检索结果-内蒙古大学图书馆

中国寄生虫学与寄生虫病杂志 2020年第4期38卷 453-463页

作者：沈瑞鑫王意婷李春晓吴家红赵彤言陈艳贵州医科大学基础医学院寄生虫学教研室贵阳550000 军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室媒介生物危害和自然疫源性疾病北京市重点实验室北京100071

目的通过对致倦库蚊溴氰菊酯敏感株和抗性株进行转录组分析,筛选可能与抗性相关的差异表达基因。方法对致倦库蚊实验室敏感株(SS株)、海南株(HN株)和溴氰菊酯药筛抗性株(RR株) 3个不同抗性水平的株系进行生物测定,分别构建3个株系的cDN... 详细信息

目的通过对致倦库蚊溴氰菊酯敏感株和抗性株进行转录组分析,筛选可能与抗性相关的差异表达基因。方法对致倦库蚊实验室敏感株(SS株)、海南株(HN株)和溴氰菊酯药筛抗性株(RR株) 3个不同抗性水平的株系进行生物测定,分别构建3个株系的cDNA文库,提取RNA,进行转录组测序。基于FPKM值进行差异性分析,对差异基因进行GO和KEGG功能注释与富集分析。筛选出致倦库蚊不同株系中表达量有显著性差异的基因,并采用实时定量PCR验证。结果生物测定结果显示,与致倦库蚊SS株相比,HN株和RR株的抗性倍数分别达到了4 828倍和197 241倍,为高等抗性水平。RNA-seq测序结果显示,致倦库蚊SS株、HN株和RR株转录组共注释基因转录本197 079个。GO富集分析结果显示,在结合、催化活性、细胞过程、代谢过程、单一生物过程、细胞、细胞连接、细胞器中基因富集数量较多。KEGG富集分析结果显示,在富集度最高的前20个条目中,RR株主要富集于剪接体、核糖体等通路,HN株则主要富集于剪切体、RNA转运、hedgehog信号通路、细胞周期、核苷酸切除修复、DNA复制等方向。基于FPKM值的差异性分析结果显示,致倦库蚊RR株和HN株较SS株均上调的有5 357个,均下调的有10 978个。与溴氰菊酯抗性相关基因的靶向性筛选结果显示,与SS株相比,RR株和HN株注释的细胞色素P450基因、谷胱甘肽转移酶基因、气味结合蛋白基因、气味受体基因、视觉基因、核糖体蛋白基因和碳酸酐酶基因转录本中,均上调的分别为100、17、13、4、16、191和1个,均下调的分别为253、48、43、4、15、504和9个。从上调基因中挑选的12个基因(2个细胞色素P450基因、1个谷胱甘肽转移酶基因、1个视觉基因、1个核糖体蛋白基因、1个碳酸酐酶基因、1个核酸内切酶基因、2个气味结合蛋白基因、3个气味受体基因)进行实时定量PCR验证结果显示,在RR株和HN株中,这12个基因较SS株均显著上调,其中RR株较SS株上调1.62~80.26倍,HN株较SS株上调2.01~189.48倍。相关性分析结果显示,12个目标基因的RNA-seq结果与实时定量PCR结果在HN株和RR株中均呈正相关(r=0.802、0.710)。证明这12个目标基因的实时定量PCR结果与转录组测序结果趋势一致。结论基于高通量测序结果和定量PCR验证分析,致倦库蚊中的某些细胞色素P450基因、谷胱甘肽S转移酶基因、视觉基因、嗅觉蛋白基因可能在其对溴氰菊酯的抗性中起一定作用。

关键词：致倦库蚊溴氰菊酯抗性基因转录组测序实时定量PCR

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基于实时荧光重组酶聚合酶扩增(RPA)技术的金黄色葡萄球菌快速检测方法的建立

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军事医学 2022年第6期46卷 441-446页

作者：徐健皓李佳欣白欣茹李世青王亚茹袁媛王景林福建农林大学生命科学学院福州350002 军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071 河北师范大学石家庄050024 昆明理工大学生命科学与技术学院昆明650500

目的建立一种针对金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,SA)辅助耐药基因femB的实时荧光重组酶聚合酶扩增(recombinase polymerase amplification,RPA)技术检测方法,并评价其灵敏度、特异性以及实用性。方法针对femB特异基因设计RPA候... 详细信息

