检索结果-内蒙古大学图书馆

水产学报 2023年第6期47卷 64-74页

作者：王佳佳王琼秦桢陈耀辉李健李吉涛中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室青岛海洋科学与技术国家试点实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室

为了探究SSR标记对凡纳滨对虾养殖群体的遗传多样性和群体遗传结构的影响，为凡纳滨对虾种质资源的遗传改良提供基础信息。实验利用MISA软件对凡纳滨对虾全基因组SSR位点进行搜索，通过聚丙烯酰胺凝胶电泳获得多态性高的SSR标记，基于PO... 详细信息

为了探究SSR标记对凡纳滨对虾养殖群体的遗传多样性和群体遗传结构的影响，为凡纳滨对虾种质资源的遗传改良提供基础信息。实验利用MISA软件对凡纳滨对虾全基因组SSR位点进行搜索，通过聚丙烯酰胺凝胶电泳获得多态性高的SSR标记，基于POPGENE 1.32、PIC-CALC和Mega 6.0软件分析6个不同来源的凡纳滨对虾养殖群体的遗传多样性和群体结构特征。在凡纳滨对虾全基因组数据中共鉴定出10 453 975个微卫星，约占基因组序列总长度的18.56%，其中，二碱基微卫星最丰富，占总数的82.15%。利用具有多态性的14个SSR标记分析3个国内群体[桂海1号(CG)、海兴农2号(CH)和山东养殖群体(CT)]，及3个国外群体[厄瓜多尔1号(FO)、厄瓜多尔2号(FT)和墨西哥群体(FM)]的遗传特征。结果显示，14个SSR标记在6个群体中共检测到208个等位基因变异，等位基因数、观测杂合度、期望杂合度和多态性信息含量的范围分别为6～25、0.112～0.994、0.234～0.925和0.226～0.918；遗传多样性丰富程度为CH>FO>FM>CT>FT>CG。桂海1号与山东养殖群体、3个国外群体间属于中等程度的遗传分化。聚类分析结果显示，国内群体桂海1号和海兴农2号聚为一大类，山东养殖群体与国外群体厄瓜多尔1号、厄瓜多尔2号和墨西哥群体聚为一大类。研究表明，筛选的14个SSR标记可用于凡纳滨对虾群体遗传多样性的评估；3个国外群体的遗传多样性相对较高，且与国内群体桂海1号和海兴农2号的亲缘关系较远。本研究对凡纳滨对虾种质资源的开发利用与新品种选育具有十分重要的意义。

关键词：凡纳滨对虾养殖群体遗传多样性基因组微卫星标记

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基于两种对虾参考基因组的中国明对虾性别分化区域初步探查

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水产学报 2023年第3期47卷 114-122页

作者：王琼李健何玉英中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室青岛海洋科学与技术国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室

中国明对虾是我国最重要的养殖虾类之一。性成熟后的中国明对虾在生长和体色上表现出性别二态性。为了探查基因组上潜在的性别分化相关区域，对中国明对虾进行了全基因组重测序研究。分别使用中国明对虾基因组和其近缘物种凡纳滨对虾的... 详细信息

中国明对虾是我国最重要的养殖虾类之一。性成熟后的中国明对虾在生长和体色上表现出性别二态性。为了探查基因组上潜在的性别分化相关区域，对中国明对虾进行了全基因组重测序研究。分别使用中国明对虾基因组和其近缘物种凡纳滨对虾的基因组作为参考基因组，计算了雌雄中国明对虾之间的遗传分化指数Fst，以筛查基因组上的性别分化相关区域。当使用中国明对虾参考基因组时，有约89%的中国明对虾测序读段全部或部分比对到中国明对虾参考基因，覆盖度大约为84%。基因组上Fst出现较多杂乱的峰，其中LG5的Fst值整体呈升高的趋势，另外LG13、LG17及LG35均有Fst指数相对较高的区域。而当使用凡纳滨对虾参考基因组时，有约60%的中国明对虾测序读段全部或部分比对到凡纳滨对虾参考基因，覆盖度约为52%。Scaffold 2550和Scaffold 3683上分别有2个最显著的峰。将雌雄中国明对虾转录组测序数据与凡纳滨对虾的参考基因组比对后，获得了中国明对虾的粗略表达谱，挖掘出了丰富的差异表达基因。分析了前述2个Scaffold上的基因表达情况。在Scaffold 2550上，有2个肌肉中的差异表达基因，有3个性腺中的差异表达基因；在Scaffold 3683上，有4个性腺中的差异表达基因，全部都是雄性高表达，且都位于Fst峰值区域，其中2个基因编码外周型苯二氮卓受体相关蛋白1 （peripheral-type benzodiazepine receptor-associated protein 1），参与类固醇激素生物合成，推测这两个雄性高表达基因参与了雄虾的性别特异性生理机制，与雄性生殖功能相关，在性别分化过程中发挥一定作用。本研究初步筛选到了与中国明对虾性别分化相关的区域和基因，为中国明对虾性别二态性的进一步研究提供了依据。

