检索结果-内蒙古大学图书馆

中国科学：生命科学 2015年第4期45卷 347-358页

作者：王锦霞常乘马洁吴松锋庄举娟朱云平大连海事大学数学系大连116026 军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206

随着质谱技术的快速发展,蛋白质组学已成为继基因组学、转录组学之后的又一研究热点,寻找可靠的差异表达蛋白对于生物标记物的发现至关重要.因此,如何准确、灵敏地筛选出差异蛋白已成为基于质谱的定量蛋白质组学的主要研究内容之一.目前... 详细信息

随着质谱技术的快速发展,蛋白质组学已成为继基因组学、转录组学之后的又一研究热点,寻找可靠的差异表达蛋白对于生物标记物的发现至关重要.因此,如何准确、灵敏地筛选出差异蛋白已成为基于质谱的定量蛋白质组学的主要研究内容之一.目前,针对该问题的研究方法众多,但这些方法策略的适用范围不尽相同.总体来说,基于质谱技术筛选差异蛋白的统计学策略可以分为3类:基于经典统计学派的策略、基于贝叶斯学派的统计检验策略和其他策略,这3类方法有各自的应用范围、特点及不足.此外,筛选过程还将产生部分假阳性结果,可以采用其他方法对差异表达蛋白的质量进行控制,以提高统计检验结果的可靠性.

关键词：质谱蛋白质组学差异表达蛋白统计学原理多重假设检验

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整合因子复合体研究进展

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军事医学 2015年第5期39卷 398-402页

作者：思兰兰张红星周钢桥广西医科大学南宁530021 军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京100850

整合因子复合体（ integrator complex ）是一个新近发现的多功能蛋白质复合物，由至少12个进化上保守的亚基（ integrator complex subunits ， INTS1～INTS12）组成。该复合体能与RNA聚合酶Ⅱ（ RNAPⅡ）大亚基的具有重复氨基酸序列的... 详细信息

整合因子复合体（ integrator complex ）是一个新近发现的多功能蛋白质复合物，由至少12个进化上保守的亚基（ integrator complex subunits ， INTS1～INTS12）组成。该复合体能与RNA聚合酶Ⅱ（ RNAPⅡ）大亚基的具有重复氨基酸序列的C端相互作用，进而介导小核RNA（small nuclear RNA， snRNA）U1／U2的3′端加工。整合因子复合体还能通过与RNAPⅡ、延伸负调控因子NELF和转录延伸因子Spt5发生相互作用，调控NELF介导的RNAPⅡ的暂停－释放，进而调控mRNA的合成。近年来，有研究陆续报道整合因子复合体还在DNA损伤应答、核周动力蛋白的募集、细胞核内卡哈尔体（ Cajal body ）的完整性、脂肪细胞的分化成熟、造血、初级纤毛的形成、肿瘤的发生发展和病毒微小RNA（ microRNA，miRNA）形成等方面发挥重要作用。该文综述了整合因子复合体的研究进展。

关键词：整合因子复合体 RNA聚合酶Ⅱ 小核RNA mRNA转录

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The structural and functional features of novel genes and their roles in the formation of organismal complexity

The structural and functional features of novel genes and th...

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第七届全国生物信息学与系统生物学学术大会

作者：杨冬徐艾诗马冲臧佳音贺福初军事医学科学院放射与辐射医学研究所国家蛋白质科学中心(北京)北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206 军事医学科学院放射与辐射医学研究所国家蛋白质科学中心(北京)北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206 吉林大学动物科学学院长春130062

Background: During evolution,genomes gradually acquire novel genetic elements,including novel genes that are species/***'s known that some novel genes substantially contribute to the increasing functional and phenotypic ***,there's no genome-wide investigation of their features and regular patterns contributing to organismal ***,we give a comprehensive analysis about the structural and functional features of novel genes and explore their roles in the formation of organismal complexity.

