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植物病理学报 2011年第4期41卷 371-378页

作者：刘林李成云杨静苏源吴晗徐玲胡燕玲农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室农业生物多样性应用技术国家工程研究中心云南农业大学植物保护学院昆明650201

ABC转运蛋白在真菌的致病性方面起着重要的作用。本研究查找和分析了稻瘟病菌基因组中47个ABC转运蛋白基因的外显子区、内含子区、5-′UTR和3-′UTR区中的SSR,并对编码区中SSR的扩张或收缩对蛋白结构的影响进行了预测。结果表明,SSR在... 详细信息

ABC转运蛋白在真菌的致病性方面起着重要的作用。本研究查找和分析了稻瘟病菌基因组中47个ABC转运蛋白基因的外显子区、内含子区、5-′UTR和3-′UTR区中的SSR,并对编码区中SSR的扩张或收缩对蛋白结构的影响进行了预测。结果表明,SSR在这些基因的调控区和编码区分布不均一,且在基因的外显子区、内含子区、5-′UTR和3-′UTR区中SSR的组成和分布均不相同;基因的编码区中三碱基和六碱基SSR相对较多,SSR的基序大都表现为GC含量较高,编码的亲水性氨基酸出现频率远远高于疏水性氨基酸。根据稻瘟病菌自然群体中SSR的变化幅度,预测了SSR的扩张或收缩对蛋白二级结构的影响,发现SSR的扩张或收缩都可能对蛋白的结构产生影响。暗示着SSR的变异在致病相关基因的变异中可能扮演着重要角色。

关键词：稻瘟病菌微卫星重复序列 ABC转运蛋白蛋白二级结构

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云南元阳梯田水稻田白背飞虱若虫空间分布型及理论抽样数

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昆虫知识 2010年第5期47卷 950-957页

作者：唐小艳陈斌李正跃李梓亦王芳生物多样性控制病虫害教育部重点实验室生物多样性控制作物病虫害应用技术国家工程研究中心云南农业大学植物保护学院昆明650201

采用Taylor幂法扩散法和Iwao回归法分析了云南元阳哈尼梯田1400～2000m海拔16个哈尼族传统水稻品种田白背飞虱Sogatella furcifera(Horvath)1～3龄若虫的空间分布特征。结果表明,白背飞虱1～3龄若虫在不同海拔、不同水稻品种田均呈聚集... 详细信息

采用Taylor幂法扩散法和Iwao回归法分析了云南元阳哈尼梯田1400～2000m海拔16个哈尼族传统水稻品种田白背飞虱Sogatella furcifera(Horvath)1～3龄若虫的空间分布特征。结果表明,白背飞虱1～3龄若虫在不同海拔、不同水稻品种田均呈聚集分布中的负二项分布,其负二项分布的公共K值为3.53,聚集原因主要是由白背飞虱生物学特性和环境因素引起。Iwao直线回归方程拟合公式为m*=3.96+1.09m(R=0.97),Taylor幂拟合公式为lg(V)=0.28+1.34×lg(m)(R=0.85)。其中,在1400～1500、1501～1600、1601～1700、1701～1800、1801～1900和1901～2000m海拔梯田稻田中,白背飞虱若虫平均拥挤度分别为10.74±0.83、23.67±3.50、21.64±6.02、47.10±5.71、52.59±12.75、13.72±3.14,差异显著(F=5.77,P<0.01),其中在1701～1800和1801～1900m海拔稻田中白背飞虱平均拥挤度最高,表明在该海拔处白背飞虱在稻丛上分布较为集中,而在1400～1500和1901～2000m海拔稻田中平均拥挤度最低。根据空间分布型参数,建立了精度分别为0.1和0.2时的理论抽样数模型,分别为n=1905.43x+34.57,n=476x.36+8.64,该模型适用于不同虫口密度下的田间抽样。当白背飞虱虫口密度为5、10、20头/丛时,分别取样30、20和15个样方。