目的建立一种针对金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,SA)辅助耐药基因femB的实时荧光重组酶聚合酶扩增(recombinase polymerase amplification,RPA)技术检测方法,并评价其灵敏度、特异性以及实用性。方法针对femB特异基因设计RPA候选扩增引物以及RPA荧光探针,设置同一浓度的阳性质粒浓度筛选出最优的RPA扩增引物,建立SA的实时荧光RPA(exo-RPA)检测方法,并设置SA基因组DNA浓度梯度测试该检测方法的灵敏度;选用11种其他致病菌基因组DNA测试方法特异性。最后模拟临床血液样本比较该法与qPCR检测方法的阳性检出率,评价方法的实用性。结果SA-exo-RPA检测方法在39℃反应温度下,5~10 min内可快速检出最低浓度为1 amol/L(3.82 fg)的SA基因组DNA,且特异性高,与其他致病菌无交叉反应。模拟临床血液样本阳性检出率与已发表文献中qPCR检测方法一致,不受样本中复杂成分的非靶标核酸干扰。结论该研究建立的SA-exo-RPA检测方法具有快速、高灵敏度和高特异性的优点,可应用于SA的现场快速检测。

关键词：重组酶聚合酶扩增金黄色葡萄球菌 femB 敏感性与特异性快速检测

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云南西北部地区家畜无形体感染的分子流行病学调查

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中国人兽共患病学报 2020年第8期36卷 678-684页

作者：姚明国江佳富高子厚贾娜汤丽何志海张青张云王帆杜春红云南省地方病防治所大理671000 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

目的了解云南省西北部地区家畜无形体感染状况,为人无形体病的防控提供科学依据。方法在云南省西北部地区15个县市采集部分家畜血液样本进行DNA提取,PCR扩增无形体16S rRNA基因片段;测定扩得基因片段DNA序列并对其做同源性比对,以确定... 详细信息

目的了解云南省西北部地区家畜无形体感染状况,为人无形体病的防控提供科学依据。方法在云南省西北部地区15个县市采集部分家畜血液样本进行DNA提取,PCR扩增无形体16S rRNA基因片段;测定扩得基因片段DNA序列并对其做同源性比对,以确定无形体种类。结果共采集1791头牛、羊、犬、马、驴的血样,PCR扩增阳性503份,其中牛、羊和犬的阳性率分别为41.08%(228/555)、38.10%(240/630)、6.29%(35/556)。测定PCR扩增16S rRNA基因片段序列,序列同源性分析显示73株序列(14.51%)属嗜吞噬细胞无形体(Anaplasma phagocytophilum),226株序列(44.93%)属绵羊无形体(***),137株序列(27.24%)属边缘无形体(***),48株序列(9.54%)属血小板无形体(***),16株序列(3.18%)属牛无形体(***),3株序列(0.60%)属山羊无形体(***)。其中牛样本检出6种无形体,以边缘无形体为主;羊样本检出5种无形体,以绵羊无形体为主,未检测到山羊无形体;犬样本仅检出嗜吞噬细胞无形体。在15个县市中有12个县市的家畜样本检出无形体基因,盈江县阳性率最高(95.65%),主要是边缘无形体。对人致病的嗜吞噬细胞无形体基因分别从牛(30份)、羊(8份)、犬(35份)样本检出,对人致病的山羊无形体从3份牛样本检出,这2种人兽共患病原体感染的家畜主要分布于滇西北的德钦和香格里拉地区。结论云南省西北部地区部分县(市)无形体感染的家畜主要是牛、羊,其次是犬,无形体种类丰富,需加强当地人无形体病的防控。

关键词：云南省西北部地区家畜无形体 16S rRNA基因

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两个来自非脱羧勒克菌的MDR质粒耐药机制研究

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军事医学 2021年第4期45卷 256-261,271页

作者：陈方舟蒋晓圆罗新华殷喆王岩周冬生赵月峨吴家红贵州医科大学基础医学院现代病原生物学特色重点实验室贵阳550025 军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071

目的探究2个来自非脱羧勒克菌的多药耐药(MDR)质粒p707804-CTXM和pP12375-CTXM的耐药机制。方法采用16S rDNA基因扩增初步鉴定菌种,得到测序数据后进行平均核苷酸一致性(ANI)比对最终核定菌种;全自动细菌鉴定及药敏分析系统检测细菌的MI... 详细信息

