检索结果-内蒙古大学图书馆

作物学报 2021年第8期47卷 1522-1530页

作者：张海程光远杨宗桃刘淑娴商贺阳黄国强徐景升福建农林大学国家甘蔗工程技术研究中心/农业农村部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室/教育部作物遗传育种与综合利用重点实验室福建福州350002

光系统II(Photosystem II,PSII)的PsbR亚基对于放氧复合体(oxygen-evolving complex)的组装和稳定具有至关重要的作用。本课题组前期克隆了甘蔗(Saccharum ***)的PsbR亚基编码基因,命名为ScPsbR,并利用酵母双杂交技术(yeast two hybrid,Y2H)验证了ScPsbR与甘蔗花叶病毒(Sugarcane mosaic virus,SCMV)编码蛋白6K2的互作。本研究通过生物信息学分析表明,ScPsbR具有典型的PsbR亚基结构域,无信号肽,具有1个跨膜结构域,为稳定的疏水性蛋白。系统进化树分析表明,该蛋白在C3和C4植物中存在明显的分化。亚细胞定位试验表明,ScPsbR定位于叶绿体且与SCMV-6K2共定位。双分子荧光互补(bimolecular fluorescence complementation,BiFC)试验进一步验证了ScPsbR与SCMV-6K2的互作。实时荧光定量PCR检测表明,ScPsbR基因表达具有显著的组织特异性,在根和茎中表达极少,未成熟叶片和初衰叶中次之,成熟叶片中相对表达量最高;SCMV侵染显著影响ScPsbR基因表达,ScPsbR基因在侵染0~12 h显著上调,侵染1~5 d下调至略低于对照的水平,但差异不显著,侵染7~15 d显著下调。

关键词： PsbR亚基甘蔗花叶病毒 6K2 蛋白互作

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植物MYC转录因子：结构特点、作用机制和功能调控

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农业生物技术学报 2022年第6期30卷 1186-1201页

作者：邹文会苏亚春任永娟张畅臧守建赵振南陈燕玲阙友雄福建农林大学农业农村部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室/福建农林大学教育部作物遗传育种与综合利用重点实验室

MYC (myelocytomatosis)转录因子(transcription factors, TFs)是茉莉酸(jasmonic acid, JA)信号转导通路的核心调控因子，参与植物的生长发育、次生代谢物的合成、逆境应答、植物激素信号转导及其通路之间的相互作用。本文针对植物MYC... 详细信息

MYC (myelocytomatosis)转录因子(transcription factors, TFs)是茉莉酸(jasmonic acid, JA)信号转导通路的核心调控因子，参与植物的生长发育、次生代谢物的合成、逆境应答、植物激素信号转导及其通路之间的相互作用。本文针对植物MYC转录因子，从序列特征、结构特点、功能特性及其在生物和非生物胁迫中的作用机制等方面进行研究进展综述。本文为进一步深入探讨MYC转录因子的功能作用和调控模式积累基础资料。

关键词： MYC转录因子结构特点功能特性调控机制

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甘蔗易化子家族蛋白Sc ZIFL1与6K2互作应答SCMV侵染

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作物学报 2022年第12期48卷 3080-3090,I0001-I0012页

作者：刘淑娴杨宗桃程光远张海周营栓商贺阳黄国强徐景升农业农村部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室/福建农林大学国家甘蔗工程技术研究中心/教育部作物遗传育种与综合利用重点实验室福建福州350002