关键词：白背飞虱空间分布型负二项分布分布型参数元阳梯田云南

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新蚜虫疠霉感染致病蚜虫的空间分布特征及其理论抽样技术

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植物保护 2012年第2期38卷 55-59,70页

作者：陈斌和淑琪杜广祖李正跃云南农业大学植物保护学院生物多样性控制病虫害教育部重点实验室生物多样性控制作物病虫害应用技术国家工程研究中心昆明650201

[目的]探明新蚜虫疠霉的空间分布特点,为进一步研究蚜虫新蚜虫疠霉病害流行规律及田间释放病原菌防治桃蚜提供依据。[方法]调查甘蓝田新蚜虫疠霉感染致病桃蚜密度,采用Taylor幂法与Iwao回归法分析新蚜虫疠霉的空间分布特征。[结果]新蚜... 详细信息

[目的]探明新蚜虫疠霉的空间分布特点,为进一步研究蚜虫新蚜虫疠霉病害流行规律及田间释放病原菌防治桃蚜提供依据。[方法]调查甘蓝田新蚜虫疠霉感染致病桃蚜密度,采用Taylor幂法与Iwao回归法分析新蚜虫疠霉的空间分布特征。[结果]新蚜虫疠霉在甘蓝田呈聚集分布中的负二项分布,公共K值为2.87。Iwao直线回归方程拟合式为m*=0.12+1.36 m(R=0.99),Taylor幂公式为lg(v)=0.35+1.69lgm(R=0.96)。在不同季节,其空间分布的拥挤度差异显著(F=5.34,p<0.01),7-9月平均拥挤度最高,而1-3月和10-12月最低。精度分别为0.1、0.2、0.3和0.5时的理论抽样数公式分别为n=430.26/x+138.30、n=107.56/x+34.57、n=47.81/x+15.37和n=17.21/x+5.53。当被新蚜虫疠霉感染罹病桃蚜密度较低,即低于每样方5头时,以模型n=17.21/x+5.53较为适宜,在较高密度,即每样方10头/株以上时,以模型n=107.56/x+34.57较宜。[结论]新蚜虫疠霉在甘蓝田均呈聚集分布中的负二项分布,聚集原因是新蚜虫疠霉生物学特性和环境因素。在6-8月,对该菌侵染蚜虫的总体理论抽样以抽查20株左右样方为宜,而在其他季节,抽查30株左右样方为宜。

关键词：新蚜虫疠霉桃蚜甘蓝空间分布型理论抽样数

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金龟子绿僵菌KMa0107菌株对三种玛绢金龟幼虫的致病力

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中国生物防治 2010年第1期26卷 18-23页

作者：陈斌李正跃和淑琪云南农业大学植物保护学院/生物多样性控制作物病虫害教育部重点实验室/生物多样性控制病虫害应用技术国家工程研究中心昆明650201

室内测定了金龟子绿僵菌Metarhizium anisopliae菌株KMa0107对玛绢金龟属3种金龟子幼虫的致病力。结果表明,KMa0107菌株对玛绢金龟Maladerasp.、阔胫玛绢金龟***和小阔胫玛绢金龟***幼虫均具有较强的毒力。接种后,玛绢金龟、阔胫玛绢金... 详细信息

室内测定了金龟子绿僵菌Metarhizium anisopliae菌株KMa0107对玛绢金龟属3种金龟子幼虫的致病力。结果表明,KMa0107菌株对玛绢金龟Maladerasp.、阔胫玛绢金龟***和小阔胫玛绢金龟***幼虫均具有较强的毒力。接种后,玛绢金龟、阔胫玛绢金龟、小阔胫玛绢金龟3种幼虫的毒力方程分别为Y=0.39X＋2.93（R2=0.97）、Y=0.41X＋2.33（R2=0.85）和Y=0.46X＋2.56（R2=0.97）。接种后3-9d,KMa0107菌株对玛绢金龟、阔胫玛绢金龟、小阔胫玛绢金龟幼虫的致死剂量对数值分别为9.09±0.3~5.26±0.18、9.04±0.29~4.67±0.21和7.35±0.18~4.7±0.17。在菌株KMa0107孢子悬浮液1.65×108~1.65×105孢子/ml浓度下,玛绢金龟、阔胫玛绢金龟和小阔胫码绢金龟幼虫LT50的估计值范围为3.4-6.2d、3.3-5.6d和2.7-4.7d。3种玛绢金龟幼虫接种绿僵菌孢子悬浮液后,随着病原菌的侵染,虫体血淋巴中蛋白质含量也随之发生变化。接种后4d,3种玛绢金龟幼虫血淋巴中蛋白质含量均明显下降。接种后2-6d,3种金龟幼虫血淋巴蛋白质含量减退率间差异显著,其中小阔胫玛绢金龟和阔胫玛绢金龟血淋巴蛋白质含量减退率明显高于玛绢金龟。

