检索结果-内蒙古大学图书馆

扬州大学学报（农业与生命科学版） 2013年第3期34卷 33-38页

作者：吴舒洁储明星过玮王凭青吴常信狄冉刘秋月李宁重庆大学生物工程学院重庆400030 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所/农业部畜禽遗传资源与种质创新重点实验室北京100193 中国农业大学动物科技学院北京100193 中国农业大学农业生物技术国家重点实验室北京100193

利用反转脉冲电泳改进的单链构象多态(PCR-SSCP)方法对促卵泡素β(FSHβ)亚基基因5′调控区近端1.5kb的序列进行多态性检测,分析该基因对小尾寒羊产羔数的影响。结果表明:引物P3、P5和P6扩增片段均存在多态性,在小尾寒羊中均检测到3种... 详细信息

利用反转脉冲电泳改进的单链构象多态(PCR-SSCP)方法对促卵泡素β(FSHβ)亚基基因5′调控区近端1.5kb的序列进行多态性检测,分析该基因对小尾寒羊产羔数的影响。结果表明:引物P3、P5和P6扩增片段均存在多态性,在小尾寒羊中均检测到3种基因型。测序结果显示引物P3的扩增片段存在C、D2种等位基因;相对于野生型,C、D等位基因均在-899bp处发生了1个TCG→GTC的三碱基突变;此外,C等位基因在-933bp处发生了1个T→A的单碱基突变。引物P5的扩增片段存在A、B2种等位基因,B等位基因序列与GenBank中序列完全一致,定义为野生型;而A等位基因则发生了A-438G、T-411C和T-375G的3个单碱基突变;还发现A等位基因在-402bp处存在1个单碱基的缺失(T)。引物P6的扩增片段存在E、F2种等位基因,F等位基因与GenBank中序列一致,E等位基因在-181bp处发生了1个T→C的单碱基突变。统计发现小尾寒羊A、C、E等位基因频率明显高于B、D、F,基因型频率AA>AB>BB、CC>CD>DD、EE>EF>FF;且引物P3遗传变异最大,P5遗传变异最小;小尾寒羊产羔数的最小二乘均值关系为AA>AB>BB、CC>CD>DD、EE>EF>FF,但3种基因型间产羔数差异均不显著(P>0.05)。

关键词：小尾寒羊促卵泡素β亚基基因 PCR—SSCP 产羔数

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小麦wx-B1a基因片段的克隆及其RNAi载体构建

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中国农学通报 2012年第12期28卷 33-38页

作者：刘子渲常柳张付芸徐婧尤明山梁荣奇中国农业大学农学与生物技术学院植物遗传育种系/农业生物技术国家重点实验室/北京市作物遗传改良重点实验室/农业部作物基因组与遗传改良重点实验室北京100193 山西大学生物工程学院太原030006

为了获得小麦wx-B1a基因的特异RNAi表达载体,以小麦品种‘京花1号’开花12天的籽粒为材料,用天根公司植物总RNA提取试剂盒提取总RNA,以wx-B1a基因(GenBank NO:AB019623)的cDNA序列设计一对特异性引物,利用RT-PCR克隆了wx-B1a基因部分cDN... 详细信息

为了获得小麦wx-B1a基因的特异RNAi表达载体,以小麦品种‘京花1号’开花12天的籽粒为材料,用天根公司植物总RNA提取试剂盒提取总RNA,以wx-B1a基因(GenBank NO:AB019623)的cDNA序列设计一对特异性引物,利用RT-PCR克隆了wx-B1a基因部分cDNA片段。Blastn结果显示,它与GenBank上报道的Triticum aestivum wx-1 gene(GenBank NO:EU719611.1)同源。通过酶切连接将此片段分别置于拟南芥FAD2的Intron1(GenBank NO:AJ271841)的上、下游,然后将此发夹结构置于小麦HMW-GS 1Dx5启动子的下游,从而构建了小麦wx-B1a基因的特异RNAi表达载体pBAC47p-wx-B1aIR。从而为下一步转化高产强筋小麦品种培育优质面条专用小麦奠定基础。

关键词：普通小麦 wx蛋白表达载体

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全基因组关联研究理论及其在流行病中的应用

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中华流行病学杂志 2011年第10期32卷 1043-1045页

