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上海市园艺学会2012年年会

作者：林范学李宏盛鲍大鹏黄丹枫国家食用菌工程技术研究中心农业部南方食用菌资源利用重点实验室上海市农业遗传育种重点开放实验室上海市农业科学院食用菌研究所上海 201403 济宁学院生命科学与工程系曲阜 273155 上海交国家食用菌工程技术研究中心农业部南方食用菌资源利用重点实验室上海市农业遗传育种重点开放实验室上海市农业科学院食用菌研究所上海 201403 上海交通大学农业与生物学院上海 200240

本研究利用香菇135菌株46个single-spore-isolates作为作图群体，通过Solexa高通量测序技术对135菌株的2个原生质体单核体135A和135B及作图群体基因组DNA进行测序，利用筛选的2253个SNP标记和2个交配型位点构建了一张包含14条连锁群的... 详细信息

本研究利用香菇135菌株46个single-spore-isolates作为作图群体，通过Solexa高通量测序技术对135菌株的2个原生质体单核体135A和135B及作图群体基因组DNA进行测序，利用筛选的2253个SNP标记和2个交配型位点构建了一张包含14条连锁群的香菇遗传连锁图普。这将是首张基于全基因组序列的香菇遗传图谱，对于后续的香菇QTL定位、分子标记辅助选择等研究具有重大意义。

关键词：香菇遗传连锁图 SNP标记基因测序

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蛹虫草中CmSnf1基因的功能研究

蛹虫草中CmSnf1基因的功能研究

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中国菌物学会2016年学术年会

作者：王荣汪滢鲍大鹏国家食用菌工程技术研究中心农业部南方食用菌资源利用重点开放实验室上海市农业遗传育种重点实验室上海市农业科学院食用菌研究所上海海洋大学食品学院

SNF1（sucrose-nonfermenting 1）途径在真核生物中高度保守,是维持生物体内能量动态平衡所必需的。本研究以蛹虫草SNF1复合体中的α亚基Snf1的编码基因Cm Snf1为研究对象,通过基因敲除、荧光标记、表型分析和实时荧光定量PCR等手段系... 详细信息

SNF1（sucrose-nonfermenting 1）途径在真核生物中高度保守,是维持生物体内能量动态平衡所必需的。本研究以蛹虫草SNF1复合体中的α亚基Snf1的编码基因Cm Snf1为研究对象,通过基因敲除、荧光标记、表型分析和实时荧光定量PCR等手段系统地分析了SNF1途径在蛹虫草中的作用。研究发现,蛹虫草Cm Snf1基因缺失后,蛹虫草的细胞壁完整性被破坏,气生菌丝变稀疏,产孢量和孢子萌发率显著下降,且在蚕蛹上无法形成子实体;通过荧光定量PCR分析发现,基因敲除后蛋白水解酶的表达受到影响。Cm Snf1基因与蛹虫草的碳源利用、产孢量和孢子萌发以及子实体的生长发育有关。SNF1途径中各亚基间的功能并非相互独立,当α亚基Snf1缺失时,β亚基及γ亚基可以在某种程度上代替α亚基Snf1行使其功能。

关键词：蛹虫草 SNF1途径子实体形成碳源利用

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工厂化生产中相对温度对杏鲍菇生长的影响

工厂化生产中相对温度对杏鲍菇生长的影响

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上海市园艺学会2012年年会

作者：于海龙杨娟尚晓冬李玉王瑞娟周峰冯志勇农业部南方食用菌资源利用重点实验室国家食用菌工程技术研究中心农业部应用真菌资源与利用重点开放实验室上海市农业遗传育种重点开放实验室上海市农业科学院食用菌研究所上海 201403 上海市农业科学院数字农业工程与技术研究中心上海 201403

使用荷兰AEM公司生产的食用菌环控系统对杏鲍菇工厂化生产过程的环境进行调控，通过对杏鲍菇整个生育过程进行全程跟踪，监测了不同相对湿度对杏鲍菇生长发育的影响。结果表明：不同相对湿度对杏鲍菇生长过程具有显著影响;菌丝恢复速度... 详细信息

使用荷兰AEM公司生产的食用菌环控系统对杏鲍菇工厂化生产过程的环境进行调控，通过对杏鲍菇整个生育过程进行全程跟踪，监测了不同相对湿度对杏鲍菇生长发育的影响。结果表明：不同相对湿度对杏鲍菇生长过程具有显著影响;菌丝恢复速度随着生长环境中相对湿度的增加而加快;原基数目随着生长环境相对湿度的增加而增加;子实体生长过程在相对湿度为91％-93％时最优，产量最高。