关键词： Novel gene Evolution Development Organism complexity

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当前慢病防控困境迫切呼唤新医学和菌心说

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科技导报 2015年第22期33卷 106-111页

作者：张成岗军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室全军军事认知与心理卫生研究中心北京100850

进入21世纪以来,国际社会所面临的慢病防控形势愈发严峻,不仅对于肥胖、糖尿病、高血压、肿瘤等慢病仍然缺乏良策,而且新药研发速度也并没有随着人类基因组计划的完成得到提高,进而导致欧美以及中国医疗改革举步维艰,反过来提示当代医... 详细信息

进入21世纪以来,国际社会所面临的慢病防控形势愈发严峻,不仅对于肥胖、糖尿病、高血压、肿瘤等慢病仍然缺乏良策,而且新药研发速度也并没有随着人类基因组计划的完成得到提高,进而导致欧美以及中国医疗改革举步维艰,反过来提示当代医疗模式可能存在一定问题。结合国际上的研究进展,针对这些问题进行系统分析以及基于大量志愿者进行科学研究的基础上,提出"慢病的菌源性学说",倾向于认为人体慢病主要是由于多种因素所导致的人体共生微生物菌群紊乱造成的,同时证明可通过纠正胃肠道菌群紊乱显著改善包括便秘、肥胖、糖尿病等在内的慢病症状。在此基础上,还进一步提出"心理活动的菌源性学说",认为人类的心理活动除了与大脑密切相关之外,还与人体共生菌群密切相关,甚至不排除人类心理活动有可能是微生物菌群通过人体大脑控制下的机体行为所展示出来的一种表现。进而提出新医学理论和菌心说学说,认为人菌平衡是健康的标志,而人菌失衡是慢病的根源,而且人菌失衡的关键在于人体和菌群之间的碳源竞争。菌心说学说认为相对于人体的躯体和大脑而言,由人体共生微生物菌群所构成的"心脑菌脑"有可能是人类心理活动的核心、中心和重心,而人体则有可能是被设计为菌群微生态系统提供生存与发展作用的场所和工具。基于这一观点,不仅可望实现慢病防控与健康管理领域的新突破,而且还有可能实现对人类心理活动以及精神意识活动的物质基础的认知与升华,对于重新认识人类以及人类社会将有可能带来前所未有的新突破。

关键词：慢病防控健康管理新医学菌心说慢病的肠源性学说慢病的菌源性学说心理活动的菌源性学说

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新型核壳型亲水聚合物-硅胶杂化填料的合成及其在蛋白质N-糖链富集中的应用

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色谱 2015年第3期33卷 221-227页

作者：白海红范超沈丙权田芳邓玉林潘一廷秦伟捷钱小红北京理工大学生命学院北京100081 军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206 北京石油化工学院化学工程学院北京102617

蛋白质的N-糖基化修饰与多种重要的生理、病理进程密切相关,是多种重大疾病诊断标志物研究的热点。由于糖蛋白本身多是低丰度表达的蛋白质,且糖链结构具有高度微不均一性,这使得蛋白质糖基化修饰的分析具有一定的挑战。本研究利用表面引... 详细信息

蛋白质的N-糖基化修饰与多种重要的生理、病理进程密切相关,是多种重大疾病诊断标志物研究的热点。由于糖蛋白本身多是低丰度表达的蛋白质,且糖链结构具有高度微不均一性,这使得蛋白质糖基化修饰的分析具有一定的挑战。本研究利用表面引发-原子转移自由基聚合(SI-ATRP)法,以带有双键的氨基葡萄糖为单体(GMAG),成功制备了新型核壳型亲水聚合物-硅胶杂化填料(pGMAG-SiO2)。由于在硅胶表面引入致密的亲水聚合物层,该填料不仅保持了硅胶良好的机械强度,而且显著提高了其亲水性,因此非常适合作为亲水填料用于蛋白质的N-糖链富集。以麦芽七糖和鸡卵清蛋白的N-糖链为研究对象,考察了该填料对N-糖链的富集效果,并将该杂化填料成功用于人血浆中糖蛋白N-糖链的富集检测,共鉴定了47种糖型。以上结果表明,pGMAG-SiO2填料对N-糖链具有较高的亲和性,可以用于N-糖链的高覆盖率鉴定。

