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病毒学报 2024年第1期40卷 169-182页

作者：王雪琛李涛王慧王凤雪内蒙古农业大学兽医学院农业农村部动物疾病临床诊疗技术重点实验室呼和浩特010018 军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

猴痘是由猴痘病毒引起的一种人兽共患疾病。猴痘病毒因1958年从带有痘疹的食蟹猴体内分离出而得名。20世纪猴痘病毒多分布于非洲中、西部的热带雨林地区。进入21世纪后,随着世界贸易及人口流通的增加,猴痘在世界范围内日益流行并造成人... 详细信息

猴痘是由猴痘病毒引起的一种人兽共患疾病。猴痘病毒因1958年从带有痘疹的食蟹猴体内分离出而得名。20世纪猴痘病毒多分布于非洲中、西部的热带雨林地区。进入21世纪后,随着世界贸易及人口流通的增加,猴痘在世界范围内日益流行并造成人际间快速传播,造成其他非流行猴痘国家迅速暴发猴痘疫情。猴痘对人类生命安全构成重大威胁,更对全球猴痘疫情的防控提出挑战。本文就猴痘病毒的流行病学、生物学特性、将猴痘病毒应用于不同动物模拟研究猴痘病毒学、免疫学与病理学机制而建立的实验动物模型及疫苗和药物的预防的研究现状进行介绍,为积极防范猴痘疫情、加快研发出特异性针对猴痘的疫苗或药物提供帮助。

关键词：猴痘猴痘病毒人兽共患疾病流行病学特征预防措施

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耐甲氧西林金黄色葡萄球菌感染小鼠致肺炎的模型构建与特征分析

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中国人兽共患病学报 2023年第5期39卷 447-454页

作者：赵玥周冬生杨文慧秦佟童吕蒙翟丽娜张丽丽商正玲贵州医科大学基础医学院免疫学教研室贵阳550025 军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物与生物安全国家重点实验室北京100071 军事科学院军事医学研究院实验动物中心北京100071

目的建立耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)的BALB/c小鼠吸入感染肺炎恢复模型,并评价模型的病原学、病理学、免疫学特征。方法将MRSA以气溶胶肺递送途径感染小鼠,在7 d内观察小鼠状态与死... 详细信息

目的建立耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)的BALB/c小鼠吸入感染肺炎恢复模型,并评价模型的病原学、病理学、免疫学特征。方法将MRSA以气溶胶肺递送途径感染小鼠,在7 d内观察小鼠状态与死亡情况。选择亚致死剂量构建小鼠肺炎恢复模型,检测感染后小鼠的血液及心、肝、脾、肺、肾组织中的细菌载量及病理变化,并对血清与肺泡灌洗液中的细胞因子及肺组织的重要细胞群的变化趋势进行检测。结果致死剂量感染后小鼠的死亡时间集中在48 h内。亚致死剂量感染小鼠后,肺部的病变以48~72 h最为严重,其余组织器官无严重病变;多种细胞因子在12~48 h浓度升高至峰值,在96 h下降至接近感染前水平;在感染后48 h内的肺中,中性粒细胞、树突状细胞、炎性单核细胞、间质巨噬细胞和内皮细胞的比例明显增加,而T细胞、B细胞、肺泡巨噬细胞和上皮细胞的比例则下降。大部分细胞群的比例在96 h恢复至接近感染前水平。结论本研究成功构建了小鼠吸入MRSA感染肺炎恢复模型,并通过多种指标的检测明确0~96 h是小鼠感染后的应答关键期。该小鼠模型可用于深入开展MRSA感染的发病机理、免疫调控、治疗评价等研究,具有良好的应用价值。

关键词：耐甲氧西林金黄色葡萄球菌小鼠模型肺部感染气溶胶

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新冠病毒鼠适应株及其感染模型研究进展与展望

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中国科学基金 2022年第4期36卷 587-593页

作者：陈奇周超秦成峰军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所/病原微生物生物安全国家重点实验室