关键词：中国明对虾性别分化基因组重测序转录组

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基于不同密度SNP面板的凡纳滨对虾AHPND抗性基因组预测准确性分析

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水产学报 2023年第1期47卷 165-174页

作者：刘杨栾生刘绵宇李旭鹏孟宪红罗坤隋娟谭建代平曹家旺陈宝龙孔杰湖州师范学院生命科学学院中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室

为评估不同SNP标记密度对凡纳滨对虾AHPND抗性基因组预测准确性的影响，本实验对26个全同胞家系进行Vp AHPND侵染，收集686尾个体的存活时间数据，对其中242尾个体利用液相芯片“黄海芯1号”(55.0 K SNP)进行基因分型，基于A、G和H亲缘... 详细信息

为评估不同SNP标记密度对凡纳滨对虾AHPND抗性基因组预测准确性的影响，本实验对26个全同胞家系进行Vp AHPND侵染，收集686尾个体的存活时间数据，对其中242尾个体利用液相芯片“黄海芯1号”(55.0 K SNP)进行基因分型，基于A、G和H亲缘关系矩阵估计Vp AHPND侵染后存活时间的遗传参数；采用随机和等距抽取方式，基于55.0K SNP构建了8个低密度SNP面板(40.0、30.0、20.0、10.0、5.0、1.0、0.5和0.1 K)，利用GBLUP和ssGBLUP等方法预测Vp AHPND侵染后存活时间的基因组育种值，利用交叉验证方法计算其预测准确性，并与BLUP方法进行对比分析。遗传参数估计结果显示，Vp AHPND侵染后存活时间表现为高遗传力水平，估计值为0.68～0.79。在55.0 K SNP密度下，针对242尾基因分型个体数据集(G242)，利用BLUP、GBLUP和ssGBLUP方法获得的预测准确性分别为0.424、0.450和0.452,GBLUP和ssGBLUP比BLUP分别提升了6.13%和6.60%；针对686尾表型测定个体数据集(P686)，利用BLUP和ssGBLUP方法获得的预测准确性分别为0.510和0.535，后者比前者提升了4.90%。对于8个低密度SNP面板，当SNP密度≥10.0 K时，基因组预测准确性变化幅度在G242和P686数据集中均较小(1.1%～1.8%)；随着SNP密度自10.0 K不断降低，基因组预测准确性在2个数据集中也不断降低，其中5.0 K密度降幅为0.6%～2.6%、1.0 K密度降幅为5.8%～11.0%、0.5 K密度降幅为11.4%～17.2%、0.1 K密度降幅为38.8%～41.6%。10.0 K与55.0 K SNP密度间基因组亲缘系数、GEBV的相关系数均高于0.99，表明利用10.0 K SNP面板可以准确地预测同胞个体间的亲缘关系及其GEBV。研究表明，使用10.0 K SNP面板对Vp AHPND侵染后存活时间进行基因组遗传评估可以得到与55.0 K SNP芯片近似的预测准确性，为低密度SNP分型芯片设计提供了参考。

关键词：凡纳滨对虾 AHPND 低密度SNP面板基因组预测准确性

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长期超低温冷冻保存对鞍带石斑鱼精子超微结构及酶活性的影响

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水产学报 2023年第7期47卷 50-66页

作者：丁小雨李振通段鹏飞邱弈树王心怡黎琳琳王林娜刘阳李文升王清滨赵侠田永胜李胜忠新疆农业大学生命科学学院中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室上海海洋大学水产与生命学院莱州明波水产有限公司

为探究长期超低温冷冻保存中鞍带石斑鱼精子质膜、活力、超微结构及酶活性的变化，阐明影响鞍带石斑鱼精子冷冻保存质量的相关机制。实验采集2022年鞍带石斑鱼鲜精及储存时间分别为23、49和61个月的冷冻保存精液，用伊红-苯胺黑染色方... 详细信息