目的探究2个来自非脱羧勒克菌的多药耐药(MDR)质粒p707804-CTXM和pP12375-CTXM的耐药机制。方法采用16S rDNA基因扩增初步鉴定菌种,得到测序数据后进行平均核苷酸一致性(ANI)比对最终核定菌种;全自动细菌鉴定及药敏分析系统检测细菌的MIC值;随后进行全基因组测序,获得细菌的全基因组序列,通过RAST、BLASTP/BLASTN、ResFinder和ISfinder等进行精细注释及比较基因组学分析确定耐药基因所在基因环境,阐明耐药移动元件的进化与传播历程。结果非脱羧勒克菌150707804和P12375分别携带质粒p707804-CTXM和pP12375-CTXM,均编码超广谱β-内酰胺酶(ESBL)。这两个质粒均只包含一个MDR区,p707804-CTXM含有β-内酰胺类、氨基糖苷类、氯霉素类、利福平类和磺胺类耐药基因,pP12375-CTXM含有除利福平类以外的上述所有耐药基因。p707804-CTXM的MDR区为新型转座子Tn6810,为Tn1696衍生物,由新型整合子In1684插入至Tn1696骨架而产生。blaCTX-M-3位于ISEcp1介导的转座元件Tn6502(ISEcp1-blaCTX-M-3-orf4 77)中;pP12375-CTXM的MDR区插入在orf531中,由Tn6322、ISKpn25、IS1R、In609、IS26和ΔISPa38构成,blaCTX-M-9由ISCR介导,位于In609的3’-CS下游。结论 p707804-CTXM和pP12375-CTXM均携带多种耐药基因,介导相应菌株的多药耐药。其中blaCTX-M由ISEcp1-blaCTX-M-orf477或ISCR介导并插入至整合子或转座子内。该研究中,p707804-CTXM是非脱羧勒克菌中携带blaCTX-M-3的首个测序质粒。

关键词：非脱羧勒克菌多药耐药移动元件超广谱β-内酰胺酶 blaCTX-M

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蚊虫驱避剂筛选用嗅觉风洞的研制与性能验证

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军事医学 2021年第3期45卷 218-222,233页

作者：谷真毓高赫廷杨巧江邢丹赵彤言赵腾李春晓安徽医科大学合肥230000 军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室媒介生物危害和自然疫源性疾病北京市重点实验室北京100071

目的研制蚊虫嗅觉风洞并通过实验验证其性能,用于驱避剂筛选和评价。方法采用低成本、模块化的方案,设计并研制一套蚊虫嗅觉风洞,通过不同温度、湿度、风速等环境因素的调试,确定实验关键因素;通过埃及伊蚊、致倦库蚊对4种商用驱避剂涂... 详细信息

目的研制蚊虫嗅觉风洞并通过实验验证其性能,用于驱避剂筛选和评价。方法采用低成本、模块化的方案,设计并研制一套蚊虫嗅觉风洞,通过不同温度、湿度、风速等环境因素的调试,确定实验关键因素;通过埃及伊蚊、致倦库蚊对4种商用驱避剂涂抹人手臂和小鼠的嗅觉行为测试,验证该嗅觉风洞应用于蚊虫驱避剂筛选的可行性。结果研制的蚊虫嗅觉风洞主要分为气路控制系统和行为筛选系统两部分;不同温度、湿度、风速等环境因素测试结果显示,温度(30±2)℃、湿度(40±3)%、风速0.2 m/s为嗅觉风洞对蚊虫嗅觉行为测试的最佳因素;未使用驱避剂时,风洞内人手臂对埃及伊蚊的引诱率为(44.1±23.1)%,小鼠对致倦库蚊的引诱率为(35.6±5.1)%,均明显高于空白对照(P<0.05)。4种商业化驱避剂对埃及伊蚊的引诱率分别为(4.4±0.4)%、(2.7±0.2)%、(3.6±1.2)%和(3.6±1.2)%,对致倦库蚊的引诱率分别为0%、0%、(3.8±3.3)%和(3.8±1.6)%,与对照组相比,使用驱避剂后人手臂和小鼠对蚊虫的引诱能力明显降低,均存在显著性差异(P<0.05)。结论研制出一套蚊虫嗅觉风洞,通过2种蚊虫对现有商业化驱避剂的嗅觉行为测试,验证了该嗅觉风洞的性能,可用于蚊虫驱避剂的筛选和评价。

关键词：蚊虫嗅觉风洞驱避剂筛选

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基于SARIMA模型的南京地区蚊虫侵害的预测研究

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南京医科大学学报（自然科学版） 2022年第1期42卷 108-111页

