检索结果-内蒙古大学图书馆

第三届全国质谱分析学术报告会

作者：井红宇张勇钱小红应万涛蛋白质组学国家重点实验室北京蛋白质组研究中心国家蛋白质科学中心军事医学科学院放射与辐射医学研究所

糖蛋白质组学研究对低丰度糖蛋白或糖肽的富集分析要求日益提高,相关的分离富集材料和技术应运而生,发展高灵敏度、高特异性的富集材料的尤为重要。目前已经报道的富集材料主要以常规的二氧化硅、二氧化钛和磁性四氧化三铁为基底材料,... 详细信息

糖蛋白质组学研究对低丰度糖蛋白或糖肽的富集分析要求日益提高,相关的分离富集材料和技术应运而生,发展高灵敏度、高特异性的富集材料的尤为重要。目前已经报道的富集材料主要以常规的二氧化硅、二氧化钛和磁性四氧化三铁为基底材料,在其表面衍生官能团进行选择性富集。这类材料因其基底材料表面官能团较少,对糖肽和非糖肽的整体吸附效果有所限制,特异性富集也因此会受到限制。近年来,纳米二维平面材料在能源制备、电化学、光学、催化、生物成像和生物制药等各个领域都有优异的表现[1],例如C3N4的表面所带的正电荷对细胞表面的负电荷有很强的静电吸引力,且C3N4本身没有毒性,具有良好的生物相容性[2],其本身二维的平面片层结构具有很好的分散性,这些优异的性能通过改性和延伸可以进一步应用于各种生物领域。我们以g-C3N4为基底材料,经过进一步改性和修饰,在其表面沉积纳米金颗粒,通过L-半胱氨酸的巯基与Au之间形成稳定的共价键而结合在材料表面,通过SEM、FTIR以及XPS等表征手段分析得出以g-C3N4为基底的L-半胱氨酸修饰材料已经成功合成。g-C3N4作为基底材料在水相和有机相中均具有良好的分散性,在沉积修饰过程中并未改变C3N4的二维平面结构,这些性质均可以增大材料与目标富集物的接触面积,提高材料的富集效率。g-C3N4表面所带氨基和L-半胱氨酸所具有的氨基具有更好的亲水性,材料具有优良的吸附作用和优异的特异性。通过酶切IgG肽段富集实验和人血实际样本富集与质谱分析,均证明L-半胱氨酸衍生化氮化碳材料具有优秀的糖肽富集回收率和选择性。

关键词：糖肽富集串联质谱亲水富集氮化碳

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

肝癌细胞系Hep3B的泛素化蛋白质组学

引用

生物工程学报 2016年第10期32卷 1443-1454页

作者：齐英姿邓晨苏纳张令强徐平军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室国家蛋白质科学中心(北京)北京蛋白质组研究中心蛋白质药物国家工程研究中心北京102206

泛素化修饰是细胞内最重要的翻译后修饰形式之一,对细胞内蛋白质的稳定、降解、定位以及生物活性的调节起到重要作用。但因其在细胞内丰度低、降解周期短等特点而很难被检测。本研究中,制备的泛素结合结构域蛋白(Ubiquitin-binding doma... 详细信息

泛素化修饰是细胞内最重要的翻译后修饰形式之一,对细胞内蛋白质的稳定、降解、定位以及生物活性的调节起到重要作用。但因其在细胞内丰度低、降解周期短等特点而很难被检测。本研究中,制备的泛素结合结构域蛋白(Ubiquitin-binding domains,UBDs)用于富集肝癌细胞系Hep3B中的泛素化蛋白,并通过液相色谱-串联质谱联用的方法对富集的泛素化蛋白进行鉴定。实验共鉴定到1 900个潜在的泛素化蛋白和158个泛素化位点,这些被鉴定到的泛素化位点分属于102个蛋白。生物信息学分析发现泛素化蛋白显著富集的相关通路与肿瘤的发生发展密切相关,此结果暗示肿瘤细胞内泛素化-蛋白酶体的失调与肿瘤细胞的信号传导及细胞外基质的变化等具有较高的关联性。

关键词： Hep3B 蛋白质组学泛素化 ThUBDs

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

目标-诱饵库搜索策略在蛋白质组质谱鉴定和质控中的应用及研究进展

引用

生物化学与生物物理进展 2016年第7期43卷 661-672页

作者：冯晓东马洁常乘白明泽朱云平舒坤贤重庆邮电大学生物信息学研究所重庆400065 军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质药物国家工程研究中心北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室国家蛋白质科学中心(北京)北京102206