易化子超家族转运蛋白(major facilitator superfamily,MFS)在生物中普遍存在,锌诱导类辅助因子(zinc induced facilitator like,ZIFL)是MFS成员,参与小分子有机物运输。本课题组前期利用酵母双杂交(yeast two-hybrid,Y2H)技术从甘蔗(Saccharum ***)中分离鉴定了1个与甘蔗花叶病毒(Sugarcane mosaic virus,SCMV)编码蛋白6K2互作的ZIFL,命名为Sc ZIFL1。本研究利用双分子荧光互补技术(bimolecular fluorescence complementation,Bi FC)进一步验证了Sc ZIFL1与SCMV-6K2的互作。生物信息学分析表明,Sc ZIFL1长度为484个氨基酸,无信号肽,具有12个跨膜结构域,为不稳定的疏水性蛋白。序列比对分析表明,Sc ZIFL1具有MFS保守的半胱氨酸模体、特征基序及反向运输基序。系统进化树分析表明,该蛋白在单子叶和双子叶植物之间,以及单子叶C_(3)植物和C_(4)植物之间存在明显分化。亚细胞定位试验表明,Sc ZIFL1定位于液泡膜,部分与SCMV-6K2共定位。实时荧光定量PCR分析发现,Sc ZIFL1基因的表达具有明显的组织特异性,在茎中表达最高,叶中次之,根中最低;在完成形态建成且处于旺盛工作状态的+1叶和第8节间中的相对表达量显著高于未成熟的心叶、第3节间和渐衰叶片+7叶;接种SCMV后,Sc ZIFL1表达量在侵染早期显著上调,随后持续高表达。

关键词：甘蔗花叶病毒 6K2 ZIFL1 蛋白互作

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现行家蚕原种对家蚕微孢子虫的抗性差异分析

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蚕业科学 2019年第3期45卷 361-368页

作者：高娜胡楠蕫战旗杨基贵周亮潘敏慧家蚕基因组生物学国家重点实验室重庆400716 西南大学农业农村部蚕桑生物学与遗传育种重点实验室重庆400716

家蚕微粒子病是一种严重危害蚕种生产的毁灭性蚕病。了解现行家蚕原种对家蚕微孢子虫的抗性特征以及家蚕微孢子虫在家蚕原种不同龄期的感染规律是家蚕微粒子病防控的基础。选取12个现行家蚕品种原种的3龄起蚕和其中8个原种的5龄第3天幼... 详细信息

家蚕微粒子病是一种严重危害蚕种生产的毁灭性蚕病。了解现行家蚕原种对家蚕微孢子虫的抗性特征以及家蚕微孢子虫在家蚕原种不同龄期的感染规律是家蚕微粒子病防控的基础。选取12个现行家蚕品种原种的3龄起蚕和其中8个原种的5龄第3天幼虫,分别添食不同剂量的家蚕微孢子虫,统计分析微孢子虫对2个时期各家蚕原种的感染率、感染强度和半数感染剂量(median infective dose,ID50)变化情况,并对ID50数据进行正态性检验。结果表明,12个家蚕原种均可感染家蚕微孢子虫,其感染率和感染程度与感染剂量呈正相关;12个家蚕原种对家蚕微孢子虫均不具有显著抗性,但部分家蚕原种对家蚕微孢子虫表现出相对抗性或相对敏感性,其中苏菊、云7表现出相对抗性,871表现出相对敏感性;5龄第3天幼虫对家蚕微孢子虫的抗性强于3龄起蚕,感染率与龄期有关,感染程度和龄期无密切关系。以上结果可为家蚕微粒子病防治提供参考。

关键词：家蚕原种家蚕微孢子虫抗性正态分布

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甘蔗PsbS亚基应答甘蔗花叶病毒侵染及其与6K2蛋白的互作研究

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作物学报 2020年第11期46卷 1722-1733页

作者：张海刘淑娴杨宗桃王彤程光远商贺阳徐景升福建农林大学国家甘蔗工程技术研究中心/农业农村部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室/教育部作物遗传育种与综合利用重点实验室福建福州350002