关键词：表面引发-原子转移自由基聚合反应核壳型硅胶填料 N-糖链 N-糖基化蛋白质

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肝细胞癌转移相关蛋白的iTRAQ定量蛋白质组学研究

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中国细胞生物学学报 2015年第7期37卷 998-1003页

作者：高萍萍陈宁孙薇安徽医科大学研究生学院合肥230032 军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206

该研究对不同转移能力的人肝癌细胞系全细胞蛋白进行差异蛋白质组分析,以期发现与肝癌转移相关的候选分子。选择具有高、低转移能力的人肝癌细胞系HCCLM6和MHCC97H为研究材料,提取细胞全蛋白,FASP酶切、iTRAQ标记后进行质谱鉴定和定量分... 详细信息

该研究对不同转移能力的人肝癌细胞系全细胞蛋白进行差异蛋白质组分析,以期发现与肝癌转移相关的候选分子。选择具有高、低转移能力的人肝癌细胞系HCCLM6和MHCC97H为研究材料,提取细胞全蛋白,FASP酶切、iTRAQ标记后进行质谱鉴定和定量分析,并利用Uni Prot数据库和GOfact软件对差异蛋白进行生物信息学分析,包括亚细胞定位、生物过程和分子功能富集分析。共鉴定了5 033种蛋白质,其中5 013种蛋白质有定量信息,发现91种差异蛋白(|ratio|≥1.5,单样本t检验,P<0.05),其中39种蛋白在高转移细胞HCCLM6中上调,52种下调。差异蛋白的细胞定位主要为细胞质和细胞膜,GO分析显著富集到细胞黏附生物过程和蛋白结合生物功能。该研究建立了高低转移能力的人肝癌细胞系HCCLM6和MHCC97H细胞全蛋白的差异表达谱,发现了4种新的与肝癌转移相关的候选蛋白(微管蛋白链β-2B、着丝粒蛋白F、层黏连蛋白亚基α5和囊泡相关膜蛋白5),为进一步研究肝癌转移机制提供了重要的数据参考。

关键词：肝细胞癌转移蛋白质组 iTRAQ

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研究肠道菌群的模式生物--秀丽隐杆线虫

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军事医学 2015年第10期39卷 794-796,801页

作者：于周龙高艳张成岗广西医科大学南宁530021 军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室全军军事认知与心理卫生研究中心北京100850

肠道微生物对人体健康有着重要的作用,与营养物质吸收和肥胖、糖尿病等代谢性疾病关系密切。从肠道微生物的角度研究疾病发生及防治方法已成热点。高等动物模型存在个体差异大、肠道微生物种类繁多、数量庞大、影响因素多变等弊端。秀... 详细信息

肠道微生物对人体健康有着重要的作用,与营养物质吸收和肥胖、糖尿病等代谢性疾病关系密切。从肠道微生物的角度研究疾病发生及防治方法已成热点。高等动物模型存在个体差异大、肠道微生物种类繁多、数量庞大、影响因素多变等弊端。秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans),简称线虫,是研究肠道微生物和宿主之间相互作用的良好模式生物,其以大肠杆菌为食物,具有生长周期短、表型易于观察、可实现药物的高通量筛选等优点。如利用线虫模型筛选具有抗致病菌感染的益生菌,同时揭示多种细菌间的相互作用机制。该文对秀丽线虫在肠道微生物与宿主共生关系及相关应用研究进展进行综述。

关键词：秀丽线虫肠道菌群衰老大肠杆菌

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不同抗氧化剂配伍组合对抗氧化能力的影响

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军事医学 2015年第1期39卷 22-25,51页

作者：杨柳李伟光王瑞雪张成岗广西医科大学南宁530021 军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室全军军事认知与心理卫生研究中心北京100850