新型冠状病毒(以下简称“新冠病毒”)肺炎疫情(以下简称“疫情”)暴发以来在全球范围内持续传播，截至目前全球已经有超过4.5亿人感染，并已造成超过600万人死亡。小动物感染模型是疫苗、药物研发及致病机制研究不可或缺的工具。然而，... 详细信息

新型冠状病毒(以下简称“新冠病毒”)肺炎疫情(以下简称“疫情”)暴发以来在全球范围内持续传播，截至目前全球已经有超过4.5亿人感染，并已造成超过600万人死亡。小动物感染模型是疫苗、药物研发及致病机制研究不可或缺的工具。然而，疫情早期的新冠病毒分离株无法感染标准实验小鼠，因而无法直接利用新冠病毒自然分离株建立基于标准实验小鼠的感染模型。为突破这一瓶颈，我们采用在小鼠体内强制连续传代的策略对新冠病毒进行适应驯化，最终获得了对标准实验小鼠具有不同感染和致病能力的鼠适应株，并以此系统性地建立了可模拟新冠肺炎轻度至重度症状的小鼠感染模型。我们通过深度测序、亲和能力分析及蛋白晶体结构解析等方法进一步探究了新冠病毒鼠适应分子机制。新冠病毒鼠适应株及感染模型的建立有效助力了多种新冠疫苗、药物的研发及新冠病毒致病机制研究，为新冠疫情的防控做出了重要贡献。本文从新冠病毒适应株的驯化、鼠适应性的结构与生物学基础、感染模型的建立及应用等方面系统回顾研究成果并对新冠病毒鼠适应株相关研究进展作一简要综述。

关键词：新冠病毒小鼠适应株感染模型氨基酸突变位点

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云南省金沙江流域小型兽类感染巴贝虫的分子流行病学调查

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中国人兽共患病学报 2025年

作者：王帆张云邵宗体李玉琼浦恩念何志海姚明国别双双江佳富杜春红云南省地方病防治所云南省自然疫源性疾病防控重点实验室北京大学首钢医院中国人民解放军军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室

目的了解云南省金沙江流域小型兽类感染巴贝虫的种类及其分布，掌握该地区小型兽类携带巴贝虫情况，为巴贝虫病的防控提供科学依据。方法选取云南省金沙江流域的其中10个县（市），在农耕地、林区等不同环境，捕获分属5目10科25属54... 详细信息

目的了解云南省金沙江流域小型兽类感染巴贝虫的种类及其分布，掌握该地区小型兽类携带巴贝虫情况，为巴贝虫病的防控提供科学依据。方法选取云南省金沙江流域的其中10个县（市），在农耕地、林区等不同环境，捕获分属5目10科25属54种的小型兽类1 493只，取其肝、脾组织提取DNA后，运用分子生物学方法检测巴贝虫18S rRNA的150 bp目的片段作初筛，阳性者进一扩增18S rRNA 1 600 bp目的片段，通过序列比对及系统进化分析进行虫种特征分析。结果在云南省金沙江流域的6个县（市）小型兽类中检测出感染巴贝虫的小型兽类14只，总阳性率为0.93%（14/1493）。经序列分析与比对为田鼠巴贝虫的Otsu型和Kobe型，与人感染巴贝虫的病例患者检出的序列具有较高的相似度和较近的进化关系。6个县（市）的阳性率分别为：巧家县2.34%（3/128），永善县2.06%（2/97），元谋县1.88%（4/213），德钦县1.03%（3/291），香格里拉市0.95%（1/105），水富县0.78%（1/128）。阳性小兽分属1目2科6属8种，分别是白尾松田鼠5.56%（1/18），斯氏家鼠3.36%（4/119），巢鼠3.33%（1/30），西南绒鼠2.94%（1/34），社鼠2.65%（3/113），针毛鼠2.35%（2/85），大耳姬鼠1.16%（1/86），中华姬鼠0.98%（1/102）。巢鼠中检出巴贝虫未见报道。在三种生境和海拔均检出小兽感染巴贝虫，其中1 500～2 500 m林区和高海拔居民区捕获的小兽巴贝虫的感染率较高。结论云南省金沙江沿岸部分县（市）的多种小型兽类存在巴贝虫感染，这些地区巴贝虫的流行情况值得关注。