为探究长期超低温冷冻保存中鞍带石斑鱼精子质膜、活力、超微结构及酶活性的变化，阐明影响鞍带石斑鱼精子冷冻保存质量的相关机制。实验采集2022年鞍带石斑鱼鲜精及储存时间分别为23、49和61个月的冷冻保存精液，用伊红-苯胺黑染色方法检测精子质膜完整性；用计算机辅助精子分析仪(CASA)检测精子运动参数；测量精浆和精子中琥珀酸脱氢酶(SDH)、过氧化氢酶(CAT)、谷胱甘肽还原酶(GR)、总超氧化物歧化酶(TSOD)、谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)和肌酸激酶(CK)共6种酶活性的变化及三磷酸腺苷(ATP）浓度变化；用扫描电镜和透射电镜观察鲜精和冻精超微结构。结果显示，伊红-苯胺黑染色后，鲜精质膜完整性最高，为83.43%±2.73%，经过超低温冷冻后，精子质膜完整性显著降低，且随着冷冻保存时间的延长而逐渐降低。CASA结果显示，鲜精活力最高，为90.47%±3.34%，经过超低温冷冻后精子活力显著降低，但长期保存23～61个月的精子活力无显著差异，精子活力保持在(63.95%±3.66%)～(68.58%±2.73%)，具有稳定的活力，且鲜精与冻精之间精子平均直线运动速度(VSL)、平均曲线运动速度(VCL)和平均路径速度(VAP)均没有显著差异。精子超微结构显示，鲜精形态结构正常、线粒体排列结构规则、形态大小正常。经过超低温冷冻保存后，精子形态结构损伤明显，表现为精子头部质膜破损、细胞质外漏、细胞核膜破损、尾部鞭毛断裂或脱落等。鞍带石斑鱼精浆和精子超低温冷冻前后6种酶活性的变化及ATP含量结果显示，经过超低温冷冻后，精子内SOD、GSH-Px和CAT及ATP含量均显著降低。精浆中酶活性升高，除GR和CAT外，其余酶活性均差异显著。研究表明，长期超低温冷冻对鞍带石斑鱼精浆和精子酶活性、精子活力及精子超微结构均具有较显著的影响。本研究结果为鱼类精子冷冻损伤机理研究积累了丰富的数据，为鱼类精子长期冷冻保存提供了技术参考和评价指标。

关键词：鞍带石斑鱼精子超低温冷冻超微结构酶活性计算机辅助精子分析系统

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循环水养殖系统重金属的分布特征及鱼体风险评估

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环境化学 2023年第3期42卷 733-742页

作者：李纯毅崔正国白莹尹杨媛崔鸿武胡清静曲克明天津农学院水产学院天津300380 中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室青岛266071

为研究海水循环水养殖系统中水体及养殖鱼体重金属的分布特征和评估鱼体的污染状况及健康风险,本文以2021年山东省烟台市某水产公司两个海水循环水养殖系统中15个站点的水样和不同生长周期的牙鲆、珍珠龙胆石斑鱼(Paralichthys olivaceu... 详细信息

为研究海水循环水养殖系统中水体及养殖鱼体重金属的分布特征和评估鱼体的污染状况及健康风险,本文以2021年山东省烟台市某水产公司两个海水循环水养殖系统中15个站点的水样和不同生长周期的牙鲆、珍珠龙胆石斑鱼(Paralichthys olivaceus、Epinephelus fuscoguttatus♀×Epinephelus lanceolatus♂)为研究对象,选用原子吸收光谱法和原子荧光光谱法测定分析其中重金属铜(Cu)、铅(Pb)、锌(Zn)、镉(Cd)、汞(Hg)和砷(As)的含量,并评估鱼体重金属的污染状况和健康风险.结果显示,循环水养殖系统水体的重金属含量均未超标,在生物体中的含量均符合国家限量标准.水体中Cu、Zn含量最大,Pb、Cd含量在9月最高,微滤机净化池水中的Pb含量大,Hg、Cu含量为6月最高,As含量为10月最大,水体中重金属含量可能与换水率、季节变化等情况有关.鱼体中牙鲆和珍珠龙胆石斑鱼重金属含量均表现为Zn>Cu>As>Pb>Cd>Hg,Cu、Zn作为鱼类生长的必要微量元素其含量最大;同一鱼体的重金属含量在不同生长周期存在显著差异,不同种类鱼体重金属含量均值差异显著(Hg除外).根据综合污染指数法,鱼体肌肉内的重金属污染状况均属于无污染清洁状态,目标危险系数证明其膳食暴露风险都较低.综合表明,此循环水养殖系统中的水体和鱼体是安全的,人类食用此系统中的鱼体不会存在相关风险.