关键词：杏鲍菇相对湿度工厂化生产

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运用SNP分子标记构建香菇遗传连锁图谱及分析QTL

运用SNP分子标记构建香菇遗传连锁图谱及分析QTL

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中国菌物学会2015年学术年会

作者：林范学李宏盛黄杰谭琦鲍大鹏国家食用菌工程技术研究中心农业部南方食用菌资源利用重点实验室上海市农业遗传育种重点开放实验室上海市农业科学院食用菌研究所济宁学院生命科学与工程系

本研究以香菇135菌株的2个原生质体单核体135A菌株和135B菌株以及46个孢子单核体为构图群体,通过solexa高通量测序获得基因组序列,对135A和135B进行了组装,组装后的基因组大小分别是37.9Mb和38.9Mb。以135A菌株的基因组序列为参考序列,... 详细信息

本研究以香菇135菌株的2个原生质体单核体135A菌株和135B菌株以及46个孢子单核体为构图群体,通过solexa高通量测序获得基因组序列,对135A和135B进行了组装,组装后的基因组大小分别是37.9Mb和38.9Mb。以135A菌株的基因组序列为参考序列,通过对135B菌株和46个子代的基因组序列和筛选,获得了136,411个SNP位点。以2255个SNP位点和A、B交配型位点为标记构建出一张香菇遗传连锁图,包括14个连锁群,总长度为1553.78cM。根据SNP标记所在的scaffold,将531条scaffold（总长度为23.69 Mb）定位在14条连锁群上,覆盖62.47%的香菇135A菌株的基因组,物理长度和遗传距离之比为15.37kb/cM。以上述构图群体为定位群体,检测到了3个控制香菇单核菌丝体生长速度的QTL,其中在LG2上检测到了一个显著的QTL（Qmmgr-3）,其贡献率为28.8%,与交配型A位点连锁。通过生物信息学分析Qmmgr-3位点附近的DNA序列信息,筛选获得了控制香菇单核菌丝体生长速度的3个候选基因（Le-TDC,Le-CH和Le-CP）。RT-PCR分析表明Le-CP基因在长速快的菌株中和长速慢的菌株中的表达水平存在显著差异。

关键词：香菇 SNP分子标记遗传连锁图谱 QTL

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4℃处理下草菇生理指标与耐低温胁迫相关性研究

4℃处理下草菇生理指标与耐低温胁迫相关性研究

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中国菌物学会2023年学术年会

作者：郑婷婷万佳宁龚明石胜茸杨瑞恒王瑞娟汪滢上海市农业科学院食用菌研究所农业农村部南方食用菌资源利用重点实验室国家食用菌工程技术研究中心国家食用菌加工技术研发分中心上海市农业遗传育种重点开放实验室上海海洋大学食品学院

为了研究生理指标与草菇耐低温胁迫相关性,对经4℃筛选的3个菌株(VC1、VC3、VC4菌株)以及草菇V23菌株进行菌株鉴定、系统分类、生长形态、生长速率试验,并测定菌丝4℃处理下的生理指标。结果表明:VC1、VC3和VC4分别为云芝Trametes versi... 详细信息

为了研究生理指标与草菇耐低温胁迫相关性,对经4℃筛选的3个菌株(VC1、VC3、VC4菌株)以及草菇V23菌株进行菌株鉴定、系统分类、生长形态、生长速率试验,并测定菌丝4℃处理下的生理指标。结果表明:VC1、VC3和VC4分别为云芝Trametes versicolor、乳白原毛平革菌Phanerochaete sordida、毛栓菌Trametes hirsuta,其中VC系列与草菇V23分别位于同一腐生担子菌演化支的木腐和草腐类群。VC系列均能够在4℃生长,其中VC1长势最好;VC1和草菇V23在15-32℃的生长形态和生长速率最为相似。4℃处理0-32h只有VC1表现出较低的β-葡萄糖苷酶抑制活力,而V23则表现出明显的波动。组平均距离分析表明VC1和V23的β-葡萄糖苷酶序列的相似性最高。与下降的VC1总糖含量相比,4℃处理下的V23总糖含量显著上升;V23多糖含量下降比例高达20.97%,远高于VC1的14.69%。这就暗示4℃处理下V23较高的β-葡萄糖苷酶活力促进细胞壁多糖降解成单糖,导致了总糖含量的上升。以上结果提示β-葡萄糖苷酶的活力和总糖含量可能与草菇耐低温胁迫负相关。