基于串联质谱的蛋白质组研究会产生海量的质谱数据,这些数据通常使用数据库搜索引擎进行鉴定分析,并根据肽段谱图匹配(PSM)反推真实的样品蛋白质.对于高通量蛋白质组数据的处理,其鉴定结果的可信是后续分析应用的前提,因此对鉴定结果的... 详细信息

基于串联质谱的蛋白质组研究会产生海量的质谱数据,这些数据通常使用数据库搜索引擎进行鉴定分析,并根据肽段谱图匹配(PSM)反推真实的样品蛋白质.对于高通量蛋白质组数据的处理,其鉴定结果的可信是后续分析应用的前提,因此对鉴定结果的质量控制尤为重要,而基于目标-诱饵库(target-decoy)搜索策略的质量控制是目前应用最为广泛的方法.本文首先介绍了基于目标-诱饵库搜索策略搜库和质量控制的实施流程,然后综述了基于目标-诱饵库搜索策略的质量控制工具,并提出了目标-诱饵库搜索策略的不足及改善方法,最后对目标-诱饵库搜索策略进行了总结与展望.

关键词：串联质谱蛋白质鉴定目标-诱饵质量控制

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

固定化表面活性剂在蛋白质组质谱分析中的应用

固定化表面活性剂在蛋白质组质谱分析中的应用

引用

第三届全国质谱分析学术报告会

作者：吴琼钱小红张养军广东药科大学药学院军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室

在常用的蛋白质组学"Bottom-up"分析策略中,表面活性剂常用于蛋白质样品的前处理过程[1],通过使蛋白质增溶和变性提高蛋白质的回收率及酶解效率[2]。十二烷基磺酸钠是蛋白质样品前处理过程中一种常用的表面活性剂,然而其不易... 详细信息

在常用的蛋白质组学"Bottom-up"分析策略中,表面活性剂常用于蛋白质样品的前处理过程[1],通过使蛋白质增溶和变性提高蛋白质的回收率及酶解效率[2]。十二烷基磺酸钠是蛋白质样品前处理过程中一种常用的表面活性剂,然而其不易除去,会对蛋白酶活性、肽段的色谱分离及质谱分析造成干扰。为此,如图1所示,我们制备了一种固定化表面活性剂,一端为FeO磁性纳米颗粒,具有亲水性和磁性,作为亲水端且能够通过外加磁场轻易除去[3];另一端为含有18个碳原子的长碳链,作为疏水端,可插入蛋白质内部,将其变性或起增溶作用。以BSA为标准蛋白比较常规方法和固定化表面活性剂对蛋白的酶解效率,结果表明使用固定化表面活性剂将其变性后进行酶解,质谱分析结果显示其平均肽段覆盖率为42.1%,与常规方法（23.8%）相比提高了76.89%,具有较好的蛋白质变性能力。进一步使用固定化表面活性剂提取HeLa细胞全蛋白,得到的蛋白数与常规方法（常用0.1%SDS[4]或8 MUA[5]作为蛋白质裂解液）相近,表明固定化表面活性剂具有较好的蛋白质变性、增溶的能力,并且能够避免SDS不易除去及UA盐浓度过高的缺点,可用于复杂生物样本的处理中,提高蛋白质组的覆盖率。

关键词：表面活性剂 Fe3O4磁性纳米颗粒质谱蛋白质组学

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

质谱方法实现抗体类药物糖链修饰的鉴定与定量研究

质谱方法实现抗体类药物糖链修饰的鉴定与定量研究

引用

第三届全国质谱分析学术报告会

作者：黄怡钱小红应万涛安徽医科大学研究生学院蛋白质组学国家重点实验室北京蛋白质组学研究中心国家蛋白质科学中心军事医学科学院放射与辐射医学研究所

在抗体药物质量属性研究中,糖修饰的结构鉴定与定量分析,越来越受到关注。贝伐单抗是一种人源化重组单克隆抗体,是美国第一个批准上市的抑制肿瘤血管生成的抗体药物。在本研究中,以贝伐单抗为测试品,建立基于液质联用的从完整糖肽水平... 详细信息

