检索结果-内蒙古大学图书馆

中国畜牧杂志 2006年第13期42卷 2-5页

作者：张纪刚殷宗俊张勤农业部畜禽遗传育种重点开放实验室农业生物技术国家重点实验室北京100094

cDNA芯片已经成为生物学试验中一种重要试验手段,与其相应的检测差异表达基因的统计方法也在快速地完善。目前通用的方法是将数据进行对数比转换,并相应进行标准化处理。鉴于对数转换的缺点,本研究提出一种非转换方法,即背景校正后直接... 详细信息

cDNA芯片已经成为生物学试验中一种重要试验手段,与其相应的检测差异表达基因的统计方法也在快速地完善。目前通用的方法是将数据进行对数比转换,并相应进行标准化处理。鉴于对数转换的缺点,本研究提出一种非转换方法,即背景校正后直接进行数据标准化。研究表明:利用这种非转换方法,可以更有效地剔除试验中的“噪音,”提高检测的准确率。本研究利用Apo AI试验的芯片数据进行了效率验证,结果表明:与对数转换方法相比,非转换方法能检测出更多的差异表达基因,可以作为cDNA芯片数据分析的一种简便高效方法。

关键词：畜牧、兽医科学基础学科 cDNA芯片对数转换非转换方法标准化

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江西东乡野生稻苗期抗旱基因定位(英文)

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Acta Genetica Sinica 2006年第6期33卷 551-558页

作者：周少霞田丰朱作峰付永彩王象坤孙传清中国农业大学植物遗传育种系农业生物技术国家重点实验室北京市作物遗传改良重点实验室农业部农作物基因组学与遗传改良重点开放实验室教育部作物杂种优势研究与利用重点实验室北京100094

普通野生稻是栽培稻的祖先种,其遗传多样性远远大于栽培稻,蕴涵着栽培品种中难以找到的重要性状。以江西东乡普通野生稻为供体、以桂朝2号为遗传背景的野生稻基因渗入系(BC4F5、BC4F6)为材料,利用30%的PEG人工模拟干旱环境,对渗入系二... 详细信息

普通野生稻是栽培稻的祖先种,其遗传多样性远远大于栽培稻,蕴涵着栽培品种中难以找到的重要性状。以江西东乡普通野生稻为供体、以桂朝2号为遗传背景的野生稻基因渗入系(BC4F5、BC4F6)为材料,利用30%的PEG人工模拟干旱环境,对渗入系二叶一心苗期进行抗旱鉴定,共定位了12个与抗旱有关的QTL,其中在第2、6和12染色体上发现了4个QTL的加性效应值为正,来自东乡野生稻的等位基因能使渗入系的抗旱性增强,特别是位于第12染色体RM17附近的qSDT12-2在多次重复中均被检测到,在PEG处理后1-8d能稳定表达。通过对抗旱性QTL的动态分析,发现不同QTL表达时间不同。

关键词：普通野生稻渗入系苗期 PEG 抗旱性 QTL

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大豆铁结合蛋白基因在旱稻中的表达及铁含量分析

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中国农业科学 2006年第11期39卷 2362-2367页

作者：董阔徐杰朱作峰刘燕王象坤付永彩孙传清中国农业大学植物遗传育种系/农业生物技术国家重点实验室/教育部作物杂种优势研究与利用重点实验室/农业部农作物基因组学与遗传改良重点开放实验室/北京市作物遗传改良重点实验室中国农业大学植物遗传育种系/农业生物技术国家重点实验室/教育部作物杂种优势研究与利用重点实验室/农业部农作物基因组学与遗传改良重点开放实验室/北京市作物遗传改良重点实验室北京100094

【目的】尝试利用转基因方法提高旱稻铁含量。【方法】采用基因枪和农杆菌转化法,将水稻胚乳特异表达的谷蛋白基因启动子GluB-1驱动下的大豆铁结合蛋白基因转入2个优良旱稻品种“旱稻297”和“旱稻277”。利用PCR、Southern杂交分析方... 详细信息

