检索结果-内蒙古大学图书馆

军事医学 2022年第3期46卷 167-172页

作者：穆凯孙岩松周冬生赵月峨杨慧盈殷喆王鹏军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

目的建立临床医学研究中便捷易用的质粒基因注释可视化系统,用于直观展示质粒结构与基因分布。方法运用Perl语言编写VPA系统4个主要模块(文件配置模块、颜色系统模块、图形生成模块和出错帮助模块),生成Perl脚本***。结果构建了质粒基... 详细信息

目的建立临床医学研究中便捷易用的质粒基因注释可视化系统,用于直观展示质粒结构与基因分布。方法运用Perl语言编写VPA系统4个主要模块(文件配置模块、颜色系统模块、图形生成模块和出错帮助模块),生成Perl脚本***。结果构建了质粒基因注释可视化系统VPA,该系统可实现多种类别、不同长度质粒的基因注释可视化显示,展示信息丰富全面、操作简单便捷。结论VPA系统可适用于目前细菌研究中常见的大部分质粒基因注释工作,为细菌的比较基因组学和结构基因组学提供了更直观的图像展示,并为其他相关可视化系统的开发提供了参考模型。

关键词： VPA系统质粒基因注释可视化

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基于CRISPR-Cas系统的核酸检测方法研究进展

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军事医学 2021年第12期45卷 955-960页

作者：游旸杜宗敏军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

核酸检测在病原体筛查、基因分型、癌症相关基因突变检测、单核苷酸多态性识别等方面有着重要作用。基于CRISPR-Cas系统的核酸检测方法具有灵敏度高、特异性强、快速廉价以及多重检测等优势,在核酸检测特别是现场快速检测领域具有良好... 详细信息

核酸检测在病原体筛查、基因分型、癌症相关基因突变检测、单核苷酸多态性识别等方面有着重要作用。基于CRISPR-Cas系统的核酸检测方法具有灵敏度高、特异性强、快速廉价以及多重检测等优势,在核酸检测特别是现场快速检测领域具有良好的应用前景。目前,基于不同的CRISPR-Cas系统已开发出多种核酸检测方法,如DETECTR、HOLMES以及SHERLOCK等。该文综述了CRISPR核酸检测方法的原理、特性以及研究进展,可为该技术的应用推广提供参考。

关键词：核酸检测 Cas12 Cas13 Cas14 等温扩增

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下调自噬相关蛋白ATG4B抑制贝氏柯克斯体细胞内增殖

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军事医学 2022年第8期46卷 569-575页

作者：张家宁付梦姣焦俊欧阳譞于永慧赵明亮张珊温博海熊小路孙岩松军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

目的研究宿主细胞自噬相关基因4B(ATG4B)对贝氏柯克斯体胞内生长繁殖的影响。方法用ATG4B特异小干扰RNA(siRNA)处理宿主细胞(THP-1和Vero),以非特异siRNA和无siRNA处理的细胞为对照;逆转录实时荧光定量PCR(qRT-PCR)和Western印迹检测抑... 详细信息

目的研究宿主细胞自噬相关基因4B(ATG4B)对贝氏柯克斯体胞内生长繁殖的影响。方法用ATG4B特异小干扰RNA(siRNA)处理宿主细胞(THP-1和Vero),以非特异siRNA和无siRNA处理的细胞为对照;逆转录实时荧光定量PCR(qRT-PCR)和Western印迹检测抑制效果;Western印迹分析细胞自噬标识蛋白(p62和LC3)的量变;qRT-PCR检测贝氏柯克斯体感染细胞中细菌增殖水平;共聚焦显微镜观察贝氏柯克斯体感染细胞中细菌寄生囊泡发育状况。结果与对照组比较,ATG4B特异siRNA处理组的细胞自噬标识蛋白p62和LC3-Ⅱ明显增多,细菌繁殖量更低,细菌寄生囊泡为散在分布小囊泡而不是单一成熟大囊泡。结论宿主细胞ATG4B表达下调可部分阻断自噬,自噬的部分阻断使贝氏柯克斯体寄生囊泡发育受阻,进而抑制贝氏柯克斯体胞内生长繁殖,为阐明宿主细胞的自噬促进贝氏柯克斯体繁殖的致病机制提供了新的依据。

关键词：贝氏柯克斯体自噬相关基因4B 小干扰RNA 胞内寄生感染细胞增殖

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鲍曼不动杆菌bauA与basD基因缺失株的构建及其生物学功能研究

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军事医学 2022年第3期46卷 179-183,187页

