检索结果-内蒙古大学图书馆

表型特征结合基因组分析鉴定不同菌落形态Bacillus velezensis ACCC 19742

生物技术通报 2020年第2期36卷 142-148页

作者：郭鹤宝王星何山文张晓霞中国农业科学院农业资源与农业区划研究所农业农村部农业微生物资源收集与保藏重点实验室

在中国农业微生物菌种中心(ACCC)菌株的定期转接保藏过程中,发现解淀粉芽孢杆菌ACCC 19742在同一培养基上出现两种不同的菌落形态,将这两个不同形态的菌株编号为19742-1和19742-2。通过形态学、生理生化及基因组分析相结合鉴定不同菌落... 详细信息

在中国农业微生物菌种中心(ACCC)菌株的定期转接保藏过程中,发现解淀粉芽孢杆菌ACCC 19742在同一培养基上出现两种不同的菌落形态,将这两个不同形态的菌株编号为19742-1和19742-2。通过形态学、生理生化及基因组分析相结合鉴定不同菌落形态ACCC 19742,并进一步确定该菌株的分类地位。首先将菌株进行分离与纯化,其次将纯化后的菌株进行16S rRNA及gyrB基因扩增及序列分析,通过MEGA 7.0软件构建系统发育树;API 20NE、BIOLOG及脂肪酸等分析菌株的生理生化特性;全基因组分析菌株的ANI和DDH值。两株菌在API 20NE中,仅葡萄糖酸盐同化反应存在差异;脂肪酸检测中主要组成相同,仅是百分含量方面略有差别;两株菌的16S rRNA基因相似性为100%,gyrB基因的相似性为99.4%;全基因组测序表明,两株菌的ANI值为99.95%,DDH值为99.62%。综合遗传学特征和表型特征,证实两者为来源于同一菌株不同的形态变异型,而并非污染所致。同时,19742-1和19742-2与Bacillus velezensis NRRL_B 41580~T的ANI及DDH值最高,分别为97%和77%,且16S rRNA和gyrB系统进化分析也表明,该菌株在分类地位上属于贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis),而非解淀粉芽孢杆菌。这为菌株的保藏提供了一定的参考价值。

关键词：解淀粉芽孢杆菌形态变异型全基因组测序贝莱斯芽孢杆菌

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不同培养基对土壤细菌可培养性的影响

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沈阳师范大学学报（自然科学版） 2022年第1期40卷 48-53页

作者：王泽贾晟楠华智超牛邦彦徐绮思任东军高淼沈阳师范大学生命科学学院沈阳110034 中国农业科学院农业资源与农业区划研究所农业农村部农业微生物资源收集与保藏重点实验室北京100081

采用不同培养基培养土壤微生物,以提高土壤细菌可培养性。以番茄大田和温室土壤为材料,采用4种培养基进行细菌的分离培养,经16S rDNA分子生物学鉴定,明确不同培养基获得细菌的种群差异。结果表明:在细菌数量方面,2种土样分别在各种培养... 详细信息

采用不同培养基培养土壤微生物,以提高土壤细菌可培养性。以番茄大田和温室土壤为材料,采用4种培养基进行细菌的分离培养,经16S rDNA分子生物学鉴定,明确不同培养基获得细菌的种群差异。结果表明:在细菌数量方面,2种土样分别在各种培养基上生长的细菌数量未达到显著性差异,但培养基间细菌数量差异较大,LB培养基分离的细菌数量分别是YEM Medium,TWYE Medium和Flour Medium培养基的2.04倍、1.88倍和3.5倍;在细菌多样性方面,细菌在温室土分离的种类多于在大田土中分离的种类,分离细菌的多样性从大到小为LB>TWYE Medium>Flour Medium>YEM Medium培养基。此外,在LB和TWYE Medium培养基中各获得一株潜在新种。综上,LB培养基分离的细菌数量和多样性最佳,其他培养基在细菌多样性方面具有补充作用。

关键词：土壤细菌培养基 16S rDNA 潜在新种

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一株对稻瘟病菌有抗菌活性的特基拉芽孢杆菌WRN032的筛选及发酵条件优化

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天然产物研究与开发 2020年第5期32卷 860-866,881页

作者：孙露单潇潇蒋建兰张桂山天津大学化工学院系统生物工程教育部重点实验室天津300350 中国农业科学院农业资源与农业区划研究所农业部农业微生物资源收集与保藏重点实验室北京100081