【目的】尝试利用转基因方法提高旱稻铁含量。【方法】采用基因枪和农杆菌转化法,将水稻胚乳特异表达的谷蛋白基因启动子GluB-1驱动下的大豆铁结合蛋白基因转入2个优良旱稻品种“旱稻297”和“旱稻277”。利用PCR、Southern杂交分析方法验证转化结果。【结果】转基因植株T1代RT-PCR证明,外源基因在种子中特异表达。T1～T3代的PCR检测证明铁结合蛋白基因已经稳定遗传。多数转基因植株T0～T3代种子中铁含量高于未转化植株,最高达到未转化对照的2倍以上。【结论】利用基因枪和农杆菌转化法可将大豆铁结合蛋白基因导入旱稻基因组中,并使转基因稻米铁含量增高。

关键词：旱稻基因枪法农杆菌法铁结合蛋白基因铁含量

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牦牛乳上皮粘蛋白MUC1的遗传多态性研究

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自然科学进展 2006年第5期16卷 629-632页

作者：郑玉才赵兴波金素钰彭先文白文林李宁吴常信西南民族大学生命科学与技术学院成都610041 中国农业大学农业生物技术国家重点实验室北京100094 中国农业大学动物科技学院农业部畜禽遗传育种重点开放实验室北京100094

采用凝胶电泳方法分离牦牛乳上皮粘蛋白MUC1,通过比较乳MUC1的多态性发现麦洼牦牛、九龙牦牛、天祝白牦牛、青海牦牛和西藏牦牛共5个牦牛群427头泌乳牦牛乳MUC1存在 9种MUC1类型,蛋白质分子质量范围为163～208 ku,普遍大于普通乳牛;群... 详细信息

采用凝胶电泳方法分离牦牛乳上皮粘蛋白MUC1,通过比较乳MUC1的多态性发现麦洼牦牛、九龙牦牛、天祝白牦牛、青海牦牛和西藏牦牛共5个牦牛群427头泌乳牦牛乳MUC1存在 9种MUC1类型,蛋白质分子质量范围为163～208 ku,普遍大于普通乳牛;群体遗传变异分析表明牦牛乳MUC1的基因频率、基因型频率存在品种间差异,基因杂合度较大,根据乳MUC1基因频率可将5个牦牛品种明显地聚为两类,提示牦牛乳MUC1存在地方类群的特异性．

关键词：牦牛乳遗传多态性 MUC1

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猪UCP3基因多态的发现与单倍型分析

猪UCP3基因多态的发现与单倍型分析

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第十次全国畜禽遗传标记研讨会

作者：李艳华赵兴波王小花李宁吴常信北京奶牛中心中国农业大学农业生物技术国家重点实验室中国农业大学动物科技学院农业部畜禽遗传育种重点开放实验室中国农业大学农业生物技术国家重点实验室中国农业大学动物科技学院农业部畜禽遗传育种重点开放实验室

解耦联蛋白家族(uncoupling proteins,UCPs),是线粒体内膜的转运蛋白,具有解离氧化磷酸化耦联的功能,影响机体能量代谢。本研究通过PCR和PCR-SSCP等方法, 对UCP3基因进行多态性扫描并进行测序验证,在UCP3基因所扫描的区段中共发现并验证... 详细信息

解耦联蛋白家族(uncoupling proteins,UCPs),是线粒体内膜的转运蛋白,具有解离氧化磷酸化耦联的功能,影响机体能量代谢。本研究通过PCR和PCR-SSCP等方法, 对UCP3基因进行多态性扫描并进行测序验证,在UCP3基因所扫描的区段中共发现并验证了6个多态性位点,然后对这6个多态性位点进行转录因子结合位点预测,结果表明,有 4个突变位点改变了转录因子结合方式,对这4个多态性位点进行单倍型分析,聚类结果表明,这几个突变位点所引起的转录因子结合位点的改变对UCP3基因的转录和调控将产生影响,从而影响猪的生产性能。

关键词：猪解耦联蛋白3 多态性单倍型

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水稻中一个新的MYC基因的克隆及其分析

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Acta Genetica Sinica 2005年第4期32卷 393-398页

作者：朱作峰孙传清付永彩钱晓茵杨金水王象坤中国农业大学植物遗传育种系/农业生物技术国家重点实验室/农业部农作物基因组学与遗传改良重点开放实验室/北京市作物遗传改良重点实验室北京100094 复旦大学遗传研究所上海200433

