检索结果-内蒙古大学图书馆

自然科学进展 2009年第6期19卷 619-627页

作者：冯万军张义荣姚颖垠郭刚刚张桂萍倪中福孙其信中国农业大学植物遗传育种系农业生物技术国家重点实验室教育部杂种优势研究与利用重点实验室北京市作物遗传改良重点实验室农业部作物基因组与遗传改良重点实验室北京100193

尽管杂种优势已经在生产上得到了广泛应用,但是对其形成机理的认识仍然非常有限.为了进一步探讨玉米杂种优势形成的分子机理,以玉米杂交种豫玉22及其亲本综3和87-1苗期根系为材料,采用蛋白质双向电泳和质谱鉴定技术进行了杂交种与亲本... 详细信息

尽管杂种优势已经在生产上得到了广泛应用,但是对其形成机理的认识仍然非常有限.为了进一步探讨玉米杂种优势形成的分子机理,以玉米杂交种豫玉22及其亲本综3和87-1苗期根系为材料,采用蛋白质双向电泳和质谱鉴定技术进行了杂交种与亲本之间苗期根系差异蛋白表达谱研究.结果表明,发芽后8d的杂交种在根长、根尖数目、表面积和生物量等根系性状上均具有明显的杂种优势.双向电泳分析结果显示,在所检测到的1118个蛋白点中,有172个(15.38%)在杂交种与亲本的根系中发生了明显的表达变化,包括单亲沉默、杂种特异、杂种偏低亲、杂种偏高亲和中亲表达等5种差异表达类型,其中以单亲沉默所占比例最高.另外,鉴定出了56个差异表达蛋白点,发现其功能涉及转录和翻译、代谢、能量、信号转导、细胞结构、胁迫响应和转座元件等.因此,玉米杂交种与亲本在蛋白丰度上存在明显的差异,并且差异表达蛋白涉及到各个生长发育过程,可能与玉米根系杂种优势表现有关.

关键词：玉米根系杂种优势分子机理蛋白质表达谱

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小麦苗期根系mRNA的稳定性分析

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自然科学进展 2009年第4期19卷 386-393页

作者：张庆波谢允慧倪中福尹玉静任海丽张桂萍孙其信中国农业大学植物遗传育种系农业生物技术国家重点实验室教育部杂种优势研究与利用重点实验室北京市作物遗传改良重点实验室农业部作物基因组与遗传改良重点实验室北京100193

转录后调控是基因表达调控的重要方式,其中mRNA稳定性是转录后调控的有效途径之一.实验采用cDNA-AFLP技术,对小麦杂交种3338/2463与其亲本苗期根系中的mRNA稳定性进行了分析.结果显示,在所检测到的2995条带中,有96条的丰度经3′脱氧腺... 详细信息

转录后调控是基因表达调控的重要方式,其中mRNA稳定性是转录后调控的有效途径之一.实验采用cDNA-AFLP技术,对小麦杂交种3338/2463与其亲本苗期根系中的mRNA稳定性进行了分析.结果显示,在所检测到的2995条带中,有96条的丰度经3′脱氧腺苷处理60min后在至少一个材料中表现为明显降低,占总数的3.21%,表明这些条带所代表的mRNA半衰期比较短,可能是不稳定mRNA.同源比对分析结果显示,在所鉴定出的74个编码不稳定mRNA的基因中,有30个与已知功能基因具有较高的同源性,其中既有转录因子和信号转导基因,还有一些结构基因,而其余44个为功能未知基因.比较分析发现,杂交种与亲本之间不稳定mRNA的比例没有显著差异,但是不同基因型之间不稳定mRNA的降解速度不同,其中WRKY和线粒体半ABC转运蛋白基因在杂交种中的下调表达可能与其mRNA在杂交种与亲本中的稳定性差异有关.