关键词：云南省金沙江流域小型兽类巴贝虫调查

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假单胞菌属中新型Inc_(pGRT1)质粒的遗传特性及其潜在传播风险

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安徽医科大学学报 2023年第8期58卷 1261-1266页

作者：李昕悦王鹏陈方舟穆小飞卢秀慧贺家琪郑亚丽周冬生殷喆安徽医科大学基础医学院合肥230032 军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

目的分析来自假单胞菌的Inc_(pGRT1)质粒的基因组结构和遗传特征,阐明其潜在的传播风险。方法对临床分离菌株15420352进行分纯和保种后提取基因组DNA,随后进行全基因组测序。测序获得了质粒p420352-strA的完整序列,并对其进行质粒型... 详细信息

目的分析来自假单胞菌的Inc_(pGRT1)质粒的基因组结构和遗传特征,阐明其潜在的传播风险。方法对临床分离菌株15420352进行分纯和保种后提取基因组DNA,随后进行全基因组测序。测序获得了质粒p420352-strA的完整序列,并对其进行质粒型别判断。对所有5个已测序的同型别质粒进行了骨架区和外源插入区的精细注释,其中包括本研究中测序的1个质粒p420352-strA和来自GenBank的4个质粒。主要通过RAST、Plasmidfinder、Blast、ResFinder和ISfinder等核定质粒的ORFs并筛查耐药毒力等相关的关键基因。结果 5个质粒被划分为新的Inc_(pGRT1)型质粒。它们均存在保守的IncpGRT1骨架标记,除主复制子repAInc_(pGRT1)外,还筛查到这些质粒均获取了一个辅复制子。5个IncpGRT1质粒携带了至少3个不同的主要外源插入区:srp区域、msr区域、Tn5053家族转座子。这些质粒中共发现3个已知的涉及2类抗生素耐药和重金属抗性的基因:strA、strB、mer。并发现在这些质粒里携带了至少1种毒力因子msr和5种关键的转运蛋白srp、emrE、mod、phn及lpt。结论 IncpGRT1型质粒已经成为一些耐药基因及毒力基因在假单胞菌属中积累和传播的重要载体,并提高了菌株的环境适应性。

关键词：假单胞菌属移动元件质粒比较基因组学

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武夷山自然保护区蚊虫种类调查与重要蚊种种群遗传结构分析

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中国热带医学 2024年第5期24卷 499-505页

作者：王明谢静文杜雨彤王刚尹紫鸽蔡京虹刘庆张恒端赵彤言史丽内蒙古农业大学园艺与植物保护学院昆虫系统进化与多样性研究室内蒙古呼和浩特010018 军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全全国重点实验室媒介生物危害和自然疫源性疾病北京市重点实验室北京100071 杭州国际旅行卫生保健中心浙江杭州310061

目的了解武夷山自然保护区蚊虫种类分布特征和重要蚊种的种群遗传多样性,为该地区蚊媒传染病防制提供科学依据。方法2022—2023年在武夷山自然保护区内选择16个采样点,幼虫采集使用吸管法、成蚊采集使用诱蚊灯法。利用形态特征和基于细... 详细信息

目的了解武夷山自然保护区蚊虫种类分布特征和重要蚊种的种群遗传多样性,为该地区蚊媒传染病防制提供科学依据。方法2022—2023年在武夷山自然保护区内选择16个采样点,幼虫采集使用吸管法、成蚊采集使用诱蚊灯法。利用形态特征和基于细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(cytochrome c oxidase subunitⅠ,COⅠ)和细胞色素氧化酶亚基Ⅱ(cytochrome c oxidase subunitⅡ,COⅡ)的分子鉴定技术相结合鉴定蚊种。利用ClustalX、DnaSP 5.0、Network 4.6.1.0等软件进行日本伊蚊(***)、白纹伊蚊(***)、骚扰阿蚊(***)种群遗传分化程度和基因流的分析。结果经鉴定,本研究在武夷山自然保护区采集的蚊虫隶属于蚊科8属30种。其中伊蚊属10种,库蚊属13种,阿蚊属1种,直角蚊属1种,蓝带蚊属1种,杵蚊亚属1种,按蚊属1种,巨蚊属2种。3种重要蚊虫种群遗传结构分析结果表明,日本伊蚊单倍体多样性指数为0.9947,种群间普遍达到中等分化程度,种群6与种群12之间遗传分化程度较高;白纹伊蚊单倍体多样性指数为0.6340,种群1和2与各种群之间遗传分化程度较大;骚扰阿蚊单倍体多样性指数为0.7033,种群2与种群3、种群4、种群6、种群7之间遗传分化程度较大,基因流较小。结论武夷山自然保护区蚊虫物种丰富。本研究对蚊种组成、分布开展了较为全面的调查,分析了日本伊蚊、白纹伊蚊、骚扰阿蚊重要蚊种的种群遗传结构特征,为当地蚊媒生态研究和蚊媒疾病防控等方面提供了科学数据参考。