关键词：循环水养殖重金属鱼风险评估

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液相芯片“黄海芯1号”在凡纳滨对虾急性肝胰腺坏死病抗性基础群体遗传评估中的应用

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水产学报 2023年第1期47卷 217-226页

作者：刘绵宇李旭鹏孔杰孟宪红陈美佳罗坤隋娟代平张雅文强光峰谭建陈宝龙曹家旺李波波赖晓芳栾生江苏海洋大学海洋科学与水产学院江苏省海洋生物资源与环境重点实验室/江苏省海洋生物技术重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室邦普种业科技有限公司

为评估基因型鉴定芯片在育种群体构建中的应用价值，实验对凡纳滨对虾3个群体（EE、PP和SS）进行急性肝胰腺坏死病（AHPND）副溶血弧菌(VpAHPND)侵染实验，利用自主研发的40K SNP液相芯片“黄海芯1号”获得146尾个体的基因型信息，对群... 详细信息

为评估基因型鉴定芯片在育种群体构建中的应用价值，实验对凡纳滨对虾3个群体（EE、PP和SS）进行急性肝胰腺坏死病（AHPND）副溶血弧菌(VpAHPND)侵染实验，利用自主研发的40K SNP液相芯片“黄海芯1号”获得146尾个体的基因型信息，对群体遗传背景进行了系统调查并估算了AHPND抗性遗传力。VpAHPND浸染实验结果显示，不同群体间存在抗病差异，PP群体的存活性能比EE和SS群体分别高出12.9%和11.6%。利用质控后的38 148个SNP信息构建系统进化树，结果显示群体内同一个家系的个体首先聚在一起，进而同属一个群体的多个家系聚在一起。主成分和遗传结构分析显示，可以准确地将146尾个体划分为3个组，与系统进化树聚类结果一致。遗传多样性分析显示，3个群体的观测杂合度（H_o）平均值为0.25～0.29，多态信息含量（PIC）平均值为0.20～0.23，上述遗传参数达到极显著水平。3个群体间的遗传分化系数(FST)为0.11～0.21，存在中高度遗传分化。基因组近交分析表明，EE、PP和SS群体的近交系数均值分别为-0.05±0.06、0.20±0.09和0.37±0.07，后2个群体内部分个体表现出较高的近交水平。使用ssGBLUPMF （Single Step Genomic BLUP with Metafounders）模型，复合基因型、表型和系谱信息，获得VpAHPND侵染后存活状态的遗传力估计值为0.24±0.07，表现为中等水平，表明基础群体具有较好的选育潜力。研究表明，利用液相芯片“黄海芯1号”开展辅助育种，可以进一步提高基础群体构建和评估的效率。

关键词：凡纳滨对虾基础群体 AHPND 育种芯片遗传多样性

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棕点石斑鱼、杂交“金虎斑”及珍珠龙胆的肌肉营养成分分析及品质评价

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水产学报 2023年第9期47卷 113-121页

作者：王林娜田永胜李振通刘阳陈帅黎琳琳段鹏飞王心怡马文辉李文升翟介明中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室青岛海洋科学与技术国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室上海海洋大学水产与生命学院中国农业科学院莱州明波水产有限公司

为确定母本棕点石斑鱼、杂交“金虎斑”和杂交珍珠龙胆的肌肉营养成分并比较其差异，实验采用常规方法，依据国家标准对棕点石斑鱼、杂交“金虎斑”及珍珠龙胆肌肉中的水分、蛋白、粗脂肪和灰分含量以及氨基酸、脂肪酸和10种矿物元素的... 详细信息