关键词： mRNA稳定性基因表达小麦杂种优势 cDNA—AFLP

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植物杂种优势形成的分子遗传机理研究进展

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自然科学进展 2009年第7期19卷 697-703页

作者：张义荣姚颖垠彭惠茹张庆波倪中福孙其信中国农业大学植物遗传育种系农业生物技术国家重点实验室教育部杂种优势研究与利用重点实验室北京市作物遗传改良重点实验室农业部作物基因组与遗传改良重点实验室北京100193

杂种优势是普遍存在的一种复杂生物学现象,在农业生产中获得了广泛应用,但对其形成机理迄今尚未阐述清楚,随着基因组学研究的深入和发展,植物杂种优势的分子遗传机理研究也取得了重要进展,证实显性、超显性和上位性对杂种优势都有所贡献... 详细信息

杂种优势是普遍存在的一种复杂生物学现象,在农业生产中获得了广泛应用,但对其形成机理迄今尚未阐述清楚,随着基因组学研究的深入和发展,植物杂种优势的分子遗传机理研究也取得了重要进展,证实显性、超显性和上位性对杂种优势都有所贡献,并克隆了水稻第2染色体上控制产量杂种优势的QTL位点qGY2-1.建立了水稻、玉米、小麦和拟南芥等植物重要杂种优势性状的转录和蛋白质组表达谱,发现杂交种与亲本之间存在明显的基因表达差异,表现为加性和非加性等差异表达模式,这可能与等位基因变异和表观遗传调控有关,基因表达调控网络解析是未来杂种优势机理研究的重要发展方向,最近在拟南芥生长杂种优势研究上已经取得了突破性的研究进展.

关键词：植物杂种优势分子遗传机理

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遗传与基因表达数据的整合——eQTL的方法及应用

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遗传 2008年第9期30卷 1228-1236页

作者：刘刚彭惠茹倪中福秦丹丹宋方威宋广树孙其信中国农业大学植物遗传育种系农业生物技术国家重点实验室教育部作物杂种优势研究与利用重点实验室北京市作物遗传改良重点实验室农业部作物基因组与遗传改良重点实验室北京100193

高通量的基因型分析和芯片技术的发展使人们能够进一步研究哪些遗传差异最终影响基因的表达。通过表达数量性状座位(eQTL)作图方法可对基因表达水平的遗传基础进行解析。与传统的QTL分析方法一样,eQTL的主要目标是鉴别表达性状座位所在... 详细信息

高通量的基因型分析和芯片技术的发展使人们能够进一步研究哪些遗传差异最终影响基因的表达。通过表达数量性状座位(eQTL)作图方法可对基因表达水平的遗传基础进行解析。与传统的QTL分析方法一样,eQTL的主要目标是鉴别表达性状座位所在的染色体区域。但由于表达谱数据成千上万,而传统的QTL分析方法最多分析几十个性状,因此需要考虑这类实验设计的特点以及统计分析方法。本文详细介绍了eQTL定位过程及其研究方法,重点从个体选择、基因芯片实验设计、基因表达数据的获得与标准化、作图方法及结果分析等方面进行了综述,指出了当前eQTL研究存在的问题和局限性。最后介绍了eQTL研究在估计基因表达遗传率、挖掘候选基因、构建基因调控网络、理解基因间及基因与环境的互作的应用进展。

关键词： eQTL 个体选择基因芯片实验设计作图方法

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15个普通小麦WRKY基因的克隆与表达分析

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自然科学进展 2008年第4期18卷 378-388页

作者：吴华玲倪中福姚颖垠郭刚刚孙其信中国农业大学植物遗传育种系农业生物技术国家重点实验室教育部杂种优势研究与利用重点实验室北京市作物遗传改良重点实验室农业部作物基因组与遗传改良重点实验室北京100094

WRKY转录因子广泛参与了植物对生物与非生物胁迫应答反应、激素响应以及生长发育等一系列生理活动.但是,对小麦WRKY家族基因目前还缺少系统的克隆、表达和功能研究.文中采用EST的电子拼接方法,克隆了15个具有完整开放阅读框的小麦WRKY基... 详细信息

WRKY转录因子广泛参与了植物对生物与非生物胁迫应答反应、激素响应以及生长发育等一系列生理活动.但是,对小麦WRKY家族基因目前还缺少系统的克隆、表达和功能研究.文中采用EST的电子拼接方法,克隆了15个具有完整开放阅读框的小麦WRKY基因,分属于WRKY家族的3个大类.表达分析发现,除TaWRKY10基因在分蘖节中表达最强外,其他基因的表达水平都是在叶中最高;4个基因随着叶片的成熟和衰老表达量显著增强;8个基因对低温、高温、NaCl或PEG等逆境因子具有响应;另外,WRKY基因在小麦杂交种与亲本之间存在明显的表达差异,并且有些基因对PEG逆境因子的响应在杂种比在亲本中快.表明,小麦WRKY基因参与了叶片衰老和逆境胁迫的响应过程,所检测到WRKY基因在杂种和亲本中的表达差异可能会通过增强杂交种的抗逆性而促进小麦杂种优势的产生.