关键词：金龟子绿僵菌玛绢金龟属毒力时间-死亡率-剂量模型血淋巴

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小麦EST-SSR的分析及其引物的开发

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云南农业大学学报（自然科学版） 2012年第5期27卷 623-630页

作者：刘林孙来亮兰茗清杨静查友贵李成云农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室农业生物多样性应用技术国家工程研究中心云南农业大学植物保护学院云南昆明650201

为开发出具有丰富多态性的、新型的小麦EST-SSR标记,利用已公布的1 071 367条小麦表达序列标签(expressed sequence tags,EST)序列,对≥24 bp的微卫星或简单重复序列进行了系统分析。结果表明,在所分析的小麦EST序列中,搜索到长度大于... 详细信息

为开发出具有丰富多态性的、新型的小麦EST-SSR标记,利用已公布的1 071 367条小麦表达序列标签(expressed sequence tags,EST)序列,对≥24 bp的微卫星或简单重复序列进行了系统分析。结果表明,在所分析的小麦EST序列中,搜索到长度大于或等于24 bp,基序匹配值大于80%的SSR序列32 350个。在这些SSR中,单碱基SSR最多,数量达18 075个,占SSR总数的55.9%;其次为3核苷酸SSR,共6 106个,占SSR总数的18.7%,重复数大于30次以上的达444个,占所有3核苷酸SSR的7.2%。4核苷酸SSR数量最少,仅有696个,仅占SSR总数的2.2%。研究中收搜索到的6核苷酸SSR共1 562个,其基序组成可分为145类,优势基序为AGCCGC(达214个)。以上结果说明小麦EST序列中含有丰富的SSR,这非常有利于开发多态性较高的EST-SSR标记。

关键词：小麦表达序列标签微卫星

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亚洲玉米螟在玉米和甘蔗不同种植模式下的产卵行为

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植物保护学报 2015年第1期42卷 10-16页

作者：昝庆安张丽和淑琪张立敏陈斌李正跃云南农业大学植物保护学院农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室农业生物多样性应用技术国家工程研究中心昆明650201 云南农业大学基础与信息工程学院昆明650201

为明确玉米和甘蔗间作对亚洲玉米螟产卵行为的影响,在尼龙网室研究了亚洲玉米螟在玉米和甘蔗不同种植模式下的产卵时间、产卵部位及产卵量的差异。结果表明,不同种植模式下亚洲玉米螟均于23∶00开始产卵,02∶00~03∶00达产卵高峰。单作... 详细信息

为明确玉米和甘蔗间作对亚洲玉米螟产卵行为的影响,在尼龙网室研究了亚洲玉米螟在玉米和甘蔗不同种植模式下的产卵时间、产卵部位及产卵量的差异。结果表明,不同种植模式下亚洲玉米螟均于23∶00开始产卵,02∶00~03∶00达产卵高峰。单作甘蔗、单作玉米和间作甘蔗叶背的玉米螟卵块和卵粒数均高于叶面,而间作玉米叶背与叶面的玉米螟卵块数无显著差异,叶背的卵粒数高于叶面。单作玉米叶脉的玉米螟卵块和卵粒数均显著高于叶缘;间作玉米和单作甘蔗叶脉与叶缘卵块数间无差异,但叶脉处卵粒数高于叶缘,间作甘蔗叶脉的卵块数高于叶缘,叶缘卵粒数高于叶脉。单作甘蔗叶背的亚洲玉米螟卵块主要分布在距叶鞘69.14 cm处,而叶面的卵块主要分布在距叶鞘21.09 cm处;间作甘蔗叶背和叶面卵块分布于距叶鞘35.17 cm和12.34 cm处,二者差异显著。单作玉米上亚洲玉米螟卵块仅分布于叶背沿叶脉远离叶鞘处,而间作玉米叶背和叶面卵块分布于近叶鞘。表明玉米和甘蔗间作对亚洲玉米螟雌蛾产卵选择性具有明显的影响。