在水稻基因组序列中发现类似MYC序列的同源序列,并设计引物成功克隆了一个水稻OsMYC基因(GenBank登录号:AY398581 ),并对其进行了分子结构分析。OsMYC基因具有典型的DNA结合结构域: 碱性区域 /螺旋环螺旋(bHLH)基序,与其他MYC类似基... 详细信息

在水稻基因组序列中发现类似MYC序列的同源序列,并设计引物成功克隆了一个水稻OsMYC基因(GenBank登录号:AY398581 ),并对其进行了分子结构分析。OsMYC基因具有典型的DNA结合结构域: 碱性区域 /螺旋环螺旋(bHLH)基序,与其他MYC类似基因的蛋白序列比对结果表明,OsMYC基因与AtMYC2、MYC7E和PG1等氨基酸序列一致性分别是 78%、48%、46%,而在bHLH区的一致性分别为 95%、84%、77%,N端保守区的一致性分别为 81%、54%、52%;位于bHLH区域内的核定位信号区则完全一致;系统进化树分析结果表明,该基因与AtMYC2、MYC7E和PG1等位于同一亚类。此外,该基因主要在营养器官中表达,茎秆中表达最强,根和叶片中较弱,并且能被外源ABA或Fe3 +所诱导,这与AtMYC2、MYC7E基因的表达模式基本相同。该基因是水稻MYC转录因子家族的一个新成员。

关键词：水稻 MYC转录因子克隆

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不同优势小麦正反杂交种子与亲本自交种子发育前期基因表达差异

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作物学报 2005年第1期31卷 119-123页

作者：孟凡荣倪中福吴利民谢晓东王章奎孙其信中国农业大学遗传育种系/农业生物技术国家重点实验室/农业部作物基因组学与遗传改良重点开放实验室北京100094

为探讨小麦杂种优势形成的分子机理,本研究选用优势不同的3个杂交组合,以授粉后2、6和12 d的正反杂交种子与亲本自交种子为材料,采用mRNA差异显示技术分析了不同优势正反杂交种子与亲本自交种子之间发育前期的基因表达差异.结果表明,所... 详细信息

为探讨小麦杂种优势形成的分子机理,本研究选用优势不同的3个杂交组合,以授粉后2、6和12 d的正反杂交种子与亲本自交种子为材料,采用mRNA差异显示技术分析了不同优势正反杂交种子与亲本自交种子之间发育前期的基因表达差异.结果表明,所有3个时期正反杂交种子与亲本自交种子之间存在明显的基因表达差异,差异可归纳为特异型(SPE)、沉默型(SIE)和单亲表达(IEP)3大类型,且随着优势的减弱,沉默表达所占比例增大,而单亲表达所占比例减少.

关键词：小麦正反交种子发育基因表达杂种优势

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利用基因渗入系研究水稻杂种优势与基因差异表达的关系

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农业生物技术学报 2005年第6期13卷 691-697页

作者：张转薛伟王象坤孙传清中国农业大学植物遗传育种系农业生物技术国家重点实验室农业部农作物基因组学与遗传改良重点开放实验室北京市作物遗传改良重点实验室北京100094 中国农业大学植物遗传育种系农业生物技术国家重点实验室农业部农作物基因组学与遗传改良重点开放实验室北京市作物遗传改良重点实验室

根据以籼稻(***)品种IR24为遗传背景的粳稻(***)品种Asominori基因渗入系与IR24回交F1在多年、多点杂种优势的表现,筛选出1个强优势组合和1个弱优势组合,其杂种优势的差异主要来源于每穗实粒数。利用cDNA-AFLP技术分析了强优势和弱优势... 详细信息

