coat-ε蛋白是组成COPⅠ的coatmer复合体的一个亚基,采用c DNA末端快速扩增(Rapid amplification of c DNA end,RACE)技术,经DNAMAN比对拼接得出coat-ε基因全长1402bp,5’非编码区(UTR)84bp,3’非编码区(UTR)310bp,开放阅读框1008bp,...
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coat-ε蛋白是组成COPⅠ的coatmer复合体的一个亚基,采用c DNA末端快速扩增(Rapid amplification of c DNA end,RACE)技术,经DNAMAN比对拼接得出coat-ε基因全长1402bp,5’非编码区(UTR)84bp,3’非编码区(UTR)310bp,开放阅读框1008bp,预测编码335个氨基酸,Signal P3.0 Server和TMHMM Server v.2.0预测氨基酸序列没有信号肽且不存在跨膜结构,PSORT II Prediction预测该蛋白位于线粒体、细胞质、内质网中。系统进化树显示,中国明对虾的coat-ε基因与节肢动物门的动物亲缘关系相近。采用实时荧光定量方法分析该基因在鳃、上皮、胃等不同组织中的相对表达,coat-ε在肌肉中的相对转录表达量最高。本试验获得的中国明对虾coat-ε全长序列,为该基因功能研究提供基础。
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