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植物保护学报 2025年第1期52卷 157-167页

作者：钟静李婷婷张水英封庆红罗予赵丽玲丁铭云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室农业农村部西南农业基因资源与种质创制重点实验室昆明650223 云南思农蔬菜种业发展有限责任公司楚雄651300

为明确番茄黄化曲叶病毒(tomato yellow leaf curl virus,TYLCV)对杂草斑籽木Baliospermum solanifolium的侵染情况,自云南省元谋县小丙岭村番茄地周边田间地头采集具有黄化、花叶症状的斑籽木病样和健康样品,对样品中病毒及伴随卫星进... 详细信息

为明确番茄黄化曲叶病毒(tomato yellow leaf curl virus,TYLCV)对杂草斑籽木Baliospermum solanifolium的侵染情况,自云南省元谋县小丙岭村番茄地周边田间地头采集具有黄化、花叶症状的斑籽木病样和健康样品,对样品中病毒及伴随卫星进行PCR检测、全基因组克隆和测序、SDT比对分析、基因组结构特征分析和重组分析。结果显示:从2个斑籽木病样中共分离到4条菜豆金色花叶病毒属Begomovirus病毒DNA-A全序列和4条β卫星全序列;分离的4条DNA-A全基因组序列均与TYLCV中国分离物的核苷酸序列相似性最高,为100.0%;在分离的4条β卫星全序列中,2条β卫星分离物与赛葵黄脉β卫星(Malvastrum yellow vein betasatellite,MaYVB)分离物的核苷酸序列相似性最高,大于99.2%,另外2条β卫星分离物与中国番茄曲叶β卫星(tomato leaf curl China betasatellite,ToLCCNB)分离物的核苷酸序列相似性最高,大于94.6%;系统进化分析结果显示所获得的分离物均与云南省TYLCV分离物亲缘关系较近,获得的所有序列均未发现重组现象。表明TYLCV可伴随不同种的β卫星共同侵染斑籽木,斑籽木是一个易感TYLCV的中间寄主。

关键词：番茄黄化曲叶病毒斑籽木 β卫星重组分析序列比对发育树

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云南三地布朗族聚集区地方稻种资源苗瘟抗性评价及抗性基因鉴定

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广东农业科学 2025年第1期52卷 1-13页

作者：董超董丽英薛静杨雅云汤翠凤阿新祥张斐斐杨勤忠戴陆园云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/云南种子种业联合实验室/农业农村部西南作物基因资源与种质创制重点实验室/农业农村部云南稻种资源科学观测试验站云南昆明650205 云南省农业科学院农业环境资源研究所云南昆明650205

【目的】明确农家保护下云南布朗族地方稻种资源苗期稻瘟病抗性水平与分布。【方法】以云南三地布朗族聚集区78份地方稻种资源为材料,利用10个稻瘟病菌株进行苗期接种鉴定和24个稻瘟病抗性基因的31个功能标记检测与分析。【结果】苗期... 详细信息