目的比较依达拉奉(edaravone)、还原型谷胱甘肽(GSH)和维生素C(VC)3种常用抗氧化剂进行配伍组合后抗氧化能力的变化情况,为后续复合抗氧化剂的筛选及临床应用提供参考依据。方法通过体外测定抗氧化剂的总抗氧化能力、还原能力、清除羟... 详细信息

目的比较依达拉奉(edaravone)、还原型谷胱甘肽(GSH)和维生素C(VC)3种常用抗氧化剂进行配伍组合后抗氧化能力的变化情况,为后续复合抗氧化剂的筛选及临床应用提供参考依据。方法通过体外测定抗氧化剂的总抗氧化能力、还原能力、清除羟自由基能力和清除超氧阴离子能力,比较分析6组抗氧化剂的抗氧化活性强弱。结果与结论实验结果表明,在相同摩尔浓度下,复合抗氧化剂具有协同清除自由基的作用,其抗氧化活性得到显著提高。提示在研究抗氧化剂联合使用时,需要考虑到不同抗氧化剂联用的增效作用,可为后续临床应用选择合理的复合抗氧化剂提供实验依据。

关键词：复合抗氧化剂抗氧化能力依达拉奉谷胱甘肽维生素C

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呼吸道微生物组与相关疾病研究进展

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军事医学 2015年第11期39卷 873-875,883页

作者：邓增华王广舜张成岗天津医科大学宝坻临床学院天津301800 军事医学科学院放射与辐射医学研究所蛋白质组学国家重点实验室全军军事认知与心理卫生研究中心北京100850

近些年,随着二代测序技术以及生物信息学的快速发展,人们得以全面了解呼吸道中微生物组的组成,其中主要包括细菌、真菌以及病毒。相关研究表明呼吸道微生物组和多种呼吸道疾病密切有关,这为哮喘、肺囊性纤维化(cystic fibrosis,CF)、慢... 详细信息

近些年,随着二代测序技术以及生物信息学的快速发展,人们得以全面了解呼吸道中微生物组的组成,其中主要包括细菌、真菌以及病毒。相关研究表明呼吸道微生物组和多种呼吸道疾病密切有关,这为哮喘、肺囊性纤维化(cystic fibrosis,CF)、慢性阻塞性肺部疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)、肺癌以及流感等疾病的研究提供了新的思路和方向。该文综述了呼吸道微生物组(细菌、真菌和病毒)与相关疾病之间关系的研究进展。

关键词：呼吸道微生物组哮喘囊性纤维化肺部疾病,慢性阻塞性肺肿瘤流感

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可选择性多聚腺苷酸化的生物学功能

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军事医学 2015年第5期39卷 393-397页

作者：杨亮张红星崔英周钢桥广西医科大学广西医科大学研究生学院广西医科大学附属肿瘤医院南宁530021 军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206

可选择性多聚腺苷酸化(alternative polyadenylation,APA)是一种普遍存在于真核生物中的基因调控机制。APA事件的发生能使一个基因产生多种mRNA转录本,从而增加转录本的复杂度。选择不同的多聚腺苷酸化位点可以使不同的转录本具有不同... 详细信息

可选择性多聚腺苷酸化(alternative polyadenylation,APA)是一种普遍存在于真核生物中的基因调控机制。APA事件的发生能使一个基因产生多种mRNA转录本,从而增加转录本的复杂度。选择不同的多聚腺苷酸化位点可以使不同的转录本具有不同的编码序列,或具有不同长度的3'端非翻译区(3'untranslated region,3'UTR)。不同长度的3'UTR可引起RNA结合蛋白或微小RNA(miRNA)的结合位点发生变化,进而影响mRNA的稳定性、定位和翻译效率。近年来,APA的研究涉及APA的形成过程、调控APA的机制以及APA对生物学过程和疾病的影响。该文对APA的上述研究进展进行了综述。

关键词：可选择性多聚腺苷酸化基因调控 RNA结合蛋白微小RNA 肿瘤

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