作者：南楠高洁宫赛赛李涛王慧军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

目的构建鲍曼不动杆菌bauA与basD基因缺失株,研究铁载体相关基因对鲍曼不动杆菌生存及致病性的影响。方法构建pMO130-Tel^(R)-bauA(Up/Down)及pMO130-Tel^(R)-basD(Up/Down)质粒,通过同源重组获得基因缺失株;通过基因缺失株生长曲线测... 详细信息

目的构建鲍曼不动杆菌bauA与basD基因缺失株,研究铁载体相关基因对鲍曼不动杆菌生存及致病性的影响。方法构建pMO130-Tel^(R)-bauA(Up/Down)及pMO130-Tel^(R)-basD(Up/Down)质粒,通过同源重组获得基因缺失株;通过基因缺失株生长曲线测定、运动能力比较、生物膜的形成及胞内存活能力测定等方法对缺失株的功能进行了测试。结果通过构建含同源片段的重组pMO130-Tel^(R)质粒,分别成功敲除鲍曼不动杆菌4294中的bauA基因和basD基因,突变株在缺铁条件下生长能力显著下降,运动能力、生物膜形成能力及胞内存活能力也有不同程度的下降。结论bauA基因和basD基因敲除对鲍曼不动杆菌生存有很大影响,提示铁载体相关基因在细菌致病中发挥重要作用。

关键词：鲍曼不动杆菌基因缺失株铁载体

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携带Kpn1酶切位点的日本脑炎病毒全长感染性克隆的构建与鉴定

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军事医学 2021年第12期45卷 908-912,918页

作者：韦傢郑黄星耀孙梦许王洪江李晓峰秦成峰军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

目的构建携带特定酶切位点的日本脑炎病毒全长感染性克隆,并对拯救病毒的生物学特征进行鉴定。方法利用分子克隆和反向遗传学技术,在日本脑炎病毒全长感染性克隆pJE70质粒的基础上引入Kpn1单酶切位点,获得pJE70_Kpn1重组质粒。将质粒线... 详细信息

目的构建携带特定酶切位点的日本脑炎病毒全长感染性克隆,并对拯救病毒的生物学特征进行鉴定。方法利用分子克隆和反向遗传学技术,在日本脑炎病毒全长感染性克隆pJE70质粒的基础上引入Kpn1单酶切位点,获得pJE70_Kpn1重组质粒。将质粒线性化后进行体外转录,将转录体RNA转染BHK-21细胞,拯救获得恢复病毒E70-Kpn1。通过间接免疫荧光、蚀斑形成实验、生长曲线测定、小鼠神经毒力评价等方法鉴定恢复病毒E70-Kpn1的生物学特性。结果成功构建了携带Kpn1的日本脑炎病毒全长感染性克隆,该克隆能拯救出重组的日本脑炎病毒E70-Kpn1,其生物学特征与亲本株E70无显著差异。结论研究获得携带Kpn1酶切位点的日本脑炎病毒全长感染性cDNA克隆,并成功拯救获得一株重组日本脑炎病毒,为下一步进行反向遗传学操作提供了可靠的工具。

关键词：脑炎病毒,日本克隆,分子 pJE70质粒 Kpn1酶切位点恢复病毒E70-Kpn1

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布林西多福韦治疗双链DNA病毒感染的药理与临床研究进展

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药物评价研究 2023年第5期46卷 1131-1140页

作者：曹玢旺王洪权王保刚军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

布林西多福韦(BCV)是西多福韦(CDV)的长脂肪侧链衍生物,是核苷类DNA聚合酶竞争性抑制剂。BCV结构中脂质部分的引入增加了细胞摄取和口服生物利用度,使其在保持广谱抗双链DNA(dsDNA)特性的基础上有效提高了抗病毒活性。临床试验表明BCV... 详细信息

布林西多福韦(BCV)是西多福韦(CDV)的长脂肪侧链衍生物,是核苷类DNA聚合酶竞争性抑制剂。BCV结构中脂质部分的引入增加了细胞摄取和口服生物利用度,使其在保持广谱抗双链DNA(dsDNA)特性的基础上有效提高了抗病毒活性。临床试验表明BCV对多种dsDNA病毒表现出良好的治疗效果,并被美国食品药品监督管理局批准用于全年龄段天花的治疗。BCV不是有机阴离子转运蛋白-1(OAT-1)的底物,肾毒性降低,腹痛、腹泻等胃肠道症状以及血清转氨酶升高是其常见的不良反应。就BCV的作用机制、药动学、临床疗效和安全性研究进行综述,为抗dsDNA病毒药物研发及合理用药提供参考。