作者：卢昕阚飙刘剑锋张勤中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室北京102206 中国农业大学动物科技学院农业生物技术国家重点实验室农业部畜禽遗传育种重点开放实验室

全基因组关联研究（GWAS）利用遍布于全基因组范围的分子标记（主要为单核苷酸多态性，SNP）并借助强大统计学工具，对影响某些复杂性状如疾病易感的遗传变异进行鉴定和分析。

关键词：全基因组关联研究流行病

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非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳中与杂合子相伴产生的非目的条带的鉴定

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农业生物技术学报 2010年第3期18卷 616-622页

作者：王晓通连林生赵春江邓学梅吴常信中国农业大学农业生物技术国家重点实验室农业部畜禽遗传育种重点开放实验室云南农业大学动物科技学院中国科学院海洋研究所

研究旨在鉴定两条在非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳中总是伴随杂合子出现的非目的条带。实验切胶回收了目的条带和非目的条带,以此为模板进行第二次PCR扩增,然后将PCR产物按不同组合进行混合并施加不同处理再次进行电泳,另外,人工合成了四条... 详细信息

研究旨在鉴定两条在非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳中总是伴随杂合子出现的非目的条带。实验切胶回收了目的条带和非目的条带,以此为模板进行第二次PCR扩增,然后将PCR产物按不同组合进行混合并施加不同处理再次进行电泳,另外,人工合成了四条包含该缺失位点的寡核苷酸单链,对条带形成的过程进行了模拟。结果表明以两条非目的条带为模板的第2次PCR产物的电泳结果均有4条带,与杂合子样本4条带的迁移率完全一致,以2条目的条带为模板的第2次PCR产物电泳条带的迁移率分别与其本身保持一致;将以2条目的条带为模板的第2次PCR产物混合并经过变性复性后,其结果出现非目的条带和目的条带,也与杂合子样本4条带的迁移率完全一致,而如果只是简单混合并未经过变性复性处理,其电泳结果只出现目的条带。另外,在利用寡核苷酸单链进行模拟的实验中发现,异源双链迁移率较低,形成了非目的条带,而正常双链迁移率较高,形成目的条带。结果提示,这种与杂合子相伴产生的非目的条带,并不是非特异性扩增的结果,而是由于模板为缺失突变杂合子,在复性过程中,PCR产物中的一部分碱基缺失的正负单链会与不缺失的正负单链发生互补,而在发生碱基缺失的位置,会有突环产生,产生的突环进而导致杂合双链迁移率降低,最终形成了两条迁移率较低的非目的条带。

关键词：非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳非目的条带碱基缺失 DNA突环

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中国美利奴羊IGFBP-3基因内含子4区的PCR-RFLP多态性分析

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中国畜牧兽医 2010年第8期37卷 134-138页

作者：沈敏王文君杨永林马春萍刘守仁李宁新疆农垦科学院兵团绵羊繁育生物技术重点实验室石河子832000 江西农业大学食品科学与工程学院南昌330045 新疆紫泥泉绵羊育种研究所石河子832025 中国农业大学农业生物技术国家重点实验室北京100193

本研究针对在绵羊IGFBP-3基因内含子4区新发现的1个SNP位点(C218T),建立了PCR-RFLP的基因分型方法。利用该方法对353只中国美利奴羊(新疆军垦型)进行了多态性检测,结果显示,有CC(249bp)、CT(249/216/33bp)和TT(216/33bp)3种基因型,基因... 详细信息

本研究针对在绵羊IGFBP-3基因内含子4区新发现的1个SNP位点(C218T),建立了PCR-RFLP的基因分型方法。利用该方法对353只中国美利奴羊(新疆军垦型)进行了多态性检测,结果显示,有CC(249bp)、CT(249/216/33bp)和TT(216/33bp)3种基因型,基因型频率分别为0.52、0.41和0.07;有C、T2种等位基因,等位基因频率分别为0.72、0.28。多重比较结果表明,不同基因型对中国美利奴部分羊毛生产性能有一定的影响,CC基因型个体的毛丛长度显著短于TT基因型个体(P<0.05),其毛囊密度显著高于CT和TT基因型个体(P<0.05)。

