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海州香薷(Elsholtzia splendens)根际铜抗性细菌的筛选及生物多样性

微生物学报 2009年第10期49卷 1360-1366页

作者：孙乐妮何琳燕张艳峰张文辉王琪盛下放南京农业大学生命科学学院农业部农业环境微生物工程重点开放实验室南京210095

【目的】重金属耐性植物海州香薷根际铜抗性细菌的筛选及生物多样性研究将有助于了解微生物-超富集植物相互关系和植物修复机理、开发微生物-香薷重金属修复新技术。【方法】采用稀释平板涂布法从海州香薷根际筛选铜抗性菌株,测定菌株... 详细信息

【目的】重金属耐性植物海州香薷根际铜抗性细菌的筛选及生物多样性研究将有助于了解微生物-超富集植物相互关系和植物修复机理、开发微生物-香薷重金属修复新技术。【方法】采用稀释平板涂布法从海州香薷根际筛选铜抗性菌株,测定菌株溶磷和产生吲哚乙酸、铁载体、1-氨基环丙烷-1-羧酸(ACC)脱氨酶的特性,采用16S rDNA限制性酶切多态性分析(amplified rDNA restriction analysis,ARDRA)研究铜抗性细菌的遗传多样性,根据16S rDNA相似性对产ACC脱氨酶的菌株进行了鉴定。【结果】分离纯化到27株抗Cu2+20 mg/L的细菌,所有菌株均能产生吲哚乙酸或其衍生物,44.4%的分离菌株能够分泌高量的铁载体。分离菌株在60%相似性水平上可聚类分为7个群。5株细菌具ACC脱氨酶活性,菌株2EBS12、2EBS13、2EBS15、3EBS11属于不动杆菌属(Acinetobacter),菌株2EBS14属于产碱菌属(Alcaligenes)。【结论】海州香薷根际铜抗性细菌具有丰富多样的生物学特性和遗传多样性,不动杆菌属和产碱杆菌属细菌具ACC脱氨酶活性。

关键词：铜抗性细菌生物多样性 ACC脱氨酶海州香薷

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具溶磷能力的植物内生促生细菌的分离筛选及其生物多样性

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微生物学报 2010年第6期50卷 710-716页

作者：黄静盛下放何琳燕南京农业大学生命科学学院农业部农业环境微生物工程重点开放实验室南京210095

【目的】具溶磷能力的植物内生促生细菌的分离筛选及生物多样性的研究将有助于扩大溶磷微生物来源、丰富功能内生细菌资源库及开发新的改善土壤磷素营养途径。【方法】结合内生细菌分离方法从油菜和玉米体内分离筛选具溶磷能力的内生细... 详细信息

【目的】具溶磷能力的植物内生促生细菌的分离筛选及生物多样性的研究将有助于扩大溶磷微生物来源、丰富功能内生细菌资源库及开发新的改善土壤磷素营养途径。【方法】结合内生细菌分离方法从油菜和玉米体内分离筛选具溶磷能力的内生细菌,测定菌株摇瓶条件下的溶磷能力,并研究其产生吲哚乙酸(IAA)、铁载体、1-氨基环丙烷-1-羧酸(ACC)脱氨酶等的特性,采用16SrDNA限制性酶切片段长度多态性分析(RFLP)研究了具溶磷能力的植物内生促生细菌的遗传多样性,并挑选典型菌株进行了鉴定。【结果】分离筛选到32株具稳定溶磷能力的植物内生细菌,所有菌株都能从磷酸钙中释放出有效磷并使培养液pH值降低,释放的有效磷浓度最高达到537.6mg/L。分离自油菜的供试细菌都能产生吲哚乙酸和铁载体,分离自玉米的供试细菌中有68.4%的菌株产生吲哚乙酸,63.2%的菌株产生铁载体,63.2%的菌株具ACC脱氨酶活性。分离菌株在76%相似性水平上可聚类分为8个群。11株典型菌株归属于泛菌属(Pantoea)、假单胞菌属(Pseudomonas)、伯克霍尔德氏菌属(Burkholderia)、不动杆菌属(Acinetobacter)及罗尔斯顿菌属(Ralstonia)等5个属。【结论】油菜和玉米体内溶磷细菌具有丰富多样的生物学特性和遗传多样性。