非光化学猝灭(non-photochemical quenching,NPQ)是高等植物主要的光保护调节机制,光合系统Ⅱ(PhotosystemⅡ,PSⅡ)的Psb S亚基在NPQ起关键作用。甘蔗(Saccharum ***)中PSⅡPsb S亚基应答甘蔗花叶病毒(Sugarcane mosaic virus,SCMV)的侵染尚未见报道。本课题组在前期研究中克隆了甘蔗的Psb S亚基编码基因,命名为Sc Psb S,该基因开放读码框(open reading frame, ORF)长度为798 bp,编码长度为265个氨基酸的蛋白。生物信息学分析表明, Sc Psb S为稳定的疏水性蛋白,具有叶绿体定位信号,有4个跨膜结构域;具有典型的Psb S亚基结构域。系统进化树分析表明, Sc Psb S在单子叶、双子叶以及单子叶的C3和C4植物中存在明显的分化。亚细胞定位分析表明,Sc Psb S定位于叶绿体且与SCMV-6K2部分共定位于叶绿体。双分子荧光互补(bimolecular fluorescence complementation, BiFC)试验进一步证实了ScPsbS与SCMV-6K2互作。实时荧光定量PCR分析发现, ScPsbS基因的表达具有明显的组织特异性,在成熟叶片中相对表达量最高,未成熟叶片和初衰叶中次之,茎和根中几乎不表达;SCMV侵染对ScPsbS基因表达影响显著, ScPsbS基因在侵染早期显著上调,侵染后期没有明显的差异。

关键词：甘蔗 PsbS亚基甘蔗花叶病毒 6K2 光保护

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家蚕中心体蛋白基因BmCnn的鉴定及表达分析

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蚕业科学 2022年第2期48卷 103-110页

作者：蒋霞周晓林陈鹏魏昳潘敏慧鲁成家蚕基因组生物学国家重点实验室西南大学重庆400716 农业农村部蚕桑生物学与遗传育种重点实验室重庆400715

Centrosomin(CNN)是中心粒周围物质(PCM)和星形微管组装所需的核心中心体蛋白,能将PCM锚定到中心粒上,并维持它们之间的适当连接,以确保有丝分裂时中心体的准确分离,进而保证细胞的正常分裂。PCR扩增得到家蚕中心体蛋白基因BmCnn的全长... 详细信息

Centrosomin(CNN)是中心粒周围物质(PCM)和星形微管组装所需的核心中心体蛋白,能将PCM锚定到中心粒上,并维持它们之间的适当连接,以确保有丝分裂时中心体的准确分离,进而保证细胞的正常分裂。PCR扩增得到家蚕中心体蛋白基因BmCnn的全长CDS序列,通过生物信息学分析BmCNN蛋白具有典型的CNN_1N结构域并在进化上保守;将PCR扩增产物亚克隆到原核表达载体pET-28a,随后将表达的重组蛋白免疫新西兰大白兔制备多克隆抗体,Western blot检测该抗体能够特异性识别家蚕细胞中2种大小不同的BmCNN;利用免疫荧光分析BmCNN的亚细胞定位,结果显示BmCNN定位于细胞质中;半定量PCR检测BmCnn在家蚕5龄第3天幼虫精巢、卵巢、头部等组织中高表达,而在丝腺组织中低表达,Western blot对BmCNN的检测结果与之基本一致。研究结果可为后期解析BmCnn基因的功能奠定基础,为阐明BmCNN在不同细胞分裂形式中的功能差异及具体调控机制提供新的方向。

关键词：中心体蛋白多克隆抗体基因表达胞质分裂

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甘蔗属种及其近缘属种蔗茅的全基因组密码子偏好性分析

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生物技术通报 2024年第3期40卷 202-214页

作者：田春艳李旭娟李纯佳毛钧刘新龙热带作物生物育种全国重点实验室昆明650205 云南省农业科学院甘蔗研究所云南省甘蔗遗传改良重点实验室开远661699 农业农村部甘蔗生物学与遗传育种重点实验室开远661699

【目的】为解析甘蔗基因组的密码子使用特征,提高异源基因在甘蔗中的表达效率。【方法】以已发布的甘蔗属种(热带种LA-purple、割手密NP-X和AP85-441)及其近缘属种蔗茅(Yunnan2009-3)基因组为数据,利用Python、CodonW1.4.2进行密码子偏... 详细信息