关键词：布林西多福韦西多福韦双链DNA病毒有机阴离子转运蛋白-1 合理用药

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肠道菌群与结直肠癌关系及其研究技术进展

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肿瘤代谢与营养电子杂志 2021年第2期8卷 211-216页

作者：常宇骁杨瑞馥毕玉晶病原微生物生物安全国家重点实验室军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所北京100071

结直肠癌是常见的肿瘤之一,在中国肿瘤发病率中排名第三。肠道菌群对肿瘤增殖、存活、转移与肿瘤发生都产生重要影响,特别是肿瘤微环境中的代谢物可以刺激炎症细胞诱导慢性炎症反应。肠道菌群会影响机体和调节结直肠甚至整个消化系统的... 详细信息

结直肠癌是常见的肿瘤之一,在中国肿瘤发病率中排名第三。肠道菌群对肿瘤增殖、存活、转移与肿瘤发生都产生重要影响,特别是肿瘤微环境中的代谢物可以刺激炎症细胞诱导慢性炎症反应。肠道菌群会影响机体和调节结直肠甚至整个消化系统的生理功能,这与结直肠癌有着密切的关系。目前测序技术和细菌-宿主机制相互作用是研究肠道菌群和结直肠癌的主要方法,测序技术可以快速大量的对粪便样本进行菌群的种类、基因和功能上的分析,细菌-宿主相互作用技术可以从实验角度研究细菌对疾病发生发展的机制,更精准地确定肠道菌群和结直肠癌的关系。但DNA提取差异、引物偏差、测序深度,以及细菌菌株差异、未知细菌的影响等都制约着研究的进展。随着研究技术的发展,培养组学以及肠道类器官技术为肠道菌群和结直肠癌关系研究带来了新的技术和方法,一定程度上弥补了测序技术和实验技术的不足。本文就针对肠道菌群和结直肠癌关系的研究技术展开综述,讨论了其研究进展及发展方向。

关键词：肠道菌群结直肠癌宏基因组培养组学类器官

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铜绿假单胞菌噬菌体vB_PaS_IME307的生物学特性研究及全基因组分析

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陆军军医大学学报 2023年第19期45卷 2045-2056页

作者：王灿刘慧莹高明明米丽媛喻鑫婷米志强柏长青安徽医科大学附属阜阳医院呼吸内科安徽阜阳236000 解放军总医院第五医学中心呼吸与危重症医学科北京100071 军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071 深圳大学总医院呼吸与危重症医学科广东深圳518000

目的以实验室保存菌株Pa175为宿主菌,从医院污水中分离得到1株铜绿假单胞菌噬菌体,研究其生物学特性及全基因组学特征。方法利用双层平板法、噬斑法分离并鉴定噬菌体;PEG8000浓缩NaCl沉淀法纯化噬菌体;蔗糖梯度离心进一步纯化噬菌体,经... 详细信息

目的以实验室保存菌株Pa175为宿主菌,从医院污水中分离得到1株铜绿假单胞菌噬菌体,研究其生物学特性及全基因组学特征。方法利用双层平板法、噬斑法分离并鉴定噬菌体;PEG8000浓缩NaCl沉淀法纯化噬菌体;蔗糖梯度离心进一步纯化噬菌体,经磷钨酸负染染色后,使用透射电子显微镜观察其形态;蛋白酶K/SDS法提取噬菌体DNA,对提取的核酸进行全基因组测序和生物信息学分析。结果得到1株裂解性铜绿假单胞菌噬菌体vB_PaS_IME307,该噬菌体可以形成透明且有晕环的噬菌斑,全基因组大小为51545 bp。透射电镜结果显示vB_PaS_IME307的头部呈正二十面体形状,直径(66±2)nm,尾长(116±2)nm;进化树分析发现该噬菌体为Mccleskeyvirinae病毒属,长尾噬菌体科(Siphoviridae)。生物学特性研究发现:vB_PaS_IME307在pH=4.0~11.0、60℃以下能够保持较高活性,感染周期约为60 min,其中包括10 min潜伏期和50 min暴发期,其暴发量为150 PFU/cell。结论噬菌体vB_PaS_IME307具有宿主特异性,对温度和pH具有较好的耐受能力,具有防治铜绿假单胞菌细菌感染的潜力。

关键词：铜绿假单胞菌噬菌体生物学特性基因组学分析

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结核分枝杆菌Hsp65-Ag85B、Hsp65-ESAT6融合基因DNA疫苗株的构建及免疫原性研究