采用牛津杯法抑菌试验,根据多种芽孢杆菌对不同植物病原真菌的生长抑制效果进行筛选,得到特基拉芽孢杆菌WRN032对稻瘟病菌的生长抑制效果最佳。以吸光度和抑菌圈直径为指标,设计进行单因素试验、多因素显著性筛选试验和中心点复合试验... 详细信息

采用牛津杯法抑菌试验,根据多种芽孢杆菌对不同植物病原真菌的生长抑制效果进行筛选,得到特基拉芽孢杆菌WRN032对稻瘟病菌的生长抑制效果最佳。以吸光度和抑菌圈直径为指标,设计进行单因素试验、多因素显著性筛选试验和中心点复合试验对特基拉芽孢杆菌WRN032的发酵条件进行优化,得到该菌株抗菌活性最优的发酵条件为:接种量1%,摇瓶装液量40%,葡萄糖浓度2%,摇床转速220 rpm,初始pH6.5,培养时间48 h,培养温度30℃。在此条件下,特基拉芽孢杆菌WRN032的发酵液吸光度和萃取物的抑菌圈直径与优化前相比分别提高了186.63%和154.10%。

关键词：特基拉芽孢杆菌稻瘟病菌牛津杯法发酵条件

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新疆食用菌产业发展现状、问题及对策

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新疆农业科技 2022年第3期 19-22页

作者：李旭东罗燕娜王静静杨雅舒黄晨阳新疆生产建设兵团第六师农业科学研究所五家渠831301 中国农业科学院农业资源与农业区划研究所农业农村部农业微生物资源收集与保藏重点实验室北京100081

食用菌产品具有高蛋白质、高氨基酸、高维生素和低脂肪的“三高一低”营养特征,食用菌生产具有经济效益高、产品品质高、生产效率高和生态功能强的“三高一强”优势,食用菌产业是实施健康中国战略和全面推进乡村振兴战略的重要抓手。目... 详细信息

食用菌产品具有高蛋白质、高氨基酸、高维生素和低脂肪的“三高一低”营养特征,食用菌生产具有经济效益高、产品品质高、生产效率高和生态功能强的“三高一强”优势,食用菌产业是实施健康中国战略和全面推进乡村振兴战略的重要抓手。目前,新疆食用菌产业规模较小,具有巨大的潜力,本文针对新疆食用菌产业现状,剖析产业存在问题,并提出相应对策,以期促进新疆食用菌产业高质量发展。

关键词：食用菌高质量乡村振兴健康中国

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我国大蒜主产区大蒜根腐病病原真菌的分离及致病性初步研究

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中国土壤与肥料 2021年第5期 296-302页

作者：汪甜尹彦舒华智超贾晟楠任东军辛丽王纪忠高淼淮阴工学院生命科学与食品工程学院江苏淮安223003 中国农业科学院农业资源与农业区划研究所/农业农村部农业微生物资源收集与保藏重点实验室北京100081 山东省玛丽亚农业机械有限公司山东金乡272203

大蒜根腐病是我国大蒜主产区山东省金乡县及其周边地区大蒜的主要病害之一。采用常规组织分离法,从连续3年采集的51份大蒜根腐病根样品中分离纯化潜在大蒜根腐病病原菌真菌62株,通过形态学和分子生物学对菌株进行鉴定,结果显示主要类群... 详细信息

大蒜根腐病是我国大蒜主产区山东省金乡县及其周边地区大蒜的主要病害之一。采用常规组织分离法,从连续3年采集的51份大蒜根腐病根样品中分离纯化潜在大蒜根腐病病原菌真菌62株,通过形态学和分子生物学对菌株进行鉴定,结果显示主要类群为镰刀菌属(Fusarium)和茎点霉(Setophoma);采用柯赫氏法则,明确镰刀菌属H9为大蒜根腐病病原菌;采用温室水培试验,研究不同浓度大蒜根腐病病原菌H9对大蒜幼苗的致病能力,结果显示致病能力与接种量呈正相关,接种孢子浓度2×10^(9) cfu/mL、接菌量为100和150 mL,40 d后就可以导致大蒜幼苗产生严重的根腐病。综上,我国山东及周边地区大蒜主产区根腐病的主要病原真菌为镰刀菌属(Fusarium)和茎点霉属(Setophoma),为该地区大蒜根腐病的科学防治提供理论依据。

关键词：大蒜根腐病病原菌鉴定致病能力

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中国食用菌工厂化生产现状与问题分析

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农业工程技术 2021年第10期41卷 11-14页

作者：黄晨阳陈强赵梦然中国农业科学院农业资源与农业区划研究所农业农村部农业微生物资源收集与保藏重点实验室北京100081

设施农业借助设施设备,运用现代农业工程、机械技术和管理技术,改善局部温度、湿度、光照、水肥、空气等环境条件,为种植业和养殖业创造相对可控制的外界条件,从而促进农业生产。设施农业的本质是借助设施提高农业资源的利用率。相对于... 详细信息