为确定母本棕点石斑鱼、杂交“金虎斑”和杂交珍珠龙胆的肌肉营养成分并比较其差异，实验采用常规方法，依据国家标准对棕点石斑鱼、杂交“金虎斑”及珍珠龙胆肌肉中的水分、蛋白、粗脂肪和灰分含量以及氨基酸、脂肪酸和10种矿物元素的组成与含量进行测定和评价。结果显示，3种石斑鱼肌肉中粗蛋白含量分别为19.0%、20.2%和16.8%;3种石斑鱼氨基酸总量、必需氨基酸总量、必需氨基酸指数、鲜味氨基酸总量分别为(18.10%、 18.53%、 16.01%),(7.52%、 7.70%、 6.32%),(88.20、 84.80、 88.30)和(6.92%、7.13%、6.10%);3种石斑鱼肌肉中粗脂肪含量分别为3.0%、4.2%和2.4%，其中珍珠龙胆DHA+EPA的含量为24.02%，杂交“金虎斑”DHA+EPA的含量为23.56%，棕点石斑鱼DHA+EPA的含量为22.76%;5种常量元素Na、K、Ca、Mg、P和5种微量元素Fe、Mn、Cu、Zn、Se均有检出。研究表明，棕点石斑鱼、杂交“金虎斑”及珍珠龙胆可以为人类提供丰富的蛋白质、脂肪、无机盐和矿物元素，是具有较高食用价值的优良海水养殖品种。其中杂交“金虎斑”在一些营养指标中明显高于母本棕点石斑鱼。

关键词：棕点石斑鱼杂交“金虎斑” 珍珠龙胆肌肉营养成分评价

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镉对绿鳍马面鲀幼鱼急性毒性、肝脏抗氧化能力及组织结构的影响

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渔业科学进展 2023年第3期44卷 74-84页

作者：王晓然边力胡琼秦搏常青英娜吴艳庆杨立国陈四清上海海洋大学水产与生命学院上海201306 中国水产科学研究院黄海水产研究所、青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室、农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室山东青岛266071 中国水产科学研究院东海水产研究所上海200093

本研究采用静水生物测试法测定了镉(Cd^(2+))对绿鳍马面鲀(Thamnaconus septentrionalis)幼鱼的急性毒性。根据预实验结果,设定8.19、9.18、10.30、11.56 mg/L共4个Cd^(2+)浓度梯度进行急性毒性实验,根据急性毒性实验结果,设定1.84、2.7... 详细信息

本研究采用静水生物测试法测定了镉(Cd^(2+))对绿鳍马面鲀(Thamnaconus septentrionalis)幼鱼的急性毒性。根据预实验结果,设定8.19、9.18、10.30、11.56 mg/L共4个Cd^(2+)浓度梯度进行急性毒性实验,根据急性毒性实验结果,设定1.84、2.76、3.68和4.60mg/L4个不同浓度Cd^(2+)急性暴露实验,分别在6、12、24、48、72和96 h检测肝脏中超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化氢酶(CAT)、谷胱甘肽抗氧化酶(GSH-PX)活性及丙二醛(MDA)含量,观察肝脏、鳃组织结构的变化。结果显示,随着Cd^(2+)浓度的增加,急性毒性效应逐渐增强,24、48、72和96 h半致死浓度(LC50)分别为11.47、10.82、9.84和9.19 mg/L,Cd^(2+)对绿鳍马面鲀幼鱼的96 h安全浓度为0.92 mg/L。6 h时,各浓度组SOD和CAT活性与对照组相比显著升高;6—48 h时,SOD、CAT、GSH-PX活性均呈先上升后下降的趋势;48—96 h时,各浓度组酶活性均呈下降趋势,且时间越长,浓度越大,活性越低。与对照组相比,MDA含量整体呈先降低后增加的趋势,12—48 h时,1.84和2.76 mg/L组MDA含量有波动,3.68、4.60 mg/L组MDA含量与时间和浓度成正比。24 h时,1.84 mg/L组肝脏组织未见明显变化,2.76、3.68和4.60mg/L组肝脏组织开始受到明显损伤,表现为细胞体积增大且形状不规则,细胞膜边界模糊,1.84和2.76mg/L组鳃组织相比无显著变化,3.68和4.60mg/L组出现鳃小片弯曲,上皮细胞水肿膨大,相邻鳃小片相互黏连融合,无游离端,细胞坏死脱落等损伤现象。在安全浓度为0.92 mg/L内绿鳍马面鲀幼鱼可健康生长,SOD、CAT和GSH-PX活性变化及MDA含量反映了绿鳍马面鲀幼鱼受损害程度,可作为安全性风险评价的参考依据。

关键词：绿鳍马面鲀镉组织结构抗氧化酶

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长牡蛎和福建牡蛎个体生长模型的构建及比较

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水产学报 2022年第6期46卷 1027-1035页

作者：姜娓娓蔺凡曾志南宁岳杜美荣房景辉高亚平方建光蒋增杰中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室福建省水产研究所