关键词：胰岛素样生长因子结合蛋白3 单核苷酸多态性羊毛性状中国美利奴羊

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利用PCR-SacⅡ-RFLP技术检测绵羊IGFBP-3基因多态性的研究

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新疆农业科学 2010年第5期47卷 849-853页

作者：沈敏王文君杨永林甘尚权马春萍何其宏张永胜李宁刘守仁新疆农垦科学院新疆生产建设兵团绵羊繁育生物技术重点实验室新疆石河子832000 江西农业大学食品科学与工程学院南昌330045 新疆紫泥泉绵羊育种中心新疆石河子832025 中国农业大学农业生物技术国家重点实验室北京100094

【目的】将IGFBP-3基因作为候选基因,寻找与绵羊羊毛品质等经济性状相关的SNP位点。【方法】利用PCR-SSCP和DNA测序快速筛查SNP位点;在此基础上建立PCR-RFLP检测方法,分析该位点在不同品种绵羊中的基因型和等位基因分布情况;通过多重比... 详细信息

【目的】将IGFBP-3基因作为候选基因,寻找与绵羊羊毛品质等经济性状相关的SNP位点。【方法】利用PCR-SSCP和DNA测序快速筛查SNP位点;在此基础上建立PCR-RFLP检测方法,分析该位点在不同品种绵羊中的基因型和等位基因分布情况;通过多重比较分析不同基因型与中国美利奴羊部分羊毛性状的关联性。【结果】以绵羊基因组DNA为模板扩增得到了249 bp的特异条带,PCR-SSCP及测序分析显示在该序列的140碱基处发生了G/T突变,导致SacⅡ酶切位点消失。经PCR-SacⅡ-RFLP检测,哈萨克羊和中国美利奴羊细毛羊得到三种基因型:TT(249 bp)、GG(139 bp/110 bp)和TG(249 bp/139 bp/110 bp);杜泊羊中出现GG和TG两种基因型;湖羊、小尾寒羊以及萨福克羊中只有GG一种基因型。关联性分析表明不同基因型与部分羊毛性状没有明显的相关性。【结论】在绵羊IGFBP-3基因嫩含子4区发现一个新的SNP位点,玻建立PCR-SacⅡ-RFLP检测方法;该位点不同等位基因和基因型在不同绵羊品种中的分布具有一定规律性;不同基因型与中国美利奴细毛羊部分羊毛性状中间没有明显的相关性。

关键词：胰岛素样生长因子结合蛋白3 单核苷酸多态性羊毛性状绵羊

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基于EM和规则算法的半同胞家系单倍型推断方法

基于EM和规则算法的半同胞家系单倍型推断方法

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第十五次全国动物遗传育种学术讨论会

作者：丁向东张勤农业生物技术国家重点实验室畜禽育种国家工程实验室农业部动物遗传育种与繁殖重点开放实验室中国农业大学动物科技学院

引言单倍型(Haplotype)是指同一染色体上多个基因座位等位基因的组合,它能同时利用多个基因座位的遗传信息,比单基因座位分析更有效力,在进化、基因定位、基因组选择等研究领域有广阔的应用前景。目前,

关键词：单倍型推断 EM算法半同胞家系最小重组原则

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定位影响中国荷斯坦奶牛产奶性状的位置候选基因

定位影响中国荷斯坦奶牛产奶性状的位置候选基因

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第十五次全国动物遗传育种学术讨论会

作者：梅瑰张勤丁向东张哲农业生物技术国家重点实验室农业部畜禽遗传育种重点开放实验室中国农业大学动物科技学院广东省农业科学院畜牧研究所广东省动物育种与营养公共实验室

引言20世纪以来,奶牛的生产水平大幅度提高,其中由于育种所实现的群体遗传改良起到很大作用。但传统的选择方法进展较慢,如果能找到影响奶牛产奶性状的主效基因,并应用于标记辅助选择,将大大加快遗传

关键词：奶牛 BTA6 位置候选产奶性状关联分析

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猪2、7和8号染色体上影响血常规指标的数量性状基因座(QTL)检测

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生物化学与生物物理进展 2008年第11期35卷 1291-1297页