关键词：草菇耐低温菌株生长形态 β-葡萄糖苷酶总糖

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基于SRAP、ISSR和RAPD分析灵芝G0130菌株单核体多态性

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工业微生物 2014年第4期44卷 39-45页

作者：徐凯唐传红王天娇杨炎唐庆九刘艳芳张劲松国家食用菌工程技术研究中心农业部南方食用菌资源利用重点实验室国家食用菌加工技术研发分中心上海市农业遗传育种重点实验室上海市农业科学院食用菌研究所上海201403 南京农业大学生命科学学院农业部农业微生物环境工程重点开放实验室江苏南京210095

旨在探讨灵芝原生质体单核体间遗传多态性，为育种材料的筛选提供分子水平依据。采用原生质体单核化获得灵芝Ganoderma lueidum36株单核体，从筛选出的12组SRAP引物，13条ISSR引物和13条RAPD引物对供试菌株的多态性综合分析结果显示，... 详细信息

旨在探讨灵芝原生质体单核体间遗传多态性，为育种材料的筛选提供分子水平依据。采用原生质体单核化获得灵芝Ganoderma lueidum36株单核体，从筛选出的12组SRAP引物，13条ISSR引物和13条RAPD引物对供试菌株的多态性综合分析结果显示，共扩增出320个条带，其中265条表现出多态性，多态位点百分率为82．81％；根据扩增结果采用软件NTsys2．10e计算菌株间的遗传相似系数（GS值）并进行聚类分析，37个菌株间GS值的变化范围为0．3741—0．9852；130—29、130．33和130-53等7株相同交配型单核体聚为一类，其余29株单核体与出发菌株G0130聚为一类，但并非严格按照交配型聚类，且单核体表现出发菌株全部或部分带型，同时也表现其所不具有的带型。研究表明，SRAP、ISSR和RAPD标记可以用于灵芝单核体多态性研究，并可为交配型鉴定提供参考，这将为育种材料的筛选提供帮助，减少育种工作量和风险。

关键词：灵芝单核体分子标记育种

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香菇菌棒转色阶段CO_(2)对香菇产量及品质的影响

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食用菌 2022年第3期44卷 9-11,21页

作者：董浩然李玉姜宁李正鹏刘四海周峰上海市农业科学院食用菌研究所/农业部南方食用菌资源利用重点实验室/国家食用菌工程技术研究中心/上海市农业遗传育种重点开放实验室上海奉贤201403 河南金海生物科技有限公司河南三门峡472000

目的:探究在工厂化可控环境下香菇菌棒转色阶段,环境CO_(2)体积分数对香菇产量及品质的影响。方法:香菇菌棒刺孔增氧后,分别在3种CO_(2)体积分数(对照CK:0.2%~0.3%、T1:0.4%~0.5%、T2:0.7%~0.8%)的条件下培养出菇(菌龄90 d出菇),统计菇... 详细信息

目的:探究在工厂化可控环境下香菇菌棒转色阶段,环境CO_(2)体积分数对香菇产量及品质的影响。方法:香菇菌棒刺孔增氧后,分别在3种CO_(2)体积分数(对照CK:0.2%~0.3%、T1:0.4%~0.5%、T2:0.7%~0.8%)的条件下培养出菇(菌龄90 d出菇),统计菇蕾数、产量,测定菇品质。结果:与CK比较,T1、T2条件下培养出菇,第1潮菇蕾数及产量显著下降,第2潮菇蕾数及产量则显著上升,第3潮均无显著差异;3潮菇总蕾数、单菇重及总产量无显著性差异。与CK相比,T1和T2的A级菇比例分别下降7.44%、22.05%,B级菇比例分别提高1.17%、5.23%,A+B级菇总和比例分别下降2.65%、6.87%,C级菇比例分别提高15.50%、3.40%。结论:香菇转色阶段可控制菇房CO_(2)体积分数在0.4%~0.5%,此条件既可保证香菇产量及品质,又能降低能耗。