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免疫学杂志 2020年第2期36卷 109-115页

作者：张真赵玲娜申梦王希良杨鹏辉包金风内蒙古医科大学基础医学院呼和浩特010059 中国人民解放军总医院第五医学中心北京100039 军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所/病原微生物与生物安全国家重点实验室北京100071

目的构建结核分枝杆菌Hsp65-Ag85B、Hsp65-ESAT6 DNA候选疫苗株并鉴定,初步评价其免疫原性。方法从GenBank中获取*** H37Rv的Ag85B、ESAT6和Hsp65基因序列优化后合成,经PCR、酶切、连接与真核表达载体PVAX1重组,构建重组质粒PVAX1-Hsp65... 详细信息

目的构建结核分枝杆菌Hsp65-Ag85B、Hsp65-ESAT6 DNA候选疫苗株并鉴定,初步评价其免疫原性。方法从GenBank中获取*** H37Rv的Ag85B、ESAT6和Hsp65基因序列优化后合成,经PCR、酶切、连接与真核表达载体PVAX1重组,构建重组质粒PVAX1-Hsp65-Ag85B和PVAX1-Hsp65-ESAT6。重组质粒体外转染验证其表达后,免疫C57BL/6小鼠,检测特异性细胞免疫应答反应。结果Hsp65-Ag85B、Hsp65-ESAT6 DNA疫苗株在体内外均能表达,Western blot结果显示,DNA疫苗株体外转染293T细胞,24 h可检测到特异性蛋白条带,48 h蛋白表达量达最高。小鼠体内实验表明,Hsp65-Ag85B、Hsp65-ESAT6 DNA疫苗株均可激发较强的免疫反应,可诱导机体产生分泌高水平TNF-α的Th型免疫应答,且Hsp65-Ag85B优于Hsp65-ESAT6。结论Hsp65-Ag85B、Hsp65-ESAT6 DNA疫苗株均具有较强的免疫原性,呈Th型细胞介导的免疫应答,推测Hsp65-Ag85B DNA疫苗的保护效力优于Hsp65-ESAT6,为新型结核DNA疫苗研制提供了实验依据。

关键词： DNA疫苗 Ag85B ESAT6 Hsp65 分枝杆菌

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金黄色葡萄球菌噬菌体vB_Sau_P68的基因组分析和裂解酶

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微生物学通报 2022年第8期49卷 3107-3119页

作者：于诗筠吕金晖文会淇张雅倩喻鑫婷米志强黄海龙吉林农业大学动物科学技术学院吉林长春130118 军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071 安徽医科大学解放军307临床学院北京100071

【背景】金黄色葡萄球菌是常见的人畜共患条件致病菌,随着多耐药菌株分离率的增长,研发与抗生素作用模式不同的抗菌剂迫在眉睫。【目的】分离高效且特异性强的金黄色葡萄球菌噬菌体,对其进行功能注释,并对其编码的裂解酶进行功能验证。... 详细信息

【背景】金黄色葡萄球菌是常见的人畜共患条件致病菌,随着多耐药菌株分离率的增长,研发与抗生素作用模式不同的抗菌剂迫在眉睫。【目的】分离高效且特异性强的金黄色葡萄球菌噬菌体,对其进行功能注释,并对其编码的裂解酶进行功能验证。【方法】通过对噬菌体全基因组序列进行分析找到裂解酶基因,利用原核表达系统对其编码的2个裂解酶蛋白进行克隆,用SDS-PAGE与蛋白免疫印迹法(Western blotting)鉴定目的蛋白是否表达,并采用单斑法验证其裂解活性。【结果】本研究的噬菌体为一株新的金黄色葡萄球菌噬菌体,命名为vB_Sau_P68,该基因组全长为139409 bp,GC含量为31.0%,编码220个开放阅读框(open reading frame,ORF),透射电镜观察具有正二十面体头部和收缩性尾部,形态学分类属于肌尾噬菌体。该噬菌体编码2个裂解酶基因,分别具有CHAP催化结构域与SH3_5结合结构域,SDS-PAGE与Western blotting表明Lys161能够表达且有裂解活性,Lys163则无法外源表达。对Lys161序列进行分析,该裂解酶无信号肽,无跨膜区域,以无规则卷曲为主。【结论】本研究对一株新的金黄色葡萄球菌噬菌体编码的2个裂解酶基因进行了克隆表达,结果提示CHAP催化结构域具有裂解活性,而SH3_5结合结构域则不表达。这一结果可为裂解酶的机制探索及应用提供理论基础。

关键词：全基因组分析 CHAP结构域 SH3_5结构域蛋白结构

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