在抗体药物质量属性研究中,糖修饰的结构鉴定与定量分析,越来越受到关注。贝伐单抗是一种人源化重组单克隆抗体,是美国第一个批准上市的抑制肿瘤血管生成的抗体药物。在本研究中,以贝伐单抗为测试品,建立基于液质联用的从完整糖肽水平对抗体药糖型定性定量的研究方法,并用于生物仿制药糖型定性定量分析中。基于液相色谱质谱技术,从完整糖肽水平对糖型进行定性定量分析,同时与传统超高效液相荧光检测方法(UPLC-FLR)定性定量结果比较,获得最优分析策略,并用于曲妥珠单抗仿制药批次间糖型定性定量分析。UPLC-FLR方法定量分析了贝伐单抗7种糖型;液质联用方法定量19种糖型;经亲水相互作用色谱(HILIC)富集后,定量22种糖型。曲妥珠单抗仿制药批次间糖型定量结果显示良好的一致性。基于液质联用的方法,具有速度快、灵敏度高、检测糖型种类多等优势,有望作为一种稳定的抗体药物糖蛋白位点特异性定量分析策略(图1)。

关键词：超高效液相荧光检测液质联用抗体药物完整糖肽定量

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

基于机器学习的蛋白质相互作用文献挖掘方法研究进展

引用

中国科学：生命科学 2016年第11期46卷 1235-1248页

作者：李满生常乘马洁朱云平军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室国家蛋白质科学中心(北京)北京102206

蛋白质相互作用是生物体内一类极其重要的分子活动.自动挖掘、整合生物文献中的蛋白质相互作用有助于生物学的研究,获得了人们的广泛关注,成为生物文献挖掘领域的重要任务之一.目前,基于机器学习的蛋白质相互作用挖掘方法已经取得了很... 详细信息

蛋白质相互作用是生物体内一类极其重要的分子活动.自动挖掘、整合生物文献中的蛋白质相互作用有助于生物学的研究,获得了人们的广泛关注,成为生物文献挖掘领域的重要任务之一.目前,基于机器学习的蛋白质相互作用挖掘方法已经取得了很大进步,对该领域的进展进行归纳总结将有助于方法的进一步优化和应用.本文在对机器学习方法构建流程介绍的基础上,进一步从机器学习的分类器、学习特征、方法评估以及挖掘系统4个方面对蛋白质相互作用文献挖掘进行系统总结,并探讨了其发展前景.

关键词：蛋白质相互作用蛋白质相互作用挖掘文献挖掘机器学习

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

胚胎干细胞向内胚层分化的分子机制及其组学研究进展

引用

中国科学：生命科学 2016年第12期46卷 1345-1353页

作者：赵文娟杨冬贺福初军事医学科学院放射与辐射医学研究所国家蛋白质科学中心(北京)北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206

胚胎干细胞(ESC)在发育过程中分化为内胚层、中胚层和外胚层3个胚层.其中内胚层进一步向终末细胞的分化,是形成整个消化道和呼吸道,以及肝脏、胰腺等器官的基础.ESC形成内胚层主要经历以下几个分化阶段:外胚叶的分化、原条的形成、内胚... 详细信息

胚胎干细胞(ESC)在发育过程中分化为内胚层、中胚层和外胚层3个胚层.其中内胚层进一步向终末细胞的分化,是形成整个消化道和呼吸道,以及肝脏、胰腺等器官的基础.ESC形成内胚层主要经历以下几个分化阶段:外胚叶的分化、原条的形成、内胚层与中胚层的分离以及定型内胚层的形成.本文主要从信号通路、转录因子以及表观遗传调控等几个方面综述胚胎干细胞向内胚层分化的分子机制,并重点介绍其组学研究进展,以期为该领域研究者提供重要参考信息.

关键词：胚胎干细胞内胚层信号通路表观遗传组学

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

人体微生态尤其是肠道微生态为新药研发提供前所未有的机遇和挑战

引用

中国药理学与毒理学杂志 2016年第7期30卷 703-713页

作者：张成岗军事医学科学院放射与辐射医学研究所、蛋白质组学国家重点实验室、全军军事认知与心理卫生研究中心北京100850

进入21世纪以来,国内外慢病高发的态势并没有得到有效控制,对医学和药学领域提出了新的挑战,无论是化学药、生物药还是中药的研发与评价,都面临着如何显著提升药效、降低其毒副作用即增敏促效的极其迫切的现实需求。随着精准医疗和大数... 详细信息