设施农业借助设施设备,运用现代农业工程、机械技术和管理技术,改善局部温度、湿度、光照、水肥、空气等环境条件,为种植业和养殖业创造相对可控制的外界条件,从而促进农业生产。设施农业的本质是借助设施提高农业资源的利用率。相对于大田作物、蔬菜、水果等,食用菌对温湿度要求高,对竞争性杂菌防控严格。目前,中国食用菌生产几乎全部属于设施农业范畴,即便是出菇阶段可以直接在大田中进行的种类,如黑木耳、大球盖菇等,在发菌阶段仍需要相应设施。食用菌生产已基本实现了设施化,设施化的最高境界是工厂化生产。

关键词：大球盖菇食用菌生产设施设备设施化工厂化生产局部温度温湿度黑木耳

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马铃薯细菌多样性解析及促生高产IAA菌株的筛选

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中国土壤与肥料 2020年第1期 223-231页

作者：崔伟国尹彦舒张方博崔曼杨茉张树清郑红丽高淼内蒙古农业大学农学院内蒙古呼和浩特010010 中国农业科学院农业资源与农业区划研究所/农业农村部农业微生物资源收集与保藏重点实验室北京100081

采用3种不同的培养基从马铃薯根际土壤和叶片中共分离出78株细菌,优势菌属是Pantoea,占菌株总数的55.13%。马铃薯根际土采用R2A培养基(27株优势菌,13个菌属)分离的细菌多样性相对较好,阿须贝培养基(31株优势菌,9个菌属)次之,土壤浸提液... 详细信息

采用3种不同的培养基从马铃薯根际土壤和叶片中共分离出78株细菌,优势菌属是Pantoea,占菌株总数的55.13%。马铃薯根际土采用R2A培养基(27株优势菌,13个菌属)分离的细菌多样性相对较好,阿须贝培养基(31株优势菌,9个菌属)次之,土壤浸提液培养基(1株优势菌,1个菌属)最少;马铃薯叶片内生菌用阿须贝培养基(19株优势菌,3个菌属)分离的细菌多样性较差。采用Salkowski比色液显色法定量测定菌株产IAA能力,结果表明有58株细菌具有分泌IAA的能力,占测定菌株总数的74.36%,从马铃薯根际土(42株优势菌,13个菌属)筛选的产IAA菌数量及细菌多样性均高于马铃薯叶片内生菌(16株优势菌,2个菌属)。根据菌株产IAA能力强弱和分离部位及分离培养基的差异,选择7株产IAA菌进行促生特性和马铃薯盆栽幼苗促生能力等研究,结果显示:有6株产IAA菌具有ACC脱氨酶能力,1株产IAA菌具有溶解无机磷能力,2株产IAA菌具有溶解有机磷能力;两轮温室促生实验结果显示,菌株Pantoea ***-34-25对马铃薯幼苗具有明显的促生作用,是生产微生物肥料的潜在菌种。

关键词：马铃薯细菌多样性吲哚乙酸温室促生试验

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雪茄烟叶原料发酵微生物多样性及酶活变化研究

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中国农业科技导报 2021年第10期23卷 171-180页

作者：张磊罗泽华杨明川李世贵辛玉华蔡斌刘好宝曾代龙顾金刚段碧华中国烟草总公司海南省公司海口雪茄研究所海口570105 中国农业科学院农业资源与农业区划研究所农业农村部农业微生物资源收集保藏重点实验室北京100081 北京农学院生物与资源环境学院北京102206 四川中烟工业有限责任公司长城雪茄烟厂四川什那618400

烟叶原料发酵是决定雪茄品质与风味的关键因素之一,研究了雪茄烟叶不同发酵阶段的微生物多样性及蛋白酶、淀粉酶、果胶酶的变化规律。结果表明,不同发酵阶段微生物菌群呈动态变化,样品1在发酵起始阶段以葡萄球菌属为优势菌,结束则以肠... 详细信息