关键词：溶磷作用内生促生细菌生物多样性 ACC脱氨酶玉米油菜

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对硝基苯酚降解菌Pseudomonas ***-7的降解特性及其降解相关基因的克隆

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微生物学报 2008年第11期48卷 1486-1492页

作者：董小军洪青李恋李顺鹏南京农业大学生命科学学院农业部农业环境微生物工程重点开放实验室南京210095

【目的】本研究的目的是分离对硝基苯酚(PNP)降解菌,研究其对PNP的降解特性;克隆其降解相关基因,并进行表达。【方法】本研究通过富集培养法和系列稀释平板涂布法分离PNP降解菌株;采用形态观察、生理生化特征测定和16S rDNA分析对菌株... 详细信息

【目的】本研究的目的是分离对硝基苯酚(PNP)降解菌,研究其对PNP的降解特性;克隆其降解相关基因,并进行表达。【方法】本研究通过富集培养法和系列稀释平板涂布法分离PNP降解菌株;采用形态观察、生理生化特征测定和16S rDNA分析对菌株进行初步鉴定;通过摇瓶试验研究菌株降解特性;利用SEFA-PCR技术克隆降解相关基因,并亚克隆到表达载体pET29a中,构建重组表达质粒pETpnpC,再转入受体菌*** BL21(DE3)中进行诱导表达;通过分光光度法测定表达产物的酶活力。【结果】分离到一株PNP降解菌PDS-7,将该菌株鉴定为假单胞菌属(Pseudomonas sp.);该菌株能够以PNP作为唯一碳源、氮源和能源生长,菌株对PNP的最高耐受浓度为80mg/L,最适降解温度为30°C,偏碱性条件有利于菌株对PNP的降解;克隆了PNP降解过程中的偏苯三酚1,2-双加氧酶基因pnpC及马来酰醋酸还原酶基因pnpD(GenBank登陆号EU233791);将pnpC在*** BL21(DE3)菌株进行了诱导表达,表达产物对偏苯三酚和邻苯二酚均有邻位开环活性,比活力分别为0.45U/mg protein和0.37U/mg protein,表明偏苯三酚1,2-双加氧酶基因pnpC得到了活性表达。【结论】分离鉴定了一株PNP降解菌Pseudomonas ***-7,研究了该菌株的降解特性,克隆和表达了降解相关基因。

关键词：对硝基苯酚 Pseudomonas sp.PDS-7 降解特性基因克隆

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遗传稳定型六六六、多菌灵降解基因工程菌构建(英文)

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微生物学报 2008年第1期48卷 45-50页

作者：武俊许敬亮洪青李顺鹏南京农业大学生命科学学院农业部农业环境微生物工程重点开放实验室南京210095

通过PCR的方法从六六六降解菌Sphingomonas ***-A扩增出完整的脱氯化氢酶基因linA。将其克隆到含有mini-Tn5的自杀性质粒pUT4K上,构建成质粒pUT/mini-Tn5-linA.通过三亲杂交,在辅助质粒RK600的帮助下,将pUT/mini-Tn5-linA转移到一株高... 详细信息

通过PCR的方法从六六六降解菌Sphingomonas ***-A扩增出完整的脱氯化氢酶基因linA。将其克隆到含有mini-Tn5的自杀性质粒pUT4K上,构建成质粒pUT/mini-Tn5-linA.通过三亲杂交,在辅助质粒RK600的帮助下,将pUT/mini-Tn5-linA转移到一株高效降解多菌灵菌株Rhodococcus ***-6中。利用mini-Tn5的转座作用将linA基因整合到DJL-6的染色体DNA上,得到工程菌株DJL-6A。该工程菌具有同时降解多菌灵和六六六的功能,且对于初始浓度为0.05μg/mL和5μg/mL的六六六的降解活性与亲本菌株BHC-A相当。在不加任何选择压力的条件下工程菌株进行连续传代,结果证明linA基因可以持续稳定的存在于宿主的染色体DNA上。