【目的】为解析甘蔗基因组的密码子使用特征,提高异源基因在甘蔗中的表达效率。【方法】以已发布的甘蔗属种(热带种LA-purple、割手密NP-X和AP85-441)及其近缘属种蔗茅(Yunnan2009-3)基因组为数据,利用Python、CodonW1.4.2进行密码子偏好性分析,同时通过中性绘图、ENC-plot、PR2-plot等分析探讨密码子偏好性形成的影响因素,并结合转录组测序数据分析密码子偏好性参数与基因表达水平的相关性。最后,基于RSCU均值与7个主要模式生物种(玉米、高粱、水稻、拟南芥、烟草、大肠杆菌、酿酒酵母)的密码子使用模式进行比较分析。【结果】显示热带种、割手密和蔗茅的基因组都富含GC,平均GC含量为56.3%,且GC3>GC1>GC2,倾向于使用以G/C结尾的密码子,平均ENC值为48.45,偏好性较低。中性绘图、ENC-plot和PR2-plot分析表明它们的密码子偏好性受到自然选择、突变压力等多种因素的共同影响,其中自然选择占主导作用。相关性分析表明密码子偏好性参数与基因实际的转录表达水平存在显著相关性,但相关性不强。根据RSCU和?RSCU值,确定了13个最优密码子,均以C或G结尾,密码子使用特性在全基因组和染色体组水平上无差异。通过比较发现,甘蔗的核苷酸组成及密码子偏好性与玉米、高粱和水稻较为相似,而与拟南芥、烟草、大肠杆菌和酵母具有显著差异。【结论】甘蔗热带种、割手密和蔗茅的密码子偏好性高度相似,其形成受自然选择和突变因素的影响。此外,对甘蔗优异基因功能异源验证时可优先选择玉米、水稻和高粱作为异源表达系统。

关键词：甘蔗属蔗茅基因组密码子使用偏好性最优密码子

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利用籼粳交RILs群体定位水稻秧苗素质性状QTL

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分子植物育种 2025年第6期 1856-1863页

作者：刘丹刘进冯章丽王嘉宇隋常玲邓力喜冯博杨林林娄惠婕遵义师范学院生物与农业科技学院江西省农业科学院水稻研究所水稻国家工程研究中心(南昌)江西省农作物种质资源研究中心沈阳农业大学水稻研究所农业农村部东北水稻生物学与遗传育种重点实验室遵义师范学院资源与环境学院

秧苗素质影响水稻移栽返青和苗期长势，壮秧对水稻产量和品质的形成具有至关重要的作用。为了解析秧苗素质相关性状的遗传机理，本研究以粳型超级稻品种‘龙稻5’和典型籼稻品种‘中优早8’为亲本构建的重组自交系群体为试验材料，测定... 详细信息

秧苗素质影响水稻移栽返青和苗期长势，壮秧对水稻产量和品质的形成具有至关重要的作用。为了解析秧苗素质相关性状的遗传机理，本研究以粳型超级稻品种‘龙稻5’和典型籼稻品种‘中优早8’为亲本构建的重组自交系群体为试验材料，测定秧苗株高(SH)、总根数(TRN)、茎基宽(BCW)、根鲜重(FRW)和茎叶鲜重(FSLW)等9个秧苗素质相关性状，进行表型分析和QTL (quantitative trait locus)定位。结果表明，亲本间秧苗素质存在明显差异‘，中优早8’具有较好的早生快发特性，综合秧苗素质强于‘龙稻5’;RIL (recombinant inbred lines)群体中秧苗素质相关指标间存在较大变异，呈现双向超亲分离，符合连续的正态分布；除根冠比和茎基宽株高比性状外，其他不同指标间均呈现正相关关系。共检测到8个控制秧苗素质性状的QTL，包括1个总根数QTL、1个根鲜重QTL、3个根冠比QTL和3个茎基宽株高比QTL，分布于第1、2、3、4、5和10号染色体上，QTL的贡献率在2.98～6.34%之间。研究结果将为深入挖掘和克隆水稻秧苗素质性状相关基因提供理论基础。