烟叶原料发酵是决定雪茄品质与风味的关键因素之一,研究了雪茄烟叶不同发酵阶段的微生物多样性及蛋白酶、淀粉酶、果胶酶的变化规律。结果表明,不同发酵阶段微生物菌群呈动态变化,样品1在发酵起始阶段以葡萄球菌属为优势菌,结束则以肠杆菌属、假单胞菌属、短杆菌属为优势菌;而样品2在发酵过程中主要以葡萄球菌和四联球菌为优势菌。不同发酵阶段酶活性变化规律具有一定差异性:样品1蛋白酶(165.95 U·g^(-1))与淀粉酶(0.34 U·g^(-1))在发酵结束活性较强,果胶酶活性(1.30 U·g^(-1))在发酵起始较强;样品2蛋白酶活性(121.57 U·g^(-1))发酵结束活性较强;果胶酶活性(1.60 U·g^(-1))与淀粉酶活性(0.38 U·g^(-1))在发酵中期活性较强。样品1雪茄原料在三个不同发酵阶段pH变化较为明显,在发酵中期pH为7.6,呈碱性;样品2雪茄原料在不同发酵阶段pH变化较小,整个发酵阶段pH呈酸性。

关键词：雪茄发酵微生物多样性酶活 pH

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辣椒根际促生菌的分离筛选及抗病促生特性研究

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生物技术通报 2020年第5期36卷 104-109页

作者：杨茉高婷李滟璟魏崇瑶高淼马莲菊沈阳师范大学生命科学学院沈阳110034 中国农业科学院农业资源与农业区划研究所农业农村部农业微生物资源收集与保藏重点实验室北京100081

获得辣椒根际促生菌(Plant growth promoting rhizobacteria,PGPR)并探究其抗病促生特性。采用固氮、无机磷和有机磷培养基从江苏省徐州市采集的辣椒根际土壤中分离筛选根际促生菌株(PGPR),通过形态特征及16S rDNA序列分析进行菌株鉴定... 详细信息

获得辣椒根际促生菌(Plant growth promoting rhizobacteria,PGPR)并探究其抗病促生特性。采用固氮、无机磷和有机磷培养基从江苏省徐州市采集的辣椒根际土壤中分离筛选根际促生菌株(PGPR),通过形态特征及16S rDNA序列分析进行菌株鉴定,对菌株的固氮、解磷、分泌3-吲哚乙酸(IAA)能力及对4种辣椒病害病原菌抗病能力进行探究。得到13株辣椒PGPR菌株,经鉴定分别属于Bacillus、Pseudomonas、Lelliottia、Siccibacter、Achromobacter、Microbacterium和Paenibacillus;13株PGPR菌株均有固氮功能;其中7株可解有机磷,分别属于Lelliottia、Bacillus、Siccibacter、Microbacterium、Paenibacillus;5株可解无机磷,分别属于Lelliottia、Bacillus、Siccibacter、Pseudomonas;3株具有分泌IAA能力,分别属于Lelliottia、Siccibacter、Bacillus;5株具有抗病能力,分别属于Bacillus、Lelliottia、Siccibacter。辣椒根际土壤含有在农业生产上具有潜在的应用价值的多功能根际促生菌。

关键词：辣椒根际促生菌抗病

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两个糙皮侧耳菌株的比较基因组学研究

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菌物学报 2019年第12期38卷 2133-2143页

作者：王丽宁赵梦然邬向丽黄晨阳曲积彬中国农业科学院农业资源与农业区划研究所/农业农村部农业微生物资源收集与保藏重点实验室

随着糙皮侧耳基因组测序的完成,基因组数据的深入挖掘和利用成为研究重点。本研究基于较高质量的糙皮侧耳CCMSSC00389-1和CCMSSC03989-1基因组图谱,开展了种内比较基因组学分析。CCMSSC00389-1和CCMSSC03989-1的11条染色体序列表现出良... 详细信息

随着糙皮侧耳基因组测序的完成,基因组数据的深入挖掘和利用成为研究重点。本研究基于较高质量的糙皮侧耳CCMSSC00389-1和CCMSSC03989-1基因组图谱,开展了种内比较基因组学分析。CCMSSC00389-1和CCMSSC03989-1的11条染色体序列表现出良好的共线性,且分别含有89.92%和91.68%的保守基因。对菌株特有基因的GO富集分析表明,两菌株各自分化出一些独特的调控方式或途径。CCMSSC00389-1和CCMSSC03989-1之间共存在931542个单核苷酸多态性位点,231654个插入/缺失和9221个结构变异。对与遗传变异重叠基因的GO富集分析表明,碳水化合物降解、物质运输/催化和调控/蛋白活性相关的基因分别容易发生SNP、In/Del和SV变异。CCMSSC00389-1中50.326kb缺失序列的断点两侧含有双链断裂修复(DSB)信号,推测DSB介导50.326kb序列的缺失。

关键词：比较分析遗传变异 GO富集分析生物信息学

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