作者：巩元芳卢昕王志鹏李珊邱小田张勤农业生物技术国家重点实验室农业部畜禽遗传育种重点开放实验室中国农业大学动物科技学院北京100193 河北科技师范学院动物科学系昌黎066600

以3个品种(长白猪、大白猪、松辽黑猪)16个公猪家系共计368头仔猪组成资源群体,在猪2、7和8号染色体上共选取35个微卫星标记,采用基于线性混合模型的方差组分分析方法,对影响与猪白细胞、红细胞和血小板相关的共计18项血常规指标的数量... 详细信息

以3个品种(长白猪、大白猪、松辽黑猪)16个公猪家系共计368头仔猪组成资源群体,在猪2、7和8号染色体上共选取35个微卫星标记,采用基于线性混合模型的方差组分分析方法,对影响与猪白细胞、红细胞和血小板相关的共计18项血常规指标的数量性状基因座(quantitative trait loci,QTL)进行了检测.通过似然比检验,并以自由度为2的卡方分布作为检验统计量的分布,共发现22个在P<5%水平下显著的QTL,其中在2号染色体上有9个,分别影响白细胞总数、中性粒细胞数、平均红细胞体积、血红蛋白含量、平均红细胞血红蛋白浓度、血小板总数、平均血小板体积、血小板分布宽度和血小板压积,在7号染色体有7个,分别影响白细胞总数、中性粒细胞数、平均红细胞血红蛋白浓度、血红蛋白含量、血小板总数、平均红细胞体积和红细胞分布宽度变异,在8号染色体上有6个,分别影响中性粒细胞百分比、淋巴细胞百分比、平均红细胞血红蛋白浓度、血小板总数、血小板压积和平均红细胞体积.为尽可能地避免由于多重检验所造成的假阳性率的升高,我们采用了控制假检出率(false discovery rate,FDR)的方法来对这22个QTL进行进一步检验,发现有14个达到FDR<5%显著水平,其中又有9个达到FDR<1%显著水平.

关键词：猪血常规指标数量性状基因座(QTL) 方差组分分析假检出率(FDR)

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Henna基因突-变是导致北京紫眼果蝇眼部蝶呤含量减少的重要原因

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中国科学（C辑） 2008年第8期38卷 742-750页

作者：王勤赵春江白丽华邓学梅吴常信中国农业大学动物科技学院农业生物技术国家重点实验室农业部畜禽遗传育种重点开放实验室北京100193

苯丙氨酸羟化酶被认为参与黑腹果蝇眼部蝶呤代谢,但是始终都缺乏有力证据.Henna是苯丙氨酸羟化酶的编码基因,"北京紫眼"果蝇(Hnbp)是Henna基因的一个隐性突变体,Hnbp突变形成的原因是Henna基因的第二外显子上具有插入片段.在H... 详细信息

苯丙氨酸羟化酶被认为参与黑腹果蝇眼部蝶呤代谢,但是始终都缺乏有力证据.Henna是苯丙氨酸羟化酶的编码基因,"北京紫眼"果蝇(Hnbp)是Henna基因的一个隐性突变体,Hnbp突变形成的原因是Henna基因的第二外显子上具有插入片段.在Hnbp中,其编码产物的Biopterin-Hydroxyl功能域中增加了15个氨基酸残基.蛋白预测结果显示,插入的残基改变了原有的蛋白结构,这种变化很可能降低了苯丙氨酸羟化酶与四氢生物蝶呤结合的能力.为了恢复突变表型,利用UAS-GAL4转基因体系使野生型Henna基因在Hnbp的背景下表达.在双拷贝的转基因系GMR-GAL4 UAS-Henna/UAS-Henna;Hnbp/Hnbp中,突变表型得到完全恢复:果蝇的眼色由突变体的紫色恢复到野生型的红色,蝶呤含量也从突变体的30%升至98%,与野生型差异不显著(P>0.05).上述实验结果充分说明,Henna基因突变是导致Hnbp突变体眼部喋呤含量降低的重要原因,为苯丙氨酸羟化酶参与果蝇眼部蝶呤代谢提供了体内实验的直接证据.

关键词：黑腹果蝇 (Drosophila melanogaster) 果蝇蝶呤北京紫眼果蝇苯丙氨酸羟化酶 Henna基因

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