关键词：小麦 WRKY转录因子基因克隆基因表达杂种优势

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人工合成六倍体小麦(AABBDD)与亲本种之间基因组与基因区域的序列变异分析

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自然科学进展 2008年第1期18卷 45-50页

作者：聂利红韩宗福逯腊虎姚颖垠孙其信倪中福中国农业大学植物遗传育种系农业生物技术国家重点实验室教育部杂种优势研究与利用重点实验室北京市作物遗传改良重点实验室农业部作物基因组与遗传改良重点实验室北京100094

为探讨六倍体小麦进化过程中基因组发生的变异,我们以两套不同世代(早代和高代)的人工合成六倍体及其母本(四倍体小麦,AABB)和父本(粗山羊草,DD)为材料,采用DNA—AFLP和SSCP方法分别对基因组与基因区域的序列变化进行了研究.结果发现,... 详细信息

为探讨六倍体小麦进化过程中基因组发生的变异,我们以两套不同世代(早代和高代)的人工合成六倍体及其母本(四倍体小麦,AABB)和父本(粗山羊草,DD)为材料,采用DNA—AFLP和SSCP方法分别对基因组与基因区域的序列变化进行了研究.结果发现,人工合成六倍体小麦基因组中来源于父本的条带发生丢失的数目更多,表明倍性较低的亲本(DD)基因组序列在多倍化过程中发生了更明显的变异,这与前人的研究结果一致.与DNA-AFLP结果相比较,采用SSCP方法检测到的变异比例明显较低,说明六倍体小麦进化过程中基因区域发生变异的频率较低,而DNA-AFLP检测到的丢失条带可能主要为非编码序列,特别是重复序列.分析还发现,有4个基因在杂交F1代就发生了变异,这说明这些基因变异是由于杂交引起的.生物信息学分析结果显示,在上述4个基因中,有3个位于2D染色体长臂上,并且位于相近的同一区域.本研究结果显示,在人工合成六倍体小麦进化过程中,基因区域的序列变异具有选择性,而不是随机的.

关键词：人工合成六倍体小麦多倍化基因组序列变异

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利用变性高效液相色谱(dHPLC)进行小麦等位基因差异表达分析

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自然科学进展 2008年第11期18卷 1256-1263页

作者：韩宗福倪中福王晓娜逯腊虎姚颖垠孙其信中国农业大学植物遗传育种系农业生物技术国家重点实验室教育部杂种优势研究与利用重点实验室北京市作物遗传改良重点实验室农业部作物基因组与遗传改良重点实验室北京100193

等位基因变异是生物体基因组中普遍存在的现象,也是物种进化和育种的重要基础.等位基因可以通过编码区的改变或者表达来影响基因的功能,因此研究等位基因的表达具有重要的生物学意义.由于小麦基因组的复杂性,造成等位基因的鉴定比较困难... 详细信息

等位基因变异是生物体基因组中普遍存在的现象,也是物种进化和育种的重要基础.等位基因可以通过编码区的改变或者表达来影响基因的功能,因此研究等位基因的表达具有重要的生物学意义.由于小麦基因组的复杂性,造成等位基因的鉴定比较困难,这极大地制约了小麦等位基因表达研究的开展.利用CAU36和CAU328两个EST-SSR标记,结合变性高效液相色谱(dHPLC)分析技术,在35个小麦基因型中分别检测到4种和3种等位变异类型,并且以抽穗期的穗下节节间为材料,对其在4×6的小麦双列杂交组合杂交F1代中进行了表达分析.结果表明,这两个EST-SSR引物扩增的等位基因在多个组合中均存在显著的差异表达,且CAU36标记检测到的等位基因表达变化值与部分杂交种的株高之间存在显著的相关性.