作者：孙燕群张守刚陆墨原张艳潘衍宇王冲吴起新姚美雪李成国南京市疾病预防控制中心南京医科大学附属南京疾病预防控制中心江苏南京210003 军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071 东南大学公共卫生学院江苏南京210009 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所北京102206 徐州医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系江苏徐州221004

目的:基于南京地区蚊虫侵害密度,建立季节性差分自回归移动平均模型预测方法,为进一步防控蚊媒病和开展爱国卫生运动提供新的思路和方法。方法:应用季节性差分自回归移动平均模型对2019年蚊虫密度进行预测。结果:拟合后的预测模型为ARIM... 详细信息

目的:基于南京地区蚊虫侵害密度,建立季节性差分自回归移动平均模型预测方法,为进一步防控蚊媒病和开展爱国卫生运动提供新的思路和方法。方法:应用季节性差分自回归移动平均模型对2019年蚊虫密度进行预测。结果:拟合后的预测模型为ARIMA(2,1,0)(1,1,0)_(12),模型残差序列为白噪声,模型预测拟合后R^(2)=0.907。结论:模型预测的拟合效果较好,说明ARIMA模型适用于开展蚊虫侵害预测研究。

关键词：蚊虫侵害季节性差分自回归移动平均预测

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蜱传脑炎病毒跨过血脑屏障的体外实验

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微生物学报 2019年第3期59卷 578-586页

作者：康晓平李裕昌吴晓燕魏婧靖郝淮杰姜涛军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物与生物安全国家重点实验室北京100071

【目的】构建蜱传脑炎病毒(Tick-borne encephalitis virus,TBEV)跨血脑屏障研究的体外细胞模型,研究2种不同细胞的TBEV培养物在病毒跨过血脑屏障中的主要差异,从而为进一步TBEV跨血脑屏障的分子机制研究奠定基础。【方法】利用人脑微... 详细信息

【目的】构建蜱传脑炎病毒(Tick-borne encephalitis virus,TBEV)跨血脑屏障研究的体外细胞模型,研究2种不同细胞的TBEV培养物在病毒跨过血脑屏障中的主要差异,从而为进一步TBEV跨血脑屏障的分子机制研究奠定基础。【方法】利用人脑微血管内皮细胞(Human brain microvascular endothelial cells,hCMEC/D3)构建体外血脑屏障的细胞模型。用BHK-21细胞中培养的蜱传脑炎病毒感染人脑微血管内皮细胞,检测TBEV在hCMEC/D3中的复制增殖情况;将TBEV加入体外血脑屏障模型的上层微孔中,用实时荧光定量PCR和噬斑测定的方法检测跨过血脑屏障的病毒量;将感染TBEV的人单核细胞加入血脑屏障模型的上层微孔中,观察渗漏进下层孔中的淋巴细胞,并用实时荧光定量PCR和噬斑测定的方法检测跨过血脑屏障的病毒量。利用伊文思蓝标记的白蛋白确定血脑屏障细胞的渗透率变化。【结果】实时荧光定量PCR和病毒滴度测定结果表明,TBEV不能在hCMEC/D3细胞中复制增殖,也不能直接跨过血脑屏障;然而,人单核细胞THP-1感染TBEV后,尽管单核细胞不能直接携带TBEV跨过血脑屏障,但THP-1中产生的病毒却能跨过血脑屏障模型进入下层孔中,并引起血脑屏障渗透率的增高。【结论】单核细胞有助于TBEV跨过血脑屏障。

关键词：蜱传脑炎病毒血脑屏障单核细胞

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河南省1272例新型冠状病毒肺炎疾病负担分析

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河南预防医学杂志 2021年第5期32卷 321-324,330页

作者：尹超男王海涛魏佳特赵琳曹务春山东大学齐鲁医学院公共卫生学院流行病学系山东济南250000 军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100000

目的应用伤残调整寿命年(DALY)指标分析河南省新型冠状病毒肺炎(新冠肺炎)疾病负担,同时应用DALY结合人力资本法分析河南省新冠肺炎造成的间接经济负担,为卫生部门制定防治措施及公共卫生规划提供参考依据。方法将河南省新冠肺炎确诊病... 详细信息