关键词：香菇 CO_(2)体积分数产量品质

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金针菇切根多糖FVP60B的降脂作用研究

金针菇切根多糖FVP60B的降脂作用研究

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中国食品科学技术学会第十七届年会

作者：王慧敏刘肖肖张赫男汪雯翰贾薇上海海洋大学食品学院上海市农业科学院食用菌研究所农业部南方食用菌资源利用重点实验室国家食用菌工程技术研究中心国家食用菌加工技术研发分中心上海市农业遗传育种重点开放实验室

高脂血症是动脉粥样硬化、冠心病、脑卒中、中风、心肌梗死等众多疾病的重要危险因素。从金针菇切根中分离纯化得到了分子质量为2.044×10～4 Ku,单糖组成为岩藻糖:半乳糖:葡萄糖:木糖:甘露糖=1.5:3:13:1:2的吡喃型杂多糖FVP60B,并... 详细信息

高脂血症是动脉粥样硬化、冠心病、脑卒中、中风、心肌梗死等众多疾病的重要危险因素。从金针菇切根中分离纯化得到了分子质量为2.044×10～4 Ku,单糖组成为岩藻糖:半乳糖:葡萄糖:木糖:甘露糖=1.5:3:13:1:2的吡喃型杂多糖FVP60B,并利用甲基化分析、紫外可见光谱和红外光谱分析以及核磁共振等手段对其进行了结构解析,并研究该多糖对巨噬细胞RAW264.7和斑马鱼的降脂作用。通过氧化型低密度脂蛋白诱导的巨噬细胞RAW264.7脂质细胞积累模型和高脂饮食诱导的斑马鱼幼鱼高脂模型等研究该多糖的降脂作用。结果表明FVP60B能明显减少脂质积累细胞内的脂滴数量,并且能够显著抑制斑马鱼幼鱼体内的脂质积累。金针菇切根多糖FVP60B具有良好的降脂活性,具有降脂食品添加剂或者保健品的开发潜力。

关键词：金针菇多糖脂质积累细胞斑马鱼降脂活性

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草菇全基因组框架图的构建和序列分析

草菇全基因组框架图的构建和序列分析

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中国菌物学会第五届会员代表大会暨2011年学术年会

作者：鲍大鹏赵国屏谭琦王升跃陈明杰郑华军张劲松朱永强汪虹康慧陈祥林楠冯爱萍国家食用菌工程技术研究中心农业部南方食用菌资源利用专业重点实验室上海市农业遗传育种重点开放实验室上海市农业科学院食用菌研究所国家人类基因组南方研究中心

草菇是一种重要的常规栽培种类,其栽培起源于我国,具有悠久的栽培历史,在国际上有"中国菇"之称。草菇味道鲜美,营养丰富,并具有一定的保健作用,在中国的华南地区及东南亚等地区一直很受欢迎。草菇是食用菌中主要的草腐菌,以... 详细信息