根据以籼稻(***)品种IR24为遗传背景的粳稻(***)品种Asominori基因渗入系与IR24回交F1在多年、多点杂种优势的表现,筛选出1个强优势组合和1个弱优势组合,其杂种优势的差异主要来源于每穗实粒数。利用cDNA-AFLP技术分析了强优势和弱优势组合在幼穗分化至抽穗的叶片基因表达差异,获得了35个差异表达片段。差异带可分为4类,即超亲或减弱表达、杂种特异表达、双亲基因沉默和单亲表达一致型,其中与单亲表达一致型占比例最大(约83%),杂种超亲或减弱表达占比例最小(约9%)。无论是强优势组合还是弱优势组合,这4种差异表达类型均有,且出现的比例也相近,差异表达片段类型与杂种优势之间没有直接的联系。对8个差异表达片段的克隆、测序、染色体登陆和功能分析,其中2个片段登陆在亲本基因型有差异的区段,且有1个在强优势杂种中特异表达的片段登陆在每穗实粒数杂种优势的位点上。本研究首次将基因的差异表达与亲本基因型、杂种优势位点及杂种优势的表型性状联系起来,为建立表现型-基因型-QTL定位-杂种优势相关基因表达-杂种优势分子生物学机理解释的技术平台奠定了的基础。

关键词：水稻杂种优势 cDNA-AFLP 渗入系基因差异表达

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云南元江普通野生稻穗颈维管束和穗部性状的QTL分析

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Acta Genetica Sinica 2005年第2期32卷 178-182页

作者：荆彦辉孙传清谭禄宾付永彩张培江徐正进陈温福王象坤中国农业大学植物遗传育种系农业生物技术国家重点实验室/农业部农作物基因组学与遗传改良重点开放实验室北京市作物遗传改良重点实验室北京100094 安徽省农业科学院水稻所合肥230031 沈阳农业大学稻作研究室沈阳110161

以云南元江普通野生稻为供体亲本 ,籼稻品种特青为轮回亲本构建高代回交群体 ,用SSR标记构建连锁图谱 ,在第 1、2、3、4、7和 1 0染色体上定位到 7个控制穗颈大维管束数的QTL ,在第 1、2、3、4和 8染色体上定位到5个控制穗颈小维管束数... 详细信息

以云南元江普通野生稻为供体亲本 ,籼稻品种特青为轮回亲本构建高代回交群体 ,用SSR标记构建连锁图谱 ,在第 1、2、3、4、7和 1 0染色体上定位到 7个控制穗颈大维管束数的QTL ,在第 1、2、3、4和 8染色体上定位到5个控制穗颈小维管束数的QTL ,在第 1 1和 1 2以外的 1 0条染色体上 ,共定位到 1 5个控制穗一、二次枝梗数和穗颖花数QTL。来自野生稻的等位基因大多表现负效 ,能显著减少群体的穗颈维管束数、枝梗数和颖花数 ,说明从野生稻演化成栽培稻的过程中 ,可能淘汰了一些对产量不利的QTL ,保留了有利的QTL。相当一部分控制穗颈维管束数、枝梗数及颖花数的QTL在染色体上成簇分布或紧密连锁 ,且加性效应的方向一致 ,从理论上解释了这些性状表型显著相关的遗传基础 ,同时也说明在人工选择或自然选择下。

关键词：普通野生稻维管束穗枝梗数颖花数数量性状基因座(QTL)

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不同猪种TGF-β1基因单核苷酸多态性分析

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中国畜牧杂志 2005年第4期41卷 11-13页

作者：武艳萍傅金恋李宁王晓凤卢纪和王爱国中国农业大学动物科技学院农业部畜禽遗传育种重点开放实验室北京100094 中国农业大学农业生物技术国家重点实验室北京100094 北京养猪育种中心北京100085

以二花脸猪、大白猪、长白猪、皮特兰猪和圣特西猪共计861 头为研究材料,采用PCR-SSCP技术,对猪TGF β1基因6 7外显子区的1156 bp序列进行多态性分析,发现一个多态位点。经克隆测序分析,位于第6内含子区内存在C→T突变,该突变位点为第7... 详细信息

以二花脸猪、大白猪、长白猪、皮特兰猪和圣特西猪共计861 头为研究材料,采用PCR-SSCP技术,对猪TGF β1基因6 7外显子区的1156 bp序列进行多态性分析,发现一个多态位点。经克隆测序分析,位于第6内含子区内存在C→T突变,该突变位点为第7外显子上游的第9位碱基(序列:AJ621785中的第1043位点)。对不同猪群的基因型和基因频率统计结果表明,二花脸猪以等位基因T为主,而大白猪、长白猪、皮特兰猪和圣特西猪则以等位基因C为主,且各猪群均处于Hardy Weinberg平衡。

关键词：畜牧医科学基础学科 TGF-β1 PCR-SCP SNP 猪

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