关键词：亚洲玉米螟玉米甘蔗间作产卵行为

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茶树表达序列标签中的微卫星特征分析

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西南农业学报 2015年第3期28卷 1014-1019页

作者：钱春仙高俊刘林杨静李成云农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室/农业生物多样性生物技术国家工程研究中心/云南农业大学植物保护学院云南昆明650201

从NCBI数据库中下载到50776条茶树表达序列标签(expressed sequence tags,EST)序列,利用Tandem Repeats Finder程序,对≧24 bp的微卫星(简单重复序列)进行系统分析。结果表明,在所分析的茶树EST序列中,搜索到长度大于或等于24 bp,基序... 详细信息

从NCBI数据库中下载到50776条茶树表达序列标签(expressed sequence tags,EST)序列,利用Tandem Repeats Finder程序,对≧24 bp的微卫星(简单重复序列)进行系统分析。结果表明,在所分析的茶树EST序列中,搜索到长度大于或等于24 bp,基序匹配值大于80%的微卫星序列5299个,在这些微卫星中,单核甘酸的最多,数量达3283个,占SSR总数的61.96%,其次为2核甘酸微卫星序列,共1113个,占微卫星总数的21%。4核苷酸微卫星数量最少,仅39个,占总数的0.74%,搜索到6核苷酸471个,其基序组成可分为83类,优势基序为AAAACT(130个)。以上结果说明茶树EST序列中含有丰富的微卫星,这非常有利于开发表达序列中的微卫星标记,为含有微卫星的基因的标识、表达提供了很好的基础。

关键词：茶树表达序列标签微卫星

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通过像素值准确分析聚丙烯酰胺凝胶电泳DNA片段大小的方法

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云南农业大学学报（自然科学版） 2013年第5期28卷 741-744页

作者：张波刘林兰茗清杨静查友贵赵婧李成云云南农业大学植物保护学院农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室农业生物多样性应用技术国家工程研究中心云南昆明650201

利用聚丙烯酰胺凝胶电泳对PCR产物进行分离是一项基础性的、常用实验技术，但根据DNA在聚丙烯酰胺凝胶电泳上距离读出目的DNA片段大小的方法尚未见报道。本文首次探讨了DNA聚丙烯酰胺凝胶电泳条带的像素与其条带之间大小的关系，使用SPS... 详细信息

利用聚丙烯酰胺凝胶电泳对PCR产物进行分离是一项基础性的、常用实验技术，但根据DNA在聚丙烯酰胺凝胶电泳上距离读出目的DNA片段大小的方法尚未见报道。本文首次探讨了DNA聚丙烯酰胺凝胶电泳条带的像素与其条带之间大小的关系，使用SPSS对条带对应的像素值和对应的条带大小进行了线性函数、二次多项式、复合函数、增长函数、对数函数、三次多项式、S型曲线、指数函数、倒数（反比例）函数、幂函数和logistic函数11种函数的拟合分析，结果表明：条带对应的像素值与其对应条带的大小相关系数均达0．950以上的函数主要有复合函数、增长函数、三次多项式、指数函数、倒数函数、幂函数和logistic函数，其中相关性最好的是logistic函数，其相关系数为0．998；而且，通过logistic函数算出的7条目标条带的测算值与实际DNA片段的值最接近，各片段大小的测算值与实际片段大小仅相差5—17bp。以上结果表明，***函数能够较准确的放映出经聚丙烯酰胺凝胶电泳后DNA的像素值与其片段大小之间的关系。这将有利于开发出电泳后直接读取DNA片段大小的软件。

