检索结果-内蒙古大学图书馆

化学学报 2009年第13期67卷 1523-1527页

作者：陈芳进刘涛王晓磊赵东升冯健男刘少君军事医学科学院基础医学研究所北京100850 军事医学科学院生物超级计算中心北京100850

蛋白质相互作用界面上磷酸酪氨酸的质子化状态对蛋白质相互作用具有重要影响,在进行相关结构的计算研究时,必须对其进行准确判定.采用AMBER/parm99力场和广义波恩(GBobc)隐式水模型,以SHC1(src homology2domain-containing transforming... 详细信息

蛋白质相互作用界面上磷酸酪氨酸的质子化状态对蛋白质相互作用具有重要影响,在进行相关结构的计算研究时,必须对其进行准确判定.采用AMBER/parm99力场和广义波恩(GBobc)隐式水模型,以SHC1(src homology2domain-containing transforming proteinC1)的SH2(Src homology2)结构域与磷酸化激活的T细胞受体CD247链的相互作用核磁结构为例,首次以热力学积分方法对相互作用界面上磷酸酪氨酸的质子化状态进行判定研究,结果显示该方法计算精确,判定结果与实验结果一致.表明该方法不仅为涉及磷酸酪氨酸的蛋白质相互作用的计算结构研究奠定了基础,在其它具有可电离基团的氨基酸的质子化状态判定中也将具有潜在的推广应用价值.

关键词：酪氨酸激酶受体磷酸酪氨酸质子化广义波恩模型热力学积分

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药理学计算程序包 PHCAPR

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军事医学科学院院刊 1991年第1期15卷 71-74页

作者：柏立嘉军事医学科学院计算中心

本文介绍了在 VAX-11/780超极小型机上开发的,针对药理学研究中经常应用的计算方法,用 BASIC 和 VAX/FMS 编写的药理学计算程序包 PHCAPR。它采用结构化设计,菜单控制,具有34种计算和绘图功能,为药理学研究工作提供一有力工具。

关键词：药理学计算计算机程序

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与INTERNET相连的几种方式探索与实践

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核电子学与探测技术 1997年第2期17卷 154-157页

作者：周士波军事医学科学院计算中心

本文介绍了几种微机和局域网与ＩＮＴＥＲＮＥＴ相连的方法与实践，给出了拓扑结构和主要方法步骤，经过联网的实践得出自己的实际体会。

关键词： X.25协议 DDN 互联网

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浅谈流行病学数据库的意义及应用

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中华流行病学杂志 1989年第6期10卷 384-385页

作者：周士波军事医学科学院计算中心

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microRNA计算发现方法的研究进展

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遗传 2008年第6期30卷 687-696页

作者：侯妍妍应晓敏李伍举军事医学科学院基础医学研究所计算生物学中心北京100850

microRNA(miRNA)是近几年发现的一类长度为～21nt的内源非编码小RNA,在植物和动物中发挥着重要而广泛的调控功能。它的发现主要有cDNA克隆测序和计算发现两条途径。由于cDNA克隆测序方法受miRNA表达的时间和组织特异性以及表达水平的影... 详细信息

microRNA(miRNA)是近几年发现的一类长度为～21nt的内源非编码小RNA,在植物和动物中发挥着重要而广泛的调控功能。它的发现主要有cDNA克隆测序和计算发现两条途径。由于cDNA克隆测序方法受miRNA表达的时间和组织特异性以及表达水平的影响,而计算发现可以弥补其不足,因此miRNA的计算发现方法研究受到了广泛的重视。文章对近几年计算发现miRNA的研究进展进行了综述,根据计算发现方法的本质,将计算发现方法归纳为5类,分别是同源片段搜索方法、基于比较基因组学的预测方法、基于序列和结构特征打分的预测方法、结合作用靶标的预测方法和基于机器学习的预测方法,并对各类方法的原理、核心思想、优点和局限性进行了分析,最后探讨了进一步的发展方向。

关键词： microRNA 计算发现同源搜索比较基因组学作用靶标机器学习

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具有重复测量设计的多元方差分析

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中国卫生统计 1993年第5期10卷 14-17页

作者：胡良平刘晓晴宋三泰军事医学科学院计算中心统计教研室军事医学科学院三零七医院肿瘤科

本文介绍了具有重复测量的多指标的设计类型,运用多元统计理论,结合医学实例,给出了进行多元方差分析和多个均值向量间两两比较的具体计算公式和计算结果。针对这种设计的特点,明确指出:在进行统计分析时,决不能忽视区组因素的影响。