关键词：蚊武夷山细胞色素氧化酶亚基Ⅰ 细胞色素氧化酶亚基Ⅱ 物种鉴定种群遗传结构

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2020-2021年河北省新诊断HIV-1感染者中和抗体分布状况

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中华医院感染学杂志 2023年第2期33卷 214-220页

作者：李思其李韩平韩婧婉张冬刘永健李天一李敬云李林北京化工大学生命科学与技术学院北京100029 军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物与生物安全国家重点实验室北京100071

目的了解河北省2020-2021年新诊断HIV-1感染者不同人群中和抗体分布特征及潜在的影响因素。方法收集河北省2020年-2021年新诊断的HIV-1感染者血浆共500份,中和实验筛查感染者血浆中和抗体分布,PCR扩增和测序获得感染者体内毒株env基因序... 详细信息

目的了解河北省2020-2021年新诊断HIV-1感染者不同人群中和抗体分布特征及潜在的影响因素。方法收集河北省2020年-2021年新诊断的HIV-1感染者血浆共500份,中和实验筛查感染者血浆中和抗体分布,PCR扩增和测序获得感染者体内毒株env基因序列,分析gp120的V1V2区、V3区和gp41基因氨基酸序列长度及非同义突变与同义突变的比例(dN/dS)所体现的选择压力与感染者血浆中和广度的相关性。结果相较于异性恋感染者,男男同性恋感染者群体中和抗体滴度更高,异性恋感染者群体中,男性感染者的中和抗体滴度高于女性感染者;CRF01_AE和BC重组型感染者血浆样本对同亚型假病毒表现出更强的中和活性(P均<0.05),而单纯B亚型和C亚型毒株感染者血浆样本对同亚型假病毒或不同亚型假病毒的中和活性均无统计学差异;gp120的V1V2区的氨基酸序列长度及体现选择压力的dN/dS均与中和抗体的中和广度线性相关。结论HIV-1感染者体内中和抗体在不同传播人群分布存在差异,男男同性恋感染者人群比异性恋人群具有更高的中和活性,重组型感染者血浆展现出对同亚型假病毒的中和优势;且中和抗体的中和广度与病毒gp120高变区的氨基酸长度及宿主的选择压力密切相关。

关键词：人类免疫缺陷病毒中和抗体传播途径亚型膜蛋白编码基因河北

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炭疽PasteurⅡ株芽孢气溶胶感染小鼠模型的构建与评价

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中国比较医学杂志 2023年第5期33卷 69-76页

作者：翟丽娜宋晓琳张丽丽杨文慧周冬生房彤宇吕蒙军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071 北京化工大学生命科学与技术学院北京100029

目的构建炭疽PasteurⅡ株芽孢气溶胶感染小鼠模型并评价构建效果。方法选取补体成分C5缺乏的B10.D2-Hc^(0)H2^(d)H2-T18c/oSnJ小鼠,以气溶胶肺递送途径感染炭疽PasteurⅡ株芽孢(减毒株),研究感染后的疾病进展、细菌载量、组织病理学改... 详细信息