目的应用伤残调整寿命年(DALY)指标分析河南省新型冠状病毒肺炎(新冠肺炎)疾病负担,同时应用DALY结合人力资本法分析河南省新冠肺炎造成的间接经济负担,为卫生部门制定防治措施及公共卫生规划提供参考依据。方法将河南省新冠肺炎确诊病例的发病、死亡数据根据性别、年龄进行整理,使用WHO疾病负担Excel计算模板和DisMod II计算程序进行DALY的计算,并进行不同年龄段、性别、病例临床分型等DALY的比较,再利用DALY与人力资本法结合估计河南省新冠肺炎的间接经济负担。结果截止到2020年2月27日,河南省共确诊1272例新冠肺炎病例,死亡20例,累计发病率为1.334/10万,死亡率为0.023/10万。河南省新冠肺炎疾病负担DALY总值为230.931人年,DALY强度为0.242人年/10万人,由死亡造成的疾病负担高达225.737人年,占总的DALY比例为97.75%;疾病负担随临床分型加重而不断增加,临床分型为危重型的患者疾病负担占比最高;30岁以上年龄段疾病负担占比最高,高达99.67%,其中60~69岁是DALY总值最高的年龄段,80岁以上年龄段DALY强度最高;男性新冠肺炎疾病负担高于女性;河南省1272例新冠肺炎患者总体间接经济负担为2802476.21元,人均2203.20元。结论河南省新冠肺炎疾病负担主要是由死亡造成的疾病负担,提示我们除加强预防措施外,在疾病早期应保证患者及时就医,控制病情发展。河南省人群中的60~69岁、80岁以上年龄段群体和男性是新冠肺炎防治工作的重中之重。

关键词：新型冠状病毒疾病负担 DALY 间接经济负担

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腺病毒IgM抗体AlphaLISA快速检测方法

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军事医学 2021年第2期45卷 119-123页

作者：陈萱荆红波张力文郑玉玲律清宇姜永强军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071 北京市顺义区疾病预防控制中心北京101300

目的建立一种腺病毒IgM抗体的均相光激化学发光免疫快速检测方法(AlphaLISA)。方法通过筛选小鼠抗人IgM单克隆抗体标记受体微球、链霉亲和素偶联供体微球和生物素化腺病毒抗原的最适比例,构建腺病毒IgM抗体均相AlphaLISA快速检测体系;... 详细信息

目的建立一种腺病毒IgM抗体的均相光激化学发光免疫快速检测方法(AlphaLISA)。方法通过筛选小鼠抗人IgM单克隆抗体标记受体微球、链霉亲和素偶联供体微球和生物素化腺病毒抗原的最适比例,构建腺病毒IgM抗体均相AlphaLISA快速检测体系;采用呼吸道感染样品对该检测体系进行评价,并与间接免疫荧光方法比较。结果与结论该法重复性较好,批内和批间变异系数均小于5%,与间接免疫荧光方法相比总符合率为87.21%,且不与其他常见呼吸道病原体的IgM抗体发生交叉反应。该法用于腺病毒IgM抗体的快速检测,可为早期确诊腺病毒感染提供可行方案。

关键词：均相光激化学发光免疫分析技术人腺病毒 IgM抗体

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1994年印度苏拉特鼠疫暴发的回顾性基因溯源研究

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军事医学 2021年第10期45卷 757-761,765页

作者：秦婧靓杨超郑宏源张湘莉兰武雅蓉崔玉军杨瑞馥赵光宇宋亚军安徽医科大学合肥230032 军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071 深圳市疾病预防控制中心深圳518055

目的明确1994年苏拉特鼠疫疫情中分离的鼠疫耶尔森菌系统发育地位及基因组特征,为进一步研究此次疫情暴发的起因提供线索。方法利用比较基因组学方法,将已发表的两株苏拉特暴发株基因组与366个鼠疫全球代表菌株的基因组进行变异鉴定和... 详细信息

目的明确1994年苏拉特鼠疫疫情中分离的鼠疫耶尔森菌系统发育地位及基因组特征,为进一步研究此次疫情暴发的起因提供线索。方法利用比较基因组学方法,将已发表的两株苏拉特暴发株基因组与366个鼠疫全球代表菌株的基因组进行变异鉴定和系统发育重建,并对苏拉特菌株的基因组特征进行解析。结果苏拉特鼠疫菌很可能是20世纪广泛使用的鼠疫减毒活疫苗株EV76的后代。但两株苏拉特基因组中均存在长度为102 kb的毒力岛(称作pgm位点),该毒力岛在其他已知的EV76疫苗及实验室保藏株中缺失。结论引发1994年苏拉特疫情的菌株属于鼠疫菌EV76种系,其引发疫情的能力可能与携带pgm位点有关。

关键词：苏拉特鼠疫鼠疫耶尔森菌减毒活疫苗系统发育学比较基因组学

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