关键词：聚丙烯酰胺凝胶电泳 DNA片段大小像素 logistic函数

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紫茎泽兰内生菌的分离及其代谢物的除草活性

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江苏农业科学 2013年第5期41卷 99-101页

作者：王静罗国玖蒙远涛刘林叶敏范黎明查友贵农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室/农业生物多样性应用技术国家工程研究中心/云南农业大学植物保护学院云南昆明650201

为了从紫茎泽兰中分离内生菌并研究内生菌代谢物的除草活性,为开发高效、安全、与环境友好的新型农药奠定基础,用紫茎泽兰茎叶汁液固体培养基从紫茎泽兰茎中分离内生菌,并制备内生菌代谢物,以高粱、小麦、黄瓜、油菜4种供试植物为测试对... 详细信息

为了从紫茎泽兰中分离内生菌并研究内生菌代谢物的除草活性,为开发高效、安全、与环境友好的新型农药奠定基础,用紫茎泽兰茎叶汁液固体培养基从紫茎泽兰茎中分离内生菌,并制备内生菌代谢物,以高粱、小麦、黄瓜、油菜4种供试植物为测试对象,以种子萌发法测定紫茎泽兰内生菌代谢物的除草活性。结果显示,从紫茎泽兰茎中分离得到9种内生真菌,且均能在马铃薯蔗糖琼脂培养基中正常生长;在1 mg/mL浓度下,9种内生菌代谢物至少对1种供试植物根长(或茎长)抑制率达80%以上,F1、F2、F5、F6、F7、F8、F9等7种内生菌代谢物至少对2种供试植物根长(或茎长)抑制率达80%以上,F1、F2、F8等3种内生菌代谢物至少对3种供试植物根长(或茎长)抑制率达80%以上。说明紫茎泽兰内生菌具有较强的除草活性。

关键词：紫茎泽兰内生菌分离代谢物除草活性

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灰色大角间座壳菌(稻瘟病菌)蛋白激酶编码基因中SSR变异及其对蛋白结构的潜在影响

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菌物学报 2010年第5期29卷 698-706页

作者：刘林李进斌张悦苏源杨静陈梦琪李成云农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室农业生物多样性应用技术国家工程研究中心云南农业大学植物保护学院昆明650201 云南省农业科学院农业环境资源研究所昆明650205

病原菌可以利用多种方式激活或者抑制蛋白激酶信号通路来增强其自身侵染力,在病原物与植物互作初期的信号识别和转导中蛋白激酶扮演着重要的角色。已有研究结果表明灰色大角间座壳菌(稻瘟病菌)蛋白激酶基因中含有丰富的SSR。作者通过对... 详细信息

病原菌可以利用多种方式激活或者抑制蛋白激酶信号通路来增强其自身侵染力,在病原物与植物互作初期的信号识别和转导中蛋白激酶扮演着重要的角色。已有研究结果表明灰色大角间座壳菌(稻瘟病菌)蛋白激酶基因中含有丰富的SSR。作者通过对灰色大角间座壳菌(稻瘟病菌)基因组中的89个蛋白激酶基因的外显子区、内含子区、5′-UTR和3′-UTR区中的SSR进行了查找和分析,并对编码区中SSR的扩张或收缩对蛋白结构的影响进行了预测。结果表明,SSR在基因的调控区和编码区中的分布是不均一的,且这些基因的外显子区、内含子区、5′-UTR和3′-UTR区中SSR的组成和分布也均不相同;基因的编码区中三碱基和六碱基SSR相对较多,且SSR基序大都表现为GC含量较高,编码的亲水性氨基酸出现的频率也远远高于疏水性氨基酸。通过病菌群体中变异幅度的检测表明,几乎所有的SSR序列都存在多态性。根据灰色大角间座壳菌(稻瘟病菌)自然群体中SSR的变化幅度,对SSR的扩张或收缩对蛋白二级结构的影响进行预测,发现SSR的扩张或收缩都可能对蛋白的结构产生影响。这暗示着SSR的变异在致病相关基因的变异中可能起着十分重要的作用。

关键词：灰色大角间座壳菌(稻瘟病菌) 微卫星重复序列蛋白激酶编码区调控区

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