【目的】明确农家保护下云南布朗族地方稻种资源苗期稻瘟病抗性水平与分布。【方法】以云南三地布朗族聚集区78份地方稻种资源为材料,利用10个稻瘟病菌株进行苗期接种鉴定和24个稻瘟病抗性基因的31个功能标记检测与分析。【结果】苗期接种鉴定结果表明,78份地方稻种资源抗性在40%~100%,平均抗性达93.6%;其中55份地方稻种资源对10个菌株的抗性达100%,占总资源数的70.5%;3个布朗族聚集区地方稻种资源的抗性强弱为勐海县(99.00%)>墨江县(89.09%)>双江县(80.59%)。菌株08-16-6a-1和HN-09-1c-7对3个布朗族聚集区的地方稻种资源致病力最强(11.54%),而菌株HN-09-1c-7和08-20-1a-1对勐海县稻种资源致病力最强(4.00%),菌株08-20-1a-1对墨江县稻种资源致病力最强(36.36%),菌株08-16-6a-1对双江县稻种资源致病力最强致病力最强(52.94%)。功能基因检测结果显示,从云南三地布朗族聚集区的地方稻种资源中,检测出Pi9、Pi5、Pita、Pikh、Pid2和Pikm 6个抗性基因;抗性基因频率为73.08%~84.62%,最高的为Pid2,最低的为Pi9;勐海县稻种资源中频率最高为Pita和Pid2,最低为Pi9;墨江县中频率最高为Pid2、Pi5和Pi9,最低为Pita;双江县中频率最高为Pid2、Pita、Pikm、Pikh和Pi9,最低为Pi5。回归分析结果显示,6个抗性基因对苗期叶瘟抗性均未达到显著水平(P>0.05),不同抗性基因组合可解释苗期叶瘟抗性变化1.8%~25.8%,抗性基因Pid2+Pi5+Pikm+Pikh组合的贡献率最低,而6个抗性基因组合的贡献率最高,但组合效应均不显著。【结论】云南三地布朗族聚集区的地方稻种资源抗性强、抗谱宽,Pid2基因为主要抗性基因,筛选出38份对10个菌株抗性达100%且含Pid2和Pi9基因的资源,是拓宽稻瘟病抗性遗传背景的重要资源。

关键词：地方稻种资源布朗族稻瘟病抗性基因功能标记致病力

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侵染凤仙花的菜豆金色花叶病毒的鉴定及基因组结构分析

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园艺学报 2022年第5期49卷 1136-1144页

作者：钟静赵丽玲李婷婷张水英陈越丁铭云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室农业农村部西南农业基因资源与种质创制重点实验室昆明650223

在对云南省西双版纳州进行病毒病害调查时发现1株疑似菜豆金色花叶病毒属病毒侵染的凤仙花植株,其症状表现为叶片皱缩和花叶。利用菜豆金色花叶病毒属病毒简并引物进行PCR扩增、克隆和分析,获得YN6198-28和YN6198-31两条菜豆金色花叶病... 详细信息

在对云南省西双版纳州进行病毒病害调查时发现1株疑似菜豆金色花叶病毒属病毒侵染的凤仙花植株,其症状表现为叶片皱缩和花叶。利用菜豆金色花叶病毒属病毒简并引物进行PCR扩增、克隆和分析,获得YN6198-28和YN6198-31两条菜豆金色花叶病毒属病毒的DNA-A全长序列,长度均为2 763 bp,编码6个开放阅读框,其中YN6198-28核苷酸序列与越南丁香黄脉病毒(Ludwigia yellow vein Vietnam virus,LuYVVNV)相似性为94.90%,表明该分离物是LuYVVNV1个分离物。重组分析发现,YN6198-28是种间重组病毒,其主要亲本为丁香黄脉病毒(Ludwigia yellow vein virus,LuYVV),次要亲本为中国胜红蓟黄脉病毒(Ageratum yellow vein China virus,AYVCNV)。

关键词：凤仙花菜豆金色花叶病毒属重组病毒

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复合侵染水茄的两种菜豆金色花叶病毒属病毒基因组结构特征分析

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植物保护学报 2020年第2期47卷 355-364页

作者：赵丽玲钟静施章吉李婷婷丁铭张仲凯云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室农业农村部西南农业基因资源与种质创制重点实验室昆明650223

为明确水茄Solanum torvum植株叶片邹缩、褪绿是否由菜豆金色花叶病毒属病毒侵染引起,从云南省西双版纳傣族自治州田间采集具有疑似感染症状的水茄植株叶片样品,应用菜豆金色花叶病毒属病毒简并引物和特异性引物进行PCR扩增、克隆和测序... 详细信息