关键词：脱氯化氢酶基因linA 转座载体pUT/mini-Tn5 多功能工程菌

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利用枯草芽孢杆菌ytkA和ywoF基因启动子与信号肽重组分泌表达mpd基因

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生物工程学报 2006年第2期22卷 249-256页

作者：张晓舟闫新崔中利李顺鹏南京农业大学生命科学学院农业部农业环境微生物工程重点开放实验室南京210095

用大肠杆菌-枯草芽孢杆菌穿梭载体pNW33N和去除了信号肽编码序列的成熟mpd基因构建了穿梭启动子探针pNW33N-mpd。用该探针从质粒pMPDP3和pMPDP29上克隆来自于枯草芽孢杆菌ytkA和ywoF基因上游的启动子功能片段,构建了穿梭表达载体pNYTM和... 详细信息

用大肠杆菌-枯草芽孢杆菌穿梭载体pNW33N和去除了信号肽编码序列的成熟mpd基因构建了穿梭启动子探针pNW33N-mpd。用该探针从质粒pMPDP3和pMPDP29上克隆来自于枯草芽孢杆菌ytkA和ywoF基因上游的启动子功能片段,构建了穿梭表达载体pNYTM和pNYWM。将表达载体pNYTM和pNYWM转入枯草芽孢杆菌1A751获得表达菌株1A751(pNYTM)和1A751(pNYTM),mpd基因在ytkA和ywoF基因的启动子和信号肽的带动下实现了分泌表达且具有天然活性,结果表明ytkA基因的启动子强度强于ywoF基因的启动子。利用ytkA基因的强启动子和nprB基因的分泌型信号肽编码序列构建了新的穿梭分泌表达载体pYNMK,并使mpd基因在枯草芽孢杆菌WB800中得到了更高水平的分泌表达,表达菌株WB800(pYNMK)在培养到第84h时甲基对硫磷水解酶酶活达到最高值为10.40u/mL,是出发菌株邻单胞菌M6表达量的10.8倍,重组表达产物有91.4%分泌在培养基中。

关键词：枯草芽孢杆菌 ytkA基因 ywoF基因启动子信号肽 mpd基因分泌表达

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抗甲磺隆假单胞菌的分离及其乙酰乳酸合酶的大小亚基ilvIH基因的克隆和表达

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微生物学报 2008年第11期48卷 1493-1498页

作者：孙笑非黄星陈博李顺鹏何健南京农业大学生命科学学院农业部农业环境微生物工程重点开放实验室南京210095

乙酰乳酸合酶(也称乙酰羟酸合酶acetohydroxyacid synthase,AHAS)是植物、真菌和细菌细胞内支链氨基酸Val、Leu、Ile生物合成过程中关键酶,是乙酰乳酸合酶抑制剂类除草剂如磺酰脲类、咪唑啉酮类、嘧啶水杨酸和磺酰氨类的作用靶标。【目... 详细信息