草菇是一种重要的常规栽培种类,其栽培起源于我国,具有悠久的栽培历史,在国际上有"中国菇"之称。草菇味道鲜美,营养丰富,并具有一定的保健作用,在中国的华南地区及东南亚等地区一直很受欢迎。草菇是食用菌中主要的草腐菌,以稻草、麦秆、废棉为生长基质。但是草菇的生物学转化率比较低,一般只有20%,远远低于其它食用菌100-150%的生物学转化率。草菇一个特有的生物学性状是在摄氏4度低温下发生自溶,这使得草菇成为唯一不能低温储运的食用菌。这也导致草菇的货架期很短,从而极大地限制了草菇栽培的普及。如何解决这些问题,多年来一直是食用菌遗传育种科研工作者努力研究的目标。由于对草菇的遗传学背景的了解比较薄弱,因而在分子水平上对草菇的分解木质纤维素和低温自溶的机理的研究一直没有重要的突破。近年来,新一代高通量测序技术的出现,显著地提高了基因组测序的速度,并大幅度地降低了测序成本,这为完成真菌类物种的全基因组序列提供了很好的机遇。通过完成草菇的全基因组测序计划,可以在全基因组水平上了解草菇降解木质纤维素的机制。并结合诱导变异型菌株基因组测序,开展其与野生型菌株的比较基因组学分析,有望了解草菇低温自溶分子机理,这些研究成果将为进一步运用基因修饰手段提高草菇分解基质的能力和耐低温的能力奠定坚实的基础。本研究采用Roche公司的454 GS FLX测序技术和Illumina公司的Solexa测序技术分别对草菇的单孢分离菌株进行了从头(de novo)全基因组序列测定,充分利用两种不同特点测序技术获得的结果,完成了草菇野生型全基因组框架图的构建,进行了初步的基因组结构和基因功能的生物信息学分析。用Roche 454 GS FLX测序技术,得到序列总长714,488,913 bp,测序覆盖率为20倍。通过Newbler软件拼装,得到LargeContigs(>2 kb)1,289个,Contig总长度为35.60Mb。采用Illumina solexa测序技术进行了DNA片段配对末端(paired-end)测序,测序长度为2*100bp,得到30,884,166对序列,基因组覆盖率为170倍。应用Velvet软件进行拼装,得到Large Contigs(>2 kb)4,022个,总计大小32.37Mb。运用独立开发的软件,将上述两组数据整合后得到Large Contigs(>2 kb)997个,Contig总长度为36.45Mb。平均Contig长度为40,218 bp,最长的Contig长度为1.04Mb,N50Contig长度为86,492 bp。再通过pair-end和Solexa 3K Matepair测序,插入片段平均大小为2-3k,对上述得到的Contig进行组装得到62个Scaffold。利用四款基因预测软件对62个Scaffold序列进行基因预测,并且以草菇EST序列的分布情况进行过滤,共得到了个基因。,共获得11,084个蛋白编码基因。平均编码序列(CDS)长度为1,532 bp,每个基因平均长度为1,948 bp,每个基因平均含有有6个外显子。通过与swiss-prot,KEGG的真核基因和蛋白数据库等进行比对,对预测基因进行了功能注释,其中有5,516个基因有明确的功能注释信息。通过KOG和GO分类,可以把4,821个基因分到25个功能类别中(KOG),1,462个基因可以进行GO分类。随后,通过KEGG代谢数据库,构建了草菇的代谢通路,发现了糖酵解、三羧酸循环等完整代谢通路。本研究在国际上首次完成了草菇的全基因组框架图,确定出草菇的基因组为36.45Mb,这远远大于通过脉冲电泳技术估算出的25Mb的基因组长度。本研究采用454 GS FLX和Solex GA两种新一代高通量测序技术相结合的方式,充分利用两种技术的不同优势,以较低的成本,高质量地完成草菇全基因组测序和框架图的构建。本研究所尝试的整合测序技术将会促进食用菌全基因组学和比较基因组学研究的广泛开展,从而能够提供全面和深入的食用菌遗传学知识,快速推动食用菌分子遗传学和分子育种学的进步。

关键词：草菇全基因组框架图

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用苹果木作栽培料工厂化培育香菇的试验研究

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上海蔬菜 2022年第3期 70-73页

作者：董浩然李玉姜宁李正鹏李巧珍刘四海周峰上海市农业科学院食用菌研究所农业部南方食用菌资源利用重点实验室国家食用菌工程技术研究中心上海市农业遗传育种重点开放实验室上海奉贤201403 河南金海生物科技有限公司河南三门峡472000

为评估苹果木作栽培料工厂化培育香菇的可行性,作者研究了不同配方栽培料对菌丝满袋时间、蕾数、单菇质量、产量的影响。试验结果表明,苹果木可作香菇液体菌种栽培香菇的原料。用配方1(栎木40%,苹果木40%,麸皮19%,石膏1%)和配方2(苹果木... 详细信息

为评估苹果木作栽培料工厂化培育香菇的可行性,作者研究了不同配方栽培料对菌丝满袋时间、蕾数、单菇质量、产量的影响。试验结果表明,苹果木可作香菇液体菌种栽培香菇的原料。用配方1(栎木40%,苹果木40%,麸皮19%,石膏1%)和配方2(苹果木80%,麸皮19%,石膏1%)作栽培料生产香菇,菌丝满袋时间分别为33.0 d、32.7 d,分别较配方3(ck)缩短了4.35%和5.22%;单棒总蕾数分别为48.50个和47.29个,分别较配方3(ck)增加31.79%和28.51%。其中,用配方1作栽培料单棒3潮菇总产量为789.79 g,生物转化率为64.69%,显著高于配方2;用配方2作栽培料生产香菇,产量集中于第一潮,可用于菌棒出口。

关键词：香菇苹果木液体菌种培养料配方

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