为明确水茄Solanum torvum植株叶片邹缩、褪绿是否由菜豆金色花叶病毒属病毒侵染引起,从云南省西双版纳傣族自治州田间采集具有疑似感染症状的水茄植株叶片样品,应用菜豆金色花叶病毒属病毒简并引物和特异性引物进行PCR扩增、克隆和测序,通过生物信息软件分析比较其核苷酸序列特征,并对其进行系统发育分析。结果显示,从采集的疑似病叶中共克隆获得了5条菜豆金色花叶病毒属病毒DNA-A全序列和3条DNA-B全序列,经全序列分析发现,侵染水茄的2种菜豆金色花叶病毒属病毒分离物分别属于中国南瓜曲叶病毒(squash leaf curl China virus,SLCCNV)和野茼蒿黄脉病毒(Crassocephalum yellow vein virus,CraYVV)。SLCCNV水茄分离物的基因组具有典型的菜豆金色花叶病毒属病毒双组分结构特征,与来自泰国的SLCCNV分离物(AB330078)亲缘关系最近,相似性最高达到99.0%;CraYVV水茄分离物的基因组具有典型的菜豆金色花叶病毒属病毒单组分结构特征,与来自云南省景洪市的CraYVV分离物(EF165536)亲缘关系最近,相似性最高达到97.6%。表明水茄是这2种菜豆金色花叶病毒属病毒的新寄主,并首次发现双组分和单组分菜豆金色花叶病毒属病毒可复合侵染水茄。

关键词：中国南瓜曲叶病毒野茼蒿黄脉病毒复合侵染水茄基因组结构

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云南地方水稻品种抗稻瘟病基因Pita功能区段序列变异分析

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中国水稻科学 2016年第3期30卷 265-272页

作者：马继琼杨奕孙一丁王炎炎许明辉云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室昆明650223

稻瘟病抗性基因序列变异的分析与认识是挖掘水稻抗稻瘟病基因资源的基础.对来源于云南省56个县（市）的218份地方稻品种稻瘟病抗性基因Pita 第二编码区功能位点区段的609个碱基进行了测序分析.结果表明,所有供试品种在此序列上有18个变... 详细信息

稻瘟病抗性基因序列变异的分析与认识是挖掘水稻抗稻瘟病基因资源的基础.对来源于云南省56个县（市）的218份地方稻品种稻瘟病抗性基因Pita 第二编码区功能位点区段的609个碱基进行了测序分析.结果表明,所有供试品种在此序列上有18个变异位点,存在46种DNA单倍型和28种蛋白类型,其中DNA 单倍型Pita-H1、Pita-H2、Pita-H6频率较高,三者比例分别为17.89%、29.82%、20.18%,合计67.89%,是云南的优势单倍型,而其他单倍型频率较低,频率0.46%-3.67%.携带Pita 抗性基因（编码区第2752位功能位点碱基为G）的品种共61个,占供试材料的27.98%,其中39个品种（占63.93%）与越南抗性品种Tetep序列一致.Pita 抗性基因在水稻各亚种和生态型中的分布是不平衡的,籼稻中的频率为35.06%,粳稻中为24.11%,水稻中31.03%,陆稻中21.92%,黏稻中30.77%,糯稻中18.37%.Pita 抗性基因在云南省广泛分布,36县（市）检测到了Pita 抗性基因,但南部地区频率高于其他地区,且有的县频率较高,呈小集中的特点,海拔2200m 以上的7个品种未能检测到Pita 抗性基因.

关键词：稻云南稻瘟病 Pita

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云南地方稻种抗稻瘟病基因Pi-d3序列变异分析

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中国水稻科学 2016年第1期30卷 17-26页

作者：杨奕孙一丁马继琼王炎炎许明辉云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室昆明650223

对来自云南的80份地方稻种抗稻瘟病基因Pi-d3编码区序列进行了PCR扩增并测序分析。结果表明,与地谷相比,80份云南地方稻种的Pi-d3编码区序列(全长2775bp)存在39个变异位点,平均变异率为1.41%。所有材料可以归为37种单倍型,频率较高的单... 详细信息