长牡蛎和福建牡蛎分别是我国北方和南方沿海重要的养殖贝类。为比较分析二者的动态生长情况，实验基于动态能量收支理论（DEB），以连续监测的水温和叶绿素a浓度为强制因子，通过现场实验、模型调试和文献查阅等方式获取模型参数，利用P... 详细信息

长牡蛎和福建牡蛎分别是我国北方和南方沿海重要的养殖贝类。为比较分析二者的动态生长情况，实验基于动态能量收支理论（DEB），以连续监测的水温和叶绿素a浓度为强制因子，通过现场实验、模型调试和文献查阅等方式获取模型参数，利用Python 2.7软件分别构建了桑沟湾长牡蛎、深沪湾福建牡蛎的个体生长模型，并以两种牡蛎的实测生长数据进行验证。结果显示：①所构建的DEB模型能够较好地模拟长牡蛎、福建牡蛎的个体生长情况（壳高、软组织湿重等），模拟值与实测值之间相关性显著；②长牡蛎和福建牡蛎的温度耐受上限（TH）、温度耐受下限（TL）、半饱和常数（FH）等参数存在差异，这可能与不同海域的理化环境、食物组成及牡蛎的选择性摄食有关；③在模拟周期内，受温度和食物的双重限制，长牡蛎冬季生长缓慢，而福建牡蛎处于持续增长状态，期间主要受到食物的限制。本研究结果可为后续生态系统模型构建和牡蛎养殖容量评估提供基础数据。

关键词：长牡蛎福建牡蛎 DEB 个体生长模型养殖容量

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近江牡蛎SLC13基因家族的全基因组鉴定及急性高盐胁迫下的表达特征

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中国水产科学 2023年第2期30卷 127-137页

作者：葛广玉迟长凤王振原刘志鸿王岩陈夕孙秀俊周丽青吴彪浙江海洋大学国家海洋设施养殖工程技术研究中心浙江舟山316022 农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所山东青岛266071 青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室山东青岛266273

溶质载体13(solute carrier 13,SLC13)是SLC转运蛋白超家族的重要成员,编码结构相似的跨膜蛋白,在介导转运阴离子和柠檬酸循环代谢中间体中发挥重要作用。近江牡蛎(Crassostrea ariakensis)基因家族收缩和扩张分析表明,SLC13家族显著扩... 详细信息

溶质载体13(solute carrier 13,SLC13)是SLC转运蛋白超家族的重要成员,编码结构相似的跨膜蛋白,在介导转运阴离子和柠檬酸循环代谢中间体中发挥重要作用。近江牡蛎(Crassostrea ariakensis)基因家族收缩和扩张分析表明,SLC13家族显著扩张,可能与渗透压调节密切相关。为进一步探讨近江牡蛎SLC13基因家族(CarSLC13)特征及在高盐胁迫下的表达变化,本研究运用生物信息学方法对CarSLC13进行鉴定,并分析了其基因结构、染色体定位、系统进化和在急性高盐胁迫后鳃组织中的表达特征。本研究共鉴定出11个CarSLC13基因,包括1个CarSLC13A1亚家族成员,6个CarSLC13A2亚家族成员和4个CarSLC13A5亚家族成员,其中7个家族成员蛋白的理化性质较为稳定,不稳定系数均小于40;亚细胞定位预测显示,所有CarSLC13均定位到细胞膜或内膜;染色体定位结果显示,11个SLC13基因定位在6条染色体上,在第3号染色体上的部分基因发生了串联复制;该基因家族成员都具有钠-硫酸盐共转运蛋白跨膜结构域(PF00939),该结构域与渗透压调节功能相关;盐度为40的人工海水急性胁迫近江牡蛎0 h、6 h和12 h后,鳃组织中的CarSLC13A2和CarSLC13A5亚家族的基因整体上表现为先升高再降低的表达趋势,而CarSLC13A1亚家族基因表达量随胁迫时间的增加而降低。本研究明确了CarSLC13家族的基因特征、系统进化及对急性高盐胁迫的响应规律,丰富了双壳贝类SLC13基因家族的研究资料,为进一步探讨该家族在渗透压调节中的作用提供了参考数据。

关键词：近江牡蛎 SLC13基因家族高盐胁迫表达模式

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