目的构建炭疽PasteurⅡ株芽孢气溶胶感染小鼠模型并评价构建效果。方法选取补体成分C5缺乏的B10.D2-Hc^(0)H2^(d)H2-T18c/oSnJ小鼠,以气溶胶肺递送途径感染炭疽PasteurⅡ株芽孢(减毒株),研究感染后的疾病进展、细菌载量、组织病理学改变、细胞因子和急性反应蛋白水平。结果小鼠半数致死剂量为5×10^(3)CFU。炭疽芽孢肺部感染小鼠12 h后就出现多器官转移并引发菌血症;组织病理改变及炎症反应与其他物种(包括兔、非人灵长类及人类)相似;血清和肺泡灌洗液中的C反应蛋白和血清淀粉样蛋白P水平表明小鼠感染后可激发急性炎症反应。结论该模型可作为替代性的小动物模型,用于进一步阐明炭疽芽孢杆菌的发病机制和宿主对炭疽芽孢易感性的差异,为炭疽疫苗和治疗药物提供新方法。

关键词：炭疽芽孢杆菌小鼠模型气溶胶吸入性炭疽

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传染病预测模型的应用及研究进展

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中华医院感染学杂志 2023年第16期33卷 2550-2554页

作者：沈世敬崔晓鸣曹务春赣南医学院公共卫生与健康管理学院江西赣州341000 军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

近年来新发突发传染病疫情不断出现,严重急性呼吸综合征、高致病性禽流感(Influenza in birds)、甲型H1N1流感(Influenza A)、埃博拉疫情(Ebola virus)、中东呼吸综合征、新型冠状病毒感染(COVID-19)等公共卫生事件的不断发生对人类健... 详细信息

近年来新发突发传染病疫情不断出现,严重急性呼吸综合征、高致病性禽流感(Influenza in birds)、甲型H1N1流感(Influenza A)、埃博拉疫情(Ebola virus)、中东呼吸综合征、新型冠状病毒感染(COVID-19)等公共卫生事件的不断发生对人类健康和社会、经济的发展造成了严重的危害,对公共卫生领域造成了严重威胁,传染病预测模型在疫情防控中发挥着重要作用,主要应用于疫情发展传播趋势的预测、不同防控措施效果的评价、疫情风险预警以及疾病的日常监测等方面,对疫情精准防控、快速遏制起到重要作用。但目前预测模型在疫情数据的处理、场景的适用性、以及模型的准确性等方面还存在一些局限性,应增加与其他科目的交叉为流行病学发展提供新的思路。

关键词：预测模型机器学习新型冠状病毒感染流行病学

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A型肉毒毒素轻链胞内持留模型的建立

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微生物学报 2021年第11期61卷 3496-3505页

作者：高洁王建新南楠宫赛赛李涛王慧军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

【目的】建立A型肉毒毒素轻链胞内持留模型来模拟A型肉毒毒素引起的长期中毒。【方法】设计构建pcDNA3.1-ALC-GFP重组质粒,提取质粒进行PCR验证,并将其转染进Nureo-2a细胞中表达,利用Western Blot与细胞免疫荧光分析验证ALC-GFP的表达... 详细信息

【目的】建立A型肉毒毒素轻链胞内持留模型来模拟A型肉毒毒素引起的长期中毒。【方法】设计构建pcDNA3.1-ALC-GFP重组质粒,提取质粒进行PCR验证,并将其转染进Nureo-2a细胞中表达,利用Western Blot与细胞免疫荧光分析验证ALC-GFP的表达情况及其在细胞内的长时间持留,建立A型肉毒毒素轻链的胞内持留模型,并将该模型用于抗肉毒药物的筛选。【结果】成功构建pcDNA3.1-ALCGFP重组质粒并将其转染进Nureo-2a细胞中,验证了ALC-GFP在细胞内具有长时间持留性,成功建立了A型肉毒毒素轻链胞内持留模型,并利用该模型筛选出潜在抗肉毒药物CB3。【结论】成功建立了A型肉毒毒素轻链胞内持留模型,并初步应用于CS1,CE2和CB3药物筛选,为A型肉毒毒素长期中毒的解毒研究奠定了基础。

关键词： A型肉毒毒素轻链 Nureo-2a细胞持留药物筛选

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