对来自云南的80份地方稻种抗稻瘟病基因Pi-d3编码区序列进行了PCR扩增并测序分析。结果表明,与地谷相比,80份云南地方稻种的Pi-d3编码区序列(全长2775bp)存在39个变异位点,平均变异率为1.41%。所有材料可以归为37种单倍型,频率较高的单倍型是H8(28.8%)、H4(11.3%)、H23(5.0%),其他单倍型频率较低,显示了云南地方稻种Pid3基因变异丰富,单倍型类型多,但频率较低。37种单倍型中存在28个氨基酸差异位点,共编码33种蛋白,其中18种单倍型共计32份材料(包括12份籼稻品种)出现了假基因,假基因化的频率较高,可能是粳稻Pi-d3假基因化向籼稻渗透。除已发现的737位氨基酸假基因位点外,新发现32和467两个假基因位点。Pi-d3基因在籼稻、粳稻亚种,水稻、陆稻,黏稻、糯稻的单倍型类型及频率两方面均存在差异,表明亚种间或生态型间发生了一定的遗传分化。37种单倍型在云南的地理分布呈大分散、小聚居的特点,普洱、版纳、临沧的单倍型种类最丰富,并以之为中心向外扩展,单倍型种类随之减少。

关键词：云南地方稻种稻瘟病 Pi-d3基因单核苷酸多态性

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云南3种野生稻中抗白叶枯病基因的鉴定

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作物学报 2015年第3期41卷 386-393页

作者：李定琴陈玲李维蛟柯学余腾琼李娥贤黄兴奇程在全云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室云南昆明650223

白叶枯病是水稻生产上最重要的细菌性病害之一,培育抗病新品种是防治白叶枯病最经济有效的途径。然而,栽培稻来源的抗病基因数量有限,并且部分抗病基因的抗病谱窄。因此,从野生稻中发掘抗病基因,将有利于培育抗病谱广且抗病能力强的水... 详细信息

白叶枯病是水稻生产上最重要的细菌性病害之一,培育抗病新品种是防治白叶枯病最经济有效的途径。然而,栽培稻来源的抗病基因数量有限,并且部分抗病基因的抗病谱窄。因此,从野生稻中发掘抗病基因,将有利于培育抗病谱广且抗病能力强的水稻新品种。本研究通过抗性鉴定和PCR分析,检测云南野生稻中的抗白叶枯病基因。结果表明,云南野生稻对2个代表性白叶枯病菌Y8和PXO99具有不同程度的抗性,疣粒野生稻甚至达到免疫的程度。功能标记检测结果显示,3种野生稻中均不含xa5、xa13和Xa21抗病基因,元江普通野生稻含Xa23和Xa3/Xa26基因或其同源基因,景洪普通野生稻中含Xa1、Xa3/Xa26和Xa27基因或同源基因,药用野生稻含Xa3/Xa26基因或同源基因,而疣粒野生稻含有Xa27抗性基因。本研究结果为进一步发掘和克隆云南野生稻中的抗白叶枯病新基因提供了理论参考。

关键词：野生稻白叶枯病抗性基因 PCR鉴定

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云南省荞麦叶枯病病原菌鉴定及其生物学特性

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植物保护学报 2019年第5期46卷 1065-1072页

作者：卢文洁罗志明李春花尹桂芳王艳青王莉花云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室昆明650205 云南省农业科学院甘蔗研究所开远616699

为明确云南省荞麦叶枯病病原菌种类,采用常规组织分离法获得病原菌菌株LW2015.3,通过形态学特征及分子生物学技术对菌株LW2015.3进行鉴定,并研究其生物学特性。结果表明,荞麦叶枯病病原菌的分生孢子呈倒棍棒状或倒梨状,褐色,具3~8个横隔... 详细信息

