FoxO3a是叉头盒(forkhead)转录因子中O亚家族成员，在生物体内参与多种调控作用，包括糖代谢、细胞增殖、细胞周期阻滞、生物长寿及细胞凋亡等，在胰岛素受体通路中处于核心的位置，对FoxO3a基因的启动子进行转录因子结合位点预测，发现存在对肌肉的发育均起重要调节作用的TEAD—1、MEF2、E蛋白家族和myogenin结合位点，本实验室已经鉴定了FoxO3a为TEAD—1的靶基因(Qiu et al，2011)。提示FoxO3a在肌细胞的形成过程中可能发挥重要的调控作用。目前尚未见关于FoxO3a基因的遗传多态及其对猪生长发育调控的研究报道，本研究通过对猪FoxO3a基因CDS区域的SNPs进行筛查和检测，并进行基因型与部分生长、胴体、肉质性状的关联分析，以期为猪的分子育种提供遗传标记。
利用生物信息学分析方法对鸡Lpin1基因编码区进行扫描,选取该基因3个引起错义突变的变异位点进行分析,其中c.391G>A位点引起编码氨基酸Asp131→Asn131突变,c.1727C>T位点引起编码氨基酸Ala576→Val576突变,c.2287A>C位点引起编码氨基酸Met763→Leu763突变。应用引入限制性酶切位点PCR(Amplifi-cation-Created Restriction Site PCR,ACRS-PCR)的方法进行引物设计扩增3个突变位点,并通过限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP)检测PCR产物,以藏鸡、隐性白羽鸡、藏隐(藏鸡♂×隐性白羽♀)和藏藏隐[藏鸡♂×(藏鸡♂×隐性白羽♀)♀]群体为材料对3个变异位点进行基因型检测,并与胴体性状进行关联分析;同时在5个中国地方鸡种(固始鸡、萧山鸡、北京油鸡、泰和丝羽乌骨鸡和茶花鸡)中进行变异位点的遗传多样性分析。结果表明:(1)鸡Lpin1基因c.1727C>T在不同品种中具丰富的多态性;而另2个位点在所检测的群体中无多态性存在,c.391G>A位点以GG基因型为主,c.2287A>C位点全部为AA基因型;(2)对c.1727C>T位点的遗传多样性分析表明该位点C等位基因占优势地位,且固始鸡和北京油鸡群体基因型分布显著偏离哈代-温伯格平衡定律(P<0.01),在萧山鸡、泰和丝羽乌骨鸡和茶花鸡三品种中基因型分布均符合哈代-温伯格平衡定律。(3)性状关联分析显示c.1727C>T位点与皮下脂肪厚呈显著关联(P<0.05),与腹脂质量呈极显著关联(P<0.01);其中CC基因型个体的皮下脂肪厚显著高于TT基因型个体(P<0.05),极显著高于TC基因型个体(P<0.01)。TT基因型个体的腹脂质量显著高于其他两种基因型个体(P<0.05)。
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