关键词： EST—SSR 等位基因表达变异变性高效液相色谱小麦

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小麦根系性状对磷胁迫响应QTL定位

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自然科学进展 2007年第10期17卷 1352-1360页

作者：李振兴倪中福彭惠茹刘志勇许胜宝刘刚孙其信中国农业大学植物遗传育种系农业生物技术国家重点实验室教育部杂种优势研究与利用重点实验室北京市作物遗传改良重点实验室农业部作物基因组与遗传改良重点实验室北京100094

土壤缺磷是限制作物产量提高的主要的非生物胁迫之一,培育磷高效基因型是解决这一问题的有效途径.根系对作物的正常生长发育,尤其是营养吸收和磷效率的提高至关重要,所以定位不同磷胁迫条件下根系及其胁迫反应相关数量性状位点(QTL)将... 详细信息

土壤缺磷是限制作物产量提高的主要的非生物胁迫之一,培育磷高效基因型是解决这一问题的有效途径.根系对作物的正常生长发育,尤其是营养吸收和磷效率的提高至关重要,所以定位不同磷胁迫条件下根系及其胁迫反应相关数量性状位点(QTL)将有助于磷高效品种的培育.本实验以小麦重组近交系群体(农大3338×Altgold)为材料,结合高密度遗传图谱,在正常供磷、低磷处理和磷饥饿处理条件下共检测到与小麦根系性状(根长、根数和根干重)及其磷胁迫响应有关的QTL位点30个(LOD>2.0),分布在14条染色体上,其中单个位点对表型贡献率大于10%的有5个,在染色体7B上共检测到7个位点.分析发现,根系性状QTL和磷胁迫响应QTL是由不同位点所控制的.此外,控制幼苗根系相关性状的QTL的增效等位基因分散于双亲中,聚合这些来自双亲的增效等位基因,将有可能选育出磷效率明显提高的小麦品种.

关键词：小麦根系磷胁迫 QTL定位

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水稻遗传转化甘露糖安全筛选体系的建立

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西北农业学报 2007年第2期16卷 41-45页

作者：王彩芬付永彩朱作峰徐杰葛占宇孙传清中国农业大学植物遗传育种系农业生物技术国家重点实验室教育部作物杂种优势研究与利用重点实验室农业部农作物基因组学与遗传改良重点开放实验室北京市作物遗传改良重点实验室

根据genebank中公布的pmi基因序列设计引物,通过PCR扩增从大肠杆菌中分离出6-磷酸甘露糖异构酶基因。将该基因替换植物表达载体pCAMBIA1300中的潮霉素抗性基因hpt,构建了以pmi为选择标记基因的植物表达载体pPMI。对水稻进行了基因枪转... 详细信息

根据genebank中公布的pmi基因序列设计引物,通过PCR扩增从大肠杆菌中分离出6-磷酸甘露糖异构酶基因。将该基因替换植物表达载体pCAMBIA1300中的潮霉素抗性基因hpt,构建了以pmi为选择标记基因的植物表达载体pPMI。对水稻进行了基因枪转化和农杆菌转化,研究了筛选培养基中甘露糖浓度对抗性愈伤组织频率的影响。部分抗性愈伤组织已获得再生植株,PCR检测初步证明外源基因已转入植物细胞。

关键词： 6-磷酸甘露糖异构酶基因(pmi) 甘露糖安全筛选标记水稻遗传转化

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江西东乡野生稻苗期抗旱基因定位(英文)

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Acta Genetica Sinica 2006年第6期33卷 551-558页

作者：周少霞田丰朱作峰付永彩王象坤孙传清中国农业大学植物遗传育种系农业生物技术国家重点实验室北京市作物遗传改良重点实验室农业部农作物基因组学与遗传改良重点开放实验室教育部作物杂种优势研究与利用重点实验室北京100094

普通野生稻是栽培稻的祖先种,其遗传多样性远远大于栽培稻,蕴涵着栽培品种中难以找到的重要性状。以江西东乡普通野生稻为供体、以桂朝2号为遗传背景的野生稻基因渗入系(BC4F5、BC4F6)为材料,利用30%的PEG人工模拟干旱环境,对渗入系二... 详细信息

普通野生稻是栽培稻的祖先种,其遗传多样性远远大于栽培稻,蕴涵着栽培品种中难以找到的重要性状。以江西东乡普通野生稻为供体、以桂朝2号为遗传背景的野生稻基因渗入系(BC4F5、BC4F6)为材料,利用30%的PEG人工模拟干旱环境,对渗入系二叶一心苗期进行抗旱鉴定,共定位了12个与抗旱有关的QTL,其中在第2、6和12染色体上发现了4个QTL的加性效应值为正,来自东乡野生稻的等位基因能使渗入系的抗旱性增强,特别是位于第12染色体RM17附近的qSDT12-2在多次重复中均被检测到,在PEG处理后1-8d能稳定表达。通过对抗旱性QTL的动态分析,发现不同QTL表达时间不同。

关键词：普通野生稻渗入系苗期 PEG 抗旱性 QTL

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