为明确云南省荞麦叶枯病病原菌种类,采用常规组织分离法获得病原菌菌株LW2015.3,通过形态学特征及分子生物学技术对菌株LW2015.3进行鉴定,并研究其生物学特性。结果表明,荞麦叶枯病病原菌的分生孢子呈倒棍棒状或倒梨状,褐色,具3~8个横隔膜,0~4个纵斜隔膜,大小为16.5~45.0μm×5.0~13.5μm,厚垣孢子呈球形,直径为6.0~12.0μm;该菌株ITS序列系统发育进化分析结果表明,菌株LW2015.3与链格孢Alternaria alternata(登录号:MG195995.1)的同源性为100%,结合形态学特征与分子鉴定结果确定云南省荞麦叶枯病病原菌为链格孢A. alternata(登录号:KT362732.1)。该病原菌菌丝生长适宜温度为20~30℃,25℃为最适温度;当p H为6~9时菌丝生长速率加快,pH 7最适菌丝生长;PDA培养基和PSA培养基最适菌丝生长;该病原菌对以麦芽糖为碳源和以硝酸钠为氮源时的利用率最高;菌丝的致死温度为50℃,10 min;不同光照条件对菌丝生长的影响有显著差异,连续光照最有利于菌丝生长。

关键词：荞麦叶枯病病原菌鉴定链格孢生物学特性

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白肉灵芝三个新品种的选育报告

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菌物学报 2022年第12期41卷 2095-2097页

作者：姚春馨田果廷王晖云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室云南昆明650205

‘云白灵芝’3个新品种由采自云南不同地区的野生白肉灵芝菌株,经常规育种系统选育获得,属白肉灵芝Ganoderma leucocontextum。3个品种的子实体菌肉洁白、质软,弹射孢子粉少,形态特征差异大。菌丝生长适宜温度18–23℃,子实体发育最适温... 详细信息

‘云白灵芝’3个新品种由采自云南不同地区的野生白肉灵芝菌株,经常规育种系统选育获得,属白肉灵芝Ganoderma leucocontextum。3个品种的子实体菌肉洁白、质软,弹射孢子粉少,形态特征差异大。菌丝生长适宜温度18–23℃,子实体发育最适温度15–23℃,菌丝长速快,发菌期、出菇期短,是中低温型早熟新品种。3个品种均适宜熟料袋栽覆土栽培,干芝产量和品质均高于对照品种。

关键词：白肉灵芝品种中低温早熟

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田头菇属真菌3-磷酸甘油醛脱氢酶稀有内含子特征分析

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应用与环境生物学报 2016年第1期22卷 103-109页

作者：陈卫民张小雷柴红梅田果廷苏开美刘武龙赵永昌云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所昆明650221 云南省农业生物技术重点实验室昆明650221 农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室昆明650221

前期研究从杨柳田头菇(Agrocybe salicacola)YAASM0711的单核菌株M20中获得了含有GC-AG内含子的3-磷酸甘油醛脱氢酶(Glycerol-3-phosphate dehydrogenase,GPD)gpd完整编码基因,本研究通过特异性引物PCR扩增探讨该基因的组成结构及内含... 详细信息

前期研究从杨柳田头菇(Agrocybe salicacola)YAASM0711的单核菌株M20中获得了含有GC-AG内含子的3-磷酸甘油醛脱氢酶(Glycerol-3-phosphate dehydrogenase,GPD)gpd完整编码基因,本研究通过特异性引物PCR扩增探讨该基因的组成结构及内含子的拼接特征.在杨柳田头菇和茶树菇(***)野生群体中均获得了此基因,序列差异性分析显示该基因可被分为两类,并且在两个物种中均有分布,表明这种序列组成差异可能在两个物种分化之前就已经存在.另外,在M20菌株的菌丝体及YAASM0711菌株的不同发育时期均没有发现可选择性剪切现象.基因表达分析表明,gpd在幼嫩的子实体中表达量最高,约为菌丝体中表达量的5.5倍,推测与子实体的快速生长有关.本研究结果有助于提高对gpd功能及其在物种分化研究中作用的认识.

关键词： GC-AG内含子 3-磷酸甘油脱氢酶杨柳田头菇选择性拼接物种分化

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