关键词：水稻重组自交系秧苗素质 QTL定位

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应用RNA重测序分析低硫条件下大豆基因表达谱

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作物学报 2023年第1期49卷 105-118页

作者：王慧吴志医张玉娥喻德跃南京农业大学/国家大豆改良中心/作物遗传与种质创新国家重点实验室/农业农村部大豆生物学与遗传育种重点实验室江苏南京210095

大豆是重要的粮油兼用作物,其硫利用的研究不足。本研究评价了云梦六月花叶和沁阳大豆对低硫的耐性,以这2个品种为材料,利用RNA重测序技术分析了对照(+S)和缺硫(-S)水平下根和叶中的表达谱。结果表明,云梦六月花叶对低硫表现为耐性,沁... 详细信息

大豆是重要的粮油兼用作物,其硫利用的研究不足。本研究评价了云梦六月花叶和沁阳大豆对低硫的耐性,以这2个品种为材料,利用RNA重测序技术分析了对照(+S)和缺硫(-S)水平下根和叶中的表达谱。结果表明,云梦六月花叶对低硫表现为耐性,沁阳大豆对低硫表现为敏感。表达谱分析在云梦六月花叶和沁阳大豆的叶中分别鉴定到9064个和9795个低硫响应的差异表达基因,根中分别鉴定到3185个和5006个差异表达基因。KEGG富集分析发现,2个材料叶中有9个共有途径,仅植物MAPK信号途径富集更多的上调表达基因。2个材料根中有18个共有途径,其中9个途径在2个材料的中对低硫的响应一致,4个途径包含更多的上调表达基因,5个途径包含更多的下调表达基因。在其余9个途径中,云梦六月花叶包含更多的上调表达基因。大豆硫酸根转运蛋白基因对硫酸根的吸收和转运非常重要,在表达谱中鉴定到27个硫酸根转运蛋白基因,分属4个亚组,亚组1、2、4的基因多受低硫诱导,亚组3的基因对低硫的响应较为复杂。基于富集分析结果,本研究从植物MAPK信号途径中克隆了一个受低硫诱导的基因GmEIL1,通过转化大豆毛状根证明该基因参与大豆硫利用的调控。本研究结果为深入探索大豆硫利用效率的遗传机理奠定了基础,为大豆耐低硫育种提供了候选基因。

关键词：大豆低硫 RNA重测序硫酸根转运蛋白 EIN3/EIL

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适合马铃薯块茎计算机断层扫描原位观察的栽培基质筛选

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园艺学报 2023年第5期50卷 1085-1094页

作者：谭杰刘建刚刘菊简银巧李广存金黎平徐建飞中国农业科学院蔬菜花卉研究所农业农村部薯类作物生物学和遗传育种重点实验室蔬菜生物育种全国重点实验室北京100081

土壤的不透明性阻碍了马铃薯块茎生长过程的直接可视化,而计算机断层扫描(Computed tomography,CT)技术可避免破坏性取样,实现植株地下生长过程实时连续观测。为了筛选马铃薯块茎CT成像效果好的栽培基质,对6种不同含水量基质的CT成像效... 详细信息

土壤的不透明性阻碍了马铃薯块茎生长过程的直接可视化,而计算机断层扫描(Computed tomography,CT)技术可避免破坏性取样,实现植株地下生长过程实时连续观测。为了筛选马铃薯块茎CT成像效果好的栽培基质,对6种不同含水量基质的CT成像效果、数据提取效果和植株生长状态进行了对比分析。结果显示,过筛草炭的植株地上部分生长状况最佳,过筛草炭、蛭石与过筛草炭混合两种类型基质中块茎干、鲜质量最高。除蛭石基质以外,其他基质成像效果均随含水量降低而改善,但基质含水量过低导致植株无法正常生长。相同含水量条件下,过筛草炭的扫描背景杂质最少、成像效果最佳,可获得更清晰的CT图像。因此,在适宜植株正常生长的含水量条件下,即20%左右含水量条件下,过筛草炭是适合CT扫描观测马铃薯块茎生长发育的栽培基质。

关键词：马铃薯块茎 CT 基质生长发育

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