进入21世纪以来,国内外慢病高发的态势并没有得到有效控制,对医学和药学领域提出了新的挑战,无论是化学药、生物药还是中药的研发与评价,都面临着如何显著提升药效、降低其毒副作用即增敏促效的极其迫切的现实需求。随着精准医疗和大数据时代的到来,为新药研发、老药新用等提出了新的机遇与挑战。然而,由于目前不断认识到由人体共生微生物群体所构成的人体微生态系统尤其是肠道微生态系统在人体健康与疾病方面越来越重要的作用,甚至与部分疾病如肥胖和糖尿病具有一定程度的因果关系,因此,对于目前药物研发甚至当前医学理论体系的一些核心思路提出了新的思考,只有从根本上对这些核心问题进行正确分析,才有可能让新药研发在新的时期以创新的方式走出传统路线,为真正有效实现慢病防控事业做出新的贡献。本文结合国内外人体微生态尤其是肠道微生态领域的研究进展,系统分析当前新药研发存在的问题,提出如何分别从人体、人体微生态和人体与人体微生态平衡这3个角度综合出发,破解当前慢病高发时期新药研发所面临和困扰的难题,期望能够促进新药研发以及慢病防控事业又好又快地发展,为我国人民身心健康服务。

关键词：人体微生态肠道微生态肠道菌群新药研发中药菌心说人菌平衡

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

多反应监测方法评估丹参和人参对大鼠肝药酶的调控作用

引用

中草药 2016年第20期47卷 3647-3655页

作者：程汉兴孙爱华王宇光高月姜颖安徽医科大学合肥安徽230032 军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206 军事医学科学院放射与辐射医学研究所药理毒理研究室北京100850

目的建立新型特异性强的高通量细胞色素P450(CYP)丰度测定方法,以人参和丹参为工具药考察药物对肝药酶的调控作用。方法采用基于质谱多反应监测(MRM)模式方法,以串联配体法(QconCAT)表达合成的重标肽段作为内标对丹参与人参处理后,对9... 详细信息

目的建立新型特异性强的高通量细胞色素P450(CYP)丰度测定方法,以人参和丹参为工具药考察药物对肝药酶的调控作用。方法采用基于质谱多反应监测(MRM)模式方法,以串联配体法(QconCAT)表达合成的重标肽段作为内标对丹参与人参处理后,对9种大鼠肝脏CYP(CYP1A1、CYP1A2、CYP2B1、CYP2B2、CYP2C6、CYP2C11、CYP3A1、CYP3A2、CYP17A1)蛋白特异肽段进行定量,探讨丹参和人参对肝脏CYP酶的表达上调或者下调作用。结果 QconCAT重标合成内标肽段与肝脏样品肽段质谱表征一致,与对照组相比,丹参与人参作用后,对大鼠肝内CYP1A1、CYP2B2的表达均具有下调作用,对CYP1A2、CYP2B1的表达均具有上调作用。丹参同时下调CYP3A2、CYP2C11和CYP17A1的表达,而人参则上调这3种蛋白的表达。建立了MRM方法对大鼠肝脏CYP蛋白定量方法,定量方法相对标准偏差在5.9%以内,相对误差在6.8%以内,定量标准曲线的线性系数大于0.9。结论对9种大鼠肝脏CYP酶进行定量研究,其中CYP2B1、CYP2B2和CYP17A1是首次进行蛋白质定量研究。丹参与人参对CYP亚型产生的调控作用存在差异性,为药物配伍实践中提供临床参考价值,避免不良药物相互作用反应。

关键词：人参丹参 CYP450 多反应监测药物配伍

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

开管毛细管色谱柱的制备及其在蛋白质组学研究中的应用进展

引用

色谱 2016年第3期34卷 226-231页

作者：周珊珊翟睿焦丰龙郝斐然吕雅瑶钱小红张养军广西医科大学广西南宁530021 军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206

近年来随着生命科学等领域的深入发展,人们对微量样本分离分析的需求越来越高,液相色谱系统的微量化受到了更多的关注。由于开管毛细管色谱柱具有较低的反向压力,可通过采用更长的色谱柱提高柱效,从而实现对复杂生物样本的高效分离,因... 详细信息

近年来随着生命科学等领域的深入发展,人们对微量样本分离分析的需求越来越高,液相色谱系统的微量化受到了更多的关注。由于开管毛细管色谱柱具有较低的反向压力,可通过采用更长的色谱柱提高柱效,从而实现对复杂生物样本的高效分离,因而成为液相色谱柱新的发展方向。本文对开管毛细管色谱柱的制备方法及应用进展进行了综述。

关键词：毛细管液相色谱开管毛细管色谱柱多孔层蛋白质组学综述

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：