关键词：重复测量设计设计类型忽视医学视区影响方差分析均值向量区组多指标

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细菌sRNA基因及其靶标预测研究进展

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微生物学报 2009年第1期49卷 1-5页

作者：王立贵赵雅琳李伍举军事医学科学院基础医学研究所计算生物学中心北京100850

细菌sRNA是一类长度在40-500 nt之间的非编码RNA，主要以不完全碱基配对方式与靶标mRNA5′端相互作用进而发挥其生物学功能。鉴于预测方法可以为细菌sRNA及其靶标的实验发现提供指导，因此，细菌sRNA与靶标预测研究受到了广泛重视。文... 详细信息

细菌sRNA是一类长度在40-500 nt之间的非编码RNA，主要以不完全碱基配对方式与靶标mRNA5′端相互作用进而发挥其生物学功能。鉴于预测方法可以为细菌sRNA及其靶标的实验发现提供指导，因此，细菌sRNA与靶标预测研究受到了广泛重视。文章首先将sRNA预测方法分为3类，分别是基于比较基因组学的预测方法、基于转录单元的预测方法和基于机器学习的预测方法；其次，将sRNA靶标预测方法分为2类，分别是序列比较方法与基于RNA二级结构的预测方法；最后对各类方法的原理、核心思想、优点和局限性进行了分析，并探讨了进一步的发展方向。

关键词： sRNA 预测靶标细菌

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字符串匹配技术研究

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计算机工程 2004年第22期30卷 24-26页

作者：李雪莹刘宝旭许榕生军事医学科学院医学情报研究所网络信息中心北京100850 中国科学院高能物理研究所计算中心北京100039

简述了字符串匹配算法的研究进展,分析了Knuth- Morris-Pratt算法、Boyer-Moore算法以及Horspool、Wu & Manber和Aho-Corasick针对Boyer-Moore算法提出的多种改进算法,并基于网络安全应用中开放源码的NIDS系统——Snort2.0,对其中... 详细信息

简述了字符串匹配算法的研究进展,分析了Knuth- Morris-Pratt算法、Boyer-Moore算法以及Horspool、Wu & Manber和Aho-Corasick针对Boyer-Moore算法提出的多种改进算法,并基于网络安全应用中开放源码的NIDS系统——Snort2.0,对其中几个算法进行评测,指出了实际应用中字符串匹配技术的关键点和解决办法,探讨了应用字符串匹配技术的NIDS的研发方向。

关键词：字符串匹配模式匹配信息处理 Knuth-Morris-Pratt算法 Boycr-Moore算法

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基于WinPcap的网络监控系统性能优化

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计算机工程 2004年第1期30卷 8-9,47页

作者：李雪莹刘宝旭许榕生中国科学院高能物理研究所计算中心北京100039 军事医学科学院医学情报研究所网络信息中心北京100850

在讨论了基于WinPcap的网络监控系统的实现方法以及在其实现中可能存在的性能瓶颈的基础上，提出了优化基于WinPcap的网络监控系统性能的方法，并对主要方法进行了分析和说明。

关键词：数据捕获协议分析 WinPcap 性能测试

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用于聚合酶链式反应(PCR)引物设计的计算机程序

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生物化学杂志 1992年第3期8卷 342-346页

作者：王槐春朱元晓王嘉玺吴加金张海鹰军事医学科学院医学情报所北京100850 军事医学科学院基础医学所北京100850 军事医学科学院计算中心北京100850

本文报道了两个用于PCR引物设计的计算机程序PCRDESN和PCRDESNA。PCRDESN程序主要从以下4个方面评价用户自己设计的一对引物的质量:(1)引物内的碱基反向重复或发夹结构,(2)两个引物之间的碱基互补配对,(3)两个引物之间的同源性,(4)引物... 详细信息

本文报道了两个用于PCR引物设计的计算机程序PCRDESN和PCRDESNA。PCRDESN程序主要从以下4个方面评价用户自己设计的一对引物的质量:(1)引物内的碱基反向重复或发夹结构,(2)两个引物之间的碱基互补配对,(3)两个引物之间的同源性,(4)引物的碱基组成及特点和T_m值计算。通过用多例文献发表的及本院有关实验室提供的引物对序列的验证,确定了程序的运算参数,证明该程序能较好地检验引物对的质量和解释某些PCR实验失败的原因。PCRDESNA程序采用逐级优化的方法和比PCRDESN所选用的更严紧的引物选择参数对用户提供的核酸序列进行快速检索,以确定所有可能的和合适的引物对。

关键词：聚合酶链反应设计计算机程序

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