关键词： PC机 Linux操作系统 Phred/Phrap/Consed软件 Blast软件,生物信息学大规模测序

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一种新的蛋白酪氨酸磷酸酶基因的克隆、定位和组织表达谱研究

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遗传 2001年第6期23卷 503-510页

作者：瞿祥虎翟云魏汉东鱼咏涛贺福初军事医学科学院放射医学研究所基因组学与蛋白质组学研究室北京100850

从人胎肝cDNA文库分离出一长度为 5 2 48bp的cDNA克隆 ,该基因包含 2 6个外显子和 2 5个内含子 ,染色体定位于在某些肿瘤细胞中易缺失的 3p2 1.1- 2 1.33。其可读框编码 16 36个氨基酸 ,该蛋白属于蛋白酪氨酸磷酸酶(PTP)家族 ,其C端有... 详细信息

从人胎肝cDNA文库分离出一长度为 5 2 48bp的cDNA克隆 ,该基因包含 2 6个外显子和 2 5个内含子 ,染色体定位于在某些肿瘤细胞中易缺失的 3p2 1.1- 2 1.33。其可读框编码 16 36个氨基酸 ,该蛋白属于蛋白酪氨酸磷酸酶(PTP)家族 ,其C端有一个典型的PTP结构域 ,N端含有约 80 0氨基酸残基的BRO1样结构域及随后 2个可能的SH3结构域结合位点 ,在这两个结构域之间及C末端还各有一个脯氨酸富集区。Northern杂交和点杂交分析显示 ,该基因以大约 5 .4kb的单一转录物广泛表达于人体各种组织 ,而且在人部分肿瘤细胞中高表达。结果提示 ,人源PTP -TD14是一个新的蛋白酪氨酸磷酸酶。

关键词：蛋白酪氨酸磷酸酶 cDNA克隆人染色体3p21 PTP结构域 BRO1样结构域组织表达谱基因克隆基因定位

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序列同源性分析软件Blast的WEB界面构建及其应用

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生物化学与生物物理进展 2001年第6期28卷 916-918页

作者：张成岗张利达欧阳曙光张启发贺福初军事医学科学院放射医学研究所基因组学与蛋白质组学研究室北京100850 华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室武汉430070

基于局域网 (Intranet)内的PC/Linux服务器 ,构建了序列同源性分析软件Blast的WEB界面 .局域网内的所有计算机均可通过WEB方式访问该服务器进行公共数据库和自建数据库的查询 ,具有保密、高效、免费的优点 ,能够满足实验室和研究院所的... 详细信息

基于局域网 (Intranet)内的PC/Linux服务器 ,构建了序列同源性分析软件Blast的WEB界面 .局域网内的所有计算机均可通过WEB方式访问该服务器进行公共数据库和自建数据库的查询 ,具有保密、高效、免费的优点 ,能够满足实验室和研究院所的大规模。

关键词：微机 Linux操作系统局域网 Blast软件 WEB界面生物信息学序列同源性分析软件

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