乙酰乳酸合酶(也称乙酰羟酸合酶acetohydroxyacid synthase,AHAS)是植物、真菌和细菌细胞内支链氨基酸Val、Leu、Ile生物合成过程中关键酶,是乙酰乳酸合酶抑制剂类除草剂如磺酰脲类、咪唑啉酮类、嘧啶水杨酸和磺酰氨类的作用靶标。【目的】获得抗甲磺隆的乙酰乳酸合酶基因,构建其表达载体,并分析基因中的位点突变与乙酰乳酸合酶对磺酰脲类除草剂抗性产生原因。【方法】从长期使用甲磺隆的土壤中分离到1株抗甲磺隆的菌株Lm10,利用PCR技术从Lm10总DNA中克隆到乙酰乳酸合酶的大小亚基基因ilvIH,对ilvIH氨基酸序列进行比对分析。分别将ilvI和ilvH分别连接到表达载体pET29a(+)多克隆位点,转化大肠杆菌(Escherichia coli)获得转化子BL21(pET-I)和BL21(pET-H),并诱导表达。【结果】菌株Lm10鉴定为假单孢菌(Pseudomonas sp.),对甲磺隆的最高耐受浓度达到14000μmol//L,且对各种乙酰乳酸合酶抑制剂类除草剂具有交叉抗性。Lm10与甲磺隆敏感菌株KT2440的小亚基氨基酸序列完全相同,而大亚基有6个氨基酸位点发生变异。转化子在IPTG诱导下,乙酰乳酸合酶的大小亚基的蛋白成功表达,粗酶液酶活试验结果表明Lm10的ilvI基因表达的乙酰乳酸合酶大亚基对甲磺隆有很强的抗性。【结论】发现菌株Lm10的乙酰乳酸合酶大亚基对甲磺隆有很强的抗性,抗甲磺隆菌株Lm10与敏感菌株KT2440的ilvI有6个氨基酸位点差异,这些位点突变可能是乙酰乳酸合酶对甲磺隆抗性产生的原因。

关键词：乙酰乳酸合酶抑制剂类除草剂除草剂抗性细菌乙酰乳酸合酶 ilvIH

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耐盐及苯乙酸、甲基对硫磷降解基因工程菌的构建

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微生物学报 2003年第5期43卷 554-559页

作者：刘智洪青徐剑宏张国顺李顺鹏南京农业大学生命科学学院农业部农业环境微生物工程重点开放实验室南京210095

H1 (Halomonassp.)是一株耐高盐浓度 (1 8%NaCl,W V)和降解苯乙酸的菌株 ,pDT3质粒为pUC1 9插入甲基对硫磷水解酶基因 (mpd基因 )构建而成。采用HindⅢ酶切 ,获得含有完整mpd基因片段 ,克隆到广宿主质粒pKT2 3 0和pBBR1 MCS2上 ,构建... 详细信息

H1 (Halomonassp.)是一株耐高盐浓度 (1 8%NaCl,W V)和降解苯乙酸的菌株 ,pDT3质粒为pUC1 9插入甲基对硫磷水解酶基因 (mpd基因 )构建而成。采用HindⅢ酶切 ,获得含有完整mpd基因片段 ,克隆到广宿主质粒pKT2 3 0和pBBR1 MCS2上 ,构建成质粒pKT MP和pBBR MP。通过三亲杂交 ,在辅助质粒pRK2 0 1 3的帮助下 ,将质粒pKT MP和pBBR MP转移到H1中 ,得到的工程菌H pKT MP和H pBBR MP具有耐盐、降解苯乙酸和水解甲基对硫磷的功能 ,其中H pBBR MP水解酶活性与亲本菌株甲基对硫磷降解菌 (Pseudomonasputida)DLL E4相当 ,而H pKT MP水解酶活性要提高 1倍左右。经过传代试验。

关键词：耐盐苯乙酸甲基对硫磷降解基因工程菌三亲杂交含盐废水

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氯代酰胺类除草剂降解菌的分离及降解性能

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应用与环境生物学报 2011年第5期17卷 711-716页

作者：倪盈盈郑金伟张隽王保站何健李顺鹏南京农业大学生命科学学院农业部农业环境微生物工程重点开放实验室南京210095

从生产乙草胺的农药厂废水生物处理池活性污泥中分离到一株氯代酰胺类除草剂降解细菌,命名为Y3B-1.根据表型特征、生理生化特性和16S rDNA序列系统发育分析,将其鉴定为副球菌属(Paracoccus sp.).研究了菌株Y3B-1在不同条件下对多种氯代... 详细信息

从生产乙草胺的农药厂废水生物处理池活性污泥中分离到一株氯代酰胺类除草剂降解细菌,命名为Y3B-1.根据表型特征、生理生化特性和16S rDNA序列系统发育分析,将其鉴定为副球菌属(Paracoccus sp.).研究了菌株Y3B-1在不同条件下对多种氯代酰胺类除草剂的降解性能.结果表明:菌株Y3B-1能以乙草胺为碳源生长,并能降解乙草胺、丁草胺和丙草胺,3 d对这3种氯代酰胺类除草剂的降解率分别达到86.7%、65.5%和69.1%,不能降解异丙甲草胺.该菌降解乙草胺的最适温度为30℃,最适pH为7.0,对乙草胺的降解效果与接种量成正相关,对较低浓度的乙草胺有很好的降解效果,过高的起始浓度抑制其对乙草胺的降解,外加营养如酵母膏和土壤悬液则显著促进其对乙草胺的降解.

关键词：酰胺类除草剂乙草胺副球菌生物降解降解特性

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趋化信号转导基因cheA突变对Pseudomonas putida DLL-1甲基对硫磷的趋化性及原位降解的影响

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微生物学报 2007年第3期47卷 471-476页

作者：文阳蒋建东邓海华蓝鸿李顺鹏南京农业大学生命科学学院农业部农业环境微生物工程重点开放实验室南京210095

Pseudomonas putida DLL-1是一株甲基对硫磷（MP）高效降解菌株,同时对MP具有趋化性.cheA基因是菌株趋化信号转导过程中负责编码组氨酸激酶的基因,为了研究菌株趋化性在农药原位降解中的作用,通过基因打靶的方式使*** DLL-1染色体上单... 详细信息

Pseudomonas putida DLL-1是一株甲基对硫磷（MP）高效降解菌株,同时对MP具有趋化性.cheA基因是菌株趋化信号转导过程中负责编码组氨酸激酶的基因,为了研究菌株趋化性在农药原位降解中的作用,通过基因打靶的方式使*** DLL-1染色体上单拷贝的cheA基因失活,成功地获得了MP的趋化突变株*** DAK,突变株与野生菌株生长能力没有显著差异.通过土壤盆钵试验（MP浓度为50mg/kg）,发现在灭菌与未灭菌土壤中趋化突变株对MP的降解能力低于原始出发菌株DLL-1约20%～30%,说明菌株DLL-1趋化性的丧失会减慢其对农药的降解,趋化性在农药的原位降解过程中发挥重要作用.

关键词：趋化性农药降解 Pseudomonas putida DLL-1 cheA基因甲基对硫磷

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乙羧氟草醚降解菌Pseudomonas sp. YF1的分离、鉴定与降解特性

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应用与环境生物学报 2009年第5期15卷 686-691页

作者：邱吉国郑金伟张隽李顺鹏何健南京农业大学生命科学学院农业部农业环境微生物工程重点开放实验室南京210095

从生产乙羧氟草醚工厂的污水处理池污泥中分离到一株乙羧氟草醚降解细菌,命名为YF1.根据表型特征、生理生化特性和16S rDNA序列系统发育分析,将其鉴定为假单胞菌属(Pseudomonas sp.).接种量为5%时,菌株YF1在含200mg/L乙羧氟草醚的基础... 详细信息

从生产乙羧氟草醚工厂的污水处理池污泥中分离到一株乙羧氟草醚降解细菌,命名为YF1.根据表型特征、生理生化特性和16S rDNA序列系统发育分析,将其鉴定为假单胞菌属(Pseudomonas sp.).接种量为5%时,菌株YF1在含200mg/L乙羧氟草醚的基础盐液体培养基中降解乙羧氟草醚,7d后降解率约80%.加大接种量和外加营养碳氮源可以促进乙羧氟草醚的降解.该菌株降解乙羧氟草醚的最适pH为7.0,最适温度为30℃.菌株YF1能利用苯酚、邻苯二酚、对苯二酚、苯甲酸、龙胆酸、对硝基苯酚和邻氯苯酚为底物生长,不能利用3-苯氧基苯甲酸为碳源生长,菌株YF1细胞内邻苯二酚1,2-双加氧酶受到乙羧氟草醚或其代谢产物的诱导.

关键词：乙羧氟草醚假单胞菌生物降解降解特性

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